junidude14 commited on
Commit
93ca571
·
verified ·
1 Parent(s): a6c8e1e

Archive 4 checkpoints (1-4)

Browse files
paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20261005T121346Z-scsemi-cv-budget-interim/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scores/immicro/scsemi_cv_20261002/pooled/per_donor.csv ADDED
@@ -0,0 +1,108 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ arm,donor,group,n_generated_cells,n_observed_cells,n_reference_cells,gen_T cell,obs_T cell,gen_B cell,obs_B cell,gen_Monocyte,obs_Monocyte,gen_NK cell,obs_NK cell,gen_DC,obs_DC,gen_Other,obs_Other,comp_l1,comp_l1_obs_loo_null,pb_r,pb_own_rank,pb_top1,precision,coverage,precision_depth_matched,coverage_depth_matched,mono_pct_gen,mono_pct_obs,median_umi_gen,median_umi_obs
2
+ scsemi__raw,HS1,DB1,1500,4384,150,0.754,0.6332116788321168,0.03666666666666667,0.05862226277372263,0.104,0.13822992700729927,0.042,0.14393248175182483,0.056666666666666664,0.018476277372262775,0.006666666666666667,0.007527372262773723,0.31795742092457424,0.11035192845413876,0.6626382561598995,16,False,0.5933333333333334,0.09333333333333334,0.8466666666666667,0.36666666666666664,10.4,13.822992700729927,1947.0,1738.0
3
+ scsemi__raw,HS2,DB2,1500,5144,150,0.7126666666666667,0.661353032659409,0.086,0.05909797822706065,0.08733333333333333,0.1386080870917574,0.07533333333333334,0.11372472783825817,0.035333333333333335,0.02041213063763608,0.0033333333333333335,0.006804043545878694,0.18627371695178851,0.0929372093835238,0.6789346875242273,22,False,0.37333333333333335,0.11333333333333333,0.6266666666666667,0.4,8.733333333333333,13.860808709175739,1981.0,1429.0
4
+ scsemi__raw,HS3,DB3,1500,4617,150,0.712,0.6484730344379467,0.030666666666666665,0.06952566601689408,0.13733333333333334,0.17782109594975093,0.03933333333333333,0.07060862031622266,0.076,0.028589993502274202,0.004666666666666667,0.004981589776911414,0.22187394411955821,0.053459165242510376,0.707553614163355,5,False,0.31333333333333335,0.03333333333333333,0.8666666666666667,0.26,13.733333333333334,17.782109594975093,1957.0,2186.0
5
+ scsemi__raw,HS4,DB4,1500,4167,150,0.7073333333333334,0.54307655387569,0.046,0.04535637149028078,0.14533333333333334,0.2371010319174466,0.056666666666666664,0.14254859611231102,0.04066666666666666,0.02423806095512359,0.004,0.007679385649148068,0.36265802735781133,0.2531884543361221,0.6970694183106255,65,False,0.4,0.02,0.8333333333333334,0.19333333333333333,14.533333333333335,23.71010319174466,1949.0,2111.0
6
+ scsemi__raw,HS6,DB3,1500,4222,150,0.5666666666666667,0.4836570345807674,0.08733333333333333,0.037423022264329704,0.25866666666666666,0.3147797252486973,0.036,0.13003315963998105,0.05,0.024869729985788725,0.0013333333333333333,0.009237328280435813,0.31610042633822827,0.3891650002178858,0.664976909894266,17,False,0.5333333333333333,0.02666666666666667,0.7733333333333333,0.3933333333333333,25.866666666666667,31.47797252486973,1955.5,2457.5
7
+ scsemi__raw,HS7,DB1,1500,4271,150,0.702,0.7035822992273473,0.056666666666666664,0.03839850152189183,0.11533333333333333,0.13135097166939827,0.07933333333333334,0.09740107703114025,0.03933333333333333,0.02130648560056193,0.007333333333333333,0.0079606649496605,0.07259002575509256,0.1475722919611167,0.6510496747817035,17,False,0.5466666666666666,0.06666666666666667,0.8266666666666667,0.37333333333333335,11.533333333333333,13.135097166939827,1957.0,1748.0
8
+ scsemi__raw,HS8,DB1,1500,3652,150,0.6593333333333333,0.6251369112814896,0.07,0.06489594742606791,0.15933333333333333,0.15553121577217963,0.04133333333333333,0.11829134720700986,0.06866666666666667,0.028477546549835708,0.0013333333333333333,0.007667031763417305,0.16658342460752096,0.07029362012561938,0.6610110873132083,22,False,0.37333333333333335,0.04666666666666667,0.82,0.3333333333333333,15.933333333333334,15.553121577217963,1954.0,1817.0
9
+ scsemi__raw,HS9,DB3,1500,3942,150,0.6286666666666667,0.6958396752917301,0.074,0.028665651953323185,0.15933333333333333,0.18670725520040587,0.036,0.049974632166412986,0.09066666666666667,0.03373921867072552,0.011333333333333334,0.0050735667174023336,0.21704312531709785,0.17742174456702342,0.6276668420888267,2,False,0.4666666666666667,0.04666666666666667,0.9533333333333334,0.4533333333333333,15.933333333333334,18.670725520040587,1962.0,2389.0
10
+ scsemi__raw,HS10,DB4,1500,4115,150,0.6486666666666666,0.5244228432563791,0.108,0.18347509113001215,0.07933333333333334,0.13001215066828675,0.094,0.13754556500607534,0.059333333333333335,0.021385176184690158,0.010666666666666666,0.0031591737545565005,0.3393989469420817,0.31297998407958516,0.6220858367793926,82,False,0.5,0.0,0.82,0.15333333333333332,7.933333333333334,13.001215066828674,1949.0,2063.0
11
+ scsemi__raw,HS11,DB6,1500,2886,150,0.7226666666666667,0.6056826056826057,0.07333333333333333,0.061330561330561334,0.132,0.24358974358974358,0.036,0.04054054054054054,0.034666666666666665,0.04573804573804574,0.0013333333333333333,0.0031185031185031187,0.257973665973666,0.2018289947837638,0.6734719829889487,19,False,0.5533333333333333,0.04,0.8933333333333333,0.22666666666666666,13.200000000000001,24.358974358974358,1957.0,2216.5
12
+ scsemi__raw,HS12,DB2,1500,5035,150,0.71,0.6798411122144985,0.028666666666666667,0.06971201588877855,0.13866666666666666,0.1529294935451837,0.048,0.064746772591857,0.06866666666666667,0.025223435948361468,0.006,0.007547169811320755,0.14720423700761334,0.09113833236975562,0.7302118866098172,18,False,0.31333333333333335,0.04666666666666667,0.82,0.22666666666666666,13.866666666666665,15.29294935451837,1981.0,1550.0
13
+ scsemi__raw,HS13,DB5,1500,4792,150,0.6953333333333334,0.6156093489148581,0.042666666666666665,0.056343906510851416,0.13466666666666666,0.2166110183639399,0.04733333333333333,0.08764607679465776,0.07066666666666667,0.02003338898163606,0.009333333333333334,0.0037562604340567614,0.27186867000556486,0.10109004194198506,0.6359461936637109,78,False,0.42,0.0,0.8533333333333334,0.19333333333333333,13.466666666666665,21.66110183639399,1958.0,2176.0
14
+ scsemi__raw,HS14,DB3,1500,4235,150,0.6673333333333333,0.6517119244391971,0.034666666666666665,0.06517119244391972,0.178,0.20306965761511217,0.06733333333333333,0.04250295159386069,0.051333333333333335,0.0332939787485242,0.0013333333333333333,0.004250295159386069,0.11698229043683596,0.12046829259489143,0.688775491728134,12,False,0.49333333333333335,0.03333333333333333,0.84,0.38666666666666666,17.8,20.30696576151122,1962.0,2164.0
15
+ scsemi__raw,HS15,DB4,1500,4592,150,0.682,0.46972996515679444,0.046,0.04638501742160279,0.152,0.37282229965156793,0.07666666666666666,0.08776132404181185,0.04066666666666666,0.0195993031358885,0.0026666666666666666,0.0037020905923344947,0.4666747967479676,0.41645998718304533,0.7078659409180471,63,False,0.6333333333333333,0.02,0.8,0.08666666666666667,15.2,37.282229965156795,1948.0,2302.0
16
+ scsemi__raw,HS16,DB4,1500,4842,150,0.6573333333333333,0.5846757538207352,0.04933333333333333,0.08736059479553904,0.16733333333333333,0.23048327137546468,0.06266666666666666,0.07166460140437836,0.059333333333333335,0.020859149111937217,0.004,0.004956629491945477,0.22226352746798841,0.1544623510971255,0.6523278732024758,83,False,0.44,0.0,0.7533333333333333,0.18666666666666668,16.733333333333334,23.04832713754647,1979.5,2066.0
17
+ scsemi__raw,HS17,DB6,1500,1753,150,0.7306666666666667,0.7221905305191101,0.086,0.07529948659440959,0.09933333333333333,0.14432401597261837,0.043333333333333335,0.03194523673702225,0.03333333333333333,0.02053622361665716,0.007333333333333333,0.005704506560182544,0.0899813652785701,0.169076216751511,0.6878142820450631,50,False,0.5,0.04,0.76,0.17333333333333334,9.933333333333334,14.432401597261837,1980.0,2194.0
18
+ scsemi__raw,HS18,DB4,1500,3348,150,0.7026666666666667,0.6633811230585425,0.04066666666666666,0.05734767025089606,0.13933333333333334,0.18309438470728792,0.04,0.07198327359617682,0.062,0.016129032258064516,0.015333333333333332,0.008064516129032258,0.18485065710872153,0.0875204452756842,0.6641027584341265,63,False,0.32,0.02666666666666667,0.6666666666666666,0.2733333333333333,13.933333333333334,18.309438470728793,1958.0,2108.0
