Archive 4 checkpoints (1-4)
Browse files- paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20261003T103040Z-crosscohort-k1000-saturation/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_crosscohort_20261002/scores/imperial_eskd/locoL_fullsat_s40000_K1000/contrast.csv +14 -0
- paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20261003T103040Z-crosscohort-k1000-saturation/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_crosscohort_20261002/scores/imperial_eskd/locoL_fullsat_s40000_K1000/per_donor.csv +158 -0
- paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20261003T103040Z-crosscohort-k1000-saturation/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_crosscohort_20261002/scores/imperial_eskd/locoL_fullsat_s40000_K1000/summary.json +1063 -0
- paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20261003T103040Z-crosscohort-k1000-saturation/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_crosscohort_20261002/scores/imperial_eskd/locoL_fullsat_s60000_K1000/README.md +73 -0
paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20261003T103040Z-crosscohort-k1000-saturation/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_crosscohort_20261002/scores/imperial_eskd/locoL_fullsat_s40000_K1000/contrast.csv
ADDED
|
@@ -0,0 +1,14 @@
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 1 |
+
arm,celltype,statistic,n_genes,r_generated,r_broadcast,partial_r_generated_given_broadcast,r_generated_vs_broadcast,n_case_donors_obs,n_control_donors_obs,n_case_donors_gen,n_control_donors_gen,n_cells_obs,n_cells_gen,deg_scored,top50_overlap,top50_jaccard,obs_top_list_size,gen_top_list_size,n_sig_obs,n_sig_gen,top50_overlap_broadcast,top50_jaccard_broadcast,broadcast_top_list_size,n_sig_broadcast
|
| 2 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,T cell,mean_cp10k,3031,0.5407630916108798,0.6352016868529187,0.38683486986203597,0.42572218124388156,113,34,113,34,262546,101874,,,,,,,,,,,
|
| 3 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,T cell,pseudobulk_log1p_cpm,3031,0.3394046288258067,0.6294466207665587,0.059020696374805504,0.47509901473664273,113,34,113,34,262546,101874,,,,,,,,,,,
|
| 4 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,B cell,mean_cp10k,3184,0.5066510690944063,0.6290331452237995,0.3490120889908626,0.4125373435670074,113,34,113,34,48625,15040,,,,,,,,,,,
|
| 5 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,B cell,pseudobulk_log1p_cpm,3184,0.282348756205035,0.4870645233040134,0.13309795873464697,0.3567366139920275,113,34,113,34,48625,15040,,,,,,,,,,,
|
| 6 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,Monocyte,mean_cp10k,2877,0.5852452284886839,0.7184291928055079,0.3126215119054127,0.5648399341570739,112,34,113,34,80851,78131,,,,,,,,,,,
|
| 7 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,Monocyte,pseudobulk_log1p_cpm,2877,0.4854399179576236,0.7066219687885489,0.14147914059950045,0.5706451517150906,112,34,113,34,80851,78131,,,,,,,,,,,
|
| 8 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,NK cell,mean_cp10k,2964,0.3783310928671535,0.6597572279517877,0.12490929127794027,0.4461070056262193,113,34,113,34,72125,15410,,,,,,,,,,,
|
| 9 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,NK cell,pseudobulk_log1p_cpm,2964,0.20551856147494624,0.5964102520780005,-0.028035290781318164,0.37950131134428866,113,34,113,34,72125,15410,,,,,,,,,,,
|
| 10 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,T cell,welch_top50_deg,5927,,,,,113,34,113,34,262546,101874,True,24,0.3157894736842105,50,50,1057,695,17,0.20481927710843373,50,2242
|
| 11 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,B cell,welch_top50_deg,5927,,,,,113,34,113,34,48625,15040,True,20,0.25,50,50,298,329,14,0.16279069767441862,50,2242
|
| 12 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,Monocyte,welch_top50_deg,5927,,,,,112,34,113,34,80851,78131,True,24,0.3157894736842105,50,50,349,796,22,0.28205128205128205,50,2242
|
| 13 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,NK cell,welch_top50_deg,5927,,,,,113,34,113,34,72125,15410,True,18,0.21951219512195122,50,50,427,271,16,0.19047619047619047,50,2242
|
| 14 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,DC,welch_top50_deg,5927,,,,,113,34,110,33,13572,1189,True,13,0.14942528735632185,50,50,341,131,15,0.17647058823529413,50,2242
|
paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20261003T103040Z-crosscohort-k1000-saturation/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_crosscohort_20261002/scores/imperial_eskd/locoL_fullsat_s40000_K1000/per_donor.csv
ADDED
|
@@ -0,0 +1,158 @@
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 1 |
+
arm,donor,group,n_generated_cells,n_observed_cells,n_reference_cells,gen_T cell,obs_T cell,gen_B cell,obs_B cell,gen_Monocyte,obs_Monocyte,gen_NK cell,obs_NK cell,gen_DC,obs_DC,gen_Other,obs_Other,comp_l1,comp_l1_obs_loo_null,pb_r,pb_own_rank,pb_top1,precision,coverage,precision_depth_matched,coverage_depth_matched,mono_pct_gen,mono_pct_obs,median_umi_gen,median_umi_obs
|
| 2 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C20_1004,covid_positive,1500,1810,150,0.22,0.43425414364640885,0.08666666666666667,0.3994475138121547,0.604,0.03867403314917127,0.043333333333333335,0.07790055248618785,0.009333333333333334,0.04751381215469613,0.03666666666666667,0.0022099447513812156,1.1995653775322284,0.6005338406000345,0.8322960302777548,129,False,0.7333333333333333,0.30666666666666664,0.7733333333333333,0.52,60.4,3.867403314917127,1427.5,1373.5
|
| 3 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C20_1404,covid_positive,1500,5836,150,0.18933333333333333,0.4885195339273475,0.066,0.2705620287868403,0.6653333333333333,0.015421521590130226,0.048666666666666664,0.204592186429061,0.005333333333333333,0.016620973269362578,0.025333333333333333,0.004283755997258396,1.341922778158556,0.377519259206171,0.8434500294865347,126,False,0.7666666666666667,0.47333333333333333,0.7933333333333333,0.6666666666666666,66.53333333333333,1.5421521590130227,1591.5,1473.0
|
| 4 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C21_1004,covid_positive,1500,5552,150,0.746,0.8982348703170029,0.034666666666666665,0.08609510086455331,0.14733333333333334,0.0,0.021333333333333333,0.0111671469740634,0.004666666666666667,0.0005403458213256485,0.046,0.003962536023054755,0.4073266090297791,0.813335352446266,0.831490338523863,139,False,0.62,0.48,0.74,0.7666666666666667,14.733333333333334,0.0,1754.5,1563.5
|
| 5 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C21_1704,covid_positive,1500,4570,150,0.504,0.7275711159737418,0.17533333333333334,0.2214442013129103,0.17266666666666666,0.004814004376367615,0.042,0.022319474835886213,0.0013333333333333333,0.011816192560175055,0.10466666666666667,0.012035010940919038,0.560329686360321,0.6774748884556812,0.8724619484728839,99,False,0.66,0.49333333333333335,0.7466666666666667,0.72,17.266666666666666,0.48140043763676155,1725.0,2131.0
|
| 6 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C21_2504,covid_positive,1500,5048,150,0.33066666666666666,0.7567353407290016,0.09666666666666666,0.12361331220285261,0.43,0.06220285261489699,0.043333333333333335,0.039619651347068144,0.0,0.011687797147385102,0.09933333333333333,0.006141045958795562,0.929406233491812,0.5401415597460854,0.8700332642761192,19,False,0.7,0.6266666666666667,0.74,0.84,43.0,6.220285261489699,1901.0,2692.5
|
| 7 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C23_2204,covid_positive,1500,3088,150,0.6113333333333333,0.685880829015544,0.058666666666666666,0.10362694300518134,0.24066666666666667,0.06703367875647669,0.05,0.11269430051813471,0.005333333333333333,0.025906735751295335,0.034,0.0048575129533678756,0.40555094991364427,0.37947949920467566,0.8901878369527808,18,False,0.84,0.68,0.8466666666666667,0.88,24.066666666666666,6.703367875647668,1804.5,1936.5
|
| 8 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C31_1304,covid_positive,1500,3525,150,0.816,0.782695035460993,0.06133333333333333,0.1075177304964539,0.07466666666666667,0.007659574468085106,0.02266666666666667,0.07716312056737588,0.004666666666666667,0.02070921985815603,0.020666666666666667,0.00425531914893617,0.23344680851063823,0.5810203700567228,0.8822588104179052,42,False,0.88,0.8,0.9066666666666666,0.8933333333333333,7.466666666666668,0.7659574468085106,1773.5,1623.0
|
| 9 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C31_2004,covid_positive,1500,2265,150,0.67,0.8004415011037528,0.07466666666666667,0.08123620309050773,0.17933333333333334,0.039293598233995586,0.044,0.05121412803532009,0.006,0.022958057395143488,0.026,0.004856512141280353,0.3223664459161148,0.6165133013422425,0.8965676889965556,35,False,0.8066666666666666,0.6333333333333333,0.86,0.7933333333333333,17.933333333333334,3.9293598233995586,1617.5,1910.0
|
| 10 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C31_2704,covid_positive,1500,4200,150,0.7566666666666667,0.7042857142857143,0.05533333333333333,0.08023809523809523,0.104,0.08714285714285715,0.06933333333333333,0.09857142857142857,0.005333333333333333,0.025952380952380952,0.009333333333333334,0.0038095238095238095,0.14952380952380953,0.42420172770616554,0.9030690862252869,3,False,0.8533333333333334,0.7266666666666667,0.88,0.9,10.4,8.714285714285715,1813.0,1704.0
|
| 11 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C33_1401,covid_positive,1500,3983,150,0.37333333333333335,0.38890283705749434,0.023333333333333334,0.016570424303288978,0.4686666666666667,0.11172483052975145,0.096,0.464474014561888,0.004666666666666667,0.014310820989204118,0.034,0.004017072558373086,0.7873753452171729,0.6015977414820979,0.8727109649475789,65,False,0.74,0.4266666666666667,0.7466666666666667,0.48,46.86666666666667,11.172483052975144,1171.5,909.0
|
| 12 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C33_1601,covid_positive,1500,395,150,0.42133333333333334,0.14430379746835442,0.04,0.11645569620253164,0.3486666666666667,0.2,0.15533333333333332,0.5240506329113924,0.0033333333333333335,0.007594936708860759,0.03133333333333333,0.007594936708860759,0.8988691983122363,0.781467701292667,0.8636739522333265,113,False,0.74,0.76,0.78,0.5933333333333334,34.86666666666667,20.0,1028.0,644.0
|
| 13 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C33_1901,covid_positive,1500,1947,150,0.5846666666666667,0.3754494093477144,0.03,0.042116076014381096,0.138,0.12223934257832562,0.212,0.43656908063687727,0.0006666666666666666,0.01078582434514638,0.034666666666666665,0.012840267077555213,0.4936086286594762,0.5457878736320764,0.886583026154782,11,False,0.58,0.5533333333333333,0.64,0.5733333333333334,13.8,12.223934257832562,876.0,897.0
|
| 14 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C34_1404,covid_positive,1500,2483,150,0.31066666666666665,0.8771647200966572,0.03933333333333333,0.01973419250906162,0.568,0.016915022150624244,0.022,0.07047925896093435,0.010666666666666666,0.011679420056383408,0.04933333333333333,0.004027386226339106,1.2319801315612837,0.7709669223771655,0.8380976401938336,124,False,0.7066666666666667,0.62,0.7333333333333333,0.78,56.8,1.6915022150624244,2204.5,1720.0
|
| 15 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C34_2104,covid_positive,1500,2808,150,0.36,0.7916666666666666,0.03933333333333333,0.024216524216524215,0.5286666666666666,0.041666666666666664,0.02,0.12428774928774929,0.01,0.013888888888888888,0.042,0.004273504273504274,1.0796866096866096,0.5999708155171841,0.8690462401438264,73,False,0.7866666666666666,0.7066666666666667,0.8266666666666667,0.9066666666666666,52.86666666666666,4.166666666666666,2119.5,2067.5
|
| 16 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C34_2504,covid_positive,1500,1945,150,0.514,0.6961439588688946,0.03866666666666667,0.024678663239074552,0.37666666666666665,0.12544987146529563,0.03133333333333333,0.12904884318766066,0.012666666666666666,0.02416452442159383,0.02666666666666667,0.0005141388174807198,0.5827146529562982,0.40892539992164,0.8939623191972996,14,False,0.8133333333333334,0.72,0.86,0.9333333333333333,37.666666666666664,12.544987146529563,2159.5,2111.0
|
| 17 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C36_1504,covid_positive,1500,4765,150,0.49466666666666664,0.7643231899265478,0.064,0.14144805876180483,0.3526666666666667,0.03546694648478489,0.04,0.030640083945435468,0.005333333333333333,0.01951731374606506,0.043333333333333335,0.008604407135362015,0.7225771248688353,0.5893382201890965,0.8724659707756899,81,False,0.7266666666666667,0.7666666666666667,0.82,0.9133333333333333,35.266666666666666,3.546694648478489,1904.5,1747.0
|
| 18 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C36_1704,covid_positive,1500,1554,150,0.6433333333333333,0.842985842985843,0.056666666666666664,0.07335907335907337,0.192,0.014800514800514801,0.074,0.0546975546975547,0.002,0.010296010296010296,0.032,0.003861003861003861,0.4492818532818533,0.7027427978748242,0.8729261736373725,72,False,0.88,0.6866666666666666,0.9066666666666666,0.9333333333333333,19.2,1.4800514800514801,1693.0,2044.5
|
| 19 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C36_2104,covid_positive,1500,1086,150,0.6186666666666667,0.7679558011049724,0.044,0.09668508287292818,0.2733333333333333,0.05432780847145488,0.028666666666666667,0.06353591160220995,0.007333333333333333,0.011970534069981584,0.028,0.0055248618784530384,0.48296132596685076,0.552682714113083,0.8836328359350708,39,False,0.82,0.7533333333333333,0.8733333333333333,0.96,27.333333333333332,5.432780847145488,2256.5,1851.0
|
| 20 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C40_1504,covid_positive,1500,5482,150,0.39066666666666666,0.7433418460415907,0.04533333333333334,0.09649762860269974,0.49866666666666665,0.05600145932141554,0.029333333333333333,0.09157241882524626,0.005333333333333333,0.009668004377964246,0.030666666666666665,0.002918642831083546,0.9408264623616686,0.4967961170529107,0.8738650347906411,29,False,0.76,0.68,0.7533333333333333,0.8333333333333334,49.86666666666667,5.6001459321415545,1756.5,1253.5
|
| 21 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C40_2204,covid_positive,1500,975,150,0.5673333333333334,0.6933333333333334,0.08466666666666667,0.13538461538461538,0.23133333333333334,0.028717948717948718,0.054,0.12923076923076923,0.002,0.010256410256410256,0.06066666666666667,0.003076923076923077,0.5204102564102564,0.4280166763557205,0.8695453963341667,110,False,0.74,0.56,0.8066666666666666,0.84,23.133333333333333,2.871794871794872,1675.5,1808.0
|
| 22 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C40_0105,covid_positive,1500,8728,150,0.256,0.42587076076993585,0.05533333333333333,0.036778185151237396,0.6166666666666667,0.4643675527039413,0.019333333333333334,0.05728689275893675,0.012,0.013175985334555454,0.04066666666666666,0.0025206232813932174,0.41800061106018943,0.5909469296575621,0.9026698969261202,4,False,0.84,0.6866666666666666,0.84,0.82,61.66666666666667,46.43675527039413,2501.0,1862.0
|
| 23 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C42_1504,covid_positive,1500,2762,150,0.5473333333333333,0.7320782041998551,0.03933333333333333,0.13613323678493844,0.344,0.020275162925416364,0.028666666666666667,0.0894279507603186,0.011333333333333334,0.013758146270818247,0.029333333333333333,0.00832729905865315,0.6894617426985274,0.5141600776933539,0.8512767439618589,130,False,0.62,0.43333333333333335,0.7666666666666667,0.6266666666666667,34.4,2.0275162925416366,1312.5,1302.0
