Archive 4 checkpoints (1-4)

paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20261003T103040Z-crosscohort-k1000-saturation/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_crosscohort_20261002/scores/imperial_eskd/xcalL_K1000/contrast.csv

@@ -0,0 +1,14 @@
+arm,celltype,statistic,n_genes,r_generated,r_broadcast,partial_r_generated_given_broadcast,r_generated_vs_broadcast,n_case_donors_obs,n_control_donors_obs,n_case_donors_gen,n_control_donors_gen,n_cells_obs,n_cells_gen,deg_scored,top50_overlap,top50_jaccard,obs_top_list_size,gen_top_list_size,n_sig_obs,n_sig_gen,top50_overlap_broadcast,top50_jaccard_broadcast,broadcast_top_list_size,n_sig_broadcast
+xcalL_K1000,T cell,mean_cp10k,3031,0.679505746730158,0.6460056883871542,0.4491214736791483,0.6473840956189109,113,34,113,34,262546,94743,,,,,,,,,,,
+xcalL_K1000,T cell,pseudobulk_log1p_cpm,3031,0.4699757616651817,0.6278742931468452,0.12775367285441583,0.624881088500297,113,34,113,34,262546,94743,,,,,,,,,,,
+xcalL_K1000,B cell,mean_cp10k,3184,0.6075768948480728,0.6444000112635492,0.378550273867686,0.5754843324397473,113,34,113,34,48625,9467,,,,,,,,,,,
+xcalL_K1000,B cell,pseudobulk_log1p_cpm,3184,0.45341963160958537,0.48679841876663843,0.2835717885718594,0.4870103817882968,113,34,113,34,48625,9467,,,,,,,,,,,
+xcalL_K1000,Monocyte,mean_cp10k,2877,0.7443643337131088,0.7473384415110175,0.44393439199705126,0.7235922895834984,112,34,113,34,80851,91028,,,,,,,,,,,
+xcalL_K1000,Monocyte,pseudobulk_log1p_cpm,2877,0.6524102017600409,0.7105252805736285,0.352083887084631,0.654612781499796,112,34,113,34,80851,91028,,,,,,,,,,,
+xcalL_K1000,NK cell,mean_cp10k,2964,0.7254439178559251,0.6691441416025611,0.5080857906180715,0.66044352746935,113,34,113,34,72125,19257,,,,,,,,,,,
+xcalL_K1000,NK cell,pseudobulk_log1p_cpm,2964,0.5116068540756027,0.5970463821595526,0.2569176190489582,0.5742989986066864,113,34,113,34,72125,19257,,,,,,,,,,,
+xcalL_K1000,T cell,welch_top50_deg,5927,,,,,113,34,113,34,262546,94743,True,26,0.35135135135135137,50,50,1057,1120,17,0.20481927710843373,50,2120
+xcalL_K1000,B cell,welch_top50_deg,5927,,,,,113,34,113,34,48625,9467,True,21,0.26582278481012656,50,50,298,421,14,0.16279069767441862,50,2120
+xcalL_K1000,Monocyte,welch_top50_deg,5927,,,,,112,34,113,34,80851,91028,True,26,0.35135135135135137,50,50,349,1430,22,0.28205128205128205,50,2120
+xcalL_K1000,NK cell,welch_top50_deg,5927,,,,,113,34,113,34,72125,19257,True,19,0.2345679012345679,50,50,427,565,16,0.19047619047619047,50,2120
+xcalL_K1000,DC,welch_top50_deg,5927,,,,,113,34,113,34,13572,2827,True,16,0.19047619047619047,50,50,341,234,15,0.17647058823529413,50,2120

paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20261003T103040Z-crosscohort-k1000-saturation/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_crosscohort_20261002/scores/imperial_eskd/xcalL_K1000/per_donor.csv

@@ -0,0 +1,158 @@
+arm,donor,group,n_generated_cells,n_observed_cells,n_reference_cells,gen_T cell,obs_T cell,gen_B cell,obs_B cell,gen_Monocyte,obs_Monocyte,gen_NK cell,obs_NK cell,gen_DC,obs_DC,gen_Other,obs_Other,comp_l1,comp_l1_obs_loo_null,pb_r,pb_own_rank,pb_top1,precision,coverage,precision_depth_matched,coverage_depth_matched,mono_pct_gen,mono_pct_obs,median_umi_gen,median_umi_obs
+xcalL_K1000,C20_1004,covid_positive,1500,1810,150,0.194,0.43425414364640885,0.04066666666666666,0.3994475138121547,0.684,0.03867403314917127,0.062,0.07790055248618785,0.012666666666666666,0.04751381215469613,0.006666666666666667,0.0022099447513812156,1.2995653775322282,0.6005338406000345,0.8212191711530205,117,False,0.8333333333333334,0.3466666666666667,0.8266666666666667,0.36,68.4,3.867403314917127,1735.0,1373.5
+xcalL_K1000,C20_1404,covid_positive,1500,5836,150,0.32,0.4885195339273475,0.04733333333333333,0.2705620287868403,0.5106666666666667,0.015421521590130226,0.11333333333333333,0.204592186429061,0.0013333333333333333,0.016620973269362578,0.007333333333333333,0.004283755997258396,0.9965894448252228,0.377519259206171,0.8292265784445972,125,False,0.8,0.54,0.8333333333333334,0.5866666666666667,51.06666666666667,1.5421521590130227,1387.5,1473.0
+xcalL_K1000,C21_1004,covid_positive,1500,5552,150,0.6566666666666666,0.8982348703170029,0.08733333333333333,0.08609510086455331,0.186,0.0,0.03866666666666667,0.0111671469740634,0.008666666666666666,0.0005403458213256485,0.02266666666666667,0.003962536023054755,0.48313640730067253,0.813335352446266,0.8282532461987807,153,False,0.7,0.4666666666666667,0.7466666666666667,0.5733333333333334,18.6,0.0,1682.5,1563.5
+xcalL_K1000,C21_1704,covid_positive,1500,4570,150,0.31266666666666665,0.7275711159737418,0.14666666666666667,0.2214442013129103,0.4073333333333333,0.004814004376367615,0.030666666666666665,0.022319474835886213,0.011333333333333334,0.011816192560175055,0.09133333333333334,0.012035010940919038,0.9803296863603209,0.6774748884556812,0.8450220461602219,139,False,0.62,0.4533333333333333,0.66,0.64,40.733333333333334,0.48140043763676155,1922.5,2131.0
+xcalL_K1000,C21_2504,covid_positive,1500,5048,150,0.18533333333333332,0.7567353407290016,0.046,0.12361331220285261,0.6906666666666667,0.06220285261489699,0.014,0.039619651347068144,0.012,0.011687797147385102,0.052,0.006141045958795562,1.3492699418911778,0.5401415597460854,0.8476652032280385,48,False,0.7466666666666667,0.4066666666666667,0.7733333333333333,0.5866666666666667,69.06666666666666,6.220285261489699,2575.0,2692.5
+xcalL_K1000,C23_2204,covid_positive,1500,3088,150,0.602,0.685880829015544,0.03933333333333333,0.10362694300518134,0.258,0.06703367875647669,0.06933333333333333,0.11269430051813471,0.016,0.025906735751295335,0.015333333333333332,0.0048575129533678756,0.40288428324697756,0.37947949920467566,0.8822800811259855,36,False,0.92,0.78,0.9266666666666666,0.8533333333333334,25.8,6.703367875647668,1741.5,1936.5
+xcalL_K1000,C31_1304,covid_positive,1500,3525,150,0.7446666666666667,0.782695035460993,0.066,0.1075177304964539,0.12666666666666668,0.007659574468085106,0.03933333333333333,0.07716312056737588,0.016,0.02070921985815603,0.007333333333333333,0.00425531914893617,0.2441702127659575,0.5810203700567228,0.8719349902614474,71,False,0.9333333333333333,0.6333333333333333,0.94,0.66,12.666666666666668,0.7659574468085106,1848.5,1623.0
+xcalL_K1000,C31_2004,covid_positive,1500,2265,150,0.616,0.8004415011037528,0.038,0.08123620309050773,0.25066666666666665,0.039293598233995586,0.05533333333333333,0.05121412803532009,0.03266666666666666,0.022958057395143488,0.007333333333333333,0.004856512141280353,0.455355408388521,0.6165133013422425,0.877530242317162,70,False,0.82,0.6466666666666666,0.86,0.6866666666666666,25.066666666666666,3.9293598233995586,1855.0,1910.0
+xcalL_K1000,C31_2704,covid_positive,1500,4200,150,0.5786666666666667,0.7042857142857143,0.04133333333333333,0.08023809523809523,0.24133333333333334,0.08714285714285715,0.108,0.09857142857142857,0.021333333333333333,0.025952380952380952,0.009333333333333334,0.0038095238095238095,0.33828571428571436,0.42420172770616554,0.884599263989725,18,False,0.84,0.8066666666666666,0.88,0.7733333333333333,24.133333333333333,8.714285714285715,1708.5,1704.0
+xcalL_K1000,C33_1401,covid_positive,1500,3983,150,0.384,0.38890283705749434,0.005333333333333333,0.016570424303288978,0.41733333333333333,0.11172483052975145,0.18666666666666668,0.464474014561888,0.0013333333333333333,0.014310820989204118,0.005333333333333333,0.004017072558373086,0.6138495271570842,0.6015977414820979,0.8615806637075811,28,False,0.8266666666666667,0.6666666666666666,0.86,0.7133333333333334,41.733333333333334,11.172483052975144,1193.5,909.0
+xcalL_K1000,C33_1601,covid_positive,1500,395,150,0.30866666666666664,0.14430379746835442,0.004666666666666667,0.11645569620253164,0.472,0.2,0.21,0.5240506329113924,0.002,0.007594936708860759,0.0026666666666666666,0.007594936708860759,0.8727257383966245,0.781467701292667,0.8378156210226549,94,False,0.84,0.8133333333333334,0.8666666666666667,0.7866666666666666,47.199999999999996,20.0,1331.0,644.0
+xcalL_K1000,C33_1901,covid_positive,1500,1947,150,0.262,0.3754494093477144,0.0026666666666666666,0.042116076014381096,0.43,0.12223934257832562,0.2926666666666667,0.43656908063687727,0.002,0.01078582434514638,0.010666666666666666,0.012840267077555213,0.6155213148433487,0.5457878736320764,0.8579145439649886,36,False,0.8933333333333333,0.78,0.8933333333333333,0.7933333333333333,43.0,12.223934257832562,1363.5,897.0
+xcalL_K1000,C34_1404,covid_positive,1500,2483,150,0.318,0.8771647200966572,0.037333333333333336,0.01973419250906162,0.5826666666666667,0.016915022150624244,0.028666666666666667,0.07047925896093435,0.021333333333333333,0.011679420056383408,0.012,0.004027386226339106,1.2019546247818498,0.7709669223771655,0.8350211762036386,124,False,0.7866666666666666,0.5666666666666667,0.8533333333333334,0.5933333333333334,58.266666666666666,1.6915022150624244,2118.0,1720.0
+xcalL_K1000,C34_2104,covid_positive,1500,2808,150,0.37,0.7916666666666666,0.03666666666666667,0.024216524216524215,0.5206666666666667,0.041666666666666664,0.028666666666666667,0.12428774928774929,0.03133333333333333,0.013888888888888888,0.012666666666666666,0.004273504273504274,1.0345754985754985,0.5999708155171841,0.8607596936804149,85,False,0.9066666666666666,0.7,0.9266666666666666,0.7866666666666666,52.06666666666667,4.166666666666666,2097.5,2067.5
+xcalL_K1000,C34_2504,covid_positive,1500,1945,150,0.49066666666666664,0.6961439588688946,0.027333333333333334,0.024678663239074552,0.386,0.12544987146529563,0.059333333333333335,0.12904884318766066,0.028666666666666667,0.02416452442159383,0.008,0.0005141388174807198,0.5503856041131105,0.40892539992164,0.8860870436155176,21,False,0.8866666666666667,0.7,0.92,0.7733333333333333,38.6,12.544987146529563,1968.0,2111.0
+xcalL_K1000,C36_1504,covid_positive,1500,4765,150,0.392,0.7643231899265478,0.028666666666666667,0.14144805876180483,0.4493333333333333,0.03546694648478489,0.094,0.030640083945435468,0.016,0.01951731374606506,0.02,0.008604407135362015,0.9772437915355019,0.5893382201890965,0.8426603795354434,108,False,0.88,0.6866666666666666,0.94,0.7533333333333333,44.93333333333333,3.546694648478489,1730.5,1747.0
+xcalL_K1000,C36_1704,covid_positive,1500,1554,150,0.5286666666666666,0.842985842985843,0.03266666666666666,0.07335907335907337,0.29933333333333334,0.014800514800514801,0.11533333333333333,0.0546975546975547,0.017333333333333333,0.010296010296010296,0.006666666666666667,0.003861003861003861,0.7100231660231662,0.7027427978748242,0.8448589221966609,111,False,0.8466666666666667,0.5066666666666667,0.9066666666666666,0.56,29.933333333333334,1.4800514800514801,1593.0,2044.5
+xcalL_K1000,C36_2104,covid_positive,1500,1086,150,0.6153333333333333,0.7679558011049724,0.02266666666666667,0.09668508287292818,0.29333333333333333,0.05432780847145488,0.04066666666666666,0.06353591160220995,0.016666666666666666,0.011970534069981584,0.011333333333333334,0.0055248618784530384,0.49902025782688775,0.552682714113083,0.8623227440028581,79,False,0.9066666666666666,0.54,0.9066666666666666,0.6533333333333333,29.333333333333332,5.432780847145488,1780.0,1851.0
+xcalL_K1000,C40_1504,covid_positive,1500,5482,150,0.332,0.7433418460415907,0.03666666666666667,0.09649762860269974,0.5366666666666666,0.05600145932141554,0.07066666666666667,0.09157241882524626,0.014,0.009668004377964246,0.01,0.002918642831083546,0.9841571202724066,0.4967961170529107,0.8655528667387089,52,False,0.8066666666666666,0.35333333333333333,0.7866666666666666,0.4,53.666666666666664,5.6001459321415545,1698.0,1253.5
+xcalL_K1000,C40_2204,covid_positive,1500,975,150,0.4726666666666667,0.6933333333333334,0.06733333333333333,0.13538461538461538,0.31733333333333336,0.028717948717948718,0.11,0.12923076923076923,0.008,0.010256410256410256,0.024666666666666667,0.003076923076923077,0.6204102564102566,0.4280166763557205,0.8516414667945734,131,False,0.8333333333333334,0.3,0.86,0.42,31.733333333333334,2.871794871794872,1644.0,1808.0
