Add files using upload-large-folder tool

.codex/models_cache.json

@@ -1,5 +1,5 @@
 {
-  "fetched_at": "2026-07-23T12:14:30.925726885Z",
+  "fetched_at": "2026-07-23T12:50:41.018932251Z",
   "etag": "W/\"0c51fd8a12c6a5ed20bc3a9f602e4e9b\"",
   "client_version": "0.144.5",
   "models": [

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/__init__.py

@@ -0,0 +1,15 @@
+"""Data module for Stage 3 training."""
+
+from .dataset import Stage3Dataset
+from .collate import Stage3Collator
+from .prompt_builder import Stage3PromptBuilder
+from .roi_formatter import ROIDescriptionFormatter
+from .patient_info_loader import PatientInfoLoader
+
+__all__ = [
+    'Stage3Dataset',
+    'Stage3Collator',
+    'Stage3PromptBuilder',
+    'ROIDescriptionFormatter',
+    'PatientInfoLoader',
+]

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/collate.py

@@ -0,0 +1,162 @@
+"""
+Stage 3 Collator
+Collates batch for Stage 3 training with ROI annotations.
+"""
+
+from typing import List, Dict, Any
+import torch
+
+from .prompt_builder import Stage3PromptBuilder
+
+
+class Stage3Collator:
+    """
+    Collates batch for Stage 3:
+    - Stacks CT/PET into [B, C, T, H, W]
+    - Tokenizes prompts + targets using Stage3PromptBuilder
+    - Handles variable number of ROIs per sample
+    - Returns tensors for HiRRA model
+    """
+
+    def __init__(self, tokenizer, prompt_config: Dict[str, Any]):
+        """
+        Args:
+            tokenizer: HuggingFace tokenizer
+            prompt_config: Configuration for PromptBuilder
+        """
+        self.prompt_builder = Stage3PromptBuilder(tokenizer, prompt_config)
+        self.pad_id = tokenizer.pad_token_id if tokenizer.pad_token_id is not None else 0
+
+    def __call__(self, batch: List[Dict[str, Any]]) -> Dict[str, Any]:
+        """
+        Collate a batch of samples.
+
+        Args:
+            batch: List of samples from Stage3Dataset
+
+        Returns:
+            Dictionary with batched tensors
+        """
+        # Stack volumes
+        ct = torch.stack([item["ct"] for item in batch])  # [B, 1, T, H, W]
+        pet = torch.stack([item["pet"] for item in batch])  # [B, 1, T, H, W]
+
+        # Boxes list (variable length per sample)
+        boxes_list = [item["boxes"] for item in batch]  # List[Tensor[N_rois, 6]]
+
+        # Build prompts and targets using PromptBuilder
+        prompt_outputs = [
+            self.prompt_builder.build(
+                prompt_context=item["prompt_context"],
+                roi_descriptions=item["roi_descriptions"],
+                full_report=None  # Stage 3 target: ROI-only
+            )
+            for item in batch
+        ]
+
+        # Extract sequences
+        prompt_sequences = [po.prompt_ids for po in prompt_outputs]
+        target_sequences = [po.target_ids for po in prompt_outputs]
+
+        # Pad sequences
+        input_ids, attention_mask = self._pad_sequences(prompt_sequences, pad_value=self.pad_id)
+        target_ids, target_mask = self._pad_sequences(target_sequences, pad_value=self.pad_id)
+
+        return {
+            "ct": ct,  # [B, 1, T, H, W]
+            "pet": pet,  # [B, 1, T, H, W]
+            "boxes_list": boxes_list,  # List[Tensor[N_rois, 6]]
+            "input_ids": input_ids,  # [B, max_prompt_len]
+            "attention_mask": attention_mask,  # [B, max_prompt_len]
+            "target_ids": target_ids,  # [B, max_target_len]
+            "target_mask": target_mask,  # [B, max_target_len]
+            # Metadata for logging/debugging
+            "patient_ids": [item["patient_id"] for item in batch],
+            "regions": [item["region"] for item in batch],
+            "num_rois": [len(item["roi_labels"]) for item in batch],
+            "token_stats": {
+                "prompt_tokens": int(attention_mask.sum().item()),
+                "target_tokens": int(target_mask.sum().item()),
+                "avg_prompt_len": int(attention_mask.sum().item()) / len(batch),
+                "avg_target_len": int(target_mask.sum().item()) / len(batch),
+                "total_rois": sum(len(item["roi_labels"]) for item in batch),
+            },
+            "prompt_contexts": [item["prompt_context"] for item in batch],
+        }
+
+    @staticmethod
+    def _pad_sequences(sequences: List[torch.Tensor], pad_value: int):
+        """
+        Pad sequences to same length.
+
+        Args:
+            sequences: List of 1D tensors with variable lengths
+            pad_value: Padding value (usually tokenizer.pad_token_id)
+
+        Returns:
+            Tuple of (padded_sequences, attention_mask)
+                padded_sequences: [B, max_len]
+                attention_mask: [B, max_len]
+        """
+        batch_size = len(sequences)
+        max_len = max(len(seq) for seq in sequences) if sequences else 0
+
+        if max_len == 0:
+            return (
+                torch.zeros((batch_size, 0), dtype=torch.long),
+                torch.zeros((batch_size, 0), dtype=torch.long)
+            )
+
+        # Initialize padded tensor and mask
+        padded = torch.full((batch_size, max_len), pad_value, dtype=torch.long)
+        mask = torch.zeros((batch_size, max_len), dtype=torch.long)
+
+        # Fill in actual sequences
+        for idx, seq in enumerate(sequences):
+            length = len(seq)
+            padded[idx, :length] = seq
+            mask[idx, :length] = 1
+
+        return padded, mask
+
+
+# Example usage and testing
+if __name__ == "__main__":
+    from transformers import AutoTokenizer
+    from .dataset import Stage3Dataset
+
+    # Load tokenizer
+    tokenizer = AutoTokenizer.from_pretrained("Qwen/Qwen2.5-3B-Instruct")
+
+    # Create dataset
+    dataset = Stage3Dataset(
+        json_path="/home/user01/aiotlab/sondinh/ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/50samples_roi_reformat_resized.json",
+        data_root="/home/user01/aiotlab/sondinh/ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data",
+        split='train',
+        train_split=0.8,
+        seed=42
+    )
+
+    # Create collator
+    prompt_config = {
+        "max_prompt_tokens": 512,
+        "max_target_tokens": 1024,
+        "add_bos": True,
+        "add_eos": True,
+    }
+    collator = Stage3Collator(tokenizer, prompt_config)
+
+    # Create a batch
+    batch = [dataset[0], dataset[1]]
+
+    # Collate
+    collated = collator(batch)
+
+    print("Collated batch:")
+    print(f"  CT shape: {collated['ct'].shape}")
+    print(f"  PET shape: {collated['pet'].shape}")
+    print(f"  Input IDs shape: {collated['input_ids'].shape}")
+    print(f"  Attention mask shape: {collated['attention_mask'].shape}")
+    print(f"  Target IDs shape: {collated['target_ids'].shape}")
+    print(f"  Num ROIs: {collated['num_rois']}")
+    print(f"  Token stats: {collated['token_stats']}")