|
| 24 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C42_2204,covid_positive,1500,4970,150,0.7086666666666667,0.8511066398390342,0.02,0.06317907444668008,0.212,0.035211267605633804,0.036,0.035211267605633804,0.004,0.012072434607645875,0.019333333333333334,0.0032193158953722333,0.38738296445338694,0.7197827632523519,0.8900805498495036,16,False,0.7533333333333333,0.64,0.8533333333333334,0.8,21.2,3.5211267605633805,1550.5,1462.0
|
| 25 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C42_2704,covid_positive,1500,8918,150,0.6493333333333333,0.8535546086566494,0.014666666666666666,0.04619869925992375,0.2673333333333333,0.036891679748822605,0.032,0.054047992823503026,0.010666666666666666,0.006391567616057412,0.026,0.0029154518950437317,0.5156026014801525,0.7246787008875823,0.8825841864824817,33,False,0.6666666666666666,0.6533333333333333,0.76,0.8133333333333334,26.73333333333333,3.6891679748822606,1491.5,1489.0
|
| 26 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C58_1604,covid_negative,1500,265,132,0.5193333333333333,0.7018867924528301,0.025333333333333333,0.04150943396226415,0.386,0.0037735849056603774,0.032,0.2188679245283019,0.006,0.01509433962264151,0.03133333333333333,0.018867924528301886,0.7893836477987421,0.51846072438743,0.8089550966979744,154,False,0.7727272727272727,0.3712121212121212,0.803030303030303,0.6212121212121212,38.6,0.37735849056603776,1841.0,1285.0
|
| 27 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C58_2501,covid_positive,1500,1671,150,0.29933333333333334,0.42848593656493117,0.04066666666666666,0.0353081986834231,0.5693333333333334,0.31717534410532616,0.04,0.15320167564332735,0.01,0.05326152004787552,0.04066666666666666,0.012567324955116697,0.5712315978456014,0.3470110787273232,0.8856224683919242,16,False,0.84,0.9066666666666666,0.8533333333333334,0.8533333333333334,56.93333333333334,31.717534410532615,2479.5,700.0
|
| 28 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C58_2901,covid_positive,1500,1615,150,0.644,0.6179566563467492,0.014,0.03653250773993808,0.258,0.17956656346749225,0.04133333333333333,0.10835913312693499,0.0033333333333333335,0.03219814241486068,0.03933333333333333,0.025386996904024767,0.23684623323013418,0.29693957301769275,0.8684555797030353,24,False,0.8266666666666667,0.8333333333333334,0.8466666666666667,0.7666666666666667,25.8,17.956656346749224,1936.5,882.0
|
| 29 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C58_0102,covid_positive,1500,972,150,0.6573333333333333,0.5339506172839507,0.034,0.027777777777777776,0.25266666666666665,0.2880658436213992,0.025333333333333333,0.11316872427983539,0.010666666666666666,0.03292181069958848,0.02,0.00411522633744856,0.29097942386831277,0.32547969346416367,0.8727463574809727,59,False,0.82,0.8533333333333334,0.8333333333333334,0.7866666666666666,25.266666666666666,28.80658436213992,2120.5,749.0
|
| 30 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C58_0402,covid_positive,1500,9254,150,0.7246666666666667,0.4245731575534904,0.020666666666666667,0.01988329371082775,0.18133333333333335,0.4091203803760536,0.048,0.11681435055111303,0.006666666666666667,0.02485411713853469,0.018666666666666668,0.004754700669980549,0.6295776961314026,0.4845732068994056,0.8843867883682553,20,False,0.9,0.8266666666666667,0.9266666666666666,0.7933333333333333,18.133333333333333,40.912038037605356,1840.5,1006.0
|
| 31 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C58_1003,recovery,1500,4918,150,0.42733333333333334,0.5917039446929646,0.028666666666666667,0.02745018300122001,0.43266666666666664,0.1691744611630744,0.04733333333333333,0.14721431476209842,0.02,0.05612037413582757,0.044,0.008336722244814965,0.6007439338484479,0.24960071023802022,0.8735171433982194,33,False,0.6466666666666666,0.9066666666666666,0.6666666666666666,0.8533333333333334,43.266666666666666,16.917446116307442,1670.5,745.5
|
| 32 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C60_2504,covid_positive,1500,1837,150,0.8546666666666667,0.8911268372346217,0.046,0.05443658138268917,0.048666666666666664,0.00979858464888405,0.03,0.032117583015786606,0.002,0.009254218835057159,0.018666666666666668,0.00326619488296135,0.1085371076029759,0.7926028747225629,0.8762746495330473,52,False,0.6933333333333334,0.5866666666666667,0.82,0.8466666666666667,4.866666666666666,0.979858464888405,1540.0,1187.0
|
| 33 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C63_1704,covid_positive,1500,3305,150,0.31733333333333336,0.7718608169440242,0.05333333333333334,0.11981845688350984,0.5086666666666667,0.013010590015128594,0.03133333333333333,0.08199697428139183,0.006666666666666667,0.006959152798789713,0.08266666666666667,0.006354009077155824,1.1439374684820978,0.5597214025715005,0.8238319808808674,150,False,0.7866666666666666,0.43333333333333335,0.8133333333333334,0.6266666666666667,50.866666666666674,1.3010590015128594,1943.0,1364.0
|
| 34 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C63_2404,covid_positive,1500,2143,150,0.6673333333333333,0.6971535230984601,0.07333333333333333,0.1675221651889874,0.14933333333333335,0.0377974801679888,0.05466666666666667,0.08726084927671489,0.005333333333333333,0.007932804479701353,0.05,0.0023331777881474567,0.31840535075439413,0.5057142314913275,0.8888688672599301,46,False,0.8866666666666667,0.5266666666666666,0.8866666666666667,0.7733333333333333,14.933333333333335,3.7797480167988797,2266.5,1596.0
|
| 35 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C63_2904,covid_positive,1500,1684,150,0.67,0.6775534441805225,0.06733333333333333,0.14251781472684086,0.15266666666666667,0.08491686460807601,0.06066666666666667,0.0855106888361045,0.0,0.007719714964370546,0.04933333333333333,0.0017814726840855108,0.2306033254156769,0.4165053727311593,0.8860222982885866,22,False,0.86,0.5266666666666666,0.9066666666666666,0.7866666666666666,15.266666666666667,8.491686460807601,2170.5,1647.5
|
| 36 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C65_1704,covid_positive,1500,1117,150,0.26266666666666666,0.5264100268576545,0.092,0.13070725156669652,0.536,0.03670546105640107,0.07466666666666667,0.2909579230080573,0.0026666666666666666,0.009847806624888093,0.032,0.005371530886302597,1.0518460161145926,0.33049285491578545,0.8542792475746769,105,False,0.7133333333333334,0.46,0.72,0.58,53.6,3.670546105640107,1300.5,1042.0
|
| 37 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C65_2104,covid_positive,1500,274,137,0.378,0.5766423357664233,0.30733333333333335,0.20802919708029197,0.19733333333333333,0.014598540145985401,0.09466666666666666,0.19343065693430658,0.0006666666666666666,0.0036496350364963502,0.022,0.0036496350364963502,0.6007785888077858,0.3905468316130126,0.8342068035762579,154,False,0.6277372262773723,0.45255474452554745,0.6204379562043796,0.6642335766423357,19.733333333333334,1.4598540145985401,1469.5,1266.0
|
| 38 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C65_2504,covid_positive,1500,1069,150,0.6426666666666667,0.6623012160898035,0.076,0.11412535079513564,0.11533333333333333,0.031805425631431246,0.086,0.16931711880261927,0.0006666666666666666,0.002806361085126286,0.07933333333333334,0.019644527595884004,0.28643342687870277,0.3451007726503511,0.8869231419901253,31,False,0.7933333333333333,0.38666666666666666,0.8666666666666667,0.8666666666666667,11.533333333333333,3.1805425631431246,1784.5,2137.0
|
| 39 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C69_1804,covid_negative,1500,6901,150,0.5706666666666667,0.819591363570497,0.020666666666666667,0.028546587451094046,0.31933333333333336,0.0585422402550355,0.058666666666666666,0.04637009129111723,0.0026666666666666666,0.03231415736849732,0.028,0.014635560063758875,0.5729042167801769,0.6531972982365499,0.8736612018349256,38,False,0.86,0.7133333333333334,0.9066666666666666,0.7733333333333333,31.933333333333337,5.85422402550355,1816.5,1211.0
|
| 40 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C82_2504,covid_positive,1500,7154,150,0.3453333333333333,0.8433044450656975,0.05466666666666667,0.03228962818003914,0.516,0.047246295778585405,0.020666666666666667,0.037042214145932346,0.005333333333333333,0.030192899077439196,0.058,0.009924517752306402,1.0784124499114716,0.6963449827928051,0.851089535260511,113,False,0.8533333333333334,0.7933333333333333,0.8266666666666667,0.76,51.6,4.724629577858541,2275.5,1210.0
|
| 41 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C85_2004,covid_negative,1500,3618,150,0.366,0.6199557766721946,0.028,0.026810392482034272,0.45466666666666666,0.15201768933112217,0.092,0.12493090105030404,0.0026666666666666666,0.039524599226091764,0.056666666666666664,0.03676064123825318,0.6474892205638475,0.3104138363519918,0.8837942277029659,8,False,0.8066666666666666,0.76,0.84,0.7266666666666667,45.46666666666667,15.201768933112216,2061.0,1463.5
|
| 42 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C93_2104,covid_positive,1500,5003,150,0.118,0.5098940635618628,0.028666666666666667,0.06516090345792525,0.76,0.15790525684589246,0.04666666666666667,0.23246052368578854,0.02,0.029982010793523885,0.02666666666666667,0.004597241655006996,1.2483283363315345,0.15328921446319485,0.8837038636305601,34,False,0.82,0.8933333333333333,0.8466666666666667,0.94,76.0,15.790525684589246,2893.0,1416.0
|
| 43 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C93_2704,covid_positive,1500,6623,150,0.49266666666666664,0.4635361618601842,0.04733333333333333,0.031103729427751775,0.33866666666666667,0.22044390759474558,0.09066666666666667,0.26256983240223464,0.0033333333333333335,0.018873622225577532,0.027333333333333334,0.003472746489506266,0.37488690925562435,0.2926458277760775,0.9049180402566578,4,False,0.8733333333333333,0.8133333333333334,0.8533333333333334,0.9133333333333333,33.86666666666667,22.04439075947456,1867.0,1439.0
|
| 44 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C93_0405,covid_positive,1500,5527,150,0.64,0.47421747783607743,0.018666666666666668,0.03057716663651167,0.14466666666666667,0.2131355165550932,0.18266666666666667,0.2529401121765877,0.004666666666666667,0.026777637054459923,0.009333333333333334,0.0023520897412701285,0.3455275315119716,0.25876960524547876,0.9000583493877818,2,False,0.8666666666666667,0.84,0.9066666666666666,0.88,14.466666666666667,21.31355165550932,1630.5,1471.0
|
| 45 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C101_0601,covid_positive,1500,344,150,0.2633333333333333,0.6482558139534884,0.034,0.03197674418604651,0.624,0.14825581395348839,0.038,0.09302325581395349,0.008666666666666666,0.0377906976744186,0.032,0.040697674418604654,0.9555348837209303,0.36624864124128725,0.841352458797681,107,False,0.7666666666666667,0.19333333333333333,0.8,0.2866666666666667,62.4,14.825581395348838,1605.0,1309.0
|
| 46 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C101_1101,covid_positive,1500,566,150,0.18466666666666667,0.27385159010600707,0.084,0.04770318021201413,0.638,0.5106007067137809,0.03266666666666666,0.06537102473498234,0.0026666666666666666,0.07420494699646643,0.058,0.028268551236749116,0.38685512367491176,0.8127869412012583,0.8724015859049423,14,False,0.76,0.64,0.8266666666666667,0.6666666666666666,63.800000000000004,51.060070671378085,1672.0,1003.0
|
| 47 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C101_1301,covid_positive,1500,2035,150,0.3413333333333333,0.3154791154791155,0.04066666666666666,0.05110565110565111,0.488,0.4692874692874693,0.028666666666666667,0.057985257985257985,0.004,0.05847665847665848,0.09733333333333333,0.047665847665847666,0.18846846846846843,0.7374984821672163,0.87524884540786,25,False,0.8333333333333334,0.7666666666666667,0.8533333333333334,0.74,48.8,46.928746928746925,1798.5,875.0
|
| 48 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C101_1801,covid_positive,1500,1555,150,0.43066666666666664,0.3562700964630225,0.058,0.3762057877813505,0.3993333333333333,0.12861736334405144,0.021333333333333333,0.03858520900321544,0.0033333333333333335,0.028938906752411574,0.08733333333333333,0.07138263665594856,0.7221264737406216,0.6305738375176237,0.8591045604369766,98,False,0.7866666666666666,0.86,0.78,0.82,39.93333333333333,12.861736334405144,2314.5,806.0
|
| 49 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C101_2001,covid_positive,1500,2130,150,0.354,0.4765258215962441,0.046,0.2051643192488263,0.5146666666666667,0.22253521126760564,0.032,0.05539906103286385,0.004,0.022535211267605635,0.04933333333333333,0.01784037558685446,0.6472488262910798,0.29917206990666134,0.8779529884190502,45,False,0.8133333333333334,0.8933333333333333,0.7933333333333333,0.8666666666666667,51.46666666666667,22.253521126760564,1998.0,882.0
|
| 50 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C101_2502,recovery,1500,587,150,0.18266666666666667,0.424190800681431,0.025333333333333333,0.06132879045996593,0.702,0.3679727427597956,0.034,0.05792163543441227,0.0006666666666666666,0.07836456558773425,0.05533333333333333,0.010221465076660987,0.7582782509937536,0.5063120176111204,0.85650496199362,25,False,0.7066666666666667,0.7666666666666667,0.8,0.74,70.19999999999999,36.79727427597956,2355.0,822.0
|
| 51 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C103_2204,covid_negative,1500,8742,150,0.4646666666666667,0.5037748798901853,0.037333333333333336,0.06394417753374514,0.32066666666666666,0.2772820864790666,0.12733333333333333,0.1261725005719515,0.006666666666666667,0.0263097689315946,0.043333333333333335,0.0025165865934568747,0.1707243193777167,0.23055484626896006,0.8776151424466425,24,False,0.7733333333333333,0.4866666666666667,0.7666666666666667,0.5933333333333334,32.06666666666666,27.728208647906662,1590.0,1718.0
|
| 52 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C104_2204,covid_negative,1500,11388,150,0.5733333333333334,0.29004214963119074,0.042666666666666665,0.03898840885142255,0.14733333333333334,0.4137688795223042,0.21866666666666668,0.18580962416578856,0.0006666666666666666,0.06840533895328416,0.017333333333333333,0.002985598876009835,0.6683484369511766,0.6015953960674094,0.8898842674429477,11,False,0.8466666666666667,0.6066666666666667,0.9133333333333333,0.6533333333333333,14.733333333333334,41.37688795223042,1374.0,1965.5
|
| 53 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C106_2204,covid_negative,1500,9233,150,0.6853333333333333,0.6097693057511101,0.029333333333333333,0.036824434095093686,0.09333333333333334,0.19451965774937724,0.16866666666666666,0.10733239467128777,0.0013333333333333333,0.047980071482725005,0.022,0.003574136250406152,0.3106483266543919,0.3128768301278175,0.8893160700638557,18,False,0.88,0.4266666666666667,0.9133333333333333,0.6733333333333333,9.333333333333334,19.451965774937722,1547.5,1796.0
|
| 54 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C108_2204,covid_negative,1500,1839,150,0.8266666666666667,0.6688417618270799,0.038,0.0032626427406199023,0.07666666666666666,0.03806416530723219,0.04933333333333333,0.25502990755845567,0.0,0.021750951604132682,0.009333333333333334,0.013050570962479609,0.4623295269168026,0.5209086508610423,0.8612649418832932,78,False,0.9133333333333333,0.47333333333333333,0.9066666666666666,0.7933333333333333,7.666666666666666,3.8064165307232187,1915.0,1341.0
