images image | predictions string | page_number int64 | title string | author string | thesis_id string | university string | department string | year string | language string | thesis_type string | keyword_abd null | abstract_tr string | abstract_en string | file_size_bytes int64 | download_timestamp string | url string | download_success bool | processor int64 | text string | processor_used int64 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9623504877090454, "polygon": [[284, 771], [1437, 770], [1436, 221], [284, 221]]}, {"class": "Metin", "confidence": 0.9186529517173767, "polygon": [[285, 2097], [1430, 2095], [1429, 1602], [284, 1604]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8654760718345642, "polygon": [[1467, ... | 42 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | ile DSB'lerin onarımı, hedef bölgede indellerle sonuçlanır (140). Genom düzenleyici nükleazlar tarafından indüklenen indelleri tanımlamak için etkili yöntemler bulunmaktadır. İşleme sonrası PCR ürünlerinin analizine dayalı yöntemler arasında bulunan T7 Endonükleaz I (T7EI) Sindirim Testi ile Indel Tespiti bu çalışmada ... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.946973443031311, "polygon": [[1438, 2140], [1438, 1550], [277, 1549], [277, 2140]]}, {"class": "Metin", "confidence": 0.9350817203521729, "polygon": [[282, 662], [1451, 660], [1450, 224], [281, 226]]}, {"class": "Resim", "confidence": 0.9170523285865784, "polygon": [[1452, 1441], [14... | 43 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | bir uyumsuzlukla sonuçlanır). Çoğaltılmış DNA daha sonra hatalı eşleşmeleri tanıyan ve hatalı eşleşmelerin upstream kısmından kesen T7 endonükleaz ile inkübe edilirken yabanıl tip çift sarmallı DNA bozulmadan (kesilmeden) kalmaktadır. Yabanıl tip DNA iplikleri ve ortaya çıkan fragmanlar (iki veya daha fazla) daha sonra... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9358730316162109, "polygon": [[1475, 2119], [1494, 300], [288, 287], [268, 2106]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8948500752449036, "polygon": [[1468, 138], [1468, 89], [1414, 88], [1413, 137]]}] | 44 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | transfekte edilmesine olanak tanır. Genel olarak transfeksiyon, stabil ve geçici transfeksiyon olmak üzere iki tipte sınıflandırılabilir (142, 145). Stabil transfeksiyon, yabancı DNA'yı konak nükleer genomuna entegre ederek veya ekstra kromozomal bir element olarak konakçı çekirdekte bir epizomal vektörü koruyarak bir ... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.941857635974884, "polygon": [[1497, 1998], [1504, 278], [267, 274], [260, 1993]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8548599481582642, "polygon": [[1464, 137], [1465, 88], [1412, 88], [1411, 136]]}] | 45 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | materyallerin transferine yardımcı olmak için manyetik kuvvet kullanan mıknatıs destekli transfeksiyon veya manyetofection, düşük verimliliğine rağmen konakçı hücreye daha az zarar veriyor gibi görünmektedir. Gen mikroenjeksiyonu ise, istenen nükleik asitleri konakçı hücrenin çekirdeğine enjekte etmek için hücreyi delm... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.940048336982727, "polygon": [[1477, 2154], [1493, 291], [281, 280], [264, 2143]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.860116720199585, "polygon": [[1465, 136], [1465, 90], [1414, 90], [1414, 136]]}] | 46 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | 2.5. Bağışıklık (immün sistem), Tüberküloz ve Bacillus Calmette-Guérin (BCG) Aşısı
Bağışıklık, vücudun patojenlerin istilasını önleme yeteneğini ifade eder. Patojenler, bakteri ve virüsler gibi hastalığa neden olan yabancı maddelerdir ve insanlar her gün bunlara maruz kalmaktadır. Antijenler, patojenlerin yüzeyine bağ... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.940542459487915, "polygon": [[1474, 2106], [1495, 300], [289, 286], [268, 2093]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8864449858665466, "polygon": [[1467, 136], [1467, 89], [1414, 89], [1414, 136]]}] | 47 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | hastalığı taklit ettiği ve aşılanmış bireyde hastalanmadan bir bağışıklık tepkisine neden olduğu aşılamadan meydana gelir (167).