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/dataset.py

@@ -0,0 +1,308 @@
+"""
+Stage 3 Dataset
+Loads CT/PET volumes, ROI boxes, and patient information for Stage 3 training.
+"""
+
+import json
+import os
+import numpy as np
+import torch
+from torch.utils.data import Dataset
+from typing import Dict, List, Tuple
+import random
+
+from .roi_formatter import ROIDescriptionFormatter
+from .patient_info_loader import PatientInfoLoader
+
+
+class Stage3Dataset(Dataset):
+    """
+    Dataset for Stage 3 training with ROI annotations.
+
+    Loads:
+    - CT and PET volumes (preprocessed .npy files)
+    - ROI bounding boxes
+    - ROI descriptions (formatted to natural language)
+    - Patient metadata (age, gender, history)
+    - Full report text
+    """
+
+    def __init__(
+        self,
+        json_path: str,
+        data_root: str,
+        split: str = 'train',
+        train_split: float | None = 0.8,
+        seed: int = 42
+    ):
+        """
+        Args:
+            json_path: Path to JSON manifest with ROI annotations
+            data_root: Root directory for .npy files and reports
+            split: 'train' or 'val'
+            train_split: Fraction of data for training (default: 0.8)
+            seed: Random seed for splitting
+        """
+        self.json_path = json_path
+        self.data_root = data_root
+        self.split = split
+        self.seed = seed
+
+        # Load JSON manifest
+        with open(json_path, 'r', encoding='utf-8') as f:
+            data = json.load(f)
+
+        all_samples = data['samples']
+
+        if train_split is None:
+            # Use all samples as provided (pre-split JSON)
+            self.samples = all_samples
+        else:
+            # Split train/val
+            random.seed(seed)
+            indices = list(range(len(all_samples)))
+            random.shuffle(indices)
+
+            split_idx = int(len(all_samples) * train_split)
+            if split == 'train':
+                selected_indices = indices[:split_idx]
+            else:  # 'val'
+                selected_indices = indices[split_idx:]
+
+            self.samples = [all_samples[i] for i in selected_indices]
+
+        # Initialize utilities
+        self.roi_formatter = ROIDescriptionFormatter()
+        self.patient_loader = PatientInfoLoader(data_root)
+
+        print(f"[Stage3Dataset] Loaded {len(self.samples)} samples for {split} split")
+        print(f"[Stage3Dataset] Total ROIs: {sum(len(s['rois']) for s in self.samples)}")
+
+    def _load_volume(self, path: str) -> torch.Tensor:
+        """
+        Load .npy volume and convert to tensor.
+
+        Args:
+            path: Relative path to .npy file
+
+        Returns:
+            Tensor of shape [1, T, H, W] (float32)
+        """
+        full_path = os.path.join(self.data_root, path)
+        volume = np.load(full_path)  # Shape: [T, H, W]
+
+        # Add channel dimension and convert to tensor
+        volume = torch.from_numpy(volume).unsqueeze(0).float()  # [1, T, H, W]
+
+        return volume
+
+    def _parse_boxes(self, rois: List[Dict]) -> torch.Tensor:
+        """
+        Parse ROI boxes và convert sang format mong đợi.
+
+        Input format (từ JSON): [x_min, y_min, z_min, x_max, y_max, z_max]
+        Output format (cho RoIAlign3D): [z_min, y_min, x_min, z_max, y_max, x_max]
+
+        Args:
+            rois: List of ROI dicts with 'bbox' field
+
+        Returns:
+            Tensor of shape [N, 6] with boxes in format [z_min, y_min, x_min, z_max, y_max, x_max]
+        """
+        boxes = []
+        for roi in rois:
+            bbox = roi['bbox']  # [x_min, y_min, z_min, x_max, y_max, z_max]
+            # Convert: hoán đổi toạ độ X và Z
+            converted = [
+                bbox[2],  # z_min (đã ở index 2)
+                bbox[1],  # y_min (giữ nguyên index 1)
+                bbox[0],  # x_min (đã ở index 0)
+                bbox[5],  # z_max (đã ở index 5)
+                bbox[4],  # y_max (giữ nguyên index 4)
+                bbox[3],  # x_max (đã ở index 3)
+            ]
+            boxes.append(converted)
+
+        return torch.tensor(boxes, dtype=torch.float32)
+
+    def _validate_boxes(self, boxes: torch.Tensor, vol_shape: tuple) -> torch.Tensor:
+        """
+        Validate ROI boxes và clip về bounds của volume.
+        Auto-fix boxes có min > max bằng cách swap.
+
+        Args:
+            boxes: [N, 6] tensor của [z_min, y_min, x_min, z_max, y_max, x_max]
+            vol_shape: (Z, H, W) tuple
+
+        Returns:
+            Boxes đã được validate và clip
+        """
+        Z, H, W = vol_shape
+
+        # Auto-fix: swap nếu min > max
+        # Z dimension
+        z_swap_mask = boxes[:, 0] >= boxes[:, 3]
+        if z_swap_mask.any():
+            boxes[z_swap_mask, [0, 3]] = boxes[z_swap_mask, [3, 0]]
+
+        # Y dimension
+        y_swap_mask = boxes[:, 1] >= boxes[:, 4]
+        if y_swap_mask.any():
+            boxes[y_swap_mask, [1, 4]] = boxes[y_swap_mask, [4, 1]]
+
+        # X dimension
+        x_swap_mask = boxes[:, 2] >= boxes[:, 5]
+        if x_swap_mask.any():
+            boxes[x_swap_mask, [2, 5]] = boxes[x_swap_mask, [5, 2]]
+
+        # Clip về bounds hợp lệ
+        boxes[:, [0, 3]] = boxes[:, [0, 3]].clamp(0, Z - 1)  # toạ độ z
+        boxes[:, [1, 4]] = boxes[:, [1, 4]].clamp(0, H - 1)  # toạ độ y
+        boxes[:, [2, 5]] = boxes[:, [2, 5]].clamp(0, W - 1)  # toạ độ x
+
+        return boxes