|
| 55 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C108_1501,covid_positive,1500,1488,150,0.302,0.2956989247311828,0.021333333333333333,0.016129032258064516,0.6006666666666667,0.21841397849462366,0.04533333333333334,0.41935483870967744,0.005333333333333333,0.04032258064516129,0.025333333333333333,0.010080645161290322,0.8180215053763442,0.6277731013291346,0.8589125982097685,70,False,0.76,0.4066666666666667,0.76,0.5333333333333333,60.06666666666667,21.841397849462364,1554.5,863.0
|
| 56 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C108_1801,covid_positive,1500,806,150,0.31533333333333335,0.2853598014888337,0.035333333333333335,0.07568238213399504,0.5593333333333333,0.08560794044665013,0.04133333333333333,0.47890818858560796,0.008,0.04466501240694789,0.04066666666666666,0.02977667493796526,1.0291778329197685,0.6914805491444265,0.8371837403293109,133,False,0.8266666666666667,0.5133333333333333,0.8733333333333333,0.4866666666666667,55.93333333333334,8.560794044665013,1621.0,676.0
|
| 57 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C108_2201,covid_positive,1500,696,150,0.31866666666666665,0.2988505747126437,0.048666666666666664,0.041666666666666664,0.5126666666666667,0.09195402298850575,0.030666666666666665,0.5100574712643678,0.0026666666666666666,0.021551724137931036,0.08666666666666667,0.035919540229885055,0.996551724137931,0.7372693269726317,0.8455626630318366,107,False,0.7866666666666666,0.32,0.8866666666666667,0.5866666666666667,51.26666666666667,9.195402298850574,1668.0,1399.5
|
| 58 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C113_0605,covid_positive,1500,3274,150,0.112,0.6053756872327428,0.05266666666666667,0.14141722663408673,0.7513333333333333,0.032376298106292,0.016,0.03512522907758094,0.002,0.030849114233353694,0.066,0.1548564447159438,1.4379140704540827,0.5460525974637085,0.8280744837940963,91,False,0.8533333333333334,0.8266666666666667,0.8666666666666667,0.92,75.13333333333333,3.2376298106292003,2830.5,2026.0
|
| 59 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C123_2404,covid_positive,1500,3758,150,0.442,0.5516232038318254,0.037333333333333336,0.04922831293241086,0.21066666666666667,0.08541777541245343,0.16666666666666666,0.271953166577967,0.0006666666666666666,0.032730175625332626,0.14266666666666666,0.009047365620010643,0.5177363846017384,0.3198850599491083,0.87824769514186,36,False,0.7466666666666667,0.6,0.82,0.64,21.066666666666666,8.541777541245343,1184.5,1299.0
|
| 60 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C123_2904,covid_positive,1500,3252,150,0.236,0.49231242312423124,0.056666666666666664,0.07380073800738007,0.5733333333333334,0.19034440344403444,0.04466666666666667,0.22478474784747848,0.004666666666666667,0.01107011070110701,0.08466666666666667,0.007687576875768758,0.9199360393603937,0.1548493916401909,0.8907116717800777,7,False,0.74,0.6733333333333333,0.76,0.78,57.333333333333336,19.034440344403443,2240.0,1489.0
|
| 61 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C123_0505,covid_positive,1500,2266,150,0.11,0.4854368932038835,0.036,0.05383936451897617,0.7933333333333333,0.27184466019417475,0.020666666666666667,0.13901147396293026,0.004,0.025154457193292144,0.036,0.02471315092674316,1.065551044424831,0.2265674044866473,0.8683497181147982,26,False,0.7333333333333333,0.5466666666666666,0.7466666666666667,0.7266666666666667,79.33333333333333,27.184466019417474,2140.5,1849.0
|
| 62 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C124_2404,covid_positive,1500,2290,150,0.132,0.5100436681222708,0.042,0.18777292576419213,0.746,0.08340611353711791,0.028666666666666667,0.19519650655021833,0.0013333333333333333,0.017903930131004366,0.05,0.005676855895196507,1.4138340611353712,0.2180274260105741,0.8329953169285105,104,False,0.6733333333333333,0.3933333333333333,0.62,0.5666666666666667,74.6,8.340611353711791,1503.5,1635.0
|
| 63 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C124_2704,covid_positive,1500,4137,150,0.214,0.5112400290065264,0.04533333333333334,0.11965192168237854,0.6446666666666667,0.06961566352429296,0.02266666666666667,0.27870437515107566,0.004666666666666667,0.015711868503746677,0.06866666666666667,0.005076142131979695,1.2772830553541215,0.2511938768171729,0.846246965413222,92,False,0.7333333333333333,0.3466666666666667,0.7733333333333333,0.38666666666666666,64.46666666666667,6.961566352429297,1682.0,1328.0
|
| 64 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C124_0105,covid_positive,1500,5245,150,0.3626666666666667,0.5548141086749285,0.023333333333333334,0.07740705433746425,0.4673333333333333,0.06444232602478552,0.06533333333333333,0.25681601525262154,0.0026666666666666666,0.041182078169685415,0.07866666666666666,0.005338417540514776,0.9524385128693994,0.31481242307974516,0.8565567271780873,72,False,0.7866666666666666,0.48,0.8066666666666666,0.64,46.733333333333334,6.444232602478552,1552.5,1944.0
|
| 65 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C126_2504,covid_positive,1500,8159,150,0.604,0.5618335580340728,0.09733333333333333,0.056992278465498224,0.19733333333333333,0.2332393675695551,0.054,0.11177840421620297,0.005333333333333333,0.028925113371736734,0.042,0.0072312783429341835,0.2345524369816563,0.2603494332735336,0.8951601089014224,9,False,0.8733333333333333,0.49333333333333335,0.8466666666666667,0.54,19.733333333333334,23.32393675695551,1992.5,1410.0
|
| 66 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C126_3004,covid_positive,1500,7181,150,0.726,0.743629021027712,0.07733333333333334,0.05848767581116836,0.11466666666666667,0.05082857540732488,0.054,0.1211530427517059,0.005333333333333333,0.0181033282272664,0.02266666666666667,0.007798356774822448,0.19510411734670197,0.49756015350471244,0.8894509570970974,30,False,0.8933333333333333,0.5733333333333334,0.9133333333333333,0.7066666666666667,11.466666666666667,5.082857540732489,2060.0,1641.0
|
| 67 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C126_0605,covid_positive,1500,6577,150,0.65,0.5716892200091227,0.07266666666666667,0.11023262885814201,0.08133333333333333,0.08712178804926259,0.18066666666666667,0.16618519081648167,0.0026666666666666666,0.055648471947696516,0.012666666666666666,0.009122700319294512,0.19267244437686892,0.20450342889728762,0.8960192235859163,15,False,0.9,0.62,0.92,0.7,8.133333333333333,8.712178804926259,1715.5,1620.0
|
| 68 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C127_2504,covid_positive,1500,2691,150,0.32,0.6648086213303604,0.06933333333333333,0.10999628390932739,0.49066666666666664,0.03121516164994426,0.043333333333333335,0.18097361575622445,0.002,0.00966183574879227,0.07466666666666667,0.0033444816053511705,1.0615473801560757,0.36079884603870843,0.8456697808395609,134,False,0.7266666666666667,0.5133333333333333,0.7866666666666666,0.78,49.06666666666666,3.121516164994426,1923.0,1559.0
|
| 69 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C127_0405,covid_positive,1500,9080,150,0.4513333333333333,0.4183920704845815,0.06,0.07444933920704846,0.31666666666666665,0.24295154185022028,0.088,0.24295154185022028,0.010666666666666666,0.018502202643171806,0.07333333333333333,0.0027533039647577094,0.3544728340675477,0.2941732061192095,0.8984618824126847,13,False,0.8733333333333333,0.49333333333333335,0.9,0.6933333333333334,31.666666666666664,24.295154185022028,2039.0,1270.0
|
| 70 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C127_1105,covid_positive,1500,5124,150,0.5793333333333334,0.5739656518345043,0.05733333333333333,0.09543325526932084,0.24466666666666667,0.14910226385636222,0.084,0.1649102263856362,0.006,0.01522248243559719,0.028666666666666667,0.001366120218579235,0.2564652615144419,0.15537646115178447,0.8945112794339624,27,False,0.8466666666666667,0.6133333333333333,0.8666666666666667,0.84,24.46666666666667,14.910226385636221,1924.5,1529.5
|
| 71 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C128_2504,covid_positive,1500,4306,150,0.36333333333333334,0.6421272642823966,0.035333333333333335,0.06618671620993961,0.49266666666666664,0.1692986530422666,0.07133333333333333,0.09939619136089178,0.014,0.02275894101254064,0.023333333333333334,0.00023223409196470042,0.6929382257315373,0.2975374112659422,0.883196524157116,41,False,0.7266666666666667,0.4666666666666667,0.78,0.66,49.266666666666666,16.92986530422666,1658.5,1385.5
|
| 72 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C128_0405,covid_positive,1500,4498,150,0.592,0.7550022232103157,0.12133333333333333,0.13361493997332147,0.18,0.053357047576700754,0.08733333333333333,0.048910626945309024,0.0013333333333333333,0.007114273010226767,0.018,0.0020008892841262785,0.3621295390543946,0.5506825877455215,0.8783466507890743,91,False,0.6066666666666667,0.4266666666666667,0.76,0.7133333333333334,18.0,5.335704757670076,1374.5,1437.0
|
| 73 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C128_1105,covid_positive,1500,6655,150,0.6393333333333333,0.7095416979714501,0.03666666666666667,0.04552967693463561,0.23133333333333334,0.15251690458302028,0.06266666666666666,0.05875281743050338,0.0006666666666666666,0.03215627347858753,0.029333333333333333,0.0015026296018031556,0.2211219634360131,0.43567687048564524,0.8854028450665146,41,False,0.8,0.4866666666666667,0.82,0.76,23.133333333333333,15.251690458302027,1588.5,1871.0
|
| 74 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C132_2804,covid_positive,1500,5471,150,0.792,0.7344178395174557,0.08466666666666667,0.13087186985925792,0.07,0.021568269055017363,0.025333333333333333,0.09376713580698227,0.008,0.01772984829098885,0.02,0.0016450374702979345,0.24873770791445815,0.5055208180623455,0.8902606608876875,34,False,0.8,0.8066666666666666,0.8533333333333334,0.8533333333333334,7.000000000000001,2.1568269055017364,1593.0,1362.0
|
| 75 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C132_0205,covid_positive,1500,4671,150,0.7313333333333333,0.6112181545707557,0.07466666666666667,0.11432241490044959,0.13333333333333333,0.08948833226289873,0.037333333333333336,0.13680154142581888,0.004666666666666667,0.046242774566473986,0.018666666666666668,0.0019267822736030828,0.3614001284521515,0.26628528318265066,0.8893619173859404,31,False,0.8666666666666667,0.7533333333333333,0.9,0.8866666666666667,13.333333333333334,8.948833226289873,1617.5,1457.0
|
| 76 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C132_1105,covid_positive,1500,4699,150,0.7866666666666666,0.6814215790593743,0.08866666666666667,0.19472228133645456,0.07266666666666667,0.04618003830602256,0.042666666666666665,0.06873802936795063,0.0013333333333333333,0.007022770802298362,0.008,0.001915301127899553,0.2756328296800738,0.527229120100576,0.8840787501878498,44,False,0.8866666666666667,0.5066666666666667,0.8933333333333333,0.8466666666666667,7.2666666666666675,4.618003830602256,1717.0,1737.0
|
| 77 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C137_3004,covid_negative,1500,4387,150,0.5626666666666666,0.5030772737633918,0.07266666666666667,0.10987007066332345,0.294,0.2227034419876909,0.042666666666666665,0.1395030772737634,0.0033333333333333335,0.019603373603829497,0.024666666666666667,0.005242762708000912,0.3006197097484994,0.11963189510488427,0.8978084235081446,21,False,0.7466666666666667,0.6133333333333333,0.8466666666666667,0.7133333333333334,29.4,22.27034419876909,1480.0,1107.0
|
| 78 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C137_2502,recovery,1500,2012,150,0.3973333333333333,0.5690854870775348,0.04933333333333333,0.17047713717693838,0.5013333333333333,0.12326043737574553,0.015333333333333332,0.11381709741550695,0.005333333333333333,0.003976143141153081,0.03133333333333333,0.019383697813121274,0.7827594433399603,0.25758501614345397,0.8654100820464499,54,False,0.7533333333333333,0.44,0.8066666666666666,0.7933333333333333,50.13333333333333,12.326043737574553,1989.0,1359.5
|
| 79 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C138_3004,covid_negative,1500,1909,150,0.38,0.34468308014667365,0.03866666666666667,0.025144054478784705,0.4593333333333333,0.3609219486642221,0.09133333333333334,0.1959140911471975,0.008,0.06862231534834992,0.02266666666666667,0.004714510214772132,0.33040614632442816,0.5280203456794647,0.8975731488900288,9,False,0.7666666666666667,0.5666666666666667,0.7933333333333333,0.7866666666666666,45.93333333333333,36.09219486642221,1666.0,1398.0
|
| 80 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C138_2301,covid_positive,1500,964,150,0.15733333333333333,0.38278008298755184,0.032,0.0508298755186722,0.738,0.12033195020746888,0.02666666666666667,0.3153526970954357,0.0033333333333333335,0.03734439834024896,0.042666666666666665,0.09336099585062241,1.2353360995850622,0.47023776039422216,0.8540318555241597,50,False,0.7666666666666667,0.32666666666666666,0.7866666666666666,0.4666666666666667,73.8,12.033195020746888,1753.5,1072.0
|
| 81 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C138_3001,covid_positive,1500,731,150,0.2886666666666667,0.12311901504787962,0.15066666666666667,0.08207934336525308,0.386,0.4008207934336525,0.114,0.27359781121751026,0.0013333333333333333,0.02188782489740082,0.059333333333333335,0.09849521203830369,0.4682699498404012,0.8571674196925764,0.8752718536902706,29,False,0.5733333333333334,0.35333333333333333,0.66,0.6066666666666667,38.6,40.08207934336525,1140.0,1223.0
|
| 82 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C138_0202,covid_positive,1500,2861,150,0.21466666666666667,0.2153093324012583,0.09866666666666667,0.0740999650471863,0.5653333333333334,0.5159035302341839,0.05,0.1422579517651171,0.005333333333333333,0.04194337644180356,0.066,0.01048584411045089,0.2590213212163579,0.7283493345710331,0.8946692370492955,19,False,0.86,0.68,0.88,0.7466666666666667,56.53333333333334,51.59035302341839,1896.5,1031.0
|
| 83 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C138_0402,covid_positive,1500,500,150,0.152,0.344,0.03266666666666666,0.074,0.738,0.304,0.030666666666666665,0.202,0.0013333333333333333,0.008,0.04533333333333334,0.068,0.8680000000000001,0.45933978631364336,0.8626864423007148,29,False,0.6733333333333333,0.42,0.7866666666666666,0.82,73.8,30.4,1878.5,1847.5
|
| 84 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C140_3004,covid_negative,1500,3196,150,0.57,0.27252816020025034,0.198,0.3886107634543179,0.15266666666666667,0.12484355444305381,0.026,0.13610763454317898,0.006666666666666667,0.07165206508135169,0.04666666666666667,0.006257822277847309,0.7314075928243636,0.6463126389522823,0.8627577142440171,84,False,0.7333333333333333,0.49333333333333335,0.7333333333333333,0.56,15.266666666666667,12.48435544430538,1243.5,915.5
|
| 85 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C140_2801,covid_positive,1500,226,113,0.21266666666666667,0.26991150442477874,0.076,0.2610619469026549,0.6033333333333334,0.11946902654867257,0.06,0.3230088495575221,0.013333333333333334,0.02654867256637168,0.034666666666666665,0.0,1.037061946902655,0.6183140775252399,0.8540473267734225,104,False,0.6991150442477876,0.3893805309734513,0.6902654867256637,0.584070796460177,60.333333333333336,11.946902654867257,1436.5,1194.0
|