Adaptif bağışıklık sisteminin mikropla ilk temas ettiğiinde tepki vermesi birkaç gün sürebilir, ancak bir dahaki sefere vücut hemen tepki verebilir. İkinci enfeksiyon daha sonra hastalık etk... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9394546151161194, "polygon": [[1468, 1208], [1477, 227], [307, 217], [299, 1198]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8814885020256042, "polygon": [[1467, 137], [1467, 90], [1413, 89], [1412, 136]]}, {"class": "Resim", "confidence": 0.8527989387512207, "polygon": [[1400, 18... | 48 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | ve ardından onlara bağlanabilir. Bu, "davetsiz misafirleri" etkisiz hale getirir ve yardım için diğer bağışıklık sistemi hücrelerini çeker. Antikor oluşumunu tetikleyebilen mikroplar ve diğer maddelere de "antijenler" denir (171). Bir antikor, bir antijene ancak tam olarak eşleşirse bağlanır. Antikorlar, adaptif bağışı... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9402459263801575, "polygon": [[1473, 2113], [1488, 293], [287, 283], [272, 2103]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8585059642791748, "polygon": [[1465, 137], [1465, 88], [1412, 88], [1412, 137]]}] | 49 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | Uzun bir süre, bağışıklık hafızası, adaptif bağışıklık sisteminin özel bir özelliği olarak kabul edilmiştir. Bununla birlikte, aşıların hedef enfeksiyonlarının ötesindeki etkilerini gösteren, giderek artan sayıda epidemiyolojik ve immünolojik çalışma birikmeye başlamıştır. Bu heterolog etkiler, antijene özgü adaptif im... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9404199719429016, "polygon": [[1477, 2111], [1493, 297], [285, 286], [269, 2101]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.880521833896637, "polygon": [[1467, 138], [1467, 88], [1412, 88], [1412, 138]]}] | 50 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | hastalığının tüm biçimleri için yeni teşhis ve tedaviler ufukta belirmektedir. Tüberküloz, dünya çapında önemli morbidite ve mortaliteye neden olmaya devam etmektedir. DSÖ'ye (Dünya Sağlık Örgütü) göre, 2017'de tahminen 10 milyon insan yeni tüberküloz hastası olmuştur. Bu bireylerin 8,7 milyonu (%87) hastalık yükünün y... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9227241277694702, "polygon": [[281, 2109], [1433, 2108], [1433, 1690], [281, 1691]]}, {"class": "Metin", "confidence": 0.9201172590255737, "polygon": [[1489, 1011], [1490, 216], [293, 215], [292, 1009]]}, {"class": "Resim", "confidence": 0.8942891955375671, "polygon": [[1412, 1644], ... | 51 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | risk faktörlerini nasıl açıklayabileceğine ve sosyoekonomik risk faktörleri üzerinde de önemli çalışmalar yapılmıştır. Sosyoekonomik düzeyi düşük nüfuslardan gelen kişilerin tüberküloz hastalığına yakalanma riskinin yüksek olduğu bilinmektedir (192) TB yükünün düşük olduğu ülkelerde, genel yaşam koşullarındaki iyileşme... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9402285218238831, "polygon": [[1475, 2113], [1494, 307], [285, 294], [266, 2100]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8663772940635681, "polygon": [[1467, 138], [1467, 88], [1412, 88], [1411, 138]]}] | 52 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | neonatal TB ölümlerinde azalmaya yol açmaktadır (197). Robert Koch tarafından 1882'de keşfedilen *M. tuberculosis* (Mtb), diğer insan patojenlerine kıyasla daha fazla ölümden sorumludur (198, 199). BCG, dört milyardan fazla dozla TB'ye karşı şu anda mevcut olan tek ve en yaygın uygulanan aşıdır. BCG bağışıklama kapsamı... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9755310416221619, "polygon": [[1473, 1511], [1483, 225], [290, 215], [280, 1501]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8824232816696167, "polygon": [[1466, 137], [1466, 89], [1413, 89], [1413, 136]]}] | 53 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | klinik durumlarda spesifik olmayan immünoterapi olarak da etkili olduğu gösterilmiştir. Bu etkilerin bilinen bir örneği, HPV’nin (İnsan Papilloma Virüs) neden olduğu kutanöz ve genital siğillere karşı BCG’nin olumlu etkisidir. Ayrıca BCG, viral enfeksiyonlara yönelik aşılara verilen yanıtı da iyileştirebilir. 40 sağlık... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9298189282417297, "polygon": [[305, 2127], [1453, 2122], [1448, 1009], [300, 1015]]}, {"class": "Resim", "confidence": 0.889689564704895, "polygon": [[1440, 1019], [1446, 219], [312, 210], [306, 1011]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8806725740432739, "polygon": [[1466,... | 54 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | Şekil 2.14. BCG aşısı intrakutan olarak enjekte edildikten sonra monositler, makrofajlar ve DC'ler (dendritik cell) aşı yerinde BCG'yi tanır ve güçlü bir bağışıklık tepkisi oluşturur. BCG, DC'ler veya makrofajlar tarafından tanınır ve içselleştirilir. BCG'nin hücre duvarı veya diğer bileşenleri, farklı ligandlara bağla... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9326282739639282, "polygon": [[301, 588], [1470, 587], [1470, 213], [300, 213]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8763675689697266, "polygon": [[1463, 135], [1464, 90], [1414, 89], [1413, 134]]}] | 55 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | aracılığıyla HEK293 hücrelerinde TIMELESS geni nakavt edilerek BCG aşısının etkinliği 84 doğuştan gelen ve adaptif gen üzerinde qRT-PCR teknolojisi ile araştırılmıştır. Sonuç olarak TIMELESS geni ile immün yanıtlar arasında yeni bulgular elde edilmiştir. Bu çalışma ile sadece mevcut tekniklerin optimize edilerek labora... | 2 | |
[{"class": "Tablo", "confidence": 0.9585729241371155, "polygon": [[1479, 1758], [1480, 384], [287, 383], [286, 1758]]}, {"class": "Resim/Tablo Açıklaması", "confidence": 0.820886492729187, "polygon": [[1135, 378], [1135, 323], [394, 322], [394, 377]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.7581287622451782, "poly... | 56 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | ## 3. GEREÇ ve YÖNTEM
### 3.1. Kimyasal Malzemeler ve Biyolojik Materyaller
| Malzeme | Üretici, Ülke |
|---------|---------------|
| Dulbecco's modification of Eagle's medium (DMEM) | Biochrom AG, Almanya |
| Penisilin/Streptomisin | Sigma, İsrail |
| SYBR Green Gerçek zamanlı PCR kiti | ThermoFisher, ABD |
| Tripan... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.957953929901123, "polygon": [[1506, 2011], [1509, 262], [258, 260], [255, 2009]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8701818585395813, "polygon": [[1466, 136], [1466, 90], [1413, 89], [1413, 136]]}] | 57 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | 3.2. TIMELESS Proteininin *in silico* Yollarla Karakterize Edilmesi, Tahmini Hücre Altı Lokalizasyonunun Belirlenmesi, 3D Protein Yapısı ve Evrimsel İlişkileri
NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/) veritabanı kullanılarak TIMELESS peptid ve CDS sekansları indirilmiştir. TIMELESS proteinlerine ait fizikokimyasal özellik... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9360685348510742, "polygon": [[317, 2002], [1472, 2002], [1471, 1686], [317, 1687]]}, {"class": "Tablo", "confidence": 0.837253212928772, "polygon": [[272, 1676], [1437, 1674], [1437, 1263], [271, 1265]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8115494251251221, "polygon": [[146... | 59 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | Şekil 3.1. pSpCas9(BB)-2A-GFP (PX458) plazmitine ait harita
Tablo 3.3. pSpCas9(BB)-2A-GFP (PX458) plasmitinin BbsI Enzimi ile Kesilmesi ve Defosforilasyonu
| Reaksiyon bileşenleri: |
|---|
| 1ug pSpCas9(BB)-2A-GFP (PX458) |
| 1 ul BbsI-HF (NEB#R3539S) enzimi |
| 5 ul Cutsmart Buffer |
| X ul ddH₂O |
| Toplam 50 ul |
... | 2 | |
[{"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8722881078720093, "polygon": [[1467, 137], [1467, 89], [1415, 89], [1415, 136]]}, {"class": "Metin", "confidence": 0.861291229724884, "polygon": [[1484, 1743], [1486, 1026], [300, 1024], [299, 1740]]}, {"class": "Tablo", "confidence": 0.8344341516494751, "polygon": [[1432, 1... | 60 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | 3.4.4. Hibridize Edilmiş Oligoların pSpCas9(BB)-2A-GFP (PX458) Plasmidi ile Ligasyonu ve Transformasyonu
Ayrı ayrı hibridize edilmiş gRNA1 ve gRNA2 ile ayrı ayrı reaksiyon kurulmuştur (Tablo 3.4.).