19
+ scsemi__raw,HS19,DB5,1500,4133,150,0.7206666666666667,0.5971449310428261,0.08733333333333333,0.1454149528187757,0.09333333333333334,0.14686668279699977,0.05466666666666667,0.09145898862811518,0.03933333333333333,0.014275344785869828,0.004666666666666667,0.004839099927413501,0.29715944834260827,0.14309888083913158,0.6585380690964877,101,False,0.4266666666666667,0.013333333333333334,0.8333333333333334,0.08666666666666667,9.333333333333334,14.686668279699976,1960.0,1955.0
20
+ scsemi__raw,HS20,DB7,1500,1366,150,0.7033333333333334,0.7657393850658858,0.106,0.09882869692532943,0.06933333333333333,0.08345534407027819,0.020666666666666667,0.029282576866764276,0.09866666666666667,0.015373352855051245,0.002,0.007320644216691069,0.18092923377257195,0.3077607388488665,0.6042765741781263,73,False,0.3933333333333333,0.02,0.96,0.14666666666666667,6.933333333333333,8.345534407027818,1959.0,2271.0
21
+ scsemi__raw,HS21,DB1,1500,4748,150,0.678,0.5945661331086773,0.04533333333333334,0.06887110362257792,0.166,0.1941870261162595,0.05733333333333333,0.11141533277169334,0.05333333333333334,0.02401010951979781,0.0,0.0069502948609941025,0.2255141814097164,0.10176465591941555,0.6706449219520693,27,False,0.4666666666666667,0.04666666666666667,0.8,0.32666666666666666,16.6,19.41870261162595,1981.0,1849.5
22
+ scsemi__raw,HS23,DB6,1500,1680,150,0.684,0.5630952380952381,0.04066666666666666,0.0994047619047619,0.12933333333333333,0.2386904761904762,0.07333333333333333,0.06904761904761905,0.06866666666666667,0.025,0.004,0.004761904761904762,0.33771428571428574,0.1997522907834552,0.7133429122476844,27,False,0.5,0.013333333333333334,0.76,0.16666666666666666,12.933333333333334,23.86904761904762,1948.0,2296.0
23
+ scsemi__raw,HS24,DB6,1500,1670,150,0.6806666666666666,0.5365269461077844,0.08333333333333333,0.07005988023952096,0.11,0.17664670658682635,0.088,0.19401197604790418,0.034,0.017964071856287425,0.004,0.004790419161676647,0.34689820359281437,0.22797704867339308,0.6925952403295599,22,False,0.5066666666666667,0.04666666666666667,0.8133333333333334,0.3,11.0,17.664670658682635,1962.5,2073.5
24
+ scsemi__raw,HS25,DB6,1500,1800,150,0.6286666666666667,0.4872222222222222,0.144,0.095,0.16266666666666665,0.30333333333333334,0.027333333333333334,0.08444444444444445,0.035333333333333335,0.026111111111111113,0.002,0.0038888888888888888,0.3993333333333334,0.32360823567713587,0.6556753682121974,47,False,0.6466666666666666,0.06,0.7266666666666667,0.20666666666666667,16.266666666666666,30.333333333333336,1960.0,2173.0
25
+ scsemi__raw,HS26,DB2,1500,3606,150,0.744,0.651414309484193,0.03266666666666666,0.054076539101497505,0.11933333333333333,0.16167498613422074,0.06333333333333334,0.09678313921242374,0.04,0.02689961175818081,0.0006666666666666666,0.009151414309484194,0.2113721575152524,0.0516486013571299,0.7025575196380167,7,False,0.3933333333333333,0.06666666666666667,0.72,0.28,11.933333333333334,16.167498613422072,1959.0,1454.5
26
+ scsemi__raw,HS27,DB2,1500,4030,150,0.7226666666666667,0.6540942928039702,0.08866666666666667,0.11464019851116625,0.092,0.1196029776674938,0.06866666666666667,0.0890818858560794,0.024666666666666667,0.015632754342431762,0.0033333333333333335,0.006947890818858561,0.15521257237386266,0.1135328366619135,0.6907831643352429,1,True,0.4866666666666667,0.10666666666666667,0.7133333333333334,0.44666666666666666,9.2,11.96029776674938,1956.0,1575.5
27
+ scsemi__raw,HS28,DB5,1500,4446,150,0.732,0.594017094017094,0.07333333333333333,0.12010796221322537,0.12866666666666668,0.1545209176788124,0.03666666666666667,0.11156095366621682,0.028,0.015744489428699954,0.0013333333333333333,0.004048582995951417,0.300476833108412,0.1325906216746598,0.6874030557661325,86,False,0.48,0.006666666666666667,0.8066666666666666,0.08666666666666667,12.866666666666667,15.45209176788124,1959.0,1941.5
28
+ scsemi__raw,HS29,DB5,1500,4285,150,0.644,0.6550758459743291,0.05333333333333334,0.03663943990665111,0.17466666666666666,0.19883313885647608,0.058666666666666666,0.0823803967327888,0.06733333333333333,0.022870478413068846,0.002,0.004200700116686115,0.12231349669389346,0.09766296356076568,0.6475910958971172,70,False,0.3933333333333333,0.013333333333333334,0.7066666666666667,0.23333333333333334,17.466666666666665,19.883313885647606,1951.0,2230.0
29
+ scsemi__raw,HS30,DB3,1500,6447,150,0.652,0.5667752442996743,0.06333333333333334,0.08127811385140375,0.18466666666666667,0.26477431363424847,0.034666666666666665,0.049325267566309915,0.06266666666666666,0.03489995346672871,0.0026666666666666666,0.002947107181634869,0.22598293780052733,0.2358035037214606,0.6828529833822351,3,False,0.44666666666666666,0.02,0.7866666666666666,0.46,18.46666666666667,26.47743136342485,1950.0,2410.0
30
+ scsemi__raw,HS31,DB3,1500,4830,150,0.6406666666666667,0.5956521739130435,0.08533333333333333,0.07039337474120083,0.138,0.21884057971014492,0.09333333333333334,0.08385093167701864,0.038,0.02546583850931677,0.004666666666666667,0.005797101449275362,0.16394202898550725,0.11132974374977682,0.7590017764119595,1,True,0.5866666666666667,0.02,0.7733333333333333,0.37333333333333335,13.8,21.884057971014492,1955.0,2217.5
31
+ scsemi__raw,HS32,DB6,1500,1818,150,0.722,0.7128712871287128,0.08,0.07535753575357536,0.11933333333333333,0.13036303630363036,0.035333333333333335,0.06050605060506051,0.042,0.019251925192519254,0.0013333333333333333,0.0016501650165016502,0.07303850385038504,0.1501730746119151,0.6672482992471955,29,False,0.5933333333333334,0.013333333333333334,0.9266666666666666,0.22,11.933333333333334,13.036303630363037,1963.0,2078.5
32
+ scsemi__raw,HS34,DB5,1500,4363,150,0.728,0.7073114829245931,0.08133333333333333,0.04859041943616777,0.098,0.16983726793490717,0.05466666666666667,0.0550080220032088,0.03,0.013981205592482237,0.008,0.005271602108640843,0.14435724654289864,0.1444751101152869,0.6513960064049729,83,False,0.44666666666666666,0.013333333333333334,0.82,0.15333333333333332,9.8,16.983726793490717,1955.5,2176.0
33
+ scsemi__raw,HS35,DB7,1500,1658,150,0.636,0.6363088057901085,0.07333333333333333,0.08443908323281062,0.11933333333333333,0.1513872135102533,0.04666666666666667,0.097708082026538,0.12133333333333333,0.024728588661037394,0.0033333333333333335,0.005428226779252111,0.1932094893445918,0.03646989861547826,0.6025125926782741,63,False,0.4866666666666667,0.013333333333333334,0.8533333333333334,0.14,11.933333333333334,15.13872135102533,1980.0,2204.0
34
+ scsemi__raw,HS36,DB5,1500,4213,150,0.7013333333333334,0.5829575124614289,0.08,0.10064087348682649,0.10066666666666667,0.14573937811535723,0.074,0.15286019463565156,0.03333333333333333,0.015428435793971042,0.010666666666666666,0.0023736055067647755,0.2891475591423373,0.17666685356154355,0.6698301342083479,84,False,0.35333333333333333,0.006666666666666667,0.82,0.21333333333333335,10.066666666666666,14.573937811535723,1982.0,2180.0
35
+ scsemi__raw,HS37,DB6,1500,2127,150,0.5953333333333334,0.5763986835919135,0.058666666666666666,0.14997649271274094,0.202,0.18288669487541137,0.10333333333333333,0.06535025858015985,0.03133333333333333,0.021626704278326282,0.009333333333333334,0.0037611659614480487,0.18261965209214864,0.18478437735438788,0.6860776798535069,60,False,0.6333333333333333,0.04666666666666667,0.7533333333333333,0.24666666666666667,20.200000000000003,18.28866948754114,1955.0,2099.0
36
+ scsemi__raw,HS38,DB2,1500,3952,150,0.556,0.4534412955465587,0.07066666666666667,0.06022267206477733,0.154,0.27631578947368424,0.18,0.16776315789473684,0.03666666666666667,0.03365384615384615,0.0026666666666666666,0.00860323886639676,0.2565047233468287,0.4041371048973656,0.7319161670129157,3,False,0.43333333333333335,0.07333333333333333,0.74,0.2866666666666667,15.4,27.631578947368425,1955.0,1448.0
37
+ scsemi__raw,HS39,DB6,1500,2056,150,0.5373333333333333,0.6731517509727627,0.04466666666666667,0.04571984435797665,0.25533333333333336,0.17607003891050585,0.021333333333333333,0.08025291828793775,0.13133333333333333,0.02091439688715953,0.01,0.0038910505836575876,0.39158236057068746,0.08809426437081906,0.6015822509200941,49,False,0.68,0.03333333333333333,0.98,0.18,25.533333333333335,17.607003891050585,1981.0,2023.0