| 86 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C140_3001,covid_positive,1500,6088,150,0.28,0.12220762155059132,0.144,0.2664257555847569,0.47933333333333333,0.33327858081471745,0.04066666666666666,0.2176412614980289,0.008,0.056504599211563734,0.048,0.003942181340341655,0.6958098992553657,0.802640909664339,0.8867092991374894,43,False,0.7333333333333333,0.52,0.7666666666666667,0.54,47.93333333333333,33.327858081471746,1508.5,925.0
|
| 87 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C140_0202,covid_positive,1500,3567,150,0.48133333333333334,0.2612839921502663,0.13,0.29072049341183065,0.2906666666666667,0.16232127838519764,0.03666666666666667,0.2321278385197645,0.014666666666666666,0.04513596860106532,0.04666666666666667,0.008410428931875526,0.7733019343986544,0.5273552598312289,0.8887130183069637,42,False,0.7066666666666667,0.5,0.6933333333333334,0.58,29.06666666666667,16.232127838519762,1334.5,1057.0
|
| 88 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C140_0402,covid_positive,1500,1593,150,0.6126666666666667,0.15065913370998116,0.14266666666666666,0.49466415568110483,0.15,0.0696798493408663,0.046,0.2542372881355932,0.004,0.025109855618330193,0.04466666666666667,0.005649717514124294,1.1626892655367231,0.9479753722382821,0.8603493020276809,113,False,0.7,0.5466666666666666,0.7666666666666667,0.6,15.0,6.96798493408663,1483.5,840.0
|
| 89 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C140_0602,covid_positive,1500,2196,150,0.3973333333333333,0.13479052823315119,0.13066666666666665,0.28734061930783245,0.3466666666666667,0.31785063752276865,0.02666666666666667,0.16939890710382513,0.018,0.08378870673952642,0.08066666666666666,0.006830601092896175,0.7303897996357014,0.7716982567941103,0.8828594083142304,34,False,0.6733333333333333,0.64,0.7066666666666667,0.6066666666666667,34.66666666666667,31.785063752276866,1267.0,902.0
|
| 90 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C140_0902,covid_positive,1500,2211,150,0.488,0.13251922207146088,0.12,0.37403889642695615,0.25066666666666665,0.2618724559023066,0.03266666666666666,0.182722749886929,0.016,0.04296698326549073,0.09266666666666666,0.005879692446856626,0.8845355042966984,0.7781426864095701,0.8753478178520735,75,False,0.5866666666666667,0.5333333333333333,0.62,0.6,25.066666666666666,26.187245590230663,948.5,1221.0
|
| 91 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C140_1103,recovery,1500,1468,150,0.44466666666666665,0.3528610354223433,0.18266666666666667,0.30040871934604907,0.2793333333333333,0.10422343324250681,0.036,0.20299727520435967,0.008,0.027929155313351498,0.04933333333333333,0.011580381471389645,0.6093369663941871,0.45698447370570333,0.8731850551366145,84,False,0.7666666666666667,0.46,0.82,0.6533333333333333,27.933333333333334,10.422343324250681,1505.5,1276.5
|
| 92 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C141_2001,covid_positive,1500,3028,150,0.166,0.3543593130779392,0.028666666666666667,0.014200792602377808,0.6606666666666666,0.35402906208718626,0.04533333333333334,0.10997357992073976,0.006,0.04722589167767503,0.09333333333333334,0.1202113606340819,0.6422069572875384,0.6250609152464633,0.8735966893147925,16,False,0.7666666666666667,0.49333333333333335,0.7933333333333333,0.7,66.06666666666666,35.402906208718626,1952.0,1203.0
|
| 93 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C141_2201,covid_positive,1500,2514,150,0.18133333333333335,0.37748607796340494,0.03266666666666666,0.07438345266507558,0.6326666666666667,0.31145584725536996,0.03333333333333333,0.11177406523468576,0.007333333333333333,0.0588703261734288,0.11266666666666666,0.066030230708035,0.7356945107398568,0.45484109472224443,0.8777004006343609,13,False,0.7266666666666667,0.36666666666666664,0.7466666666666667,0.4866666666666667,63.26666666666667,31.145584725536995,1820.0,892.0
|
| 94 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C141_3001,covid_positive,1500,1237,150,0.18733333333333332,0.3556992724333064,0.04933333333333333,0.116410670978173,0.6553333333333333,0.28698464025869036,0.02666666666666667,0.09215844785772029,0.004666666666666667,0.02263540824575586,0.07666666666666666,0.12611156022635409,0.7366973861492859,0.46858161030005163,0.8783647542143523,34,False,0.7666666666666667,0.66,0.7933333333333333,0.84,65.53333333333333,28.698464025869036,2263.5,1561.0
|
| 95 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C141_0202,covid_positive,1500,1025,150,0.352,0.5629268292682926,0.020666666666666667,0.041951219512195125,0.518,0.15609756097560976,0.04133333333333333,0.18341463414634146,0.0006666666666666666,0.02048780487804878,0.06733333333333333,0.0351219512195122,0.7882276422764227,0.19725128707993503,0.8667151620476534,32,False,0.7333333333333333,0.64,0.7466666666666667,0.7933333333333333,51.800000000000004,15.609756097560975,1662.5,1487.0
|
| 96 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C142_3004,covid_negative,1500,10903,150,0.7273333333333334,0.5483811794918829,0.046,0.10841052921214345,0.06666666666666667,0.1384022746033202,0.13866666666666666,0.17169586352380078,0.0033333333333333335,0.03182610290745666,0.018,0.001284050261395946,0.391336207160109,0.10993152287868031,0.887727496312087,17,False,0.9133333333333333,0.5733333333333334,0.9133333333333333,0.76,6.666666666666667,13.840227460332018,1777.0,1617.0
|
| 97 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C145_3004,covid_negative,1500,743,150,0.73,0.6002691790040376,0.11066666666666666,0.05787348586810229,0.09266666666666666,0.033647375504710635,0.04933333333333333,0.26648721399730824,0.0013333333333333333,0.018842530282637954,0.016,0.02288021534320323,0.4830865859129655,0.40904637916920633,0.8615818769050481,109,False,0.86,0.6266666666666667,0.8866666666666667,0.6666666666666666,9.266666666666666,3.3647375504710633,1631.0,894.0
|
| 98 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C145_0701,covid_positive,1500,1110,150,0.3526666666666667,0.3036036036036036,0.054,0.26306306306306304,0.5046666666666667,0.1963963963963964,0.04666666666666667,0.1972972972972973,0.012666666666666666,0.03063063063063063,0.029333333333333333,0.009009009009009009,0.7553153153153154,0.40826211592305217,0.8655224228552303,84,False,0.7866666666666666,0.3333333333333333,0.8066666666666666,0.38,50.46666666666667,19.63963963963964,1787.5,848.5
|
| 99 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C145_1201,covid_positive,1500,347,150,0.46,0.207492795389049,0.07666666666666666,0.5504322766570605,0.356,0.0345821325648415,0.064,0.14697406340057637,0.006,0.02881844380403458,0.037333333333333336,0.03170028818443804,1.1591162343900097,0.9088402398068922,0.813707822550585,153,False,0.74,0.30666666666666664,0.78,0.25333333333333335,35.6,3.45821325648415,1804.5,627.0
|
| 100 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C145_1401,covid_positive,1500,1060,150,0.4786666666666667,0.2169811320754717,0.144,0.2650943396226415,0.128,0.22641509433962265,0.19866666666666666,0.24716981132075472,0.0006666666666666666,0.016037735849056604,0.05,0.02830188679245283,0.5667672955974844,0.6006937140099664,0.8659286128532259,93,False,0.6466666666666666,0.32,0.7666666666666667,0.47333333333333333,12.8,22.641509433962266,1338.0,861.0
|
| 101 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C145_1901,covid_positive,1500,1173,150,0.2733333333333333,0.32821824381926684,0.10066666666666667,0.24296675191815856,0.508,0.216538789428815,0.06066666666666667,0.16112531969309463,0.004,0.0247229326513214,0.05333333333333334,0.026427962489343565,0.6367331628303496,0.37541090702821167,0.8705164876193893,41,False,0.7666666666666667,0.6466666666666666,0.8533333333333334,0.6533333333333333,50.8,21.653878942881498,1694.0,1148.0
|
| 102 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C145_2301,covid_positive,1500,958,150,0.33466666666666667,0.5198329853862212,0.068,0.1638830897703549,0.482,0.10334029227557412,0.06733333333333333,0.1826722338204593,0.004,0.009394572025052192,0.044,0.020876826722338204,0.8035657620041753,0.1768956965532666,0.8664577845442014,63,False,0.7866666666666666,0.46,0.8066666666666666,0.64,48.199999999999996,10.334029227557412,1670.5,1421.0
|
| 103 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C146_3004,covid_negative,1500,2608,150,0.734,0.7346625766871165,0.034666666666666665,0.049079754601226995,0.09866666666666667,0.125,0.12133333333333333,0.05253067484662577,0.0026666666666666666,0.03450920245398773,0.008666666666666666,0.004217791411042945,0.14650306748466257,0.49491463253360723,0.8917413998498888,10,False,0.9,0.8733333333333333,0.94,0.8466666666666667,9.866666666666667,12.5,1582.5,845.5
|
| 104 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C146_1201,covid_positive,1500,3205,150,0.41333333333333333,0.5691107644305772,0.027333333333333334,0.10452418096723869,0.4573333333333333,0.2343213728549142,0.068,0.05585023400936037,0.013333333333333334,0.027769110764430577,0.020666666666666667,0.008424336973478939,0.49480811232449295,0.2838086230577918,0.8850799214515492,42,False,0.82,0.37333333333333335,0.84,0.38666666666666666,45.733333333333334,23.432137285491418,1701.5,854.0
|
| 105 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C146_1401,covid_positive,1500,1733,150,0.6266666666666667,0.6641661858049625,0.016666666666666666,0.09001731102135026,0.2613333333333333,0.14945181765724178,0.07666666666666666,0.06520484708597807,0.008666666666666666,0.029428736295441432,0.01,0.0017311021350259665,0.26322446624350826,0.3462518852424742,0.8871272253895843,23,False,0.7533333333333333,0.5866666666666667,0.8266666666666667,0.52,26.13333333333333,14.945181765724177,1567.0,758.0
|
| 106 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C146_1601,covid_positive,1500,363,150,0.24733333333333332,0.4573002754820937,0.03266666666666666,0.2975206611570248,0.6233333333333333,0.06336088154269973,0.054,0.1322314049586777,0.009333333333333334,0.0440771349862259,0.03333333333333333,0.005509641873278237,1.1755922865013773,0.38438686812923534,0.8077365657772453,152,False,0.8066666666666666,0.37333333333333335,0.8733333333333333,0.3,62.33333333333333,6.336088154269973,1677.5,577.0
|
| 107 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C146_1901,covid_positive,1500,2803,150,0.5433333333333333,0.708169818052087,0.02266666666666667,0.13877987870139136,0.30733333333333335,0.06814127720299679,0.10266666666666667,0.06778451658936853,0.004,0.00856225472707813,0.02,0.00856225472707813,0.571023902961113,0.4743586223633906,0.8665586836816196,64,False,0.7333333333333333,0.3466666666666667,0.8266666666666667,0.36666666666666664,30.733333333333334,6.814127720299679,1395.5,820.0
|
| 108 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C146_2301,covid_positive,1500,1330,150,0.43733333333333335,0.649624060150376,0.06,0.13458646616541353,0.166,0.0518796992481203,0.30733333333333335,0.1443609022556391,0.0,0.006015037593984963,0.029333333333333333,0.013533834586466165,0.5857844611528822,0.34888028148801287,0.8627192839402053,78,False,0.6333333333333333,0.29333333333333333,0.72,0.4266666666666667,16.6,5.18796992481203,1114.0,953.5
|
| 109 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C146_2701,covid_positive,1500,1109,150,0.18066666666666667,0.4211000901713255,0.148,0.16050495942290352,0.582,0.3155996393146979,0.037333333333333336,0.06492335437330929,0.005333333333333333,0.019837691614066726,0.04666666666666667,0.018034265103697024,0.5900655244965434,0.3804961133507021,0.8909591257486186,16,False,0.7933333333333333,0.6666666666666666,0.82,0.8466666666666667,58.199999999999996,31.55996393146979,2060.0,1485.0
|
| 110 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C146_2502,recovery,1500,5129,150,0.754,0.71475921232209,0.020666666666666667,0.04679274712419575,0.084,0.14837200233963735,0.124,0.06336517839734841,0.0006666666666666666,0.01852212906999415,0.016666666666666666,0.008188730746734256,0.21670709040098785,0.4474379382767293,0.8934994615744821,6,False,0.8666666666666667,0.7266666666666667,0.8866666666666667,0.8066666666666666,8.4,14.837200233963735,1705.0,1290.0
|
| 111 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C147_3004,covid_negative,1500,2048,150,0.63,0.59375,0.10333333333333333,0.1328125,0.15866666666666668,0.109375,0.07666666666666666,0.1259765625,0.004666666666666667,0.0322265625,0.02666666666666667,0.005859375,0.2126979166666667,0.22370774989435227,0.8786051380576869,54,False,0.8133333333333334,0.8066666666666666,0.8733333333333333,0.8533333333333334,15.866666666666667,10.9375,1789.5,1014.0
|
| 112 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C147_1401,covid_positive,1500,2973,150,0.21133333333333335,0.2263706693575513,0.02,0.2472250252270434,0.666,0.3871510258997645,0.051333333333333335,0.110326269761184,0.004,0.02119071644803229,0.04733333333333333,0.007736293306424487,0.6368920282542887,0.696052470846853,0.858787334581348,58,False,0.7933333333333333,0.29333333333333333,0.8133333333333334,0.4,66.60000000000001,38.71510258997645,1823.5,1017.0
|
| 113 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C147_1901,covid_positive,1500,3691,150,0.43533333333333335,0.42021132484421564,0.042666666666666665,0.24735843944730426,0.404,0.04958005960444324,0.06333333333333334,0.21376320780276348,0.006666666666666667,0.006502302898943376,0.048,0.06258466540232999,0.7394126253047956,0.44423714583520624,0.8490738112448235,132,False,0.7733333333333333,0.26666666666666666,0.8,0.38,40.400000000000006,4.958005960444324,1969.5,844.0
|
| 114 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C152_0405,covid_negative,1500,4046,150,0.8426666666666667,0.8826000988630747,0.017333333333333333,0.014335145823035097,0.013333333333333334,0.04572417202174987,0.12133333333333333,0.04745427582797825,0.0006666666666666666,0.009886307464162136,0.004666666666666667,0.0,0.16308782336464,0.7754400808208591,0.8904903187063989,2,False,0.88,0.7866666666666666,0.9066666666666666,0.9,1.3333333333333335,4.572417202174988,1515.0,1464.5
|
| 115 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C161_1105,covid_negative,1500,820,150,0.11866666666666667,0.6743902439024391,0.059333333333333335,0.06341463414634146,0.7033333333333334,0.20853658536585365,0.019333333333333334,0.00975609756097561,0.0033333333333333335,0.03902439024390244,0.096,0.004878048780487805,1.1909918699186994,0.4531345605258982,0.8398467367080781,70,False,0.64,0.48,0.7933333333333333,0.6733333333333333,70.33333333333334,20.853658536585364,1829.5,1665.0
|
| 116 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C164_1105,covid_negative,1500,5983,150,0.78,0.8880160454621427,0.022,0.018051144910579978,0.08666666666666667,0.04579642319906402,0.09733333333333333,0.03359518636135718,0.002,0.010864114992478689,0.012,0.0036770850743774027,0.2337603209092428,0.7863414092318038,0.8875376513090445,18,False,0.8666666666666667,0.78,0.9066666666666666,0.94,8.666666666666668,4.579642319906402,1607.5,1565.0
|
| 117 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C167_1205,covid_negative,1500,9978,150,0.7766666666666666,0.7162758067749048,0.03666666666666667,0.03487672880336741,0.044,0.08819402685909,0.132,0.149929845660453,0.002,0.008719182200841852,0.008666666666666666,0.0020044097013429546,0.13768610944076967,0.4406591339254403,0.8936365883729427,5,False,0.8933333333333333,0.8133333333333334,0.9333333333333333,0.9066666666666666,4.3999999999999995,8.819402685909001,1553.0,1452.0