+
+    def _format_roi_descriptions(self, rois: List[Dict]) -> List[str]:
+        """
+        Format ROI descriptions to natural language.
+
+        Args:
+            rois: List of ROI dicts with 'description' field
+
+        Returns:
+            List of formatted description strings
+        """
+        formatted_descriptions = []
+        for roi in rois:
+            raw_description = roi.get('description', '')
+            if raw_description:
+                formatted = self.roi_formatter.format(raw_description)
+            else:
+                formatted = "Không có thông tin chi tiết về tổn thương."
+            formatted_descriptions.append(formatted)
+
+        return formatted_descriptions
+
+    def _get_roi_labels(self, rois: List[Dict]) -> List[str]:
+        """
+        Get ROI labels.
+
+        Args:
+            rois: List of ROI dicts with 'label' field
+
+        Returns:
+            List of label strings
+        """
+        return [roi.get('label', f"ROI {roi['index']}") for roi in rois]
+
+    def __len__(self) -> int:
+        return len(self.samples)
+
+    def __getitem__(self, idx: int) -> Dict:
+        """
+        Get a single sample.
+
+        Returns:
+            Dictionary containing:
+                - ct: CT volume tensor [1, T, H, W]
+                - pet: PET volume tensor [1, T, H, W]
+                - boxes: ROI boxes tensor [N, 6]
+                - roi_labels: List of ROI labels
+                - roi_descriptions: List of formatted ROI descriptions
+                - patient_info: Dict with age, gender, history
+                - full_report: Full report text (impression)
+                - patient_id: Patient ID string
+                - region: Body region string
+        """
+        sample = self.samples[idx]
+
+        # Load volumes
+        ct = self._load_volume(sample['modalities']['ct'])
+        pet = self._load_volume(sample['modalities']['pet'])
+
+        # Parse ROIs
+        rois = sample['rois']
+        boxes = self._parse_boxes(rois)
+        # Validate boxes với volume shape (T, H, W)
+        boxes = self._validate_boxes(boxes, ct.shape[1:])
+        roi_labels = self._get_roi_labels(rois)
+        roi_descriptions = self._format_roi_descriptions(rois)
+
+        # Load patient information and report
+        patient_id = sample['patient_id']
+        region = sample['region']
+
+        try:
+            patient_info = self.patient_loader.load(patient_id, region)
+        except Exception as e:
+            print(f"[Warning] Failed to load patient info for {patient_id}/{region}: {e}")
+            # Fallback to default values
+            patient_info = {
+                'age': 'unknown',
+                'gender': 'unknown',
+                'history': 'Không có thông tin',
+                'clinical_history': 'Không có thông tin',
+                'indication': 'Không có thông tin',
+                'full_report': '',
+                'detailed_description': '',
+                'region_name_vi': region,
+                'region_name_en': region,
+            }
+
+        num_rois = len(rois)
+        prompt_context = {
+            'patient_id': patient_id,
+            'region': region,
+            'region_name_en': patient_info.get('region_name_en', region),
+            'region_name_vi': patient_info.get('region_name_vi', region),
+            'clinical_history': patient_info.get('clinical_history', patient_info.get('history', 'Không có thông tin')),
+            'indication': patient_info.get('indication', 'Không có thông tin'),
+            'birth_year': patient_info.get('birth_year', 'Không rõ'),
+            'gender': patient_info.get('gender', 'Không rõ'),
+            'exam_date': patient_info.get('exam_date', 'Không rõ'),
+            'num_rois': num_rois
+        }
+
+        return {
+            'ct': ct,
+            'pet': pet,
+            'boxes': boxes,
+            'roi_labels': roi_labels,
+            'roi_descriptions': roi_descriptions,
+            'patient_info': patient_info,
+            'full_report': patient_info['full_report'],
+            'patient_id': patient_id,
+            'region': region,
+            'prompt_context': prompt_context,
+        }
+
+
+# Example usage and testing
+if __name__ == "__main__":
+    # Test dataset
+    dataset = Stage3Dataset(
+        json_path="/home/user01/aiotlab/sondinh/ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/50samples_roi_reformat_resized.json",
+        data_root="/home/user01/aiotlab/sondinh/ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data",
+        split='train',
+        train_split=0.8,
+        seed=42
+    )
+
+    print(f"\nDataset size: {len(dataset)}")
+
+    # Get first sample
+    sample = dataset[0]
+    print(f"\nSample 0:")
+    print(f"  Patient ID: {sample['patient_id']}")
+    print(f"  Region: {sample['region']}")
+    print(f"  CT shape: {sample['ct'].shape}")
+    print(f"  PET shape: {sample['pet'].shape}")
+    print(f"  Boxes shape: {sample['boxes'].shape}")
+    print(f"  Num ROIs: {len(sample['roi_labels'])}")
+    print(f"  ROI labels: {sample['roi_labels']}")
+    print(f"  Patient age: {sample['patient_info']['age']}")
+    print(f"  Patient gender: {sample['patient_info']['gender']}")
+    print(f"  ROI descriptions:")
+    for i, desc in enumerate(sample['roi_descriptions']):
+        print(f"    {i+1}. {desc}")
+    print(f"  Full report: {sample['full_report'][:100]}...")