+xcalL_K1000,C40_0105,covid_positive,1500,8728,150,0.2986666666666667,0.42587076076993585,0.029333333333333333,0.036778185151237396,0.6166666666666667,0.4643675527039413,0.030666666666666665,0.05728689275893675,0.013333333333333334,0.013175985334555454,0.011333333333333334,0.0025206232813932174,0.3225383440268867,0.5909469296575621,0.8899657615903478,3,False,0.86,0.6,0.8933333333333333,0.6866666666666666,61.66666666666667,46.43675527039413,2097.5,1862.0
+xcalL_K1000,C42_1504,covid_positive,1500,2762,150,0.4766666666666667,0.7320782041998551,0.02,0.13613323678493844,0.428,0.020275162925416364,0.05333333333333334,0.0894279507603186,0.015333333333333332,0.013758146270818247,0.006666666666666667,0.00832729905865315,0.8186000482741973,0.5141600776933539,0.8233112492791593,142,False,0.6,0.30666666666666664,0.6133333333333333,0.38,42.8,2.0275162925416366,1397.5,1302.0
+xcalL_K1000,C42_2204,covid_positive,1500,4970,150,0.5786666666666667,0.8511066398390342,0.03,0.06317907444668008,0.328,0.035211267605633804,0.04733333333333333,0.035211267605633804,0.011333333333333334,0.012072434607645875,0.004666666666666667,0.0032193158953722333,0.6127162977867204,0.7197827632523519,0.871187658972307,37,False,0.7533333333333333,0.26666666666666666,0.8066666666666666,0.32666666666666666,32.800000000000004,3.5211267605633805,1816.0,1462.0
+xcalL_K1000,C42_2704,covid_positive,1500,8918,150,0.49266666666666664,0.8535546086566494,0.03133333333333333,0.04619869925992375,0.39866666666666667,0.036891679748822605,0.05,0.054047992823503026,0.014,0.006391567616057412,0.013333333333333334,0.0029154518950437317,0.7596026014801525,0.7246787008875823,0.8611710494458704,79,False,0.7866666666666666,0.22,0.8133333333333334,0.26,39.86666666666667,3.6891679748822606,1758.0,1489.0
+xcalL_K1000,C58_1604,covid_negative,1500,265,132,0.5333333333333333,0.7018867924528301,0.010666666666666666,0.04150943396226415,0.33866666666666667,0.0037735849056603774,0.10866666666666666,0.2188679245283019,0.0026666666666666666,0.01509433962264151,0.006,0.018867924528301886,0.6697861635220126,0.51846072438743,0.801784870316776,153,False,0.8712121212121212,0.7196969696969697,0.9090909090909091,0.8257575757575758,33.86666666666667,0.37735849056603776,1462.5,1285.0
+xcalL_K1000,C58_2501,covid_positive,1500,1671,150,0.30333333333333334,0.42848593656493117,0.006666666666666667,0.0353081986834231,0.602,0.31717534410532616,0.050666666666666665,0.15320167564332735,0.024666666666666667,0.05326152004787552,0.012666666666666666,0.012567324955116697,0.5698479952124476,0.3470110787273232,0.8732120936443912,19,False,0.9133333333333333,0.9266666666666666,0.9,0.8666666666666667,60.199999999999996,31.717534410532615,2139.5,700.0
+xcalL_K1000,C58_2901,covid_positive,1500,1615,150,0.5286666666666666,0.6179566563467492,0.01,0.03653250773993808,0.36733333333333335,0.17956656346749225,0.074,0.10835913312693499,0.01,0.03219814241486068,0.01,0.025386996904024767,0.37553353973168224,0.29693957301769275,0.8677744626005671,40,False,0.8866666666666667,0.8666666666666667,0.92,0.8133333333333334,36.733333333333334,17.956656346749224,1772.0,882.0
+xcalL_K1000,C58_0102,covid_positive,1500,972,150,0.6693333333333333,0.5339506172839507,0.014666666666666666,0.027777777777777776,0.2633333333333333,0.2880658436213992,0.030666666666666665,0.11316872427983539,0.012,0.03292181069958848,0.01,0.00411522633744856,0.2825349794238683,0.32547969346416367,0.8737578282835035,37,False,0.8733333333333333,0.94,0.9,0.8933333333333333,26.333333333333332,28.80658436213992,1765.5,749.0
+xcalL_K1000,C58_0402,covid_positive,1500,9254,150,0.7006666666666667,0.4245731575534904,0.007333333333333333,0.01988329371082775,0.19266666666666668,0.4091203803760536,0.078,0.11681435055111303,0.011333333333333334,0.02485411713853469,0.01,0.004754700669980549,0.5626776168863915,0.4845732068994056,0.8836556056553698,10,False,0.9133333333333333,0.8733333333333333,0.9466666666666667,0.8533333333333334,19.26666666666667,40.912038037605356,1686.5,1006.0
+xcalL_K1000,C58_1003,recovery,1500,4918,150,0.5513333333333333,0.5917039446929646,0.030666666666666665,0.02745018300122001,0.3373333333333333,0.1691744611630744,0.052,0.14721431476209842,0.019333333333333334,0.05612037413582757,0.009333333333333334,0.008336722244814965,0.3447439338484479,0.24960071023802022,0.8642179219965984,29,False,0.8066666666666666,0.9,0.84,0.7933333333333333,33.733333333333334,16.917446116307442,1574.0,745.5
+xcalL_K1000,C60_2504,covid_positive,1500,1837,150,0.484,0.8911268372346217,0.04666666666666667,0.05443658138268917,0.30866666666666664,0.00979858464888405,0.12933333333333333,0.032117583015786606,0.007333333333333333,0.009254218835057159,0.024,0.00326619488296135,0.833635274904736,0.7926028747225629,0.8449888353580572,136,False,0.7466666666666667,0.38,0.8,0.4,30.866666666666664,0.979858464888405,1207.5,1187.0
+xcalL_K1000,C63_1704,covid_positive,1500,3305,150,0.2906666666666667,0.7718608169440242,0.025333333333333333,0.11981845688350984,0.6186666666666667,0.013010590015128594,0.04533333333333334,0.08199697428139183,0.006666666666666667,0.006959152798789713,0.013333333333333334,0.006354009077155824,1.2252708018154312,0.5597214025715005,0.8080924166126483,152,False,0.76,0.21333333333333335,0.7666666666666667,0.31333333333333335,61.86666666666667,1.3010590015128594,2001.5,1364.0
+xcalL_K1000,C63_2404,covid_positive,1500,2143,150,0.47,0.6971535230984601,0.06933333333333333,0.1675221651889874,0.308,0.0377974801679888,0.09133333333333334,0.08726084927671489,0.024666666666666667,0.007932804479701353,0.03666666666666667,0.0023331777881474567,0.6506847099082282,0.5057142314913275,0.8597750582456759,112,False,0.8666666666666667,0.26666666666666666,0.8933333333333333,0.3,30.8,3.7797480167988797,2158.0,1596.0
+xcalL_K1000,C63_2904,covid_positive,1500,1684,150,0.47933333333333333,0.6775534441805225,0.104,0.14251781472684086,0.29933333333333334,0.08491686460807601,0.07066666666666667,0.0855106888361045,0.017333333333333333,0.007719714964370546,0.029333333333333333,0.0017814726840855108,0.5031638954869359,0.4165053727311593,0.8773077402553822,53,False,0.8933333333333333,0.44,0.9066666666666666,0.5,29.933333333333334,8.491686460807601,2253.0,1647.5
+xcalL_K1000,C65_1704,covid_positive,1500,1117,150,0.26866666666666666,0.5264100268576545,0.028666666666666667,0.13070725156669652,0.56,0.03670546105640107,0.13466666666666666,0.2909579230080573,0.0026666666666666666,0.009847806624888093,0.005333333333333333,0.005371530886302597,1.046589077887198,0.33049285491578545,0.8334055325541692,111,False,0.8266666666666667,0.4666666666666667,0.8266666666666667,0.5333333333333333,56.00000000000001,3.670546105640107,1366.0,1042.0
+xcalL_K1000,C65_2104,covid_positive,1500,274,137,0.13466666666666666,0.5766423357664233,0.035333333333333335,0.20802919708029197,0.7733333333333333,0.014598540145985401,0.03933333333333333,0.19343065693430658,0.0033333333333333335,0.0036496350364963502,0.014,0.0036496350364963502,1.5381703163017033,0.3905468316130126,0.7727976802437155,154,False,0.7737226277372263,0.36496350364963503,0.8102189781021898,0.5547445255474452,77.33333333333333,1.4598540145985401,2751.0,1266.0
+xcalL_K1000,C65_2504,covid_positive,1500,1069,150,0.436,0.6623012160898035,0.08266666666666667,0.11412535079513564,0.338,0.031805425631431246,0.082,0.16931711880261927,0.006666666666666667,0.002806361085126286,0.05466666666666667,0.019644527595884004,0.6901540380417835,0.3451007726503511,0.8594577124121046,102,False,0.6866666666666666,0.4266666666666667,0.7266666666666667,0.6266666666666667,33.800000000000004,3.1805425631431246,1462.5,2137.0
+xcalL_K1000,C69_1804,covid_negative,1500,6901,150,0.48533333333333334,0.819591363570497,0.009333333333333334,0.028546587451094046,0.37733333333333335,0.0585422402550355,0.10533333333333333,0.04637009129111723,0.012,0.03231415736849732,0.010666666666666666,0.014635560063758875,0.7555086702410277,0.6531972982365499,0.867046271278248,45,False,0.9066666666666666,0.5666666666666667,0.9266666666666666,0.6066666666666667,37.733333333333334,5.85422402550355,1742.0,1211.0
+xcalL_K1000,C82_2504,covid_positive,1500,7154,150,0.288,0.8433044450656975,0.015333333333333332,0.03228962818003914,0.5846666666666667,0.047246295778585405,0.06933333333333333,0.037042214145932346,0.018666666666666668,0.030192899077439196,0.024,0.009924517752306402,1.1675739446463516,0.6963449827928051,0.8272885314336231,117,False,0.8733333333333333,0.5333333333333333,0.86,0.5466666666666666,58.46666666666667,4.724629577858541,1910.0,1210.0
+xcalL_K1000,C85_2004,covid_negative,1500,3618,150,0.20066666666666666,0.6199557766721946,0.005333333333333333,0.026810392482034272,0.6666666666666666,0.15201768933112217,0.07933333333333334,0.12493090105030404,0.020666666666666667,0.039524599226091764,0.027333333333333334,0.03676064123825318,1.029297954671089,0.3104138363519918,0.855392240417699,24,False,0.84,0.62,0.9133333333333333,0.6066666666666667,66.66666666666666,15.201768933112216,2041.0,1463.5
+xcalL_K1000,C93_2104,covid_positive,1500,5003,150,0.18933333333333333,0.5098940635618628,0.009333333333333334,0.06516090345792525,0.6766666666666666,0.15790525684589246,0.08266666666666667,0.23246052368578854,0.03133333333333333,0.029982010793523885,0.010666666666666666,0.004597241655006996,1.0523643147444868,0.15328921446319485,0.8598641380804354,25,False,0.8466666666666667,0.78,0.8733333333333333,0.7666666666666667,67.66666666666666,15.790525684589246,2199.0,1416.0
+xcalL_K1000,C93_2704,covid_positive,1500,6623,150,0.388,0.4635361618601842,0.007333333333333333,0.031103729427751775,0.438,0.22044390759474558,0.13866666666666666,0.26256983240223464,0.013333333333333334,0.018873622225577532,0.014666666666666666,0.003472746489506266,0.4575000251648296,0.2926458277760775,0.8896649916019008,4,False,0.92,0.78,0.9333333333333333,0.7666666666666667,43.8,22.04439075947456,1853.0,1439.0
+xcalL_K1000,C93_0405,covid_positive,1500,5527,150,0.48,0.47421747783607743,0.004666666666666667,0.03057716663651167,0.2753333333333333,0.2131355165550932,0.20533333333333334,0.2529401121765877,0.02,0.026777637054459923,0.014666666666666666,0.0023520897412701285,0.16058983173511848,0.25876960524547876,0.8935882977607661,1,True,0.9333333333333333,0.74,0.9466666666666667,0.7466666666666667,27.53333333333333,21.31355165550932,1612.0,1471.0
+xcalL_K1000,C101_0601,covid_positive,1500,344,150,0.372,0.6482558139534884,0.021333333333333333,0.03197674418604651,0.5053333333333333,0.14825581395348839,0.08733333333333333,0.09302325581395349,0.006666666666666667,0.0377906976744186,0.007333333333333333,0.040697674418604654,0.7141550387596899,0.36624864124128725,0.8446968846250773,95,False,0.76,0.36,0.78,0.7133333333333334,50.53333333333333,14.825581395348838,1364.0,1309.0
+xcalL_K1000,C101_1101,covid_positive,1500,566,150,0.222,0.27385159010600707,0.02666666666666667,0.04770318021201413,0.682,0.5106007067137809,0.058666666666666666,0.06537102473498234,0.005333333333333333,0.07420494699646643,0.005333333333333333,0.028268551236749116,0.3427985865724383,0.8127869412012583,0.8599638181002109,16,False,0.82,0.76,0.86,0.8066666666666666,68.2,51.060070671378085,2036.0,1003.0
+xcalL_K1000,C101_1301,covid_positive,1500,2035,150,0.31866666666666665,0.3154791154791155,0.024666666666666667,0.05110565110565111,0.5766666666666667,0.4692874692874693,0.050666666666666665,0.057985257985257985,0.006,0.05847665847665848,0.023333333333333334,0.047665847665847666,0.2211334971334971,0.7374984821672163,0.8656701137871863,19,False,0.8066666666666666,0.7533333333333333,0.8266666666666667,0.74,57.666666666666664,46.928746928746925,1947.0,875.0
+xcalL_K1000,C101_1801,covid_positive,1500,1555,150,0.3893333333333333,0.3562700964630225,0.04533333333333334,0.3762057877813505,0.48,0.12861736334405144,0.04,0.03858520900321544,0.010666666666666666,0.028938906752411574,0.034666666666666665,0.07138263665594856,0.7717213290460878,0.6305738375176237,0.8451567249070873,115,False,0.8,0.64,0.8333333333333334,0.6133333333333333,48.0,12.861736334405144,2037.0,806.0
+xcalL_K1000,C101_2001,covid_positive,1500,2130,150,0.37533333333333335,0.4765258215962441,0.026,0.2051643192488263,0.5213333333333333,0.22253521126760564,0.05533333333333333,0.05539906103286385,0.006,0.022535211267605635,0.016,0.01784037558685446,0.5975962441314553,0.29917206990666134,0.8561456308047887,55,False,0.78,0.8266666666666667,0.8466666666666667,0.7866666666666666,52.13333333333333,22.253521126760564,1797.0,882.0
