Archive 4 checkpoints (1-4)

paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20260928T225702Z-paired-ft-scsemi-delta/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scores/imperial_eskd/fewshot_n5/draw1_scsemi5/contrast.csv

@@ -0,0 +1,14 @@
+arm,celltype,statistic,n_genes,r_generated,r_broadcast,partial_r_generated_given_broadcast,r_generated_vs_broadcast,n_case_donors_obs,n_control_donors_obs,n_case_donors_gen,n_control_donors_gen,n_cells_obs,n_cells_gen,deg_scored,top50_overlap,top50_jaccard,obs_top_list_size,gen_top_list_size,n_sig_obs,n_sig_gen,top50_overlap_broadcast,top50_jaccard_broadcast,broadcast_top_list_size,n_sig_broadcast
+scsemi5,T cell,mean_cp10k,3031,0.6216931467766444,0.6393101171199623,0.587625625406497,0.29770740155278297,102,32,102,32,239681,133048,,,,,,,,,,,
+scsemi5,T cell,pseudobulk_log1p_cpm,3031,0.354945755824924,0.6360064629967949,0.30141858731094423,0.19973514031339598,102,32,102,32,239681,133048,,,,,,,,,,,
+scsemi5,B cell,mean_cp10k,3188,0.3921663727078082,0.6236351264700181,0.3361144783575504,0.21762364053770225,102,32,101,32,44946,18743,,,,,,,,,,,
+scsemi5,B cell,pseudobulk_log1p_cpm,3188,-0.0007962257691689206,0.4862172069397853,-0.08450124911923894,0.1485446568414446,102,32,101,32,44946,18743,,,,,,,,,,,
+scsemi5,Monocyte,mean_cp10k,2883,0.5567156938097007,0.7132449085093915,0.31423851689297394,0.5160238834129596,101,32,102,32,76538,26547,,,,,,,,,,,
+scsemi5,Monocyte,pseudobulk_log1p_cpm,2883,0.34403585059374175,0.7072577030580933,0.12158099904456728,0.37371268811719577,101,32,102,32,76538,26547,,,,,,,,,,,
+scsemi5,NK cell,mean_cp10k,2966,0.5605587256909219,0.6685247181490744,0.4901638715921738,0.32232842747444074,102,32,100,32,68326,12982,,,,,,,,,,,
+scsemi5,NK cell,pseudobulk_log1p_cpm,2966,0.22165681800752213,0.5979896628156075,0.12545272735909002,0.2061330120076724,102,32,100,32,68326,12982,,,,,,,,,,,
+scsemi5,T cell,welch_top50_deg,5927,,,,,102,32,102,32,239681,133048,True,8,0.08695652173913043,50,50,827,1781,17,0.20481927710843373,50,1949
+scsemi5,B cell,welch_top50_deg,5927,,,,,102,32,101,32,44946,18743,True,4,0.041666666666666664,50,50,255,967,13,0.14942528735632185,50,1949
+scsemi5,Monocyte,welch_top50_deg,5927,,,,,101,32,102,32,76538,26547,True,7,0.07526881720430108,50,50,260,736,24,0.3157894736842105,50,1949
+scsemi5,NK cell,welch_top50_deg,5927,,,,,102,32,100,32,68326,12982,True,7,0.07526881720430108,50,50,386,909,17,0.20481927710843373,50,1949
+scsemi5,DC,welch_top50_deg,5927,,,,,102,32,100,32,12644,6598,True,6,0.06382978723404255,50,50,242,852,15,0.17647058823529413,50,1949

paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20260928T225702Z-paired-ft-scsemi-delta/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scores/imperial_eskd/fewshot_n5/draw1_scsemi5/per_donor.csv

@@ -0,0 +1,144 @@
+arm,donor,group,n_generated_cells,n_observed_cells,n_reference_cells,gen_T cell,obs_T cell,gen_B cell,obs_B cell,gen_Monocyte,obs_Monocyte,gen_NK cell,obs_NK cell,gen_DC,obs_DC,gen_Other,obs_Other,comp_l1,comp_l1_obs_loo_null,pb_r,pb_own_rank,pb_top1,precision,coverage,precision_depth_matched,coverage_depth_matched,mono_pct_gen,mono_pct_obs,median_umi_gen,median_umi_obs
+scsemi5,C20_1004,covid_positive,1500,1810,150,0.666,0.43425414364640885,0.03333333333333333,0.3994475138121547,0.14933333333333335,0.03867403314917127,0.07666666666666666,0.07790055248618785,0.03933333333333333,0.04751381215469613,0.035333333333333335,0.0022099447513812156,0.7510570902394106,0.6004913294178431,0.7531564830709517,102,False,0.36666666666666664,0.013333333333333334,0.26,0.1,14.933333333333335,3.867403314917127,1479.0,1373.5
+scsemi5,C20_1404,covid_positive,1500,5836,150,0.6666666666666666,0.4885195339273475,0.028,0.2705620287868403,0.148,0.015421521590130226,0.08333333333333333,0.204592186429061,0.04066666666666666,0.016620973269362578,0.03333333333333333,0.004283755997258396,0.727641763765136,0.3642782187326007,0.691601657070231,57,False,0.36666666666666664,0.006666666666666667,0.26,0.18,14.799999999999999,1.5421521590130227,1478.0,1473.0
+scsemi5,C21_1004,covid_positive,1500,5552,150,0.9713333333333334,0.8982348703170029,0.004,0.08609510086455331,0.017333333333333333,0.0,0.0,0.0111671469740634,0.0,0.0005403458213256485,0.007333333333333333,0.003962536023054755,0.18760518731988476,0.8290754320960301,0.4790501694269573,55,False,0.3,0.02,0.8666666666666667,0.04,1.7333333333333332,0.0,1476.0,1563.5