38
+ scsemi__raw,HS40,DB2,1500,3867,150,0.688,0.6938194983191104,0.04066666666666666,0.045771916214119475,0.12133333333333333,0.15490043961727437,0.092,0.07525213343677269,0.05733333333333333,0.026377036462373934,0.0006666666666666666,0.003878975950349108,0.09540832686837343,0.11776170689172173,0.6732207796305444,40,False,0.6266666666666667,0.08666666666666667,0.78,0.38666666666666666,12.133333333333333,15.490043961727437,1949.0,1477.0
39
+ scsemi__raw,HS41,DB7,1500,1392,150,0.7366666666666667,0.6458333333333334,0.088,0.15589080459770116,0.11733333333333333,0.14152298850574713,0.028,0.035201149425287355,0.02666666666666667,0.014367816091954023,0.0033333333333333335,0.007183908045977011,0.20626436781609198,0.18061106366573926,0.6474777387394006,71,False,0.5466666666666666,0.006666666666666667,0.8866666666666667,0.18,11.733333333333333,14.152298850574713,1957.0,2276.0
40
+ scsemi__raw,HS42,DB1,1500,4312,150,0.716,0.700139146567718,0.051333333333333335,0.034786641929499075,0.10333333333333333,0.18320964749536178,0.027333333333333334,0.04336734693877551,0.08466666666666667,0.029684601113172542,0.017333333333333333,0.008812615955473098,0.19182065553494118,0.17733574040448996,0.619211198461224,6,False,0.6066666666666667,0.06666666666666667,0.98,0.26666666666666666,10.333333333333334,18.320964749536177,1962.0,1957.5
41
+ scsemi__raw,HS43,DB5,1500,4357,150,0.7433333333333333,0.6584806059215056,0.048666666666666664,0.071149873766353,0.114,0.13839798026164793,0.04466666666666667,0.11223318797337617,0.046,0.017443194858847832,0.0033333333333333335,0.0022951572182694515,0.2288954173360875,0.08170110306985698,0.6925626564771565,74,False,0.46,0.006666666666666667,0.7133333333333334,0.18,11.4,13.839798026164793,1961.0,2180.0
42
+ scsemi__raw,HS44,DB5,1500,3849,150,0.6866666666666666,0.719147830605352,0.056666666666666664,0.06832943621719927,0.15733333333333333,0.15146791374382956,0.04666666666666667,0.03715250714471291,0.046,0.019225772928033256,0.006666666666666667,0.004676539360872954,0.08828786697843598,0.16171111530061713,0.6360616003148629,101,False,0.52,0.006666666666666667,0.6266666666666667,0.2,15.733333333333333,15.146791374382957,1978.0,1852.0
43
+ scsemi__raw,HS45,DB7,1500,1980,150,0.6573333333333333,0.6646464646464646,0.06266666666666666,0.08333333333333333,0.16133333333333333,0.1191919191919192,0.050666666666666665,0.10606060606060606,0.06133333333333333,0.022727272727272728,0.006666666666666667,0.00404040404040404,0.16674747474747467,0.09892308336113056,0.64239221022654,65,False,0.44,0.02666666666666667,0.8333333333333334,0.2866666666666667,16.133333333333333,11.91919191919192,1958.0,2373.5
44
+ scsemi__raw,HS46,DB1,1500,4117,150,0.738,0.6315278115132378,0.03333333333333333,0.060480932717998544,0.12466666666666666,0.13990769978139422,0.07266666666666667,0.13577847947534613,0.028666666666666667,0.028175856205975226,0.0026666666666666666,0.004129220306048093,0.2139259978949073,0.10082066424856224,0.7424222691167766,27,False,0.32666666666666666,0.05333333333333334,0.8066666666666666,0.46,12.466666666666667,13.990769978139422,1981.0,1777.0
45
+ scsemi__raw,HS47,DB3,1500,4401,150,0.714,0.609634174051352,0.05333333333333334,0.13542376732560782,0.04066666666666666,0.09702340377187003,0.052,0.12315382867530107,0.12866666666666668,0.029993183367416496,0.011333333333333334,0.004771642808452625,0.41920199954555776,0.20140136508584636,0.6192262139631188,10,False,0.6066666666666667,0.04,0.9533333333333334,0.30666666666666664,4.066666666666666,9.702340377187003,1979.0,2179.0
46
+ scsemi__raw,HS48,DB5,1500,3855,150,0.702,0.7058365758754864,0.078,0.09909208819714656,0.09733333333333333,0.0840466926070039,0.07933333333333334,0.0874189364461738,0.04,0.019974059662775615,0.0033333333333333335,0.0036316472114137485,0.0666251621271077,0.1838878483358187,0.6604454392686561,84,False,0.36666666666666664,0.013333333333333334,0.78,0.24,9.733333333333333,8.40466926070039,1979.0,1918.0
47
+ scsemi__raw,HS49,DB3,1500,3893,150,0.7553333333333333,0.6773696378114564,0.037333333333333336,0.027228358592345236,0.116,0.1857179553043925,0.051333333333333335,0.07346519393783714,0.03933333333333333,0.03056768558951965,0.0006666666666666666,0.005651168764449011,0.19366863601335732,0.13183133829460064,0.6785648626760401,6,False,0.38,0.04,0.7533333333333333,0.4,11.600000000000001,18.57179553043925,1949.0,2103.0
48
+ scsemi__raw,HS50,DB5,1500,4299,150,0.678,0.6882996045591998,0.08,0.08211211909746452,0.11066666666666666,0.11979530123284485,0.06866666666666667,0.09211444521981857,0.058666666666666666,0.013258897418004187,0.004,0.004419632472668062,0.0908155384973249,0.11605472180378049,0.6019009122949366,98,False,0.6066666666666667,0.013333333333333334,0.9333333333333333,0.08,11.066666666666666,11.979530123284485,1960.0,2077.0
49
+ scsemi__raw,HS51,DB3,1500,3803,150,0.7,0.7068104128319748,0.09733333333333333,0.09019195372074677,0.098,0.10544307125953195,0.03333333333333333,0.06731527741256903,0.06933333333333333,0.02576912963449908,0.002,0.004470155140678412,0.10141116662284166,0.17384356614229543,0.6840897749620786,7,False,0.34,0.04666666666666667,0.9133333333333333,0.36,9.8,10.544307125953194,1979.0,2114.0
50
+ scsemi__raw,HS52,DB1,1500,4286,150,0.65,0.7473168455436304,0.062,0.04316378908072795,0.16266666666666665,0.12085860942603827,0.06466666666666666,0.06276248250116659,0.056666666666666664,0.017498833411105925,0.004,0.008399440037330844,0.20343257116192248,0.22422736494415424,0.650706418783034,39,False,0.5333333333333333,0.08,0.8666666666666667,0.3933333333333333,16.266666666666666,12.085860942603826,1957.0,1848.5
51
+ scsemi__raw,HS53,DB7,1500,1544,150,0.706,0.7506476683937824,0.027333333333333334,0.10233160621761658,0.12933333333333333,0.08290155440414508,0.059333333333333335,0.040803108808290155,0.07533333333333334,0.01878238341968912,0.0026666666666666666,0.0045336787564766836,0.24302590673575133,0.2808956847065351,0.6768049465182104,91,False,0.38,0.006666666666666667,0.7866666666666666,0.23333333333333334,12.933333333333334,8.290155440414509,1949.0,2239.5
52
+ scsemi__raw,HS54,DB3,1500,5391,150,0.7706666666666667,0.7853830458171026,0.032,0.06362455945093674,0.112,0.0849564088295307,0.03666666666666667,0.037655351511778894,0.04666666666666667,0.02485624188462252,0.002,0.003524392506028566,0.09770803190502686,0.29954613259862284,0.6979338426350767,31,False,0.32,0.02666666666666667,0.8666666666666667,0.3333333333333333,11.200000000000001,8.49564088295307,1955.0,2188.0
53
+ scsemi__raw,HS55,DB1,1500,4574,150,0.7113333333333334,0.6228683865325755,0.038,0.04241364232619152,0.166,0.22431132487975514,0.04533333333333334,0.08439003060778312,0.034666666666666665,0.019676432006996064,0.004666666666666667,0.006340183646698732,0.206910362920857,0.11812530601946182,0.6911529130811549,15,False,0.44,0.05333333333333334,0.7133333333333334,0.5133333333333333,16.6,22.431132487975514,1961.0,1849.0
54
+ scsemi__raw,HS56,DB1,1500,4121,150,0.732,0.6112594030575104,0.030666666666666665,0.04707595243872846,0.12066666666666667,0.13977190002426595,0.06866666666666667,0.16743508857073525,0.046,0.028391167192429023,0.002,0.006066488716330988,0.27669885950012124,0.16610266972256024,0.7224940327615211,4,False,0.41333333333333333,0.04,0.8266666666666667,0.42,12.066666666666666,13.977190002426596,1979.0,1751.0
55
+ scsemi__raw,HS57,DB2,1500,3932,150,0.658,0.6584435401831129,0.042666666666666665,0.03128179043743642,0.12866666666666668,0.18972533062054933,0.108,0.08214649033570702,0.05733333333333333,0.030010172939979655,0.005333333333333333,0.00839267548321465,0.12912309257375376,0.10612160391730195,0.6577614502016773,1,True,0.6066666666666667,0.06,0.86,0.44,12.866666666666667,18.972533062054932,1979.0,1676.5
56
+ scsemi__raw,HS58,DB7,1500,1299,150,0.748,0.6605080831408776,0.044,0.029253271747498075,0.148,0.15550423402617397,0.012,0.1170130869899923,0.04,0.03156274056966898,0.008,0.006158583525789068,0.22503464203233253,0.11422143310126104,0.6291653602712789,74,False,0.4866666666666667,0.02,0.7133333333333334,0.18,14.799999999999999,15.550423402617398,1957.5,1944.0