+xcalL_K1000,C101_2502,recovery,1500,587,150,0.12666666666666668,0.424190800681431,0.004,0.06132879045996593,0.726,0.3679727427597956,0.09133333333333334,0.05792163543441227,0.009333333333333334,0.07836456558773425,0.042666666666666665,0.010221465076660987,0.8477683134582622,0.5063120176111204,0.860578268865067,16,False,0.8,0.8933333333333333,0.84,0.8866666666666667,72.6,36.79727427597956,2023.0,822.0
+xcalL_K1000,C103_2204,covid_negative,1500,8742,150,0.5046666666666667,0.5037748798901853,0.020666666666666667,0.06394417753374514,0.28,0.2772820864790666,0.16333333333333333,0.1261725005719515,0.012666666666666666,0.0263097689315946,0.018666666666666668,0.0025165865934568747,0.11384122626401283,0.23055484626896006,0.8775916276601579,13,False,0.92,0.5266666666666666,0.9066666666666666,0.5533333333333333,28.000000000000004,27.728208647906662,1640.0,1718.0
+xcalL_K1000,C104_2204,covid_negative,1500,11388,150,0.5686666666666667,0.29004214963119074,0.01,0.03898840885142255,0.248,0.4137688795223042,0.14666666666666667,0.18580962416578856,0.02,0.06840533895328416,0.006666666666666667,0.002985598876009835,0.5646111696522654,0.6015953960674094,0.8899835874554597,4,False,0.8733333333333333,0.6466666666666666,0.9466666666666667,0.66,24.8,41.37688795223042,1490.0,1965.5
+xcalL_K1000,C106_2204,covid_negative,1500,9233,150,0.656,0.6097693057511101,0.016,0.036824434095093686,0.174,0.19451965774937724,0.13533333333333333,0.10733239467128777,0.012666666666666666,0.047980071482725005,0.006,0.003574136250406152,0.15331499332105863,0.3128768301278175,0.892008224788826,10,False,0.9066666666666666,0.3333333333333333,0.9333333333333333,0.38666666666666666,17.4,19.451965774937722,1684.5,1796.0
+xcalL_K1000,C108_2204,covid_negative,1500,1839,150,0.7213333333333334,0.6688417618270799,0.022,0.0032626427406199023,0.144,0.03806416530723219,0.09666666666666666,0.25502990755845567,0.008666666666666666,0.021750951604132682,0.007333333333333333,0.013050570962479609,0.35432952691680264,0.5209086508610423,0.8707703582018869,66,False,0.8533333333333334,0.92,0.88,0.9666666666666667,14.399999999999999,3.8064165307232187,1848.0,1341.0
+xcalL_K1000,C108_1501,covid_positive,1500,1488,150,0.30133333333333334,0.2956989247311828,0.016666666666666666,0.016129032258064516,0.5453333333333333,0.21841397849462366,0.12066666666666667,0.41935483870967744,0.006666666666666667,0.04032258064516129,0.009333333333333334,0.010080645161290322,0.6661827956989248,0.6277731013291346,0.8564563673382001,57,False,0.8,0.7066666666666667,0.8666666666666667,0.74,54.53333333333333,21.841397849462364,1438.0,863.0
+xcalL_K1000,C108_1801,covid_positive,1500,806,150,0.43266666666666664,0.2853598014888337,0.020666666666666667,0.07568238213399504,0.45,0.08560794044665013,0.08933333333333333,0.47890818858560796,0.0033333333333333335,0.04466501240694789,0.004,0.02977667493796526,1.0233978494623657,0.6914805491444265,0.82626846099735,136,False,0.8333333333333334,0.7066666666666667,0.84,0.6333333333333333,45.0,8.560794044665013,1323.0,676.0
+xcalL_K1000,C108_2201,covid_positive,1500,696,150,0.3333333333333333,0.2988505747126437,0.02666666666666667,0.041666666666666664,0.5546666666666666,0.09195402298850575,0.06133333333333333,0.5100574712643678,0.006666666666666667,0.021551724137931036,0.017333333333333333,0.035919540229885055,0.9943908045977011,0.7372693269726317,0.8370845493674971,111,False,0.76,0.58,0.8133333333333334,0.8066666666666666,55.46666666666666,9.195402298850574,1788.5,1399.5
+xcalL_K1000,C113_0605,covid_positive,1500,3274,150,0.06,0.6053756872327428,0.005333333333333333,0.14141722663408673,0.8913333333333333,0.032376298106292,0.018,0.03512522907758094,0.01,0.030849114233353694,0.015333333333333332,0.1548564447159438,1.717914070454083,0.5460525974637085,0.8024965108961232,104,False,0.92,0.62,0.8933333333333333,0.66,89.13333333333333,3.2376298106292003,3406.0,2026.0
+xcalL_K1000,C123_2404,covid_positive,1500,3758,150,0.2753333333333333,0.5516232038318254,0.011333333333333334,0.04922831293241086,0.5293333333333333,0.08541777541245343,0.148,0.271953166577967,0.005333333333333333,0.032730175625332626,0.030666666666666665,0.009047365620010643,0.9310697179350718,0.3198850599491083,0.8510007392297732,72,False,0.82,0.34,0.84,0.49333333333333335,52.93333333333333,8.541777541245343,1485.5,1299.0
+xcalL_K1000,C123_2904,covid_positive,1500,3252,150,0.3446666666666667,0.49231242312423124,0.026,0.07380073800738007,0.56,0.19034440344403444,0.034666666666666665,0.22478474784747848,0.009333333333333334,0.01107011070110701,0.025333333333333333,0.007687576875768758,0.7746027060270603,0.1548493916401909,0.8756610384235369,15,False,0.7933333333333333,0.29333333333333333,0.8266666666666667,0.36666666666666664,56.00000000000001,19.034440344403443,2164.0,1489.0
+xcalL_K1000,C123_0505,covid_positive,1500,2266,150,0.102,0.4854368932038835,0.005333333333333333,0.05383936451897617,0.8493333333333334,0.27184466019417475,0.019333333333333334,0.13901147396293026,0.010666666666666666,0.025154457193292144,0.013333333333333334,0.02471315092674316,1.154977346278317,0.2265674044866473,0.8424570045110681,29,False,0.86,0.38,0.88,0.5133333333333333,84.93333333333334,27.184466019417474,3291.0,1849.0
+xcalL_K1000,C124_2404,covid_positive,1500,2290,150,0.24533333333333332,0.5100436681222708,0.018,0.18777292576419213,0.6633333333333333,0.08340611353711791,0.04066666666666666,0.19519650655021833,0.004666666666666667,0.017903930131004366,0.028,0.005676855895196507,1.2045007278020379,0.2180274260105741,0.8296252618074881,103,False,0.8133333333333334,0.20666666666666667,0.7866666666666666,0.24,66.33333333333333,8.340611353711791,2341.0,1635.0
+xcalL_K1000,C124_2704,covid_positive,1500,4137,150,0.3333333333333333,0.5112400290065264,0.023333333333333334,0.11965192168237854,0.5173333333333333,0.06961566352429296,0.066,0.27870437515107566,0.012,0.015711868503746677,0.048,0.005076142131979695,0.9812830553541214,0.2511938768171729,0.8462268291024518,102,False,0.8666666666666667,0.14666666666666667,0.8866666666666667,0.16666666666666666,51.733333333333334,6.961566352429297,1964.5,1328.0
+xcalL_K1000,C124_0105,covid_positive,1500,5245,150,0.346,0.5548141086749285,0.012,0.07740705433746425,0.49733333333333335,0.06444232602478552,0.098,0.25681601525262154,0.012,0.041182078169685415,0.034666666666666665,0.005338417540514776,0.9244385128693995,0.31481242307974516,0.8553112672565394,66,False,0.8466666666666667,0.36666666666666664,0.8266666666666667,0.4066666666666667,49.733333333333334,6.444232602478552,1776.5,1944.0
+xcalL_K1000,C126_2504,covid_positive,1500,8159,150,0.4713333333333333,0.5618335580340728,0.09133333333333334,0.056992278465498224,0.32066666666666666,0.2332393675695551,0.06866666666666667,0.11177840421620297,0.023333333333333334,0.028925113371736734,0.024666666666666667,0.0072312783429341835,0.27840748457735826,0.2603494332735336,0.8917679688335066,11,False,0.8266666666666667,0.16666666666666666,0.86,0.21333333333333335,32.06666666666666,23.32393675695551,2079.0,1410.0
+xcalL_K1000,C126_3004,covid_positive,1500,7181,150,0.53,0.743629021027712,0.08266666666666667,0.05848767581116836,0.266,0.05082857540732488,0.082,0.1211530427517059,0.021333333333333333,0.0181033282272664,0.018,0.007798356774822448,0.5055641275588357,0.49756015350471244,0.8715275442802088,77,False,0.9,0.30666666666666664,0.88,0.32666666666666666,26.6,5.082857540732489,2055.5,1641.0
+xcalL_K1000,C126_0605,covid_positive,1500,6577,150,0.548,0.5716892200091227,0.048666666666666664,0.11023262885814201,0.242,0.08712178804926259,0.13133333333333333,0.16618519081648167,0.02266666666666667,0.055648471947696516,0.007333333333333333,0.009122700319294512,0.3097564239014748,0.20450342889728762,0.8842496699279423,36,False,0.88,0.2733333333333333,0.8933333333333333,0.2866666666666667,24.2,8.712178804926259,1831.0,1620.0
+xcalL_K1000,C127_2504,covid_positive,1500,2691,150,0.2753333333333333,0.6648086213303604,0.029333333333333333,0.10999628390932739,0.588,0.03121516164994426,0.07066666666666667,0.18097361575622445,0.006666666666666667,0.00966183574879227,0.03,0.0033444816053511705,1.166880713489409,0.36079884603870843,0.8249604302854996,134,False,0.7666666666666667,0.42,0.8266666666666667,0.5,58.8,3.121516164994426,1868.0,1559.0
+xcalL_K1000,C127_0405,covid_positive,1500,9080,150,0.586,0.4183920704845815,0.03,0.07444933920704846,0.246,0.24295154185022028,0.11066666666666666,0.24295154185022028,0.01,0.018502202643171806,0.017333333333333333,0.0027533039647577094,0.3704728340675477,0.2941732061192095,0.8781309179961652,13,False,0.8733333333333333,0.3333333333333333,0.92,0.36666666666666664,24.6,24.295154185022028,1671.5,1270.0
+xcalL_K1000,C127_1105,covid_positive,1500,5124,150,0.624,0.5739656518345043,0.030666666666666665,0.09543325526932084,0.202,0.14910226385636222,0.12666666666666668,0.1649102263856362,0.006,0.01522248243559719,0.010666666666666666,0.001366120218579235,0.2244652615144418,0.15537646115178447,0.8786050366145092,28,False,0.9266666666666666,0.5266666666666666,0.9333333333333333,0.5466666666666666,20.200000000000003,14.910226385636221,1680.5,1529.5
+xcalL_K1000,C128_2504,covid_positive,1500,4306,150,0.4093333333333333,0.6421272642823966,0.025333333333333333,0.06618671620993961,0.43866666666666665,0.1692986530422666,0.116,0.09939619136089178,0.005333333333333333,0.02275894101254064,0.005333333333333333,0.00023223409196470042,0.5821458430097538,0.2975374112659422,0.8739251969673477,23,False,0.72,0.4266666666666667,0.8066666666666666,0.5533333333333333,43.86666666666667,16.92986530422666,1254.5,1385.5
+xcalL_K1000,C128_0405,covid_positive,1500,4498,150,0.3433333333333333,0.7550022232103157,0.05,0.13361493997332147,0.40066666666666667,0.053357047576700754,0.192,0.048910626945309024,0.0026666666666666666,0.007114273010226767,0.011333333333333334,0.0020008892841262785,0.9994628723877279,0.5506825877455215,0.8475130866377774,105,False,0.8533333333333334,0.25333333333333335,0.8933333333333333,0.25333333333333335,40.06666666666667,5.335704757670076,1436.0,1437.0
+xcalL_K1000,C128_1105,covid_positive,1500,6655,150,0.488,0.7095416979714501,0.014,0.04552967693463561,0.30866666666666664,0.15251690458302028,0.15133333333333332,0.05875281743050338,0.016,0.03215627347858753,0.022,0.0015026296018031556,0.5384552967693463,0.43567687048564524,0.8764455549814928,34,False,0.8333333333333334,0.5466666666666666,0.9066666666666666,0.62,30.866666666666664,15.251690458302027,1618.5,1871.0
+xcalL_K1000,C132_2804,covid_positive,1500,5471,150,0.764,0.7344178395174557,0.06866666666666667,0.13087186985925792,0.11466666666666667,0.021568269055017363,0.04,0.09376713580698227,0.008,0.01772984829098885,0.004666666666666667,0.0016450374702979345,0.2514043745811248,0.5055208180623455,0.8723166584800204,44,False,0.9066666666666666,0.88,0.9066666666666666,0.8466666666666667,11.466666666666667,2.1568269055017364,1716.0,1362.0
+xcalL_K1000,C132_0205,covid_positive,1500,4671,150,0.7333333333333333,0.6112181545707557,0.051333333333333335,0.11432241490044959,0.15733333333333333,0.08948833226289873,0.04066666666666666,0.13680154142581888,0.012,0.046242774566473986,0.005333333333333333,0.0019267822736030828,0.3867334617854849,0.26628528318265066,0.8724188017693894,41,False,0.9133333333333333,0.7333333333333333,0.9333333333333333,0.7666666666666667,15.733333333333333,8.948833226289873,1659.5,1457.0
+xcalL_K1000,C132_1105,covid_positive,1500,4699,150,0.7233333333333334,0.6814215790593743,0.104,0.19472228133645456,0.10066666666666667,0.04618003830602256,0.06066666666666667,0.06873802936795063,0.009333333333333334,0.007022770802298362,0.002,0.001915301127899553,0.19758728807547715,0.527229120100576,0.8798968139016778,29,False,0.88,0.6733333333333333,0.8666666666666667,0.7333333333333333,10.066666666666666,4.618003830602256,1827.0,1737.0
+xcalL_K1000,C137_3004,covid_negative,1500,4387,150,0.6133333333333333,0.5030772737633918,0.04533333333333334,0.10987007066332345,0.286,0.2227034419876909,0.035333333333333335,0.1395030772737634,0.014666666666666666,0.019603373603829497,0.005333333333333333,0.005242762708000912,0.3472863764151659,0.11963189510488427,0.8809017775478895,17,False,0.8733333333333333,0.84,0.88,0.7866666666666666,28.599999999999998,22.27034419876909,1552.0,1107.0