+scsemi5,C21_1704,covid_positive,1500,4570,150,0.8153333333333334,0.7275711159737418,0.10866666666666666,0.2214442013129103,0.030666666666666665,0.004814004376367615,0.014666666666666666,0.022319474835886213,0.0013333333333333333,0.011816192560175055,0.029333333333333333,0.012035010940919038,0.2618264040846098,0.6926414033893676,0.5540553742186847,49,False,0.47333333333333333,0.006666666666666667,0.6933333333333334,0.16,3.0666666666666664,0.48140043763676155,1479.0,2131.0
+scsemi5,C21_2504,covid_positive,1500,5048,150,0.8946666666666667,0.7567353407290016,0.0,0.12361331220285261,0.023333333333333334,0.06220285261489699,0.0,0.039619651347068144,0.0,0.011687797147385102,0.082,0.006141045958795562,0.427580559957739,0.555308074679772,0.4902643218579857,3,False,0.46,0.0,0.9466666666666667,0.2,2.3333333333333335,6.220285261489699,1477.0,2692.5
+scsemi5,C23_2204,covid_positive,1500,3088,150,0.606,0.685880829015544,0.106,0.10362694300518134,0.152,0.06703367875647669,0.102,0.11269430051813471,0.03333333333333333,0.025906735751295335,0.0006666666666666666,0.0048575129533678756,0.18953195164075998,0.39409599471189793,0.5975582019721705,19,False,0.26666666666666666,0.006666666666666667,0.43333333333333335,0.21333333333333335,15.2,6.703367875647668,1477.0,1936.5
+scsemi5,C33_1401,covid_positive,1500,3983,150,0.6593333333333333,0.38890283705749434,0.015333333333333332,0.016570424303288978,0.14533333333333334,0.11172483052975145,0.14333333333333334,0.464474014561888,0.012666666666666666,0.014310820989204118,0.024,0.004017072558373086,0.6480438530420956,0.5896374394294868,0.6746834417873127,37,False,0.36666666666666664,0.12666666666666668,0.20666666666666667,0.11333333333333333,14.533333333333335,11.172483052975144,1477.5,909.0
+scsemi5,C33_1601,covid_positive,1500,395,150,0.616,0.14430379746835442,0.050666666666666665,0.11645569620253164,0.032,0.2,0.28933333333333333,0.5240506329113924,0.01,0.007594936708860759,0.002,0.007594936708860759,0.9482025316455697,0.7677029781484593,0.5002725546332666,122,False,0.22,0.14,0.29333333333333333,0.08666666666666667,3.2,20.0,1477.0,644.0
+scsemi5,C33_1901,covid_positive,1500,1947,150,0.2786666666666667,0.3754494093477144,0.034,0.042116076014381096,0.45266666666666666,0.12223934257832562,0.09333333333333334,0.43656908063687727,0.11866666666666667,0.01078582434514638,0.02266666666666667,0.012840267077555213,0.8962691319979456,0.5338275715794653,0.7517658335936466,4,False,0.31333333333333335,0.1,0.32666666666666666,0.18,45.266666666666666,12.223934257832562,1479.0,897.0
+scsemi5,C34_1404,covid_positive,1500,2483,150,0.71,0.8771647200966572,0.034,0.01973419250906162,0.148,0.016915022150624244,0.04533333333333334,0.07047925896093435,0.03266666666666666,0.011679420056383408,0.03,0.004027386226339106,0.38462129144851664,0.7866841890640882,0.7047180079050633,99,False,0.35333333333333333,0.02666666666666667,0.34,0.17333333333333334,14.799999999999999,1.6915022150624244,1478.0,1720.0
+scsemi5,C34_2104,covid_positive,1500,2808,150,0.724,0.7916666666666666,0.06,0.024216524216524215,0.09466666666666666,0.041666666666666664,0.06733333333333333,0.12428774928774929,0.051333333333333335,0.013888888888888888,0.0026666666666666666,0.004273504273504274,0.25245584045584046,0.6156880822041072,0.6597195297888293,28,False,0.35333333333333333,0.006666666666666667,0.4866666666666667,0.30666666666666664,9.466666666666667,4.166666666666666,1476.0,2067.5
+scsemi5,C34_2504,covid_positive,1500,1945,150,0.6446666666666667,0.6961439588688946,0.09533333333333334,0.024678663239074552,0.13866666666666666,0.12544987146529563,0.078,0.12904884318766066,0.04066666666666666,0.02416452442159383,0.0026666666666666666,0.0005141388174807198,0.20505227077977717,0.4246426666085629,0.6300606172102037,18,False,0.16,0.0,0.44,0.17333333333333334,13.866666666666665,12.544987146529563,1477.0,2111.0
+scsemi5,C36_1504,covid_positive,1500,4765,150,0.52,0.7643231899265478,0.20133333333333334,0.14144805876180483,0.206,0.03546694648478489,0.02666666666666667,0.030640083945435468,0.03866666666666667,0.01951731374606506,0.007333333333333333,0.008604407135362015,0.49913536201469044,0.6043398820157845,0.6586609892094283,55,False,0.4066666666666667,0.013333333333333334,0.2866666666666667,0.3333333333333333,20.599999999999998,3.546694648478489,1477.0,1747.0
+scsemi5,C36_1704,covid_positive,1500,1554,150,0.5333333333333333,0.842985842985843,0.19733333333333333,0.07335907335907337,0.18,0.014800514800514801,0.015333333333333332,0.0546975546975547,0.06333333333333334,0.010296010296010296,0.010666666666666666,0.003861003861003861,0.6980334620334621,0.7184734275336759,0.6337619005398578,35,False,0.38,0.006666666666666667,0.2866666666666667,0.36666666666666664,18.0,1.4800514800514801,1477.0,2044.5