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_738/report/abdomen_pelvis.json

@@ -0,0 +1,12 @@
+{
+  "Họ tên": "patient_738",
+  "Năm sinh": "1971",
+  "Giới tính": "Nam",
+  "Ngày xét nghiệm": "18/12/2018",
+  "Chỉ định": "Đánh giá giai đoạn",
+  "Bệnh sử lâm sàng": "U lympho tế bào B lớn, biểu hiện ở vùng cổ",
+  "Nhận định kết quả": "Chưa phát hiện hình ảnh tăng chuyển hóa FDG khu trú, bất thường tại các vị trí khác trên xạ hình PET/CT toàn thân.",
+  "Mô tả hình ảnh": {
+    "Ổ bụng - khung chậu": "Hình ảnh bắt xạ theo đặc điểm sinh lý ở gan, lách, thượng thận và đài bể thận 2 bên. Hình ảnh đám hạch có kích thước 54 x 32 mm, tăng chuyển hóa FDG (SUVmax: 8,6) ở vùng tá tụy. Hình ảnh tăng chuyển hóa FDG ở khung đại tràng theo đặc điểm sinh lý. Hình ảnh vài hạch bẹn, kích thước 10mm, không tăng chuyển hóa FDG ở hố bẹn hai bên."
+  }
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_738/report/abdomen_pelvis/gan.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [-51.141395568847656, -2.4629883766174316, -501.57318115234375],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [154.3684058337053, 150.71920024248368, 147.63934050962294],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Gan",
+                    "description": "[Gan] - [Hấp thu sinh lý] - [0] - [0] - [0] - [0] - [Tăng chuyển hóa] - [0] - [0] - [3] - [Hấp thu FDG sinh lý bình thường của gan, không có dấu hiệu bất thường.]",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [-51.141395568847656, -2.4629883766174316, -501.57318115234375],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.615686274509804, 0.4117647058823529, 0.6666666666666666],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_738/report/abdomen_pelvis/hach o bung.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [0.4446970752748598, -14.80301462329966, -583.4830332815682],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [55.39237560311631, 38.014375413903366, 55.34032250211487],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Hạch ổ bụng",
+                    "description": "[ổ bụng] - [hạch quanh tụy] - [50x57 mm] - [7.3] - [Mật độ mô mềm] - [dính nhau thành đám] - [Tăng chuyển hóa] - [u lympho, viêm, 0] - [sinh thiết, 0, 0] - [3]",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [0.4446970752748598, -14.80301462329966, -583.4830332815682],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.9764705882352941, 0.6470588235294118, 0.3764705882352941],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_738/report/abdomen_pelvis/lach.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [92.4993667602539, 41.56945037841797, -522.0454711914063],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [76.0926552123928, 87.40515877455292, 79.78490128184859],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Lách",
+                    "description": "[Lách] - [Hấp thu sinh lý] - [0] - [0] - [0] - [0] - [Tăng chuyển hóa] - [0] - [0] - [3] - [Hấp thu FDG sinh lý bình thường của lách, không có dấu hiệu bất thường.]",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [92.4993667602539, 41.56945037841797, -522.0454711914063],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.803921568627451, 0.43529411764705883, 0.35294117647058826],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_738/report/abdomen_pelvis/than.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [-70.15509796142578, 48.202178955078125, -583.8880004882813],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [67.87757362135895, 53.68165172249515, 95.63077573055342],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Thận",
+                    "description": "[Thận] - [Hấp thu sinh lý] - [0] - [0] - [0] - [0] - [Tăng chuyển hóa] - [0] - [0] - [3] - [Hấp thu FDG sinh lý bình thường của thận, không có dấu hiệu bất thường.]",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [-70.15509796142578, 48.202178955078125, -583.8880004882813],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.8392156862745098, 0.5019607843137255, 0.7019607843137254],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_738/report/chest.json