+xcalL_K1000,C137_2502,recovery,1500,2012,150,0.39,0.5690854870775348,0.027333333333333334,0.17047713717693838,0.5086666666666667,0.12326043737574553,0.050666666666666665,0.11381709741550695,0.008666666666666666,0.003976143141153081,0.014666666666666666,0.019383697813121274,0.7801935056328695,0.25758501614345397,0.8592593997791517,56,False,0.8266666666666667,0.9266666666666666,0.8133333333333334,0.9266666666666666,50.866666666666674,12.326043737574553,1781.5,1359.5
+xcalL_K1000,C138_3004,covid_negative,1500,1909,150,0.43333333333333335,0.34468308014667365,0.013333333333333334,0.025144054478784705,0.42133333333333334,0.3609219486642221,0.102,0.1959140911471975,0.019333333333333334,0.06862231534834992,0.010666666666666666,0.004714510214772132,0.31002758861533086,0.5280203456794647,0.8876784019517764,7,False,0.8533333333333334,0.92,0.8866666666666667,0.9133333333333333,42.13333333333333,36.09219486642221,1597.0,1398.0
+xcalL_K1000,C138_2301,covid_positive,1500,964,150,0.2806666666666667,0.38278008298755184,0.016,0.0508298755186722,0.6093333333333333,0.12033195020746888,0.07666666666666666,0.3153526970954357,0.008,0.03734439834024896,0.009333333333333334,0.09336099585062241,0.9780027662517288,0.47023776039422216,0.854138620510728,61,False,0.8066666666666666,0.62,0.8333333333333334,0.68,60.93333333333333,12.033195020746888,1558.0,1072.0
+xcalL_K1000,C138_3001,covid_positive,1500,731,150,0.04,0.12311901504787962,0.004,0.08207934336525308,0.9233333333333333,0.4008207934336525,0.020666666666666667,0.27359781121751026,0.002,0.02188782489740082,0.01,0.09849521203830369,1.0450250797993617,0.8571674196925764,0.8245898882928125,30,False,0.8533333333333334,0.7,0.8733333333333333,0.78,92.33333333333333,40.08207934336525,3116.0,1223.0
+xcalL_K1000,C138_0202,covid_positive,1500,2861,150,0.112,0.2153093324012583,0.006666666666666667,0.0740999650471863,0.8346666666666667,0.5159035302341839,0.024666666666666667,0.1422579517651171,0.011333333333333334,0.04194337644180356,0.010666666666666666,0.01048584411045089,0.6378879179773972,0.7283493345710331,0.857108824862499,10,False,0.8466666666666667,0.7933333333333333,0.86,0.8266666666666667,83.46666666666667,51.59035302341839,2857.5,1031.0
+xcalL_K1000,C138_0402,covid_positive,1500,500,150,0.09266666666666666,0.344,0.008,0.074,0.8393333333333334,0.304,0.024,0.202,0.012666666666666666,0.008,0.023333333333333334,0.068,1.0799999999999998,0.45933978631364336,0.8436923899906894,24,False,0.8733333333333333,0.8066666666666666,0.9133333333333333,0.8866666666666667,83.93333333333334,30.4,3017.0,1847.5
+xcalL_K1000,C140_3004,covid_negative,1500,3196,150,0.5013333333333333,0.27252816020025034,0.278,0.3886107634543179,0.16666666666666666,0.12484355444305381,0.035333333333333335,0.13610763454317898,0.013333333333333334,0.07165206508135169,0.005333333333333333,0.006257822277847309,0.5412565707133917,0.6463126389522823,0.8649784260819683,55,False,0.8333333333333334,0.6733333333333333,0.9066666666666666,0.64,16.666666666666664,12.48435544430538,1811.5,915.5
+xcalL_K1000,C140_2801,covid_positive,1500,226,113,0.31333333333333335,0.26991150442477874,0.07133333333333333,0.2610619469026549,0.5533333333333333,0.11946902654867257,0.048666666666666664,0.3230088495575221,0.01,0.02654867256637168,0.0033333333333333335,0.0,0.9612389380530973,0.6183140775252399,0.8469641907049226,80,False,0.7787610619469026,0.6902654867256637,0.8141592920353983,0.7876106194690266,55.333333333333336,11.946902654867257,1384.0,1194.0
+xcalL_K1000,C140_3001,covid_positive,1500,6088,150,0.39266666666666666,0.12220762155059132,0.15933333333333333,0.2664257555847569,0.386,0.33327858081471745,0.04933333333333333,0.2176412614980289,0.006666666666666667,0.056504599211563734,0.006,0.003942181340341655,0.6504765659220325,0.802640909664339,0.872941899007342,32,False,0.7466666666666667,0.6266666666666667,0.8133333333333334,0.5933333333333334,38.6,33.327858081471746,1416.0,925.0
+xcalL_K1000,C140_0202,covid_positive,1500,3567,150,0.5386666666666666,0.2612839921502663,0.16,0.29072049341183065,0.22666666666666666,0.16232127838519764,0.054,0.2321278385197645,0.008,0.04513596860106532,0.012666666666666666,0.008410428931875526,0.6919686010653209,0.5273552598312289,0.8774603087216897,31,False,0.82,0.6133333333333333,0.8866666666666667,0.6,22.666666666666664,16.232127838519762,1503.0,1057.0
+xcalL_K1000,C140_0402,covid_positive,1500,1593,150,0.6,0.15065913370998116,0.17933333333333334,0.49466415568110483,0.122,0.0696798493408663,0.07133333333333333,0.2542372881355932,0.008666666666666666,0.025109855618330193,0.018666666666666668,0.005649717514124294,1.0293559322033898,0.9479753722382821,0.8578059393724051,108,False,0.9266666666666666,0.5066666666666667,0.9266666666666666,0.5066666666666667,12.2,6.96798493408663,1715.0,840.0
+xcalL_K1000,C140_0602,covid_positive,1500,2196,150,0.4746666666666667,0.13479052823315119,0.148,0.28734061930783245,0.30933333333333335,0.31785063752276865,0.04666666666666667,0.16939890710382513,0.014,0.08378870673952642,0.007333333333333333,0.006830601092896175,0.6807577413479053,0.7716982567941103,0.8704395940776427,35,False,0.8266666666666667,0.68,0.86,0.6066666666666667,30.933333333333334,31.785063752276866,1649.5,902.0
+xcalL_K1000,C140_0902,covid_positive,1500,2211,150,0.48333333333333334,0.13251922207146088,0.16466666666666666,0.37403889642695615,0.28,0.2618724559023066,0.042666666666666665,0.182722749886929,0.023333333333333334,0.04296698326549073,0.006,0.005879692446856626,0.7381239258254184,0.7781426864095701,0.8615978554894123,68,False,0.86,0.6533333333333333,0.8333333333333334,0.7066666666666667,28.000000000000004,26.187245590230663,1642.5,1221.0
+xcalL_K1000,C140_1103,recovery,1500,1468,150,0.478,0.3528610354223433,0.19,0.30040871934604907,0.2613333333333333,0.10422343324250681,0.03866666666666667,0.20299727520435967,0.015333333333333332,0.027929155313351498,0.016666666666666666,0.011580381471389645,0.5746702997275204,0.45698447370570333,0.867101542833657,83,False,0.8666666666666667,0.6666666666666666,0.8666666666666667,0.7866666666666666,26.13333333333333,10.422343324250681,1750.5,1276.5
+xcalL_K1000,C141_2001,covid_positive,1500,3028,150,0.282,0.3543593130779392,0.028666666666666667,0.014200792602377808,0.6126666666666667,0.35402906208718626,0.05333333333333334,0.10997357992073976,0.01,0.04722589167767503,0.013333333333333334,0.1202113606340819,0.5462069572875385,0.6250609152464633,0.8582320155233539,58,False,0.8,0.6066666666666667,0.8733333333333333,0.76,61.266666666666666,35.402906208718626,1851.0,1203.0
+xcalL_K1000,C141_2201,covid_positive,1500,2514,150,0.37533333333333335,0.37748607796340494,0.02266666666666667,0.07438345266507558,0.5113333333333333,0.31145584725536996,0.05266666666666667,0.11177406523468576,0.010666666666666666,0.0588703261734288,0.027333333333333334,0.066030230708035,0.39975497215592676,0.45484109472224443,0.8720254255639559,27,False,0.7933333333333333,0.6266666666666667,0.8733333333333333,0.7133333333333334,51.13333333333333,31.145584725536995,1609.5,892.0
+xcalL_K1000,C141_3001,covid_positive,1500,1237,150,0.228,0.3556992724333064,0.02266666666666667,0.116410670978173,0.6853333333333333,0.28698464025869036,0.04066666666666666,0.09215844785772029,0.009333333333333334,0.02263540824575586,0.014,0.12611156022635409,0.7966973861492859,0.46858161030005163,0.8469713566979342,68,False,0.76,0.7133333333333334,0.78,0.8266666666666667,68.53333333333333,28.698464025869036,2700.5,1561.0
+xcalL_K1000,C141_0202,covid_positive,1500,1025,150,0.37066666666666664,0.5629268292682926,0.013333333333333334,0.041951219512195125,0.5026666666666667,0.15609756097560976,0.088,0.18341463414634146,0.010666666666666666,0.02048780487804878,0.014666666666666666,0.0351219512195122,0.6931382113821137,0.19725128707993503,0.8646845317879834,38,False,0.86,0.8733333333333333,0.84,0.92,50.26666666666667,15.609756097560975,1874.5,1487.0
+xcalL_K1000,C142_3004,covid_negative,1500,10903,150,0.718,0.5483811794918829,0.028666666666666667,0.10841052921214345,0.12,0.1384022746033202,0.118,0.17169586352380078,0.008,0.03182610290745666,0.007333333333333333,0.001284050261395946,0.3513362071601088,0.10993152287868031,0.8870984351585076,13,False,0.92,0.43333333333333335,0.9266666666666666,0.5,12.0,13.840227460332018,1736.0,1617.0
+xcalL_K1000,C145_3004,covid_negative,1500,743,150,0.694,0.6002691790040376,0.08933333333333333,0.05787348586810229,0.15133333333333332,0.033647375504710635,0.05333333333333334,0.26648721399730824,0.007333333333333333,0.018842530282637954,0.004666666666666667,0.02288021534320323,0.48575325257963214,0.40904637916920633,0.8528760809439762,126,False,0.8866666666666667,0.8466666666666667,0.9,0.8333333333333334,15.133333333333333,3.3647375504710633,1745.0,894.0
+xcalL_K1000,C145_0701,covid_positive,1500,1110,150,0.49333333333333335,0.3036036036036036,0.028666666666666667,0.26306306306306304,0.348,0.1963963963963964,0.12,0.1972972972972973,0.004666666666666667,0.03063063063063063,0.005333333333333333,0.009009009009009009,0.6826666666666666,0.40826211592305217,0.8564924472957047,77,False,0.8133333333333334,0.5933333333333334,0.8666666666666667,0.54,34.8,19.63963963963964,1160.0,848.5
+xcalL_K1000,C145_1201,covid_positive,1500,347,150,0.4673333333333333,0.207492795389049,0.028,0.5504322766570605,0.31466666666666665,0.0345821325648415,0.176,0.14697406340057637,0.0026666666666666666,0.02881844380403458,0.011333333333333334,0.03170028818443804,1.137902017291066,0.9088402398068922,0.7982074177164014,156,False,0.7466666666666667,0.4266666666666667,0.8066666666666666,0.37333333333333335,31.466666666666665,3.45821325648415,1190.5,627.0
+xcalL_K1000,C145_1401,covid_positive,1500,1060,150,0.24333333333333335,0.2169811320754717,0.03933333333333333,0.2650943396226415,0.548,0.22641509433962265,0.12133333333333333,0.24716981132075472,0.007333333333333333,0.016037735849056604,0.04066666666666666,0.02830188679245283,0.7206037735849056,0.6006937140099664,0.8424117914129388,94,False,0.7733333333333333,0.5533333333333333,0.8,0.4866666666666667,54.800000000000004,22.641509433962266,1649.5,861.0
+xcalL_K1000,C145_1901,covid_positive,1500,1173,150,0.32,0.32821824381926684,0.04,0.24296675191815856,0.5346666666666666,0.216538789428815,0.06666666666666667,0.16112531969309463,0.013333333333333334,0.0247229326513214,0.025333333333333333,0.026427962489343565,0.6362557544757033,0.37541090702821167,0.8471582632043986,59,False,0.82,0.76,0.8333333333333334,0.8266666666666667,53.46666666666666,21.653878942881498,1780.5,1148.0
+xcalL_K1000,C145_2301,covid_positive,1500,958,150,0.30733333333333335,0.5198329853862212,0.016666666666666666,0.1638830897703549,0.514,0.10334029227557412,0.12,0.1826722338204593,0.017333333333333333,0.009394572025052192,0.024666666666666667,0.020876826722338204,0.844776617954071,0.1768956965532666,0.8543854969618443,62,False,0.8466666666666667,0.8333333333333334,0.8733333333333333,0.8,51.4,10.334029227557412,1607.0,1421.0
+xcalL_K1000,C146_3004,covid_negative,1500,2608,150,0.742,0.7346625766871165,0.012666666666666666,0.049079754601226995,0.15133333333333332,0.125,0.074,0.05253067484662577,0.016,0.03450920245398773,0.004,0.004217791411042945,0.110280163599182,0.49491463253360723,0.8858355432489722,8,False,0.9133333333333333,0.9,0.9333333333333333,0.8733333333333333,15.133333333333333,12.5,1602.5,845.5
+xcalL_K1000,C146_1201,covid_positive,1500,3205,150,0.514,0.5691107644305772,0.012666666666666666,0.10452418096723869,0.34933333333333333,0.2343213728549142,0.11933333333333333,0.05585023400936037,0.0026666666666666666,0.027769110764430577,0.002,0.008424336973478939,0.3569901196047841,0.2838086230577918,0.8682971354030113,29,False,0.7533333333333333,0.6266666666666667,0.8066666666666666,0.6066666666666667,34.93333333333333,23.432137285491418,1262.5,854.0