+scsemi5,C36_2104,covid_positive,1500,1086,150,0.626,0.7679558011049724,0.106,0.09668508287292818,0.138,0.05432780847145488,0.09466666666666666,0.06353591160220995,0.03266666666666666,0.011970534069981584,0.0026666666666666666,0.0055248618784530384,0.2896279926335175,0.5684133437719349,0.6115051101417505,34,False,0.18,0.0,0.4866666666666667,0.19333333333333333,13.8,5.432780847145488,1478.0,1851.0
+scsemi5,C40_1504,covid_positive,1500,5482,150,0.6873333333333334,0.7433418460415907,0.03333333333333333,0.09649762860269974,0.14733333333333334,0.05600145932141554,0.068,0.09157241882524626,0.03266666666666666,0.009668004377964246,0.03133333333333333,0.002918642831083546,0.28549045360574,0.5118608780184215,0.7496650869916326,14,False,0.34,0.02,0.2733333333333333,0.32,14.733333333333334,5.6001459321415545,1477.0,1253.5
+scsemi5,C40_2204,covid_positive,1500,975,150,0.6753333333333333,0.6933333333333334,0.11466666666666667,0.13538461538461538,0.034666666666666665,0.028717948717948718,0.156,0.12923076923076923,0.002,0.010256410256410256,0.017333333333333333,0.003076923076923077,0.09394871794871795,0.4422968437931516,0.6936497897506458,45,False,0.32666666666666666,0.0,0.62,0.2,3.4666666666666663,2.871794871794872,1478.0,1808.0
+scsemi5,C40_0105,covid_positive,1500,8728,150,0.508,0.42587076076993585,0.18733333333333332,0.036778185151237396,0.21866666666666668,0.4643675527039413,0.03333333333333333,0.05728689275893675,0.04133333333333333,0.013175985334555454,0.011333333333333334,0.0025206232813932174,0.5393088909257561,0.5892920186797782,0.7510672946783861,4,False,0.52,0.006666666666666667,0.32,0.16,21.866666666666667,46.43675527039413,1476.0,1862.0
+scsemi5,C42_1504,covid_positive,1500,2762,150,0.7333333333333333,0.7320782041998551,0.06333333333333334,0.13613323678493844,0.028666666666666667,0.020275162925416364,0.16733333333333333,0.0894279507603186,0.0006666666666666666,0.013758146270818247,0.006666666666666667,0.00832729905865315,0.17510403089548635,0.5291558868111794,0.5548742318687774,45,False,0.08,0.03333333333333333,0.23333333333333334,0.07333333333333333,2.8666666666666667,2.0275162925416366,1478.0,1302.0
+scsemi5,C42_2204,covid_positive,1500,4970,150,0.7953333333333333,0.8511066398390342,0.10066666666666667,0.06317907444668008,0.007333333333333333,0.035211267605633804,0.07133333333333333,0.035211267605633804,0.022,0.012072434607645875,0.0033333333333333335,0.0032193158953722333,0.1673024815560027,0.7355932300783182,0.753312210389848,9,False,0.24,0.0,0.5466666666666666,0.05333333333333334,0.7333333333333333,3.5211267605633805,1478.0,1462.0
+scsemi5,C42_2704,covid_positive,1500,8918,150,0.7866666666666666,0.8535546086566494,0.10533333333333333,0.04619869925992375,0.004666666666666667,0.036891679748822605,0.07466666666666667,0.054047992823503026,0.026,0.006391567616057412,0.0026666666666666666,0.0029154518950437317,0.19872348060103165,0.7404891677135488,0.6907232999055071,26,False,0.4066666666666667,0.02,0.7,0.07333333333333333,0.46666666666666673,3.6891679748822606,1477.0,1489.0
+scsemi5,C58_1604,covid_negative,1500,265,132,0.502,0.7018867924528301,0.162,0.04150943396226415,0.202,0.0037735849056603774,0.04466666666666667,0.2188679245283019,0.07866666666666666,0.01509433962264151,0.010666666666666666,0.018867924528301886,0.7645786163522011,0.5210170745594213,0.6406342331633359,141,False,0.4015151515151515,0.06060606060606061,0.20454545454545456,0.022727272727272728,20.200000000000003,0.37735849056603776,1477.0,1285.0
+scsemi5,C58_2501,covid_positive,1500,1671,150,0.514,0.42848593656493117,0.18066666666666667,0.0353081986834231,0.21666666666666667,0.31717534410532616,0.03333333333333333,0.15320167564332735,0.04733333333333333,0.05326152004787552,0.008,0.012567324955116697,0.46174506283662475,0.34585136457201227,0.7117408225041361,33,False,0.47333333333333333,0.25333333333333335,0.41333333333333333,0.12666666666666668,21.666666666666668,31.717534410532615,1475.0,700.0
+scsemi5,C58_2901,covid_positive,1500,1615,150,0.7453333333333333,0.6179566563467492,0.03666666666666667,0.03653250773993808,0.13933333333333334,0.17956656346749225,0.023333333333333334,0.10835913312693499,0.042666666666666665,0.03219814241486068,0.012666666666666666,0.025386996904024767,0.2759587203302373,0.31199109328144964,0.49601613907076936,63,False,0.17333333333333334,0.18666666666666668,0.62,0.20666666666666667,13.933333333333334,17.956656346749224,1479.0,882.0
