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research/registry/claims.yaml

@@ -150,7 +150,8 @@
   created: '2026-08-23'
   updated: '2026-08-23'
 - id: CLAIM-AIR-001
-  claim: Ein standardisiertes ResearchPacket verbessert die Identifikation vorab definierter methodischer Fehler gegenüber einem unstrukturierten Experimentbericht.
+  claim: Ein standardisiertes ResearchPacket verbessert die Identifikation vorab definierter
+    methodischer Fehler gegenüber einem unstrukturierten Experimentbericht.
   research_question: RQ-AIR-001
   hypothesis: H-AIR-001-A
   evidence: []
@@ -166,7 +167,9 @@
   created: '2026-09-02'
   updated: '2026-09-02'
 - id: CLAIM-EVAL-006
-  claim: Unter dem eingefrorenen V2-Protokoll konformieren die deklarierten MHRN-Einzelzellverträge für Izhikevich-2003, lif-current-v1 und das separat klassifizierte Refractory-Semantik-Mapping mit der gematchten Brian2-2.10.1-Referenz innerhalb der präregistrierten Toleranzen.
+  claim: Unter dem eingefrorenen V2-Protokoll konformieren die deklarierten MHRN-Einzelzellverträge
+    für Izhikevich-2003, lif-current-v1 und das separat klassifizierte Refractory-Semantik-Mapping
+    mit der gematchten Brian2-2.10.1-Referenz innerhalb der präregistrierten Toleranzen.
   research_question: RQ-EVAL-006
   hypothesis: H-EVAL-006-A
   evidence:
@@ -186,3 +189,75 @@
   minimum_runs: 1
   created: '2026-09-18'
   updated: '2026-09-18'
+- id: CLAIM-S1-TOPO-001
+  claim: Unter kontrollierter Neuronenzahl, globalem Kantenbudget, Stimulus, Gewichten
+    und Delays verändern mindestens zwei vorab definierte Netzwerktopologien die registrierten
+    Propagationsmetriken innerhalb des definierten Stage-1-Small-SNN-Betriebsbereichs;
+    ein Vorteil einer 5D-Anordnung wird nicht vorausgesetzt.
+  research_question: RQ-SNN-003
+  hypothesis: H-SNN-003-B
+  evidence:
+  - EVID-2026-19
+  experiments:
+  - EXP-S1-TOPO-V2-20260918
+  - EXP-S1-TOPO-V3-R1-20260918
+  - EXP-S1-TOPO-PROMO-R1-20260927
+  sources:
+  - SRC-WATTS-STROGATZ-1998
+  - SRC-BARABASI-1999
+  status: inconclusive
+  confidence: low
+  required_evidence:
+  - preregistered_topology_propagation
+  - human_scientific_review
+  - evidence_engine_provenance
+  minimum_runs: 1
+  created: '2026-09-27'
+  updated: '2026-09-27'
+- id: CLAIM-S1-EFFICIENCY-001
+  claim: Im registrierten 64-Neuronen-Small-SNN-Regime kann eine spezifische 5D-Koordinatenorganisation
+    nach expliziter Kontrolle dynamischer Rekrutierung eine hoehere Propagations-Effizienz
+    als vorab definierte Kontrollen zeigen, operationalisiert durch activation_auc_0_32
+    pro Spike und pro geliefertem Event; dies ist kein Claim zu Speicherreduktion,
+    Informationskapazitaet oder allgemeiner 5D-Ueberlegenheit.
+  research_question: RQ-SNN-003
+  hypothesis: H-SNN-003-C
+  evidence: []
+  experiments: []
+  sources:
+  - SRC-OLSHAUSEN-FIELD-1996
+  - SRC-WATTS-STROGATZ-1998
+  - SRC-BARABASI-1999
+  status: untested
+  confidence: none
+  required_evidence:
+  - prospective_efficiency_preregistration
+  - dynamic_recruitment_controls
+  - paired_efficiency_endpoints
+  - multiplicity_control
+  - human_scientific_review
+  minimum_runs: 20
+  created: '2026-09-27'
+  updated: '2026-09-27'
+- id: CLAIM-S1-TEMP-001
+  claim: Unter dem registrierten sechsneuronigen Small-SNN-Task erzeugen unterscheidbare
+    Eingabekanäle eine decodierbare zeitliche Reihenfolge an den festgelegten Ausgängen,
+    während die identity-destroyed Kontrolle dieses feste Ordnungssignal entfernt.
+  research_question: RQ-TEMP-002
+  hypothesis: H-TEMP-002-A
+  evidence:
+  - EVID-2026-20
+  experiments:
+  - EXP-S1-TEMP-ORDER-V2-20260919
+  - EXP-S1-TEMP-PROMO-R1-20260927
+  sources: []
+  status: inconclusive
+  confidence: low
+  required_evidence:
+  - preregistered_temporal_order_task
+  - identity_destroyed_control
+  - human_scientific_review
+  - evidence_engine_provenance
+  minimum_runs: 1
+  created: '2026-09-27'
+  updated: '2026-09-27'

research/registry/evidence/EVID-2026-19.json

@@ -0,0 +1,107 @@
+{
+  "evidence_id": "EVID-2026-19",
+  "experiment_id": "EXP-S1-TOPO-PROMO-R1-20260927",
+  "claim_id": "CLAIM-S1-TOPO-001",
+  "hypothesis_id": "H-SNN-003-B",
+  "result_summary": "The prospective Stage-1 topology promotion replication reproduced the bounded topology-sensitive propagation result on predeclared fresh seeds 6301-6320 within the registered 64-neuron/246-edge Small-SNN operating envelope. Design integrity passed, the preregistered ceiling-resolution criterion passed, and all five first-output-latency replication contrasts reproduced the registered direction. The human review explicitly preserves the null findings and does not support 5D superiority.",
+  "effect_size": {
+    "activation_auc_0_32_median_delta": {
+      "1d_to_2d": 4.3984375,
+      "2d_to_3d": 1.3828125,
+      "3d_to_5d": -3.0703125,
+      "5d_to_5d_shuffled": -3.2890625,
+      "5d_to_random_graph": -2.4609375
+    },
+    "half_activation_latency_censored_median_delta": {
+      "1d_to_2d": -4.0,
+      "2d_to_3d": -2.0,
+      "3d_to_5d": 0.0,
+      "5d_to_5d_shuffled": 0.0,
+      "5d_to_random_graph": 0.0
+    },
+    "first_output_latency_censored_median_delta": {
+      "1d_to_2d": -10.0,
+      "2d_to_3d": -3.0,
+      "3d_to_5d": -1.0,
+      "5d_to_5d_shuffled": -3.0,
+      "5d_to_random_graph": -2.5
+    }
+  },
+  "statistical_significance": {},
+  "evidence_mode": "stochastic_experiment",
+  "verification": {
+    "preregistration_id": "PREREG-S1-TOPO-PROMO-R1",
+    "replication_class": "INTERNAL_PROMOTION_REPLICATION",
+    "design_integrity_passed": true,
+    "ceiling_resolution_supported": true,
+    "replication_supported": true,
+    "evaluation_runs": 120,
+    "evaluation_seeds": [
+      6301,
+      6302,
+      6303,
+      6304,
+      6305,
+      6306,
+      6307,
+      6308,
+      6309,
+      6310,
+      6311,
+      6312,
+      6313,
+      6314,
+      6315,
+      6316,
+      6317,
+      6318,
+      6319,
+      6320
+    ],
+    "historical_seed_disjoint": true,
+    "single_holm_family_primary_tests": true,
+    "null_findings_preserved": [
+      "half_activation_latency_censored 3d->5d not significant",
+      "half_activation_latency_censored 5d->5d_shuffled not significant",
+      "half_activation_latency_censored 5d->random_graph not significant under registered CI+Holm rule"
+    ],
+    "independent_authorship_replication": false,
+    "five_d_superiority_supported": false,
+    "source_freeze_sha": "5c66d953f66818a8bc6f49e8703b74cccd1ad3ee18c7a717ae6c1019dc090695",
+    "human_review": {
+      "experiment_id": "EXP-S1-TOPO-PROMO-R1-20260927",
+      "reviewer": "Thomas Heisig",
+      "decision": "supports",
+      "comments": "Der Human Review akzeptiert die eng begrenzte Aussage von CLAIM-S1-TOPO-001: Innerhalb des präregistrierten 64-Neuronen-/246-Kanten-Small-SNN-Betriebsbereichs erzeugen die registrierten, bei Neuronenzahl, globalem Kantenbudget, Stimulus, Gewichten und Delays gematchten Topologien reproduzierbare Unterschiede in den registrierten Propagationsmetriken. Die Entscheidung berücksichtigt ausdrücklich die nicht signifikanten half_activation_latency_censored-Kontraste 3d→5d und 5d→5d_shuffled sowie den nach Holm nicht signifikanten 5d→random_graph-Endpunkt; diese werden als begrenzte Sensitivität/Sättigung dieser Metrik in diesem Regime interpretiert und nicht verschwiegen. Die Entscheidung stützt keine 5D-Überlegenheit; insbesondere zeigen die Daten keinen allgemeinen Aktivierungsvorteil von 5D gegenüber 3D. Sie stützt weder Skalierung über 64 Neuronen hinaus noch Kognition, Lernen, Gedächtnis, biologische Gleichwertigkeit oder unabhängige externe Replikation. Der Lauf bleibt interne Promotion-Replikation; EVID-Promotion ist eine separate explizite Aktion.",
+      "reviewed_at": "2026-09-27T08:05:00+02:00",
+      "source_review_artifact": "review_request.json",
+      "source_review_summary": "External scientific assessment supplied in the human review concluded that the bounded claim is scientifically supportable while preserving the null findings and the no-5D-superiority boundary.",