@@ -0,0 +1,12 @@
+{
+  "Họ tên": "patient_738",
+  "Năm sinh": "1971",
+  "Giới tính": "Nam",
+  "Ngày xét nghiệm": "18/12/2018",
+  "Chỉ định": "Đánh giá giai đoạn",
+  "Bệnh sử lâm sàng": "U lympho tế bào B lớn, biểu hiện ở vùng cổ",
+  "Nhận định kết quả": "Chưa phát hiện hình ảnh tăng chuyển hóa FDG khu trú, bất thường tại các vị trí khác trên xạ hình PET/CT toàn thân.",
+  "Mô tả hình ảnh": {
+    "Lồng ngực": "Hình ảnh bắt xạ theo đặc điểm sinh lý ở tim. Không phát hiện hình ảnh tràn dịch màng phổi hai bên và tràn dịch màng tim. Hình ảnh vài hạch nách nhỏ ( 10 mm) ở hố nách hai bên, không tăng chuyển hóa FDG. Không phát hiện hình ảnh hạch tăng chuyển hóa FDG khu trú, bất thường ở trung thất."
+  }
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_738/report/chest/tim.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [54.793575286865234, -19.97236442565918, -421.78363037109375],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [86.88896960356536, 100.18610877862724, 77.5121104717158],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Tim",
+                    "description": "[Tim] - [Hấp thu sinh lý] - [0] - [0] - [0] - [0] - [Tăng chuyển hóa] - [0] - [0] - [2] - [Hấp thu FDG sinh lý bình thường của tim, không có dấu hiệu bất thường.]",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [54.793575286865234, -19.97236442565918, -421.78363037109375],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.35294117647058826, 0.615686274509804, 0.8235294117647058],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_738/report/head_neck.json

@@ -0,0 +1,12 @@
+{
+  "Họ tên": "patient_738",
+  "Năm sinh": "1971",
+  "Giới tính": "Nam",
+  "Ngày xét nghiệm": "18/12/2018",
+  "Chỉ định": "Đánh giá giai đoạn",
+  "Bệnh sử lâm sàng": "U lympho tế bào B lớn, biểu hiện ở vùng cổ",
+  "Nhận định kết quả": "Chưa phát hiện hình ảnh tăng chuyển hóa FDG khu trú, bất thường tại các vị trí khác trên xạ hình PET/CT toàn thân.",
+  "Mô tả hình ảnh": {
+    "Đầu - cổ": "Hình ảnh bắt xạ theo đặc điểm sinh lý ở não. Tăng nhẹ chuyển hóa FDG ở amydal, rìa lưỡi hai bên theo đặc điểm sinh lý. Hình ảnh nhiều hạch kích thước nhỏ, tạo thành chuỗi ở dọc cơ ức đòn chũm trái, tăng nhẹ chuyển hóa FDG (SUVmax: 2,7)."
+  }
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_738/report/head_neck/amydal.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [11.65267562866211, -4.441683292388916, -192.91302490234375],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [48.5451683213422, 19.463445437069453, 26.97665810280938],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Amydal",
+                    "description": "[Amydal] - [Hấp thu sinh lý] - [0] - [0] - [0] - [0] - [Tăng chuyển hóa] - [0] - [0] - [1] - [Hấp thu FDG sinh lý bình thường của amydal, không có dấu hiệu bất thường.]",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [11.65267562866211, -4.441683292388916, -192.91302490234375],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.4901960784313726, 0.7568627450980392, 0.4274509803921568],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_738/report/head_neck/hach co.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [59.72749710083008, 34.726470947265625, -239.35345458984375],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [23.198327968680715, 29.835696178614086, 44.51919376076184],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Hạch cổ",
+                    "description": "[hạch cổ] - [hạch nhóm IIB, V bên trái] - [max 9 mm] - [2.7] - [Mật độ mô mềm] - [dính nhau thành chùm] - [Tăng chuyển hóa] - [u lympho, viêm, 0] - [FNA, 0, 0] - [1] ",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [59.72749710083008, 34.726470947265625, -239.35345458984375],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.615686274509804, 0.4117647058823529, 0.6666666666666666],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_738/report/head_neck/luoi.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [12.907135963439941, -46.62843704223633, -188.871826171875],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [40.60319581790125, 45.826283674420935, 42.04873111958054],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Lưỡi",
+                    "description": "[Lưỡi] - [Hấp thu sinh lý] - [0] - [0] - [0] - [0] - [Tăng chuyển hóa] - [0] - [0] - [1] - [Hấp thu FDG sinh lý bình thường của lưỡi, không có dấu hiệu bất thường.]",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [12.907135963439941, -46.62843704223633, -188.871826171875],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.35294117647058826, 0.615686274509804, 0.8235294117647058],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_738/report/head_neck/nao.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [16.098007202148438, 24.838085174560547, -82.1339111328125],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [110.2035866719412, 83.34019658092704, 54.74024297793672],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Não",
+                    "description": "[Não] - [Hấp thu sinh lý] - [0] - [0] - [0] - [0] - [Tăng chuyển hóa đối xứng ở vỏ não và hạch nền] - [0] - [0] - [1] - [Hấp thu FDG sinh lý bình thường của não, không có dấu hiệu bất thường.]",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [16.098007202148438, 24.838085174560547, -82.1339111328125],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.9372549019607843, 0.34901960784313724, 0.3843137254901961],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_741/report/abdomen_pelvis.json