+xcalL_K1000,C146_1401,covid_positive,1500,1733,150,0.5813333333333334,0.6641661858049625,0.008666666666666666,0.09001731102135026,0.23066666666666666,0.14945181765724178,0.17533333333333334,0.06520484708597807,0.0033333333333333335,0.029428736295441432,0.0006666666666666666,0.0017311021350259665,0.38268667051356026,0.3462518852424742,0.8755441378342042,13,False,0.8466666666666667,0.6,0.82,0.5933333333333334,23.066666666666666,14.945181765724177,1309.0,758.0
+xcalL_K1000,C146_1601,covid_positive,1500,363,150,0.358,0.4573002754820937,0.020666666666666667,0.2975206611570248,0.504,0.06336088154269973,0.10866666666666666,0.1322314049586777,0.004666666666666667,0.0440771349862259,0.004,0.005509641873278237,0.8812782369146006,0.38438686812923534,0.8113595397825378,152,False,0.76,0.5666666666666667,0.7866666666666666,0.49333333333333335,50.4,6.336088154269973,1347.0,577.0
+xcalL_K1000,C146_1901,covid_positive,1500,2803,150,0.3873333333333333,0.708169818052087,0.01,0.13877987870139136,0.378,0.06814127720299679,0.20933333333333334,0.06778451658936853,0.004666666666666667,0.00856225472707813,0.010666666666666666,0.00856225472707813,0.907023902961113,0.4743586223633906,0.8589963033827714,66,False,0.84,0.4866666666666667,0.8866666666666667,0.5266666666666666,37.8,6.814127720299679,1414.5,820.0
+xcalL_K1000,C146_2301,covid_positive,1500,1330,150,0.15133333333333332,0.649624060150376,0.010666666666666666,0.13458646616541353,0.696,0.0518796992481203,0.11733333333333333,0.1443609022556391,0.006666666666666667,0.006015037593984963,0.018,0.013533834586466165,1.2984761904761906,0.34888028148801287,0.8125684728588732,107,False,0.8066666666666666,0.5933333333333334,0.82,0.6133333333333333,69.6,5.18796992481203,2300.0,953.5
+xcalL_K1000,C146_2701,covid_positive,1500,1109,150,0.122,0.4211000901713255,0.018666666666666668,0.16050495942290352,0.8173333333333334,0.3155996393146979,0.022,0.06492335437330929,0.01,0.019837691614066726,0.01,0.018034265103697024,1.0034673880372709,0.3804961133507021,0.8452456692152375,20,False,0.8,0.7066666666666667,0.8266666666666667,0.84,81.73333333333333,31.55996393146979,2982.0,1485.0
+xcalL_K1000,C146_2502,recovery,1500,5129,150,0.692,0.71475921232209,0.007333333333333333,0.04679274712419575,0.16333333333333333,0.14837200233963735,0.11333333333333333,0.06336517839734841,0.013333333333333334,0.01852212906999415,0.010666666666666666,0.008188730746734256,0.13481484369922667,0.4474379382767293,0.8930758860767596,3,False,0.9266666666666666,0.8533333333333334,0.9133333333333333,0.8733333333333333,16.333333333333332,14.837200233963735,1695.5,1290.0
+xcalL_K1000,C147_3004,covid_negative,1500,2048,150,0.5866666666666667,0.59375,0.07066666666666667,0.1328125,0.236,0.109375,0.06933333333333333,0.1259765625,0.02666666666666667,0.0322265625,0.010666666666666666,0.005859375,0.2628645833333333,0.22370774989435227,0.8752736561187847,48,False,0.8933333333333333,0.8666666666666667,0.9,0.8733333333333333,23.599999999999998,10.9375,1738.5,1014.0
+xcalL_K1000,C147_1401,covid_positive,1500,2973,150,0.20466666666666666,0.2263706693575513,0.004666666666666667,0.2472250252270434,0.6813333333333333,0.3871510258997645,0.08866666666666667,0.110326269761184,0.009333333333333334,0.02119071644803229,0.011333333333333334,0.007736293306424487,0.5955586949209553,0.696052470846853,0.8553450890169039,41,False,0.8533333333333334,0.47333333333333333,0.9066666666666666,0.54,68.13333333333334,38.71510258997645,1983.5,1017.0
+xcalL_K1000,C147_1901,covid_positive,1500,3691,150,0.354,0.42021132484421564,0.026,0.24735843944730426,0.4706666666666667,0.04958005960444324,0.102,0.21376320780276348,0.019333333333333334,0.006502302898943376,0.028,0.06258466540232999,0.8678352749932268,0.44423714583520624,0.8358511006921978,141,False,0.8466666666666667,0.5133333333333333,0.88,0.6,47.06666666666667,4.958005960444324,1931.0,844.0
+xcalL_K1000,C152_0405,covid_negative,1500,4046,150,0.9353333333333333,0.8826000988630747,0.0033333333333333335,0.014335145823035097,0.016666666666666666,0.04572417202174987,0.042,0.04745427582797825,0.0006666666666666666,0.009886307464162136,0.002,0.0,0.10946646894051738,0.7754400808208591,0.874707006941364,1,True,0.9533333333333334,0.74,0.9733333333333334,0.7466666666666667,1.6666666666666667,4.572417202174988,1551.5,1464.5
+xcalL_K1000,C161_1105,covid_negative,1500,820,150,0.044,0.6743902439024391,0.006666666666666667,0.06341463414634146,0.9146666666666666,0.20853658536585365,0.018,0.00975609756097561,0.005333333333333333,0.03902439024390244,0.011333333333333334,0.004878048780487805,1.4416585365853658,0.4531345605258982,0.8270429611385314,52,False,0.8466666666666667,0.4866666666666667,0.92,0.5066666666666667,91.46666666666667,20.853658536585364,2810.5,1665.0
+xcalL_K1000,C164_1105,covid_negative,1500,5983,150,0.7733333333333333,0.8880160454621427,0.007333333333333333,0.018051144910579978,0.108,0.04579642319906402,0.09666666666666666,0.03359518636135718,0.009333333333333334,0.010864114992478689,0.005333333333333333,0.0036770850743774027,0.25386261073040284,0.7863414092318038,0.8882754521865674,11,False,0.94,0.8133333333333334,0.9933333333333333,0.86,10.8,4.579642319906402,1689.5,1565.0
+xcalL_K1000,C167_1205,covid_negative,1500,9978,150,0.742,0.7162758067749048,0.020666666666666667,0.03487672880336741,0.07866666666666666,0.08819402685909,0.146,0.149929845660453,0.008,0.008719182200841852,0.004666666666666667,0.0020044097013429546,0.05677290038083789,0.4406591339254403,0.8848652448941239,4,False,0.9133333333333333,0.9133333333333333,0.94,0.92,7.866666666666666,8.819402685909001,1683.0,1452.0
+xcalL_K1000,C168_1205,covid_negative,1500,2323,150,0.6293333333333333,0.49978476108480413,0.06466666666666666,0.05337925096857512,0.236,0.21437795953508396,0.04733333333333333,0.16272061988807576,0.017333333333333333,0.06371071889797675,0.005333333333333333,0.006026689625484288,0.32491605682307356,0.1658329352655326,0.8847631678369055,20,False,0.9,0.8,0.8933333333333333,0.78,23.599999999999998,21.437795953508395,1609.0,781.0
+xcalL_K1000,C168_2001,covid_positive,1500,2751,150,0.368,0.3300617957106507,0.016666666666666666,0.31842966194111233,0.4713333333333333,0.18684114867320975,0.11733333333333333,0.11959287531806616,0.01,0.03744093057070156,0.016666666666666666,0.007633587786259542,0.66292693565976,0.4595903594509014,0.8700897091892416,31,False,0.82,0.46,0.84,0.4533333333333333,47.13333333333333,18.684114867320975,1522.0,945.0
+xcalL_K1000,C168_2301,covid_positive,1500,901,150,0.5053333333333333,0.42730299667036625,0.059333333333333335,0.19200887902330743,0.336,0.051054384017758046,0.09066666666666667,0.2885682574916759,0.004,0.03551609322974473,0.004666666666666667,0.005549389567147614,0.7259519052904181,0.39790520105397054,0.8457288436492733,124,False,0.7933333333333333,0.49333333333333335,0.8466666666666667,0.5466666666666666,33.6,5.105438401775805,1222.5,853.0
+xcalL_K1000,C168_3001,covid_positive,1500,1160,150,0.292,0.3931034482758621,0.04066666666666666,0.10775862068965517,0.5753333333333334,0.28706896551724137,0.068,0.1310344827586207,0.014,0.06810344827586207,0.01,0.01293103448275862,0.5765287356321841,0.32000040598561813,0.8689522115759226,27,False,0.88,0.86,0.86,0.8,57.53333333333334,28.706896551724135,1783.5,837.0
+xcalL_K1000,C168_0202,covid_positive,1500,651,150,0.498,0.2903225806451613,0.056666666666666664,0.18125960061443933,0.344,0.3302611367127496,0.06733333333333333,0.09984639016897082,0.02666666666666667,0.09831029185867896,0.007333333333333333,0.0,0.45749923195084485,0.5938289354525899,0.8676516088390039,73,False,0.9133333333333333,0.7133333333333334,0.9,0.6866666666666666,34.4,33.026113671274956,1698.5,670.0
+xcalL_K1000,C168_0403,recovery,1500,2526,150,0.484,0.29493269992082344,0.030666666666666665,0.08036421219319081,0.37733333333333335,0.4398258115597783,0.07933333333333334,0.1421219319081552,0.014666666666666666,0.0344418052256532,0.014,0.00831353919239905,0.389507521773555,0.5581908119702741,0.8808502219374899,17,False,0.8533333333333334,0.8533333333333334,0.8666666666666667,0.76,37.733333333333334,43.982581155977826,1622.5,1080.0
+xcalL_K1000,C169_1205,covid_negative,1500,1252,150,0.494,0.444888178913738,0.036,0.11421725239616613,0.31533333333333335,0.15175718849840256,0.12,0.2340255591054313,0.016,0.031150159744408944,0.018666666666666668,0.023961661341853034,0.42537593184238554,0.15223327472556483,0.8719112248141265,57,False,0.8733333333333333,0.9333333333333333,0.8866666666666667,0.9,31.533333333333335,15.175718849840255,1809.0,1000.0
+xcalL_K1000,C169_2001,covid_positive,1500,755,150,0.576,0.5814569536423841,0.02,0.1827814569536424,0.2693333333333333,0.052980132450331126,0.106,0.14437086092715232,0.004666666666666667,0.030463576158940398,0.024,0.007947019867549669,0.46481236203090515,0.29768533533541947,0.8515758961827431,79,False,0.8133333333333334,0.7666666666666667,0.8266666666666667,0.6533333333333333,26.93333333333333,5.298013245033113,1456.0,586.0
+xcalL_K1000,C169_2301,covid_positive,1500,3773,150,0.5706666666666667,0.5139146567717996,0.03266666666666666,0.08666843360720912,0.23533333333333334,0.04320169626292075,0.15,0.31221839385104694,0.004666666666666667,0.028624436787702094,0.006666666666666667,0.015372382719321495,0.4977672939305594,0.3238790347253354,0.862716182977761,85,False,0.8533333333333334,0.5533333333333333,0.8533333333333334,0.5933333333333334,23.533333333333335,4.320169626292075,1429.0,886.0
+xcalL_K1000,C169_0202,covid_positive,1500,1286,150,0.6766666666666666,0.5256609642301711,0.042666666666666665,0.14774494556765164,0.12066666666666667,0.14074650077760498,0.138,0.12052877138413685,0.011333333333333334,0.04821150855365474,0.010666666666666666,0.017107309486780714,0.3369538621047174,0.15711851398724597,0.8820538149359651,36,False,0.9,0.9333333333333333,0.9533333333333334,0.92,12.066666666666666,14.074650077760499,1743.0,841.0
+xcalL_K1000,C169_0403,recovery,1500,4368,150,0.6886666666666666,0.5057234432234432,0.04533333333333334,0.1201923076923077,0.13666666666666666,0.12248168498168498,0.10066666666666667,0.21268315018315018,0.008,0.023351648351648352,0.020666666666666667,0.015567765567765568,0.4044542124542125,0.11155685954848588,0.8807436780452205,39,False,0.9333333333333333,0.7866666666666666,0.94,0.7666666666666667,13.666666666666666,12.248168498168498,1716.5,992.0
+xcalL_K1000,C170_1205,covid_negative,1500,953,150,0.7013333333333334,0.5204616998950682,0.01,0.02098635886673662,0.11,0.21720881427072403,0.16466666666666666,0.19832109129066108,0.007333333333333333,0.03882476390346275,0.006666666666666667,0.004197271773347324,0.366682056663169,0.22143452316734474,0.876472752372808,34,False,0.9266666666666666,0.9066666666666666,0.9466666666666667,0.8933333333333333,11.0,21.720881427072403,1658.0,736.0
+xcalL_K1000,C170_2301,covid_positive,1500,1055,150,0.5973333333333334,0.4199052132701422,0.010666666666666666,0.0947867298578199,0.234,0.07109004739336493,0.14933333333333335,0.37156398104265403,0.002,0.03981042654028436,0.006666666666666667,0.002843601895734597,0.6883222748815166,0.43142506766774563,0.8499409398385891,128,False,0.88,0.6466666666666666,0.9,0.6066666666666667,23.400000000000002,7.109004739336493,1353.5,548.0
+xcalL_K1000,C170_0202,covid_positive,1500,5621,150,0.7113333333333334,0.4090019569471624,0.025333333333333333,0.10745418964597046,0.122,0.13271659847002312,0.13266666666666665,0.26845756982743285,0.0026666666666666666,0.07987902508450453,0.006,0.0024906600249066002,0.6116814327225288,0.3053494423257437,0.8695698108359813,42,False,0.8866666666666667,0.7,0.9,0.6666666666666666,12.2,13.271659847002311,1498.5,840.0
+xcalL_K1000,C170_0402,covid_positive,1500,808,150,0.7253333333333334,0.5742574257425742,0.011333333333333334,0.054455445544554455,0.09733333333333333,0.017326732673267328,0.154,0.3193069306930693,0.004,0.03094059405940594,0.008,0.0037128712871287127,0.4707392739273929,0.46360567902963296,0.859303436213799,85,False,0.9266666666666666,0.8333333333333334,0.94,0.7466666666666667,9.733333333333333,1.7326732673267329,1610.0,907.0
+xcalL_K1000,C170_0403,recovery,1500,3745,150,0.7393333333333333,0.6101468624833111,0.008666666666666666,0.015487316421895861,0.078,0.06809078771695594,0.16533333333333333,0.2809078771695594,0.004,0.021628838451268357,0.004666666666666667,0.003738317757009346,0.2800480640854472,0.4565486308105643,0.8851541134945099,16,False,0.9666666666666667,0.7,0.96,0.76,7.8,6.809078771695594,1731.0,984.0