+      "scope": "CLAIM-S1-TOPO-001 only",
+      "independent_authorship_replication": false,
+      "null_findings_preserved": [
+        "half_activation_latency_censored 3d->5d: not significant",
+        "half_activation_latency_censored 5d->5d_shuffled: not significant",
+        "half_activation_latency_censored 5d->random_graph: p_holm=0.0234375 but CI includes zero, therefore not significant under the registered rule"
+      ],
+      "prohibited_interpretations": [
+        "5D superiority",
+        "scaling beyond the registered 64-neuron operating envelope",
+        "cognition, learning or memory",
+        "biological equivalence",
+        "independent external replication"
+      ]
+    }
+  },
+  "status": "supports",
+  "limitations": "Internal promotion replication only. Scope is limited to the registered 64-neuron, 246-edge, weight-55, 128-tick Small-SNN operating envelope. No 5D superiority, no scaling claim, no cognition/learning/memory claim, no biological equivalence, and no independent external replication. The non-significant half-activation-latency contrasts are preserved.",
+  "artifacts": {
+    "figures": [],
+    "data_files": []
+  },
+  "generated": "2026-09-27T08:12:12.487861",
+  "experiment_validity": {
+    "valid": true,
+    "runtime_error_count": 0,
+    "fatal_error_count": 0
+  }
+}

research/registry/evidence/EVID-2026-20.json

@@ -0,0 +1,131 @@
+{
+  "evidence_id": "EVID-2026-20",
+  "experiment_id": "EXP-S1-TEMP-PROMO-R1-20260927",
+  "claim_id": "CLAIM-S1-TEMP-001",
+  "hypothesis_id": "H-TEMP-002-A",
+  "result_summary": "The prospective Stage-1 Temporal-Order promotion replication supported the bounded six-neuron two-channel temporal-order claim on 20 fresh predeclared paired seeds. The frozen decoder classifies three presented states: forward, reverse, and simultaneous. The reported forward/reverse intact accuracy median of 1.0 and identity-destroyed accuracy median of 0.0 refer to correct classification of the presented forward/reverse conditions; the simultaneous-control value of 1.0 is a separate simultaneous-class task-adequacy accuracy, not forward/reverse order accuracy. The paired forward/reverse delta median was 1.0 with bootstrap CI [1.0, 1.0], and the exact paired sign-test p-value was 1.9073486328125e-6. The human review explicitly records perfect-score saturation as a methodological limitation and does not extend the result to memory, cognition or general temporal reasoning.",
+  "effect_size": {
+    "intact_order_accuracy_median": 1,
+    "identity_destroyed_order_accuracy_median": 0,
+    "paired_accuracy_delta_median": 1,
+    "paired_accuracy_delta_bootstrap_ci95": [
+      1,
+      1
+    ],
+    "paired_sign_test_p": 0.0000019073486328125,
+    "intact_simultaneous_success_fraction": 1
+  },
+  "statistical_significance": {},
+  "evidence_mode": "stochastic_experiment",
+  "verification": {
+    "preregistration_id": "PREREG-S1-TEMP-PROMO-R1",
+    "replication_class": "INTERNAL_PROMOTION_REPLICATION",
+    "design_integrity_passed": true,
+    "evaluation_runs": 120,
+    "evaluation_seed_count": 20,
+    "historical_seed_disjoint": true,
+    "identity_destroyed_control_present": true,
+    "simultaneous_control_role": "non-inferential task-adequacy control",
+    "all_preregistered_gates_passed": true,
+    "perfect_score_saturation_noted": true,
+    "independent_authorship_replication": false,
+    "source_freeze_sha": "1239ada71c105c4caf69ac683e3caeb2a6580f5e012c004391c2f4247c73e706",
+    "human_review": {
+      "schema_version": 1,
+      "experiment_id": "EXP-S1-TEMP-PROMO-R1-20260927",
+      "reviewer": "Thomas Heisig",
+      "review_date": "2026-09-27",
+      "decision": "supports",
+      "decision_scope": "supports CLAIM-S1-TEMP-001 only within the frozen six-neuron, two-channel task",
+      "review_basis": {
+        "human_review": "The reviewer assessed the reported preregistered results and explicitly conditioned supports on clarification of the simultaneous-control semantics, documentation of perfect-score saturation, and preservation of the narrow claim boundary.",
+        "repository_verification": "The frozen preregistration, runner, statistics and raw evaluation data were subsequently checked against the stated conditions. This repository verification is not represented as additional human inspection."
+      },
+      "simultaneous_control_clarification": {
+        "status": "resolved_as_defined_task_adequacy_control",
+        "preregistered_role": "non-inferential task-adequacy control",
+        "decoder_rule": "simultaneous if first output_A spike and first output_B spike occur on the same tick",
+        "observed_behavior": "In intact simultaneous trials, both first output spikes occur on the same tick and decoded_order is simultaneous; therefore success_fraction=1.0 means correct detection of simultaneity, not 100% forward/reverse order accuracy.",
+        "interpretation": "The value 1.0 is not a chance-level order-decoding result and does not by itself indicate a non-temporal shortcut. It verifies that the frozen decoder distinguishes the simultaneous case as designed.",
+        "residual_methodological_question": "Because all intact forward/reverse trials and all simultaneous controls are perfectly classified across the registered seeds, the task may be too easy to discriminate temporal coding from simpler deterministic path-following or decoder shortcuts under harder perturbations."
+      },
+      "perfect_score_limitation": {
+        "status": "explicit_limitation",
+        "observation": "Intact forward/reverse accuracy=1.0, identity-destroyed accuracy=0.0, paired delta=1.0 and bootstrap CI=[1.0,1.0] across all 20 seeds.",
+        "consequence": "The result establishes the bounded task behavior but does not quantify robustness margin, mechanism uniqueness, generalization, or difficulty scaling. Ceiling/floor saturation reduces mechanistic resolution."
+      },
+      "verified_results": {
+        "evaluation_runs": 120,
+        "seeds": 20,
+        "design_integrity_passed": true,
+        "intact_order_accuracy_median": 1,
+        "identity_destroyed_order_accuracy_median": 0,
+        "intact_simultaneous_success_fraction": 1,
+        "paired_accuracy_delta_median": 1,
+        "paired_accuracy_delta_ci95": [
+          1,
+          1
+        ],
+        "paired_sign_test_p": 0.0000019073486328125,
+        "all_preregistered_gates_passed": true
+      },
+      "allowed_interpretation": "Within the registered six-neuron acyclic two-channel Small-SNN task and frozen decoder, preserving logical A/B channel identity supports correct decoding of the fixed forward/reverse temporal order, while the matched identity-destroyed arm removes that order signal. The simultaneous control behaves as preregistered by producing equal first-output ticks and the decoder label simultaneous.",
+      "prohibited_interpretations": [
+        "learning",
+        "memory or order memory",
+        "cognition",
+        "general temporal reasoning",
+        "biological equivalence",
+        "scaling beyond the six-neuron task",
+        "5D superiority",
+        "independent external replication",
+        "mechanistic uniqueness of temporal coding",
+        "robustness to harder perturbations not tested here"
+      ],
+      "limitations": [
+        "The task is intentionally very small: six neurons, four synapses and two logical channels.",
+        "Perfect ceiling/floor separation across all seeds may reflect a task that is too easy to resolve robustness margin or exclude all shortcut strategies.",
+        "The simultaneous control is a preregistered task-adequacy control, not an inferential order-accuracy endpoint.",
+        "The identity-destroyed arm collapses both logical events onto physical input_A; it proves dependence on channel identity under this task but does not identify a unique neural mechanism.",
+        "This is an internal promotion replication and not independent scientific replication."