57
+ scsemi__raw,HS59,DB4,1500,4268,150,0.6513333333333333,0.5796626054358013,0.128,0.06115276476101218,0.13733333333333334,0.21860356138706655,0.020666666666666667,0.11879100281162137,0.05266666666666667,0.016166822867853797,0.01,0.005623242736644799,0.35878912839737587,0.16086314016172729,0.5818680114993207,100,False,0.7133333333333334,0.006666666666666667,0.96,0.13333333333333333,13.733333333333334,21.860356138706656,1960.0,2091.5
58
+ scsemi__raw,HS60,DB6,1500,2659,150,0.708,0.6288078224896577,0.07266666666666667,0.04061677322301617,0.12866666666666668,0.16058668672433246,0.042,0.14328694998119593,0.04733333333333333,0.020308386611508085,0.0013333333333333333,0.006393380970289583,0.2765340353516359,0.10675930642106161,0.6899068467343682,31,False,0.4666666666666667,0.04666666666666667,0.8266666666666667,0.22,12.866666666666667,16.058668672433246,1955.0,2014.0
59
+ scsemi__raw,HS61,DB7,1500,1607,150,0.6433333333333333,0.4971997510889857,0.11,0.1001866832607343,0.128,0.29869321717485997,0.015333333333333332,0.07093963907902924,0.10266666666666667,0.02862476664592408,0.0006666666666666666,0.0043559427504667085,0.4599775980087119,0.3297864210010398,0.5980653215827307,71,False,0.7333333333333333,0.013333333333333334,0.9,0.09333333333333334,12.8,29.869321717485995,1952.0,2387.0
60
+ scsemi__raw,HS62,DB3,1500,4121,150,0.744,0.6699830138315943,0.034,0.07789371511768989,0.12533333333333332,0.1400145595729192,0.058,0.08881339480708565,0.035333333333333335,0.02062606163552536,0.0033333333333333335,0.0026692550351856345,0.17877667232872274,0.06870752648302034,0.6780736710982332,6,False,0.4,0.04,0.82,0.4,12.533333333333333,14.00145595729192,1950.0,2159.0
61
+ scsemi__raw,HS63,DB5,1500,4391,150,0.758,0.7214757458437714,0.07,0.05465725347301298,0.09066666666666667,0.15053518560692325,0.02266666666666667,0.0530630835800501,0.056666666666666664,0.016624914598041447,0.002,0.0036438168982008655,0.18381750550368176,0.16641086870648242,0.5895074970475489,79,False,0.5666666666666667,0.013333333333333334,0.98,0.12666666666666668,9.066666666666666,15.053518560692325,1950.0,2196.0
62
+ scsemi__raw,HS64,DB2,1500,3894,150,0.7066666666666667,0.6592193117616847,0.06933333333333333,0.0968156137647663,0.064,0.13071391884951206,0.06933333333333333,0.0901386748844376,0.08733333333333333,0.01848998459167951,0.0033333333333333335,0.004622496147919877,0.23258140729327162,0.0851778478746588,0.6138859272489249,29,False,0.7133333333333334,0.08,0.9733333333333334,0.25333333333333335,6.4,13.071391884951206,1957.0,1596.0
63
+ scsemi__raw,HS65,DB2,1500,4394,150,0.718,0.6096950386891216,0.066,0.10969503868912153,0.074,0.16909421939007738,0.05733333333333333,0.07055075102412381,0.08066666666666666,0.03413746017296313,0.004,0.006827492034592627,0.30966833560916396,0.1009418487685411,0.6108698443666754,43,False,0.62,0.12666666666666668,0.9733333333333334,0.26,7.3999999999999995,16.90942193900774,1983.0,1449.5
64
+ scsemi__raw,HS66,DB4,1500,4857,150,0.7286666666666667,0.6448424953675108,0.082,0.10376775787523163,0.092,0.16512250360304714,0.026,0.07020794729256744,0.059333333333333335,0.012559192917438749,0.012,0.0035001029442042414,0.2781964175416924,0.07018841515094539,0.5868825447200179,78,False,0.66,0.013333333333333334,0.9666666666666667,0.10666666666666667,9.2,16.512250360304716,1955.0,2041.0
65
+ scsemi__raw,HS67,DB2,1500,3971,150,0.6313333333333333,0.6293125157391085,0.09866666666666667,0.1095441954167716,0.11866666666666667,0.13925963233442457,0.06466666666666666,0.09393099974817426,0.084,0.018886930244270964,0.0026666666666666666,0.009065726517250064,0.13426777469990767,0.08266309657299821,0.6882538578000257,22,False,0.5666666666666667,0.12,0.8733333333333333,0.36666666666666664,11.866666666666667,13.925963233442456,1962.0,1563.0
66
+ scsemi__raw,HS68,DB6,1500,2659,150,0.73,0.6938698758931929,0.07533333333333334,0.07070327190673185,0.11666666666666667,0.156825874388868,0.03933333333333333,0.05039488529522377,0.038,0.02181271154569387,0.0006666666666666666,0.006393380970289583,0.11389494797542934,0.11227502394848955,0.6451552862051921,25,False,0.6266666666666667,0.02666666666666667,0.92,0.32,11.666666666666666,15.6825874388868,1981.0,2248.0
67
+ scsemi__raw,HS69,DB6,1500,1765,150,0.708,0.6957507082152975,0.048666666666666664,0.07932011331444759,0.11,0.15637393767705382,0.016666666666666666,0.04645892351274788,0.104,0.020396600566572238,0.012666666666666666,0.0016997167138810198,0.21363928234183183,0.12360880773036576,0.6093217171487432,46,False,0.6,0.04666666666666667,0.9266666666666666,0.18666666666666668,11.0,15.637393767705381,1951.0,1982.0
68
+ scsemi__raw,HS70,DB4,1500,4513,150,0.7326666666666667,0.6470197208065588,0.050666666666666665,0.10104143585198316,0.12533333333333332,0.11766009306448039,0.042,0.10857522712164858,0.04666666666666667,0.020385552847329937,0.0026666666666666666,0.005317970307999114,0.2392025998965951,0.10416402359051107,0.6748066147263265,74,False,0.4666666666666667,0.0,0.7,0.18,12.533333333333333,11.766009306448039,1957.0,2181.0
69
+ scsemi__raw,HS71,DB4,1500,4400,150,0.67,0.571590909090909,0.03666666666666667,0.08863636363636364,0.08333333333333333,0.10477272727272727,0.112,0.21409090909090908,0.08733333333333333,0.017045454545454544,0.010666666666666666,0.003863636363636364,0.3510000000000001,0.276048059084431,0.6175663376204797,88,False,0.5466666666666666,0.006666666666666667,0.82,0.2,8.333333333333332,10.477272727272727,1962.0,1825.0
70
+ scsemi__raw,HS72,DB4,1500,4520,150,0.7473333333333333,0.7331858407079646,0.058666666666666666,0.08517699115044247,0.106,0.11438053097345133,0.032,0.0418141592920354,0.05,0.01836283185840708,0.006,0.007079646017699115,0.0915693215339233,0.21399189787711892,0.670079046520797,101,False,0.47333333333333333,0.013333333333333334,0.7533333333333333,0.21333333333333335,10.6,11.438053097345133,1980.0,1974.0
71
+ scsemi__raw,HS73,DB2,1500,4209,150,0.6886666666666666,0.5915894511760513,0.03,0.07531480161558565,0.07133333333333333,0.10667617011166548,0.098,0.20076027559990497,0.10466666666666667,0.020669992872416252,0.007333333333333333,0.004989308624376337,0.3668358279876455,0.2222407964474368,0.6811712508349199,32,False,0.5533333333333333,0.1,0.66,0.38,7.133333333333333,10.667617011166548,1960.0,1262.0
72
+ scsemi__raw,HS74,DB5,1500,4719,150,0.7346666666666667,0.6753549480822209,0.05333333333333334,0.08645899554990465,0.09866666666666667,0.101716465352829,0.03933333333333333,0.11337147700784064,0.07133333333333333,0.018648018648018648,0.0026666666666666666,0.004450095359186269,0.22399406653952106,0.14161207913760504,0.6483301345219625,102,False,0.4,0.013333333333333334,0.6266666666666667,0.16666666666666666,9.866666666666667,10.1716465352829,1957.5,1934.0
73
+ scsemi__raw,HS75,DB6,1500,2126,150,0.668,0.6933207902163687,0.038,0.07572906867356538,0.11066666666666666,0.15851364063969897,0.09533333333333334,0.04280338664158043,0.06666666666666667,0.023518344308560677,0.021333333333333333,0.0061147695202257765,0.2217936657259328,0.1139013876062158,0.6459372983252057,13,False,0.4666666666666667,0.04666666666666667,0.6466666666666666,0.41333333333333333,11.066666666666666,15.851364063969896,1957.0,2141.5
74
+ scsemi__raw,HS76,DB1,1500,3892,150,0.6366666666666667,0.5775950668036999,0.11133333333333334,0.10405960945529291,0.14266666666666666,0.1593011305241521,0.059333333333333335,0.10251798561151079,0.048,0.04290853031860226,0.002,0.013617677286742035,0.1428735868448099,0.13867627154294643,0.6972291199937297,6,False,0.5066666666666667,0.06666666666666667,0.82,0.52,14.266666666666666,15.93011305241521,1955.0,1764.0
75
+ scsemi__raw,HS77,DB2,1500,3662,150,0.6746666666666666,0.6826870562534134,0.034666666666666665,0.0488803932277444,0.134,0.1851447296559257,0.11266666666666666,0.06499180775532495,0.042,0.012015292190060076,0.002,0.006280720917531403,0.15531913344256326,0.1270347032704926,0.6731119966193821,27,False,0.6466666666666666,0.05333333333333334,0.8,0.38,13.4,18.51447296559257,1959.0,1437.0
76