+xcalL_K1000,C187_2605,covid_negative,1500,1867,150,0.252,0.129084092126406,0.006,0.04124263524370648,0.5226666666666666,0.5243706480985538,0.164,0.11355115158007499,0.037333333333333336,0.17621853240492769,0.018,0.015532940546331012,0.35166363149437607,1.0139205985390403,0.8943618959199466,6,False,0.8733333333333333,0.82,0.9266666666666666,0.8,52.26666666666666,52.437064809855386,1948.5,783.0
+xcalL_K1000,C187_1201,covid_positive,1500,1985,150,0.19733333333333333,0.05994962216624685,0.015333333333333332,0.02518891687657431,0.692,0.23425692695214106,0.086,0.6392947103274559,0.006,0.031234256926952142,0.0033333333333333335,0.010075566750629723,1.190253568429891,1.104027839607859,0.8547328876643336,47,False,0.7866666666666666,0.72,0.8133333333333334,0.7,69.19999999999999,23.425692695214106,1743.0,706.0
+xcalL_K1000,C187_1401,covid_positive,1500,3155,150,0.158,0.10998415213946117,0.009333333333333334,0.041521394611727415,0.7306666666666667,0.22060221870047544,0.08266666666666667,0.5670364500792393,0.013333333333333334,0.04659270998415214,0.006,0.014263074484944533,1.1161605916534603,0.9630876751036153,0.8632835885744208,18,False,0.8133333333333334,0.74,0.8733333333333333,0.7133333333333334,73.06666666666666,22.060221870047545,1718.5,671.0
+xcalL_K1000,C187_1901,covid_positive,1500,1966,150,0.172,0.08748728382502544,0.019333333333333334,0.07019328585961343,0.702,0.1958290946083418,0.084,0.5635808748728383,0.011333333333333334,0.049338758901322485,0.011333333333333334,0.0335707019328586,1.1813672431332654,0.9507376292367147,0.851666661277129,42,False,0.8266666666666667,0.82,0.8266666666666667,0.7933333333333333,70.19999999999999,19.58290946083418,1959.5,904.5
+xcalL_K1000,C187_2301,covid_positive,1500,529,150,0.154,0.16446124763705103,0.004666666666666667,0.17391304347826086,0.724,0.06994328922495274,0.082,0.5311909262759924,0.012,0.03780718336483932,0.023333333333333334,0.022684310018903593,1.309411468178954,0.886363356674395,0.8043857971614302,131,False,0.8933333333333333,0.8266666666666667,0.8933333333333333,0.8,72.39999999999999,6.994328922495274,2114.5,695.0
+xcalL_K1000,C187_2502,recovery,1500,5693,150,0.36666666666666664,0.284559985947655,0.018666666666666668,0.018443702792903565,0.4866666666666667,0.2466186544879677,0.08533333333333333,0.39030388196030213,0.020666666666666667,0.04268399789214825,0.022,0.017389776919023364,0.6539757597049006,0.6600913911248751,0.8792706830469595,27,False,0.8733333333333333,0.8666666666666667,0.8666666666666667,0.8266666666666667,48.66666666666667,24.661865448796767,2008.0,985.0
+xcalL_K1000,C190_2605,covid_negative,1500,1791,150,0.116,0.04578447794528197,0.004666666666666667,0.0893355667225014,0.7846666666666666,0.4712451144611949,0.052,0.3405918481295366,0.025333333333333333,0.0413176996091569,0.017333333333333333,0.011725293132328308,0.7784902289223897,1.0015556678724205,0.872940805847254,6,False,0.8533333333333334,0.66,0.8933333333333333,0.6866666666666666,78.46666666666667,47.124511446119485,2364.0,1186.0
+xcalL_K1000,C190_2901,covid_positive,1500,1527,150,0.24066666666666667,0.0412573673870334,0.096,0.3798297314996726,0.6033333333333334,0.3700065487884741,0.03666666666666667,0.16110019646365423,0.017333333333333333,0.04191224623444663,0.006,0.005893909626719057,0.8656843483955469,0.9933407123646675,0.8637915442855403,28,False,0.8533333333333334,0.6933333333333334,0.86,0.6866666666666666,60.333333333333336,37.00065487884741,1968.5,1198.0
+xcalL_K1000,C190_0102,covid_positive,1500,4868,150,0.3433333333333333,0.03594905505341003,0.258,0.3769515201314708,0.28,0.33340180772391126,0.09133333333333334,0.20336894001643385,0.012,0.042317173377156944,0.015333333333333332,0.00801150369761709,0.629412215831279,0.9830900367886798,0.8790160921739661,20,False,0.8533333333333334,0.6733333333333333,0.8933333333333333,0.6866666666666666,28.000000000000004,33.34018077239113,1711.5,1038.0
+xcalL_K1000,C190_0302,covid_positive,1500,2220,150,0.32266666666666666,0.11576576576576576,0.344,0.3342342342342342,0.262,0.3045045045045045,0.035333333333333335,0.20315315315315316,0.011333333333333334,0.03333333333333333,0.024666666666666667,0.009009009009009009,0.4646486486486487,0.8214616047411845,0.8674992338903698,24,False,0.8066666666666666,0.66,0.8333333333333334,0.7266666666666667,26.200000000000003,30.45045045045045,1749.0,1175.5
+xcalL_K1000,C190_0502,covid_positive,1500,2030,150,0.32266666666666666,0.05172413793103448,0.23666666666666666,0.24778325123152709,0.35333333333333333,0.5167487684729064,0.04733333333333333,0.10541871921182266,0.025333333333333333,0.07389162561576355,0.014666666666666666,0.004433497536945813,0.5623513957307061,1.0866909499598747,0.8782362211098258,10,False,0.86,0.7,0.86,0.7,35.333333333333336,51.67487684729064,1818.0,799.0
+xcalL_K1000,C190_0802,covid_positive,1500,1447,150,0.268,0.038700760193503804,0.138,0.2156185210780926,0.512,0.5929509329647547,0.037333333333333336,0.0912232204561161,0.030666666666666665,0.05459571527297857,0.014,0.006910850034554251,0.4727767795438838,1.1361739979511323,0.876570773271099,12,False,0.9066666666666666,0.76,0.8933333333333333,0.78,51.2,59.295093296475464,1899.5,854.0
+xcalL_K1000,C190_1002,covid_positive,1500,4052,150,0.25466666666666665,0.044669299111549855,0.088,0.12043435340572557,0.574,0.6414116485686081,0.037333333333333336,0.12709772951628825,0.027333333333333334,0.06071076011846002,0.018666666666666668,0.005676209279368213,0.4459756498848305,1.054957183505068,0.8894441331887708,2,False,0.84,0.8666666666666667,0.8666666666666667,0.8,57.4,64.14116485686081,1914.5,994.0
+xcalL_K1000,C190_0903,recovery,1500,1371,150,0.24733333333333332,0.0962800875273523,0.04733333333333333,0.24288840262582057,0.6033333333333334,0.4062727935813275,0.056666666666666664,0.1560904449307075,0.022,0.07221006564551423,0.023333333333333334,0.0262582056892779,0.6962275711159737,0.8758868530865975,0.8848542386799584,2,False,0.78,0.8866666666666667,0.84,0.84,60.333333333333336,40.62727935813275,1817.5,998.0
+xcalL_K1000,C193_2605,covid_negative,1500,5566,150,0.37866666666666665,0.40837226015091627,0.028666666666666667,0.03557312252964427,0.4493333333333333,0.34441250449155586,0.092,0.17714696370822852,0.03133333333333333,0.02982393100970176,0.02,0.004671218109953288,0.24351802611091147,0.3678845402221646,0.9026817135799378,1,True,0.9,0.7533333333333333,0.9333333333333333,0.8066666666666666,44.93333333333333,34.44125044915559,1861.5,2119.5
+xcalL_K1000,C195_2605,covid_negative,1500,7759,150,0.7973333333333333,0.5532929501224385,0.006666666666666667,0.038407011212785155,0.074,0.08815569016625854,0.11533333333333333,0.3107359195772651,0.004666666666666667,0.008248485629591443,0.002,0.0011599432916612965,0.4897608798384671,0.3966356083186975,0.8851268180711878,1,True,0.9066666666666666,0.92,0.9533333333333334,0.8733333333333333,7.3999999999999995,8.815569016625854,1590.0,1513.0
+xcalL_K1000,C197_2605,covid_negative,1500,2835,150,0.544,0.6052910052910053,0.012666666666666666,0.13015873015873017,0.32133333333333336,0.1347442680776014,0.09733333333333333,0.08677248677248678,0.012666666666666666,0.01869488536155203,0.012,0.02433862433862434,0.39429982363315697,0.25943326779757336,0.8744085046125564,73,False,0.9,0.68,0.9,0.7333333333333333,32.13333333333333,13.474426807760139,2009.5,1812.0
+xcalL_K1000,C212_2705,covid_negative,1500,1150,150,0.43066666666666664,0.5417391304347826,0.05533333333333333,0.0817391304347826,0.32866666666666666,0.15478260869565216,0.13666666666666666,0.18869565217391304,0.037333333333333336,0.026956521739130435,0.011333333333333334,0.00608695652173913,0.3790144927536232,0.12773468943038657,0.888790142098235,16,False,0.8666666666666667,0.52,0.9133333333333333,0.58,32.86666666666667,15.478260869565217,1910.5,1861.5
+xcalL_K1000,C214_2705,covid_negative,1500,6279,150,0.49,0.3494186972447842,0.07933333333333334,0.08138238573021182,0.30466666666666664,0.3817486860965122,0.072,0.14667940754897277,0.029333333333333333,0.03567447045707915,0.024666666666666667,0.005096352922439879,0.32030323299888525,0.4386856288973712,0.89876700911316,2,False,0.86,0.76,0.88,0.7,30.466666666666665,38.17486860965122,2022.0,1795.0
+xcalL_K1000,C234_2805,covid_negative,1500,9882,150,0.586,0.609492005666869,0.02,0.08429467719085205,0.25066666666666665,0.16636308439587127,0.12066666666666667,0.12001619105444242,0.017333333333333333,0.016798218984011334,0.005333333333333333,0.0030358227079538553,0.1755733657154422,0.22572250861824003,0.903413352314406,4,False,0.9266666666666666,0.82,0.9066666666666666,0.84,25.066666666666666,16.63630843958713,1874.0,1650.0
+xcalL_K1000,C237_2805,covid_negative,1500,5071,150,0.436,0.5912048905541314,0.024,0.08913429303884836,0.4073333333333333,0.15519621376454348,0.08933333333333333,0.14789982252021297,0.026,0.014198382961940446,0.017333333333333333,0.0023663971603234074,0.5578113455597188,0.1889138281990117,0.8827048589043465,19,False,0.7666666666666667,0.6733333333333333,0.8066666666666666,0.7266666666666667,40.733333333333334,15.519621376454348,1822.5,1379.0
+xcalL_K1000,C238_2905,covid_negative,1500,7843,150,0.4493333333333333,0.8912405967104424,0.015333333333333332,0.034298100216753794,0.3913333333333333,0.03735815376769094,0.09666666666666666,0.023842917251051893,0.016666666666666666,0.010455182965701899,0.030666666666666665,0.002805049088359046,0.9217440605210592,0.7928318521290224,0.8578765544950879,56,False,0.8466666666666667,0.6333333333333333,0.88,0.6466666666666666,39.13333333333333,3.735815376769094,1794.5,1738.0
+xcalL_K1000,C240_2905,covid_negative,1500,2346,150,0.4166666666666667,0.5524296675191815,0.023333333333333334,0.03836317135549872,0.34933333333333333,0.20588235294117646,0.154,0.18584825234441602,0.035333333333333335,0.014919011082693947,0.021333333333333333,0.0025575447570332483,0.3652821824381926,0.21742860567739122,0.89581427830313,6,False,0.8133333333333334,0.6,0.84,0.6266666666666667,34.93333333333333,20.588235294117645,1720.5,1652.5
+xcalL_K1000,C246_2905,covid_negative,1500,769,150,0.7126666666666667,0.7451235370611183,0.011333333333333334,0.013003901170351105,0.11266666666666666,0.08972691807542263,0.148,0.13394018205461639,0.008666666666666666,0.015604681404421327,0.006666666666666667,0.002600780234070221,0.08213090593844818,0.4987244371938444,0.8919403967242081,5,False,0.92,0.86,0.92,0.86,11.266666666666666,8.972691807542263,1669.0,1382.0
+xcalL_K1000,C251_2905,covid_negative,1500,2117,150,0.644,0.8304204062352385,0.08066666666666666,0.07510628247520075,0.18066666666666667,0.03306565895134624,0.06,0.05054322153991497,0.028666666666666667,0.007085498346717053,0.006,0.003778932451582428,0.372840812470477,0.6704117251468811,0.8771919640534652,28,False,0.8733333333333333,0.6,0.9066666666666666,0.6533333333333333,18.066666666666666,3.306565895134624,1870.5,2293.0

paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20261003T103040Z-crosscohort-k1000-saturation/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_crosscohort_20261002/scores/imperial_eskd/xcalL_K1000/summary.json

@@ -0,0 +1,1063 @@
+{
+ "schema": "paired_ft_scores.v1",
+ "dataset": "imperial_eskd",
+ "written_utc": "2026-10-02T16:08:47.252466+00:00",
+ "command": [
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/tools/score_ft.py",
+  "--dataset",
+  "imperial_eskd",
+  "--threads",
+  "8",
+  "--donors",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_crosscohort_20261002/data/imperial_eskd/usable_samples.txt",
+  "--arm",
+  "xcalL_K1000=/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_crosscohort_20261002/generated/imperial_eskd/hoL_imperial_eskd/xcal_K1000.npz",
+  "--case-groups",
+  "covid_positive",
+  "--control-groups",
+  "covid_negative",
+  "--out",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_crosscohort_20261002/scores/imperial_eskd/xcalL_K1000"
+ ],
+ "arms": [
+  "xcalL_K1000"
+ ],
+ "donors": [
+  "C20_1004",
+  "C20_1404",
+  "C21_1004",
+  "C21_1704",
+  "C21_2504",
+  "C23_2204",
+  "C31_1304",
+  "C31_2004",
+  "C31_2704",
+  "C33_1401",
+  "C33_1601",
+  "C33_1901",
+  "C34_1404",
+  "C34_2104",
+  "C34_2504",
+  "C36_1504",