**Tablo 3.4.** Hibridize edilmiş oligoların pSpCas9(BB)-2A-GFP (PX458) plasmidi ile ligasyonu ve transformasyonu
| Reak... | 2 | |
[{"class": "Tablo", "confidence": 0.9479222893714905, "polygon": [[1475, 1025], [1477, 284], [311, 281], [309, 1021]]}, {"class": "Metin", "confidence": 0.9395819306373596, "polygon": [[1437, 1667], [1437, 1077], [282, 1076], [282, 1666]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8163925409317017, "polygon": [[1467... | 61 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | ### Tablo 3.5. gRNA’nın vektör içine insersiyonunun kontrolü
| Reaksiyon bileşenleri: |
|---|---|
| 5ul | 5X Q5 PCR Reaksiyon Bufferı (NEB) |
| 0,5ul | dNTPs 10 mM |
| 1,25ul | 10 uM hU6 Forward Primeri (evrensel primer) |
| 1,25ul | 10 uM gRNA1 / gRNA2 Reverse Primeri |
| 1ul | Plazmit (~100ng/ul) |
| 0,25ul | Q5 Pol... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.95064777135849, "polygon": [[1462, 2096], [1479, 1069], [292, 1050], [275, 2077]]}, {"class": "Resim", "confidence": 0.9288867115974426, "polygon": [[1417, 916], [1419, 224], [312, 221], [310, 913]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8298740983009338, "polygon": [[1469, 13... | 62 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | Şekil 3.2. HEK293 hücre hattının yetiştirilmesi (Şekil BioRender kullanılarak oluşturulmuştur).
Daha sonra genin ifadesini deneysel anlamda doğrulamak üzere HEK293 hücre hattından RNA izolasyonu ve cDNA sentezi yapılarak uygun primerler tasarlanmış ve gen ifadesi kesin olarak kontrol edilmiştir. FavorPrep™ Tissue RNA ... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9523334503173828, "polygon": [[1472, 1312], [1473, 230], [276, 229], [275, 1311]]}, {"class": "Tablo", "confidence": 0.9160740971565247, "polygon": [[1441, 1709], [1441, 1415], [286, 1415], [285, 1708]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.854170024394989, "polygon": [[1467,... | 63 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | FARB Mini Kolona 750 µl Yıkama Tamponu 2 eklendi. 30 saniye boyunca 18.000 x g'de santrifüjlendi. Akışı atıldı ve FARB Mini Kolonu Toplama Tüpüne tekrar takıldı ve bu işlem yinelendi.
Tüpler 3 dakika boyunca 18.000 x g'de santrifüjlendi. Akışı atıldı ve FARB Mini Kolonu Toplama Tüpüne geri takıldı. FARB Mini Kolonu bi... | 2 | |
[{"class": "Tablo", "confidence": 0.956631064414978, "polygon": [[314, 1409], [1450, 1402], [1444, 302], [307, 309]]}, {"class": "Metin", "confidence": 0.9322207570075989, "polygon": [[1460, 2093], [1464, 1414], [302, 1408], [299, 2087]]}, {"class": "Resim/Tablo Açıklaması", "confidence": 0.8590360283851624, "polygon":... | 64 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | Tablo 3.7. TIMELESS’a özgü primer çiftleri ve gen ifadesinin ölçülmesine dair reaksiyon bileşenleri/koşulları
| TIMELESS’a özgü tasarlanan primer çiftleri |
|---|---|
| TIM Forward | CAACCAGAGGAAGGAACAGAAG |
| TIM Reverse | TGTGCTCGGTGGCTCTCTTTAC |
| qRT-PCR bileşenleri |
|---|---|
| **Bileşenler** | **Hacim miktarla... | 2 | |
[{"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8498027920722961, "polygon": [[1467, 137], [1467, 89], [1413, 89], [1413, 136]]}, {"class": "Metin", "confidence": 0.8409379720687866, "polygon": [[1499, 1885], [1510, 263], [254, 255], [243, 1877]]}, {"class": "Kaynakça", "confidence": 0.40023940801620483, "polygon": [[1493... | 65 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | 3.7. T7 Endonükleaz Testi
gCntrl ve gRNA1/2 transfekte edilmiş hücreler, hedeflenen bölgelerde uygulanan indel mutasyonlarını doğrulamak için T7 endonükleaz testine tabi tutulmuştur.
