{ "architectures": [ "Rfd4ProteinaModel" ], "autoencoder": { "allowed_residue_types": [ [ false, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ false, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true ], [ false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true ], [ false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ] ], "atom37_mask": [ [ false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, true, true, false, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, true, true, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, true, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, true, false, false, false, true, false, false, false, false, true, true, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, true, true, true, true, true, false, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, false, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, false, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, false, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, false, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, true, true, true, true, true, false, true, true, false, false, true ], [ true, true, true, false, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, true, true, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, true, false, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, true, false, false, false, false, true, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, true, true, false, false, true, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, true, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, true, true ], [ true, true, true, true, true, true, true, false, true, true, true, true, false, false, true, false, false, true, true, true, false, false, false, false, true, true, true, true, true, true, false, true, false, true, false, true, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, true, false, false, false, true, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, true, true, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, true, true, true, false, false, false, false, false, true, true, false, true, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, true, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, true, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, true, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, true, true, false, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, true, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, true, true, false, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, true, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, true, false, false, true, false, false, false, true, false, false, false, true, false, false, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, true, false, true, true ], [ true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, true, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, true, false, false, true, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, true, false, false, false, false, true, true, false, true, false, false, true, false, true, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, true, false, false, false, true, true, true, false, false, false, false, true, false, false, true, false, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, true, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, true, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, true, true, false, false, false, false, true, true, false, false, false, true, false, true, false, true, true, false, true, true, false, false, true, false, false, false, true, true, true, true ], [ true, true, true, false, true, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, true, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, true, true, true, false, true, true, false, false, true, true, true, true, true, true, true, false, true, true, false, true, true, true, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, true, true, false, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, true, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, true, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, true, false, false, true, true, false, false, false, false, true, true, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, true, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, true, false, true, false, true, false, false, false, false, true, true, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, true, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, true, true, true, true, false, false, false, false, true, true, true, true, true, false, false, false, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, true, true, true, true ], [ true, true, true, true, true, false, true, true, false, false, false, false, true, true, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, true, false, false, false, false, false, true, true, false, true, false, true, false, true, false, false, false, false, true, true, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, true, false, false, false, false, true, true, false, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, true, false, false, true, false, false, false, true, true, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, true, false, true, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, true, false, false, false, true, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, true, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, true, false, false, true, true ], [ true, true, true, true, true, false, true, false, false, true, true, false, false, false, true, true, true, false, true, false, false, false, true, true, true, true, true, true, false, true, true, true, false, true, false, true, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, true, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, false, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, true, true, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, true, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, true, false, false, false, true, false, false, false, false, true, true, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, true, false, true, false, false, true, false, false, true, false, true, false, false, true, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, true, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, true, true, true, false, true, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, true, true, false, false, true, false, false, true, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, true, true, false, false, true, false, false, false, false, true, true, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, true, false, false, false, false, true, true, false, true, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, true, false, true, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, true, true, true, true, true, false, false, true, false, false, false, false, true, true, false, false, false, true, true, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, true, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, true, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, true, false, false, true, false, false, false, false, false, true, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, true, false, false, true, true, true ], [ true, true, true, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, true, true, false, true, true, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, true, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, true, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, true, false, false, true, true, false, false, false, true, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, true, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, true, false, false, true, false, true, false, false, false, false, false, false, true, false, false, true, true, true, false, false, true, true, true ], [ true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, true, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, true, false, true, true, true, false, true, false, false, true, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, true, true, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, true, true, false, true, false, false, true, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, false, false, true, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, false, false, false, true, true, false, true, false, false, true, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, true, true, false, false, false, false, false, false, true, true, true, true, false, true, true, false, false, false, false, true, true, false, false, false, true ], [ true, true, true, false, true, false, false, true, false, true, false, false, false, false, true, false, true, false, true, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, true, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, false, true, false, false, false, false, false, true, true, false, false, true, false, false, true, false, true, true, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, false, false, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, true, true, false, true, false, false, true, true, false, true, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, false, true, true, false, true, false, false, true, true, false, true, false, false, false, false, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, true, false, false, true ], [ true, true, true, true, true, true, true, false, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, true, true, true, false, true, false, true, false, true, true, true, false, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, true, true, true, true, false, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, true, true, false, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, true, true, true, true, false, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ], [ true, true, true, true, true, true, true, false, true, true, true, true, true, true, true, true, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false, false ] ], "condition_size": 128, "decoder_features": [ "ca_coors_nm", "z_latent_seq", "token_type", "cond_residue_type" ], "encoder_features": [ "token_type", "x1_a37coors_nm", "x1_a37coors_nm_rel", "chain_idx_seq", "incident_bond_type_counts", "atom37_element_charge_embedding" ], "hidden_size": 768, "latent_dim": 32, "layer_norm_eps": 1e-05, "model_type": "", "num_attention_heads": 12, "num_hidden_layers": 12, "num_residue_types": 147, "num_token_types": 7, "token_type_embedding_size": 32 }, "denoiser": { "cath_embedding_size": 32, "condition_features": [ "time_emb_bb_ca", "time_emb_local_latents", "cath_code", "recycle_remaining" ], "condition_size": 256, "hidden_size": 768, "latent_dim": 32, "layer_norm_eps": 1e-05, "model_type": "", "num_attention_heads": 12, "num_bond_path_bins": 64, "num_cath_architectures": 44, "num_cath_classes": 6, "num_cath_topologies": 1473, "num_charge_classes": 11, "num_elements": 128, "num_hidden_layers": 14, "num_pair_distance_bins": 30, "num_sequence_classes": 147, "num_token_types": 7, "pair_condition_features": [ "time_emb_bb_ca", "time_emb_local_latents" ], "pair_distance_max": 3.0, "pair_distance_min": 0.1, "pair_features": [ "xt_bb_ca_pair_dists", "bond_mask", "bond_order", "is_aromatic", "index_group_pair", "molecule_idx_pair", "molecule_entity_pair", "token_bond_path_length", "canonical_polymer_ordering", "na_ss_pair" ], "pair_size": 384, "recycle_conditioning_size": 1, "sequence_features": [ "xt_bb_ca", "xt_local_latents", "token_type", "sequence_probabilities", "cond_a37coors_nm", "cond_a37coors_internal_nm", "rasa_binned", "secondary_structure", "hbond_modernized", "pistack", "pication", "saltbridge", "hydrophobic", "metal_coord", "na_ss_state", "hotspot", "atom_charge", "atomic_element", "coord_group_seq", "chirality", "chain_centroid_xyz" ], "time_embedding_size": 256, "token_type_embedding_size": 32, "triangle_hidden_size": 256, "update_pair_every_n": 2 }, "dtype": "float32", "model_type": "rfd4_proteina", "product_flow": { "bb_ca": { "dim": 3, "guidance_enabled": true, "stochastic_centering_group_keys": [ "molecule_iid" ], "stochastic_centering_mode": "x_0", "stochastic_centering_scale": 0.2, "stochastic_centering_scope": "per_group", "zero_com_noise": true }, "local_latents": { "dim": 32, "guidance_enabled": true, "stochastic_centering_mode": "none", "stochastic_centering_scale": null, "zero_com_noise": false } }, "recycle_depths": [ 6, 6, 6, 6, 6, 5, 5, 5, 5, 5, 5, 5, 5, 5, 5, 4, 4, 4, 4, 4, 3, 3, 3, 3, 3, 3, 3, 3, 3, 3, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1 ], "sampler_args": { "bb_ca": { "gt": { "mode": "1/t" }, "schedule": { "mode": "log", "p": 2.0, "tail_step_multiplier": 2, "tail_steps": 10 }, "simulation_step_params": { "center_every_step": false, "sampling_mode": "vf_tsr", "sc_scale_noise": 1.0, "t_lim_ode": 0.95, "t_lim_ode_below": 0.02, "tsr_k": 16.0, "tsr_sigma": 3.0 } }, "local_latents": { "gt": { "mode": "tan" }, "schedule": { "mode": "power", "p": 2.0, "tail_step_multiplier": 2, "tail_steps": 10 }, "simulation_step_params": { "center_every_step": false, "sampling_mode": "vf_tsr", "sc_scale_noise": 1.0, "t_lim_ode": 0.95, "t_lim_ode_below": 0.02, "tsr_k": 4.0, "tsr_sigma": 12.0 } } }, "transformers_version": "5.18.0.dev0" }