+ scsemi__raw,HS78,DB1,1500,4299,150,0.6833333333333333,0.6366596882996045,0.08933333333333333,0.08792742498255408,0.07666666666666666,0.12281926029309141,0.066,0.1139799953477553,0.07733333333333334,0.02814608048383345,0.007333333333333333,0.0104675505931612,0.19453361246801587,0.0930846793667521,0.6271520719315881,24,False,0.5466666666666666,0.02,0.9266666666666666,0.38,7.666666666666666,12.28192602930914,1949.0,1732.0
77
+ scsemi__raw,HS79,DB5,1500,4239,150,0.682,0.6161830620429346,0.054,0.09648502005189903,0.158,0.15876385940080207,0.042666666666666665,0.11181882519462137,0.05333333333333334,0.014154281670205236,0.01,0.0025949516395376267,0.22480207596131171,0.08541963001951579,0.6282250452894759,84,False,0.5466666666666666,0.006666666666666667,0.72,0.19333333333333333,15.8,15.876385940080207,1947.0,2188.0
78
+ scsemi__raw,HS80,DB3,1500,4301,150,0.718,0.6842594745408045,0.076,0.10578935131364799,0.12533333333333332,0.14415252266914672,0.04,0.04022320390606836,0.036,0.02022785398744478,0.004666666666666667,0.0053475935828877,0.09902534294350147,0.15384742023496367,0.701780525542308,1,True,0.38666666666666666,0.03333333333333333,0.8333333333333334,0.3333333333333333,12.533333333333333,14.415252266914672,1961.0,2305.0
79
+ scsemi__raw,HS81,DB7,1500,1638,150,0.7233333333333334,0.721001221001221,0.044,0.04212454212454213,0.12866666666666668,0.13553113553113552,0.04,0.06288156288156288,0.05733333333333333,0.03296703296703297,0.006666666666666667,0.005494505494505495,0.05949206349206352,0.185942347514068,0.6453658981821437,63,False,0.4,0.03333333333333333,0.74,0.20666666666666667,12.866666666666667,13.553113553113553,1959.0,2240.5
80
+ scsemi__raw,HS82,DB2,1500,4201,150,0.7006666666666667,0.6553201618662223,0.078,0.1309212092358962,0.12066666666666667,0.14782194715543917,0.05333333333333334,0.031183051654368008,0.04066666666666666,0.02499404903594382,0.006666666666666667,0.009759581052130446,0.16633880822026495,0.15894642621843333,0.6604352106943668,10,False,0.42,0.13333333333333333,0.8466666666666667,0.29333333333333333,12.066666666666666,14.782194715543916,1957.0,1587.0
81
+ scsemi__raw,HS83,DB6,1500,2410,150,0.6666666666666666,0.7128630705394191,0.088,0.08049792531120332,0.12,0.14481327800829877,0.066,0.045228215767634854,0.042,0.012448132780082987,0.017333333333333333,0.004149377593360996,0.14201936376210242,0.16053425400081622,0.6590244507904656,21,False,0.5,0.02,0.8133333333333334,0.4066666666666667,12.0,14.481327800829877,1955.0,2373.0
82
+ scsemi__raw,HS84,DB3,1500,3090,150,0.6086666666666667,0.6702265372168285,0.13,0.04692556634304207,0.13333333333333333,0.17184466019417477,0.078,0.08608414239482201,0.044,0.020711974110032363,0.006,0.004207119741100324,0.21631067961165046,0.07365816258718899,0.708828279575057,3,False,0.42,0.06666666666666667,0.7466666666666667,0.5066666666666667,13.333333333333334,17.184466019417478,1979.0,2083.0
83
+ scsemi__raw,HS85,DB5,1500,4216,150,0.7073333333333334,0.5785104364326376,0.06266666666666666,0.07756166982922201,0.13866666666666666,0.22936432637571158,0.024,0.0896584440227704,0.06266666666666666,0.021347248576850095,0.004666666666666667,0.003557874762808349,0.3425022137887414,0.1324206136184556,0.5822616005591681,92,False,0.5066666666666667,0.006666666666666667,0.9666666666666667,0.06,13.866666666666665,22.93643263757116,1958.0,2171.5
84
+ scsemi__raw,HS86,DB7,1500,1111,150,0.7413333333333333,0.6561656165616562,0.04,0.0711071107110711,0.12333333333333334,0.162016201620162,0.012,0.0711071107110711,0.082,0.034203420342034205,0.0013333333333333333,0.0054005400540054005,0.2659285928592859,0.0575439281573075,0.6324078667329198,63,False,0.58,0.02666666666666667,0.6266666666666667,0.3466666666666667,12.333333333333334,16.2016201620162,1958.0,1989.0
85
+ scsemi__raw,HS87,DB5,1500,4067,150,0.7373333333333333,0.6801081878534546,0.062,0.08409146791246619,0.11933333333333333,0.12490779444307844,0.034666666666666665,0.10154905335628227,0.04133333333333333,0.007376444553725104,0.005333333333333333,0.001967051880993361,0.18909663142365377,0.12256060494136646,0.65765059009076,107,False,0.42,0.006666666666666667,0.7733333333333333,0.10666666666666667,11.933333333333334,12.490779444307844,1956.0,1983.0
86
+ scsemi__raw,HS88,DB3,1500,5093,150,0.6653333333333333,0.6540349499312782,0.058666666666666666,0.040054977419988216,0.15533333333333332,0.20400549774199883,0.035333333333333335,0.0738268211270371,0.08,0.02297270763793442,0.005333333333333333,0.005105046141763205,0.17433130440473854,0.10621022867784316,0.6427297716720333,23,False,0.44666666666666666,0.02666666666666667,0.9133333333333333,0.36,15.533333333333331,20.400549774199884,1959.0,2032.0
87
+ scsemi__raw,HS89,DB2,1500,3796,150,0.692,0.5795574288724974,0.030666666666666665,0.045574288724973655,0.15333333333333332,0.19836670179135932,0.07466666666666667,0.14673340358271866,0.04533333333333334,0.022128556375131718,0.004,0.007639620653319284,0.27129469617140844,0.18049041078155578,0.6908576344745758,9,False,0.49333333333333335,0.11333333333333333,0.8133333333333334,0.3466666666666667,15.333333333333332,19.836670179135933,1949.0,1510.0
88
+ scsemi__raw,HS90,DB7,1500,1291,150,0.6413333333333333,0.6839659178931061,0.098,0.06584043377226956,0.12666666666666668,0.13632842757552285,0.05266666666666667,0.0844306738962045,0.078,0.024012393493415957,0.0033333333333333335,0.005422153369481022,0.17229434546862898,0.0930947275849112,0.683234993890042,73,False,0.6066666666666667,0.02,0.9066666666666666,0.2866666666666667,12.666666666666668,13.632842757552286,1948.0,2183.0
89
+ scsemi__raw,HS91,DB6,1500,2568,150,0.696,0.6320093457943925,0.034666666666666665,0.04361370716510903,0.134,0.16277258566978192,0.06,0.12694704049844235,0.06933333333333333,0.027258566978193146,0.006,0.007398753894080997,0.21213084112149527,0.084765745333139,0.6818517820973876,39,False,0.4266666666666667,0.05333333333333334,0.86,0.26666666666666666,13.4,16.27725856697819,1963.0,2112.0
90
+ scsemi__raw,HS92,DB7,1500,2115,150,0.7006666666666667,0.5810874704491725,0.09866666666666667,0.11678486997635934,0.072,0.05484633569739953,0.09133333333333334,0.23356973995271868,0.03333333333333333,0.007565011820330969,0.004,0.006146572104018913,0.32500236406619387,0.3732998486021758,0.6200623512157214,85,False,0.4666666666666667,0.04,0.7133333333333334,0.21333333333333335,7.199999999999999,5.484633569739953,1980.5,1976.0
91
+ scsemi__raw,HS93,DB1,1500,5125,150,0.714,0.7139512195121951,0.066,0.08253658536585366,0.1,0.13873170731707318,0.06333333333333334,0.041951219512195125,0.05266666666666667,0.016975609756097562,0.004,0.005853658536585366,0.1142439024390244,0.16735400075678866,0.6466583249989899,1,True,0.68,0.04,0.9866666666666667,0.4066666666666667,10.0,13.873170731707319,1955.0,1873.0
92
+ scsemi__raw,HS94,DB3,1500,4273,150,0.718,0.7343786566814884,0.07133333333333333,0.038380528902410484,0.12266666666666666,0.1352679616194711,0.048,0.06763398080973555,0.03666666666666667,0.019424292066463844,0.0033333333333333335,0.004914579920430611,0.10039035806225136,0.19246014152979807,0.6988495286229254,1,True,0.43333333333333335,0.04,0.84,0.36,12.266666666666666,13.52679616194711,1957.0,2305.0
93
+ scsemi__raw,HS95,DB1,1500,4264,150,0.644,0.6458724202626641,0.07866666666666666,0.08348968105065666,0.12266666666666666,0.13860225140712945,0.05733333333333333,0.09826454033771106,0.08866666666666667,0.025093808630393996,0.008666666666666666,0.008677298311444653,0.12714571607254527,0.05639935549912288,0.6205233048338242,32,False,0.58,0.04666666666666667,0.9,0.44666666666666666,12.266666666666666,13.860225140712945,1957.0,1829.5
94
+ scsemi__raw,HS96,DB7,1500,1801,150,0.7186666666666667,0.5147140477512493,0.08866666666666667,0.06885063853414769,0.126,0.25818989450305385,0.04466666666666667,0.10716268739589117,0.019333333333333334,0.04553026096612993,0.0026666666666666666,0.00555247084952804,0.4475372940958727,0.2631177119211146,0.6707938028939086,64,False,0.6666666666666666,0.02,0.8933333333333333,0.13333333333333333,12.6,25.818989450305384,1979.0,2252.0
95
