Archive 4 checkpoints (1-4)

paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20260930T065633Z-summary-deck-scsemi-final/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scores/imperial_eskd/fewshot_n5/draw4_scsemi5/README.md

@@ -0,0 +1,73 @@
+# score_ft.py output: imperial_eskd, 143 scored donors
+
+Arms: scsemi5.  Every arm is scored on the same donors against the same observed reference.
+
+## Inputs and fixed contracts
+- Observed reference: `/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/imperial_eskd/reference.npz` (sha 34b4caa3f8a6), built from datadir:/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/data/imperial_eskd;
+  observed cells sum exactly to the features pseudobulk of every donor. Observed labels: /home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/imperial_eskd/observed_labels/labels/labels.parquet.
+- Generated cells: `generated_counts` read out once with Poisson(seed 20260916) over the **whole NPZ in row order**
+  (`poisson_readout.poisson_integerise`), then the scored donors' rows. These integer counts are used for labels, embedding,
+  depth and the contrast. Pseudobulk uses the summed `generated_counts` (rates), as `score_generated.py`.
+- Labels: frozen f01common scANVI (`predict_scanvi.py`, CPU, zero query epochs), six-type gate ['T cell', 'B cell', 'Monocyte', 'NK cell', 'DC', 'Other']; query genes =
+  the 1,006-gene annotation list minus genes the dataset's sc assay did not measure in every sample (1005 genes).
+- Scoring genes: 6k panel genes measured by both assays in every sample of the dataset (5927 genes).
+
+## Definitions
+1. **Composition**: fraction of each donor's cells per six-type label (all generated cells; all observed QC cells).
+   `comp_l1` = sum over the six labels of |generated - observed| (immicro_common.l1). `comp_l1_obs_loo_null` = L1 of the
+   donor's observed composition to the mean of the *other scored donors'* observed compositions. `composition_top1` =
+   fraction of donors whose generated composition is closest (L1) to their own observed composition.
+2. **Pseudobulk**: `pb_r` = Pearson r of CPM-log1p(summed generated_counts) vs CPM-log1p(observed pseudobulk) on the scoring
+   genes (evaluate_realbulk.cpm_log1p / paired_r). `pb_top1` = the donor's generated pseudobulk is closest (Pearson) to its own
+   observed pseudobulk among the 143 scored donors (immicro_common.retrieval = evaluate_realbulk.top1 arithmetic).
+3. **Precision / coverage / density** (stage_b_embed.py functions): per-cell CP10K over the scoring genes + log1p; PCA-50
+   (randomized, random_state 20260925) and k = 10 real-real k-NN balls fitted on **R1 of the scored donors only**.
+   Reference rule (independent of fold and arm): per donor, cells in canonical order (library_id+barcode), one
+   permutation from `default_rng([20260925, uint64(sha256(donor)[:8])])`; R1 = first n, R2 = next n,
+   n = min(150, n_cells // 2) (21382 R1 cells here). Generated query: per donor n cells (the donor's R1 size),
+   without replacement, `default_rng([20260926, same key])`. Precision = fraction of generated cells inside any R1 ball
+   (Kynkaanniemi 2019); coverage = fraction of R1 cells whose ball holds a generated cell; density = Naeem 2020.
+   Per-donor precision = that donor's generated cells; per-donor coverage = that donor's R1 cells (the pooled values are
+   their n-weighted means; plain means when every donor has 150 reference cells). R2 (held-out real cells of the same donors) is the
+   perfect-generator control: precision 0.9696, coverage 0.9998.
+   **Depth matched**: stage_b_embed depth matching run pairwise (R1 vs this arm): per donor and within-donor rank of detected
+   genes, both cells are thinned by UMI sampling without replacement to the smaller detected-gene count; PCA kept from
+   un-thinned R1, radii recomputed on thinned R1; fresh rng(20260929) per arm. R2 control: precision
+   0.9684, coverage 0.9997.
+4. **Monocyte %** = 100 x Monocyte fraction (all cells) per donor; **median UMI per cell** = median over cells of the
+   Poisson-read (generated) / observed counts summed over the scoring genes (per donor, and pooled).
+5. **Group contrast** (T, B, Monocyte, NK): case groups ['covid_positive'] (n = 104) vs control groups ['covid_negative'] (n = 31); rule: explicit --case-groups / --control-groups; groups from features groups.
+   Genes per type = scoring genes detected (count > 0) in >= 1 % of the scored donors' observed
+   cells of that type. Primary statistic `mean_cp10k`: per-cell CP10K over the scoring genes; per donor the mean over its
+   cells of the type (donors with >= 1 such cell); group mean = mean over the group's donors (donor-balanced);
+   logFC = log2(case mean + 1) - log2(control mean + 1). Secondary `pseudobulk_log1p_cpm`: the SLE benchmark evaluator's
+   statistic (donor x type summed counts, log1p CPM over the scoring genes, mean case - mean control;
+   evaluate_generated_vs_truth.group_log_fold_change). Both are computed on the generated cells (their frozen labels) and on
+   the observed cells; `r_generated` = Pearson r of the two logFC vectors. Broadcast baseline `r_broadcast`: the same
+   observed vector against the logFC of the input bulk (condition NPZ `bulk_counts` of the arm, scoring genes, per-donor
+   CP10K resp. log1p CPM, group means). `partial_r_generated_given_broadcast`: r of the OLS residuals of observed and
+   generated logFC on the bulk logFC (residual_specificity.py).
+6. **Top-50 DEG overlap** (contrast.csv rows `statistic = welch_top50_deg`; summary `deg_top50`): the SLE benchmark's score (`total_top50_overlap` of
+   `bulk2sc-paper/scripts/evaluate_generated_vs_truth.py`, Welch backend: the "top-50 DEG 81 / 84" of the final model), run
+   with the evaluator's own functions on the same donor x type pseudobulks as the contrast. Per cell type, observed and
+   generated separately: donor x type summed counts on all 5927 scoring genes (donors of the two groups with
+   >= 1 cell of the type) -> `welch_bh_deg` (log1p CPM, two-sided Welch t-test case vs control, Benjamini-Hochberg over the
+   genes with a defined p-value; needs >= 2 donors per group) -> `top_deg_genes` (FDR < 0.05, descending |logFC|,
+   first 50; shorter when fewer genes pass). `top50_overlap` = |observed list & generated list|; `top50_jaccard`
+   the evaluator's Jaccard. Summary `sum` = total over the scored types (the quantity reported as 81), `max` = the sum of
+   the observed list lengths (the "of 262"), `sum_4type` = T + B + Monocyte + NK. A type is scored when its observed test
+   is defined; an arm whose generated test is undefined for a scored type gets overlap 0. Types: T cell, B cell, Monocyte, NK cell, DC
+   (aggregates: /home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/imperial_eskd/deg_reference.npz).
+   **Broadcast analogue** (`top50_overlap_broadcast`, as `sle_broadcast.py` `broadcast_input_bulk`; not part of the
+   published benchmark): the same test on the arm's condition bulk_counts (scoring genes, the 104 + 31
+   donors), one whole-PBMC top-50 list, compared with every type's observed list.
+
+## Files
+- `per_donor.csv`: one row per arm x donor (all per-donor quantities above).
+- `summary.json`: per arm the donor means / pooled values, provenance (NPZ sha, receipt check, generation metadata,
+  Poisson nnz of the whole NPZ, annotation contract), and the reference block (PCA, R2 control).
+- `contrast.csv`: per arm x cell type x statistic (`mean_cp10k`, `pseudobulk_log1p_cpm`: logFC r; `welch_top50_deg`:
+  top-50 DEG overlap, T / B / Monocyte / NK / DC; columns of the other kind are empty).
+- `arms/<arm>/labels/` (predict_scanvi.py labels + manifest), `arms/<arm>/generated_cells.parquet` (NPZ row, donor, label,
+  UMI on the scoring genes, P/C subsample flag), `arms/<arm>/deg_top50_lists.csv` (observed, generated and broadcast
+  top-50 gene lists, Ensembl ids, rank order).

paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20260930T065633Z-summary-deck-scsemi-final/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scores/imperial_eskd/fewshot_n5/draw4_scsemi5/contrast.csv

@@ -0,0 +1,14 @@
+arm,celltype,statistic,n_genes,r_generated,r_broadcast,partial_r_generated_given_broadcast,r_generated_vs_broadcast,n_case_donors_obs,n_control_donors_obs,n_case_donors_gen,n_control_donors_gen,n_cells_obs,n_cells_gen,deg_scored,top50_overlap,top50_jaccard,obs_top_list_size,gen_top_list_size,n_sig_obs,n_sig_gen,top50_overlap_broadcast,top50_jaccard_broadcast,broadcast_top_list_size,n_sig_broadcast
+scsemi5,T cell,mean_cp10k,3032,0.6608758993053973,0.6232824935145761,0.5172416570523088,0.49729533983442176,104,31,104,31,244943,123240,,,,,,,,,,,
+scsemi5,T cell,pseudobulk_log1p_cpm,3032,0.39416433973970916,0.6213005296240948,0.21441515807479058,0.3848269585485117,104,31,104,31,244943,123240,,,,,,,,,,,
+scsemi5,B cell,mean_cp10k,3180,0.508795842660168,0.6315018114438883,0.34044963377663795,0.42787608365526364,104,31,102,31,46230,18292,,,,,,,,,,,
+scsemi5,B cell,pseudobulk_log1p_cpm,3180,0.0463991635070618,0.49592343727839516,-0.11196557126755932,0.28167559852515994,104,31,102,31,46230,18292,,,,,,,,,,,
+scsemi5,Monocyte,mean_cp10k,2878,0.6022410345197411,0.7121111596726496,0.32321045113629815,0.5879575053115986,103,31,103,31,77634,25735,,,,,,,,,,,
+scsemi5,Monocyte,pseudobulk_log1p_cpm,2878,0.3791373105369172,0.7117946294640722,0.09487941851988327,0.4489921291400756,103,31,103,31,77634,25735,,,,,,,,,,,
+scsemi5,NK cell,mean_cp10k,2963,0.6136729160725262,0.6592751152623284,0.4027262076016801,0.5460400579138946,104,31,103,31,65766,27846,,,,,,,,,,,
+scsemi5,NK cell,pseudobulk_log1p_cpm,2963,0.30430998704669965,0.5939124968903833,0.11041453981036775,0.3736444778058893,104,31,103,31,65766,27846,,,,,,,,,,,
+scsemi5,T cell,welch_top50_deg,5927,,,,,104,31,104,31,244943,123240,True,21,0.26582278481012656,50,50,1194,250,15,0.17647058823529413,50,2055
+scsemi5,B cell,welch_top50_deg,5927,,,,,104,31,102,31,46230,18292,True,8,0.08695652173913043,50,50,310,158,12,0.13636363636363635,50,2055
+scsemi5,Monocyte,welch_top50_deg,5927,,,,,103,31,103,31,77634,25735,True,10,0.1111111111111111,50,50,305,358,21,0.26582278481012656,50,2055
+scsemi5,NK cell,welch_top50_deg,5927,,,,,104,31,103,31,65766,27846,True,14,0.16279069767441862,50,50,431,340,14,0.16279069767441862,50,2055
+scsemi5,DC,welch_top50_deg,5927,,,,,104,31,101,31,12690,4766,True,8,0.08695652173913043,50,50,295,56,14,0.16279069767441862,50,2055

paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20260930T065633Z-summary-deck-scsemi-final/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scores/imperial_eskd/fewshot_n5/draw4_scsemi5/per_donor.csv

@@ -0,0 +1,144 @@
+arm,donor,group,n_generated_cells,n_observed_cells,n_reference_cells,gen_T cell,obs_T cell,gen_B cell,obs_B cell,gen_Monocyte,obs_Monocyte,gen_NK cell,obs_NK cell,gen_DC,obs_DC,gen_Other,obs_Other,comp_l1,comp_l1_obs_loo_null,pb_r,pb_own_rank,pb_top1,precision,coverage,precision_depth_matched,coverage_depth_matched,mono_pct_gen,mono_pct_obs,median_umi_gen,median_umi_obs