Hücreler, tripsinizasyon ve santrifüjleme ile toplanmıştır. FavorPrep™ Genomic DNA Extraction Mini Kiti kullanılarak üreticinin talimat... | 2 | |
[{"class": "Tablo", "confidence": 0.9427672028541565, "polygon": [[1463, 1556], [1466, 936], [317, 932], [315, 1551]]}, {"class": "Metin", "confidence": 0.9222774505615234, "polygon": [[274, 1880], [1447, 1880], [1447, 1585], [274, 1585]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8400058746337891, "polygon": [[1466... | 66 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | Tablo 3.8. T7 endoknükleaz sırasında kullanılan primer çiftleri
| İleri Primer | CATGAGGATGAGACACGAGATG |
|-------------|------------------------|
| Geri Primer | GAGACAATGAAGGAGGGAGAAG |
Primerler OligoAnalyzer™ Tool (https://www.idtdna.com/pages/tools/oligoanalyzer) kullanılarak tasarlanıp ve 40 döngülük qRT-PCR re... | 2 | |
[{"class": "Tablo", "confidence": 0.9432987570762634, "polygon": [[1464, 1006], [1465, 327], [325, 325], [324, 1004]]}, {"class": "Metin", "confidence": 0.9211438894271851, "polygon": [[1487, 1854], [1488, 1058], [297, 1055], [295, 1852]]}, {"class": "Resim/Tablo Açıklaması", "confidence": 0.8479727506637573, "polygon"... | 67 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | Tablo 3.10. T7 Endonükleaz reaksiyon bileşenleri, T7 Endonükleaz I testi için hibridizasyon koşulları
| BİLEŞENLER | 19 µl bağlanma reaksiyonu |
|---|---|
| DNA | 200 ng |
| 10X NEBuffer 2 | 2 ul |
| Nükleazsız Su | 19 µl'ye kadar |
**T7 Endonükleaz I testi için hibridizasyon koşulları**
| ADIM | SICAKLIK | HIZ | ZA... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9174853563308716, "polygon": [[1470, 1630], [1471, 710], [297, 708], [295, 1629]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8500252962112427, "polygon": [[1467, 136], [1468, 88], [1411, 88], [1411, 136]]}, {"class": "Resim/Tablo Açıklaması", "confidence": 0.8332828879356384, "pol... | 68 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | ### Tablo 3.11. Aşılama sonucu elde edilen hücre grupları
| Hücre Numaraları | Hücre Grupları |
|------------------|---------------------------------|
| I | Aşılı Normal HEK293 |
| II | Aşısız Normal HEK293 |
| III | Aşılı Nakavt TIMELES... | 2 | |
[{"class": "Resim", "confidence": 0.8747724890708923, "polygon": [[1131, 2072], [1140, 218], [219, 213], [209, 2067]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.7331297397613525, "polygon": [[1413, 143], [1413, 90], [1352, 90], [1351, 142]]}] | 69 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 2 | | 01 | 02 | 03 | 04 | 05 | 06 | 07 | 08 | 09 | 10 | 11 | 12 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| A | APCS | C3 | CASP1 | CCL2 | CCL5 | CCR4 | CCR5 | CCR6 | CCR8 | CD14 | CD4 | CD40 |
| B | CD40LG | CD80 | CD86 | CD8A | CRP | CSF2 | CXCL10 | CXCR3 | DDX58 | FASLG | FOXP3 | GATA3 |
| C | HLA-A | HLA-E | ... | 2 | |
[{"class": "Tablo", "confidence": 0.9109554290771484, "polygon": [[282, 927], [1414, 925], [1412, 315], [280, 318]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8434866666793823, "polygon": [[1466, 138], [1467, 88], [1411, 87], [1410, 137]]}, {"class": "Resim/Tablo Açıklaması", "confidence": 0.8425195217132568, "polyg... | 70 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | Tablo 3.13. Gen ifadesini ölçmek için kullanılan bileşenler ve qRT-PCR için kullanılan reaksiyon koşulları
| Reaksiyon Bileşenleri | 96’lı well için toplam hacim |
|----------------------|-----------------------------|
| 2x RT2 SYBR® Green Mastermix | 1350 µl |
| cDNA | 102 µl |
| RNase-free water | 1248 µl |
| **Tota... | 2 | |
[{"class": "Resim", "confidence": 0.9255927205085754, "polygon": [[1341, 1951], [1345, 1269], [428, 1265], [425, 1947]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8660183548927307, "polygon": [[1463, 135], [1464, 91], [1413, 90], [1413, 134]]}, {"class": "Resim/Tablo Açıklaması", "confidence": 0.8321546316146851, "p... | 71 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 2 | 4. BULGULAR
4.1. TIMELESS Proteininin *In Silico* Yollarla Karakterize Edilmesi, Tahmini Hücre Altı Lokalizasyonunun Belirlenmesi, 3D Protein Yapısı ve Evrimsel İlişkileri
Bu tez çalışması kapsamında TIMELESS proteinin karakterizasyonu ve fizikokimyasal özellikleri araştırılmıştır. Amino asit uzunluğu, moleküler ağır... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9523758292198181, "polygon": [[1466, 1278], [1466, 222], [288, 221], [287, 1278]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8847964406013489, "polygon": [[1465, 137], [1466, 89], [1413, 88], [1412, 136]]}] | 72 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | İçerdiği yapılara göre TIMELESS proteinine ait 3 boyutlu homoloji görüntüüsü elde edilmiştir (Tablo 4.2). Elde edilen verilere sonucunda TIMELESS’ın helix, beta strand ve turn için özellikler gösterdiği anlaşılmıştır (Şekil 4.2.). İçerdiği protein yapıları X-Ray, NMR ve EM’den elde edilerek hazırlanmış verilere dayalı ... | 2 | |