+  "C36_1704",
+  "C36_2104",
+  "C40_1504",
+  "C40_2204",
+  "C40_0105",
+  "C42_1504",
+  "C42_2204",
+  "C42_2704",
+  "C58_1604",
+  "C58_2501",
+  "C58_2901",
+  "C58_0102",
+  "C58_0402",
+  "C58_1003",
+  "C60_2504",
+  "C63_1704",
+  "C63_2404",
+  "C63_2904",
+  "C65_1704",
+  "C65_2104",
+  "C65_2504",
+  "C69_1804",
+  "C82_2504",
+  "C85_2004",
+  "C93_2104",
+  "C93_2704",
+  "C93_0405",
+  "C101_0601",
+  "C101_1101",
+  "C101_1301",
+  "C101_1801",
+  "C101_2001",
+  "C101_2502",
+  "C103_2204",
+  "C104_2204",
+  "C106_2204",
+  "C108_2204",
+  "C108_1501",
+  "C108_1801",
+  "C108_2201",
+  "C113_0605",
+  "C123_2404",
+  "C123_2904",
+  "C123_0505",
+  "C124_2404",
+  "C124_2704",
+  "C124_0105",
+  "C126_2504",
+  "C126_3004",
+  "C126_0605",
+  "C127_2504",
+  "C127_0405",
+  "C127_1105",
+  "C128_2504",
+  "C128_0405",
+  "C128_1105",
+  "C132_2804",
+  "C132_0205",
+  "C132_1105",
+  "C137_3004",
+  "C137_2502",
+  "C138_3004",
+  "C138_2301",
+  "C138_3001",
+  "C138_0202",
+  "C138_0402",
+  "C140_3004",
+  "C140_2801",
+  "C140_3001",
+  "C140_0202",
+  "C140_0402",
+  "C140_0602",
+  "C140_0902",
+  "C140_1103",
+  "C141_2001",
+  "C141_2201",
+  "C141_3001",
+  "C141_0202",
+  "C142_3004",
+  "C145_3004",
+  "C145_0701",
+  "C145_1201",
+  "C145_1401",
+  "C145_1901",
+  "C145_2301",
+  "C146_3004",
+  "C146_1201",
+  "C146_1401",
+  "C146_1601",
+  "C146_1901",
+  "C146_2301",
+  "C146_2701",
+  "C146_2502",
+  "C147_3004",
+  "C147_1401",
+  "C147_1901",
+  "C152_0405",
+  "C161_1105",
+  "C164_1105",
+  "C167_1205",
+  "C168_1205",
+  "C168_2001",
+  "C168_2301",
+  "C168_3001",
+  "C168_0202",
+  "C168_0403",
+  "C169_1205",
+  "C169_2001",
+  "C169_2301",
+  "C169_0202",
+  "C169_0403",
+  "C170_1205",
+  "C170_2301",
+  "C170_0202",
+  "C170_0402",
+  "C170_0403",
+  "C187_2605",
+  "C187_1201",
+  "C187_1401",
+  "C187_1901",
+  "C187_2301",
+  "C187_2502",
+  "C190_2605",
+  "C190_2901",
+  "C190_0102",
+  "C190_0302",
+  "C190_0502",
+  "C190_0802",
+  "C190_1002",
+  "C190_0903",
+  "C193_2605",
+  "C195_2605",
+  "C197_2605",
+  "C212_2705",
+  "C214_2705",
+  "C234_2805",
+  "C237_2805",
+  "C238_2905",
+  "C240_2905",
+  "C246_2905",
+  "C251_2905"
+ ],
+ "n_donors": 157,
+ "reference": {
+  "cache": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/imperial_eskd",
+  "reference_sha256": "34b4caa3f8a60b46d5faf58f09cdaa5622bcce19e4c45d9902a711fead96375e",
+  "features_sha256": "e46e5bb1a24eae045efe75125d20e3accaa8f68a1006eb2f60d24159013d4aa7",
+  "n_r1_cells": 23482,
+  "pca": {
+   "n_components": 50,
+   "explained_variance_ratio_sum": 0.2583312690258026,
+   "n_fit_cells": 23482
+  },
+  "r2_control": {
+   "precision": 0.9672515117962694,
+   "coverage": 0.9997018993271442,
+   "density": 1.2663444340345795,
+   "n_query": 23482,
+   "depth_matched": {
+    "precision": 0.9666978962609658,
+    "coverage": 0.9996593135167362,
+    "density": 1.267034324163189
+   }
+  },
+  "observed_l1_loo_null_mean": 0.5047406322420376
+ },
+ "contrast_definition": {
+  "enabled": true,
+  "rule": "explicit --case-groups / --control-groups",
+  "group_source": "features groups",
+  "case_groups": [
+   "covid_positive"
+  ],
+  "control_groups": [
+   "covid_negative"
+  ],
+  "n_case_donors": 113,
+  "n_control_donors": 34,
+  "n_donors_in_neither": 10,
+  "case": [
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false
+  ],
+  "ctrl": [
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true
+  ],
+  "groups": [
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative"
+  ]
+ },
+ "deg_definition": {
+  "enabled": true,
+  "score": "top-50 DEG overlap per cell type (benchmark total_top50_overlap, Welch backend)",
+  "source": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/bulk2sc-paper/scripts/evaluate_generated_vs_truth.py",
+  "functions": [
+   "welch_bh_deg",
+   "top_deg_genes",
+   "jaccard"
+  ],
+  "reproduces": "utility_studies_final6k_20260925/sle top-50 DEG 81 (1,006 genes) / 84 (2,279 genes) = sum over the six gated types of top50_overlap_count",
+  "top_n": 50,
+  "fdr": 0.05,
+  "n_genes": 5927,
+  "types": [
+   "T cell",
+   "B cell",
+   "Monocyte",
+   "NK cell",
+   "DC"
+  ],
+  "aggregates_source": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/imperial_eskd/deg_reference.npz",
+  "aggregates_sha256": "8fada1ace7530b79bfc5c5201b9cb60399ff77d083dd8b53b13cfbe900cda55c",
+  "aggregates_note": null,
+  "types_not_scored_observed": [],
+  "observed": {
+   "T cell": {
+    "n_significant": 1057,
+    "n_tested": 5755,
+    "n_case_donors": 113,
+    "n_control_donors": 34,
+    "n_cells": 262546,
+    "top_list_size": 50
+   },
+   "B cell": {
+    "n_significant": 298,
+    "n_tested": 5645,
+    "n_case_donors": 113,
+    "n_control_donors": 34,
+    "n_cells": 48625,
+    "top_list_size": 50
+   },
+   "Monocyte": {
+    "n_significant": 349,
+    "n_tested": 5631,
+    "n_case_donors": 112,
+    "n_control_donors": 34,
+    "n_cells": 80851,
+    "top_list_size": 50
+   },
+   "NK cell": {
+    "n_significant": 427,
+    "n_tested": 5591,
+    "n_case_donors": 113,
+    "n_control_donors": 34,
+    "n_cells": 72125,
+    "top_list_size": 50
+   },
+   "DC": {
+    "n_significant": 341,
+    "n_tested": 5437,
+    "n_case_donors": 113,
+    "n_control_donors": 34,
+    "n_cells": 13572,
+    "top_list_size": 50
+   }
+  },
+  "broadcast": "welch_bh_deg + top_deg_genes on the arm's condition bulk_counts (scoring genes, case|control donors), one list compared with every type's observed list (sle_broadcast.py broadcast_input_bulk); not part of the published benchmark"
+ },
+ "headline": {
+  "xcalL_K1000": {
+   "comp_l1": 0.6511665403698953,
+   "comp_l1_obs_loo_null": 0.5047406322420376,
+   "precision": 0.8453709224086534,
+   "coverage": 0.6370411378928541,
+   "precision_dm": 0.8699855208244613,
+   "coverage_dm": 0.6638701984498765,
+   "pb_r_median": 0.8649784260819683,
+   "pb_top1": 0.025477707006369428,
+   "mono_pct_gen": 40.99617834394905,
+   "mono_pct_obs": 16.91641814873756,
+   "median_umi_gen": 1733.5,
+   "median_umi_obs": 1349.0,
+   "contrast_mean_cp10k_r_gen": 0.6892227232868162,
+   "contrast_pseudobulk_log1p_cpm_r_gen": 0.5218531122776027,
+   "contrast_mean_cp10k_r_broadcast": 0.6767220706910705,
+   "contrast_pseudobulk_log1p_cpm_r_broadcast": 0.6055610936616662,
+   "deg_top50_T": 26,
+   "deg_top50_B": 21,
+   "deg_top50_Mono": 26,
+   "deg_top50_NK": 19,
+   "deg_top50_DC": 16,
+   "deg_top50_sum": 108,
+   "deg_top50_max": 250,
+   "deg_top50_sum_4type": 92,
+   "deg_top50_sum_broadcast": 84,
+   "seconds": 53.0
+  }
+ },
+ "per_arm": {
+  "xcalL_K1000": {
+   "arm": "xcalL_K1000",
+   "npz": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_crosscohort_20261002/generated/imperial_eskd/hoL_imperial_eskd/xcal_K1000.npz",
+   "npz_sha256": "efba17cf1001411859dc019a1e17855a64fc01cccf8e457fcac32af8e18559ee",
+   "receipt_verified": true,
+   "generation": {
+    "checkpoint": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/runs/f01_6k_1x_seed20260627/checkpoint_epoch_016.pt",
+    "checkpoint_sha256": "8c7cd0e83e2bc19fe03dfcbc084919a1e2f61be8cc8bc12f4caf543dfda91633",
+    "input_condition_path": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_crosscohort_20261002/splits/hoL_imperial_eskd/test_xcal_K1000.npz",
+    "input_condition_sha256": "a6ad2125a8ea0bf0c4e28a6b85b4ef9204a5514f919befbfcb6cbf75e2d2ce08",
+    "seed": 20260927,
+    "steps": 50,
+    "support_readout": "bernoulli",
+    "weights": "ema"
+   },
+   "condition_for_broadcast": {
+    "path": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_crosscohort_20261002/splits/hoL_imperial_eskd/test_xcal_K1000.npz",
+    "sha256": "a6ad2125a8ea0bf0c4e28a6b85b4ef9204a5514f919befbfcb6cbf75e2d2ce08"
+   },
+   "poisson": {
+    "seed": 20260916,
+    "rule": "whole NPZ, rows in NPZ order",
+    "nnz_whole_npz": 73607146,
+    "median_library_whole_npz_panel": 1733.5,
+    "n_rows_whole_npz": 235500
+   },
+   "annotation": {
+    "model_pt_sha256": "bf3655899e5abee435340fc008656c4a17342da0f30b70cfd43de8e9223e1930",
+    "zero_padded_model_genes": 0,
+    "label_counts": {
+     "T cell": 101889,
+     "Monocyte": 96546,
+     "NK cell": 20507,
+     "B cell": 10082,
+     "Other": 3446,
+     "DC": 3030
+    },
+    "mean_l2_max_prob": 0.9408064898370178,
+    "predict_seconds": 8.9
+   },
+   "n_donors": 157,
+   "n_generated_cells": 235500,
+   "composition": {
+    "l1_mean": 0.6511665403698953,
+    "l1_median": 0.6127162977867204,
+    "l1_obs_loo_null_mean": 0.5047406322420376,
+    "l1_generated_loo_mean_vs_observed_mean": 0.6690444681179539,
+    "composition_top1": 0.01910828025477707,
+    "mean_fraction_generated": {
+     "T cell": 0.43265,
+     "B cell": 0.042811,
+     "Monocyte": 0.409962,
+     "NK cell": 0.087079,
+     "DC": 0.012866,
+     "Other": 0.014633
+    },
+    "mean_fraction_observed": {
+     "T cell": 0.49735,
+     "B cell": 0.119189,
+     "Monocyte": 0.169164,
+     "NK cell": 0.169625,
+     "DC": 0.030313,
+     "Other": 0.01436
+    }
+   },
+   "pseudobulk": {
+    "n_genes": 5927,
+    "r_median": 0.8649784260819683,
+    "r_mean": 0.8618808797615614,
+    "top1": 0.025477707006369428,
+    "n_top1": 4,
+    "own_rank_median": 41.0,
+    "chance_top1": 0.006369426751592357
+   },
+   "precision_coverage": {
+    "precision": 0.8453709224086534,
+    "coverage": 0.6370411378928541,
+    "density": 0.7936206456008857,
+    "n_query": 23482,
+    "n_reference": 23482
+   },
+   "precision_coverage_depth_matched": {
+    "precision": 0.8699855208244613,
+    "coverage": 0.6638701984498765,
+    "density": 0.9030959884166595,
+    "detected_median_before": {
+     "R1": 345.0,
+     "Q": 299.0
+    },
+    "detected_median_after": {
+     "R1": 296.0,
+     "Q": 296.0
+    }
+   },
+   "monocyte_pct": {
+    "generated_mean_over_donors": 40.99617834394905,
+    "observed_mean_over_donors": 16.91641814873756,
+    "generated_pooled_cells": 40.99617834394905
+   },
+   "median_umi_per_cell_scoring_genes": {
+    "generated_pooled": 1733.5,
+    "observed_pooled": 1349.0,
+    "generated_mean_of_donor_medians": 1805.3311767578125,
+    "observed_mean_of_donor_medians": 1279.6082802547771
+   },
+   "contrast": {
+    "mean_cp10k": {
+     "per_type": {
+      "T cell": {
+       "r_generated": 0.679505746730158,
+       "r_broadcast": 0.6460056883871542,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.4491214736791483,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.6473840956189109,
+       "n_genes": 3031
+      },
+      "B cell": {
+       "r_generated": 0.6075768948480728,
+       "r_broadcast": 0.6444000112635492,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.378550273867686,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.5754843324397473,
+       "n_genes": 3184
+      },
+      "Monocyte": {
+       "r_generated": 0.7443643337131088,
+       "r_broadcast": 0.7473384415110175,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.44393439199705126,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.7235922895834984,
+       "n_genes": 2877
+      },
+      "NK cell": {
+       "r_generated": 0.7254439178559251,
+       "r_broadcast": 0.6691441416025611,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.5080857906180715,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.66044352746935,
+       "n_genes": 2964
+      }
+     },
+     "mean_r_generated": 0.6892227232868162,
+     "mean_r_broadcast": 0.6767220706910705,
+     "mean_partial_r": 0.44492298254048923
+    },
+    "pseudobulk_log1p_cpm": {
+     "per_type": {
+      "T cell": {
+       "r_generated": 0.4699757616651817,
+       "r_broadcast": 0.6278742931468452,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.12775367285441583,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.624881088500297,
+       "n_genes": 3031
+      },
+      "B cell": {
+       "r_generated": 0.45341963160958537,
+       "r_broadcast": 0.48679841876663843,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.2835717885718594,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.4870103817882968,