+scsemi5,C20_1004,covid_positive,1500,1810,150,0.5593333333333333,0.43425414364640885,0.17733333333333334,0.3994475138121547,0.12066666666666667,0.03867403314917127,0.12,0.07790055248618785,0.0026666666666666666,0.04751381215469613,0.02,0.0022099447513812156,0.5339226519337017,0.5911691602962323,0.7284668632650565,126,False,0.41333333333333333,0.013333333333333334,0.2733333333333333,0.03333333333333333,12.066666666666666,3.867403314917127,1087.0,1373.5
+scsemi5,C20_1404,covid_positive,1500,5836,150,0.54,0.4885195339273475,0.018666666666666668,0.2705620287868403,0.098,0.015421521590130226,0.328,0.204592186429061,0.012,0.016620973269362578,0.0033333333333333335,0.004283755997258396,0.5149335161069227,0.38288467460802705,0.5935010123731453,76,False,0.2866666666666667,0.02666666666666667,0.12,0.14666666666666667,9.8,1.5421521590130227,1085.0,1473.0
+scsemi5,C21_1004,covid_positive,1500,5552,150,0.55,0.8982348703170029,0.09,0.08609510086455331,0.11733333333333333,0.0,0.13066666666666665,0.0111671469740634,0.086,0.0005403458213256485,0.026,0.003962536023054755,0.6964697406340058,0.826057012140823,0.511015456128022,117,False,0.18666666666666668,0.02,0.23333333333333334,0.09333333333333334,11.733333333333333,0.0,1086.0,1563.5
+scsemi5,C21_1704,covid_positive,1500,4570,150,0.8533333333333334,0.7275711159737418,0.07333333333333333,0.2214442013129103,0.014666666666666666,0.004814004376367615,0.042666666666666665,0.022319474835886213,0.009333333333333334,0.011816192560175055,0.006666666666666667,0.012035010940919038,0.31192414296134213,0.6818042238645966,0.6695924381754834,62,False,0.5466666666666666,0.006666666666666667,0.7,0.16666666666666666,1.4666666666666666,0.48140043763676155,1086.0,2131.0
+scsemi5,C21_2504,covid_positive,1500,5048,150,0.8006666666666666,0.7567353407290016,0.13066666666666665,0.12361331220285261,0.03,0.06220285261489699,0.007333333333333333,0.039619651347068144,0.019333333333333334,0.011687797147385102,0.012,0.006141045958795562,0.12897834125726354,0.5444708951550008,0.5769185319178353,3,False,0.5133333333333333,0.0,0.7666666666666667,0.26666666666666666,3.0,6.220285261489699,1087.0,2692.5
+scsemi5,C23_2204,covid_positive,1500,3088,150,0.5386666666666666,0.685880829015544,0.11133333333333334,0.10362694300518134,0.22933333333333333,0.06703367875647669,0.09266666666666666,0.11269430051813471,0.026,0.025906735751295335,0.002,0.0048575129533678756,0.34019861830742665,0.39112008771380663,0.6103222887163556,18,False,0.35333333333333333,0.006666666666666667,0.32,0.28,22.933333333333334,6.703367875647668,1084.0,1936.5
+scsemi5,C31_1304,covid_positive,1500,3525,150,0.5813333333333334,0.782695035460993,0.11866666666666667,0.1075177304964539,0.18866666666666668,0.007659574468085106,0.06266666666666666,0.07716312056737588,0.043333333333333335,0.02070921985815603,0.005333333333333333,0.00425531914893617,0.43171631205673766,0.5936184984835277,0.5731366355778649,51,False,0.5133333333333333,0.02666666666666667,0.2866666666666667,0.24,18.866666666666667,0.7659574468085106,1086.0,1623.0
+scsemi5,C31_2004,covid_positive,1500,2265,150,0.5386666666666666,0.8004415011037528,0.112,0.08123620309050773,0.21666666666666667,0.039293598233995586,0.102,0.05121412803532009,0.02666666666666667,0.022958057395143488,0.004,0.004856512141280353,0.5252626931567329,0.6291114297690472,0.6456703379875457,25,False,0.2733333333333333,0.0,0.20666666666666667,0.24,21.666666666666668,3.9293598233995586,1088.0,1910.0
+scsemi5,C31_2704,covid_positive,1500,4200,150,0.524,0.7042857142857143,0.10666666666666667,0.08023809523809523,0.21866666666666668,0.08714285714285715,0.12066666666666667,0.09857142857142857,0.02666666666666667,0.025952380952380952,0.0033333333333333335,0.0038095238095238095,0.3615238095238095,0.43679985613297023,0.6349968969472014,10,False,0.32,0.013333333333333334,0.25333333333333335,0.26,21.866666666666667,8.714285714285715,1086.0,1704.0
+scsemi5,C34_1404,covid_positive,1500,2483,150,0.592,0.8771647200966572,0.14933333333333335,0.01973419250906162,0.12666666666666668,0.016915022150624244,0.09866666666666667,0.07047925896093435,0.017333333333333333,0.011679420056383408,0.016,0.004027386226339106,0.5703294401933147,0.7836657691088813,0.7091778597765437,105,False,0.4066666666666667,0.013333333333333334,0.38,0.08666666666666667,12.666666666666668,1.6915022150624244,1085.0,1720.0
+scsemi5,C34_2104,covid_positive,1500,2808,150,0.558,0.7916666666666666,0.092,0.024216524216524215,0.22133333333333333,0.041666666666666664,0.09533333333333334,0.12428774928774929,0.029333333333333333,0.013888888888888888,0.004,0.004273504273504274,0.5257891737891737,0.6126696622489,0.6369949868339732,54,False,0.4,0.013333333333333334,0.3933333333333333,0.36,22.133333333333333,4.166666666666666,1084.0,2067.5
+scsemi5,C34_2504,covid_positive,1500,1945,150,0.55,0.6961439588688946,0.11,0.024678663239074552,0.21466666666666667,0.12544987146529563,0.094,0.12904884318766066,0.028666666666666667,0.02416452442159383,0.0026666666666666666,0.0005141388174807198,0.3623856041131105,0.421624246653356,0.6469967686758726,19,False,0.42,0.013333333333333334,0.42,0.30666666666666664,21.46666666666667,12.544987146529563,1085.0,2111.0
+scsemi5,C40_1504,covid_positive,1500,5482,150,0.572,0.7433418460415907,0.176,0.09649762860269974,0.12533333333333332,0.05600145932141554,0.10466666666666667,0.09157241882524626,0.004666666666666667,0.009668004377964246,0.017333333333333333,0.002918642831083546,0.35268636750577664,0.5088424580632146,0.7475215647078098,15,False,0.34,0.03333333333333333,0.28,0.16666666666666666,12.533333333333333,5.6001459321415545,1087.0,1253.5
+scsemi5,C40_2204,covid_positive,1500,975,150,0.44,0.6933333333333334,0.098,0.13538461538461538,0.13866666666666666,0.028717948717948718,0.24933333333333332,0.12923076923076923,0.06933333333333333,0.010256410256410256,0.004666666666666667,0.003076923076923077,0.5814358974358975,0.4314596642683807,0.5925208020766292,55,False,0.30666666666666664,0.0,0.20666666666666667,0.26,13.866666666666665,2.871794871794872,1085.0,1808.0
+scsemi5,C40_0105,covid_positive,1500,8728,150,0.7686666666666667,0.42587076076993585,0.098,0.036778185151237396,0.058666666666666666,0.4643675527039413,0.058666666666666666,0.05728689275893675,0.012,0.013175985334555454,0.004,0.0025206232813932174,0.8137537427436603,0.5776921188650213,0.7343257726502108,35,False,0.4533333333333333,0.0,0.5333333333333333,0.08,5.866666666666666,46.43675527039413,1085.0,1862.0
+scsemi5,C42_1504,covid_positive,1500,2762,150,0.446,0.7320782041998551,0.10666666666666667,0.13613323678493844,0.20066666666666666,0.020275162925416364,0.21533333333333332,0.0894279507603186,0.0,0.013758146270818247,0.03133333333333333,0.00832729905865315,0.6586058411778903,0.5183187072864084,0.701013817061466,65,False,0.3466666666666667,0.013333333333333334,0.08666666666666667,0.06666666666666667,20.066666666666666,2.0275162925416366,1086.0,1302.0
+scsemi5,C42_2204,covid_positive,1500,4970,150,0.576,0.8511066398390342,0.09466666666666666,0.06317907444668008,0.06466666666666666,0.035211267605633804,0.202,0.035211267605633804,0.04666666666666667,0.012072434607645875,0.016,0.0032193158953722333,0.5502132796780684,0.7325748101231112,0.6891915496646644,8,False,0.26666666666666666,0.02,0.11333333333333333,0.14666666666666667,6.466666666666667,3.5211267605633805,1086.0,1462.0
+scsemi5,C42_2704,covid_positive,1500,8918,150,0.5186666666666667,0.8535546086566494,0.10133333333333333,0.04619869925992375,0.22,0.036891679748822605,0.13733333333333334,0.054047992823503026,0.02,0.006391567616057412,0.0026666666666666666,0.0029154518950437317,0.6702734544367196,0.7374707477583418,0.6150087019020132,61,False,0.43333333333333335,0.006666666666666667,0.3,0.11333333333333333,22.0,3.6891679748822606,1084.0,1489.0
+scsemi5,C58_1604,covid_negative,1500,265,132,0.5493333333333333,0.7018867924528301,0.08733333333333333,0.04150943396226415,0.06866666666666667,0.0037735849056603774,0.25,0.2188679245283019,0.04133333333333333,0.01509433962264151,0.0033333333333333335,0.018867924528301886,0.3361761006289307,0.5424653360208308,0.5920746553518988,140,False,0.2803030303030303,0.03787878787878788,0.10606060606060606,0.022727272727272728,6.866666666666667,0.37735849056603776,1085.5,1285.0
+scsemi5,C58_2501,covid_positive,1500,1671,150,0.6166666666666667,0.42848593656493117,0.122,0.0353081986834231,0.12466666666666666,0.31717534410532616,0.112,0.15320167564332735,0.008,0.05326152004787552,0.016666666666666666,0.012567324955116697,0.5579437462597249,0.3323930763933689,0.7024952016923208,42,False,0.46,0.20666666666666667,0.34,0.12,12.466666666666667,31.717534410532615,1086.0,700.0
+scsemi5,C58_2901,covid_positive,1500,1615,150,0.9706666666666667,0.6179566563467492,0.0,0.03653250773993808,0.0,0.17956656346749225,0.0,0.10835913312693499,0.0,0.03219814241486068,0.029333333333333333,0.025386996904024767,0.7133126934984519,0.29284138321987946,0.4034729538685311,60,False,0.16,0.17333333333333334,0.9933333333333333,0.4266666666666667,0.0,17.956656346749224,1083.0,882.0
+scsemi5,C58_0102,covid_positive,1500,972,150,0.7973333333333333,0.5339506172839507,0.086,0.027777777777777776,0.054,0.2880658436213992,0.03866666666666667,0.11316872427983539,0.019333333333333334,0.03292181069958848,0.004666666666666667,0.00411522633744856,0.644312757201646,0.32310574214870186,0.5663985764721415,98,False,0.4666666666666667,0.17333333333333334,0.6066666666666667,0.05333333333333334,5.4,28.80658436213992,1087.0,749.0
+scsemi5,C58_0402,covid_positive,1500,9254,150,0.5633333333333334,0.4245731575534904,0.014,0.01988329371082775,0.21733333333333332,0.4091203803760536,0.15666666666666668,0.11681435055111303,0.042,0.02485411713853469,0.006666666666666667,0.004754700669980549,0.395340681507096,0.4714492302250327,0.7174278355524468,24,False,0.46,0.10666666666666667,0.32666666666666666,0.2,21.73333333333333,40.912038037605356,1085.5,1006.0
+scsemi5,C58_1003,recovery,1500,4918,150,0.7666666666666667,0.5917039446929646,0.0006666666666666666,0.02745018300122001,0.15533333333333332,0.1691744611630744,0.006,0.14721431476209842,0.014666666666666666,0.05612037413582757,0.056666666666666664,0.008336722244814965,0.4465853327911075,0.25566936712348404,0.445857080506736,61,False,0.21333333333333335,0.22,0.8733333333333333,0.35333333333333333,15.533333333333331,16.917446116307442,1084.0,745.5
+scsemi5,C60_2504,covid_positive,1500,1837,150,0.5053333333333333,0.8911268372346217,0.09466666666666666,0.05443658138268917,0.132,0.00979858464888405,0.18733333333333332,0.032117583015786606,0.07533333333333334,0.009254218835057159,0.005333333333333333,0.00326619488296135,0.7715870078025768,0.8045028930001179,0.5775600865955315,102,False,0.30666666666666664,0.013333333333333334,0.24,0.03333333333333333,13.200000000000001,0.979858464888405,1085.0,1187.0
+scsemi5,C63_1704,covid_positive,1500,3305,150,0.36733333333333335,0.7718608169440242,0.118,0.11981845688350984,0.19866666666666666,0.013010590015128594,0.2866666666666667,0.08199697428139183,0.007333333333333333,0.006959152798789713,0.022,0.006354009077155824,0.8126918809884014,0.5699378547834837,0.7534886214453843,91,False,0.54,0.02,0.3466666666666667,0.16,19.866666666666667,1.3010590015128594,1087.0,1364.0
+scsemi5,C63_2404,covid_positive,1500,2143,150,0.8493333333333334,0.6971535230984601,0.07066666666666667,0.1675221651889874,0.014,0.0377974801679888,0.054,0.08726084927671489,0.011333333333333334,0.007932804479701353,0.0006666666666666666,0.0023331777881474567,0.3111606781770105,0.5097354270036487,0.8141027056696103,17,False,0.22666666666666666,0.013333333333333334,0.64,0.14666666666666667,1.4000000000000001,3.7797480167988797,1087.0,1596.0