[{"class": "Resim", "confidence": 0.9211696982383728, "polygon": [[1465, 1230], [1468, 203], [304, 200], [301, 1227]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8725629448890686, "polygon": [[1464, 134], [1465, 90], [1413, 90], [1412, 134]]}, {"class": "Resim/Tablo Açıklaması", "confidence": 0.8338552713394165, "pol... | 73 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 2 | Şekil 4.2. TIMELESS proteinine ait 3D yapısı | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9465101361274719, "polygon": [[313, 1590], [1482, 1589], [1482, 1121], [313, 1123]]}, {"class": "Tablo", "confidence": 0.9140705466270447, "polygon": [[1503, 1126], [1511, 273], [304, 261], [295, 1114]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.861108660697937, "polygon": [[1467,... | 74 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | Tablo 4.2. TIMELESS proteininde görülen içerikler
| İsim | Method | Resolution (Å)(elektron yoğunluğu) | Zincir | Pozisyon |
|-------|--------|----------------------------------|--------|----------|
| 4XHT | X-ray | 1.65 Å | A/B/C/D| 1000-1098|
| 4XHU | X-ray | 2.09 Å ... | 2 | |
[{"class": "Resim", "confidence": 0.9546682834625244, "polygon": [[1386, 1217], [1389, 224], [379, 220], [375, 1214]]}, {"class": "Metin", "confidence": 0.9172151684761047, "polygon": [[1457, 1939], [1461, 1294], [306, 1288], [303, 1933]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8655887842178345, "polygon": [[1465... | 75 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 2 | Şekil 4.3. ML yöntemi kullanılarak 1000 tekrarlı şekilde oluşturulan filogenetik ağaç
Sirkadiyen genlerde toplam 20 farklı korunmuş motif tanımlanarak amino asit dizileri Şekil 4.4.'te gösterilmiştir. Motif analizi incelendiğinde ise, aynı gruplarda bulunun alt türlerin benzer motif yapısı içerdiği anlaşılmıştır. BMAL... | 2 | |
[{"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8915227055549622, "polygon": [[1465, 135], [1465, 90], [1412, 89], [1412, 135]]}, {"class": "Metin", "confidence": 0.8759576082229614, "polygon": [[1485, 1910], [1486, 1151], [309, 1149], [308, 1909]]}, {"class": "Resim", "confidence": 0.8206387758255005, "polygon": [[1495, ... | 76 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | Şekil 4.4. Sirkadiyen proteinlerin korunmuş 20 motifine ait şematik gösterim. Motifleri tanımlamak için MEME çevrimiçi aracı kullanılmıştır. Her motif tipi farklı renkteki kutularla gösterilmiştir ve kutulardaki sayılar (1-20) motifleri ifade etmektedir. Her renkli kutunun uzunluğu ve konumu boyuta göre ölçeklendirilmi... | 2 | |
[{"class": "Resim", "confidence": 0.8966541886329651, "polygon": [[1380, 1159], [1399, 261], [364, 240], [345, 1137]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8570069670677185, "polygon": [[1467, 136], [1467, 89], [1412, 89], [1411, 136]]}, {"class": "Resim/Tablo Açıklaması", "confidence": 0.847612202167511, "poly... | 77 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 2 | Şekil 4.5. TIMELESS’ı hedefleyen miRNA’lar
4.3. TIMELESS’a Özgü Genom Düzenleme
Bbsl restriksiyon enzimi ile pSpCas9(BB)-2A-GFP (PX458) plazmiti 245-267’den kesim yapılarak Şekil 4.6.’da gösterilen sekans uzaklaştırıldı. gRNA1 ve gRNA2 ayrı ayrı gRNA scaffold sekansının önüne yerleştirildi. | 2 | |
[{"class": "Resim", "confidence": 0.9286300539970398, "polygon": [[432, 1510], [1335, 1508], [1334, 1127], [432, 1128]]}, {"class": "Resim", "confidence": 0.907079815864563, "polygon": [[1394, 801], [1399, 224], [364, 215], [359, 792]]}, {"class": "Metin", "confidence": 0.868906557559967, "polygon": [[1447, 1803], [144... | 78 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 2 | Şekil 4.6. pSpCas9(BB)-2A-GFP (PX458) plasmidi BbsI enzimi ile muamele edildikten sonra kesilip uzaklaştırılan sekans
gRNA1 ve gRNA2 dizisinin plazmit içindeki varlığı PCR ürünü jelde yürütülmesi ile test edildi (Şekil 4.7.).
Şekil 4.7. gRNA1 ve gRNA2 sekansının plasmid içine insersiyonunun kontrol PCR’1.
PCR ürünü ... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9338192939758301, "polygon": [[1454, 525], [1454, 226], [284, 225], [284, 524]]}, {"class": "Metin", "confidence": 0.9120635986328125, "polygon": [[291, 1525], [1457, 1523], [1457, 1212], [290, 1213]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8803329467773438, "polygon": [[1463, ... | 81 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | 4.4. gRNA Taşıyan pSpCas9(BB)-2A-GFP (PX458) Plasmidinin HEK293 Hücre Hattına Transfeksiyonu
İndel mutasyon sonucuna göre gRNA2 tercih edilerek transfeksiyon gerçekleştirilmiş ve GFP ile kontrol sağlanmıştır (Şekil 4.12).