+scsemi5,C58_0102,covid_positive,1500,972,150,0.602,0.5339506172839507,0.10266666666666667,0.027777777777777776,0.14466666666666667,0.2880658436213992,0.10333333333333333,0.11316872427983539,0.04666666666666667,0.03292181069958848,0.0006666666666666666,0.00411522633744856,0.3133662551440329,0.3396485470698924,0.57924189165274,87,False,0.26666666666666666,0.12666666666666668,0.4866666666666667,0.08,14.466666666666667,28.80658436213992,1477.0,749.0
+scsemi5,C58_0402,covid_positive,1500,9254,150,0.5813333333333334,0.4245731575534904,0.13133333333333333,0.01988329371082775,0.132,0.4091203803760536,0.118,0.11681435055111303,0.03666666666666667,0.02485411713853469,0.0006666666666666666,0.004754700669980549,0.562416828758735,0.48330314244449224,0.5838485076901108,56,False,0.3466666666666667,0.09333333333333334,0.5133333333333333,0.11333333333333333,13.200000000000001,40.912038037605356,1478.0,1006.0
+scsemi5,C58_1003,recovery,1500,4918,150,0.564,0.5917039446929646,0.14333333333333334,0.02745018300122001,0.12466666666666666,0.1691744611630744,0.0006666666666666666,0.14721431476209842,0.16133333333333333,0.05612037413582757,0.006,0.008336722244814965,0.4421922190592382,0.26376956384374894,0.4932885420435167,60,False,0.18,0.2733333333333333,0.35333333333333333,0.16666666666666666,12.466666666666667,16.917446116307442,1479.0,745.5
+scsemi5,C60_2504,covid_positive,1500,1837,150,0.736,0.8911268372346217,0.11133333333333334,0.05443658138268917,0.03133333333333333,0.00979858464888405,0.10333333333333333,0.032117583015786606,0.0013333333333333333,0.009254218835057159,0.016666666666666666,0.00326619488296135,0.32609544547269104,0.8074787999982093,0.6728688526701458,58,False,0.29333333333333333,0.02666666666666667,0.47333333333333333,0.06666666666666667,3.1333333333333333,0.979858464888405,1481.0,1187.0
+scsemi5,C63_1704,covid_positive,1500,3305,150,0.6613333333333333,0.7718608169440242,0.098,0.11981845688350984,0.036,0.013010590015128594,0.19466666666666665,0.08199697428139183,0.004666666666666667,0.006959152798789713,0.005333333333333333,0.006354009077155824,0.27131820474029245,0.5745797776085927,0.6385793732519192,43,False,0.42,0.013333333333333334,0.5,0.06666666666666667,3.5999999999999996,1.3010590015128594,1476.0,1364.0
+scsemi5,C63_2404,covid_positive,1500,2143,150,0.506,0.6971535230984601,0.202,0.1675221651889874,0.20133333333333334,0.0377974801679888,0.042666666666666665,0.08726084927671489,0.035333333333333335,0.007932804479701353,0.012666666666666666,0.0023331777881474567,0.4714954114170166,0.5205726065284196,0.7197907083631397,85,False,0.4666666666666667,0.02666666666666667,0.36,0.29333333333333333,20.133333333333333,3.7797480167988797,1479.0,1596.0
+scsemi5,C63_2904,covid_positive,1500,1684,150,0.6026666666666667,0.6775534441805225,0.102,0.14251781472684086,0.14466666666666667,0.08491686460807601,0.10933333333333334,0.0855106888361045,0.03266666666666666,0.007719714964370546,0.008666666666666666,0.0017814726840855108,0.23080918448139345,0.4313637477682515,0.5907696878546408,31,False,0.28,0.006666666666666667,0.5666666666666667,0.19333333333333333,14.466666666666667,8.491686460807601,1475.0,1647.5
+scsemi5,C69_1804,covid_negative,1500,6901,150,0.5526666666666666,0.819591363570497,0.16333333333333333,0.028546587451094046,0.20866666666666667,0.0585422402550355,0.009333333333333334,0.04637009129111723,0.05533333333333333,0.03231415736849732,0.010666666666666666,0.014635560063758875,0.6158606965174129,0.6689170397382014,0.5883026698234043,33,False,0.36,0.006666666666666667,0.38,0.24666666666666667,20.866666666666667,5.85422402550355,1477.0,1211.0
+scsemi5,C82_2504,covid_positive,1500,7154,150,0.5266666666666666,0.8433044450656975,0.18733333333333332,0.03228962818003914,0.22,0.047246295778585405,0.022,0.037042214145932346,0.03333333333333333,0.030192899077439196,0.010666666666666666,0.009924517752306402,0.6633599850899264,0.7111604608410802,0.6209603215178393,95,False,0.49333333333333335,0.04,0.31333333333333335,0.16666666666666666,22.0,4.724629577858541,1478.0,1210.0
+scsemi5,C85_2004,covid_negative,1500,3618,150,0.524,0.6199557766721946,0.174,0.026810392482034272,0.22,0.15201768933112217,0.03933333333333333,0.12493090105030404,0.03333333333333333,0.039524599226091764,0.009333333333333334,0.03676064123825318,0.4303438363736871,0.32591831955695433,0.7131786809775998,1,True,0.25333333333333335,0.16666666666666666,0.3466666666666667,0.52,22.0,15.201768933112216,1476.0,1463.5