+scsemi5,C63_2904,covid_positive,1500,1684,150,0.83,0.6775534441805225,0.09333333333333334,0.14251781472684086,0.03133333333333333,0.08491686460807601,0.016,0.0855106888361045,0.021333333333333333,0.007719714964370546,0.008,0.0017814726840855108,0.3445574030087094,0.4205265682434805,0.5463321037803076,27,False,0.36,0.02666666666666667,0.6533333333333333,0.17333333333333334,3.1333333333333333,8.491686460807601,1085.0,1647.5
+scsemi5,C65_1704,covid_positive,1500,1117,150,0.18533333333333332,0.5264100268576545,0.12533333333333332,0.13070725156669652,0.20133333333333334,0.03670546105640107,0.482,0.2909579230080573,0.0033333333333333335,0.009847806624888093,0.0026666666666666666,0.005371530886302597,0.7113398985377499,0.34764485555436003,0.7595300143247001,25,False,0.41333333333333333,0.07333333333333333,0.11333333333333333,0.10666666666666667,20.133333333333333,3.670546105640107,1087.0,1042.0
+scsemi5,C65_2104,covid_positive,1500,274,137,0.338,0.5766423357664233,0.12666666666666668,0.20802919708029197,0.202,0.014598540145985401,0.3233333333333333,0.19343065693430658,0.0026666666666666666,0.0036496350364963502,0.007333333333333333,0.0036496350364963502,0.6419756690997567,0.40769883225158726,0.6697986693668652,136,False,0.30656934306569344,0.043795620437956206,0.145985401459854,0.13138686131386862,20.200000000000003,1.4598540145985401,1086.0,1266.0
+scsemi5,C65_2504,covid_positive,1500,1069,150,0.8493333333333334,0.6623012160898035,0.07066666666666667,0.11412535079513564,0.014,0.031805425631431246,0.05466666666666667,0.16931711880261927,0.010666666666666666,0.002806361085126286,0.0006666666666666666,0.019644527595884004,0.38978484565014043,0.3689269603792679,0.7488526325669723,37,False,0.3466666666666667,0.02,0.5333333333333333,0.10666666666666667,1.4000000000000001,3.1805425631431246,1086.0,2137.0
+scsemi5,C69_1804,covid_negative,1500,6901,150,0.8713333333333333,0.819591363570497,0.06733333333333333,0.028546587451094046,0.019333333333333334,0.0585422402550355,0.004666666666666667,0.04637009129111723,0.03133333333333333,0.03231415736849732,0.006,0.014635560063758875,0.18105743129015117,0.6629704514610715,0.5181772402256801,29,False,0.2733333333333333,0.02666666666666667,0.9533333333333334,0.13333333333333333,1.9333333333333333,5.85422402550355,1084.5,1211.0
+scsemi5,C82_2504,covid_positive,1500,7154,150,0.86,0.8433044450656975,0.06533333333333333,0.03228962818003914,0.014666666666666666,0.047246295778585405,0.048666666666666664,0.037042214145932346,0.010666666666666666,0.030192899077439196,0.0006666666666666666,0.009924517752306402,0.12272742521666202,0.708184553842989,0.6808160889289492,46,False,0.4066666666666667,0.02,0.6666666666666666,0.11333333333333333,1.4666666666666666,4.724629577858541,1086.0,1210.0
+scsemi5,C85_2004,covid_negative,1500,3618,150,0.7733333333333333,0.6199557766721946,0.11733333333333333,0.026810392482034272,0.04466666666666667,0.15201768933112217,0.03,0.12493090105030404,0.025333333333333333,0.039524599226091764,0.009333333333333334,0.03676064123825318,0.4878009950248756,0.3188794160050589,0.679022565686376,1,True,0.2866666666666667,0.12,0.5933333333333334,0.3,4.466666666666667,15.201768933112216,1086.0,1463.5
+scsemi5,C93_2104,covid_positive,1500,5003,150,0.7626666666666667,0.5098940635618628,0.12266666666666666,0.06516090345792525,0.038,0.15790525684589246,0.028666666666666667,0.23246052368578854,0.04133333333333333,0.029982010793523885,0.006666666666666667,0.004597241655006996,0.6473982277300286,0.17851516238611484,0.7156939049897072,14,False,0.36,0.08666666666666667,0.5666666666666667,0.22666666666666666,3.8,15.790525684589246,1087.0,1416.0
+scsemi5,C93_2704,covid_positive,1500,6623,150,0.7733333333333333,0.4635361618601842,0.08866666666666667,0.031103729427751775,0.052,0.22044390759474558,0.06666666666666667,0.26256983240223464,0.013333333333333334,0.018873622225577532,0.006,0.003472746489506266,0.7397747244451156,0.29316451474958,0.7112213455287556,8,False,0.3466666666666667,0.02,0.5866666666666667,0.16,5.2,22.04439075947456,1088.0,1439.0
+scsemi5,C93_0405,covid_positive,1500,5527,150,0.7706666666666667,0.47421747783607743,0.13733333333333334,0.03057716663651167,0.034666666666666665,0.2131355165550932,0.03,0.2529401121765877,0.024666666666666667,0.026777637054459923,0.0026666666666666666,0.0023520897412701285,0.807039864905615,0.25928829221898125,0.630471287241461,4,False,0.32666666666666666,0.05333333333333334,0.5666666666666667,0.14,3.4666666666666663,21.31355165550932,1086.5,1471.0
+scsemi5,C101_0601,covid_positive,1500,344,150,0.498,0.6482558139534884,0.014666666666666666,0.03197674418604651,0.11333333333333333,0.14825581395348839,0.356,0.09302325581395349,0.010666666666666666,0.0377906976744186,0.007333333333333333,0.040697674418604654,0.5259534883720931,0.3744947058376843,0.589591862682763,110,False,0.19333333333333333,0.02,0.07333333333333333,0.013333333333333334,11.333333333333332,14.825581395348838,1084.0,1309.0
+scsemi5,C101_1101,covid_positive,1500,566,150,0.616,0.27385159010600707,0.01,0.04770318021201413,0.11066666666666666,0.5106007067137809,0.24866666666666667,0.06537102473498234,0.007333333333333333,0.07420494699646643,0.007333333333333333,0.028268551236749116,1.0508881036513544,0.7974033914028266,0.5582240243875529,74,False,0.19333333333333333,0.06,0.08666666666666667,0.10666666666666667,11.066666666666666,51.060070671378085,1085.0,1003.0
+scsemi5,C101_1301,covid_positive,1500,2035,150,0.6306666666666667,0.3154791154791155,0.14733333333333334,0.05110565110565111,0.12933333333333333,0.4692874692874693,0.06933333333333333,0.057985257985257985,0.004,0.05847665847665848,0.019333333333333334,0.047665847665847666,0.8455266175266176,0.7221149323687845,0.6550553892484808,15,False,0.42,0.13333333333333333,0.3466666666666667,0.17333333333333334,12.933333333333334,46.928746928746925,1086.0,875.0
+scsemi5,C101_1801,covid_positive,1500,1555,150,0.9586666666666667,0.3562700964630225,0.0,0.3762057877813505,0.030666666666666665,0.12861736334405144,0.0013333333333333333,0.03858520900321544,0.0006666666666666666,0.028938906752411574,0.008666666666666666,0.07138263665594856,1.2047931404072885,0.6204470850868845,0.44940993322183637,62,False,0.20666666666666667,0.1,0.8666666666666667,0.18666666666666668,3.0666666666666664,12.861736334405144,1087.0,806.0
+scsemi5,C101_2001,covid_positive,1500,2130,150,0.7913333333333333,0.4765258215962441,0.12933333333333333,0.2051643192488263,0.03266666666666666,0.22253521126760564,0.021333333333333333,0.05539906103286385,0.021333333333333333,0.022535211267605635,0.004,0.01784037558685446,0.6296150234741785,0.27657155628137864,0.5382772521448719,66,False,0.32666666666666666,0.12666666666666668,0.5866666666666667,0.08,3.266666666666666,22.253521126760564,1086.0,882.0
+scsemi5,C101_2502,recovery,1500,587,150,0.816,0.424190800681431,0.08933333333333333,0.06132879045996593,0.04133333333333333,0.3679727427597956,0.02666666666666667,0.05792163543441227,0.016666666666666666,0.07836456558773425,0.01,0.010221465076660987,0.8396274843838727,0.49246044379491805,0.6699968960845073,81,False,0.18666666666666668,0.09333333333333334,0.44,0.07333333333333333,4.133333333333333,36.79727427597956,1086.0,822.0
+scsemi5,C103_2204,covid_negative,1500,8742,150,0.724,0.5037748798901853,0.11866666666666667,0.06394417753374514,0.042666666666666665,0.2772820864790666,0.020666666666666667,0.1261725005719515,0.06,0.0263097689315946,0.034,0.0025165865934568747,0.6802425074353696,0.22898053310587163,0.49847485202541164,50,False,0.25333333333333335,0.006666666666666667,0.66,0.03333333333333333,4.266666666666667,27.728208647906662,1086.5,1718.0
+scsemi5,C104_2204,covid_negative,1500,11388,150,0.554,0.29004214963119074,0.08866666666666667,0.03898840885142255,0.21533333333333332,0.4137688795223042,0.09866666666666667,0.18580962416578856,0.042,0.06840533895328416,0.0013333333333333333,0.002985598876009835,0.6272722163681068,0.6005869248218639,0.5769237270954446,5,False,0.37333333333333335,0.006666666666666667,0.36,0.10666666666666667,21.53333333333333,41.37688795223042,1085.0,1965.5
+scsemi5,C106_2204,covid_negative,1500,9233,150,0.8586666666666667,0.6097693057511101,0.06466666666666666,0.036824434095093686,0.014,0.19451965774937724,0.050666666666666665,0.10733239467128777,0.011333333333333334,0.047980071482725005,0.0006666666666666666,0.003574136250406152,0.553479186974259,0.30987026117345995,0.6344380879590564,13,False,0.3,0.006666666666666667,0.6,0.07333333333333333,1.4000000000000001,19.451965774937722,1086.0,1796.0
+scsemi5,C108_2204,covid_negative,1500,1839,150,0.7913333333333333,0.6688417618270799,0.008666666666666666,0.0032626427406199023,0.05733333333333333,0.03806416530723219,0.1,0.25502990755845567,0.029333333333333333,0.021750951604132682,0.013333333333333334,0.013050570962479609,0.31005981511691144,0.5467779063928259,0.5133014283771237,79,False,0.18666666666666668,0.08666666666666667,0.37333333333333335,0.06,5.733333333333333,3.8064165307232187,1087.0,1341.0
+scsemi5,C108_1501,covid_positive,1500,1488,150,0.44866666666666666,0.2956989247311828,0.012666666666666666,0.016129032258064516,0.12133333333333333,0.21841397849462366,0.4,0.41935483870967744,0.011333333333333334,0.04032258064516129,0.006,0.010080645161290322,0.3059354838709677,0.6273434136382737,0.5712083563945546,93,False,0.11333333333333333,0.09333333333333334,0.02666666666666667,0.06,12.133333333333333,21.841397849462364,1085.0,863.0
+scsemi5,C108_1801,covid_positive,1500,806,150,0.5293333333333333,0.2853598014888337,0.015333333333333332,0.07568238213399504,0.114,0.08560794044665013,0.33,0.47890818858560796,0.009333333333333334,0.04466501240694789,0.002,0.02977667493796526,0.5447311827956989,0.7031329434575473,0.5734671713876929,133,False,0.26666666666666666,0.18666666666666668,0.05333333333333334,0.06,11.4,8.560794044665013,1085.0,676.0
+scsemi5,C108_2201,covid_positive,1500,696,150,0.534,0.2988505747126437,0.04,0.041666666666666664,0.12,0.09195402298850575,0.284,0.5100574712643678,0.011333333333333334,0.021551724137931036,0.010666666666666666,0.035919540229885055,0.5263908045977012,0.7504284354512468,0.6214779943532818,85,False,0.22666666666666666,0.05333333333333334,0.12666666666666668,0.06666666666666667,12.0,9.195402298850574,1084.0,1399.5
+scsemi5,C113_0605,covid_positive,1500,3274,150,0.568,0.6053756872327428,0.16733333333333333,0.14141722663408673,0.12333333333333334,0.032376298106292,0.11533333333333333,0.03512522907758094,0.0026666666666666666,0.030849114233353694,0.023333333333333334,0.1548564447159438,0.39416249236408063,0.5467024804605793,0.7426182137039727,38,False,0.4266666666666667,0.04666666666666667,0.4066666666666667,0.4266666666666667,12.333333333333334,3.2376298106292003,1085.0,2026.0
+scsemi5,C123_2404,covid_positive,1500,3758,150,0.23466666666666666,0.5516232038318254,0.10133333333333333,0.04922831293241086,0.20466666666666666,0.08541777541245343,0.42733333333333334,0.271953166577967,0.0,0.032730175625332626,0.032,0.009047365620010643,0.6993734255809828,0.34353769941174406,0.7047481721545358,4,False,0.56,0.03333333333333333,0.32666666666666666,0.2,20.466666666666665,8.541777541245343,1086.0,1299.0