Şekil 4.12. Transfeksiyon sonucu TIMELESS nakavtı ve GFP oluşumunun şematize edilmesi
Elde edil... | 2 | |
[{"class": "Resim", "confidence": 0.946099579334259, "polygon": [[1289, 1759], [1299, 1117], [466, 1105], [456, 1747]]}, {"class": "Resim", "confidence": 0.9246392846107483, "polygon": [[303, 677], [1437, 673], [1435, 213], [301, 218]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8520095348358154, "polygon": [[1463, 1... | 82 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 2 | Şekil 4.13. Transfeksiyon işleminin ardından HEK294 hücre hattının ilk 168 saatlik GFP görüntüleri. 0. saat hücrenin ters ışık mikroskop görüntülemeleri (20x büyüme) 24. saat -168. saat floresan mikroskop görüntülemeleri (20x büyüme).
4.5. TIMELESS ve KO TIMELESS’in Gen İfade Sonuçları
Normal ve TIMELESS nakavt HEK29... | 2 | |
[{"class": "Tablo", "confidence": 0.9391696453094482, "polygon": [[1491, 1007], [1491, 350], [319, 349], [318, 1006]]}, {"class": "Metin", "confidence": 0.926449179649353, "polygon": [[1474, 1341], [1475, 1038], [321, 1038], [321, 1340]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8826255202293396, "polygon": [[1465,... | 83 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | Tablo 4.3. Aşı ile muamele edilen normal ve nakavt hücrelere ait konsantrasyon ve saflık miktarları. Sunulan datalar ikişer biyolojik tekrarın ortalamasını ifade eder.
| Aşılı Normal HEK293 – Grup I | RNA Saflık Oranı (260/280) | RNA Konsantrasyon (ng/ µl) | cDNA (260/280) | cDNA Konsantrasyon (ng/ µl) |
|------------... | 2 | |
[{"class": "Resim", "confidence": 0.9333999156951904, "polygon": [[320, 987], [1448, 986], [1448, 200], [319, 201]]}, {"class": "Tablo", "confidence": 0.9049725532531738, "polygon": [[1448, 1822], [1448, 1593], [298, 1592], [298, 1821]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8877231478691101, "polygon": [[1467, ... | 84 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 2 | Şekil 4.15. HEK293 hücre hattından izole edilen TIMELESS ve nakavt TIMELESS’ın qRT-PCR gen ifade sonuçları. 14,21-14,26 normal HEK293 hücrelerine ait ACT geni (Grup II), 17,15-17,26 TIMELESS nakavt HEK293 hücrelerine ait ACT geni (Grup IV), 24,06-24,17 normal HEK293 hücrelerine ait TIMELESS geni (Grup II), KO ile göste... | 2 | |
[{"class": "Resim", "confidence": 0.8932578563690186, "polygon": [[1343, 1079], [1360, 310], [414, 289], [397, 1058]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8193078637123108, "polygon": [[1465, 135], [1465, 89], [1411, 88], [1411, 135]]}, {"class": "Metin", "confidence": 0.8037616014480591, "polygon": [[1488, 20... | 85 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 2 | Şekil 4.16. İndel sonucunda elde edilen bant görüntüleri (+): T7 içeren (-): T7 içermeyen, kontrol
4.7. TIMELESS nakavt hücrelerin BCG Aşısına Karşı Gösterdiği Bağışıklık Yanıtının Gen İfadesi Düzeyinde İncelenmesi
BCG aşısına karşın bağışıklık yanıtında TIMELESS geninin nakavt edilmesi ile oluşan fonksiyonel bilgile... | 2 | |
[{"class": "Resim", "confidence": 0.9408603310585022, "polygon": [[321, 1872], [1410, 1868], [1408, 1398], [320, 1402]]}, {"class": "Resim", "confidence": 0.9386810660362244, "polygon": [[353, 717], [1407, 713], [1405, 244], [351, 248]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8972670435905457, "polygon": [[1466, ... | 87 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 2 | Şekil 4.17. HEK293 hücre hattı üzerinde BCG aşısının doğuştan gelen ve kazanılmış bağışıklık sistemine ait ifadesi artan veya azalan genlerin değişim profilinin gösterildiği Heat Map (ısı haritası). Mavi renkten kırmızı renge gen ifadesi artışı söz konusudur. (Grup I – Grup II). Veriler ortalama ± SD olarak hesaplanmış... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9171398878097534, "polygon": [[1476, 491], [1476, 207], [310, 207], [310, 491]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.879413902759552, "polygon": [[1466, 134], [1466, 91], [1416, 90], [1415, 134]]}, {"class": "Metin", "confidence": 0.8303583264350891, "polygon": [[1464, 2084]... | 88 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | Aşılanmış ve aşılanmamış TIMELESS nakavt hücre hatları arasında incelenen genlerin tamamında aşılama sonrasında gen ifadelerinin artış gösterdiği anlaşılmıştır (Şekil 4. 19). En yüksek katsayı artışının ise SLC11A1 geninde meydana geldiği anlaşılmıştır (EK 4).
Şekil 4.19. Aşılı nakavt ve aşısız nakavt hattı üzerinde B... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9437088370323181, "polygon": [[1504, 2072], [1506, 255], [237, 253], [235, 2070]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8601576089859009, "polygon": [[1468, 137], [1469, 88], [1414, 87], [1414, 137]]}] | 89 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | niteliktedir (25-31).