|
| 118 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C168_1205,covid_negative,1500,2323,150,0.5573333333333333,0.49978476108480413,0.11466666666666667,0.05337925096857512,0.214,0.21437795953508396,0.094,0.16272061988807576,0.006,0.06371071889797675,0.014,0.006026689625484288,0.25361859664227293,0.1658329352655326,0.8958799675604604,26,False,0.8066666666666666,0.8,0.8333333333333334,0.7666666666666667,21.4,21.437795953508395,1530.5,781.0
|
| 119 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C168_2001,covid_positive,1500,2751,150,0.4106666666666667,0.3300617957106507,0.048666666666666664,0.31842966194111233,0.438,0.18684114867320975,0.072,0.11959287531806616,0.006,0.03744093057070156,0.024666666666666667,0.007633587786259542,0.6975936023264269,0.4595903594509014,0.8649347566789155,84,False,0.76,0.26,0.86,0.3,43.8,18.684114867320975,1488.5,945.0
|
| 120 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C168_2301,covid_positive,1500,901,150,0.38533333333333336,0.42730299667036625,0.07266666666666667,0.19200887902330743,0.4266666666666667,0.051054384017758046,0.07733333333333334,0.2885682574916759,0.013333333333333334,0.03551609322974473,0.024666666666666667,0.005549389567147614,0.7894591194968553,0.39790520105397054,0.8605010275131924,131,False,0.7333333333333333,0.41333333333333333,0.7866666666666666,0.4666666666666667,42.66666666666667,5.105438401775805,1583.0,853.0
|
| 121 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C168_3001,covid_positive,1500,1160,150,0.25666666666666665,0.3931034482758621,0.07066666666666667,0.10775862068965517,0.5753333333333334,0.28706896551724137,0.058,0.1310344827586207,0.0033333333333333335,0.06810344827586207,0.036,0.01293103448275862,0.6226666666666667,0.32000040598561813,0.8926617552367613,21,False,0.8066666666666666,0.8066666666666666,0.7733333333333333,0.76,57.53333333333334,28.706896551724135,1729.0,837.0
|
| 122 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C168_0202,covid_positive,1500,651,150,0.46266666666666667,0.2903225806451613,0.10133333333333333,0.18125960061443933,0.324,0.3302611367127496,0.082,0.09984639016897082,0.006,0.09831029185867896,0.024,0.0,0.39268817204301076,0.5938289354525899,0.8824402414106268,87,False,0.8,0.7266666666666667,0.8066666666666666,0.6866666666666666,32.4,33.026113671274956,1671.5,670.0
|
| 123 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C168_0403,recovery,1500,2526,150,0.398,0.29493269992082344,0.050666666666666665,0.08036421219319081,0.44666666666666666,0.4398258115597783,0.06066666666666667,0.1421219319081552,0.010666666666666666,0.0344418052256532,0.03333333333333333,0.00831353919239905,0.26985589865399845,0.5581908119702741,0.895608519670794,11,False,0.8066666666666666,0.6933333333333334,0.8533333333333334,0.76,44.666666666666664,43.982581155977826,1844.0,1080.0
|
| 124 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C169_1205,covid_negative,1500,1252,150,0.5246666666666666,0.444888178913738,0.062,0.11421725239616613,0.2613333333333333,0.15175718849840256,0.08666666666666667,0.2340255591054313,0.005333333333333333,0.031150159744408944,0.06,0.023961661341853034,0.45078594249201276,0.15223327472556483,0.8794717025973198,34,False,0.8266666666666667,0.7866666666666666,0.8533333333333334,0.82,26.13333333333333,15.175718849840255,1903.0,1000.0
|
| 125 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C169_2001,covid_positive,1500,755,150,0.6293333333333333,0.5814569536423841,0.036,0.1827814569536424,0.218,0.052980132450331126,0.08733333333333333,0.14437086092715232,0.0026666666666666666,0.030463576158940398,0.02666666666666667,0.007947019867549669,0.4632317880794701,0.29768533533541947,0.8406000294471252,130,False,0.74,0.35333333333333333,0.8133333333333334,0.25333333333333335,21.8,5.298013245033113,1442.0,586.0
|
| 126 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C169_2301,covid_positive,1500,3773,150,0.5893333333333334,0.5139146567717996,0.046,0.08666843360720912,0.24866666666666667,0.04320169626292075,0.066,0.31221839385104694,0.008666666666666666,0.028624436787702094,0.04133333333333333,0.015372382719321495,0.613689195158583,0.3238790347253354,0.8722660829456662,96,False,0.8333333333333334,0.37333333333333335,0.8533333333333334,0.49333333333333335,24.866666666666667,4.320169626292075,1936.5,886.0
|
| 127 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C169_0202,covid_positive,1500,1286,150,0.7006666666666667,0.5256609642301711,0.06933333333333333,0.14774494556765164,0.07,0.14074650077760498,0.13266666666666665,0.12052877138413685,0.0026666666666666666,0.04821150855365474,0.024666666666666667,0.017107309486780714,0.3894059097978227,0.15711851398724597,0.8842621483872131,32,False,0.86,0.84,0.8666666666666667,0.8066666666666666,7.000000000000001,14.074650077760499,1672.5,841.0
|
| 128 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C169_0403,recovery,1500,4368,150,0.7686666666666667,0.5057234432234432,0.072,0.1201923076923077,0.04466666666666667,0.12248168498168498,0.086,0.21268315018315018,0.0,0.023351648351648352,0.028666666666666667,0.015567765567765568,0.5520842490842491,0.11155685954848588,0.8734818170479045,53,False,0.9,0.56,0.9266666666666666,0.6933333333333334,4.466666666666667,12.248168498168498,1858.0,992.0
|
| 129 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C170_1205,covid_negative,1500,953,150,0.6853333333333333,0.5204616998950682,0.028,0.02098635886673662,0.07533333333333334,0.21720881427072403,0.20133333333333334,0.19832109129066108,0.0013333333333333333,0.03882476390346275,0.008666666666666666,0.004197271773347324,0.35873382301504025,0.22143452316734474,0.8801245541926414,61,False,0.9133333333333333,0.8133333333333334,0.9333333333333333,0.7866666666666666,7.533333333333333,21.720881427072403,1575.0,736.0
|
| 130 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C170_2301,covid_positive,1500,1055,150,0.6193333333333333,0.4199052132701422,0.026,0.0947867298578199,0.23133333333333334,0.07109004739336493,0.08133333333333333,0.37156398104265403,0.01,0.03981042654028436,0.032,0.002843601895734597,0.7776556082148499,0.43142506766774563,0.853105736508812,149,False,0.7666666666666667,0.4533333333333333,0.8266666666666667,0.41333333333333333,23.133333333333333,7.109004739336493,1988.0,548.0
|
| 131 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C170_0202,covid_positive,1500,5621,150,0.7866666666666666,0.4090019569471624,0.04733333333333333,0.10745418964597046,0.07333333333333333,0.13271659847002312,0.07933333333333334,0.26845756982743285,0.0013333333333333333,0.07987902508450453,0.012,0.0024906600249066002,0.7743480993891952,0.3053494423257437,0.8795234908520272,68,False,0.9,0.74,0.9333333333333333,0.6733333333333333,7.333333333333333,13.271659847002311,1832.5,840.0
|
| 132 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C170_0402,covid_positive,1500,808,150,0.764,0.5742574257425742,0.024666666666666667,0.054455445544554455,0.056,0.017326732673267328,0.13466666666666666,0.3193069306930693,0.002,0.03094059405940594,0.018666666666666668,0.0037128712871287127,0.48673927392739275,0.46360567902963296,0.8619022064810525,92,False,0.8666666666666667,0.5733333333333334,0.9133333333333333,0.6333333333333333,5.6000000000000005,1.7326732673267329,1724.0,907.0
|
| 133 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C170_0403,recovery,1500,3745,150,0.7086666666666667,0.6101468624833111,0.023333333333333334,0.015487316421895861,0.03933333333333333,0.06809078771695594,0.21866666666666668,0.2809078771695594,0.0013333333333333333,0.021628838451268357,0.008666666666666666,0.003738317757009346,0.22258834000890074,0.4565486308105643,0.8882014132076593,25,False,0.9666666666666667,0.4666666666666667,0.9666666666666667,0.64,3.933333333333333,6.809078771695594,1765.5,984.0
|
| 134 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C187_2605,covid_negative,1500,1867,150,0.384,0.129084092126406,0.032,0.04124263524370648,0.3993333333333333,0.5243706480985538,0.13,0.11355115158007499,0.007333333333333333,0.17621853240492769,0.04733333333333333,0.015532940546331012,0.6063302981610427,1.0139205985390403,0.9000441621343966,9,False,0.8533333333333334,0.8466666666666667,0.88,0.8133333333333334,39.93333333333333,52.437064809855386,1774.5,783.0
|
| 135 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C187_1201,covid_positive,1500,1985,150,0.122,0.05994962216624685,0.025333333333333333,0.02518891687657431,0.7273333333333334,0.23425692695214106,0.059333333333333335,0.6392947103274559,0.008666666666666666,0.031234256926952142,0.05733333333333333,0.010075566750629723,1.2050579345088162,1.104027839607859,0.8606235919001681,54,False,0.7533333333333333,0.48,0.84,0.44,72.73333333333333,23.425692695214106,1875.5,706.0
|
| 136 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C187_1401,covid_positive,1500,3155,150,0.164,0.10998415213946117,0.02,0.041521394611727415,0.7106666666666667,0.22060221870047544,0.05533333333333333,0.5670364500792393,0.009333333333333334,0.04659270998415214,0.04066666666666666,0.014263074484944533,1.1409677760169044,0.9630876751036153,0.8689843116853789,23,False,0.7666666666666667,0.6333333333333333,0.82,0.6466666666666666,71.06666666666666,22.060221870047545,1586.0,671.0
|
| 137 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C187_1901,covid_positive,1500,1966,150,0.23933333333333334,0.08748728382502544,0.03866666666666667,0.07019328585961343,0.6173333333333333,0.1958290946083418,0.064,0.5635808748728383,0.002,0.049338758901322485,0.03866666666666667,0.0335707019328586,1.156892505934215,0.9507376292367147,0.8622834628558864,42,False,0.6733333333333333,0.5866666666666667,0.76,0.64,61.73333333333333,19.58290946083418,1493.5,904.5
|
| 138 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C187_2301,covid_positive,1500,529,150,0.18933333333333333,0.16446124763705103,0.024,0.17391304347826086,0.6613333333333333,0.06994328922495274,0.06333333333333334,0.5311909262759924,0.0013333333333333333,0.03780718336483932,0.06066666666666667,0.022684310018903593,1.3084889729048519,0.886363356674395,0.8132486190174147,133,False,0.7866666666666666,0.66,0.8333333333333334,0.6466666666666666,66.13333333333333,6.994328922495274,1738.5,695.0
|
| 139 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C187_2502,recovery,1500,5693,150,0.43,0.284559985947655,0.04133333333333333,0.018443702792903565,0.4013333333333333,0.2466186544879677,0.07,0.39030388196030213,0.006666666666666667,0.04268399789214825,0.050666666666666665,0.017389776919023364,0.7126424263715674,0.6600913911248751,0.8852613497900416,27,False,0.7733333333333333,0.6666666666666666,0.8333333333333334,0.6866666666666666,40.13333333333333,24.661865448796767,2010.5,985.0
|
| 140 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C190_2605,covid_negative,1500,1791,150,0.148,0.04578447794528197,0.037333333333333336,0.0893355667225014,0.7226666666666667,0.4712451144611949,0.043333333333333335,0.3405918481295366,0.006,0.0413176996091569,0.042666666666666665,0.011725293132328308,0.7691568955890563,1.0015556678724205,0.8831479800000678,6,False,0.7666666666666667,0.6333333333333333,0.7666666666666667,0.6733333333333333,72.26666666666667,47.124511446119485,2153.5,1186.0
|
| 141 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C190_2901,covid_positive,1500,1527,150,0.12,0.0412573673870334,0.15,0.3798297314996726,0.6406666666666667,0.3700065487884741,0.03266666666666666,0.16110019646365423,0.017333333333333333,0.04191224623444663,0.03933333333333333,0.005893909626719057,0.765684348395547,0.9933407123646675,0.8849834908819714,24,False,0.7933333333333333,0.7466666666666667,0.7733333333333333,0.7466666666666667,64.06666666666668,37.00065487884741,2512.0,1198.0
|
| 142 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C190_0102,covid_positive,1500,4868,150,0.19733333333333333,0.03594905505341003,0.30666666666666664,0.3769515201314708,0.336,0.33340180772391126,0.10266666666666667,0.20336894001643385,0.0033333333333333335,0.042317173377156944,0.054,0.00801150369761709,0.4199419337167899,0.9830900367886798,0.8983938323875431,7,False,0.7666666666666667,0.76,0.8133333333333334,0.72,33.6,33.34018077239113,1647.5,1038.0
|
| 143 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C190_0302,covid_positive,1500,2220,150,0.218,0.11576576576576576,0.5073333333333333,0.3342342342342342,0.21533333333333332,0.3045045045045045,0.032,0.20315315315315316,0.004,0.03333333333333333,0.023333333333333334,0.009009009009009009,0.5793153153153153,0.8214616047411845,0.8971201449854679,7,False,0.74,0.76,0.7666666666666667,0.8533333333333334,21.53333333333333,30.45045045045045,1603.0,1175.5
|
| 144 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C190_0502,covid_positive,1500,2030,150,0.272,0.05172413793103448,0.35333333333333333,0.24778325123152709,0.2713333333333333,0.5167487684729064,0.05333333333333334,0.10541871921182266,0.006666666666666667,0.07389162561576355,0.043333333333333335,0.004433497536945813,0.7294515599343186,1.0866909499598747,0.9010908812438749,7,False,0.7666666666666667,0.94,0.8066666666666666,0.7866666666666666,27.133333333333333,51.67487684729064,1551.0,799.0
|
| 145 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C190_0802,covid_positive,1500,1447,150,0.17533333333333334,0.038700760193503804,0.2906666666666667,0.2156185210780926,0.424,0.5929509329647547,0.056,0.0912232204561161,0.014,0.05459571527297857,0.04,0.006910850034554251,0.4895397373876987,1.1361739979511323,0.9062521432347742,8,False,0.7466666666666667,0.8533333333333334,0.7266666666666667,0.8066666666666666,42.4,59.295093296475464,1690.0,854.0
|
| 146 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C190_1002,covid_positive,1500,4052,150,0.182,0.044669299111549855,0.17866666666666667,0.12043435340572557,0.522,0.6414116485686081,0.042666666666666665,0.12709772951628825,0.009333333333333334,0.06071076011846002,0.06533333333333333,0.005676209279368213,0.5104402764067127,1.054957183505068,0.9147137746163635,1,True,0.7933333333333333,0.9266666666666666,0.8333333333333334,0.8533333333333334,52.2,64.14116485686081,1835.5,994.0
|
| 147 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C190_0903,recovery,1500,1371,150,0.362,0.0962800875273523,0.11266666666666666,0.24288840262582057,0.37533333333333335,0.4062727935813275,0.11866666666666667,0.1560904449307075,0.0026666666666666666,0.07221006564551423,0.028666666666666667,0.0262582056892779,0.5362567469000729,0.8758868530865975,0.8863937386082325,11,False,0.8066666666666666,0.7333333333333333,0.7666666666666667,0.6133333333333333,37.53333333333334,40.62727935813275,1635.5,998.0
|
| 148 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C193_2605,covid_negative,1500,5566,150,0.4846666666666667,0.40837226015091627,0.038,0.03557312252964427,0.336,0.34441250449155586,0.08533333333333333,0.17714696370822852,0.006666666666666667,0.02982393100970176,0.04933333333333333,0.004671218109953288,0.24676679841897228,0.3678845402221646,0.9044016717856702,1,True,0.8266666666666667,0.78,0.8466666666666667,0.8266666666666667,33.6,34.44125044915559,1773.5,2119.5
|