+scsemi5,C123_2904,covid_positive,1500,3252,150,0.596,0.49231242312423124,0.11866666666666667,0.07380073800738007,0.12333333333333334,0.19034440344403444,0.12,0.22478474784747848,0.005333333333333333,0.01107011070110701,0.03666666666666667,0.007687576875768758,0.3550651906519065,0.15718934468419524,0.7086753144863011,3,False,0.3466666666666667,0.013333333333333334,0.23333333333333334,0.14,12.333333333333334,19.034440344403443,1087.0,1489.0
+scsemi5,C123_0505,covid_positive,1500,2266,150,0.5113333333333333,0.4854368932038835,0.09866666666666667,0.05383936451897617,0.2,0.27184466019417475,0.10733333333333334,0.13901147396293026,0.004,0.025154457193292144,0.07866666666666666,0.02471315092674316,0.24935451603412762,0.2116373285290317,0.647241723170494,9,False,0.3466666666666667,0.006666666666666667,0.49333333333333335,0.12666666666666668,20.0,27.184466019417474,1085.0,1849.0
+scsemi5,C124_2404,covid_positive,1500,2290,150,0.7673333333333333,0.5100436681222708,0.092,0.18777292576419213,0.05533333333333333,0.08340611353711791,0.06066666666666667,0.19519650655021833,0.012,0.017903930131004366,0.012666666666666666,0.005676855895196507,0.5285589519650655,0.23494530395777288,0.6861795964201509,22,False,0.5066666666666667,0.013333333333333334,0.6333333333333333,0.11333333333333333,5.533333333333333,8.340611353711791,1085.0,1635.0
+scsemi5,C124_2704,covid_positive,1500,4137,150,0.7726666666666666,0.5112400290065264,0.09533333333333334,0.11965192168237854,0.05266666666666667,0.06961566352429296,0.062,0.27870437515107566,0.011333333333333334,0.015711868503746677,0.006,0.005076142131979695,0.524700991056321,0.2752833180808006,0.6580576860710508,20,False,0.46,0.013333333333333334,0.62,0.06,5.266666666666667,6.961566352429297,1087.0,1328.0
+scsemi5,C124_0105,covid_positive,1500,5245,150,0.7913333333333333,0.5548141086749285,0.08866666666666667,0.07740705433746425,0.050666666666666665,0.06444232602478552,0.04533333333333334,0.25681601525262154,0.012666666666666666,0.041182078169685415,0.011333333333333334,0.005338417540514776,0.5075475055608516,0.3386566676430225,0.6127000849525144,11,False,0.42,0.006666666666666667,0.6066666666666667,0.1,5.066666666666666,6.444232602478552,1087.0,1944.0
+scsemi5,C126_2504,covid_positive,1500,8159,150,0.5673333333333334,0.5618335580340728,0.11666666666666667,0.056992278465498224,0.2,0.2332393675695551,0.08333333333333333,0.11177840421620297,0.028666666666666667,0.028925113371736734,0.004,0.0072312783429341835,0.13034832700085802,0.2589288967759831,0.5931302987109353,9,False,0.4066666666666667,0.006666666666666667,0.38666666666666666,0.04666666666666667,20.0,23.32393675695551,1087.0,1410.0
+scsemi5,C126_3004,covid_positive,1500,7181,150,0.5533333333333333,0.743629021027712,0.114,0.05848767581116836,0.20533333333333334,0.05082857540732488,0.08733333333333333,0.1211530427517059,0.03333333333333333,0.0181033282272664,0.006666666666666667,0.007798356774822448,0.45049417444181405,0.5096254631629721,0.5810016700868271,29,False,0.44,0.006666666666666667,0.38,0.1,20.533333333333335,5.082857540732489,1086.0,1641.0
+scsemi5,C126_0605,covid_positive,1500,6577,150,0.544,0.5716892200091227,0.11133333333333334,0.11023262885814201,0.18533333333333332,0.08712178804926259,0.11866666666666667,0.16618519081648167,0.036,0.055648471947696516,0.004666666666666667,0.009122700319294512,0.1986244995185241,0.22003992572143777,0.6079495727053669,11,False,0.38,0.04,0.4,0.12666666666666668,18.53333333333333,8.712178804926259,1084.0,1620.0
+scsemi5,C127_2504,covid_positive,1500,2691,150,0.7726666666666666,0.6648086213303604,0.092,0.10999628390932739,0.054,0.03121516164994426,0.064,0.18097361575622445,0.010666666666666666,0.00966183574879227,0.006666666666666667,0.0033444816053511705,0.2699397993311036,0.3860902271513931,0.7590499684392945,53,False,0.3,0.02666666666666667,0.44666666666666666,0.06,5.4,3.121516164994426,1087.0,1559.0
+scsemi5,C127_0405,covid_positive,1500,9080,150,0.7953333333333333,0.4183920704845815,0.1,0.07444933920704846,0.04133333333333333,0.24295154185022028,0.044,0.24295154185022028,0.014666666666666666,0.018502202643171806,0.004666666666666667,0.0027533039647577094,0.8088105726872247,0.29426676218633313,0.5526835339869343,42,False,0.43333333333333335,0.02666666666666667,0.5866666666666667,0.04666666666666667,4.133333333333333,24.295154185022028,1083.5,1270.0
+scsemi5,C127_1105,covid_positive,1500,5124,150,0.5406666666666666,0.5739656518345043,0.02266666666666667,0.09543325526932084,0.21466666666666667,0.14910226385636222,0.17933333333333334,0.1649102263856362,0.03866666666666667,0.01522248243559719,0.004,0.001366120218579235,0.2121311475409837,0.17227750941850428,0.7080055424009641,23,False,0.41333333333333333,0.013333333333333334,0.35333333333333333,0.19333333333333333,21.46666666666667,14.910226385636221,1085.0,1529.5
+scsemi5,C128_2504,covid_positive,1500,4306,150,0.518,0.6421272642823966,0.09733333333333333,0.06618671620993961,0.07,0.1692986530422666,0.26866666666666666,0.09939619136089178,0.042,0.02275894101254064,0.004,0.00023223409196470042,0.4468518346493265,0.30990079804938797,0.684294784632525,57,False,0.30666666666666664,0.013333333333333334,0.05333333333333334,0.03333333333333333,7.000000000000001,16.92986530422666,1087.0,1385.5
+scsemi5,C128_0405,covid_positive,1500,4498,150,0.7753333333333333,0.7550022232103157,0.14533333333333334,0.13361493997332147,0.03,0.053357047576700754,0.026,0.048910626945309024,0.016666666666666666,0.007114273010226767,0.006666666666666667,0.0020008892841262785,0.09253534904401951,0.5544123239040238,0.7108122868389775,48,False,0.32,0.0,0.5866666666666667,0.013333333333333334,3.0,5.335704757670076,1086.0,1437.0
+scsemi5,C128_1105,covid_positive,1500,6655,150,0.758,0.7095416979714501,0.15333333333333332,0.04552967693463561,0.03266666666666666,0.15251690458302028,0.023333333333333334,0.05875281743050338,0.029333333333333333,0.03215627347858753,0.0033333333333333335,0.0015026296018031556,0.3161853243175557,0.44649756050615236,0.6363969709735524,30,False,0.36666666666666664,0.02,0.6733333333333333,0.08,3.266666666666666,15.251690458302027,1085.0,1871.0
+scsemi5,C132_2804,covid_positive,1500,5471,150,0.8553333333333333,0.7344178395174557,0.07133333333333333,0.13087186985925792,0.012666666666666666,0.021568269055017363,0.04733333333333333,0.09376713580698227,0.012666666666666666,0.01772984829098885,0.0006666666666666666,0.0016450374702979345,0.2418309876317553,0.5093998680139151,0.6878169464403197,37,False,0.24,0.02666666666666667,0.6066666666666667,0.14,1.2666666666666666,2.1568269055017364,1087.0,1362.0
+scsemi5,C132_0205,covid_positive,1500,4671,150,0.554,0.6112181545707557,0.11733333333333333,0.11432241490044959,0.19866666666666666,0.08948833226289873,0.09,0.13680154142581888,0.034666666666666665,0.046242774566473986,0.005333333333333333,0.0019267822736030828,0.23119160779276374,0.27701422293541983,0.5725316219115668,45,False,0.44,0.02666666666666667,0.22666666666666666,0.15333333333333332,19.866666666666667,8.948833226289873,1086.0,1457.0
+scsemi5,C132_1105,covid_positive,1500,4699,150,0.628,0.6814215790593743,0.02,0.19472228133645456,0.19666666666666666,0.04618003830602256,0.09066666666666667,0.06873802936795063,0.058,0.007022770802298362,0.006666666666666667,0.001915301127899553,0.4562877207916577,0.5311081700521457,0.6715813295335761,44,False,0.22666666666666666,0.006666666666666667,0.28,0.18666666666666668,19.666666666666664,4.618003830602256,1087.0,1737.0
+scsemi5,C138_3004,covid_negative,1500,1909,150,0.5133333333333333,0.34468308014667365,0.10333333333333333,0.025144054478784705,0.23133333333333334,0.3609219486642221,0.13,0.1959140911471975,0.018666666666666668,0.06862231534834992,0.0033333333333333335,0.004714510214772132,0.4936790640824166,0.5281468676155976,0.5955102942094533,35,False,0.41333333333333333,0.03333333333333333,0.31333333333333335,0.07333333333333333,23.133333333333333,36.09219486642221,1084.0,1398.0
+scsemi5,C138_2301,covid_positive,1500,964,150,0.36533333333333334,0.38278008298755184,0.09133333333333334,0.0508298755186722,0.20266666666666666,0.12033195020746888,0.318,0.3153526970954357,0.016666666666666666,0.03734439834024896,0.006,0.09336099585062241,0.25097095435684647,0.4812990193584171,0.6906147191824975,19,False,0.38666666666666666,0.03333333333333333,0.26,0.05333333333333334,20.266666666666666,12.033195020746888,1087.0,1072.0
+scsemi5,C138_3001,covid_positive,1500,731,150,0.21266666666666667,0.12311901504787962,0.10266666666666667,0.08207934336525308,0.228,0.4008207934336525,0.316,0.27359781121751026,0.01,0.02188782489740082,0.13066666666666665,0.09849521203830369,0.3694172366621067,0.8573617659294562,0.7544558502996919,26,False,0.18666666666666668,0.04666666666666667,0.1,0.12666666666666668,22.8,40.08207934336525,1087.0,1223.0
+scsemi5,C138_0202,covid_positive,1500,2861,150,0.5853333333333334,0.2153093324012583,0.043333333333333335,0.0740999650471863,0.12333333333333334,0.5159035302341839,0.13866666666666666,0.1422579517651171,0.008,0.04194337644180356,0.10133333333333333,0.01048584411045089,0.9217429803099151,0.7144985234943826,0.6268951764300602,62,False,0.12666666666666668,0.04666666666666667,0.15333333333333332,0.04,12.333333333333334,51.59035302341839,1086.0,1031.0
+scsemi5,C138_0402,covid_positive,1500,500,150,0.5886666666666667,0.344,0.15333333333333332,0.074,0.12733333333333333,0.304,0.1,0.202,0.0033333333333333335,0.008,0.027333333333333334,0.068,0.648,0.4595341325505233,0.7402541017463772,67,False,0.3466666666666667,0.013333333333333334,0.28,0.09333333333333334,12.733333333333333,30.4,1087.0,1847.5
+scsemi5,C140_3004,covid_negative,1500,3196,150,0.5946666666666667,0.27252816020025034,0.11466666666666667,0.3886107634543179,0.17,0.12484355444305381,0.04533333333333334,0.13610763454317898,0.064,0.07165206508135169,0.011333333333333334,0.006257822277847309,0.744740926157697,0.6385203514127898,0.4877152861205405,106,False,0.31333333333333335,0.06,0.48,0.04,17.0,12.48435544430538,1084.0,915.5
+scsemi5,C140_2801,covid_positive,1500,226,113,0.5793333333333334,0.26991150442477874,0.162,0.2610619469026549,0.12066666666666667,0.11946902654867257,0.11533333333333333,0.3230088495575221,0.004,0.02654867256637168,0.018666666666666668,0.0,0.6585722713864309,0.6262991645866398,0.6949889009303356,123,False,0.2831858407079646,0.05309734513274336,0.23893805309734514,0.008849557522123894,12.066666666666666,11.946902654867257,1087.0,1194.0
+scsemi5,C140_3001,covid_positive,1500,6088,150,0.498,0.12220762155059132,0.11466666666666667,0.2664257555847569,0.22066666666666668,0.33327858081471745,0.13533333333333333,0.2176412614980289,0.02266666666666667,0.056504599211563734,0.008666666666666666,0.003942181340341655,0.7610337275514673,0.7956494278822857,0.5982095070020227,77,False,0.36,0.04,0.26,0.006666666666666667,22.066666666666666,33.327858081471746,1084.0,925.0
+scsemi5,C140_0202,covid_positive,1500,3567,150,0.5486666666666666,0.2612839921502663,0.11066666666666666,0.29072049341183065,0.19333333333333333,0.16232127838519764,0.10866666666666666,0.2321278385197645,0.034666666666666665,0.04513596860106532,0.004,0.008410428931875526,0.636789458929072,0.5339703340264136,0.5564415824529759,82,False,0.38666666666666666,0.04666666666666667,0.43333333333333335,0.013333333333333334,19.333333333333332,16.232127838519762,1086.0,1057.0