+      ],
+      "follow_up_required": {
+        "status": "open_methodological_follow_up",
+        "purpose": "stress-test decoder/task internal validity without modifying the present evidence",
+        "suggested_tests": [
+          "jitter the forward/reverse gap while freezing decoder rules prospectively",
+          "swap physical channel labels after network construction to test label shortcuts",
+          "introduce balanced amplitude/current perturbations that are independent of logical order",
+          "add near-simultaneous nonzero gaps to measure temporal resolution instead of only perfect separation",
+          "use a held-out decoder or blinded decoder mapping where feasible"
+        ],
+        "evidence_role": "exploratory planning only; not required to reinterpret or invalidate the current bounded claim unless a prospective follow-up contradicts it"
+      },
+      "automatic_evidence_promotion": false,
+      "explicit_evidence_promotion_permitted_after_review": true,
+      "independent_authorship_replication": false,
+      "comments": "Supports the narrowly scoped claim under the frozen preregistered protocol. The simultaneous-control value of 1.0 is clarified as correct simultaneous-class detection, not order accuracy. Perfect-score saturation remains a material limitation and motivates a separate prospective decoder/task stress test. No learning, memory, cognition, scaling, biological-equivalence or general temporal-reasoning claim is supported."
+    },
+    "decoder_class_semantics": {
+      "classes": [
+        "forward",
+        "reverse",
+        "simultaneous"
+      ],
+      "forward_reverse_accuracy": "accuracy for correctly classifying the presented forward/reverse condition",
+      "simultaneous_accuracy": "separate accuracy for correctly classifying the presented simultaneous condition; not forward/reverse order accuracy"
+    }
+  },
+  "status": "supports",
+  "limitations": "Internal promotion replication only. Scope is limited to the registered six-neuron, four-synapse, two-channel acyclic Small-SNN task and the frozen decoder. Perfect ceiling/floor separation limits mechanistic resolution and motivates a separate prospective stress test. No learning, memory, order memory, cognition, general temporal reasoning, biological equivalence, scaling, 5D superiority or independent external replication is established.",
+  "artifacts": {
+    "figures": [],
+    "data_files": []
+  },
+  "generated": "2026-09-27T08:41:53.662660",
+  "experiment_validity": {
+    "valid": true,
+    "runtime_error_count": 0,
+    "fatal_error_count": 0
+  }
+}

research/registry/hypotheses.yaml

@@ -34,10 +34,22 @@
   hypothesis: Unter gleicher Neuronenzahl, Dichte und Stimulusbedingung unterscheiden
     sich Propagationslatenz oder -reichweite zwischen mindestens zwei vorab definierten
     Topologien; ein Vorteil einer 5D-Anordnung wird nicht vorausgesetzt.
-  status: untested
-  evidence: []
+  status: inconclusive
+  evidence:
+  - EVID-2026-19
   created: '2026-09-11'
   updated: '2026-09-11'
+- id: H-SNN-003-C
+  research_question: RQ-SNN-003
+  hypothesis: Unter dem registrierten 64-Neuronen-Small-SNN-Regime zeigt die 5D-Koordinatenorganisation
+    nach Kontrolle der dynamischen Rekrutierung eine höhere Propagations-Effizienz
+    als vorab definierte 3D-, 5D-shuffled- und Random-Graph-Kontrollen, operationalisiert
+    als activation_auc_0_32 pro Spike und pro geliefertem Event; ein allgemeiner 5D-Vorteil
+    wird nicht behauptet.
+  status: untested
+  evidence: []
+  created: '2026-09-27'
+  updated: '2026-09-27'
 - id: H-SNN-004-A
   research_question: RQ-SNN-004
   hypothesis: STDP führt zu einer meßbaren asymmetrischen Verschiebung der synaptischen
@@ -56,28 +68,32 @@
   updated: '2026-08-23'
 - id: H-PING-001-A
   research_question: RQ-PING-001
-  hypothesis: Identische Impulse erzeugen bei identischem Anfangszustand dieselbe beobachtete Response-Signatur.
+  hypothesis: Identische Impulse erzeugen bei identischem Anfangszustand dieselbe
+    beobachtete Response-Signatur.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-03'
   updated: '2026-09-03'
 - id: H-TEMP-001-A
   research_question: RQ-TEMP-001
-  hypothesis: Die Temporal-State-Vergleiche unterscheiden sich deterministisch nach FAST-, MEDIUM- und SLOW-Horizont.
+  hypothesis: Die Temporal-State-Vergleiche unterscheiden sich deterministisch nach
+    FAST-, MEDIUM- und SLOW-Horizont.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-03'
   updated: '2026-09-03'
 - id: H-TIME-001-A
   research_question: RQ-TIME-001
-  hypothesis: Die Tick-Leiter liefert reproduzierbare Durchsatz- und Zustandsmessungen bis 1.000.000 Ticks.
+  hypothesis: Die Tick-Leiter liefert reproduzierbare Durchsatz- und Zustandsmessungen
+    bis 1.000.000 Ticks.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-03'
   updated: '2026-09-03'
 - id: H-REG-001-A
   research_question: RQ-REG-001
-  hypothesis: Chronischer Druck erhöht deterministisch Resource Pressure und Thermal Threat, während unbekannte Telemetrie Unsicherheit erhält.
+  hypothesis: Chronischer Druck erhöht deterministisch Resource Pressure und Thermal
+    Threat, während unbekannte Telemetrie Unsicherheit erhält.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-03'
@@ -264,123 +280,147 @@
   updated: '2026-08-23'
 - id: H-EPIST-002-A
   research_question: RQ-EPIST-002
-  hypothesis: Reviewer mit einem status- und provenienzgetrennten Claim-Paket weisen gegenueber einem inhaltlich aequivalenten abgeflachten Summary-Paket eine geringere Rate vorab definierter epistemischer Klassifikationsfehler auf.
+  hypothesis: Reviewer mit einem status- und provenienzgetrennten Claim-Paket weisen
+    gegenueber einem inhaltlich aequivalenten abgeflachten Summary-Paket eine geringere
+    Rate vorab definierter epistemischer Klassifikationsfehler auf.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-19'
   updated: '2026-09-19'
 - id: H-AIR-001-A
   research_question: RQ-AIR-001
-  hypothesis: Ein Scientific Research Assistant mit strukturiertem ResearchPacket erkennt vorab definierte methodische Defekte mit höherem F1-Score als dasselbe Modell mit einem unstrukturierten Experimentbericht.
+  hypothesis: Ein Scientific Research Assistant mit strukturiertem ResearchPacket
+    erkennt vorab definierte methodische Defekte mit höherem F1-Score als dasselbe
+    Modell mit einem unstrukturierten Experimentbericht.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-02'
   updated: '2026-09-02'
-
 - id: H-SUITE-001-A
   research_question: RQ-SUITE-001
-  hypothesis: Alle Science-Suite-Teilprotokolle erfuellen in einem gemeinsamen Lauf ihre registrierten Ausfuehrungsvertraege und erzeugen auswertbare DATA-, Statistik- und Provenienzartefakte.
+  hypothesis: Alle Science-Suite-Teilprotokolle erfuellen in einem gemeinsamen Lauf
+    ihre registrierten Ausfuehrungsvertraege und erzeugen auswertbare DATA-, Statistik-
+    und Provenienzartefakte.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
-
 - id: H-REC-001-A
   research_question: RQ-REC-001
-  hypothesis: Rekurrenzgewicht und Delay erzeugen reproduzierbare Übergänge zwischen sofortigem Erlöschen, transienter Aktivität und Aktivität bis zum Ende des registrierten Beobachtungsfensters.
+  hypothesis: Rekurrenzgewicht und Delay erzeugen reproduzierbare Übergänge zwischen
+    sofortigem Erlöschen, transienter Aktivität und Aktivität bis zum Ende des registrierten
+    Beobachtungsfensters.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
 - id: H-GEN-001-A
   research_question: RQ-GEN-001
-  hypothesis: Learning-on verbessert die Erfolgsrate auf vorab registrierten Perturbationsproben gegenüber Learning-off und Sham-Replay.