+ scsemi__raw,HS97,DB4,1500,4609,150,0.6793333333333333,0.7179431546973313,0.07866666666666666,0.0414406595790844,0.13133333333333333,0.16294206986331092,0.06666666666666667,0.05467563462790193,0.03666666666666667,0.018876111954870906,0.007333333333333333,0.004122369277500542,0.14043711578795107,0.1592790337504619,0.6475110308840104,67,False,0.5933333333333334,0.02,0.7866666666666666,0.2,13.133333333333333,16.29420698633109,1955.0,2171.0
96
+ scsemi__raw,HS98,DB2,1500,4959,150,0.5713333333333334,0.5366001209921355,0.06466666666666666,0.07360354910264166,0.21333333333333335,0.30490018148820325,0.06466666666666666,0.03891913692276669,0.07933333333333334,0.03367614438394838,0.006666666666666667,0.012300867110304496,0.21227586206896554,0.31477848043973794,0.6804188111949028,1,True,0.62,0.1,0.8333333333333334,0.36666666666666664,21.333333333333336,30.490018148820326,1959.0,1606.0
97
+ scsemi__raw,HS100,DB6,1500,1838,150,0.6966666666666667,0.6784548422198041,0.035333333333333335,0.05005440696409141,0.148,0.13547334058759522,0.05,0.11588683351468988,0.06666666666666667,0.011969532100108813,0.0033333333333333335,0.008161044613710556,0.17087123685165034,0.134568115885382,0.6926337185218248,12,False,0.32666666666666666,0.04,0.6266666666666667,0.34,14.799999999999999,13.547334058759523,1950.0,2221.0
98
+ scsemi__raw,HS101,DB4,1500,6549,150,0.648,0.6659031913269201,0.084,0.051152847763017255,0.12866666666666668,0.192090395480226,0.10133333333333333,0.05939838143227974,0.037333333333333336,0.026721636891128418,0.0006666666666666666,0.004733547106428463,0.17078760116048247,0.11368421579889504,0.6582863310025578,65,False,0.6333333333333333,0.03333333333333333,0.84,0.23333333333333334,12.866666666666667,19.2090395480226,1955.0,1960.0
99
+ scsemi__raw,HS102,DB7,1500,1983,150,0.6433333333333333,0.6283408976298538,0.10666666666666667,0.10791729702471003,0.12933333333333333,0.17397881996974282,0.062,0.06454866364094806,0.05733333333333333,0.017650025214321734,0.0013333333333333333,0.007564296520423601,0.10935148764498231,0.08584927778602476,0.6788039667930504,67,False,0.6266666666666667,0.0,0.84,0.19333333333333333,12.933333333333334,17.39788199697428,1959.0,2275.0
100
+ scsemi__raw,HS103,DB6,1500,2442,150,0.7046666666666667,0.5941850941850941,0.050666666666666665,0.0819000819000819,0.138,0.1601146601146601,0.03333333333333333,0.14004914004914004,0.06266666666666666,0.01760851760851761,0.010666666666666666,0.006142506142506142,0.3201277641277641,0.11405812083375173,0.6325135216772144,36,False,0.58,0.06,0.86,0.2733333333333333,13.8,16.01146601146601,1958.0,2156.5
101
+ scsemi__raw,HS104,DB4,1500,4870,150,0.734,0.657700205338809,0.07466666666666667,0.07268993839835729,0.12133333333333333,0.19815195071868583,0.03866666666666667,0.05626283367556468,0.03133333333333333,0.012320328542094456,0.0,0.002874743326488706,0.19457905544147844,0.10148009796784185,0.647788781015486,79,False,0.52,0.006666666666666667,0.84,0.16,12.133333333333333,19.815195071868583,1960.0,2025.5
102
+ scsemi__raw,HS105,DB4,1500,4489,150,0.6973333333333334,0.6277567386945868,0.03333333333333333,0.08977500556916908,0.126,0.13967476052572955,0.052,0.12007128536422365,0.086,0.01826687458231232,0.005333333333333333,0.0044553352639786145,0.2763754362515779,0.08853362414206933,0.6776833291729408,79,False,0.37333333333333335,0.006666666666666667,0.74,0.29333333333333333,12.6,13.967476052572955,1961.0,2019.0
103
+ scsemi__raw,HS106,DB2,1500,3949,150,0.5406666666666666,0.40845783742719677,0.024,0.03950367181564953,0.22866666666666666,0.2985565966067359,0.10466666666666667,0.21144593567991896,0.09666666666666666,0.03545201316789061,0.005333333333333333,0.006583945302608255,0.3868469654764919,0.5367816906601658,0.6035747844254246,34,False,0.5733333333333334,0.1,0.9733333333333334,0.20666666666666667,22.866666666666667,29.855659660673588,1948.0,1685.0
104
+ scsemi__raw,HS107,DB1,1500,4445,150,0.6906666666666667,0.7313835770528684,0.06933333333333333,0.031496062992125984,0.12266666666666666,0.14195725534308212,0.07666666666666666,0.0686164229471316,0.037333333333333336,0.02002249718785152,0.0033333333333333335,0.006524184476940383,0.12639670041244846,0.1882743069540917,0.6768473198714373,17,False,0.5266666666666666,0.04,0.78,0.49333333333333335,12.266666666666666,14.195725534308213,1957.0,1849.0
105
+ scsemi__raw,HS108,DB7,1500,1868,150,0.6466666666666666,0.5931477516059958,0.04533333333333334,0.08832976445396146,0.114,0.08618843683083512,0.124,0.20235546038543897,0.06533333333333333,0.023554603854389723,0.004666666666666667,0.006423982869379015,0.2462184154175588,0.2548823272285929,0.6303883000224011,78,False,0.62,0.02,0.7733333333333333,0.2,11.4,8.618843683083512,1964.0,2026.0
106
+ scsemi__raw,HS109,DB5,1500,4265,150,0.6866666666666666,0.6801875732708089,0.09333333333333334,0.04126611957796014,0.09666666666666666,0.17327080890973037,0.058666666666666666,0.06424384525205158,0.056,0.03610785463071512,0.008666666666666666,0.00492379835873388,0.1643626416568972,0.12347777057415639,0.6110602278119237,94,False,0.52,0.0,0.88,0.14,9.666666666666666,17.327080890973036,1981.0,2074.0
107
+ scsemi__raw,HS110,DB1,1500,4176,150,0.7046666666666667,0.5744731800766284,0.050666666666666665,0.1285919540229885,0.13333333333333333,0.15158045977011494,0.056,0.10871647509578544,0.051333333333333335,0.03089080459770115,0.004,0.005747126436781609,0.30127203065134095,0.16056596306141124,0.6703594999959075,41,False,0.47333333333333333,0.08,0.7133333333333334,0.4666666666666667,13.333333333333334,15.158045977011495,1947.0,1704.5
108
+ scsemi__raw,HS111,DB1,1500,4787,150,0.7,0.6772508878211824,0.07933333333333334,0.09024441194902862,0.11,0.12784625026112387,0.046,0.077501566743263,0.062,0.02360559849592647,0.0026666666666666666,0.003551284729475663,0.12228702736578226,0.10990481184878803,0.6500527311017898,22,False,0.7066666666666667,0.04,0.92,0.4066666666666667,11.0,12.784625026112387,1961.0,1865.0
paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20261005T121346Z-scsemi-cv-budget-interim/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scores/immicro/scsemi_cv_20261002/pooled/summary.json ADDED
@@ -0,0 +1,293 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ {
2
+ "schema": "paired_ft_scores.v1",
3
+ "dataset": "immicro",
4
+ "written_utc": "2026-10-05T12:07:00.852153+00:00",
5
+ "command": [
6
+ "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/tools/score_ft.py",
7
+ "--dataset",
8
+ "immicro",
9
+ "--out",
10
+ "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scores/immicro/scsemi_cv_20261002/pooled",
11
+ "--threads",
12
+ "8",
13
+ "--arm",
14
+ "scsemi__raw=/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/generated/immicro/pooled_scsemi_cv_20261002/scsemi__raw.npz"
15
+ ],
16
+ "arms": [
17
+ "scsemi__raw"
18
+ ],
19
+ "donors": [
20
+ "HS1",
21
+ "HS2",
22
+ "HS3",
23
+ "HS4",
24
+ "HS6",
25
+ "HS7",
26
+ "HS8",
27
+ "HS9",
28
+ "HS10",
29
+ "HS11",
30
+ "HS12",
31
+ "HS13",
32
+ "HS14",
33
+ "HS15",
34
+ "HS16",
35
+ "HS17",
36
+ "HS18",
37
+ "HS19",
38
+ "HS20",
39
+ "HS21",
40
+ "HS23",
41
+ "HS24",
42
+ "HS25",
43
+ "HS26",
44
+ "HS27",
45
+ "HS28",
46
+ "HS29",
47
+ "HS30",
48
+ "HS31",
49
+ "HS32",
50
+ "HS34",
51
+ "HS35",
52
+ "HS36",
53
+ "HS37",
54
+ "HS38",
55
+ "HS39",
56
+ "HS40",
57
+ "HS41",
58
+ "HS42",
59
+ "HS43",
60
+ "HS44",
61
+ "HS45",
62
+ "HS46",
63
+ "HS47",
64
+ "HS48",
65
+ "HS49",
66
+ "HS50",
67
+ "HS51",
68
+ "HS52",
69
+ "HS53",
70
+ "HS54",
71
+ "HS55",
72
+ "HS56",
73
+ "HS57",
74
+ "HS58",
75
+ "HS59",
76
+ "HS60",
77
+ "HS61",
78
+ "HS62",
79
+ "HS63",
80
+ "HS64",
81
+ "HS65",
82
+ "HS66",
83
+ "HS67",
84
+ "HS68",
85
+ "HS69",
86
+ "HS70",
87
+ "HS71",
88
+ "HS72",
89
+ "HS73",
90
+ "HS74",
91
+ "HS75",
92
+ "HS76",
93
+ "HS77",
94
+ "HS78",
95
+ "HS79",
96
+ "HS80",
97
+ "HS81",
98
+ "HS82",
99
+ "HS83",
100
+ "HS84",
101
+ "HS85",
102
+ "HS86",
103
+ "HS87",
104
+ "HS88",
105
+ "HS89",
106
+ "HS90",
107
+ "HS91",
108
+ "HS92",
109
+ "HS93",
110
+ "HS94",
111
+ "HS95",
112
+ "HS96",
113
+ "HS97",
114
+ "HS98",
115
+ "HS100",
116
+ "HS101",
117
+ "HS102",
118
+ "HS103",
119
+ "HS104",
120
+ "HS105",
121
+ "HS106",
122
+ "HS107",
123
+ "HS108",
124
+ "HS109",
125
+ "HS110",
126
+ "HS111"
127
+ ],
128
+ "n_donors": 107,
129
+ "reference": {
130