| 149 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C195_2605,covid_negative,1500,7759,150,0.7446666666666667,0.5532929501224385,0.018,0.038407011212785155,0.046,0.08815569016625854,0.18533333333333332,0.3107359195772651,0.0013333333333333333,0.008248485629591443,0.004666666666666667,0.0011599432916612965,0.38976087983846713,0.3966356083186975,0.8988646610139306,1,True,0.96,0.9,0.9333333333333333,0.94,4.6,8.815569016625854,1596.0,1513.0
|
| 150 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C197_2605,covid_negative,1500,2835,150,0.574,0.6052910052910053,0.027333333333333334,0.13015873015873017,0.32666666666666666,0.1347442680776014,0.048666666666666664,0.08677248677248678,0.008,0.01869488536155203,0.015333333333333332,0.02433862433862434,0.3838447971781306,0.25943326779757336,0.8804336742108251,45,False,0.9133333333333333,0.6933333333333334,0.94,0.9133333333333333,32.666666666666664,13.474426807760139,2253.5,1812.0
|
| 151 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C212_2705,covid_negative,1500,1150,150,0.5913333333333334,0.5417391304347826,0.068,0.0817391304347826,0.15266666666666667,0.15478260869565216,0.17133333333333334,0.18869565217391304,0.004666666666666667,0.026956521739130435,0.012,0.00608695652173913,0.1110144927536232,0.12773468943038657,0.9024002828039634,6,False,0.8266666666666667,0.7,0.88,0.9,15.266666666666667,15.478260869565217,1760.5,1861.5
|
| 152 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C214_2705,covid_negative,1500,6279,150,0.6206666666666667,0.3494186972447842,0.07266666666666667,0.08138238573021182,0.21733333333333332,0.3817486860965122,0.042666666666666665,0.14667940754897277,0.0033333333333333335,0.03567447045707915,0.043333333333333335,0.005096352922439879,0.6189698996655518,0.4386856288973712,0.8933062184592485,4,False,0.86,0.6666666666666666,0.9133333333333333,0.6266666666666667,21.73333333333333,38.17486860965122,2051.0,1795.0
|
| 153 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C234_2805,covid_negative,1500,9882,150,0.6786666666666666,0.609492005666869,0.059333333333333335,0.08429467719085205,0.16266666666666665,0.16636308439587127,0.07933333333333334,0.12001619105444242,0.002,0.016798218984011334,0.018,0.0030358227079538553,0.16827767658368753,0.22572250861824003,0.9135599483212066,1,True,0.8933333333333333,0.8466666666666667,0.8866666666666667,0.9133333333333333,16.266666666666666,16.63630843958713,1906.0,1650.0
|
| 154 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C237_2805,covid_negative,1500,5071,150,0.436,0.5912048905541314,0.066,0.08913429303884836,0.386,0.15519621376454348,0.07266666666666667,0.14789982252021297,0.004,0.014198382961940446,0.035333333333333335,0.0023663971603234074,0.5275414448169329,0.1889138281990117,0.8940585086455446,8,False,0.7866666666666666,0.8133333333333334,0.8266666666666667,0.82,38.6,15.519621376454348,1864.0,1379.0
|
| 155 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C238_2905,covid_negative,1500,7843,150,0.5586666666666666,0.8912405967104424,0.04066666666666666,0.034298100216753794,0.30866666666666664,0.03735815376769094,0.06,0.023842917251051893,0.0033333333333333335,0.010455182965701899,0.028666666666666667,0.002805049088359046,0.6793915593522887,0.7928318521290224,0.8737644306703679,60,False,0.8933333333333333,0.56,0.9,0.7866666666666666,30.866666666666664,3.735815376769094,2058.5,1738.0
|
| 156 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C240_2905,covid_negative,1500,2346,150,0.5873333333333334,0.5524296675191815,0.03666666666666667,0.03836317135549872,0.196,0.20588235294117646,0.14666666666666667,0.18584825234441602,0.008,0.014919011082693947,0.025333333333333333,0.0025575447570332483,0.11535890878090373,0.21742860567739122,0.895432800951669,16,False,0.8533333333333334,0.5866666666666667,0.86,0.76,19.6,20.588235294117645,1763.0,1652.5
|
| 157 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C246_2905,covid_negative,1500,769,150,0.7506666666666667,0.7451235370611183,0.015333333333333332,0.013003901170351105,0.04933333333333333,0.08972691807542263,0.17666666666666667,0.13394018205461639,0.0013333333333333333,0.015604681404421327,0.006666666666666667,0.002600780234070221,0.1093298656263546,0.4987244371938444,0.8834339841135237,20,False,0.9066666666666666,0.5933333333333334,0.92,0.8133333333333334,4.933333333333334,8.972691807542263,1631.0,1382.0
|
| 158 |
+
locoL_fullsat_s40000_K1000,C251_2905,covid_negative,1500,2117,150,0.73,0.8304204062352385,0.056,0.07510628247520075,0.10533333333333333,0.03306565895134624,0.09,0.05054322153991497,0.004666666666666667,0.007085498346717053,0.014,0.003778932451582428,0.2438910407809793,0.6704117251468811,0.8777870019600914,29,False,0.7933333333333333,0.3933333333333333,0.8266666666666667,0.78,10.533333333333333,3.306565895134624,1715.5,2293.0
|
paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20261003T103040Z-crosscohort-k1000-saturation/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_crosscohort_20261002/scores/imperial_eskd/locoL_fullsat_s40000_K1000/summary.json
ADDED
|
@@ -0,0 +1,1063 @@
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 1 |
+
{
|
| 2 |
+
"schema": "paired_ft_scores.v1",
|
| 3 |
+
"dataset": "imperial_eskd",
|
| 4 |
+
"written_utc": "2026-10-03T09:23:17.982315+00:00",
|
| 5 |
+
"command": [
|
| 6 |
+
"/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/tools/score_ft.py",
|
| 7 |
+
"--dataset",
|
| 8 |
+
"imperial_eskd",
|
| 9 |
+
"--threads",
|
| 10 |
+
"8",
|
| 11 |
+
"--donors",
|
| 12 |
+
"/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_crosscohort_20261002/data/imperial_eskd/usable_samples.txt",
|
| 13 |
+
"--arm",
|
| 14 |
+
"locoL_fullsat_s40000_K1000=/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_crosscohort_20261002/generated/imperial_eskd/hoL_imperial_eskd/K1000_fullsat_s40000.npz",
|
| 15 |
+
"--case-groups",
|
| 16 |
+
"covid_positive",
|
| 17 |
+
"--control-groups",
|
| 18 |
+
"covid_negative",
|
| 19 |
+
"--out",
|
| 20 |
+
"/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_crosscohort_20261002/scores/imperial_eskd/locoL_fullsat_s40000_K1000"
|
| 21 |
+
],
|
| 22 |
+
"arms": [
|
| 23 |
+
"locoL_fullsat_s40000_K1000"
|
| 24 |
+
],
|
| 25 |
+
"donors": [
|
| 26 |
+
"C20_1004",
|
| 27 |
+
"C20_1404",
|
| 28 |
+
"C21_1004",
|
| 29 |
+
"C21_1704",
|
| 30 |
+
"C21_2504",
|
| 31 |
+
"C23_2204",
|
| 32 |
+
"C31_1304",
|
| 33 |
+
"C31_2004",
|
| 34 |
+
"C31_2704",
|
| 35 |
+
"C33_1401",
|
| 36 |
+
"C33_1601",
|
| 37 |
+
"C33_1901",
|
| 38 |
+
"C34_1404",
|
| 39 |
+
"C34_2104",
|
| 40 |
+
"C34_2504",
|
| 41 |
+
"C36_1504",
|
| 42 |
+
"C36_1704",
|
| 43 |
+
"C36_2104",
|
| 44 |
+
"C40_1504",
|
| 45 |
+
"C40_2204",
|
| 46 |
+
"C40_0105",
|
| 47 |
+
"C42_1504",
|
| 48 |
+
"C42_2204",
|
| 49 |
+
"C42_2704",
|
| 50 |
+
"C58_1604",
|
| 51 |
+
"C58_2501",
|
| 52 |
+
"C58_2901",
|
| 53 |
+
"C58_0102",
|
| 54 |
+
"C58_0402",
|
| 55 |
+
"C58_1003",
|
| 56 |
+
"C60_2504",
|
| 57 |
+
"C63_1704",
|
| 58 |
+
"C63_2404",
|
| 59 |
+
"C63_2904",
|
| 60 |
+
"C65_1704",
|
| 61 |
+
"C65_2104",
|
| 62 |
+
"C65_2504",
|
| 63 |
+
"C69_1804",
|
| 64 |
+
"C82_2504",
|
| 65 |
+
"C85_2004",
|
| 66 |
+
"C93_2104",
|
| 67 |
+
"C93_2704",
|
| 68 |
+
"C93_0405",
|
| 69 |
+
"C101_0601",
|
| 70 |
+
"C101_1101",
|
| 71 |
+
"C101_1301",
|
| 72 |
+
"C101_1801",
|
| 73 |
+
"C101_2001",
|
| 74 |
+
"C101_2502",
|
| 75 |
+
"C103_2204",
|
| 76 |
+
"C104_2204",
|
| 77 |
+
"C106_2204",
|
| 78 |
+
"C108_2204",
|
| 79 |
+
"C108_1501",
|
| 80 |
+
"C108_1801",
|
| 81 |
+
"C108_2201",
|
| 82 |
+
"C113_0605",
|
| 83 |
+
"C123_2404",
|
| 84 |
+
"C123_2904",
|
| 85 |
+
"C123_0505",
|
| 86 |
+
"C124_2404",
|
| 87 |
+
"C124_2704",
|
| 88 |
+
"C124_0105",
|
| 89 |
+
"C126_2504",
|
| 90 |
+
"C126_3004",
|
| 91 |
+
"C126_0605",
|
| 92 |
+
"C127_2504",
|
| 93 |
+
"C127_0405",
|
| 94 |
+
"C127_1105",
|
| 95 |
+
"C128_2504",
|
| 96 |
+
"C128_0405",
|
| 97 |
+
"C128_1105",
|
| 98 |
+
"C132_2804",
|
| 99 |
+
"C132_0205",
|
| 100 |
+
"C132_1105",
|
| 101 |
+
"C137_3004",
|
| 102 |
+
"C137_2502",
|
| 103 |
+
"C138_3004",
|
| 104 |
+
"C138_2301",
|
| 105 |
+
"C138_3001",
|
| 106 |
+
"C138_0202",
|
| 107 |
+
"C138_0402",
|
| 108 |
+
"C140_3004",
|
| 109 |
+
"C140_2801",
|
| 110 |
+
"C140_3001",
|
| 111 |
+
"C140_0202",
|
| 112 |
+
"C140_0402",
|
| 113 |
+
"C140_0602",
|
| 114 |
+
"C140_0902",
|
| 115 |
+
"C140_1103",
|
| 116 |
+
"C141_2001",
|
| 117 |
+
"C141_2201",
|
| 118 |
+
"C141_3001",
|
| 119 |
+
"C141_0202",
|
| 120 |
+
"C142_3004",
|
| 121 |
+
"C145_3004",
|
| 122 |
+
"C145_0701",
|
| 123 |
+
"C145_1201",
|
| 124 |
+
"C145_1401",
|
| 125 |
+
"C145_1901",
|
| 126 |
+
"C145_2301",
|
| 127 |
+
"C146_3004",
|
| 128 |
+
"C146_1201",
|
| 129 |
+
"C146_1401",
|
| 130 |
+
"C146_1601",
|
| 131 |
+
"C146_1901",
|
| 132 |
+
"C146_2301",
|
| 133 |
+
"C146_2701",
|
| 134 |
+
"C146_2502",
|
| 135 |
+
"C147_3004",
|
| 136 |
+
"C147_1401",
|
| 137 |
+
"C147_1901",
|
| 138 |
+
"C152_0405",
|
| 139 |
+
"C161_1105",
|
| 140 |
+
"C164_1105",
|
| 141 |
+
"C167_1205",
|
| 142 |
+
"C168_1205",
|
| 143 |
+
"C168_2001",
|
| 144 |
+
"C168_2301",
|
| 145 |
+
"C168_3001",
|
| 146 |
+
"C168_0202",
|
| 147 |
+
"C168_0403",
|
| 148 |
+
"C169_1205",
|
| 149 |
+
"C169_2001",
|
| 150 |
+
"C169_2301",
|
| 151 |
+
"C169_0202",
|
| 152 |
+
"C169_0403",
|
| 153 |
+
"C170_1205",
|
| 154 |
+
"C170_2301",
|
| 155 |
+
"C170_0202",
|
| 156 |
+
"C170_0402",
|
| 157 |
+
"C170_0403",
|
| 158 |
+
"C187_2605",
|
| 159 |
+
"C187_1201",
|
| 160 |
+
"C187_1401",
|
| 161 |
+
"C187_1901",
|
| 162 |
+
"C187_2301",
|
| 163 |
+
"C187_2502",
|
| 164 |
+
"C190_2605",
|
| 165 |
+
"C190_2901",
|
| 166 |
+
"C190_0102",
|
| 167 |
+
"C190_0302",
|
| 168 |
+
"C190_0502",
|
| 169 |
+
"C190_0802",
|
| 170 |
+
"C190_1002",
|
| 171 |
+
"C190_0903",
|
| 172 |
+
"C193_2605",
|
| 173 |
+
"C195_2605",
|
| 174 |
+
"C197_2605",
|
| 175 |
+
"C212_2705",
|
| 176 |
+
"C214_2705",
|
| 177 |
+
"C234_2805",
|
| 178 |
+
"C237_2805",
|
| 179 |
+
"C238_2905",
|
| 180 |
+
"C240_2905",
|
| 181 |
+
"C246_2905",
|
| 182 |
+
"C251_2905"
|
| 183 |
+
],
|
| 184 |
+
"n_donors": 157,
|
| 185 |
+
"reference": {
|
| 186 |
+
"cache": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/imperial_eskd",
|
| 187 |
+
"reference_sha256": "34b4caa3f8a60b46d5faf58f09cdaa5622bcce19e4c45d9902a711fead96375e",
|
| 188 |
+
"features_sha256": "e46e5bb1a24eae045efe75125d20e3accaa8f68a1006eb2f60d24159013d4aa7",
|
| 189 |
+
"n_r1_cells": 23482,
|
| 190 |
+
"pca": {
|
| 191 |
+
"n_components": 50,
|
| 192 |
+
"explained_variance_ratio_sum": 0.2583312690258026,
|
| 193 |
+
"n_fit_cells": 23482
|
| 194 |
+
},
|
| 195 |
+
"r2_control": {
|
| 196 |
+
"precision": 0.9672515117962694,
|
| 197 |
+
"coverage": 0.9997018993271442,
|
| 198 |
+
"density": 1.2663444340345795,
|
| 199 |
+
"n_query": 23482,
|
| 200 |
+
"depth_matched": {
|
| 201 |
+
"precision": 0.9666978962609658,
|
| 202 |
+
"coverage": 0.9996593135167362,
|
| 203 |
+
"density": 1.267034324163189
|
| 204 |
+
}
|
| 205 |
+
},
|
| 206 |
+
"observed_l1_loo_null_mean": 0.5047406322420376
|
| 207 |
+
},
|
| 208 |
+
"contrast_definition": {
|
| 209 |
+
"enabled": true,
|
| 210 |
+
"rule": "explicit --case-groups / --control-groups",
|
| 211 |
+
"group_source": "features groups",
|
| 212 |
+
"case_groups": [
|
| 213 |
+
"covid_positive"
|
| 214 |
+
],
|
| 215 |
+
"control_groups": [
|
| 216 |
+
"covid_negative"
|
| 217 |
+
],
|
| 218 |
+
"n_case_donors": 113,
|
| 219 |
+
"n_control_donors": 34,
|
| 220 |
+
"n_donors_in_neither": 10,
|
| 221 |
+
"case": [
|
| 222 |
+
true,
|
| 223 |
+
true,
|
| 224 |
+
true,
|
| 225 |
+
true,
|
| 226 |
+
true,
|
| 227 |
+
true,
|
| 228 |
+
true,
|
| 229 |
+
true,
|
| 230 |
+
true,
|
| 231 |
+
true,
|
| 232 |
+
true,
|
| 233 |
+
true,
|
| 234 |
+
true,
|
| 235 |
+
true,
|
| 236 |
+
true,
|
| 237 |
+
true,
|
| 238 |
+
true,
|
| 239 |
+
true,
|
| 240 |
+
true,
|
| 241 |
+
true,
|
| 242 |
+
true,
|
| 243 |
+
true,
|
| 244 |
+
true,
|
| 245 |
+
true,
|
| 246 |
+
false,
|
| 247 |
+
true,
|
| 248 |
+
true,
|
| 249 |
+
true,
|
| 250 |
+
true,
|
| 251 |
+
false,
|
| 252 |
+
true,
|
| 253 |
+
true,
|
| 254 |
+
true,
|
| 255 |
+
true,
|
| 256 |
+
true,
|
| 257 |
+
true,
|
| 258 |
+
true,
|
| 259 |
+
false,
|
| 260 |
+
true,
|
| 261 |
+
false,
|
| 262 |
+
true,
|
| 263 |
+
true,
|
| 264 |
+
true,
|
| 265 |
+
true,
|
| 266 |
+
true,
|
| 267 |
+
true,
|
| 268 |
+
true,
|
| 269 |
+
true,
|
| 270 |
+
false,
|
| 271 |
+
false,
|
| 272 |
+
false,
|
| 273 |
+
false,
|
| 274 |
+
false,
|
| 275 |
+
true,
|
| 276 |
+
true,
|
| 277 |
+
true,
|
| 278 |
+
true,
|
| 279 |
+
true,
|
| 280 |
+
true,
|
| 281 |
+
true,
|
| 282 |
+
true,
|
| 283 |
+
true,
|
| 284 |
+
true,
|
| 285 |
+
true,
|
| 286 |
+
true,
|
| 287 |
+
true,
|
| 288 |
+
true,
|
| 289 |
+
true,
|
| 290 |
+
true,
|
| 291 |
+
true,
|
| 292 |
+
true,
|
| 293 |
+
true,
|
| 294 |
+
true,
|
| 295 |
+
true,
|
| 296 |
+
true,
|
| 297 |
+
false,
|
| 298 |
+
false,
|
| 299 |
+
false,
|
| 300 |
+
true,
|
| 301 |
+
true,
|
| 302 |
+
true,
|
| 303 |
+
true,
|
| 304 |
+
false,
|
| 305 |
+
true,
|
| 306 |
+
true,
|
| 307 |
+
true,
|
| 308 |
+
true,
|
| 309 |
+
true,
|
| 310 |
+
true,
|
| 311 |
+
false,
|
| 312 |
+
true,
|
| 313 |
+
true,
|
| 314 |
+
true,
|
| 315 |
+
true,
|
| 316 |
+
false,
|
| 317 |
+
false,
|
| 318 |
+
true,
|
| 319 |
+
true,
|
| 320 |
+
true,
|
| 321 |
+
true,
|
| 322 |
+
true,
|
| 323 |
+
false,
|
| 324 |
+
true,
|
| 325 |
+
true,
|
| 326 |
+
true,
|
| 327 |
+
true,
|
| 328 |
+
true,
|
| 329 |
+
true,
|
| 330 |
+
false,
|
| 331 |
+
false,
|
| 332 |
+
true,
|
| 333 |
+
true,
|
| 334 |
+
false,
|
| 335 |
+
false,
|
| 336 |
+
false,
|
| 337 |
+
false,
|
| 338 |
+
false,
|
| 339 |
+
true,
|
| 340 |
+
true,
|
| 341 |
+
true,
|
| 342 |
+
true,
|
| 343 |
+
false,
|
| 344 |
+
false,
|
| 345 |
+
true,
|
| 346 |
+
true,
|
| 347 |
+
true,
|
| 348 |
+
false,
|
| 349 |
+
false,
|
| 350 |
+
true,
|
| 351 |
+
true,
|
| 352 |
+
true,
|
| 353 |
+
false,
|
| 354 |
+
false,
|
| 355 |
+
true,
|
| 356 |
+
true,
|
| 357 |
+
true,
|
| 358 |
+
true,
|
| 359 |
+
false,
|
| 360 |
+
false,
|
| 361 |
+
true,
|
| 362 |
+
true,
|
| 363 |
+
true,
|
| 364 |
+
true,
|
| 365 |
+
true,
|
| 366 |
+
true,
|
| 367 |
+
false,
|
| 368 |
+
false,
|
| 369 |
+
false,
|
| 370 |
+
false,
|
| 371 |
+
false,
|
| 372 |
+
false,
|
| 373 |
+
false,
|
| 374 |
+
false,
|
| 375 |
+
false,
|
| 376 |
+
false,
|
| 377 |
+
false,
|
| 378 |
+
false
|
| 379 |
+
],
|
| 380 |
+
"ctrl": [
|
| 381 |
+
false,
|
| 382 |
+
false,
|
| 383 |
+
false,
|
| 384 |
+
false,
|
| 385 |
+
false,
|
| 386 |
+
false,
|
| 387 |
+
false,
|
| 388 |
+
false,
|
| 389 |
+
false,
|
| 390 |
+
false,
|
| 391 |
+
false,
|
| 392 |
+
false,
|
| 393 |
+
false,
|
| 394 |
+
false,
|
| 395 |
+
false,
|
| 396 |
+
false,
|
| 397 |
+
false,
|
| 398 |
+
false,
|
| 399 |
+
false,
|
| 400 |
+
false,
|
| 401 |
+
false,
|
| 402 |
+
false,
|
| 403 |
+
false,
|
| 404 |
+
false,
|
| 405 |
+
true,
|
| 406 |
+
false,
|
| 407 |
+
false,
|
| 408 |
+
false,
|
| 409 |
+
false,
|
| 410 |
+
false,
|
| 411 |
+
false,
|
| 412 |
+
false,
|
| 413 |
+
false,
|
| 414 |
+
false,
|
| 415 |
+
false,
|
| 416 |
+
false,
|
| 417 |
+
false,
|
| 418 |
+
true,
|
| 419 |
+
false,
|
| 420 |
+
true,
|
| 421 |
+
false,
|
| 422 |
+
false,
|
| 423 |
+
false,
|
| 424 |
+
false,
|
| 425 |
+
false,
|
| 426 |
+
false,
|
| 427 |
+
false,
|
| 428 |
+
false,
|
| 429 |
+
false,
|
| 430 |
+
true,
|
| 431 |
+
true,
|
| 432 |
+