@@ -0,0 +1,12 @@
+{
+  "Họ tên": "patient_741",
+  "Năm sinh": "1940",
+  "Giới tính": "Nam",
+  "Ngày xét nghiệm": "18/12/2018",
+  "Chỉ định": "Đánh giá giai đoạn",
+  "Bệnh sử lâm sàng": "U lympho tế bào B lớn biểu hiện ở nách trái",
+  "Nhận định kết quả": "Hình ảnh tăng chuyển hóa FDG ở tủy xương vùng cánh tay, dọc cột sống, xương chậu, xương đùi hai bên. Cần đối chiếu với sinh thiết tủy xương để phân biệt phản ứng của tủy xương hoặc do u lympho ở tủy xương. Chưa phát hiện hình ảnh tăng chuyển hóa FDG khu trú, bất thường tại các vị trí khác trên xạ hình PET/CT toàn thân.",
+  "Mô tả hình ảnh": {
+    "Ổ bụng - khung chậu": "Hình ảnh bắt xạ theo đặc điểm sinh lý ở gan, lách, thượng thận và đài bể thận 2 bên. Hình ảnh tăng chuyển hóa FDG ở khung đại tràng theo đặc điểm sinh lý. Không phát hiện hình ảnh hạch tăng chuyển hóa FDG ở vùng bụng và chậu. Hình ảnh hạch có kích thước 20 x 17 mm, tăng chuyển hóa FDG (SUVmax: 15,5) ở vùng bẹn phải."
+  }
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_741/report/abdomen_pelvis/hach ben P.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [-76.13709986324736, 0.6997814178466797, -919.0508160453287],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [19.870282938895627, 18.007443913374146, 19.870282938895627],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Hạch bẹn phải",
+                    "description": "[bẹn] - [hạch bẹn phải] - [max 18 mm] - [15.5] - [Mật độ mô mềm] - [tròn] - [Tăng chuyển hóa] - [u lympho, viêm, 0] - [FNA, 0, 0] - [3]",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [-76.13709986324736, 0.6997814178466797, -919.0508160453287],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.803921568627451, 0.43529411764705883, 0.35294117647058826],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_741/report/abdomen_pelvis/lach.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [48.001060485839844, 59.88737869262695, -581.3175659179688],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [64.58921575946744, 70.63960754485974, 102.9782975018689],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Lách",
+                    "description": "[Lách] - [Hấp thu sinh lý] - [0] - [0] - [0] - [0] - [Tăng chuyển hóa] - [0] - [0] - [3] - [Hấp thu FDG sinh lý bình thường của lách, không có dấu hiệu bất thường.]",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [48.001060485839844, 59.88737869262695, -581.3175659179688],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.803921568627451, 0.43529411764705883, 0.35294117647058826],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_741/report/abdomen_pelvis/than.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [-95.38191223144531, 64.03630828857422, -615.456787109375],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [62.28905654479456, 50.57692001329271, 89.18816566943669],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Thận",
+                    "description": "[Thận] - [Hấp thu sinh lý] - [0] - [0] - [0] - [0] - [Tăng chuyển hóa] - [0] - [0] - [3] - [Hấp thu FDG sinh lý bình thường của thận, không có dấu hiệu bất thường.]",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [-95.38191223144531, 64.03630828857422, -615.456787109375],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.8392156862745098, 0.5019607843137255, 0.7019607843137254],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_741/report/abdomen_pelvis/tuy xuong.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [-19.96163558959961, 47.40094757080078, -708.7559814453125],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [56.305547810715154, 48.625848236960564, 119.38876572998049],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Tủy xương",
+                    "description": "[Tủy xương] - [tủy xương hầu hết hệ thống xương] - [0] - [6.9] - [0] - [0] - [Tăng chuyển hóa] - [u lympho, sinh lý, 0] - [sinh thiết tủy, huyết tủy đồ, xét nghiệm máu] - [123]",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [-19.96163558959961, 47.40094757080078, -708.7559814453125],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.45098039215686275, 0.45098039215686275, 0.45098039215686275],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_741/report/chest.json