+scsemi5,C140_0402,covid_positive,1500,1593,150,0.5133333333333333,0.15065913370998116,0.09333333333333334,0.49466415568110483,0.11133333333333334,0.0696798493408663,0.18,0.2542372881355932,0.09733333333333333,0.025109855618330193,0.004666666666666667,0.005649717514124294,0.9531023226616446,0.9559604592996818,0.5316199653142392,111,False,0.2,0.03333333333333333,0.2866666666666667,0.02666666666666667,11.133333333333335,6.96798493408663,1086.0,840.0
+scsemi5,C140_0602,covid_positive,1500,2196,150,0.546,0.13479052823315119,0.11333333333333333,0.28734061930783245,0.19933333333333333,0.31785063752276865,0.112,0.16939890710382513,0.025333333333333333,0.08378870673952642,0.004,0.006830601092896175,0.8224189435336976,0.764706775012057,0.5475593015565968,69,False,0.3933333333333333,0.08,0.3933333333333333,0.10666666666666667,19.933333333333334,31.785063752276866,1090.0,902.0
+scsemi5,C140_0902,covid_positive,1500,2211,150,0.5653333333333334,0.13251922207146088,0.10933333333333334,0.37403889642695615,0.206,0.2618724559023066,0.07133333333333333,0.182722749886929,0.04466666666666667,0.04296698326549073,0.0033333333333333335,0.005879692446856626,0.8690275893260968,0.7711512046275167,0.5106822281953405,93,False,0.3466666666666667,0.02666666666666667,0.5266666666666666,0.03333333333333333,20.599999999999998,26.187245590230663,1086.0,1221.0
+scsemi5,C140_1103,recovery,1500,1468,150,0.556,0.3528610354223433,0.11466666666666667,0.30040871934604907,0.20066666666666666,0.10422343324250681,0.096,0.20299727520435967,0.029333333333333333,0.027929155313351498,0.0033333333333333335,0.011580381471389645,0.6019727520435968,0.4649695607671032,0.5396059294604515,105,False,0.29333333333333333,0.03333333333333333,0.3933333333333333,0.05333333333333334,20.066666666666666,10.422343324250681,1086.0,1276.5
+scsemi5,C141_2001,covid_positive,1500,3028,150,0.5266666666666666,0.3543593130779392,0.016,0.014200792602377808,0.104,0.35402906208718626,0.336,0.10997357992073976,0.007333333333333333,0.04722589167767503,0.01,0.1202113606340819,0.8002659621312197,0.609444442221954,0.5898706786170611,52,False,0.15333333333333332,0.06,0.07333333333333333,0.08,10.4,35.402906208718626,1085.0,1203.0
+scsemi5,C141_2201,covid_positive,1500,2514,150,0.4786666666666667,0.37748607796340494,0.014666666666666666,0.07438345266507558,0.12533333333333332,0.31145584725536996,0.3606666666666667,0.11177406523468576,0.011333333333333334,0.0588703261734288,0.009333333333333334,0.066030230708035,0.7001463802704854,0.43922462169773513,0.5937833494165186,43,False,0.08,0.12666666666666668,0.08,0.05333333333333334,12.533333333333333,31.145584725536995,1085.0,892.0
+scsemi5,C141_3001,covid_positive,1500,1237,150,0.6273333333333333,0.3556992724333064,0.14666666666666667,0.116410670978173,0.12533333333333332,0.28698464025869036,0.07866666666666666,0.09215844785772029,0.004666666666666667,0.02263540824575586,0.017333333333333333,0.12611156022635409,0.6037801131770413,0.4544442962362094,0.6704921359415821,11,False,0.36666666666666664,0.06,0.30666666666666664,0.1,12.533333333333333,28.698464025869036,1086.0,1561.0
+scsemi5,C141_0202,covid_positive,1500,1025,150,0.8113333333333334,0.5629268292682926,0.03133333333333333,0.041951219512195125,0.10866666666666666,0.15609756097560976,0.014,0.18341463414634146,0.010666666666666666,0.02048780487804878,0.024,0.0351219512195122,0.4968130081300814,0.22041789156899266,0.5231800032928035,53,False,0.28,0.08666666666666667,0.54,0.12666666666666668,10.866666666666665,15.609756097560975,1086.0,1487.0
+scsemi5,C142_3004,covid_negative,1500,10903,150,0.7313333333333333,0.5483811794918829,0.013333333333333334,0.10841052921214345,0.064,0.1384022746033202,0.156,0.17169586352380078,0.030666666666666665,0.03182610290745666,0.004666666666666667,0.001284050261395946,0.3726695404934422,0.1331379680119099,0.5757467139402555,15,False,0.29333333333333333,0.02666666666666667,0.2733333333333333,0.09333333333333334,6.4,13.840227460332018,1084.0,1617.0
+scsemi5,C145_3004,covid_negative,1500,743,150,0.6013333333333334,0.6002691790040376,0.114,0.05787348586810229,0.17733333333333334,0.033647375504710635,0.04066666666666666,0.26648721399730824,0.058,0.018842530282637954,0.008666666666666666,0.02288021534320323,0.4800681920143564,0.4320860863906481,0.5093402221406437,97,False,0.26,0.05333333333333334,0.42,0.12,17.733333333333334,3.3647375504710633,1086.0,894.0
+scsemi5,C145_0701,covid_positive,1500,1110,150,0.5,0.3036036036036036,0.016666666666666666,0.26306306306306304,0.09933333333333333,0.1963963963963964,0.37066666666666664,0.1972972972972973,0.01,0.03063063063063063,0.0033333333333333335,0.009009009009009009,0.7395315315315315,0.4007833812668684,0.5824615801912838,101,False,0.14,0.07333333333333333,0.006666666666666667,0.04,9.933333333333334,19.63963963963964,1085.0,848.5
+scsemi5,C145_1201,covid_positive,1500,347,150,0.45266666666666666,0.207492795389049,0.09133333333333334,0.5504322766570605,0.06333333333333334,0.0345821325648415,0.3466666666666667,0.14697406340057637,0.04,0.02881844380403458,0.006,0.03170028818443804,0.9695984630163303,0.8996513976004751,0.5547377029766328,142,False,0.10666666666666667,0.06,0.02666666666666667,0.02,6.333333333333334,3.45821325648415,1086.0,627.0
+scsemi5,C145_1401,covid_positive,1500,1060,150,0.568,0.2169811320754717,0.043333333333333335,0.2650943396226415,0.11866666666666667,0.22641509433962265,0.24333333333333335,0.24716981132075472,0.011333333333333334,0.016037735849056604,0.015333333333333332,0.02830188679245283,0.7020377358490565,0.5915789452607205,0.5285677615690315,105,False,0.05333333333333334,0.02666666666666667,0.03333333333333333,0.04666666666666667,11.866666666666667,22.641509433962266,1085.0,861.0
+scsemi5,C145_1901,covid_positive,1500,1173,150,0.8066666666666666,0.32821824381926684,0.132,0.24296675191815856,0.02266666666666667,0.216538789428815,0.014,0.16112531969309463,0.021333333333333333,0.0247229326513214,0.0033333333333333335,0.026427962489343565,0.9568968456947997,0.35234559765969414,0.49672825300900103,79,False,0.3333333333333333,0.06666666666666667,0.6866666666666666,0.18,2.2666666666666666,21.653878942881498,1085.0,1148.0
+scsemi5,C145_2301,covid_positive,1500,958,150,0.776,0.5198329853862212,0.14933333333333335,0.1638830897703549,0.025333333333333333,0.10334029227557412,0.027333333333333334,0.1826722338204593,0.018,0.009394572025052192,0.004,0.020876826722338204,0.5295448851774531,0.19238259566135318,0.5600339106394895,65,False,0.38,0.08,0.5466666666666666,0.11333333333333333,2.533333333333333,10.334029227557412,1085.0,1421.0
+scsemi5,C146_3004,covid_negative,1500,2608,150,0.6186666666666667,0.7346625766871165,0.007333333333333333,0.049079754601226995,0.214,0.125,0.102,0.05253067484662577,0.054,0.03450920245398773,0.004,0.004217791411042945,0.31592024539877295,0.5065809929498488,0.6085057782085029,24,False,0.25333333333333335,0.18666666666666668,0.36666666666666664,0.24666666666666667,21.4,12.5,1085.0,845.5
+scsemi5,C146_1201,covid_positive,1500,3205,150,0.5506666666666666,0.5691107644305772,0.019333333333333334,0.10452418096723869,0.11,0.2343213728549142,0.2986666666666667,0.05585023400936037,0.016,0.027769110764430577,0.005333333333333333,0.008424336973478939,0.48563286531461264,0.2830345165409798,0.6051295370531926,76,False,0.15333333333333332,0.02666666666666667,0.006666666666666667,0.02666666666666667,11.0,23.432137285491418,1088.0,854.0
+scsemi5,C146_1401,covid_positive,1500,1733,150,0.574,0.6641661858049625,0.082,0.09001731102135026,0.06933333333333333,0.14945181765724178,0.228,0.06520484708597807,0.042,0.029428736295441432,0.004666666666666667,0.0017311021350259665,0.3566039623004424,0.35955401104041523,0.6106750803660971,34,False,0.15333333333333332,0.13333333333333333,0.006666666666666667,0.11333333333333333,6.933333333333333,14.945181765724177,1086.0,758.0
+scsemi5,C146_1601,covid_positive,1500,363,150,0.53,0.4573002754820937,0.014666666666666666,0.2975206611570248,0.11666666666666667,0.06336088154269973,0.324,0.1322314049586777,0.010666666666666666,0.0440771349862259,0.004,0.005509641873278237,0.6355482093663912,0.3740439147783728,0.5517603683661829,138,False,0.14,0.07333333333333333,0.02666666666666667,0.006666666666666667,11.666666666666666,6.336088154269973,1087.0,577.0
+scsemi5,C146_1901,covid_positive,1500,2803,150,0.594,0.708169818052087,0.04,0.13877987870139136,0.11533333333333333,0.06814127720299679,0.22733333333333333,0.06778451658936853,0.012,0.00856225472707813,0.011333333333333334,0.00856225472707813,0.42589939350695677,0.47895356019216834,0.5899845304344375,63,False,0.14,0.06666666666666667,0.006666666666666667,0.04,11.533333333333333,6.814127720299679,1087.0,820.0
+scsemi5,C146_2301,covid_positive,1500,1330,150,0.4846666666666667,0.649624060150376,0.046,0.13458646616541353,0.12133333333333333,0.0518796992481203,0.324,0.1443609022556391,0.005333333333333333,0.006015037593984963,0.018666666666666668,0.013533834586466165,0.5084511278195489,0.35347521931679055,0.6034443854157001,72,False,0.06666666666666667,0.04,0.1,0.04,12.133333333333333,5.18796992481203,1088.0,953.5
+scsemi5,C146_2701,covid_positive,1500,1109,150,0.7826666666666666,0.4211000901713255,0.13266666666666665,0.16050495942290352,0.04,0.3155996393146979,0.026,0.06492335437330929,0.014,0.019837691614066726,0.004666666666666667,0.018034265103697024,0.7231331529906824,0.3559145979795056,0.6674454643462224,75,False,0.35333333333333333,0.02666666666666667,0.5333333333333333,0.10666666666666667,4.0,31.55996393146979,1085.0,1485.0
+scsemi5,C146_2502,recovery,1500,5129,150,0.6133333333333333,0.71475921232209,0.006666666666666667,0.04679274712419575,0.21,0.14837200233963735,0.12066666666666667,0.06336517839734841,0.046,0.01852212906999415,0.0033333333333333335,0.008188730746734256,0.2928147137193735,0.46074006407467033,0.6661150765543611,14,False,0.22,0.07333333333333333,0.3933333333333333,0.18666666666666668,21.0,14.837200233963735,1084.0,1290.0
+scsemi5,C147_3004,covid_negative,1500,2048,150,0.6186666666666667,0.59375,0.09933333333333333,0.1328125,0.20066666666666666,0.109375,0.03333333333333333,0.1259765625,0.04066666666666666,0.0322265625,0.007333333333333333,0.005859375,0.25224479166666675,0.2252631211530846,0.49872612047851184,70,False,0.30666666666666664,0.08,0.58,0.11333333333333333,20.066666666666666,10.9375,1086.0,1014.0
+scsemi5,C147_1401,covid_positive,1500,2973,150,0.57,0.2263706693575513,0.162,0.2472250252270434,0.12666666666666668,0.3871510258997645,0.11933333333333333,0.110326269761184,0.006,0.02119071644803229,0.016,0.007736293306424487,0.721800201816347,0.6746563259960143,0.6895379584644502,103,False,0.44,0.05333333333333334,0.3333333333333333,0.02,12.666666666666668,38.71510258997645,1086.0,1017.0
+scsemi5,C147_1901,covid_positive,1500,3691,150,0.604,0.42021132484421564,0.152,0.24735843944730426,0.126,0.04958005960444324,0.10066666666666667,0.21376320780276348,0.005333333333333333,0.006502302898943376,0.012,0.06258466540232999,0.5204172311026822,0.4478029938438064,0.6133725865445497,92,False,0.37333333333333335,0.08666666666666667,0.36,0.013333333333333334,12.6,4.958005960444324,1088.0,844.0