+  hypothesis: Learning-on verbessert die Erfolgsrate auf vorab registrierten Perturbationsproben
+    gegenüber Learning-off und Sham-Replay.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
 - id: H-REPL-001-A
   research_question: RQ-REPL-001
-  hypothesis: Der Rekurrenzbehandlungseffekt bleibt über mindestens 20 vorab registrierte Initialisierungsseeds in Richtung und Größenordnung konsistent.
+  hypothesis: Der Rekurrenzbehandlungseffekt bleibt über mindestens 20 vorab registrierte
+    Initialisierungsseeds in Richtung und Größenordnung konsistent.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
 - id: H-5D-005-A
   research_question: RQ-5D-005
-  hypothesis: Mindestens eine registrierte Propagationsmetrik unterscheidet sich in 5D von topology-matched niedrigdimensionalen Einbettungen.
+  hypothesis: Mindestens eine registrierte Propagationsmetrik unterscheidet sich in
+    5D von topology-matched niedrigdimensionalen Einbettungen.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
 - id: H-REG-002-A
   research_question: RQ-REG-002
-  hypothesis: Der registrierte Regulationsfeedbackpfad verbessert die Recovery-Metrik nach einer identischen Druckphase gegenüber Regulation-off.
+  hypothesis: Der registrierte Regulationsfeedbackpfad verbessert die Recovery-Metrik
+    nach einer identischen Druckphase gegenüber Regulation-off.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
 - id: H-TEMP-002-A
   research_question: RQ-TEMP-002
-  hypothesis: Forward-, Reverse- und Simultanfolgen erzeugen bei gleicher Ereignisanzahl unterscheidbare spike-basierte Antwortsignaturen.
-  status: untested
-  evidence: []
+  hypothesis: Forward-, Reverse- und Simultanfolgen erzeugen bei gleicher Ereignisanzahl
+    unterscheidbare spike-basierte Antwortsignaturen.
+  status: inconclusive
+  evidence:
+  - EVID-2026-20
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
 - id: H-PERF-001-A
   research_question: RQ-PERF-001
-  hypothesis: Der Core-Tick-Loop ist nicht der einzige dominante Kostenblock vollständiger Science-Läufe; mindestens ein zusätzlicher gemessener Subsystemanteil ist relevant.
+  hypothesis: Der Core-Tick-Loop ist nicht der einzige dominante Kostenblock vollständiger
+    Science-Läufe; mindestens ein zusätzlicher gemessener Subsystemanteil ist relevant.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
 - id: H-REC-002-A
   research_question: RQ-REC-002
-  hypothesis: Größere rekurrente Delays verändern Persistenzdauer oder Propagation Depth gegenüber dem Delay-1-Kontrollarm.
+  hypothesis: Größere rekurrente Delays verändern Persistenzdauer oder Propagation
+    Depth gegenüber dem Delay-1-Kontrollarm.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
 - id: H-LIFE-001-A
   research_question: RQ-LIFE-001
-  hypothesis: Sequenzielle Lernaufgaben zeigen eine messbare Veränderung der Retentions- oder Gewichtssignatur gegenüber einer Single-Task-Baseline.
+  hypothesis: Sequenzielle Lernaufgaben zeigen eine messbare Veränderung der Retentions-
+    oder Gewichtssignatur gegenüber einer Single-Task-Baseline.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
-
 - id: H-SNN-006-A
   research_question: RQ-SNN-006
-  hypothesis: Alle zehn vorab registrierten, unterschiedlichen seed-gebundenen Parameterrealisierungen bleiben ueber 100.000 Ticks numerisch und topologisch stabil; unter gepaartem Tonic-Drive bleibt die post-burn-in Aktivitaet positiv mit CV und relativer Drift jeweils <= 0.25.
+  hypothesis: Alle zehn vorab registrierten, unterschiedlichen seed-gebundenen Parameterrealisierungen
+    bleiben ueber 100.000 Ticks numerisch und topologisch stabil; unter gepaartem
+    Tonic-Drive bleibt die post-burn-in Aktivitaet positiv mit CV und relativer Drift
+    jeweils <= 0.25.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-16'
   updated: '2026-09-16'
-
 - id: H-ETH-001-B
   research_question: RQ-ETH-001
-  hypothesis: Vollständige Provenienzketten erlauben unabhängigen Kodierern, materielle epistemische Beiträge von Mensch, Modell und Software reproduzierbar definierten Rollen zuzuordnen.
+  hypothesis: Vollständige Provenienzketten erlauben unabhängigen Kodierern, materielle
+    epistemische Beiträge von Mensch, Modell und Software reproduzierbar definierten
+    Rollen zuzuordnen.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-18'
   updated: '2026-09-18'
 - id: H-ETH-001-C
   research_question: RQ-ETH-001
-  hypothesis: Kanonisierung ist eine von der bloßen Generierung trennbare epistemische Handlung und lässt sich in MHRN-Claim-Episoden als Auswahl-, Prüf- oder Freigabeentscheidung identifizieren.
+  hypothesis: Kanonisierung ist eine von der bloßen Generierung trennbare epistemische
+    Handlung und lässt sich in MHRN-Claim-Episoden als Auswahl-, Prüf- oder Freigabeentscheidung
+    identifizieren.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-18'
   updated: '2026-09-18'
 - id: H-ETH-001-D
   research_question: RQ-ETH-001
-  hypothesis: Unter gegenwärtigen Forschungsintegritäts- und Publikationsstandards verbleiben formale wissenschaftliche Autorenschaft und Verantwortung bei verantwortlichen natürlichen Personen, auch wenn KI-Systeme materiell beitragen.
+  hypothesis: Unter gegenwärtigen Forschungsintegritäts- und Publikationsstandards
+    verbleiben formale wissenschaftliche Autorenschaft und Verantwortung bei verantwortlichen
+    natürlichen Personen, auch wenn KI-Systeme materiell beitragen.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-18'
   updated: '2026-09-18'
 - id: H-ETH-001-E
   research_question: RQ-ETH-001
-  hypothesis: Eine mehrdimensionale Beitrags- und Verantwortungsmatrix erhöht bei denselben Claim-Episoden die Audit-Vollständigkeit gegenüber einer binären Autor-Werkzeug-Klassifikation, ohne die Reproduzierbarkeit der Kodierung zu verschlechtern.
+  hypothesis: Eine mehrdimensionale Beitrags- und Verantwortungsmatrix erhöht bei
+    denselben Claim-Episoden die Audit-Vollständigkeit gegenüber einer binären Autor-Werkzeug-Klassifikation,
+    ohne die Reproduzierbarkeit der Kodierung zu verschlechtern.
   status: untested
   evidence: []
   created: '2026-09-18'

research/registry/questions.yaml

@@ -54,24 +54,30 @@
 - id: RQ-SNN-003
   domain: Spiking Neural Networks
   question: Wie variiert die Propagation mit der Topologie?
-  relevance: Grundlegendes Verständnis der Signalausbreitung in multidimensionalen SNNs.
+  relevance: Grundlegendes Verständnis der Signalausbreitung in multidimensionalen
+    SNNs.
   literature:
   - SRC-WATTS-STROGATZ-1998
   - SRC-BARABASI-1999
+  - SRC-OLSHAUSEN-FIELD-1996
   hypotheses:
   - H-SNN-003-B
-  evidence: []
-  status: open
-  answer:
-    current: EXP-S1-TOPO-V2-20260918 und EXP-S1-TOPO-V3-R1-20260918 bilden
-      gemeinsam die kanonische Stage-1-Topologie-DATA-Linie. Beide Human Reviews
-      durch Thomas Heisig akzeptieren die begrenzte Interpretation. Die DATA sind
-      nicht als EVID promotet.
-    confidence: replicated_internal_data_human_reviewed_evid_not_promoted
-    limitations: Interne Replikation ist keine unabhängige externe Replikation.
-      Die historischen V2/R1-Manifeste erfüllen den aktuellen EvidenceEngine-
-      Promotionsvertrag nicht vollständig und werden nicht rückwirkend umgeschrieben.
-      Kein 5D-Vorteilsclaim; H-5D-005-A bleibt separat open/untested.