+ "cache": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/immicro",
131
+ "reference_sha256": "c5e2547be3ec3b12cb0c0b404a49e14a046ae59d40be70427f98f083a76bce17",
132
+ "features_sha256": "735255066ce7ebbac13a1fdfd058e26f31edd60314cc02fd589b0a292dbbc838",
133
+ "n_r1_cells": 16050,
134
+ "pca": {
135
+ "n_components": 50,
136
+ "explained_variance_ratio_sum": 0.28717318177223206,
137
+ "n_fit_cells": 16050
138
+ },
139
+ "r2_control": {
140
+ "precision": 0.9634267912772586,
141
+ "coverage": 0.9999376947040498,
142
+ "density": 1.3859065420560748,
143
+ "n_query": 16050,
144
+ "depth_matched": {
145
+ "precision": 0.9634890965732087,
146
+ "coverage": 0.9996884735202493,
147
+ "density": 1.3669096573208723
148
+ }
149
+ },
150
+ "observed_l1_loo_null_mean": 0.1606372707722086
151
+ },
152
+ "contrast_definition": {
153
+ "enabled": false,
154
+ "reason": "dataset immicro has no group contrast (use --groups-csv / --case-groups)"
155
+ },
156
+ "deg_definition": {
157
+ "enabled": false,
158
+ "reason": "contrast off"
159
+ },
160
+ "headline": {
161
+ "scsemi__raw": {
162
+ "comp_l1": 0.2170087237986556,
163
+ "comp_l1_obs_loo_null": 0.1606372707722086,
164
+ "precision": 0.5054205607476635,
165
+ "coverage": 0.03844236760124611,
166
+ "precision_dm": 0.8206853582554517,
167
+ "coverage_dm": 0.2770093457943925,
168
+ "pb_r_median": 0.6610110873132083,
169
+ "pb_top1": 0.06542056074766354,
170
+ "mono_pct_gen": 12.793146417445481,
171
+ "mono_pct_obs": 16.6538380766508,
172
+ "median_umi_gen": 1961.0,
173
+ "median_umi_obs": 1961.0,
174
+ "seconds": 21.7
175
+ }
176
+ },
177
+ "per_arm": {
178
+ "scsemi__raw": {
179
+ "arm": "scsemi__raw",
180
+ "npz": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/generated/immicro/pooled_scsemi_cv_20261002/scsemi__raw.npz",
181
+ "npz_sha256": "437caa3b0d785cf690dca5ca11aa9a8cc98e553ba8264cb5fea37ce4f53d78e1",
182
+ "receipt_verified": true,
183
+ "generation": {
184
+ "checkpoint": null,
185
+ "checkpoint_sha256": null,
186
+ "input_condition_path": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/generated/immicro/pooled_scsemi_cv_20261002/conditions_pooled_raw.npz",
187
+ "input_condition_sha256": "0cf3f9750bb8b48a787720f344559c0f05bacddd14c68e314c7f9fda7f43820f",
188
+ "seed": null,
189
+ "steps": null,
190
+ "support_readout": null,
191
+ "weights": null
192
+ },
193
+ "condition_for_broadcast": null,
194
+ "poisson": {
195
+ "seed": 20260916,
196
+ "rule": "whole NPZ, rows in NPZ order",
197
+ "nnz_whole_npz": 20246004,
198
+ "median_library_whole_npz_panel": 1961.0,
199
+ "n_rows_whole_npz": 160500
200
+ },
201
+ "annotation": {
202
+ "model_pt_sha256": "bf3655899e5abee435340fc008656c4a17342da0f30b70cfd43de8e9223e1930",
203
+ "zero_padded_model_genes": 1,
204
+ "label_counts": {
205
+ "T cell": 110460,
206
+ "Monocyte": 20533,
207
+ "B cell": 10350,
208
+ "DC": 9191,
209
+ "NK cell": 9144,
210
+ "Other": 822
211
+ },
212
+ "mean_l2_max_prob": 0.9194958692862423,
213
+ "predict_seconds": 5.8
214
+ },
215
+ "n_donors": 107,
216
+ "n_generated_cells": 160500,
217
+ "composition": {
218
+ "l1_mean": 0.2170087237986556,
219
+ "l1_median": 0.206910362920857,
220
+ "l1_obs_loo_null_mean": 0.1606372707722086,
221
+ "l1_generated_loo_mean_vs_observed_mean": 0.21278129170341273,
222
+ "composition_top1": 0.04672897196261682,
223
+ "mean_fraction_generated": {
224
+ "T cell": 0.688224,
225
+ "B cell": 0.064486,
226
+ "Monocyte": 0.127931,
227
+ "NK cell": 0.056972,
228
+ "DC": 0.057265,
229
+ "Other": 0.005121
230
+ },
231
+ "mean_fraction_observed": {
232
+ "T cell": 0.639048,
233
+ "B cell": 0.074796,
234
+ "Monocyte": 0.166538,
235
+ "NK cell": 0.091197,
236
+ "DC": 0.022818,
237
+ "Other": 0.005602
238
+ }
239
+ },
240
+ "pseudobulk": {
241
+ "n_genes": 5508,
242
+ "r_median": 0.6610110873132083,
243
+ "r_mean": 0.6600893540276109,
244
+ "top1": 0.06542056074766354,
245
+ "n_top1": 7,
246
+ "own_rank_median": 39.0,
247
+ "chance_top1": 0.009345794392523364
248
+ },
249
+ "precision_coverage": {
250
+ "precision": 0.5054205607476635,
251
+ "coverage": 0.03844236760124611,
252
+ "density": 0.09828037383177571,
253
+ "n_query": 16050,
254
+ "n_reference": 16050
255
+ },
256
+ "precision_coverage_depth_matched": {
257
+ "precision": 0.8206853582554517,
258
+ "coverage": 0.2770093457943925,
259
+ "density": 0.60398753894081,
260
+ "detected_median_before": {
261
+ "R1": 362.0,
262
+ "Q": 122.0
263
+ },
264
+ "detected_median_after": {
265
+ "R1": 122.0,
266
+ "Q": 122.0
267
+ }
268
+ },
269
+ "monocyte_pct": {
270
+ "generated_mean_over_donors": 12.793146417445481,
271
+ "observed_mean_over_donors": 16.6538380766508,
272
+ "generated_pooled_cells": 12.793146417445483
273
+ },
274
+ "median_umi_per_cell_scoring_genes": {
275
+ "generated_pooled": 1961.0,
276
+ "observed_pooled": 1961.0,
277
+ "generated_mean_of_donor_medians": 1960.9486083984375,
278
+ "observed_mean_of_donor_medians": 1997.7429906542056
279
+ },
280
+ "seconds": 21.7
281
+ }
282
+ },
283
+ "code_sha256": {
284
+ "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/tools/score_ft.py": "ec5f40b4cea6d5062d0138f3b934abb6465e34cbfeac869c8a0906924c033aec",
285
+ "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/tools/ft_common.py": "4a6366b0f22208cd58714fc0261b8840c643b9d4569704d560cfd93534cbc747",
286
+ "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/utility_studies_final6k_20260925/umap/cell_immicro_5arm/tools/stage_b_embed.py": "d056cfdf38fb0e5f478756f370174e993b75d0c973c48e02e21749175a4ca2da",
287
+ "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/bulk2sc-paper/scripts/evaluate_generated_vs_truth.py": "48b12d794782b840838853e93e0fc55fab00532c4b3698f4588e926b985d2881",
288
+ "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/utility_studies_final6k_20260925/immicro/tools/immicro_common.py": "c5c30e917148cc5e664e91ea30c11bbdff9b6d1f53a3e0a13e16b1917eff37e9",
289
+ "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/aifi_scanvi_rebuild_20260916/predict_scanvi.py": "482ee5dcf4d72b54bc36cbb6dcff62e5030bc7afc46cb5fb01eca73a82ee45a5",
290
+ "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/aifi_scanvi_rebuild_20260916/poisson_readout.py": "8bfa080942fbcdc89ae23b276524a1a83266fb8cbc56b9af279e50f82e6cde38"
291
+ },
292
+ "seconds": 29.9
293
+ }
paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20261005T121346Z-scsemi-cv-budget-interim/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scores/ji2025_chili/scsemi_cv_20261002/fold0/README.md ADDED
@@ -0,0 +1,73 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ # score_ft.py output: ji2025_chili, 7 scored donors
2
+
3
+ Arms: scsemi__raw. Every arm is scored on the same donors against the same observed reference.
4
+
5
+ ## Inputs and fixed contracts
6
+ - Observed reference: `/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/ji2025_chili/reference.npz` (sha 19c30f56db69), built from datadir:/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/data/ji2025_chili;
7
+ observed cells sum exactly to the features pseudobulk of every donor. Observed labels: /home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/ji2025_chili/observed_labels/labels/labels.parquet.
8
+ - Generated cells: `generated_counts` read out once with Poisson(seed 20260916) over the **whole NPZ in row order**
9
+ (`poisson_readout.poisson_integerise`), then the scored donors' rows. These integer counts are used for labels, embedding,
10
+ depth and the contrast. Pseudobulk uses the summed `generated_counts` (rates), as `score_generated.py`.
11
+ - Labels: frozen f01common scANVI (`predict_scanvi.py`, CPU, zero query epochs), six-type gate ['T cell', 'B cell', 'Monocyte', 'NK cell', 'DC', 'Other']; query genes =
12
+ the 1,006-gene annotation list minus genes the dataset's sc assay did not measure in every sample (1004 genes).
13
+ - Scoring genes: 6k panel genes measured by both assays in every sample of the dataset (5752 genes).
14
+
15
+ ## Definitions
16
+ 1. **Composition**: fraction of each donor's cells per six-type label (all generated cells; all observed QC cells).