+scsemi5,C93_2104,covid_positive,1500,5003,150,0.49266666666666664,0.5098940635618628,0.17933333333333334,0.06516090345792525,0.21666666666666667,0.15790525684589246,0.044,0.23246052368578854,0.05733333333333333,0.029982010793523885,0.01,0.004597241655006996,0.41137584116196946,0.15497546364007836,0.7273708641626575,10,False,0.44,0.04666666666666667,0.3,0.2733333333333333,21.666666666666668,15.790525684589246,1478.0,1416.0
+scsemi5,C93_2704,covid_positive,1500,6623,150,0.5406666666666666,0.4635361618601842,0.10266666666666667,0.031103729427751775,0.15666666666666668,0.22044390759474558,0.158,0.26256983240223464,0.04133333333333333,0.018873622225577532,0.0006666666666666666,0.003472746489506266,0.34230630630630626,0.2782062958630936,0.6359770132368262,11,False,0.14,0.006666666666666667,0.47333333333333333,0.18666666666666668,15.666666666666668,22.04439075947456,1479.0,1439.0
+scsemi5,C93_0405,covid_positive,1500,5527,150,0.6053333333333333,0.47421747783607743,0.08466666666666667,0.03057716663651167,0.14533333333333334,0.2131355165550932,0.12866666666666668,0.2529401121765877,0.034,0.026777637054459923,0.002,0.0023520897412701285,0.38485543694590196,0.24433007333249482,0.6073676928038869,4,False,0.12666666666666668,0.04666666666666667,0.49333333333333335,0.20666666666666667,14.533333333333335,21.31355165550932,1479.0,1471.0
+scsemi5,C103_2204,covid_negative,1500,8742,150,0.732,0.5037748798901853,0.07333333333333333,0.06394417753374514,0.10666666666666667,0.2772820864790666,0.030666666666666665,0.1261725005719515,0.05266666666666667,0.0263097689315946,0.004666666666666667,0.0025165865934568747,0.5322425074353696,0.2433929610480895,0.4986962257343978,38,False,0.18666666666666668,0.0,0.54,0.04666666666666667,10.666666666666668,27.728208647906662,1478.0,1718.0
+scsemi5,C104_2204,covid_negative,1500,11388,150,0.9026666666666666,0.29004214963119074,0.018,0.03898840885142255,0.04,0.4137688795223042,0.024,0.18580962416578856,0.012666666666666666,0.06840533895328416,0.0026666666666666666,0.002985598876009835,1.2252490340709516,0.5873872689225684,0.5846613628535127,9,False,0.12,0.013333333333333334,0.5333333333333333,0.10666666666666667,4.0,41.37688795223042,1478.5,1965.5
+scsemi5,C106_2204,covid_negative,1500,9233,150,0.9126666666666666,0.6097693057511101,0.014666666666666666,0.036824434095093686,0.04,0.19451965774937724,0.018666666666666668,0.10733239467128777,0.012666666666666666,0.047980071482725005,0.0013333333333333333,0.003574136250406152,0.6057947218311132,0.3258305729636226,0.5723852420289424,7,False,0.20666666666666667,0.013333333333333334,0.4666666666666667,0.12666666666666668,4.0,19.451965774937722,1477.0,1796.0
+scsemi5,C108_2204,covid_negative,1500,1839,150,0.7046666666666667,0.6688417618270799,0.08,0.0032626427406199023,0.12666666666666668,0.03806416530723219,0.03666666666666667,0.25502990755845567,0.05,0.021750951604132682,0.002,0.013050570962479609,0.4588276237085373,0.5230688572960983,0.511460401979959,95,False,0.25333333333333335,0.06,0.5866666666666667,0.05333333333333334,12.666666666666668,3.8064165307232187,1478.0,1341.0
+scsemi5,C108_1501,covid_positive,1500,1488,150,0.672,0.2956989247311828,0.025333333333333333,0.016129032258064516,0.152,0.21841397849462366,0.094,0.41935483870967744,0.028,0.04032258064516129,0.028666666666666667,0.010080645161290322,0.8081827956989248,0.6138588730792813,0.6604287529856101,53,False,0.24666666666666667,0.09333333333333334,0.26,0.06,15.2,21.841397849462364,1478.0,863.0
+scsemi5,C108_1801,covid_positive,1500,806,150,0.6733333333333333,0.2853598014888337,0.03,0.07568238213399504,0.152,0.08560794044665013,0.09066666666666667,0.47890818858560796,0.024,0.04466501240694789,0.03,0.02977667493796526,0.9091778329197684,0.6805344462810445,0.680421788022815,86,False,0.26,0.14666666666666667,0.16666666666666666,0.10666666666666667,15.2,8.560794044665013,1479.0,676.0
+scsemi5,C108_2201,covid_positive,1500,696,150,0.32266666666666666,0.2988505747126437,0.051333333333333335,0.041666666666666664,0.454,0.09195402298850575,0.06066666666666667,0.5100574712643678,0.072,0.021551724137931036,0.03933333333333333,0.035919540229885055,0.8987816091954023,0.7262486468617357,0.6605277541018297,67,False,0.5066666666666667,0.08,0.43333333333333335,0.08666666666666667,45.4,9.195402298850574,1478.0,1399.5
+scsemi5,C113_0605,covid_positive,1500,3274,150,0.454,0.6053756872327428,0.06133333333333333,0.14141722663408673,0.346,0.032376298106292,0.03,0.03512522907758094,0.102,0.030849114233353694,0.006666666666666667,0.1548564447159438,0.7695491753207085,0.5610453471989747,0.7156175432025954,27,False,0.72,0.06,0.44,0.62,34.599999999999994,3.2376298106292003,1476.0,2026.0