true,
|
| 433 |
+
true,
|
| 434 |
+
false,
|
| 435 |
+
false,
|
| 436 |
+
false,
|
| 437 |
+
false,
|
| 438 |
+
false,
|
| 439 |
+
false,
|
| 440 |
+
false,
|
| 441 |
+
false,
|
| 442 |
+
false,
|
| 443 |
+
false,
|
| 444 |
+
false,
|
| 445 |
+
false,
|
| 446 |
+
false,
|
| 447 |
+
false,
|
| 448 |
+
false,
|
| 449 |
+
false,
|
| 450 |
+
false,
|
| 451 |
+
false,
|
| 452 |
+
false,
|
| 453 |
+
false,
|
| 454 |
+
false,
|
| 455 |
+
false,
|
| 456 |
+
true,
|
| 457 |
+
false,
|
| 458 |
+
true,
|
| 459 |
+
false,
|
| 460 |
+
false,
|
| 461 |
+
false,
|
| 462 |
+
false,
|
| 463 |
+
true,
|
| 464 |
+
false,
|
| 465 |
+
false,
|
| 466 |
+
false,
|
| 467 |
+
false,
|
| 468 |
+
false,
|
| 469 |
+
false,
|
| 470 |
+
false,
|
| 471 |
+
false,
|
| 472 |
+
false,
|
| 473 |
+
false,
|
| 474 |
+
false,
|
| 475 |
+
true,
|
| 476 |
+
true,
|
| 477 |
+
false,
|
| 478 |
+
false,
|
| 479 |
+
false,
|
| 480 |
+
false,
|
| 481 |
+
false,
|
| 482 |
+
true,
|
| 483 |
+
false,
|
| 484 |
+
false,
|
| 485 |
+
false,
|
| 486 |
+
false,
|
| 487 |
+
false,
|
| 488 |
+
false,
|
| 489 |
+
false,
|
| 490 |
+
true,
|
| 491 |
+
false,
|
| 492 |
+
false,
|
| 493 |
+
true,
|
| 494 |
+
true,
|
| 495 |
+
true,
|
| 496 |
+
true,
|
| 497 |
+
true,
|
| 498 |
+
false,
|
| 499 |
+
false,
|
| 500 |
+
false,
|
| 501 |
+
false,
|
| 502 |
+
false,
|
| 503 |
+
true,
|
| 504 |
+
false,
|
| 505 |
+
false,
|
| 506 |
+
false,
|
| 507 |
+
false,
|
| 508 |
+
true,
|
| 509 |
+
false,
|
| 510 |
+
false,
|
| 511 |
+
false,
|
| 512 |
+
false,
|
| 513 |
+
true,
|
| 514 |
+
false,
|
| 515 |
+
false,
|
| 516 |
+
false,
|
| 517 |
+
false,
|
| 518 |
+
false,
|
| 519 |
+
true,
|
| 520 |
+
false,
|
| 521 |
+
false,
|
| 522 |
+
false,
|
| 523 |
+
false,
|
| 524 |
+
false,
|
| 525 |
+
false,
|
| 526 |
+
false,
|
| 527 |
+
true,
|
| 528 |
+
true,
|
| 529 |
+
true,
|
| 530 |
+
true,
|
| 531 |
+
true,
|
| 532 |
+
true,
|
| 533 |
+
true,
|
| 534 |
+
true,
|
| 535 |
+
true,
|
| 536 |
+
true,
|
| 537 |
+
true
|
| 538 |
+
],
|
| 539 |
+
"groups": [
|
| 540 |
+
"covid_positive",
|
| 541 |
+
"covid_positive",
|
| 542 |
+
"covid_positive",
|
| 543 |
+
"covid_positive",
|
| 544 |
+
"covid_positive",
|
| 545 |
+
"covid_positive",
|
| 546 |
+
"covid_positive",
|
| 547 |
+
"covid_positive",
|
| 548 |
+
"covid_positive",
|
| 549 |
+
"covid_positive",
|
| 550 |
+
"covid_positive",
|
| 551 |
+
"covid_positive",
|
| 552 |
+
"covid_positive",
|
| 553 |
+
"covid_positive",
|
| 554 |
+
"covid_positive",
|
| 555 |
+
"covid_positive",
|
| 556 |
+
"covid_positive",
|
| 557 |
+
"covid_positive",
|
| 558 |
+
"covid_positive",
|
| 559 |
+
"covid_positive",
|
| 560 |
+
"covid_positive",
|
| 561 |
+
"covid_positive",
|
| 562 |
+
"covid_positive",
|
| 563 |
+
"covid_positive",
|
| 564 |
+
"covid_negative",
|
| 565 |
+
"covid_positive",
|
| 566 |
+
"covid_positive",
|
| 567 |
+
"covid_positive",
|
| 568 |
+
"covid_positive",
|
| 569 |
+
"recovery",
|
| 570 |
+
"covid_positive",
|
| 571 |
+
"covid_positive",
|
| 572 |
+
"covid_positive",
|
| 573 |
+
"covid_positive",
|
| 574 |
+
"covid_positive",
|
| 575 |
+
"covid_positive",
|
| 576 |
+
"covid_positive",
|
| 577 |
+
"covid_negative",
|
| 578 |
+
"covid_positive",
|
| 579 |
+
"covid_negative",
|
| 580 |
+
"covid_positive",
|
| 581 |
+
"covid_positive",
|
| 582 |
+
"covid_positive",
|
| 583 |
+
"covid_positive",
|
| 584 |
+
"covid_positive",
|
| 585 |
+
"covid_positive",
|
| 586 |
+
"covid_positive",
|
| 587 |
+
"covid_positive",
|
| 588 |
+
"recovery",
|
| 589 |
+
"covid_negative",
|
| 590 |
+
"covid_negative",
|
| 591 |
+
"covid_negative",
|
| 592 |
+
"covid_negative",
|
| 593 |
+
"covid_positive",
|
| 594 |
+
"covid_positive",
|
| 595 |
+
"covid_positive",
|
| 596 |
+
"covid_positive",
|
| 597 |
+
"covid_positive",
|
| 598 |
+
"covid_positive",
|
| 599 |
+
"covid_positive",
|
| 600 |
+
"covid_positive",
|
| 601 |
+
"covid_positive",
|
| 602 |
+
"covid_positive",
|
| 603 |
+
"covid_positive",
|
| 604 |
+
"covid_positive",
|
| 605 |
+
"covid_positive",
|
| 606 |
+
"covid_positive",
|
| 607 |
+
"covid_positive",
|
| 608 |
+
"covid_positive",
|
| 609 |
+
"covid_positive",
|
| 610 |
+
"covid_positive",
|
| 611 |
+
"covid_positive",
|
| 612 |
+
"covid_positive",
|
| 613 |
+
"covid_positive",
|
| 614 |
+
"covid_positive",
|
| 615 |
+
"covid_negative",
|
| 616 |
+
"recovery",
|
| 617 |
+
"covid_negative",
|
| 618 |
+
"covid_positive",
|
| 619 |
+
"covid_positive",
|
| 620 |
+
"covid_positive",
|
| 621 |
+
"covid_positive",
|
| 622 |
+
"covid_negative",
|
| 623 |
+
"covid_positive",
|
| 624 |
+
"covid_positive",
|
| 625 |
+
"covid_positive",
|
| 626 |
+
"covid_positive",
|
| 627 |
+
"covid_positive",
|
| 628 |
+
"covid_positive",
|
| 629 |
+
"recovery",
|
| 630 |
+
"covid_positive",
|
| 631 |
+
"covid_positive",
|
| 632 |
+
"covid_positive",
|
| 633 |
+
"covid_positive",
|
| 634 |
+
"covid_negative",
|
| 635 |
+
"covid_negative",
|
| 636 |
+
"covid_positive",
|
| 637 |
+
"covid_positive",
|
| 638 |
+
"covid_positive",
|
| 639 |
+
"covid_positive",
|
| 640 |
+
"covid_positive",
|
| 641 |
+
"covid_negative",
|
| 642 |
+
"covid_positive",
|
| 643 |
+
"covid_positive",
|
| 644 |
+
"covid_positive",
|
| 645 |
+
"covid_positive",
|
| 646 |
+
"covid_positive",
|
| 647 |
+
"covid_positive",
|
| 648 |
+
"recovery",
|
| 649 |
+
"covid_negative",
|
| 650 |
+
"covid_positive",
|
| 651 |
+
"covid_positive",
|
| 652 |
+
"covid_negative",
|
| 653 |
+
"covid_negative",
|
| 654 |
+
"covid_negative",
|
| 655 |
+
"covid_negative",
|
| 656 |
+
"covid_negative",
|
| 657 |
+
"covid_positive",
|
| 658 |
+
"covid_positive",
|
| 659 |
+
"covid_positive",
|
| 660 |
+
"covid_positive",
|
| 661 |
+
"recovery",
|
| 662 |
+
"covid_negative",
|
| 663 |
+
"covid_positive",
|
| 664 |
+
"covid_positive",
|
| 665 |
+
"covid_positive",
|
| 666 |
+
"recovery",
|
| 667 |
+
"covid_negative",
|
| 668 |
+
"covid_positive",
|
| 669 |
+
"covid_positive",
|
| 670 |
+
"covid_positive",
|
| 671 |
+
"recovery",
|
| 672 |
+
"covid_negative",
|
| 673 |
+
"covid_positive",
|
| 674 |
+
"covid_positive",
|
| 675 |
+
"covid_positive",
|
| 676 |
+
"covid_positive",
|
| 677 |
+
"recovery",
|
| 678 |
+
"covid_negative",
|
| 679 |
+
"covid_positive",
|
| 680 |
+
"covid_positive",
|
| 681 |
+
"covid_positive",
|
| 682 |
+
"covid_positive",
|
| 683 |
+
"covid_positive",
|
| 684 |
+
"covid_positive",
|
| 685 |
+
"recovery",
|
| 686 |
+
"covid_negative",
|
| 687 |
+
"covid_negative",
|
| 688 |
+
"covid_negative",
|
| 689 |
+
"covid_negative",
|
| 690 |
+
"covid_negative",
|
| 691 |
+
"covid_negative",
|
| 692 |
+
"covid_negative",
|
| 693 |
+
"covid_negative",
|
| 694 |
+
"covid_negative",
|
| 695 |
+
"covid_negative",
|
| 696 |
+
"covid_negative"
|
| 697 |
+
]
|
| 698 |
+
},
|
| 699 |
+
"deg_definition": {
|
| 700 |
+
"enabled": true,
|
| 701 |
+
"score": "top-50 DEG overlap per cell type (benchmark total_top50_overlap, Welch backend)",
|
| 702 |
+
"source": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/bulk2sc-paper/scripts/evaluate_generated_vs_truth.py",
|
| 703 |
+
"functions": [
|
| 704 |
+
"welch_bh_deg",
|
| 705 |
+
"top_deg_genes",
|
| 706 |
+
"jaccard"
|
| 707 |
+
],
|
| 708 |
+
"reproduces": "utility_studies_final6k_20260925/sle top-50 DEG 81 (1,006 genes) / 84 (2,279 genes) = sum over the six gated types of top50_overlap_count",
|
| 709 |
+
"top_n": 50,
|
| 710 |
+
"fdr": 0.05,
|
| 711 |
+
"n_genes": 5927,
|
| 712 |
+
"types": [
|
| 713 |
+
"T cell",
|
| 714 |
+
"B cell",
|
| 715 |
+
"Monocyte",
|
| 716 |
+
"NK cell",
|
| 717 |
+
"DC"
|
| 718 |
+
],
|
| 719 |
+
"aggregates_source": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/imperial_eskd/deg_reference.npz",
|
| 720 |
+
"aggregates_sha256": "8fada1ace7530b79bfc5c5201b9cb60399ff77d083dd8b53b13cfbe900cda55c",
|
| 721 |
+
"aggregates_note": null,
|
| 722 |
+
"types_not_scored_observed": [],
|
| 723 |
+
"observed": {
|
| 724 |
+
"T cell": {
|
| 725 |
+
"n_significant": 1057,
|
| 726 |
+
"n_tested": 5755,
|
| 727 |
+
"n_case_donors": 113,
|
| 728 |
+
"n_control_donors": 34,
|
| 729 |
+
"n_cells": 262546,
|
| 730 |
+
"top_list_size": 50
|
| 731 |
+
},
|
| 732 |
+
"B cell": {
|
| 733 |
+
"n_significant": 298,
|
| 734 |
+
"n_tested": 5645,
|
| 735 |
+
"n_case_donors": 113,
|
| 736 |
+
"n_control_donors": 34,
|
| 737 |
+
"n_cells": 48625,
|
| 738 |
+
"top_list_size": 50
|
| 739 |
+
},
|
| 740 |
+
"Monocyte": {
|
| 741 |
+
"n_significant": 349,
|
| 742 |
+
"n_tested": 5631,
|
| 743 |
+
"n_case_donors": 112,
|
| 744 |
+
"n_control_donors": 34,
|
| 745 |
+
"n_cells": 80851,
|
| 746 |
+
"top_list_size": 50
|
| 747 |
+
},
|
| 748 |
+
"NK cell": {
|
| 749 |
+
"n_significant": 427,
|
| 750 |
+
"n_tested": 5591,
|
| 751 |
+
"n_case_donors": 113,
|
| 752 |
+
"n_control_donors": 34,
|
| 753 |
+
"n_cells": 72125,
|
| 754 |
+
"top_list_size": 50
|
| 755 |
+
},
|
| 756 |
+
"DC": {
|
| 757 |
+
"n_significant": 341,
|
| 758 |
+
"n_tested": 5437,
|
| 759 |
+
"n_case_donors": 113,
|
| 760 |
+
"n_control_donors": 34,
|
| 761 |
+
"n_cells": 13572,
|
| 762 |
+
"top_list_size": 50
|
| 763 |
+
}
|
| 764 |
+
},
|
| 765 |
+
"broadcast": "welch_bh_deg + top_deg_genes on the arm's condition bulk_counts (scoring genes, case|control donors), one list compared with every type's observed list (sle_broadcast.py broadcast_input_bulk); not part of the published benchmark"
|
| 766 |
+
},
|
| 767 |
+
"headline": {
|
| 768 |
+
"locoL_fullsat_s40000_K1000": {
|
| 769 |
+
"comp_l1": 0.608905739142699,
|
| 770 |
+
"comp_l1_obs_loo_null": 0.5047406322420376,
|
| 771 |
+
"precision": 0.7874116344434035,
|
| 772 |
+
"coverage": 0.6026318030832126,
|
| 773 |
+
"precision_dm": 0.8236947449109957,
|
| 774 |
+
"coverage_dm": 0.7040712034750022,
|
| 775 |
+
"pb_r_median": 0.87824769514186,
|
| 776 |
+
"pb_top1": 0.025477707006369428,
|
| 777 |
+
"mono_pct_gen": 35.2828025477707,
|
| 778 |
+
"mono_pct_obs": 16.91641814873756,
|
| 779 |
+
"median_umi_gen": 1710.0,
|
| 780 |
+
"median_umi_obs": 1349.0,
|
| 781 |
+
"contrast_mean_cp10k_r_gen": 0.5027476205152808,
|
| 782 |
+
"contrast_pseudobulk_log1p_cpm_r_gen": 0.32817796611585287,
|
| 783 |
+
"contrast_mean_cp10k_r_broadcast": 0.6606053132085035,
|
| 784 |
+
"contrast_pseudobulk_log1p_cpm_r_broadcast": 0.6048858412342804,
|
| 785 |
+
"deg_top50_T": 24,
|
| 786 |
+
"deg_top50_B": 20,
|
| 787 |
+
"deg_top50_Mono": 24,
|
| 788 |
+
"deg_top50_NK": 18,
|
| 789 |
+
"deg_top50_DC": 13,
|
| 790 |
+
"deg_top50_sum": 99,
|
| 791 |
+
"deg_top50_max": 250,
|
| 792 |
+
"deg_top50_sum_4type": 86,
|
| 793 |
+
"deg_top50_sum_broadcast": 84,
|
| 794 |
+
"seconds": 46.3
|
| 795 |
+
}
|
| 796 |
+
},
|
| 797 |
+
"per_arm": {
|
| 798 |
+
"locoL_fullsat_s40000_K1000": {
|
| 799 |
+
"arm": "locoL_fullsat_s40000_K1000",
|
| 800 |
+
"npz": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_crosscohort_20261002/generated/imperial_eskd/hoL_imperial_eskd/K1000_fullsat_s40000.npz",
|
| 801 |
+
"npz_sha256": "9a969303c383cf4d492177cdc0111b7ba7ef53a2c205b4fcee398355cab7692d",
|
| 802 |
+
"receipt_verified": true,
|
| 803 |
+
"generation": {
|
| 804 |
+
"checkpoint": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_crosscohort_20261002/runs/hoL_imperial_eskd/K1000/fullsat/checkpoint_ft_s40000.pt",
|
| 805 |
+
"checkpoint_sha256": "02862b856805147e73daf92ac391d9753bee0457f9d1d59b2501c3a5f966e384",
|
| 806 |
+
"input_condition_path": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_crosscohort_20261002/data/imperial_eskd/test_raw_K1000.npz",
|
| 807 |
+
"input_condition_sha256": "f0a2b659a4596ce745beab389dfd02e39cc318bf8552ffa6561d91d74e12ed7e",
|
| 808 |
+
"seed": 20260927,
|
| 809 |
+
"steps": 50,
|
| 810 |
+
"support_readout": "bernoulli",
|
| 811 |
+
"weights": "ema"
|
| 812 |
+
},
|
| 813 |
+
"condition_for_broadcast": {
|
| 814 |
+
"path": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_crosscohort_20261002/data/imperial_eskd/test_raw_K1000.npz",
|
| 815 |
+
"sha256": "f0a2b659a4596ce745beab389dfd02e39cc318bf8552ffa6561d91d74e12ed7e"
|
| 816 |
+
},
|
| 817 |
+
"poisson": {
|
| 818 |
+
"seed": 20260916,
|
| 819 |
+
"rule": "whole NPZ, rows in NPZ order",
|
| 820 |
+
"nnz_whole_npz": 63094717,
|
| 821 |
+
"median_library_whole_npz_panel": 1710.0,
|
| 822 |
+
"n_rows_whole_npz": 235500
|
| 823 |
+
},
|
| 824 |
+
"annotation": {
|
| 825 |
+
"model_pt_sha256": "bf3655899e5abee435340fc008656c4a17342da0f30b70cfd43de8e9223e1930",
|
| 826 |
+
"zero_padded_model_genes": 0,
|
| 827 |
+
"label_counts": {
|
| 828 |
+
"T cell": 109184,
|
| 829 |
+
"Monocyte": 83091,
|
| 830 |
+
"NK cell": 16626,
|
| 831 |
+
"B cell": 15950,
|
| 832 |
+
"Other": 9376,
|
| 833 |
+
"DC": 1273
|
| 834 |
+
},
|
| 835 |
+
"mean_l2_max_prob": 0.9340101172417845,
|
| 836 |
+
"predict_seconds": 7.5
|
| 837 |
+
},
|
| 838 |
+
"n_donors": 157,
|
| 839 |
+
"n_generated_cells": 235500,
|
| 840 |
+
"composition": {
|
| 841 |
+
"l1_mean": 0.608905739142699,
|
| 842 |
+
"l1_median": 0.5793153153153153,
|
| 843 |
+
"l1_obs_loo_null_mean": 0.5047406322420376,
|
| 844 |
+
"l1_generated_loo_mean_vs_observed_mean": 0.6424710013487205,
|
| 845 |
+
"composition_top1": 0.01910828025477707,
|
| 846 |
+
"mean_fraction_generated": {
|
| 847 |
+
"T cell": 0.463626,
|
| 848 |
+
"B cell": 0.067728,
|
| 849 |
+
"Monocyte": 0.352828,
|
| 850 |
+
"NK cell": 0.070599,
|
| 851 |
+
"DC": 0.005406,
|
| 852 |
+
"Other": 0.039813
|
| 853 |
+
},
|
| 854 |
+
"mean_fraction_observed": {
|
| 855 |
+
"T cell": 0.49735,
|
| 856 |
+
"B cell": 0.119189,
|
| 857 |
+
"Monocyte": 0.169164,
|
| 858 |
+
"NK cell": 0.169625,
|
| 859 |
+
"DC": 0.030313,
|
| 860 |
+
"Other": 0.01436
|
| 861 |
+
}
|
| 862 |
+
},
|
| 863 |
+
"pseudobulk": {
|
| 864 |
+
"n_genes": 5927,
|
| 865 |
+
"r_median": 0.87824769514186,
|
| 866 |
+
"r_mean": 0.8744410729104176,
|
| 867 |
+
"top1": 0.025477707006369428,
|
| 868 |
+
"n_top1": 4,
|
| 869 |
+
"own_rank_median": 35.0,
|
| 870 |
+
"chance_top1": 0.006369426751592357
|
| 871 |
+
},
|
| 872 |
+
"precision_coverage": {
|
| 873 |
+
"precision": 0.7874116344434035,
|
| 874 |
+
"coverage": 0.6026318030832126,
|
| 875 |
+
"density": 0.7208031683842944,
|
| 876 |
+
"n_query": 23482,
|
| 877 |
+
"n_reference": 23482
|
| 878 |
+
},
|
| 879 |
+
"precision_coverage_depth_matched": {
|
| 880 |
+
"precision": 0.8236947449109957,
|
| 881 |
+
"coverage": 0.7040712034750022,
|
| 882 |
+
"density": 0.9407546205604292,
|
| 883 |
+
"detected_median_before": {
|
| 884 |
+
"R1": 345.0,
|
| 885 |
+
"Q": 259.0
|
| 886 |
+
},
|
| 887 |
+
"detected_median_after": {
|
| 888 |
+
"R1": 259.0,
|
| 889 |
+
"Q": 259.0
|
| 890 |
+
}
|
| 891 |
+
},
|
| 892 |
+
"monocyte_pct": {
|
| 893 |
+
"generated_mean_over_donors": 35.2828025477707,
|
| 894 |
+
"observed_mean_over_donors": 16.91641814873756,
|
| 895 |
+
"generated_pooled_cells": 35.2828025477707
|
| 896 |
+
},
|
| 897 |
+
"median_umi_per_cell_scoring_genes": {
|
| 898 |
+
"generated_pooled": 1710.0,
|
| 899 |
+
"observed_pooled": 1349.0,
|
| 900 |
+
"generated_mean_of_donor_medians": 1752.9267578125,
|
| 901 |
+
"observed_mean_of_donor_medians": 1279.6082802547771
|
| 902 |
+
},
|
| 903 |
+
"contrast": {
|
| 904 |
+
"mean_cp10k": {
|
| 905 |
+
"per_type": {
|
| 906 |
+
"T cell": {
|
| 907 |
+
"r_generated": 0.5407630916108798,
|
| 908 |
+
"r_broadcast": 0.6352016868529187,
|
| 909 |
+
"partial_r_generated_given_broadcast": 0.38683486986203597,