@@ -0,0 +1,12 @@
+{
+  "Họ tên": "patient_741",
+  "Năm sinh": "1940",
+  "Giới tính": "Nam",
+  "Ngày xét nghiệm": "18/12/2018",
+  "Chỉ định": "Đánh giá giai đoạn",
+  "Bệnh sử lâm sàng": "U lympho tế bào B lớn biểu hiện ở nách trái",
+  "Nhận định kết quả": "Hình ảnh tăng chuyển hóa FDG ở tủy xương vùng cánh tay, dọc cột sống, xương chậu, xương đùi hai bên. Cần đối chiếu với sinh thiết tủy xương để phân biệt phản ứng của tủy xương hoặc do u lympho ở tủy xương. Chưa phát hiện hình ảnh tăng chuyển hóa FDG khu trú, bất thường tại các vị trí khác trên xạ hình PET/CT toàn thân.",
+  "Mô tả hình ảnh": {
+    "Lồng ngực": "Hình ảnh bắt xạ theo đặc điểm sinh lý ở tim. Không phát hiện hình ảnh tràn dịch màng phổi hai bên và tràn dịch màng tim. Hình ảnh nhiều hạch thượng đòn tạo thành đám. Hạch lớn nhất có kích thước 20 x 27 mm, tăng chuyển hóa FDG (SUVmax: 12). Hình ảnh đám tổn thương tỉ trọng mô mềm ở nách trái, xâm lấn ra xung quanh vào các cơ thành ngực, vai và lưng trái, tăng chuyển hóa FDG (SUVmax: 14,4). Hình ảnh nhiều hạch ở hố nách phải. Hạch lớn nhất có kích thước 15 mm, không tăng chuyển hóa FDG. Hình ảnh vài hạch ở trước và cạnh khí quản, kích thước 10 mm, không tăng chuyển hóa FDG. Không phát hiện hình ảnh tăng chuyển hóa FDG khu trú, bất thường ở nhu mô phổi hai bên. Hình ảnh dày màng phổi thành sau phổi trái, không tăng chuyển hóa FDG."
+  }
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_741/report/chest/dam nach trai.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [105.06242370605469, 31.151119232177734, -472.7967224121094],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [169.69526933702124, 186.31520303705997, 357.4762977355813],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Đám tổn thương bên trái",
+                    "description": "[cổ, ngực, nách trái] - [đám tổn thương ở cổ, nách trái, xâm lấn ra xung quanh vào các cơ thành ngực, vai và lưng trái] - [0] - [16.4] - [Mật độ mô mềm] - [đám tổn thương] - [Tăng chuyển hóa mạnh] - [u lympho, vận động cơ, 0] - [sinh thiết, xét nghiệm máu, 0] - [2] ",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [105.06242370605469, 31.151119232177734, -472.7967224121094],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.8392156862745098, 0.5019607843137255, 0.7019607843137254],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_741/report/head_neck.json

@@ -0,0 +1,12 @@
+{
+  "Họ tên": "patient_741",
+  "Năm sinh": "1940",
+  "Giới tính": "Nam",
+  "Ngày xét nghiệm": "18/12/2018",
+  "Chỉ định": "Đánh giá giai đoạn",
+  "Bệnh sử lâm sàng": "U lympho tế bào B lớn biểu hiện ở nách trái",
+  "Nhận định kết quả": "Hình ảnh tăng chuyển hóa FDG ở tủy xương vùng cánh tay, dọc cột sống, xương chậu, xương đùi hai bên. Cần đối chiếu với sinh thiết tủy xương để phân biệt phản ứng của tủy xương hoặc do u lympho ở tủy xương. Chưa phát hiện hình ảnh tăng chuyển hóa FDG khu trú, bất thường tại các vị trí khác trên xạ hình PET/CT toàn thân.",
+  "Mô tả hình ảnh": {
+    "Đầu - cổ": "Hình ảnh bắt xạ theo đặc điểm sinh lý ở não. Tăng nhẹ chuyển hóa FDG ở amydal, rìa lưỡi hai bên theo đặc điểm sinh lý. Hình ảnh vài hạch ở góc hàm và phía trong cơ ức đòn chũm (nhóm IIB) hai bên, kích thước nhỏ 10 mm, không tăng chuyển hóa FDG khả năng do viêm hoặc quá sản."
+  }
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/18/patient_741/report/head_neck/nao.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [-6.677858829498291, 45.329315185546875, -145.60984802246094],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [110.2035866719412, 83.34019658092704, 66.21920811221075],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Não",
+                    "description": "[Não] - [Hấp thu sinh lý] - [0] - [0] - [0] - [0] - [Tăng chuyển hóa đối xứng ở vỏ não và hạch nền] - [0] - [0] - [1] - [Hấp thu FDG sinh lý bình thường của não, không có dấu hiệu bất thường.]",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [-6.677858829498291, 45.329315185546875, -145.60984802246094],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.9372549019607843, 0.34901960784313724, 0.3843137254901961],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/19/patient_54/report/abdomen_pelvis.json