+scsemi5,C161_1105,covid_negative,1500,820,150,0.3233333333333333,0.6743902439024391,0.10533333333333333,0.06341463414634146,0.24066666666666667,0.20853658536585365,0.048666666666666664,0.00975609756097561,0.012,0.03902439024390244,0.27,0.004878048780487805,0.7561626016260163,0.4502160694501434,0.7246172396402969,65,False,0.15333333333333332,0.006666666666666667,0.08666666666666667,0.08666666666666667,24.066666666666666,20.853658536585364,1087.0,1665.0
+scsemi5,C164_1105,covid_negative,1500,5983,150,0.6106666666666667,0.8880160454621427,0.011333333333333334,0.018051144910579978,0.208,0.04579642319906402,0.10466666666666667,0.03359518636135718,0.06266666666666666,0.010864114992478689,0.0026666666666666666,0.0036770850743774027,0.570155217560867,0.7982374954865337,0.678939989422544,23,False,0.30666666666666664,0.03333333333333333,0.34,0.3333333333333333,20.8,4.579642319906402,1085.0,1565.0
+scsemi5,C167_1205,covid_negative,1500,9978,150,0.5866666666666667,0.7162758067749048,0.007333333333333333,0.03487672880336741,0.20866666666666667,0.08819402685909,0.14133333333333334,0.149929845660453,0.05266666666666667,0.008719182200841852,0.0033333333333333335,0.0020044097013429546,0.3314980958107837,0.4523381415108289,0.6246202288242825,24,False,0.30666666666666664,0.013333333333333334,0.34,0.19333333333333333,20.866666666666667,8.819402685909001,1085.0,1452.0
+scsemi5,C168_1205,covid_negative,1500,2323,150,0.5493333333333333,0.49978476108480413,0.10466666666666667,0.05337925096857512,0.20533333333333334,0.21437795953508396,0.108,0.16272061988807576,0.029333333333333333,0.06371071889797675,0.0033333333333333335,0.006026689625484288,0.20167197589324154,0.15733487198607096,0.5676512881786545,43,False,0.38666666666666666,0.17333333333333334,0.4666666666666667,0.08,20.533333333333335,21.437795953508395,1086.0,781.0
+scsemi5,C168_2001,covid_positive,1500,2751,150,0.564,0.3300617957106507,0.17,0.31842966194111233,0.124,0.18684114867320975,0.11733333333333333,0.11959287531806616,0.004,0.03744093057070156,0.020666666666666667,0.007633587786259542,0.4939425663395129,0.43695328400941197,0.7232890712808036,56,False,0.44666666666666666,0.06666666666666667,0.28,0.03333333333333333,12.4,18.684114867320975,1087.0,945.0
+scsemi5,C168_2301,covid_positive,1500,901,150,0.5346666666666666,0.42730299667036625,0.09466666666666666,0.19200887902330743,0.068,0.051054384017758046,0.25533333333333336,0.2885682574916759,0.04466666666666667,0.03551609322974473,0.0026666666666666666,0.005549389567147614,0.2669197188309286,0.4018007059848499,0.6321847487611568,95,False,0.2733333333333333,0.06666666666666667,0.10666666666666667,0.02666666666666667,6.800000000000001,5.105438401775805,1087.0,853.0
+scsemi5,C168_3001,covid_positive,1500,1160,150,0.528,0.3931034482758621,0.10533333333333333,0.10775862068965517,0.21733333333333332,0.28706896551724137,0.12733333333333333,0.1310344827586207,0.017333333333333333,0.06810344827586207,0.004666666666666667,0.01293103448275862,0.2697931034482759,0.30574193059837124,0.6225774991156428,37,False,0.4866666666666667,0.07333333333333333,0.30666666666666664,0.1,21.73333333333333,28.706896551724135,1082.0,837.0
+scsemi5,C168_0202,covid_positive,1500,651,150,0.534,0.2903225806451613,0.108,0.18125960061443933,0.214,0.3302611367127496,0.11866666666666667,0.09984639016897082,0.022,0.09831029185867896,0.0033333333333333335,0.0,0.5316620583717357,0.5711918600111004,0.5706091305741349,104,False,0.46,0.05333333333333334,0.4866666666666667,0.07333333333333333,21.4,33.026113671274956,1086.5,670.0
+scsemi5,C168_0403,recovery,1500,2526,150,0.502,0.29493269992082344,0.11866666666666667,0.08036421219319081,0.22733333333333333,0.4398258115597783,0.13066666666666665,0.1421219319081552,0.018666666666666668,0.0344418052256532,0.0026666666666666666,0.00831353919239905,0.49073950910530484,0.5439323365830273,0.6023535135818082,45,False,0.4,0.05333333333333334,0.28,0.06,22.733333333333334,43.982581155977826,1085.0,1080.0
+scsemi5,C169_1205,covid_negative,1500,1252,150,0.862,0.444888178913738,0.05,0.11421725239616613,0.022,0.15175718849840256,0.016666666666666666,0.2340255591054313,0.03866666666666667,0.031150159744408944,0.010666666666666666,0.023961661341853034,0.8492566560170394,0.1628721939164842,0.47747139904986713,76,False,0.18,0.14,0.7933333333333333,0.20666666666666667,2.1999999999999997,15.175718849840255,1085.0,1000.0
+scsemi5,C169_2001,covid_positive,1500,755,150,0.5706666666666667,0.5814569536423841,0.16533333333333333,0.1827814569536424,0.13133333333333333,0.052980132450331126,0.10866666666666666,0.14437086092715232,0.005333333333333333,0.030463576158940398,0.018666666666666668,0.007947019867549669,0.1781456953642385,0.3005595154237766,0.6561501871211104,94,False,0.30666666666666664,0.15333333333333332,0.26,0.02666666666666667,13.133333333333333,5.298013245033113,1085.0,586.0
+scsemi5,C169_2301,covid_positive,1500,3773,150,0.534,0.5139146567717996,0.09066666666666667,0.08666843360720912,0.059333333333333335,0.04320169626292075,0.2653333333333333,0.31221839385104694,0.04666666666666667,0.028624436787702094,0.004,0.015372382719321495,0.11651488647407027,0.34787736782091533,0.5827821582387449,77,False,0.18,0.04666666666666667,0.06666666666666667,0.06666666666666667,5.933333333333334,4.320169626292075,1085.0,886.0
+scsemi5,C169_0202,covid_positive,1500,1286,150,0.6806666666666666,0.5256609642301711,0.012666666666666666,0.14774494556765164,0.07,0.14074650077760498,0.206,0.12052877138413685,0.028666666666666667,0.04821150855365474,0.002,0.017107309486780714,0.4809538621047175,0.15723016260325706,0.5895747399127723,46,False,0.24666666666666667,0.22666666666666666,0.24,0.14,7.000000000000001,14.074650077760499,1086.0,841.0
+scsemi5,C169_0403,recovery,1500,4368,150,0.71,0.5057234432234432,0.016,0.1201923076923077,0.05733333333333333,0.12248168498168498,0.18666666666666668,0.21268315018315018,0.02666666666666667,0.023351648351648352,0.0033333333333333335,0.015567765567765568,0.4151831501831501,0.13281521908529717,0.5808183366045166,80,False,0.3466666666666667,0.07333333333333333,0.29333333333333333,0.08,5.733333333333333,12.248168498168498,1084.0,992.0
+scsemi5,C187_2605,covid_negative,1500,1867,150,0.7833333333333333,0.129084092126406,0.11,0.04124263524370648,0.032,0.5243706480985538,0.042666666666666665,0.11355115158007499,0.028,0.17621853240492769,0.004,0.015532940546331012,1.4460132119264413,0.9980299651774706,0.6572298896660201,63,False,0.36,0.16,0.5333333333333333,0.13333333333333333,3.2,52.437064809855386,1086.0,783.0
+scsemi5,C187_1201,covid_positive,1500,1985,150,0.38266666666666665,0.05994962216624685,0.014,0.02518891687657431,0.11666666666666667,0.23425692695214106,0.47,0.6392947103274559,0.011333333333333334,0.031234256926952142,0.005333333333333333,0.010075566750629723,0.6454340890008397,1.1059285246361366,0.6348794757378778,59,False,0.16,0.13333333333333333,0.03333333333333333,0.04,11.666666666666666,23.425692695214106,1086.5,706.0
+scsemi5,C187_1401,covid_positive,1500,3155,150,0.4106666666666667,0.10998415213946117,0.016,0.041521394611727415,0.12,0.22060221870047544,0.43666666666666665,0.5670364500792393,0.008,0.04659270998415214,0.008666666666666666,0.014263074484944533,0.601365029054411,0.9648194937507721,0.6452877368406281,17,False,0.12666666666666668,0.22,0.04666666666666667,0.05333333333333334,12.0,22.060221870047545,1084.0,671.0
+scsemi5,C187_1901,covid_positive,1500,1966,150,0.5433333333333333,0.08748728382502544,0.16266666666666665,0.07019328585961343,0.13,0.1958290946083418,0.12733333333333333,0.5635808748728383,0.008,0.049338758901322485,0.028666666666666667,0.0335707019328586,1.0966388606307225,0.9509675223578019,0.7576771616659654,1,True,0.36,0.05333333333333334,0.28,0.08,13.0,19.58290946083418,1085.0,904.5
+scsemi5,C187_2301,covid_positive,1500,529,150,0.588,0.16446124763705103,0.14266666666666666,0.17391304347826086,0.12266666666666666,0.06994328922495274,0.12266666666666666,0.5311909262759924,0.004,0.03780718336483932,0.02,0.022684310018903593,0.9525242596093256,0.8904081689675525,0.6686115688465398,107,False,0.44666666666666666,0.23333333333333334,0.26666666666666666,0.14666666666666667,12.266666666666666,6.994328922495274,1085.0,695.0
+scsemi5,C187_2502,recovery,1500,5693,150,0.608,0.284559985947655,0.15066666666666667,0.018443702792903565,0.11533333333333333,0.2466186544879677,0.09866666666666667,0.39030388196030213,0.01,0.04268399789214825,0.017333333333333333,0.017389776919023364,0.9113259558522162,0.6603212842459626,0.6024328104624161,35,False,0.3333333333333333,0.06,0.46,0.03333333333333333,11.533333333333333,24.661865448796767,1086.0,985.0
+scsemi5,C190_2605,covid_negative,1500,1791,150,0.5726666666666667,0.04578447794528197,0.17133333333333334,0.0893355667225014,0.12733333333333333,0.4712451144611949,0.10266666666666667,0.3405918481295366,0.006666666666666667,0.0413176996091569,0.019333333333333334,0.011725293132328308,1.2329759910664433,1.0035664674336382,0.6357698101753338,14,False,0.38,0.07333333333333333,0.4066666666666667,0.1,12.733333333333333,47.124511446119485,1085.0,1186.0
+scsemi5,C190_2901,covid_positive,1500,1527,150,0.49866666666666665,0.0412573673870334,0.112,0.3798297314996726,0.23,0.3700065487884741,0.13266666666666665,0.16110019646365423,0.018,0.04191224623444663,0.008666666666666666,0.005893909626719057,0.9203641126391617,0.9740680872969392,0.5826595461209537,77,False,0.4266666666666667,0.03333333333333333,0.29333333333333333,0.05333333333333334,23.0,37.00065487884741,1086.0,1198.0
+scsemi5,C190_0102,covid_positive,1500,4868,150,0.534,0.03594905505341003,0.106,0.3769515201314708,0.216,0.33340180772391126,0.114,0.20336894001643385,0.02666666666666667,0.042317173377156944,0.0033333333333333335,0.00801150369761709,0.99610188989318,0.9777651397756887,0.5998367958357518,23,False,0.32666666666666666,0.03333333333333333,0.35333333333333333,0.14,21.6,33.34018077239113,1085.0,1038.0
+scsemi5,C190_0302,covid_positive,1500,2220,150,0.5853333333333334,0.11576576576576576,0.10933333333333334,0.3342342342342342,0.19666666666666666,0.3045045045045045,0.06466666666666666,0.20315315315315316,0.034,0.03333333333333333,0.01,0.009009009009009009,0.9424504504504505,0.8161367077281934,0.5355066453487942,58,False,0.37333333333333335,0.06,0.5666666666666667,0.14,19.666666666666664,30.45045045045045,1086.0,1175.5
+scsemi5,C190_0502,covid_positive,1500,2030,150,0.5266666666666666,0.05172413793103448,0.11266666666666666,0.24778325123152709,0.216,0.5167487684729064,0.11266666666666666,0.10541871921182266,0.026,0.07389162561576355,0.006,0.004433497536945813,0.9675139573070608,1.0674183248921467,0.5814692455977983,45,False,0.36,0.09333333333333334,0.36666666666666664,0.06,21.6,51.67487684729064,1087.0,799.0
+scsemi5,C190_0802,covid_positive,1500,1447,150,0.5273333333333333,0.038700760193503804,0.106,0.2156185210780926,0.21533333333333332,0.5929509329647547,0.12333333333333334,0.0912232204561161,0.02266666666666667,0.05459571527297857,0.005333333333333333,0.006910850034554251,1.0414853720340935,1.116901372883404,0.6062320817851017,39,False,0.43333333333333335,0.06,0.3933333333333333,0.07333333333333333,21.53333333333333,59.295093296475464,1088.0,854.0
+scsemi5,C190_1002,covid_positive,1500,4052,150,0.5293333333333333,0.044669299111549855,0.1,0.12043435340572557,0.21466666666666667,0.6414116485686081,0.12266666666666666,0.12709772951628825,0.023333333333333334,0.06071076011846002,0.01,0.005676209279368213,0.9779756498848305,1.03568455843734,0.635426790347651,9,False,0.44666666666666666,0.11333333333333333,0.36,0.1,21.46666666666667,64.14116485686081,1086.0,994.0