Tez çalışması kapsamında TIMELESS genini hedefleyen miRNA'lar analiz edilmiştir. Analiz sonuçlarına göre 52 miRNA tespit edilmiştir. Genom onarımındaki rolü nedeniyle, mTIM düzensizliğinin birçok kanser türünde yaygın olarak bulunduğu bilinmektedir. Bu doğrultuda elde edilen bulgulara göre tüm mi... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9388725161552429, "polygon": [[1473, 2108], [1494, 305], [290, 291], [269, 2095]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8669881224632263, "polygon": [[1467, 136], [1467, 88], [1414, 88], [1414, 136]]}] | 90 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | bilinmektedir (236). miR-4666’nın ise TGF-β/Smad hedefleme yoluyla kolorektal kanser hücrelerini sinerjik olarak bastırdığı bilinmektedir (237). Hem patojenik enfeksiyonlara hem de patojenik olmayan inflamasyona karşı doğuştan gelen bağışıklık tepkilerinin düzenlenmesinde ise miR-146’nın rol oynadığı bilinmektedir (238... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9376344084739685, "polygon": [[1512, 2068], [1515, 246], [235, 244], [232, 2065]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8773858547210693, "polygon": [[1467, 136], [1468, 89], [1416, 88], [1416, 135]]}] | 91 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | üzerinde çeşitli otoimmün ve inflamatuar hastalıkların ve şiddetli COVID-19 formlarının geliştiği ortaya konmuştur (244). Bu tez çalışmasında BCG aşılaması sonrasında normal hücrelerde SLC11A1 geninin ifadesinde istatistiksel olarak anlamlı bir artış saptanmıştır. SLC11A1 üzerinde Zheng vd. (2022) tarafından yapılan bi... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9320555329322815, "polygon": [[1511, 2073], [1513, 240], [235, 238], [233, 2071]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8659709692001343, "polygon": [[1468, 136], [1468, 88], [1416, 88], [1416, 135]]}] | 92 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | koruma sağlayabilir. Ayrıca, TLR gen ailesi, BCG aşısının etkinliği ile de ilgilidir. Bazı çalışmalar, BCG aşısının etkinliğinin, kişilerin TLR gen varyasyonlarına bağlı olarak değişebileceğini göstermektedir (253). Çalışmamız kapsamında TLR ailesinin tamamında artış gözlenirken TLR1 TLR2 TLR4 TLR5 TLR6 TLR7 ve TLR9’da... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9389865398406982, "polygon": [[1472, 2106], [1490, 302], [288, 290], [270, 2093]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8938543796539307, "polygon": [[1467, 135], [1468, 89], [1417, 88], [1417, 135]]}] | 93 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | genlerinin ilişkili olduğu ve BCG’ye karşı hücre içi makrofaj patojenine yanıtı kontrol eden elemanlardan biri olduğu ortaya konmuştur. Ek olarak BCG'nin cüzzama karşı korumadaki etkinliğinin SLC11A1'deki polimorfizmle ilişkili olduğu bilinmektedir. SLC11A1'in genomik bölgesindeki polimorfizm(ler)i sonucunda altta yata... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9493469595909119, "polygon": [[290, 1406], [1472, 1400], [1466, 217], [284, 223]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8921459913253784, "polygon": [[1467, 136], [1468, 90], [1416, 89], [1415, 135]]}] | 94 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | Arntl2’nin (BMAL2) aşırı ekspresyonunun FoxP3’ün ifadesini artttığını gösterilmiştir (269). Hanekom vd. (2006) tarafından yapılan bir çalışmada doğumda BCG ile aşılanmış 10 haftalık bebeklerden alınan tam kanlar üzerinde FoxP3 ifadesinin bu verileri ile benzer şekilde arttığı görülmüştür (270). Tüm tez çalışması bulgul... | 2 | |
[{"class": "Metin", "confidence": 0.9592902064323425, "polygon": [[1493, 1977], [1497, 270], [265, 267], [260, 1974]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8670831322669983, "polygon": [[1465, 135], [1465, 90], [1414, 89], [1413, 134]]}] | 95 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | 6. SONUÇ VE ÖNERİLER
Hücre döngüsü ve DNA onarımının işlevi olduğu bilinen TIMELESS’ın tez çalışmasından elde edilen veriler neticesinde çeşitli biyolojik süreçlerde de önemli bir rol oynadığı tespit edilmiştir. *In silico* araçlar kullanılarak yapılan araştırmalar neticesinde TIMELESS’ın kanser ve bağışıklıkla ilişki... | 2 | |
[{"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8390020728111267, "polygon": [[1465, 137], [1466, 91], [1412, 90], [1411, 136]]}, {"class": "Metin", "confidence": 0.8157758712768555, "polygon": [[1383, 2070], [1396, 257], [258, 250], [246, 2062]]}] | 116 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | 8. EKLER
EK 1. TIMELESS genini hedefleyen miRNA’lar
| miRNA | Sequence |
|-------|----------|
| hsa-miR-520g-5p | 5' - ucuagaggaagcacuuucuguuu - 3' (uzunluk = 23) |
| hsa-miR-6516-5p | 5' - uuugcaguaacaggugugagca - 3' (uzunluk = 22) |
| hsa-miR-4496 | 5' - gaggaaacugaagcugagaggg - 3' (uzunluk = 22) |
| hsa-miR-4774-5... | 2 | |