+  - H-SNN-003-C
+  evidence:
+  - EVID-2026-19
+  status: inconclusive
+  answer:
+    current: CLAIM-S1-TOPO-001 besitzt seit EXP-S1-TOPO-PROMO-R1-20260927 kanonische
+      EVID (EVID-2026-19) fuer die eng begrenzte Aussage, dass Topologie im registrierten
+      64-Neuronen-/246-Kanten-Regime Propagationsmetriken veraendert. Eine nachtraeglich
+      beobachtete AUC-pro-Spike/-Event-Systematik wird getrennt als explorative Motivation
+      fuer H-SNN-003-C gefuehrt und ist keine EVID.
+    confidence: bounded_topology_evid_efficiency_hypothesis_untested
+    limitations: EVID-2026-19 belegt keine 5D-Ueberlegenheit. AUC-pro-Spike und AUC-pro-Event
+      waren nicht als primaere Endpunkte preregistriert. Die 5D-Bedingung belegt im
+      aktuellen 4x2x2x2x2-Layout alle 64 Koordinaten; geringere final_active_fraction
+      ist dynamische Rekrutierung, nicht strukturelle Adressraum-Occupancy. H-SNN-003-C
+      bleibt bis zu einer neuen prospektiven Studie untested.
   created: '2026-08-23'
   updated: '2026-09-25'
 - id: RQ-SNN-004
@@ -111,8 +117,10 @@
   updated: '2026-08-23'
 - id: RQ-PING-001
   domain: Network Dynamics
-  question: Ist die beobachtete Network-Impulse-Response bei identischem Zustand und Seed reproduzierbar?
+  question: Ist die beobachtete Network-Impulse-Response bei identischem Zustand und
+    Seed reproduzierbar?
   relevance: Reproduzierbarkeit der kontrollierten Impulsantwort.
+  literature: []
   hypotheses:
   - H-PING-001-A
   evidence: []
@@ -125,8 +133,10 @@
   updated: '2026-09-03'
 - id: RQ-TEMP-001
   domain: Temporal State
-  question: Wie unterscheiden sich FAST-, MEDIUM- und SLOW-Referenzzustände unter identischer Ausführung?
+  question: Wie unterscheiden sich FAST-, MEDIUM- und SLOW-Referenzzustände unter
+    identischer Ausführung?
   relevance: Messung von Persistenz und Zustandsdrift ohne Runtime-Zurückspulen.
+  literature: []
   hypotheses:
   - H-TEMP-001-A
   evidence: []
@@ -139,8 +149,10 @@
   updated: '2026-09-03'
 - id: RQ-TIME-001
   domain: Learning Timescale
-  question: Wie verändert sich die messbare Laufzeit und Lernaktivität über die registrierte Tick-Leiter?
+  question: Wie verändert sich die messbare Laufzeit und Lernaktivität über die registrierte
+    Tick-Leiter?
   relevance: Kalibrierung der zeitlichen Ausführung vor Langzeitexperimenten.
+  literature: []
   hypotheses:
   - H-TIME-001-A
   evidence: []
@@ -153,8 +165,10 @@
   updated: '2026-09-03'
 - id: RQ-REG-001
   domain: Regulation
-  question: Wie reagieren Drives und funktionale Zustandsgrößen auf nominale, chronische und unbekannte Telemetrie?
+  question: Wie reagieren Drives und funktionale Zustandsgrößen auf nominale, chronische
+    und unbekannte Telemetrie?
   relevance: Deterministische Prüfung der Selbstregulation unter Ressourcen- und Sensorbedingungen.
+  literature: []
   hypotheses:
   - H-REG-001-A
   evidence: []
@@ -471,8 +485,10 @@
   updated: '2026-08-23'
 - id: RQ-ETH-001
   domain: Ethics
-  question: Wie verteilen sich epistemische Beiträge, Entscheidungsmacht, formale Autorenschaft und wissenschaftliche Verantwortung bei Human–AI-gestützter MHRN-Forschung?
-  relevance: Trennt Beitragsprovenienz, Generierung, Kanonisierung, formale Autorenschaft und Verantwortung, statt maschinelle Beteiligung mit Autorenschaft gleichzusetzen.
+  question: Wie verteilen sich epistemische Beiträge, Entscheidungsmacht, formale
+    Autorenschaft und wissenschaftliche Verantwortung bei Human–AI-gestützter MHRN-Forschung?
+  relevance: Trennt Beitragsprovenienz, Generierung, Kanonisierung, formale Autorenschaft
+    und Verantwortung, statt maschinelle Beteiligung mit Autorenschaft gleichzusetzen.
   literature: []
   hypotheses:
   - H-ETH-001-A
@@ -485,7 +501,9 @@
   answer:
     current: null
     confidence: none
-    limitations: Am 2026-09-18 aus der Legacy-Frage zur binären Autorenschaft präzisiert. Ältere Explorations- und Boundary-Audit-Artefakte beziehen sich auf die frühere Formulierung und sind keine direkte Evidenz für H-ETH-001-B bis H-ETH-001-E.
+    limitations: Am 2026-09-18 aus der Legacy-Frage zur binären Autorenschaft präzisiert.
+      Ältere Explorations- und Boundary-Audit-Artefakte beziehen sich auf die frühere
+      Formulierung und sind keine direkte Evidenz für H-ETH-001-B bis H-ETH-001-E.
   created: '2026-08-23'
   updated: '2026-09-18'
 - id: RQ-ETH-002
@@ -522,8 +540,11 @@
   updated: '2026-08-23'
 - id: RQ-EPIST-002
   domain: Epistemology
-  question: Unter welchen Bedingungen reduziert eine explizite Trennung von Quelle, Entscheidung, Ausfuehrung, DATA, Review, EVID und Claim epistemische Fehlklassifikationen in schnell iterierender, KI-assistierter MHRN-Forschung?
-  relevance: Macht die epistemologisch-methodische Achse selbst prospektiv pruefbar, statt Prozessverbesserung aus einzelnen Korrekturereignissen abzuleiten.
+  question: Unter welchen Bedingungen reduziert eine explizite Trennung von Quelle,
+    Entscheidung, Ausfuehrung, DATA, Review, EVID und Claim epistemische Fehlklassifikationen
+    in schnell iterierender, KI-assistierter MHRN-Forschung?
+  relevance: Macht die epistemologisch-methodische Achse selbst prospektiv pruefbar,
+    statt Prozessverbesserung aus einzelnen Korrekturereignissen abzuleiten.
   literature: []
   hypotheses:
   - H-EPIST-002-A
@@ -532,13 +553,18 @@
   answer:
     current: null
     confidence: none
-    limitations: Die historischen Korrekturfaelle motivieren das Design, sind aber keine konfirmatorische Evidenz fuer einen kausalen Governance-Nutzen. Das Vergleichsprotokoll ist noch nicht praeregistriert oder autorisiert.
+    limitations: Die historischen Korrekturfaelle motivieren das Design, sind aber
+      keine konfirmatorische Evidenz fuer einen kausalen Governance-Nutzen. Das Vergleichsprotokoll
+      ist noch nicht praeregistriert oder autorisiert.
   created: '2026-09-19'
   updated: '2026-09-19'
 - id: RQ-AIR-001
   domain: AI-Assisted Research
-  question: Kann ein LLM-basierter Scientific Research Assistant methodische Fehler in Brain-5D-Experimenten anhand eines standardisierten ResearchPacket zuverlässig identifizieren?
-  relevance: Prüft den wissenschaftlichen Nutzen der Research-Assistant-Architektur, ohne ihr wissenschaftliche Entscheidungsgewalt zu geben.
+  question: Kann ein LLM-basierter Scientific Research Assistant methodische Fehler
+    in Brain-5D-Experimenten anhand eines standardisierten ResearchPacket zuverlässig
+    identifizieren?
+  relevance: Prüft den wissenschaftlichen Nutzen der Research-Assistant-Architektur,
+    ohne ihr wissenschaftliche Entscheidungsgewalt zu geben.
   literature: []
   hypotheses:
   - H-AIR-001-A
@@ -550,11 +576,13 @@
     limitations: null
   created: '2026-09-02'
   updated: '2026-09-02'
-
 - id: RQ-SUITE-001
   domain: Research Infrastructure
-  question: Erzeugt der vollstaendige Science-Suite-Lauf unter gemeinsamer Provenienz vollstaendige und intern konsistente Diagnoseartefakte fuer alle registrierten Teilprotokolle?
-  relevance: Trennt technische Omnibus-Validierung von hypothesenspezifischer wissenschaftlicher Evidenz.
+  question: Erzeugt der vollstaendige Science-Suite-Lauf unter gemeinsamer Provenienz
+    vollstaendige und intern konsistente Diagnoseartefakte fuer alle registrierten
+    Teilprotokolle?