+scsemi5,C190_0903,recovery,1500,1371,150,0.5646666666666667,0.0962800875273523,0.168,0.24288840262582057,0.11866666666666667,0.4062727935813275,0.10866666666666666,0.1560904449307075,0.007333333333333333,0.07221006564551423,0.03266666666666666,0.0262582056892779,0.9495900802334063,0.8548296582894102,0.6738618707143076,5,False,0.37333333333333335,0.21333333333333335,0.38,0.20666666666666667,11.866666666666667,40.62727935813275,1086.0,998.0
+scsemi5,C193_2605,covid_negative,1500,5566,150,0.5733333333333334,0.40837226015091627,0.09266666666666666,0.03557312252964427,0.21866666666666668,0.34441250449155586,0.08133333333333333,0.17714696370822852,0.028666666666666667,0.02982393100970176,0.005333333333333333,0.004671218109953288,0.445433465085639,0.36821325684791817,0.5857251962793785,4,False,0.4066666666666667,0.02,0.5133333333333333,0.25333333333333335,21.866666666666667,34.44125044915559,1086.0,2119.5
+scsemi5,C195_2605,covid_negative,1500,7759,150,0.5913333333333334,0.5532929501224385,0.004,0.038407011212785155,0.18733333333333332,0.08815569016625854,0.142,0.3107359195772651,0.07133333333333333,0.008248485629591443,0.004,0.0011599432916612965,0.40628586158010055,0.42150604715340445,0.6410585747655241,10,False,0.26666666666666666,0.006666666666666667,0.28,0.3,18.73333333333333,8.815569016625854,1087.0,1513.0
+scsemi5,C197_2605,covid_negative,1500,2835,150,0.8053333333333333,0.6052910052910053,0.08333333333333333,0.13015873015873017,0.056,0.1347442680776014,0.03933333333333333,0.08677248677248678,0.011333333333333334,0.01869488536155203,0.004666666666666667,0.02433862433862434,0.4000846560846561,0.26098244063521137,0.6049366901663943,17,False,0.3333333333333333,0.013333333333333334,0.5266666666666666,0.24,5.6000000000000005,13.474426807760139,1085.0,1812.0
+scsemi5,C212_2705,covid_negative,1500,1150,150,0.5233333333333333,0.5417391304347826,0.108,0.0817391304347826,0.21933333333333332,0.15478260869565216,0.114,0.18869565217391304,0.027333333333333334,0.026956521739130435,0.008,0.00608695652173913,0.18620289855072464,0.15243626611095185,0.609135454587881,6,False,0.3933333333333333,0.013333333333333334,0.42,0.44666666666666666,21.933333333333334,15.478260869565217,1086.0,1861.5
+scsemi5,C214_2705,covid_negative,1500,6279,150,0.55,0.3494186972447842,0.108,0.08138238573021182,0.208,0.3817486860965122,0.09333333333333334,0.14667940754897277,0.034666666666666665,0.03567447045707915,0.006,0.005096352922439879,0.45620512820512826,0.42435577816087855,0.5719211959548722,16,False,0.3333333333333333,0.02,0.43333333333333335,0.13333333333333333,20.8,38.17486860965122,1086.0,1795.0
+scsemi5,C234_2805,covid_negative,1500,9882,150,0.7786666666666666,0.609492005666869,0.098,0.08429467719085205,0.04933333333333333,0.16636308439587127,0.059333333333333335,0.12001619105444242,0.010666666666666666,0.016798218984011334,0.004,0.0030358227079538553,0.3676883222019834,0.23726654209605264,0.7291033537833995,1,True,0.31333333333333335,0.06,0.5666666666666667,0.25333333333333335,4.933333333333334,16.63630843958713,1085.0,1650.0
+scsemi5,C237_2805,covid_negative,1500,5071,150,0.7513333333333333,0.5912048905541314,0.15,0.08913429303884836,0.034,0.15519621376454348,0.035333333333333335,0.14789982252021297,0.02,0.014198382961940446,0.009333333333333334,0.0023663971603234074,0.46752540590284614,0.20043474686898952,0.7510212971400485,5,False,0.26,0.04666666666666667,0.4866666666666667,0.13333333333333333,3.4000000000000004,15.519621376454348,1085.0,1379.0
+scsemi5,C238_2905,covid_negative,1500,7843,150,0.8533333333333334,0.8912405967104424,0.07,0.034298100216753794,0.014666666666666666,0.03735815376769094,0.051333333333333335,0.023842917251051893,0.009333333333333334,0.010455182965701899,0.0013333333333333333,0.002805049088359046,0.12638463173105524,0.8047320141978977,0.815971795337243,2,False,0.36666666666666664,0.02666666666666667,0.6,0.15333333333333332,1.4666666666666666,3.735815376769094,1085.0,1738.0
+scsemi5,C240_2905,covid_negative,1500,2346,150,0.5066666666666667,0.5524296675191815,0.10133333333333333,0.03836317135549872,0.22866666666666666,0.20588235294117646,0.134,0.18584825234441602,0.02266666666666667,0.014919011082693947,0.006666666666666667,0.0025575447570332483,0.1952225063938618,0.22906512638272097,0.6265564668005773,9,False,0.37333333333333335,0.03333333333333333,0.37333333333333335,0.3333333333333333,22.866666666666667,20.588235294117645,1087.0,1652.5
+scsemi5,C246_2905,covid_negative,1500,769,150,0.5713333333333334,0.7451235370611183,0.010666666666666666,0.013003901170351105,0.21533333333333332,0.08972691807542263,0.15333333333333332,0.13394018205461639,0.04533333333333334,0.015604681404421327,0.004,0.002600780234070221,0.3522548764629388,0.5104399081436252,0.7318107286450831,11,False,0.4866666666666667,0.06,0.49333333333333335,0.43333333333333335,21.53333333333333,8.972691807542263,1087.0,1382.0
+scsemi5,C251_2905,covid_negative,1500,2117,150,0.5986666666666667,0.8304204062352385,0.09933333333333333,0.07510628247520075,0.19266666666666668,0.03306565895134624,0.05533333333333333,0.05054322153991497,0.04533333333333334,0.007085498346717053,0.008666666666666666,0.003778932451582428,0.46350747913714374,0.6822350108464306,0.5611103664243555,28,False,0.36,0.0,0.54,0.2866666666666667,19.26666666666667,3.306565895134624,1087.0,2293.0

paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20260930T065633Z-summary-deck-scsemi-final/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scores/imperial_eskd/fewshot_n5/draw4_scsemi5/summary.json

@@ -0,0 +1,1007 @@
+{
+ "schema": "paired_ft_scores.v1",
+ "dataset": "imperial_eskd",
+ "written_utc": "2026-09-29T02:17:25.231788+00:00",
+ "command": [
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/tools/score_ft.py",
+  "--dataset",
+  "imperial_eskd",
+  "--out",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scores/imperial_eskd/fewshot_n5/draw4_scsemi5",
+  "--threads",
+  "6",
+  "--donors",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/data/imperial_eskd/fewshot_n5/draw4/test_samples.txt",
+  "--case-groups",
+  "covid_positive",
+  "--control-groups",
+  "covid_negative",
+  "--arm",
+  "scsemi5=/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/generated/imperial_eskd/fewshot_n5/draw4/scsemi5__raw.npz"
+ ],
+ "arms": [
+  "scsemi5"
+ ],
+ "donors": [
+  "C20_1004",
+  "C20_1404",
+  "C21_1004",
+  "C21_1704",
+  "C21_2504",
+  "C23_2204",
+  "C31_1304",
+  "C31_2004",
+  "C31_2704",
+  "C34_1404",
+  "C34_2104",
+  "C34_2504",
+  "C40_1504",
+  "C40_2204",
+  "C40_0105",
+  "C42_1504",
+  "C42_2204",
+  "C42_2704",
+  "C58_1604",
+  "C58_2501",
+  "C58_2901",
+  "C58_0102",
+  "C58_0402",
+  "C58_1003",
+  "C60_2504",
+  "C63_1704",
+  "C63_2404",
+  "C63_2904",
+  "C65_1704",
+  "C65_2104",
+  "C65_2504",
+  "C69_1804",
+  "C82_2504",
+  "C85_2004",
+  "C93_2104",
+  "C93_2704",
+  "C93_0405",
+  "C101_0601",
+  "C101_1101",
+  "C101_1301",
+  "C101_1801",
+  "C101_2001",
+  "C101_2502",
+  "C103_2204",
+  "C104_2204",
+  "C106_2204",
+  "C108_2204",
+  "C108_1501",
+  "C108_1801",
+  "C108_2201",
+  "C113_0605",
+  "C123_2404",
+  "C123_2904",
+  "C123_0505",
+  "C124_2404",
+  "C124_2704",
+  "C124_0105",
+  "C126_2504",
+  "C126_3004",
+  "C126_0605",
+  "C127_2504",
+  "C127_0405",
+  "C127_1105",
+  "C128_2504",
+  "C128_0405",
+  "C128_1105",
+  "C132_2804",
+  "C132_0205",
+  "C132_1105",
+  "C138_3004",
+  "C138_2301",
+  "C138_3001",
+  "C138_0202",
+  "C138_0402",
+  "C140_3004",
+  "C140_2801",
+  "C140_3001",
+  "C140_0202",
+  "C140_0402",
+  "C140_0602",
+  "C140_0902",
+  "C140_1103",
+  "C141_2001",
+  "C141_2201",
+  "C141_3001",
+  "C141_0202",
+  "C142_3004",
+  "C145_3004",
+  "C145_0701",
+  "C145_1201",
+  "C145_1401",
+  "C145_1901",
+  "C145_2301",
+  "C146_3004",
+  "C146_1201",
+  "C146_1401",
+  "C146_1601",
+  "C146_1901",
+  "C146_2301",
+  "C146_2701",
+  "C146_2502",
+  "C147_3004",
+  "C147_1401",
+  "C147_1901",
+  "C161_1105",
+  "C164_1105",
+  "C167_1205",
+  "C168_1205",
+  "C168_2001",
+  "C168_2301",
+  "C168_3001",
+  "C168_0202",
+  "C168_0403",
+  "C169_1205",
+  "C169_2001",
+  "C169_2301",
+  "C169_0202",
+  "C169_0403",
+  "C187_2605",
+  "C187_1201",
+  "C187_1401",
+  "C187_1901",
+  "C187_2301",
+  "C187_2502",
+  "C190_2605",
+  "C190_2901",
+  "C190_0102",
+  "C190_0302",
+  "C190_0502",
+  "C190_0802",
+  "C190_1002",
+  "C190_0903",
+  "C193_2605",
+  "C195_2605",
+  "C197_2605",
+  "C212_2705",
+  "C214_2705",
+  "C234_2805",
+  "C237_2805",
+  "C238_2905",
+  "C240_2905",
+  "C246_2905",
+  "C251_2905"
+ ],
+ "n_donors": 143,
+ "reference": {
+  "cache": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/imperial_eskd",
+  "reference_sha256": "34b4caa3f8a60b46d5faf58f09cdaa5622bcce19e4c45d9902a711fead96375e",
+  "features_sha256": "e46e5bb1a24eae045efe75125d20e3accaa8f68a1006eb2f60d24159013d4aa7",
+  "n_r1_cells": 21382,
+  "pca": {
+   "n_components": 50,
+   "explained_variance_ratio_sum": 0.2627490162849426,
+   "n_fit_cells": 21382
+  },
+  "r2_control": {
+   "precision": 0.9695538303245721,
+   "coverage": 0.9998129267608269,
+   "density": 1.2846272565709476,
+   "n_query": 21382,
+   "depth_matched": {
+    "precision": 0.9684313908895332,
+    "coverage": 0.999672621831447,
+    "density": 1.2835141707978672
+   }
+  },
+  "observed_l1_loo_null_mean": 0.5095285177538514
+ },
+ "contrast_definition": {
+  "enabled": true,
+  "rule": "explicit --case-groups / --control-groups",
+  "group_source": "features groups",
+  "case_groups": [
+   "covid_positive"
+  ],
+  "control_groups": [
+   "covid_negative"
+  ],
+  "n_case_donors": 104,
+  "n_control_donors": 31,
+  "n_donors_in_neither": 8,
+  "case": [
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false
+  ],
+  "ctrl": [
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true
+  ],
+  "groups": [
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative"
+  ]
+ },
+ "deg_definition": {
+  "enabled": true,
+  "score": "top-50 DEG overlap per cell type (benchmark total_top50_overlap, Welch backend)",
+  "source": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/bulk2sc-paper/scripts/evaluate_generated_vs_truth.py",
+  "functions": [
+   "welch_bh_deg",
+   "top_deg_genes",
+   "jaccard"
+  ],
+  "reproduces": "utility_studies_final6k_20260925/sle top-50 DEG 81 (1,006 genes) / 84 (2,279 genes) = sum over the six gated types of top50_overlap_count",
+  "top_n": 50,
+  "fdr": 0.05,
+  "n_genes": 5927,
+  "types": [
+   "T cell",
+   "B cell",
+   "Monocyte",
+   "NK cell",
+   "DC"
+  ],
+  "aggregates_source": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/imperial_eskd/deg_reference.npz",
+  "aggregates_sha256": "8fada1ace7530b79bfc5c5201b9cb60399ff77d083dd8b53b13cfbe900cda55c",
+  "aggregates_note": null,
+  "types_not_scored_observed": [],
+  "observed": {
+   "T cell": {
+    "n_significant": 1194,
+    "n_tested": 5743,
+    "n_case_donors": 104,
+    "n_control_donors": 31,
+    "n_cells": 244943,
+    "top_list_size": 50
+   },
+   "B cell": {
+    "n_significant": 310,
+    "n_tested": 5634,
+    "n_case_donors": 104,
+    "n_control_donors": 31,
+    "n_cells": 46230,
+    "top_list_size": 50