+scsemi5,C123_2404,covid_positive,1500,3758,150,0.2833333333333333,0.5516232038318254,0.036,0.04922831293241086,0.4646666666666667,0.08541777541245343,0.11533333333333333,0.271953166577967,0.03666666666666667,0.032730175625332626,0.064,0.009047365620010643,0.8762760333510732,0.3215679971400515,0.6414436953801218,11,False,0.36666666666666664,0.02,0.5466666666666666,0.18,46.46666666666667,8.541777541245343,1479.0,1299.0
+scsemi5,C123_2904,covid_positive,1500,3252,150,0.32133333333333336,0.49231242312423124,0.03,0.07380073800738007,0.454,0.19034440344403444,0.07133333333333333,0.22478474784747848,0.06933333333333333,0.01107011070110701,0.054,0.007687576875768758,0.7364624846248462,0.1452495457529155,0.5934517121766538,4,False,0.5333333333333333,0.013333333333333334,0.68,0.22,45.4,19.034440344403443,1478.0,1489.0
+scsemi5,C123_0505,covid_positive,1500,2266,150,0.33466666666666667,0.4854368932038835,0.03333333333333333,0.05383936451897617,0.466,0.27184466019417475,0.04066666666666666,0.13901147396293026,0.043333333333333335,0.025154457193292144,0.082,0.02471315092674316,0.5392421300382466,0.2257882712311602,0.6068913500870908,15,False,0.5133333333333333,0.013333333333333334,0.82,0.2,46.6,27.184466019417474,1479.0,1849.0
+scsemi5,C124_2404,covid_positive,1500,2290,150,0.376,0.5100436681222708,0.36733333333333335,0.18777292576419213,0.128,0.08340611353711791,0.04066666666666666,0.19519650655021833,0.03266666666666666,0.017903930131004366,0.05533333333333333,0.005676855895196507,0.5771470160116449,0.2192243647813003,0.709697406246277,46,False,0.5466666666666666,0.013333333333333334,0.48,0.16666666666666666,12.8,8.340611353711791,1479.0,1635.0
+scsemi5,C124_2704,covid_positive,1500,4137,150,0.38533333333333336,0.5112400290065264,0.36533333333333334,0.11965192168237854,0.12466666666666666,0.06961566352429296,0.03333333333333333,0.27870437515107566,0.04533333333333334,0.015711868503746677,0.046,0.005076142131979695,0.7425554749818708,0.25239081558789916,0.6870972152478524,48,False,0.5133333333333333,0.013333333333333334,0.5333333333333333,0.24,12.466666666666667,6.961566352429297,1477.0,1328.0
+scsemi5,C124_0105,covid_positive,1500,5245,150,0.3933333333333333,0.5548141086749285,0.3606666666666667,0.07740705433746425,0.12266666666666666,0.06444232602478552,0.03266666666666666,0.25681601525262154,0.046,0.041182078169685415,0.04466666666666667,0.005338417540514776,0.7712602478551002,0.31668696537132995,0.6952461443145925,35,False,0.5,0.006666666666666667,0.4666666666666667,0.21333333333333335,12.266666666666666,6.444232602478552,1478.0,1944.0
+scsemi5,C126_2504,covid_positive,1500,8159,150,0.6526666666666666,0.5618335580340728,0.10933333333333334,0.056992278465498224,0.132,0.2332393675695551,0.06733333333333333,0.11177840421620297,0.035333333333333335,0.028925113371736734,0.0033333333333333335,0.0072312783429341835,0.29916476692405114,0.2735472165459468,0.5937090121072611,6,False,0.18666666666666668,0.04,0.48,0.2,13.200000000000001,23.32393675695551,1479.0,1410.0
+scsemi5,C126_3004,covid_positive,1500,7181,150,0.814,0.743629021027712,0.10333333333333333,0.05848767581116836,0.005333333333333333,0.05082857540732488,0.06133333333333333,0.1211530427517059,0.014666666666666666,0.0181033282272664,0.0013333333333333333,0.007798356774822448,0.23043327298890587,0.5126438831181791,0.6410849864093882,8,False,0.4,0.02666666666666667,0.62,0.20666666666666667,0.5333333333333333,5.082857540732489,1477.5,1641.0
+scsemi5,C126_0605,covid_positive,1500,6577,150,0.7433333333333333,0.5716892200091227,0.08733333333333333,0.11023262885814201,0.058666666666666666,0.08712178804926259,0.06,0.16618519081648167,0.04733333333333333,0.055648471947696516,0.0033333333333333335,0.009122700319294512,0.34328822664842124,0.21966724708715352,0.5780576281619891,8,False,0.3466666666666667,0.06,0.6333333333333333,0.11333333333333333,5.866666666666666,8.712178804926259,1478.0,1620.0
+scsemi5,C127_2504,covid_positive,1500,2691,150,0.332,0.6648086213303604,0.052,0.10999628390932739,0.4553333333333333,0.03121516164994426,0.052,0.18097361575622445,0.06,0.00966183574879227,0.048666666666666664,0.0033444816053511705,1.0395570419918245,0.3625505284053567,0.6404741907608811,122,False,0.36666666666666664,0.0,0.3933333333333333,0.12666666666666668,45.53333333333333,3.121516164994426,1479.0,1559.0
+scsemi5,C127_0405,covid_positive,1500,9080,150,0.49066666666666664,0.4183920704845815,0.198,0.07444933920704846,0.218,0.24295154185022028,0.042666666666666665,0.24295154185022028,0.04133333333333333,0.018502202643171806,0.009333333333333334,0.0027533039647577094,0.4504728340675477,0.2793085432998465,0.6936183921524954,12,False,0.4866666666666667,0.02666666666666667,0.3,0.12,21.8,24.295154185022028,1479.0,1270.0