|
| 910 |
+
"r_generated_vs_broadcast": 0.42572218124388156,
|
| 911 |
+
"n_genes": 3031
|
| 912 |
+
},
|
| 913 |
+
"B cell": {
|
| 914 |
+
"r_generated": 0.5066510690944063,
|
| 915 |
+
"r_broadcast": 0.6290331452237995,
|
| 916 |
+
"partial_r_generated_given_broadcast": 0.3490120889908626,
|
| 917 |
+
"r_generated_vs_broadcast": 0.4125373435670074,
|
| 918 |
+
"n_genes": 3184
|
| 919 |
+
},
|
| 920 |
+
"Monocyte": {
|
| 921 |
+
"r_generated": 0.5852452284886839,
|
| 922 |
+
"r_broadcast": 0.7184291928055079,
|
| 923 |
+
"partial_r_generated_given_broadcast": 0.3126215119054127,
|
| 924 |
+
"r_generated_vs_broadcast": 0.5648399341570739,
|
| 925 |
+
"n_genes": 2877
|
| 926 |
+
},
|
| 927 |
+
"NK cell": {
|
| 928 |
+
"r_generated": 0.3783310928671535,
|
| 929 |
+
"r_broadcast": 0.6597572279517877,
|
| 930 |
+
"partial_r_generated_given_broadcast": 0.12490929127794027,
|
| 931 |
+
"r_generated_vs_broadcast": 0.4461070056262193,
|
| 932 |
+
"n_genes": 2964
|
| 933 |
+
}
|
| 934 |
+
},
|
| 935 |
+
"mean_r_generated": 0.5027476205152808,
|
| 936 |
+
"mean_r_broadcast": 0.6606053132085035,
|
| 937 |
+
"mean_partial_r": 0.29334444050906294
|
| 938 |
+
},
|
| 939 |
+
"pseudobulk_log1p_cpm": {
|
| 940 |
+
"per_type": {
|
| 941 |
+
"T cell": {
|
| 942 |
+
"r_generated": 0.3394046288258067,
|
| 943 |
+
"r_broadcast": 0.6294466207665587,
|
| 944 |
+
"partial_r_generated_given_broadcast": 0.059020696374805504,
|
| 945 |
+
"r_generated_vs_broadcast": 0.47509901473664273,
|
| 946 |
+
"n_genes": 3031
|
| 947 |
+
},
|
| 948 |
+
"B cell": {
|
| 949 |
+
"r_generated": 0.282348756205035,
|
| 950 |
+
"r_broadcast": 0.4870645233040134,
|
| 951 |
+
"partial_r_generated_given_broadcast": 0.13309795873464697,
|
| 952 |
+
"r_generated_vs_broadcast": 0.3567366139920275,
|
| 953 |
+
"n_genes": 3184
|
| 954 |
+
},
|
| 955 |
+
"Monocyte": {
|
| 956 |
+
"r_generated": 0.4854399179576236,
|
| 957 |
+
"r_broadcast": 0.7066219687885489,
|
| 958 |
+
"partial_r_generated_given_broadcast": 0.14147914059950045,
|
| 959 |
+
"r_generated_vs_broadcast": 0.5706451517150906,
|
| 960 |
+
"n_genes": 2877
|
| 961 |
+
},
|
| 962 |
+
"NK cell": {
|
| 963 |
+
"r_generated": 0.20551856147494624,
|
| 964 |
+
"r_broadcast": 0.5964102520780005,
|
| 965 |
+
"partial_r_generated_given_broadcast": -0.028035290781318164,
|
| 966 |
+
"r_generated_vs_broadcast": 0.37950131134428866,
|
| 967 |
+
"n_genes": 2964
|
| 968 |
+
}
|
| 969 |
+
},
|
| 970 |
+
"mean_r_generated": 0.32817796611585287,
|
| 971 |
+
"mean_r_broadcast": 0.6048858412342804,
|
| 972 |
+
"mean_partial_r": 0.07639062623190869
|
| 973 |
+
}
|
| 974 |
+
},
|
| 975 |
+
"deg_top50": {
|
| 976 |
+
"types_scored": [
|
| 977 |
+
"T cell",
|
| 978 |
+
"B cell",
|
| 979 |
+
"Monocyte",
|
| 980 |
+
"NK cell",
|
| 981 |
+
"DC"
|
| 982 |
+
],
|
| 983 |
+
"types_not_scored": {},
|
| 984 |
+
"per_type": {
|
| 985 |
+
"T cell": {
|
| 986 |
+
"deg_scored": true,
|
| 987 |
+
"top50_overlap": 24,
|
| 988 |
+
"top50_jaccard": 0.3157894736842105,
|
| 989 |
+
"obs_top_list_size": 50,
|
| 990 |
+
"gen_top_list_size": 50,
|
| 991 |
+
"top50_overlap_broadcast": 17,
|
| 992 |
+
"top50_jaccard_broadcast": 0.20481927710843373,
|
| 993 |
+
"n_cells_obs": 262546,
|
| 994 |
+
"n_cells_gen": 101874
|
| 995 |
+
},
|
| 996 |
+
"B cell": {
|
| 997 |
+
"deg_scored": true,
|
| 998 |
+
"top50_overlap": 20,
|
| 999 |
+
"top50_jaccard": 0.25,
|
| 1000 |
+
"obs_top_list_size": 50,
|
| 1001 |
+
"gen_top_list_size": 50,
|
| 1002 |
+
"top50_overlap_broadcast": 14,
|
| 1003 |
+
"top50_jaccard_broadcast": 0.16279069767441862,
|
| 1004 |
+
"n_cells_obs": 48625,
|
| 1005 |
+
"n_cells_gen": 15040
|
| 1006 |
+
},
|
| 1007 |
+
"Monocyte": {
|
| 1008 |
+
"deg_scored": true,
|
| 1009 |
+
"top50_overlap": 24,
|
| 1010 |
+
"top50_jaccard": 0.3157894736842105,
|
| 1011 |
+
"obs_top_list_size": 50,
|
| 1012 |
+
"gen_top_list_size": 50,
|
| 1013 |
+
"top50_overlap_broadcast": 22,
|
| 1014 |
+
"top50_jaccard_broadcast": 0.28205128205128205,
|
| 1015 |
+
"n_cells_obs": 80851,
|
| 1016 |
+
"n_cells_gen": 78131
|
| 1017 |
+
},
|
| 1018 |
+
"NK cell": {
|
| 1019 |
+
"deg_scored": true,
|
| 1020 |
+
"top50_overlap": 18,
|
| 1021 |
+
"top50_jaccard": 0.21951219512195122,
|
| 1022 |
+
"obs_top_list_size": 50,
|
| 1023 |
+
"gen_top_list_size": 50,
|
| 1024 |
+
"top50_overlap_broadcast": 16,
|
| 1025 |
+
"top50_jaccard_broadcast": 0.19047619047619047,
|
| 1026 |
+
"n_cells_obs": 72125,
|
| 1027 |
+
"n_cells_gen": 15410
|
| 1028 |
+
},
|
| 1029 |
+
"DC": {
|
| 1030 |
+
"deg_scored": true,
|
| 1031 |
+
"top50_overlap": 13,
|
| 1032 |
+
"top50_jaccard": 0.14942528735632185,
|
| 1033 |
+
"obs_top_list_size": 50,
|
| 1034 |
+
"gen_top_list_size": 50,
|
| 1035 |
+
"top50_overlap_broadcast": 15,
|
| 1036 |
+
"top50_jaccard_broadcast": 0.17647058823529413,
|
| 1037 |
+
"n_cells_obs": 13572,
|
| 1038 |
+
"n_cells_gen": 1189
|
| 1039 |
+
}
|
| 1040 |
+
},
|
| 1041 |
+
"sum": 99,
|
| 1042 |
+
"sum_4type": 86,
|
| 1043 |
+
"max": 250,
|
| 1044 |
+
"mean": 19.8,
|
| 1045 |
+
"sum_broadcast": 84,
|
| 1046 |
+
"sum_broadcast_4type": 69,
|
| 1047 |
+
"broadcast_n_significant": 2242,
|
| 1048 |
+
"seconds": 0.63
|
| 1049 |
+
},
|
| 1050 |
+
"seconds": 46.3
|
| 1051 |
+
}
|
| 1052 |
+
},
|
| 1053 |
+
"code_sha256": {
|
| 1054 |
+
"/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/tools/score_ft.py": "ec5f40b4cea6d5062d0138f3b934abb6465e34cbfeac869c8a0906924c033aec",
|
| 1055 |
+
"/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/tools/ft_common.py": "4a6366b0f22208cd58714fc0261b8840c643b9d4569704d560cfd93534cbc747",
|
| 1056 |
+
"/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/utility_studies_final6k_20260925/umap/cell_immicro_5arm/tools/stage_b_embed.py": "d056cfdf38fb0e5f478756f370174e993b75d0c973c48e02e21749175a4ca2da",
|
| 1057 |
+
"/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/bulk2sc-paper/scripts/evaluate_generated_vs_truth.py": "48b12d794782b840838853e93e0fc55fab00532c4b3698f4588e926b985d2881",
|
| 1058 |
+
"/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/utility_studies_final6k_20260925/immicro/tools/immicro_common.py": "c5c30e917148cc5e664e91ea30c11bbdff9b6d1f53a3e0a13e16b1917eff37e9",
|
| 1059 |
+
"/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/aifi_scanvi_rebuild_20260916/predict_scanvi.py": "482ee5dcf4d72b54bc36cbb6dcff62e5030bc7afc46cb5fb01eca73a82ee45a5",
|
| 1060 |
+
"/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/aifi_scanvi_rebuild_20260916/poisson_readout.py": "8bfa080942fbcdc89ae23b276524a1a83266fb8cbc56b9af279e50f82e6cde38"
|
| 1061 |
+
},
|
| 1062 |
+
"seconds": 61.7
|
| 1063 |
+
}
|
paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20261003T103040Z-crosscohort-k1000-saturation/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_crosscohort_20261002/scores/imperial_eskd/locoL_fullsat_s60000_K1000/README.md
ADDED
|
@@ -0,0 +1,73 @@
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 1 |
+
# score_ft.py output: imperial_eskd, 157 scored donors
|
| 2 |
+
|
| 3 |
+
Arms: locoL_fullsat_s60000_K1000. Every arm is scored on the same donors against the same observed reference.
|
| 4 |
+
|
| 5 |
+
## Inputs and fixed contracts
|
| 6 |
+
- Observed reference: `/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/imperial_eskd/reference.npz` (sha 34b4caa3f8a6), built from datadir:/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/data/imperial_eskd;
|
| 7 |
+
observed cells sum exactly to the features pseudobulk of every donor. Observed labels: /home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/imperial_eskd/observed_labels/labels/labels.parquet.
|
| 8 |
+
- Generated cells: `generated_counts` read out once with Poisson(seed 20260916) over the **whole NPZ in row order**
|
| 9 |
+
(`poisson_readout.poisson_integerise`), then the scored donors' rows. These integer counts are used for labels, embedding,
|
| 10 |
+
depth and the contrast. Pseudobulk uses the summed `generated_counts` (rates), as `score_generated.py`.
|
| 11 |
+
- Labels: frozen f01common scANVI (`predict_scanvi.py`, CPU, zero query epochs), six-type gate ['T cell', 'B cell', 'Monocyte', 'NK cell', 'DC', 'Other']; query genes =
|
| 12 |
+
the 1,006-gene annotation list minus genes the dataset's sc assay did not measure in every sample (1005 genes).
|
| 13 |
+
- Scoring genes: 6k panel genes measured by both assays in every sample of the dataset (5927 genes).
|
| 14 |
+
|
| 15 |
+
## Definitions
|
| 16 |
+
1. **Composition**: fraction of each donor's cells per six-type label (all generated cells; all observed QC cells).
|
| 17 |
+
`comp_l1` = sum over the six labels of |generated - observed| (immicro_common.l1). `comp_l1_obs_loo_null` = L1 of the
|
| 18 |
+
donor's observed composition to the mean of the *other scored donors'* observed compositions. `composition_top1` =
|
| 19 |
+
fraction of donors whose generated composition is closest (L1) to their own observed composition.
|
| 20 |
+
2. **Pseudobulk**: `pb_r` = Pearson r of CPM-log1p(summed generated_counts) vs CPM-log1p(observed pseudobulk) on the scoring
|
| 21 |
+
genes (evaluate_realbulk.cpm_log1p / paired_r). `pb_top1` = the donor's generated pseudobulk is closest (Pearson) to its own
|
| 22 |
+
observed pseudobulk among the 157 scored donors (immicro_common.retrieval = evaluate_realbulk.top1 arithmetic).
|
| 23 |
+
3. **Precision / coverage / density** (stage_b_embed.py functions): per-cell CP10K over the scoring genes + log1p; PCA-50
|
| 24 |
+
(randomized, random_state 20260925) and k = 10 real-real k-NN balls fitted on **R1 of the scored donors only**.
|
| 25 |
+
Reference rule (independent of fold and arm): per donor, cells in canonical order (library_id+barcode), one
|
| 26 |
+
permutation from `default_rng([20260925, uint64(sha256(donor)[:8])])`; R1 = first n, R2 = next n,
|
| 27 |
+
n = min(150, n_cells // 2) (23482 R1 cells here). Generated query: per donor n cells (the donor's R1 size),
|
| 28 |
+
without replacement, `default_rng([20260926, same key])`. Precision = fraction of generated cells inside any R1 ball
|
| 29 |
+
(Kynkaanniemi 2019); coverage = fraction of R1 cells whose ball holds a generated cell; density = Naeem 2020.
|
| 30 |
+
Per-donor precision = that donor's generated cells; per-donor coverage = that donor's R1 cells (the pooled values are
|
| 31 |
+
their n-weighted means; plain means when every donor has 150 reference cells). R2 (held-out real cells of the same donors) is the
|
| 32 |
+
perfect-generator control: precision 0.9673, coverage 0.9997.
|
| 33 |
+
**Depth matched**: stage_b_embed depth matching run pairwise (R1 vs this arm): per donor and within-donor rank of detected
|
| 34 |
+
genes, both cells are thinned by UMI sampling without replacement to the smaller detected-gene count; PCA kept from
|
| 35 |
+
un-thinned R1, radii recomputed on thinned R1; fresh rng(20260929) per arm. R2 control: precision
|
| 36 |
+
0.9667, coverage 0.9997.
|
| 37 |
+
4. **Monocyte %** = 100 x Monocyte fraction (all cells) per donor; **median UMI per cell** = median over cells of the
|
| 38 |
+
Poisson-read (generated) / observed counts summed over the scoring genes (per donor, and pooled).
|
| 39 |
+
5. **Group contrast** (T, B, Monocyte, NK): case groups ['covid_positive'] (n = 113) vs control groups ['covid_negative'] (n = 34); rule: explicit --case-groups / --control-groups; groups from features groups.
|
| 40 |
+
Genes per type = scoring genes detected (count > 0) in >= 1 % of the scored donors' observed
|
| 41 |
+
cells of that type. Primary statistic `mean_cp10k`: per-cell CP10K over the scoring genes; per donor the mean over its
|
| 42 |
+
cells of the type (donors with >= 1 such cell); group mean = mean over the group's donors (donor-balanced);
|
| 43 |
+
logFC = log2(case mean + 1) - log2(control mean + 1). Secondary `pseudobulk_log1p_cpm`: the SLE benchmark evaluator's
|
| 44 |
+
statistic (donor x type summed counts, log1p CPM over the scoring genes, mean case - mean control;
|
| 45 |
+
evaluate_generated_vs_truth.group_log_fold_change). Both are computed on the generated cells (their frozen labels) and on
|
| 46 |
+
the observed cells; `r_generated` = Pearson r of the two logFC vectors. Broadcast baseline `r_broadcast`: the same
|
| 47 |
+
observed vector against the logFC of the input bulk (condition NPZ `bulk_counts` of the arm, scoring genes, per-donor
|
| 48 |
+
CP10K resp. log1p CPM, group means). `partial_r_generated_given_broadcast`: r of the OLS residuals of observed and
|
| 49 |
+
generated logFC on the bulk logFC (residual_specificity.py).
|
| 50 |
+
6. **Top-50 DEG overlap** (contrast.csv rows `statistic = welch_top50_deg`; summary `deg_top50`): the SLE benchmark's score (`total_top50_overlap` of
|
| 51 |
+
`bulk2sc-paper/scripts/evaluate_generated_vs_truth.py`, Welch backend: the "top-50 DEG 81 / 84" of the final model), run
|
| 52 |
+
with the evaluator's own functions on the same donor x type pseudobulks as the contrast. Per cell type, observed and
|
| 53 |
+
generated separately: donor x type summed counts on all 5927 scoring genes (donors of the two groups with
|
| 54 |
+
>= 1 cell of the type) -> `welch_bh_deg` (log1p CPM, two-sided Welch t-test case vs control, Benjamini-Hochberg over the
|
| 55 |
+
genes with a defined p-value; needs >= 2 donors per group) -> `top_deg_genes` (FDR < 0.05, descending |logFC|,
|
| 56 |
+
first 50; shorter when fewer genes pass). `top50_overlap` = |observed list & generated list|; `top50_jaccard`
|
| 57 |
+
the evaluator's Jaccard. Summary `sum` = total over the scored types (the quantity reported as 81), `max` = the sum of
|
| 58 |
+
the observed list lengths (the "of 262"), `sum_4type` = T + B + Monocyte + NK. A type is scored when its observed test
|
| 59 |
+
is defined; an arm whose generated test is undefined for a scored type gets overlap 0. Types: T cell, B cell, Monocyte, NK cell, DC
|
| 60 |
+
(aggregates: /home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/imperial_eskd/deg_reference.npz).
|
| 61 |
+
**Broadcast analogue** (`top50_overlap_broadcast`, as `sle_broadcast.py` `broadcast_input_bulk`; not part of the
|
| 62 |
+
published benchmark): the same test on the arm's condition bulk_counts (scoring genes, the 113 + 34
|
| 63 |
+
donors), one whole-PBMC top-50 list, compared with every type's observed list.
|
| 64 |
+
|
| 65 |
+
## Files
|
| 66 |
+
- `per_donor.csv`: one row per arm x donor (all per-donor quantities above).
|
| 67 |
+
- `summary.json`: per arm the donor means / pooled values, provenance (NPZ sha, receipt check, generation metadata,
|
| 68 |
+
Poisson nnz of the whole NPZ, annotation contract), and the reference block (PCA, R2 control).
|
| 69 |
+
- `contrast.csv`: per arm x cell type x statistic (`mean_cp10k`, `pseudobulk_log1p_cpm`: logFC r; `welch_top50_deg`:
|
| 70 |
+
top-50 DEG overlap, T / B / Monocyte / NK / DC; columns of the other kind are empty).
|
| 71 |
+
- `arms/<arm>/labels/` (predict_scanvi.py labels + manifest), `arms/<arm>/generated_cells.parquet` (NPZ row, donor, label,
|
| 72 |
+
UMI on the scoring genes, P/C subsample flag), `arms/<arm>/deg_top50_lists.csv` (observed, generated and broadcast
|
| 73 |
+
top-50 gene lists, Ensembl ids, rank order).
|