+       "n_genes": 3184
+      },
+      "Monocyte": {
+       "r_generated": 0.6524102017600409,
+       "r_broadcast": 0.7105252805736285,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.352083887084631,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.654612781499796,
+       "n_genes": 2877
+      },
+      "NK cell": {
+       "r_generated": 0.5116068540756027,
+       "r_broadcast": 0.5970463821595526,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.2569176190489582,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.5742989986066864,
+       "n_genes": 2964
+      }
+     },
+     "mean_r_generated": 0.5218531122776027,
+     "mean_r_broadcast": 0.6055610936616662,
+     "mean_partial_r": 0.25508174188996613
+    }
+   },
+   "deg_top50": {
+    "types_scored": [
+     "T cell",
+     "B cell",
+     "Monocyte",
+     "NK cell",
+     "DC"
+    ],
+    "types_not_scored": {},
+    "per_type": {
+     "T cell": {
+      "deg_scored": true,
+      "top50_overlap": 26,
+      "top50_jaccard": 0.35135135135135137,
+      "obs_top_list_size": 50,
+      "gen_top_list_size": 50,
+      "top50_overlap_broadcast": 17,
+      "top50_jaccard_broadcast": 0.20481927710843373,
+      "n_cells_obs": 262546,
+      "n_cells_gen": 94743
+     },
+     "B cell": {
+      "deg_scored": true,
+      "top50_overlap": 21,
+      "top50_jaccard": 0.26582278481012656,
+      "obs_top_list_size": 50,
+      "gen_top_list_size": 50,
+      "top50_overlap_broadcast": 14,
+      "top50_jaccard_broadcast": 0.16279069767441862,
+      "n_cells_obs": 48625,
+      "n_cells_gen": 9467
+     },
+     "Monocyte": {
+      "deg_scored": true,
+      "top50_overlap": 26,
+      "top50_jaccard": 0.35135135135135137,
+      "obs_top_list_size": 50,
+      "gen_top_list_size": 50,
+      "top50_overlap_broadcast": 22,
+      "top50_jaccard_broadcast": 0.28205128205128205,
+      "n_cells_obs": 80851,
+      "n_cells_gen": 91028
+     },
+     "NK cell": {
+      "deg_scored": true,
+      "top50_overlap": 19,
+      "top50_jaccard": 0.2345679012345679,
+      "obs_top_list_size": 50,
+      "gen_top_list_size": 50,
+      "top50_overlap_broadcast": 16,
+      "top50_jaccard_broadcast": 0.19047619047619047,
+      "n_cells_obs": 72125,
+      "n_cells_gen": 19257
+     },
+     "DC": {
+      "deg_scored": true,
+      "top50_overlap": 16,
+      "top50_jaccard": 0.19047619047619047,
+      "obs_top_list_size": 50,
+      "gen_top_list_size": 50,
+      "top50_overlap_broadcast": 15,
+      "top50_jaccard_broadcast": 0.17647058823529413,
+      "n_cells_obs": 13572,
+      "n_cells_gen": 2827
+     }
+    },
+    "sum": 108,
+    "sum_4type": 92,
+    "max": 250,
+    "mean": 21.6,
+    "sum_broadcast": 84,
+    "sum_broadcast_4type": 69,
+    "broadcast_n_significant": 2120,
+    "seconds": 0.82
+   },
+   "seconds": 53.0
+  }
+ },
+ "code_sha256": {
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/tools/score_ft.py": "ec5f40b4cea6d5062d0138f3b934abb6465e34cbfeac869c8a0906924c033aec",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/tools/ft_common.py": "4a6366b0f22208cd58714fc0261b8840c643b9d4569704d560cfd93534cbc747",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/utility_studies_final6k_20260925/umap/cell_immicro_5arm/tools/stage_b_embed.py": "d056cfdf38fb0e5f478756f370174e993b75d0c973c48e02e21749175a4ca2da",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/bulk2sc-paper/scripts/evaluate_generated_vs_truth.py": "48b12d794782b840838853e93e0fc55fab00532c4b3698f4588e926b985d2881",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/utility_studies_final6k_20260925/immicro/tools/immicro_common.py": "c5c30e917148cc5e664e91ea30c11bbdff9b6d1f53a3e0a13e16b1917eff37e9",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/aifi_scanvi_rebuild_20260916/predict_scanvi.py": "482ee5dcf4d72b54bc36cbb6dcff62e5030bc7afc46cb5fb01eca73a82ee45a5",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/aifi_scanvi_rebuild_20260916/poisson_readout.py": "8bfa080942fbcdc89ae23b276524a1a83266fb8cbc56b9af279e50f82e6cde38"
+ },
+ "seconds": 70.1
+}

paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20261003T103040Z-crosscohort-k1000-saturation/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_crosscohort_20261002/scores/ji2025_chili/locoL_fullsat_s20000_K1000/README.md

@@ -0,0 +1,73 @@
+# score_ft.py output: ji2025_chili, 33 scored donors
+
+Arms: locoL_fullsat_s20000_K1000.  Every arm is scored on the same donors against the same observed reference.
+
+## Inputs and fixed contracts
+- Observed reference: `/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/ji2025_chili/reference.npz` (sha 19c30f56db69), built from datadir:/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/data/ji2025_chili;
+  observed cells sum exactly to the features pseudobulk of every donor. Observed labels: /home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/ji2025_chili/observed_labels/labels/labels.parquet.
+- Generated cells: `generated_counts` read out once with Poisson(seed 20260916) over the **whole NPZ in row order**
+  (`poisson_readout.poisson_integerise`), then the scored donors' rows. These integer counts are used for labels, embedding,
+  depth and the contrast. Pseudobulk uses the summed `generated_counts` (rates), as `score_generated.py`.
+- Labels: frozen f01common scANVI (`predict_scanvi.py`, CPU, zero query epochs), six-type gate ['T cell', 'B cell', 'Monocyte', 'NK cell', 'DC', 'Other']; query genes =
+  the 1,006-gene annotation list minus genes the dataset's sc assay did not measure in every sample (1004 genes).
+- Scoring genes: 6k panel genes measured by both assays in every sample of the dataset (5752 genes).
+
+## Definitions
+1. **Composition**: fraction of each donor's cells per six-type label (all generated cells; all observed QC cells).
+   `comp_l1` = sum over the six labels of |generated - observed| (immicro_common.l1). `comp_l1_obs_loo_null` = L1 of the
+   donor's observed composition to the mean of the *other scored donors'* observed compositions. `composition_top1` =
+   fraction of donors whose generated composition is closest (L1) to their own observed composition.
+2. **Pseudobulk**: `pb_r` = Pearson r of CPM-log1p(summed generated_counts) vs CPM-log1p(observed pseudobulk) on the scoring
+   genes (evaluate_realbulk.cpm_log1p / paired_r). `pb_top1` = the donor's generated pseudobulk is closest (Pearson) to its own
+   observed pseudobulk among the 33 scored donors (immicro_common.retrieval = evaluate_realbulk.top1 arithmetic).
+3. **Precision / coverage / density** (stage_b_embed.py functions): per-cell CP10K over the scoring genes + log1p; PCA-50
+   (randomized, random_state 20260925) and k = 10 real-real k-NN balls fitted on **R1 of the scored donors only**.
+   Reference rule (independent of fold and arm): per donor, cells in canonical order (library_id+barcode), one
+   permutation from `default_rng([20260925, uint64(sha256(donor)[:8])])`; R1 = first n, R2 = next n,
+   n = min(150, n_cells // 2) (4950 R1 cells here). Generated query: per donor n cells (the donor's R1 size),
+   without replacement, `default_rng([20260926, same key])`. Precision = fraction of generated cells inside any R1 ball
+   (Kynkaanniemi 2019); coverage = fraction of R1 cells whose ball holds a generated cell; density = Naeem 2020.
+   Per-donor precision = that donor's generated cells; per-donor coverage = that donor's R1 cells (the pooled values are
+   their n-weighted means; plain means when every donor has 150 reference cells). R2 (held-out real cells of the same donors) is the
+   perfect-generator control: precision 0.9962, coverage 1.0000.
+   **Depth matched**: stage_b_embed depth matching run pairwise (R1 vs this arm): per donor and within-donor rank of detected
+   genes, both cells are thinned by UMI sampling without replacement to the smaller detected-gene count; PCA kept from
+   un-thinned R1, radii recomputed on thinned R1; fresh rng(20260929) per arm. R2 control: precision
+   0.9968, coverage 1.0000.
+4. **Monocyte %** = 100 x Monocyte fraction (all cells) per donor; **median UMI per cell** = median over cells of the
+   Poisson-read (generated) / observed counts summed over the scoring genes (per donor, and pooled).
+5. **Group contrast** (T, B, Monocyte, NK): case groups ['TOL', 'FU1'] (n = 18) vs control groups ['BC', 'AC'] (n = 15); rule: explicit --case-groups / --control-groups; groups from features groups.
+   Genes per type = scoring genes detected (count > 0) in >= 1 % of the scored donors' observed
+   cells of that type. Primary statistic `mean_cp10k`: per-cell CP10K over the scoring genes; per donor the mean over its
+   cells of the type (donors with >= 1 such cell); group mean = mean over the group's donors (donor-balanced);
+   logFC = log2(case mean + 1) - log2(control mean + 1). Secondary `pseudobulk_log1p_cpm`: the SLE benchmark evaluator's
+   statistic (donor x type summed counts, log1p CPM over the scoring genes, mean case - mean control;
+   evaluate_generated_vs_truth.group_log_fold_change). Both are computed on the generated cells (their frozen labels) and on
+   the observed cells; `r_generated` = Pearson r of the two logFC vectors. Broadcast baseline `r_broadcast`: the same
+   observed vector against the logFC of the input bulk (condition NPZ `bulk_counts` of the arm, scoring genes, per-donor
+   CP10K resp. log1p CPM, group means). `partial_r_generated_given_broadcast`: r of the OLS residuals of observed and
+   generated logFC on the bulk logFC (residual_specificity.py).
+6. **Top-50 DEG overlap** (contrast.csv rows `statistic = welch_top50_deg`; summary `deg_top50`): the SLE benchmark's score (`total_top50_overlap` of
+   `bulk2sc-paper/scripts/evaluate_generated_vs_truth.py`, Welch backend: the "top-50 DEG 81 / 84" of the final model), run
+   with the evaluator's own functions on the same donor x type pseudobulks as the contrast. Per cell type, observed and
+   generated separately: donor x type summed counts on all 5752 scoring genes (donors of the two groups with
+   >= 1 cell of the type) -> `welch_bh_deg` (log1p CPM, two-sided Welch t-test case vs control, Benjamini-Hochberg over the
+   genes with a defined p-value; needs >= 2 donors per group) -> `top_deg_genes` (FDR < 0.05, descending |logFC|,
+   first 50; shorter when fewer genes pass). `top50_overlap` = |observed list & generated list|; `top50_jaccard`
+   the evaluator's Jaccard. Summary `sum` = total over the scored types (the quantity reported as 81), `max` = the sum of
+   the observed list lengths (the "of 262"), `sum_4type` = T + B + Monocyte + NK. A type is scored when its observed test
+   is defined; an arm whose generated test is undefined for a scored type gets overlap 0. Types: T cell, B cell, Monocyte, NK cell, DC
+   (aggregates: /home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/ji2025_chili/deg_reference.npz).
+   **Broadcast analogue** (`top50_overlap_broadcast`, as `sle_broadcast.py` `broadcast_input_bulk`; not part of the
+   published benchmark): the same test on the arm's condition bulk_counts (scoring genes, the 18 + 15
+   donors), one whole-PBMC top-50 list, compared with every type's observed list.
+
+## Files
+- `per_donor.csv`: one row per arm x donor (all per-donor quantities above).
+- `summary.json`: per arm the donor means / pooled values, provenance (NPZ sha, receipt check, generation metadata,
+  Poisson nnz of the whole NPZ, annotation contract), and the reference block (PCA, R2 control).
+- `contrast.csv`: per arm x cell type x statistic (`mean_cp10k`, `pseudobulk_log1p_cpm`: logFC r; `welch_top50_deg`:
+  top-50 DEG overlap, T / B / Monocyte / NK / DC; columns of the other kind are empty).
+- `arms/<arm>/labels/` (predict_scanvi.py labels + manifest), `arms/<arm>/generated_cells.parquet` (NPZ row, donor, label,
+  UMI on the scoring genes, P/C subsample flag), `arms/<arm>/deg_top50_lists.csv` (observed, generated and broadcast
+  top-50 gene lists, Ensembl ids, rank order).