+  relevance: Trennt technische Omnibus-Validierung von hypothesenspezifischer wissenschaftlicher
+    Evidenz.
   literature: []
   hypotheses:
   - H-SUITE-001-A
@@ -563,14 +591,17 @@
   answer:
     current: null
     confidence: none
-    limitations: Omnibus-Diagnostik ist keine Primaerevidenz fuer die enthaltenen Fach-RQs.
+    limitations: Omnibus-Diagnostik ist keine Primaerevidenz fuer die enthaltenen
+      Fach-RQs.
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
-
 - id: RQ-REC-001
   domain: Recurrent Dynamics
-  question: Unter welchen Rekurrenzgewichten und Delays wechselt Brain-5D zwischen sofortigem Erlöschen, transienter rekurrenter Aktivität und bis zum Beobachtungsende persistierender Aktivität?
-  relevance: EXP-GEN-0021 zeigte einen klaren rekurrenzabhängigen Dynamikunterschied, aber noch keine Parametergrenze.
+  question: Unter welchen Rekurrenzgewichten und Delays wechselt Brain-5D zwischen
+    sofortigem Erlöschen, transienter rekurrenter Aktivität und bis zum Beobachtungsende
+    persistierender Aktivität?
+  relevance: EXP-GEN-0021 zeigte einen klaren rekurrenzabhängigen Dynamikunterschied,
+    aber noch keine Parametergrenze.
   literature: []
   hypotheses:
   - H-REC-001-A
@@ -579,13 +610,16 @@
   answer:
     current: null
     confidence: none
-    limitations: Abgeleitet aus EXP-GEN-0021; persistente Aktivität ist nicht gleichbedeutend mit Gedächtnis oder Kognition.
+    limitations: Abgeleitet aus EXP-GEN-0021; persistente Aktivität ist nicht gleichbedeutend
+      mit Gedächtnis oder Kognition.
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
 - id: RQ-GEN-001
   domain: Learning Generalization
-  question: Verbessert reward-moduliertes lokales Lernen die Leistung auf Holdout- und Perturbationsbedingungen, die nicht zur Anpassung verwendet wurden?
-  relevance: EXP-GEN-0021 zeigte funktionelle Änderung unter Learning-on, aber keine Generalisierung.
+  question: Verbessert reward-moduliertes lokales Lernen die Leistung auf Holdout-
+    und Perturbationsbedingungen, die nicht zur Anpassung verwendet wurden?
+  relevance: EXP-GEN-0021 zeigte funktionelle Änderung unter Learning-on, aber keine
+    Generalisierung.
   literature: []
   hypotheses:
   - H-GEN-001-A
@@ -594,13 +628,16 @@
   answer:
     current: null
     confidence: none
-    limitations: Generalisierung muss gegenüber Learning-off und Sham-Replay getrennt werden.
+    limitations: Generalisierung muss gegenüber Learning-off und Sham-Replay getrennt
+      werden.
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
 - id: RQ-REPL-001
   domain: Replication
-  question: Bleiben die in EXP-GEN-0021 beobachteten Rekurrenz- und Learning-Effekte unter unabhängigen Initialisierungen und sauberem Prozess erhalten?
-  relevance: Identische Seedsignaturen zeigen Determinismus, aber keine statistisch unabhängige Replikation.
+  question: Bleiben die in EXP-GEN-0021 beobachteten Rekurrenz- und Learning-Effekte
+    unter unabhängigen Initialisierungen und sauberem Prozess erhalten?
+  relevance: Identische Seedsignaturen zeigen Determinismus, aber keine statistisch
+    unabhängige Replikation.
   literature: []
   hypotheses:
   - H-REPL-001-A
@@ -609,13 +646,17 @@
   answer:
     current: null
     confidence: none
-    limitations: Replikation erfordert echte Variation der Initialisierung und einen Clean Freeze.
+    limitations: Replikation erfordert echte Variation der Initialisierung und einen
+      Clean Freeze.
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
 - id: RQ-5D-005
   domain: 5D Topology
-  question: Verändert 5D-Geometrie Propagation, Robustheit oder Dynamik, wenn Neuronenzahl, Synapsenzahl, Grad- und Gewichtsmuster sowie Stimulusplan kontrolliert gleich bleiben?
-  relevance: Der kleine 5D-Test in EXP-GEN-0021 isolierte keinen dimensionsspezifischen Effekt.
+  question: Verändert 5D-Geometrie Propagation, Robustheit oder Dynamik, wenn Neuronenzahl,
+    Synapsenzahl, Grad- und Gewichtsmuster sowie Stimulusplan kontrolliert gleich
+    bleiben?
+  relevance: Der kleine 5D-Test in EXP-GEN-0021 isolierte keinen dimensionsspezifischen
+    Effekt.
   literature: []
   hypotheses:
   - H-5D-005-A
@@ -624,13 +665,17 @@
   answer:
     current: null
     confidence: none
-    limitations: Der erste operationalisierte Test hält die Graphstruktur bewusst klein und identisch.
+    limitations: Der erste operationalisierte Test hält die Graphstruktur bewusst
+      klein und identisch.
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
 - id: RQ-REG-002
   domain: Closed-loop Regulation
-  question: Verbessert aktive Regulation Stabilität und Recovery eines laufenden SNN unter identischen Ressourcen- oder Sensorperturbationen gegenüber deaktivierter Regulation?
-  relevance: EXP-GEN-0021 validierte Regulationszustände, aber noch keinen funktionalen Closed-loop-Nutzen.
+  question: Verbessert aktive Regulation Stabilität und Recovery eines laufenden SNN
+    unter identischen Ressourcen- oder Sensorperturbationen gegenüber deaktivierter
+    Regulation?
+  relevance: EXP-GEN-0021 validierte Regulationszustände, aber noch keinen funktionalen
+    Closed-loop-Nutzen.
   literature: []
   hypotheses:
   - H-REG-002-B
@@ -640,35 +685,33 @@
   answer:
     current: null
     confidence: none
-    limitations: Der Feedbackpfad muss als technische Intervention und nicht als Emotion interpretiert werden.
+    limitations: Der Feedbackpfad muss als technische Intervention und nicht als Emotion
+      interpretiert werden.
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
 - id: RQ-TEMP-002
   domain: Temporal Learning
-  question: Reagiert Brain-5D auf spike-tragende zeitliche Reihenfolge anders als auf umgekehrte oder simultane Kontrollfolgen?
+  question: Reagiert Brain-5D auf spike-tragende zeitliche Reihenfolge anders als
+    auf umgekehrte oder simultane Kontrollfolgen?
   relevance: EXP-GEN-0021 zeigte Temporal-State-Diskrepanzen ohne Spike-Aktivität.
   literature: []
   hypotheses:
   - H-TEMP-002-A
-  evidence: []
-  status: open
+  evidence:
+  - EVID-2026-20
+  status: inconclusive
   answer:
-    current: EXP-S1-TEMP-ORDER-V2-20260919 liefert präregistrierte Stage-1-DATA
-      aus 120 Läufen über 20 Seeds mit identity-destroyed Kontrolle. Der Laufstatus
-      ist SUPPORTED_WITHIN_PREREGISTERED_PROTOCOL. Der Human Review durch Thomas
-      Heisig ist mit accepted_as_interpretation abgeschlossen; EVID-Promotion und
-      unabhängige Replikation stehen separat aus.
-    confidence: preregistered_task_data_human_reviewed_evid_not_promoted
-    limitations: Der Befund ist eine eng begrenzte Small-SNN-Funktionslinie.
-      Er belegt weder Lernen, Gedächtnis, allgemeines zeitliches Schlussfolgern,
-      Skalierbarkeit noch unabhängige Replikation und ist keine Replikation der
-      Topologie-DATA-Linie.
+    current: EXP-S1-TEMP-PROMO-R1-20260927 reproduced the bounded six-neuron two-channel temporal-order task on 20 fresh paired seeds under the current EvidenceEngine provenance contract. The canonical Human Review decision is supports with explicit perfect-score saturation and decoder/task limitations. Explicit promotion created EVID-2026-20. The historical V2 run remains reviewed DATA.
+    confidence: bounded_temporal_order_evid_with_methodological_limitations
+    limitations: The simultaneous condition is a non-inferential task-adequacy control, not forward/reverse order accuracy. Perfect ceiling/floor separation limits mechanistic resolution and motivates a separate prospective decoder stress test. No learning, memory, general temporal reasoning, cognition, scaling, biological equivalence or independent replication is established.