+   },
+   "Monocyte": {
+    "n_significant": 305,
+    "n_tested": 5624,
+    "n_case_donors": 103,
+    "n_control_donors": 31,
+    "n_cells": 77634,
+    "top_list_size": 50
+   },
+   "NK cell": {
+    "n_significant": 431,
+    "n_tested": 5565,
+    "n_case_donors": 104,
+    "n_control_donors": 31,
+    "n_cells": 65766,
+    "top_list_size": 50
+   },
+   "DC": {
+    "n_significant": 295,
+    "n_tested": 5419,
+    "n_case_donors": 104,
+    "n_control_donors": 31,
+    "n_cells": 12690,
+    "top_list_size": 50
+   }
+  },
+  "broadcast": "welch_bh_deg + top_deg_genes on the arm's condition bulk_counts (scoring genes, case|control donors), one list compared with every type's observed list (sle_broadcast.py broadcast_input_bulk); not part of the published benchmark"
+ },
+ "headline": {
+  "scsemi5": {
+   "comp_l1": 0.5564609753933458,
+   "comp_l1_obs_loo_null": 0.5095285177538514,
+   "precision": 0.3236834720793191,
+   "coverage": 0.05691703301842672,
+   "precision_dm": 0.369609952296324,
+   "coverage_dm": 0.12795809559442523,
+   "pb_r_median": 0.6133725865445497,
+   "pb_top1": 0.02097902097902098,
+   "mono_pct_gen": 12.785081585081587,
+   "mono_pct_obs": 17.567899313806723,
+   "median_umi_gen": 1086.0,
+   "median_umi_obs": 1367.0,
+   "contrast_mean_cp10k_r_gen": 0.5963964231394581,
+   "contrast_pseudobulk_log1p_cpm_r_gen": 0.28100270020759693,
+   "contrast_mean_cp10k_r_broadcast": 0.6565426449733607,
+   "contrast_pseudobulk_log1p_cpm_r_broadcast": 0.6057327733142364,
+   "deg_top50_T": 21,
+   "deg_top50_B": 8,
+   "deg_top50_Mono": 10,
+   "deg_top50_NK": 14,
+   "deg_top50_DC": 8,
+   "deg_top50_sum": 61,
+   "deg_top50_max": 250,
+   "deg_top50_sum_4type": 53,
+   "deg_top50_sum_broadcast": 76,
+   "seconds": 28.8
+  }
+ },
+ "per_arm": {
+  "scsemi5": {
+   "arm": "scsemi5",
+   "npz": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/generated/imperial_eskd/fewshot_n5/draw4/scsemi5__raw.npz",
+   "npz_sha256": "7c3743fa01a196c371ec3210d45c1ff28f51a6d97dad0643bdaa5648c5dc15d0",
+   "receipt_verified": true,
+   "generation": {
+    "checkpoint": null,
+    "checkpoint_sha256": null,
+    "input_condition_path": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/data/imperial_eskd/fewshot_n5/draw4/test_raw.npz",
+    "input_condition_sha256": "55970c18927ba5d8e151bf797760d36017fffd360229507c346e39c3c6759f69",
+    "seed": 20260927,
+    "steps": null,
+    "support_readout": "upstream (values <= 10 normalized units zeroed by fast_semi)",
+    "weights": null
+   },
+   "condition_for_broadcast": {
+    "path": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/data/imperial_eskd/fewshot_n5/draw4/test_raw.npz",
+    "sha256": "55970c18927ba5d8e151bf797760d36017fffd360229507c346e39c3c6759f69"
+   },
+   "poisson": {
+    "seed": 20260916,
+    "rule": "whole NPZ, rows in NPZ order",
+    "nnz_whole_npz": 27307100,
+    "median_library_whole_npz_panel": 1086.0,
+    "n_rows_whole_npz": 214500
+   },
+   "annotation": {
+    "model_pt_sha256": "bf3655899e5abee435340fc008656c4a17342da0f30b70cfd43de8e9223e1930",
+    "zero_padded_model_genes": 0,
+    "label_counts": {
+     "T cell": 130945,
+     "NK cell": 29007,
+     "Monocyte": 27424,
+     "B cell": 19289,
+     "DC": 5020,
+     "Other": 2815
+    },
+    "mean_l2_max_prob": 0.902823820529701,
+    "predict_seconds": 5.4
+   },
+   "n_donors": 143,
+   "n_generated_cells": 214500,
+   "composition": {
+    "l1_mean": 0.5564609753933458,
+    "l1_median": 0.5257891737891737,
+    "l1_obs_loo_null_mean": 0.5095285177538514,
+    "l1_generated_loo_mean_vs_observed_mean": 0.5008186609423579,
+    "composition_top1": 0.0,
+    "mean_fraction_generated": {
+     "T cell": 0.610466,
+     "B cell": 0.089925,
+     "Monocyte": 0.127851,
+     "NK cell": 0.135231,
+     "DC": 0.023403,
+     "Other": 0.013124
+    },
+    "mean_fraction_observed": {
+     "T cell": 0.491688,
+     "B cell": 0.123343,
+     "Monocyte": 0.175679,
+     "NK cell": 0.163061,
+     "DC": 0.03105,
+     "Other": 0.015178
+    }
+   },
+   "pseudobulk": {
+    "n_genes": 5927,
+    "r_median": 0.6133725865445497,
+    "r_mean": 0.6242486172546702,
+    "top1": 0.02097902097902098,
+    "n_top1": 3,
+    "own_rank_median": 45.0,
+    "chance_top1": 0.006993006993006993
+   },
+   "precision_coverage": {
+    "precision": 0.3236834720793191,
+    "coverage": 0.05691703301842672,
+    "density": 0.049242353381348795,
+    "n_query": 21382,
+    "n_reference": 21382
+   },
+   "precision_coverage_depth_matched": {
+    "precision": 0.369609952296324,
+    "coverage": 0.12795809559442523,
+    "density": 0.10799738097465157,
+    "detected_median_before": {
+     "R1": 346.0,
+     "Q": 126.0
+    },
+    "detected_median_after": {
+     "R1": 126.0,
+     "Q": 126.0
+    }
+   },
+   "monocyte_pct": {
+    "generated_mean_over_donors": 12.785081585081587,
+    "observed_mean_over_donors": 17.567899313806723,
+    "generated_pooled_cells": 12.785081585081585
+   },
+   "median_umi_per_cell_scoring_genes": {
+    "generated_pooled": 1086.0,
+    "observed_pooled": 1367.0,
+    "generated_mean_of_donor_medians": 1085.80419921875,
+    "observed_mean_of_donor_medians": 1292.7272727272727
+   },
+   "contrast": {
+    "mean_cp10k": {
+     "per_type": {
+      "T cell": {
+       "r_generated": 0.6608758993053973,
+       "r_broadcast": 0.6232824935145761,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.5172416570523088,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.49729533983442176,
+       "n_genes": 3032
+      },
+      "B cell": {
+       "r_generated": 0.508795842660168,
+       "r_broadcast": 0.6315018114438883,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.34044963377663795,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.42787608365526364,
+       "n_genes": 3180
+      },
+      "Monocyte": {
+       "r_generated": 0.6022410345197411,
+       "r_broadcast": 0.7121111596726496,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.32321045113629815,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.5879575053115986,
+       "n_genes": 2878
+      },
+      "NK cell": {
+       "r_generated": 0.6136729160725262,
+       "r_broadcast": 0.6592751152623284,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.4027262076016801,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.5460400579138946,
+       "n_genes": 2963
+      }
+     },
+     "mean_r_generated": 0.5963964231394581,
+     "mean_r_broadcast": 0.6565426449733607,
+     "mean_partial_r": 0.39590698739173125
+    },
+    "pseudobulk_log1p_cpm": {
+     "per_type": {
+      "T cell": {
+       "r_generated": 0.39416433973970916,
+       "r_broadcast": 0.6213005296240948,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.21441515807479058,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.3848269585485117,
+       "n_genes": 3032
+      },
+      "B cell": {
+       "r_generated": 0.0463991635070618,
+       "r_broadcast": 0.49592343727839516,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": -0.11196557126755932,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.28167559852515994,
+       "n_genes": 3180
+      },
+      "Monocyte": {
+       "r_generated": 0.3791373105369172,
+       "r_broadcast": 0.7117946294640722,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.09487941851988327,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.4489921291400756,
+       "n_genes": 2878
+      },
+      "NK cell": {
+       "r_generated": 0.30430998704669965,
+       "r_broadcast": 0.5939124968903833,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.11041453981036775,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.3736444778058893,
+       "n_genes": 2963
+      }
+     },
+     "mean_r_generated": 0.28100270020759693,
+     "mean_r_broadcast": 0.6057327733142364,
+     "mean_partial_r": 0.07693588628437056
+    }
+   },
+   "deg_top50": {
+    "types_scored": [
+     "T cell",
+     "B cell",
+     "Monocyte",
+     "NK cell",
+     "DC"
+    ],
+    "types_not_scored": {},
+    "per_type": {
+     "T cell": {
+      "deg_scored": true,
+      "top50_overlap": 21,
+      "top50_jaccard": 0.26582278481012656,
+      "obs_top_list_size": 50,
+      "gen_top_list_size": 50,
+      "top50_overlap_broadcast": 15,
+      "top50_jaccard_broadcast": 0.17647058823529413,
+      "n_cells_obs": 244943,
+      "n_cells_gen": 123240
+     },
+     "B cell": {
+      "deg_scored": true,
+      "top50_overlap": 8,
+      "top50_jaccard": 0.08695652173913043,
+      "obs_top_list_size": 50,
+      "gen_top_list_size": 50,
+      "top50_overlap_broadcast": 12,
+      "top50_jaccard_broadcast": 0.13636363636363635,
+      "n_cells_obs": 46230,
+      "n_cells_gen": 18292
+     },
+     "Monocyte": {
+      "deg_scored": true,
+      "top50_overlap": 10,
+      "top50_jaccard": 0.1111111111111111,
+      "obs_top_list_size": 50,
+      "gen_top_list_size": 50,
+      "top50_overlap_broadcast": 21,
+      "top50_jaccard_broadcast": 0.26582278481012656,
+      "n_cells_obs": 77634,
+      "n_cells_gen": 25735
+     },
+     "NK cell": {
+      "deg_scored": true,
+      "top50_overlap": 14,
+      "top50_jaccard": 0.16279069767441862,
+      "obs_top_list_size": 50,
+      "gen_top_list_size": 50,
+      "top50_overlap_broadcast": 14,
+      "top50_jaccard_broadcast": 0.16279069767441862,
+      "n_cells_obs": 65766,
+      "n_cells_gen": 27846
+     },
+     "DC": {
+      "deg_scored": true,
+      "top50_overlap": 8,
+      "top50_jaccard": 0.08695652173913043,
+      "obs_top_list_size": 50,
+      "gen_top_list_size": 50,
+      "top50_overlap_broadcast": 14,
+      "top50_jaccard_broadcast": 0.16279069767441862,
+      "n_cells_obs": 12690,
+      "n_cells_gen": 4766
+     }
+    },
+    "sum": 61,
+    "sum_4type": 53,
+    "max": 250,
+    "mean": 12.2,
+    "sum_broadcast": 76,
+    "sum_broadcast_4type": 62,
+    "broadcast_n_significant": 2055,
+    "seconds": 0.2
+   },
+   "seconds": 28.8
+  }
+ },
+ "code_sha256": {
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/tools/score_ft.py": "492e929e9bc7b716f6f9c8bbeedc98e7dec8cc759a20cdc6ec39b1e65194eb74",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/tools/ft_common.py": "4a6366b0f22208cd58714fc0261b8840c643b9d4569704d560cfd93534cbc747",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/utility_studies_final6k_20260925/umap/cell_immicro_5arm/tools/stage_b_embed.py": "d056cfdf38fb0e5f478756f370174e993b75d0c973c48e02e21749175a4ca2da",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/bulk2sc-paper/scripts/evaluate_generated_vs_truth.py": "48b12d794782b840838853e93e0fc55fab00532c4b3698f4588e926b985d2881",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/utility_studies_final6k_20260925/immicro/tools/immicro_common.py": "c5c30e917148cc5e664e91ea30c11bbdff9b6d1f53a3e0a13e16b1917eff37e9",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/aifi_scanvi_rebuild_20260916/predict_scanvi.py": "482ee5dcf4d72b54bc36cbb6dcff62e5030bc7afc46cb5fb01eca73a82ee45a5",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/aifi_scanvi_rebuild_20260916/poisson_readout.py": "8bfa080942fbcdc89ae23b276524a1a83266fb8cbc56b9af279e50f82e6cde38"
+ },
+ "seconds": 37.2
+}