+scsemi5,C127_1105,covid_positive,1500,5124,150,0.8793333333333333,0.5739656518345043,0.012666666666666666,0.09543325526932084,0.048,0.14910226385636222,0.042,0.1649102263856362,0.014,0.01522248243559719,0.004,0.001366120218579235,0.6160031225604995,0.17017449536860002,0.6157406093188686,30,False,0.31333333333333335,0.04,0.44,0.14,4.8,14.910226385636221,1479.0,1529.5
+scsemi5,C128_2504,covid_positive,1500,4306,150,0.6873333333333334,0.6421272642823966,0.03933333333333333,0.06618671620993961,0.14266666666666666,0.1692986530422666,0.07066666666666667,0.09939619136089178,0.028,0.02275894101254064,0.032,0.00023223409196470042,0.16442978789286272,0.31291921800459493,0.7117152821143177,91,False,0.34,0.006666666666666667,0.10666666666666667,0.06,14.266666666666666,16.92986530422666,1479.0,1385.5
+scsemi5,C128_0405,covid_positive,1500,4498,150,0.498,0.7550022232103157,0.20133333333333334,0.13361493997332147,0.21266666666666667,0.053357047576700754,0.035333333333333335,0.048910626945309024,0.04733333333333333,0.007114273010226767,0.005333333333333333,0.0020008892841262785,0.5411590336445827,0.565249503428795,0.7125683168597748,84,False,0.44,0.0,0.35333333333333333,0.12666666666666668,21.266666666666666,5.335704757670076,1478.5,1437.0
+scsemi5,C128_1105,covid_positive,1500,6655,150,0.9033333333333333,0.7095416979714501,0.017333333333333333,0.04552967693463561,0.046,0.15251690458302028,0.020666666666666667,0.05875281743050338,0.012,0.03215627347858753,0.0006666666666666666,0.0015026296018031556,0.3875832707237665,0.4510859769357033,0.6111117823910904,17,False,0.12666666666666668,0.02,0.31333333333333335,0.18,4.6,15.251690458302027,1478.0,1871.0
+scsemi5,C132_2804,covid_positive,1500,5471,150,0.814,0.7344178395174557,0.104,0.13087186985925792,0.004,0.021568269055017363,0.052,0.09376713580698227,0.026,0.01772984829098885,0.0,0.0016450374702979345,0.17570462438311094,0.520237047538686,0.6163411771541232,35,False,0.31333333333333335,0.05333333333333334,0.5133333333333333,0.15333333333333332,0.4,2.1568269055017364,1475.0,1362.0
+scsemi5,C132_0205,covid_positive,1500,4671,150,0.8033333333333333,0.6112181545707557,0.112,0.11432241490044959,0.006666666666666667,0.08948833226289873,0.05466666666666667,0.13680154142581888,0.023333333333333334,0.046242774566473986,0.0,0.0019267822736030828,0.3842303575251553,0.2816026393649707,0.6185999155084912,39,False,0.36666666666666664,0.02666666666666667,0.6066666666666667,0.12,0.6666666666666667,8.948833226289873,1478.0,1457.0
+scsemi5,C132_1105,covid_positive,1500,4699,150,0.9073333333333333,0.6814215790593743,0.016,0.19472228133645456,0.04533333333333334,0.04618003830602256,0.007333333333333333,0.06873802936795063,0.023333333333333334,0.007022770802298362,0.0006666666666666666,0.001915301127899553,0.484444633609988,0.5419453495769165,0.5690649171318526,44,False,0.2,0.006666666666666667,0.48,0.13333333333333333,4.533333333333333,4.618003830602256,1475.5,1737.0
+scsemi5,C137_3004,covid_negative,1500,4387,150,0.744,0.5030772737633918,0.07666666666666666,0.10987007066332345,0.08733333333333333,0.2227034419876909,0.058,0.1395030772737634,0.030666666666666665,0.019603373603829497,0.0033333333333333335,0.005242762708000912,0.5039720385988906,0.13252427808111147,0.5694707101259041,66,False,0.31333333333333335,0.05333333333333334,0.6666666666666666,0.08,8.733333333333333,22.27034419876909,1478.0,1107.0
+scsemi5,C137_2502,recovery,1500,2012,150,0.5213333333333333,0.5690854870775348,0.19866666666666666,0.17047713717693838,0.18933333333333333,0.12326043737574553,0.02666666666666667,0.11381709741550695,0.056,0.003976143141153081,0.008,0.019383697813121274,0.292572564612326,0.2724221453184065,0.6807413700404792,36,False,0.41333333333333333,0.04666666666666667,0.30666666666666664,0.16,18.933333333333334,12.326043737574553,1476.0,1359.5
+scsemi5,C138_3004,covid_negative,1500,1909,150,0.7266666666666667,0.34468308014667365,0.082,0.025144054478784705,0.08533333333333333,0.3609219486642221,0.07133333333333333,0.1959140911471975,0.029333333333333333,0.06862231534834992,0.005333333333333333,0.004714510214772132,0.8789167103195391,0.5145646129945836,0.5615486904292121,59,False,0.38,0.03333333333333333,0.52,0.06666666666666667,8.533333333333333,36.09219486642221,1475.0,1398.0