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-25'
 - id: RQ-PERF-001
   domain: Runtime Performance
-  question: Welche Subsysteme dominieren die Wall-Time wissenschaftlicher Läufe und welche Optimierungen erhöhen den Durchsatz bei erhaltener deterministischer Äquivalenz?
-  relevance: EXP-GEN-0021 zeigte eine große Differenz zwischen isoliertem Tick-Durchsatz und Suite-Laufzeit.
+  question: Welche Subsysteme dominieren die Wall-Time wissenschaftlicher Läufe und
+    welche Optimierungen erhöhen den Durchsatz bei erhaltener deterministischer Äquivalenz?
+  relevance: EXP-GEN-0021 zeigte eine große Differenz zwischen isoliertem Tick-Durchsatz
+    und Suite-Laufzeit.
   literature: []
   hypotheses:
   - H-PERF-001-A
@@ -677,12 +720,14 @@
   answer:
     current: null
     confidence: none
-    limitations: Performanceänderungen mit veränderter numerischer oder zeitlicher Semantik gelten als Protokolländerung.
+    limitations: Performanceänderungen mit veränderter numerischer oder zeitlicher
+      Semantik gelten als Protokolländerung.
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
 - id: RQ-REC-002
   domain: Recurrent Dynamics
-  question: Wie verändern Loop-Delay und skalierte Rekurrenzstruktur Persistenzdauer, Inter-Spike-Dynamik und Extinktionsverhalten?
+  question: Wie verändern Loop-Delay und skalierte Rekurrenzstruktur Persistenzdauer,
+    Inter-Spike-Dynamik und Extinktionsverhalten?
   relevance: Der Drei-Neuronen-Loop aus EXP-GEN-0021 reicht nicht für Skalierungsaussagen.
   literature: []
   hypotheses:
@@ -692,12 +737,14 @@
   answer:
     current: null
     confidence: none
-    limitations: Version 1 operationalisiert zunächst Loop-Delay als kontrollierten Skalierungsparameter.
+    limitations: Version 1 operationalisiert zunächst Loop-Delay als kontrollierten
+      Skalierungsparameter.
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
 - id: RQ-LIFE-001
   domain: Lifelong Learning
-  question: Bleibt zuvor erworbene Lernleistung bei sequenziellen Aufgaben erhalten oder entstehen messbare Interferenzeffekte?
+  question: Bleibt zuvor erworbene Lernleistung bei sequenziellen Aufgaben erhalten
+    oder entstehen messbare Interferenzeffekte?
   relevance: Das positive Single-Task-Learningsignal aus EXP-GEN-0021 motiviert Retentionstests.
   literature: []
   hypotheses:
@@ -707,14 +754,16 @@
   answer:
     current: null
     confidence: none
-    limitations: Der erste Runner ist ein Vorläufer-Screen; echte Catastrophic-Forgetting-Evidenz erfordert ein gemeinsames fortlaufend trainiertes Netzwerk.
+    limitations: Der erste Runner ist ein Vorläufer-Screen; echte Catastrophic-Forgetting-Evidenz
+      erfordert ein gemeinsames fortlaufend trainiertes Netzwerk.
   created: '2026-09-05'
   updated: '2026-09-05'
-
 - id: RQ-SNN-006
   domain: Spiking Neural Networks
-  question: Bleibt die unter RQ-SNN-001 beobachtete Langzeitstabilitaet unter vorab definierten lokalen Variationen von synaptischem Gewicht und Tonic-Drive erhalten?
-  relevance: Trennt die deterministische Stabilitaet einer festen Parameterisierung von lokaler Robustheit ueber tatsaechlich unterschiedliche, seed-gebundene Modellparameterisierungen.
+  question: Bleibt die unter RQ-SNN-001 beobachtete Langzeitstabilitaet unter vorab
+    definierten lokalen Variationen von synaptischem Gewicht und Tonic-Drive erhalten?
+  relevance: Trennt die deterministische Stabilitaet einer festen Parameterisierung
+    von lokaler Robustheit ueber tatsaechlich unterschiedliche, seed-gebundene Modellparameterisierungen.
   literature:
   - SRC-IZHIKEVICH-2003
   - SRC-GERSTNER-2014

research/registry/sources.yaml

@@ -186,3 +186,45 @@
   brain5d_questions:
     - RQ-SNN-003
   brain5d_relevance: "Klassische Referenz für skalenfreie Netzwerktopologien."
+
+- source_id: SRC-OLSHAUSEN-FIELD-1996
+  authors:
+    - Bruno A. Olshausen
+    - David J. Field
+  title: "Emergence of simple-cell receptive field properties by learning a sparse code for natural images"
+  year: 1996
+  journal: "Nature"
+  doi: "10.1038/381607a0"
+  topic:
+    - sparse_coding
+    - efficient_coding
+    - neuroscience
+  claims:
+    - "Sparse coding is a biologically motivated efficient-coding principle; this source does not imply that MHRN Stage-1 topology is a sparse code."
+  brain5d_questions:
+    - RQ-SNN-003
+  brain5d_relevance: "Related-work context for a new prospective propagation-efficiency hypothesis. It motivates careful efficiency controls but is not evidence for a 5D advantage."
+
+- source_id: SRC-STIMBERG-2019
+  authors:
+    - Marcel Stimberg
+    - Romain Brette
+    - Dan F. M. Goodman
+  title: "Brian 2, an intuitive and efficient neural simulator"
+  year: 2019
+  journal: "eLife"
+  volume: 8
+  article: e47314
+  doi: "10.7554/eLife.47314"
+  software_project: "Brian 2"
+  software_license: "CeCILL 2.1"
+  topic:
+    - snn_simulation
+    - reference_implementation
+    - reproducibility
+  claims:
+    - "Brian 2 is a flexible simulator for spiking neural networks and is used in MHRN only as an external reference implementation where explicitly declared."
+  brain5d_questions:
+    - RQ-EVAL-006
+    - RQ-SNN-003
+  brain5d_relevance: "Primary software-method citation for Brian 2 reference comparisons. Its use does not itself constitute evidence for an MHRN claim."

research/registry/stage1_baseline.json

@@ -3,12 +3,12 @@
   "baseline_id": "STAGE1-SCIENTIFIC-BASELINE-20260925",
   "stage": 1,
   "name": "Kleines SNN",
-  "as_of": "2026-09-25",
+  "as_of": "2026-09-27",
   "authority": "canonical_stage_scientific_baseline",
   "source_branch_basis": "develop",
   "maturity": {
-    "score": 0.75,
-    "percent": 75,
+    "score": 0.85,
+    "percent": 85,
     "weighting_contract": {
       "research_question": {
         "weight": 0.15,
@@ -27,14 +27,14 @@
       },
       "reviewed_evidence": {
         "weight": 0.2,
-        "status": "partial",
-        "contribution": 0.1,
+        "status": "met",
+        "contribution": 0.2,
         "decomposition": {
           "human_scientific_review_fraction": 0.5,
           "canonical_evidence_engine_promotion_fraction": 0.5
         },
         "human_review_subgate": "complete",
-        "canonical_evid_promotion_subgate": "open"
+        "canonical_evid_promotion_subgate": "complete"
       },
       "independent_replication": {
         "weight": 0.15,
@@ -67,10 +67,17 @@
         "role": "corrected_preregistered_time_resolved_internal_replication",
         "human_review": "research/experiments/EXP-S1-TOPO-V3-R1-20260918/review_request.json.human-review.json",
         "human_review_decision": "accepted_as_interpretation"
+      },
+      {
+        "experiment_id": "EXP-S1-TOPO-PROMO-R1-20260927",
+        "role": "prospective_promotion_eligible_internal_replication",
+        "human_review": "research/experiments/EXP-S1-TOPO-PROMO-R1-20260927/human_review.json",
+        "human_review_decision": "supports",
+        "evidence_id": "EVID-2026-19"
       }
     ],
     "audit_only_experiment": "EXP-S1-TOPO-V3-20260918",
-    "relationship": "V2 and V3-R1 form one coherent DATA line. R1 is an internal replication/extension with fresh seeds and corrected multiple-testing implementation; it is not independent scientific replication.",
+    "relationship": "V2 and V3-R1 remain the historical coherent DATA line. EXP-S1-TOPO-PROMO-R1-20260927 prospectively reproduced the bounded topology claim on fresh seeds under the current EvidenceEngine provenance contract and was human-reviewed as supports, producing EVID-2026-19. None of these runs is independent scientific replication.",
     "claim_boundary": "Topology-sensitive propagation is supported only in the preregistered 64-neuron/246-edge Small-SNN operating envelope. No 5D superiority, scaling, cognition, biological equivalence or independent replication is established."