[{"class": "Tablo", "confidence": 0.9487950205802917, "polygon": [[1477, 2092], [1480, 408], [268, 406], [265, 2090]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8839168548583984, "polygon": [[1464, 136], [1465, 90], [1401, 89], [1401, 135]]}, {"class": "Resim/Tablo Açıklaması", "confidence": 0.8408737778663635, "pol... | 118 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | EK 2. Normal Hücreler Üzerinde Gerçekleştirilen BCG Aşısının Gen İfade Analizlerinin İstatistiki Değerlendirmesi
| Gen Sembolleri | AVG Delta Ct | 2^(-Delta Ct) | Kat Düzenlemesi |
|----------------|--------------|----------------|-----------------|
| | Aşılı Normal | Aşısız Normal | Aşılı Normal | Aşıs... | 2 | |
[{"class": "Tablo", "confidence": 0.9689764976501465, "polygon": [[1489, 1752], [1493, 247], [301, 244], [297, 1749]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8349728584289551, "polygon": [[1463, 135], [1464, 89], [1400, 89], [1400, 135]]}] | 119 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | | Genetik Faktör | X±SS | Ortanca | X±SS | Ortanca | X±SS | Ortanca | p* |
|----------------|------|---------|------|---------|------|---------|---|
| IL6 | 0.55 | 3.34 | 0.682324 | 0.098454 | 6.93 |
| CXCL8 | 1.63 | 3.08 | 0.322072 | 0.117896 | 2.73 |
| IRAK1 | 2.76 | 3.02 | 0.147... | 2 | |
[{"class": "Tablo", "confidence": 0.9574583768844604, "polygon": [[1480, 2080], [1482, 445], [274, 443], [272, 2078]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.9025287628173828, "polygon": [[1464, 136], [1465, 89], [1402, 88], [1401, 135]]}, {"class": "Resim/Tablo Açıklaması", "confidence": 0.7761272192001343, "pol... | 120 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | EK 3. BCG Aşılı Normal HEK293 Hücreleri ve BCG aşılı TIMELESS Nakavt Edilmiş BCG Aşılı HEK293 Hücreleri Arasındaki Gen İfade Analizlerinin İstatistiki Değerlendirmesi
| Gen Sembolleri | AVG Delta Ct | 2^(-Delta Ct) | Kat Düzenlemesi |
|----------------|--------------|----------------|-----------------|
| ... | 2 | |
[{"class": "Tablo", "confidence": 0.9634463787078857, "polygon": [[281, 1615], [1491, 1611], [1486, 234], [276, 238]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8589872121810913, "polygon": [[1464, 134], [1464, 90], [1401, 90], [1401, 134]]}] | 121 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | | IL6 | 6.04 | 4.20 | 0.015238 | 0.054362 | -3.57 |
| CXCL8 | 4.70 | 3.58 | 0.038508 | 0.083370 | -2.16 |
| IRAK1 | 6.43 | 4.71 | 0.011584 | 0.038294 | -3.31 |
| IRF3 | 5.90 | 2.45 | 0.016747 | 0.183185 | -10.94|
| IRF7 | 7.45 | 5.93 | 0.005722 | 0.016456 | -2.88 |
| ITGAM | 6.11 | 4.19 | 0.014498 | 0.0... | 2 | |
[{"class": "Tablo", "confidence": 0.9544013738632202, "polygon": [[1448, 2054], [1452, 395], [272, 393], [268, 2051]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8938117027282715, "polygon": [[1463, 136], [1464, 90], [1401, 89], [1400, 135]]}, {"class": "Resim/Tablo Açıklaması", "confidence": 0.8258213996887207, "pol... | 122 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | EK 4. Nakavt TIMELESS Hücreleri Üzerinde BCG aşılı ve Aşısız Gen İfade Analizlerinin İstatistiki Değerlendirmesi
| Gen Sembollerı | AVG Delta Ct | 2^(-Delta Ct) | Kat Değişimi |
|----------------|--------------|----------------|--------------|
| | TIMELESS nakavt BCG aşılı HEK293 hücreleri | TIMELESS na... | 2 | |
[{"class": "Tablo", "confidence": 0.9646446704864502, "polygon": [[1454, 1584], [1460, 244], [300, 238], [293, 1578]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.8468948006629944, "polygon": [[1464, 135], [1465, 89], [1401, 89], [1401, 135]]}] | 123 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 1 | | CXCL8 | -1.11 | -0.77 | 2.162871 | 1.704722 | 1.27 |
| IRAK1 | 0.62 | 2.21 | 0.650613 | 0.216357 | 3.01 |
| IRF3 | 0.09 | 1.11 | 0.940604 | 0.461728 | 2.04 |
| IRF7 | 1.64 | 3.02 | 0.321388 | 0.122914 | 2.61 |
| ITGAM | 0.30 | 0.41 | 0.814307 | 0.753518 | 1.08 |
| JAK2 | 4.96 | 5.46 | 0.032238 | 0.022671 | 1.42 |
| L... | 2 | |
[{"class": "Resim", "confidence": 0.9257200956344604, "polygon": [[1433, 1798], [1435, 342], [303, 341], [302, 1797]]}, {"class": "Sayfa Numarası", "confidence": 0.7970226407051086, "polygon": [[1468, 138], [1468, 88], [1398, 87], [1397, 137]]}, {"class": "Resim/Tablo Açıklaması", "confidence": 0.6203851103782654, "pol... | 124 | Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması / Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique | AYBÜKE OKAY | 804543 | Hacettepe Üniversitesi | Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı | 2023 | Türkçe | Yüksek Lisans | null | Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vü... | Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of gene... | 5,509,889 | 2025-08-23T01:29:28.317815 | https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=j_Fjwp4JS4mk97Puqti8rrhLQTtuOj0N8ZvIDH5lCONdeDeJ6DzlxJRPL3MqPO_m | true | 2 | EK 5. Tez Çalışması Orjinallik Raporu
SIRKADİYEN RİTMİN AŞI İLE EDİNİLEN BAĞIŞIKLIK YANITINA ETKİSİNİN CRISPR/CAS9 TEKNİĞİYLE ARAŞTIRILMASI
| ORJİNALLIK RAPORU |
|---|---|---|---|
| %7 BENZERLİK ENDEKSİ | %6 İNTERNET KAYNAKLARI | %3 YAYINLAR | %3 ÖĞRENCİ ÖDEVLERİ |
| BİRİNCİL KAYNAKLAR |
|---|---|
| 1 fullsepp.com |... | 2 |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.