@@ -0,0 +1,12 @@
+{
+  "Họ tên": "patient_54",
+  "Năm sinh": "1952",
+  "Giới tính": "Nam",
+  "Ngày xét nghiệm": "19/12/2018",
+  "Chỉ định": "Đánh giá đáp ứng điều trị",
+  "Bệnh sử lâm sàng": "Lymphoma đã điều trị hóa chất",
+  "Nhận định kết quả": "Chưa phát hiện hình ảnh tăng chuyển hóa FDG khu trú, bất thường tại các vị trí khác trên xạ hình PET/CT toàn thân.",
+  "Mô tả hình ảnh": {
+    "Ổ bụng - khung chậu": "Hình ảnh bắt xạ theo đặc điểm sinh lý ở gan, lách, thượng thận và đài bể thận 2 bên. Hình ảnh tăng chuyển hóa FDG ở khung đại tràng theo đặc điểm sinh lý. Hình ảnh vài hạch bẹn, kích thước 10 mm, không tăng chuyển hóa FDG ở hố bẹn hai bên."
+  }
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/19/patient_54/report/abdomen_pelvis/gan.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [-46.68294143676758, 7.817852020263672, -552.9817504882813],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [169.07061397680943, 177.7996831235942, 124.82663187108815],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Gan",
+                    "description": "[Gan] - [Hấp thu sinh lý] - [0] - [0] - [0] - [0] - [Tăng chuyển hóa] - [0] - [0] - [3] - [Hấp thu FDG sinh lý bình thường của gan, không có dấu hiệu bất thường.]",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [-46.68294143676758, 7.817852020263672, -552.9817504882813],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.976470588235294, 0.6470588235294118, 0.3764705882352941],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/19/patient_54/report/abdomen_pelvis/lach.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [112.71099090576172, 42.680213928222656, -573.4617309570313],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [55.90922636916588, 80.91624328890882, 73.45009820308306],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Lách",
+                    "description": "[Lách] - [Hấp thu sinh lý] - [0] - [0] - [0] - [0] - [Tăng chuyển hóa] - [0] - [0] - [3] - [Hấp thu FDG sinh lý bình thường của lách, không có dấu hiệu bất thường.]",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [112.71099090576172, 42.680213928222656, -573.4617309570313],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.615686274509804, 0.4117647058823529, 0.6666666666666666],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}

ACL 2026/Hirra_model/training/stage3/data/full_data/U lympho/PETCT_2018/THANG 12/19/patient_54/report/abdomen_pelvis/than.mrk.json

@@ -0,0 +1,71 @@
+{
+    "@schema": "https://raw.githubusercontent.com/slicer/slicer/master/Modules/Loadable/Markups/Resources/Schema/markups-schema-v1.0.3.json#",
+    "markups": [
+        {
+            "type": "ROI",
+            "coordinateSystem": "LPS",
+            "coordinateUnits": "mm",
+            "locked": false,
+            "fixedNumberOfControlPoints": false,
+            "labelFormat": "%N-%d",
+            "lastUsedControlPointNumber": 1,
+            "roiType": "Box",
+            "center": [-51.901339828873176, 61.66513097388696, -598.8845367526396],
+            "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+            "size": [59.69585010046535, 46.063513744810535, 84.95992599790125],
+            "insideOut": false,
+            "controlPoints": [
+                {
+                    "id": "1",
+                    "label": "Thận",
+                    "description": "[Thận] - [Hấp thu sinh lý] - [0] - [0] - [0] - [0] - [Tăng chuyển hóa] - [0] - [0] - [3] - [Hấp thu FDG sinh lý bình thường của thận, không có dấu hiệu bất thường.]",
+                    "associatedNodeID": "vtkMRMLScalarVolumeNode1",
+                    "position": [-51.901339828873176, 61.66513097388696, -598.8845367526396],
+                    "orientation": [-1.0, -0.0, -0.0, -0.0, -1.0, -0.0, 0.0, 0.0, 1.0],
+                    "selected": true,
+                    "locked": false,
+                    "visibility": true,
+                    "positionStatus": "defined"
+                }
+            ],
+            "measurements": [
+                {
+                    "name": "volume",
+                    "enabled": false,
+                    "units": "cm3",
+                    "printFormat": "%-#4.4g%s"
+                }
+            ],
+            "display": {
+                "visibility": true,
+                "opacity": 1.0,
+                "color": [0.4, 1.0, 1.0],
+                "selectedColor": [0.803921568627451, 0.4352941176470588, 0.35294117647058826],
+                "activeColor": [0.4, 1.0, 0.0],
+                "propertiesLabelVisibility": true,
+                "pointLabelsVisibility": false,
+                "textScale": 3.0,
+                "glyphType": "Sphere3D",
+                "glyphScale": 3.0,
+                "glyphSize": 5.0,
+                "useGlyphScale": true,
+                "sliceProjection": false,
+                "sliceProjectionUseFiducialColor": true,
+                "sliceProjectionOutlinedBehindSlicePlane": false,
+                "sliceProjectionColor": [1.0, 1.0, 1.0],
+                "sliceProjectionOpacity": 0.6,
+                "lineThickness": 0.2,
+                "lineColorFadingStart": 1.0,
+                "lineColorFadingEnd": 10.0,
+                "lineColorFadingSaturation": 1.0,
+                "lineColorFadingHueOffset": 0.0,
+                "handlesInteractive": true,
+                "translationHandleVisibility": true,
+                "rotationHandleVisibility": false,
+                "scaleHandleVisibility": true,
+                "interactionHandleScale": 3.0,
+                "snapMode": "toVisibleSurface"
+            }
+        }
+    ]
+}