   },
   "second_functional_line": {
@@ -79,11 +86,10 @@
     "hypothesis": "H-TEMP-002-A",
     "role": "independent_stage1_functional_line",
     "independence_semantics": "Independent in functional question/task, not an independent replication of the topology claim.",
-    "evidence_class": "DATA",
+    "evidence_class": "EVID",
     "result_status": "SUPPORTED_WITHIN_PREREGISTERED_PROTOCOL",
-    "experiment_id": "EXP-S1-TEMP-ORDER-V2-20260919",
-    "human_review": "research/experiments/EXP-S1-TEMP-ORDER-V2-20260919/review_request.json.review.json",
-    "human_review_decision": "accepted_as_interpretation",
+    "human_review": "research/experiments/EXP-S1-TEMP-PROMO-R1-20260927/human_review.json",
+    "human_review_decision": "supports",
     "key_result": {
       "runs": 120,
       "intact_order_accuracy_median": 1,
@@ -96,25 +102,66 @@
       ],
       "exact_paired_sign_test_p": 0.0000019073486
     },
-    "claim_boundary": "Scoped technical temporal-order function of a six-neuron acyclic SNN under the registered decoder/task. No learning, memory, cognition, scaling, biological equivalence, 5D advantage or independent replication is established."
+    "claim_boundary": "Scoped technical temporal-order function of a six-neuron acyclic two-channel SNN under the registered decoder/task. The simultaneous condition is a non-inferential task-adequacy control. Perfect ceiling/floor separation is an explicit methodological limitation. No learning, memory, cognition, scaling, biological equivalence, 5D advantage, general temporal reasoning or independent replication is established.",
+    "experiments": [
+      {
+        "experiment_id": "EXP-S1-TEMP-ORDER-V2-20260919",
+        "role": "preregistered_primary_functional_data",
+        "human_review": "research/experiments/EXP-S1-TEMP-ORDER-V2-20260919/review_request.json.review.json",
+        "human_review_decision": "accepted_as_interpretation"
+      },
+      {
+        "experiment_id": "EXP-S1-TEMP-PROMO-R1-20260927",
+        "role": "prospective_promotion_eligible_internal_replication",
+        "human_review": "research/experiments/EXP-S1-TEMP-PROMO-R1-20260927/human_review.json",
+        "human_review_decision": "supports",
+        "evidence_id": "EVID-2026-20",
+        "methodological_follow_up": "research/notes/2026-09-27_stage1_temporal_order_decoder_followup.md"
+      }
+    ],
+    "evidence_id": "EVID-2026-20",
+    "relationship": "The historical V2 run remains reviewed DATA. EXP-S1-TEMP-PROMO-R1-20260927 prospectively reproduced the bounded task on fresh seeds under the current EvidenceEngine provenance contract and was human-reviewed as supports with explicit perfect-score/decoder limitations, producing EVID-2026-20. This functional line is not an independent replication of the topology claim."
   },
   "evid_promotion_assessment": {
-    "status": "BLOCKED_CURRENT_EVIDENCE_ENGINE_CONTRACT",
-    "scientific_evidence": false,
+    "status": "TOPOLOGY_AND_TEMPORAL_PROMOTIONS_COMPLETED",
+    "scientific_evidence": true,
     "automatic_evidence_promotion": false,
-    "scope": "Stage-1 topology and temporal-order DATA remain DATA after accepted interpretation reviews.",
-    "reasons": [
-      "No canonical Stage-1 claim ID is registered for EvidenceEngine promotion of these scoped results.",
-      "The historical experiment manifests predate the current promotion provenance contract and must not be retroactively rewritten.",
-      "The completed reviews are accepted_as_interpretation artifacts, not canonical EvidenceEngine human_review.json decisions in the supports/refutes/inconclusive schema."
-    ],
-    "required_next_step": "Define a separate scoped claim and prospective promotion-eligible execution/review path before any Stage-1 EVID registration."
+    "topology_claim_id": "CLAIM-S1-TOPO-001",
+    "topology_evidence_id": "EVID-2026-19",
+    "topology_promotion_experiment": "EXP-S1-TOPO-PROMO-R1-20260927",
+    "topology_human_review_decision": "supports",
+    "temporal_claim_id": "CLAIM-S1-TEMP-001",
+    "temporal_evidence_id": "EVID-2026-20",
+    "temporal_promotion_experiment": "EXP-S1-TEMP-PROMO-R1-20260927",
+    "temporal_human_review_decision": "supports",
+    "temporal_scientific_evidence": true,
+    "scope": "Both central Stage-1 functional lines now have separate canonical human-reviewed EVID. This strengthens Stage-1 evidence breadth but does not satisfy independent replication.",
+    "remaining_next_step": "Pursue independently implemented reference/cross-implementation replication for the central topology claim. The separate topology-efficiency hypothesis remains DRAFT/untested and cannot substitute for the independent-replication criterion."
   },
   "independent_replication": {
     "complete": false,
     "topology_v3_r1_counts_as_independent_replication": false,
     "temporal_order_line_counts_as_topology_replication": false,
-    "requirement": "Independently controlled and independently authored/audited preregistered replication."
+    "requirement": "Independently controlled and independently authored/audited preregistered replication.",
+    "draft_reference_plan": {
+      "preregistration": "research/preregistrations/PREREG-S1-TOPO-REFERENCE-R2.json",
+      "framework": "Brian2 2.10.1",
+      "status": "DRAFT_PRE_FREEZE_GATES_PENDING",
+      "execution_authorized": false,
+      "mandatory_new_gate": "CAL-S1-TOPO-REFERENCE-TOPOLOGY-MAP-R2",
+      "possible_partial_credit_if_successful": 0.075,
+      "possible_stage1_maturity_if_successful": 0.925,
+      "full_external_replication_still_required": true,
+      "note": "R2 supersedes the aborted pre-DATA R1 protocol. Project-side cross-implementation replication can earn only partial 7.5/15 replication credit and requires separate explicit human execution authorization after freeze."
+    },
+    "r1_reference_history": {
+      "preregistration": "research/preregistrations/PREREG-S1-TOPO-REFERENCE-R1.json",
+      "freeze": "research/preregistrations/PREREG-S1-TOPO-REFERENCE-R1.freeze.json",
+      "deviation": "research/decisions/2026-09-27_stage1_reference_r1_prefreeze_deviation.json",
+      "status": "FROZEN_ABORTED_BEFORE_REFERENCE_DATA",
+      "reference_data_created": false,
+      "maturity_credit": 0
+    }
   },
   "stronger_claims_kept_separate": [
     {
@@ -123,5 +170,24 @@
       "status": "open_untested",
       "note": "The Stage-1 baseline does not establish a 5D advantage."
     }
-  ]
+  ],
+  "efficiency_exploration": {
+    "research_question": "RQ-SNN-003",
+    "hypothesis": "H-SNN-003-C",
+    "claim_id": "CLAIM-S1-EFFICIENCY-001",
+    "status": "DRAFT_CALIBRATION_GATE_FAILED_FREEZE_BLOCKED",
+    "scientific_evidence": false,
+    "exploratory_note": "research/notes/2026-09-27_stage1_topology_efficiency_exploratory.md",
+    "preregistration": "research/preregistrations/PREREG-S1-TOPO-EFFICIENCY-R1.json",
+    "calibration": "research/calibrations/CAL-S1-TOPO-EFFICIENCY-R1-20260927/result.json",
+    "calibration_result": {
+      "verified": true,
+      "3d_recruitment_matched_gate_passed": false,
+      "5d_high_recruitment_gate_passed": false,
+      "interpretation": "Stimulus-current sweep 70-140 did not change median recruitment enough to satisfy either preregistered gate; R1 must not be frozen or executed."
+    },
+    "maturity_credit": 0,
+    "note": "Exploratory efficiency work is quarantined from EVID-2026-19 and does not contribute to Stage-1 maturity.",
+    "maturity_semantics": "Even a future successful, human-reviewed EVID promotion for CLAIM-S1-EFFICIENCY-001 would not raise Stage-1 maturity above the current 85% by itself because the reviewed_evidence component is already fully saturated at 20/20. Only the independent_replication component can provide the next maturity increase."
+  }
 }