17
+ `comp_l1` = sum over the six labels of |generated - observed| (immicro_common.l1). `comp_l1_obs_loo_null` = L1 of the
18
+ donor's observed composition to the mean of the *other scored donors'* observed compositions. `composition_top1` =
19
+ fraction of donors whose generated composition is closest (L1) to their own observed composition.
20
+ 2. **Pseudobulk**: `pb_r` = Pearson r of CPM-log1p(summed generated_counts) vs CPM-log1p(observed pseudobulk) on the scoring
21
+ genes (evaluate_realbulk.cpm_log1p / paired_r). `pb_top1` = the donor's generated pseudobulk is closest (Pearson) to its own
22
+ observed pseudobulk among the 7 scored donors (immicro_common.retrieval = evaluate_realbulk.top1 arithmetic).
23
+ 3. **Precision / coverage / density** (stage_b_embed.py functions): per-cell CP10K over the scoring genes + log1p; PCA-50
24
+ (randomized, random_state 20260925) and k = 10 real-real k-NN balls fitted on **R1 of the scored donors only**.
25
+ Reference rule (independent of fold and arm): per donor, cells in canonical order (library_id+barcode), one
26
+ permutation from `default_rng([20260925, uint64(sha256(donor)[:8])])`; R1 = first n, R2 = next n,
27
+ n = min(150, n_cells // 2) (1050 R1 cells here). Generated query: per donor n cells (the donor's R1 size),
28
+ without replacement, `default_rng([20260926, same key])`. Precision = fraction of generated cells inside any R1 ball
29
+ (Kynkaanniemi 2019); coverage = fraction of R1 cells whose ball holds a generated cell; density = Naeem 2020.
30
+ Per-donor precision = that donor's generated cells; per-donor coverage = that donor's R1 cells (the pooled values are
31
+ their n-weighted means; plain means when every donor has 150 reference cells). R2 (held-out real cells of the same donors) is the
32
+ perfect-generator control: precision 0.9990, coverage 1.0000.
33
+ **Depth matched**: stage_b_embed depth matching run pairwise (R1 vs this arm): per donor and within-donor rank of detected
34
+ genes, both cells are thinned by UMI sampling without replacement to the smaller detected-gene count; PCA kept from
35
+ un-thinned R1, radii recomputed on thinned R1; fresh rng(20260929) per arm. R2 control: precision
36
+ 0.9990, coverage 1.0000.
37
+ 4. **Monocyte %** = 100 x Monocyte fraction (all cells) per donor; **median UMI per cell** = median over cells of the
38
+ Poisson-read (generated) / observed counts summed over the scoring genes (per donor, and pooled).
39
+ 5. **Group contrast** (T, B, Monocyte, NK): case groups ['TOL', 'FU1'] (n = 4) vs control groups ['BC', 'AC'] (n = 3); rule: explicit --case-groups / --control-groups; groups from features groups.
40
+ Genes per type = scoring genes detected (count > 0) in >= 1 % of the scored donors' observed
41
+ cells of that type. Primary statistic `mean_cp10k`: per-cell CP10K over the scoring genes; per donor the mean over its
42
+ cells of the type (donors with >= 1 such cell); group mean = mean over the group's donors (donor-balanced);
43
+ logFC = log2(case mean + 1) - log2(control mean + 1). Secondary `pseudobulk_log1p_cpm`: the SLE benchmark evaluator's
44
+ statistic (donor x type summed counts, log1p CPM over the scoring genes, mean case - mean control;
45
+ evaluate_generated_vs_truth.group_log_fold_change). Both are computed on the generated cells (their frozen labels) and on
46
+ the observed cells; `r_generated` = Pearson r of the two logFC vectors. Broadcast baseline `r_broadcast`: the same
47
+ observed vector against the logFC of the input bulk (condition NPZ `bulk_counts` of the arm, scoring genes, per-donor
48
+ CP10K resp. log1p CPM, group means). `partial_r_generated_given_broadcast`: r of the OLS residuals of observed and
49
+ generated logFC on the bulk logFC (residual_specificity.py).
50
+ 6. **Top-50 DEG overlap** (contrast.csv rows `statistic = welch_top50_deg`; summary `deg_top50`): the SLE benchmark's score (`total_top50_overlap` of
51
+ `bulk2sc-paper/scripts/evaluate_generated_vs_truth.py`, Welch backend: the "top-50 DEG 81 / 84" of the final model), run
52
+ with the evaluator's own functions on the same donor x type pseudobulks as the contrast. Per cell type, observed and
53
+ generated separately: donor x type summed counts on all 5752 scoring genes (donors of the two groups with
54
+ >= 1 cell of the type) -> `welch_bh_deg` (log1p CPM, two-sided Welch t-test case vs control, Benjamini-Hochberg over the
55
+ genes with a defined p-value; needs >= 2 donors per group) -> `top_deg_genes` (FDR < 0.05, descending |logFC|,
56
+ first 50; shorter when fewer genes pass). `top50_overlap` = |observed list & generated list|; `top50_jaccard`
57
+ the evaluator's Jaccard. Summary `sum` = total over the scored types (the quantity reported as 81), `max` = the sum of
58
+ the observed list lengths (the "of 262"), `sum_4type` = T + B + Monocyte + NK. A type is scored when its observed test
59
+ is defined; an arm whose generated test is undefined for a scored type gets overlap 0. Types: T cell, B cell, Monocyte, NK cell, DC
60
+ (aggregates: /home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/ji2025_chili/deg_reference.npz).
61
+ **Broadcast analogue** (`top50_overlap_broadcast`, as `sle_broadcast.py` `broadcast_input_bulk`; not part of the
62
+ published benchmark): the same test on the arm's condition bulk_counts (scoring genes, the 4 + 3
63
+ donors), one whole-PBMC top-50 list, compared with every type's observed list.
64
+
65
+ ## Files
66
+ - `per_donor.csv`: one row per arm x donor (all per-donor quantities above).
67
+ - `summary.json`: per arm the donor means / pooled values, provenance (NPZ sha, receipt check, generation metadata,
68
+ Poisson nnz of the whole NPZ, annotation contract), and the reference block (PCA, R2 control).
69
+ - `contrast.csv`: per arm x cell type x statistic (`mean_cp10k`, `pseudobulk_log1p_cpm`: logFC r; `welch_top50_deg`:
70
+ top-50 DEG overlap, T / B / Monocyte / NK / DC; columns of the other kind are empty).
71
+ - `arms/<arm>/labels/` (predict_scanvi.py labels + manifest), `arms/<arm>/generated_cells.parquet` (NPZ row, donor, label,
72
+ UMI on the scoring genes, P/C subsample flag), `arms/<arm>/deg_top50_lists.csv` (observed, generated and broadcast
73
+ top-50 gene lists, Ensembl ids, rank order).
paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20261005T121346Z-scsemi-cv-budget-interim/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scores/ji2025_chili/scsemi_cv_20261002/fold0/contrast.csv ADDED
@@ -0,0 +1,14 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ arm,celltype,statistic,n_genes,r_generated,r_broadcast,partial_r_generated_given_broadcast,r_generated_vs_broadcast,n_case_donors_obs,n_control_donors_obs,n_case_donors_gen,n_control_donors_gen,n_cells_obs,n_cells_gen,deg_scored,top50_overlap,top50_jaccard,obs_top_list_size,gen_top_list_size,n_sig_obs,n_sig_gen,top50_overlap_broadcast,top50_jaccard_broadcast,broadcast_top_list_size,n_sig_broadcast
2
+ scsemi__raw,T cell,mean_cp10k,3081,0.15856624108957548,0.1190450891436176,0.14210402392947438,0.16253393773781682,4,3,4,3,9937,5126,,,,,,,,,,,
3
+ scsemi__raw,T cell,pseudobulk_log1p_cpm,3081,0.05959417993720579,0.2115266020201074,0.03960278050030513,0.09965749406757335,4,3,4,3,9937,5126,,,,,,,,,,,
4
+ scsemi__raw,B cell,mean_cp10k,3220,0.058236169083901466,0.07998240288565073,0.048100789494480475,0.1340578867436337,4,3,4,3,2420,627,,,,,,,,,,,
5
+ scsemi__raw,B cell,pseudobulk_log1p_cpm,3220,0.005882560106885731,0.09605664241926874,-0.0018279897291521405,0.0801219685617723,4,3,4,3,2420,627,,,,,,,,,,,
6
+ scsemi__raw,Monocyte,mean_cp10k,3042,0.4068693913507391,0.2702851870874978,0.3560699679110969,0.29241991353420704,4,3,4,3,9477,2070,,,,,,,,,,,
7
+ scsemi__raw,Monocyte,pseudobulk_log1p_cpm,3042,0.2608408550174998,0.2959365090443363,0.21716220890567287,0.193745530834027,4,3,4,3,9477,2070,,,,,,,,,,,
8
+ scsemi__raw,NK cell,mean_cp10k,3093,0.2486943065133554,0.07850914184133898,0.2383883184965949,0.20481552626444624,4,3,4,3,2081,1812,,,,,,,,,,,
9
+ scsemi__raw,NK cell,pseudobulk_log1p_cpm,3093,0.09528908236669889,0.10464207300269963,0.08469322622740773,0.11064359703897245,4,3,4,3,2081,1812,,,,,,,,,,,
10
+ scsemi__raw,T cell,welch_top50_deg,5752,,,,,4,3,4,3,9937,5126,True,0,,0,0,0,0,0,,0,0
11
+ scsemi__raw,B cell,welch_top50_deg,5752,,,,,4,3,4,3,2420,627,True,0,,0,0,0,0,0,,0,0
12
+ scsemi__raw,Monocyte,welch_top50_deg,5752,,,,,4,3,4,3,9477,2070,True,0,,0,0,0,0,0,,0,0
13
+ scsemi__raw,NK cell,welch_top50_deg,5752,,,,,4,3,4,3,2081,1812,True,0,,0,0,0,0,0,,0,0
14
+ scsemi__raw,DC,welch_top50_deg,5752,,,,,4,3,3,3,318,668,True,0,0.0,50,0,221,0,0,0.0,0,0