+scsemi5,C138_2301,covid_positive,1500,964,150,0.65,0.38278008298755184,0.034,0.0508298755186722,0.14533333333333334,0.12033195020746888,0.11133333333333334,0.3153526970954357,0.023333333333333334,0.03734439834024896,0.036,0.09336099585062241,0.5844426002766252,0.45853676495599766,0.7875907347375194,1,True,0.3466666666666667,0.05333333333333334,0.26,0.14666666666666667,14.533333333333335,12.033195020746888,1478.5,1072.0
+scsemi5,C138_3001,covid_positive,1500,731,150,0.7,0.12311901504787962,0.08,0.08207934336525308,0.014,0.4008207934336525,0.18266666666666667,0.27359781121751026,0.004,0.02188782489740082,0.019333333333333334,0.09849521203830369,1.1537619699042407,0.8447747757854266,0.7773019860125885,126,False,0.34,0.1,0.41333333333333333,0.19333333333333333,1.4000000000000001,40.08207934336525,1478.0,1223.0
+scsemi5,C138_0202,covid_positive,1500,2861,150,0.49533333333333335,0.2153093324012583,0.196,0.0740999650471863,0.214,0.5159035302341839,0.04733333333333333,0.1422579517651171,0.03666666666666667,0.04194337644180356,0.010666666666666666,0.01048584411045089,0.8042097168822092,0.7278592878456447,0.7413836263410579,22,False,0.3466666666666667,0.05333333333333334,0.3333333333333333,0.12,21.4,51.59035302341839,1477.0,1031.0
+scsemi5,C138_0402,covid_positive,1500,500,150,0.482,0.344,0.18266666666666667,0.074,0.23066666666666666,0.304,0.04,0.202,0.048666666666666664,0.008,0.016,0.068,0.5746666666666668,0.44694714240649364,0.7237360860830463,44,False,0.3466666666666667,0.04666666666666667,0.3933333333333333,0.08666666666666667,23.066666666666666,30.4,1476.0,1847.5
+scsemi5,C140_3004,covid_negative,1500,3196,150,0.838,0.27252816020025034,0.09733333333333333,0.3886107634543179,0.0033333333333333335,0.12484355444305381,0.035333333333333335,0.13610763454317898,0.02266666666666667,0.07165206508135169,0.0033333333333333335,0.006257822277847309,1.1309436795994994,0.6482568391620279,0.5133084755669153,102,False,0.35333333333333333,0.09333333333333334,0.62,0.04,0.33333333333333337,12.48435544430538,1479.0,915.5
+scsemi5,C140_2801,covid_positive,1500,226,113,0.674,0.26991150442477874,0.04066666666666666,0.2610619469026549,0.14466666666666667,0.11946902654867257,0.072,0.3230088495575221,0.03666666666666667,0.02654867256637168,0.032,0.0,0.9428082595870207,0.6068657551167502,0.7267560462520261,90,False,0.2920353982300885,0.11504424778761062,0.22123893805309736,0.05309734513274336,14.466666666666667,11.946902654867257,1479.0,1194.0
+scsemi5,C140_3001,covid_positive,1500,6088,150,0.48533333333333334,0.12220762155059132,0.20733333333333334,0.2664257555847569,0.19066666666666668,0.33327858081471745,0.048,0.2176412614980289,0.059333333333333335,0.056504599211563734,0.009333333333333334,0.003942181340341655,0.7426911957950064,0.7898736886381303,0.695509489296603,56,False,0.43333333333333335,0.06,0.3466666666666667,0.04666666666666667,19.066666666666666,33.327858081471746,1477.0,925.0
+scsemi5,C140_0202,covid_positive,1500,3567,150,0.792,0.2612839921502663,0.10866666666666666,0.29072049341183065,0.004,0.16232127838519764,0.07533333333333334,0.2321278385197645,0.018,0.04513596860106532,0.002,0.008410428931875526,1.0614320156994674,0.5161650690484364,0.5953133870893584,80,False,0.46,0.05333333333333334,0.7266666666666667,0.08666666666666667,0.4,16.232127838519762,1479.0,1057.0
+scsemi5,C140_0402,covid_positive,1500,1593,150,0.7986666666666666,0.15065913370998116,0.11333333333333333,0.49466415568110483,0.002,0.0696798493408663,0.06533333333333333,0.2542372881355932,0.020666666666666667,0.025109855618330193,0.0,0.005649717514124294,1.2960150659133713,0.9365270498297922,0.5529386000861878,112,False,0.47333333333333333,0.03333333333333333,0.6666666666666666,0.013333333333333334,0.2,6.96798493408663,1477.5,840.0
+scsemi5,C140_0602,covid_positive,1500,2196,150,0.778,0.13479052823315119,0.11333333333333333,0.28734061930783245,0.006666666666666667,0.31785063752276865,0.078,0.16939890710382513,0.024,0.08378870673952642,0.0,0.006830601092896175,1.2864189435336977,0.7676679356678244,0.5759972584488399,82,False,0.3466666666666667,0.1,0.6133333333333333,0.14,0.6666666666666667,31.785063752276866,1477.0,902.0
+scsemi5,C140_0902,covid_positive,1500,2211,150,0.8213333333333334,0.13251922207146088,0.10133333333333333,0.37403889642695615,0.0033333333333333335,0.2618724559023066,0.05,0.182722749886929,0.022,0.04296698326549073,0.002,0.005879692446856626,1.3776282225237448,0.7653754653833613,0.5374422347300607,102,False,0.36666666666666664,0.03333333333333333,0.6133333333333333,0.07333333333333333,0.33333333333333337,26.187245590230663,1477.0,1221.0
+scsemi5,C140_1103,recovery,1500,1468,150,0.7986666666666666,0.3528610354223433,0.10333333333333333,0.30040871934604907,0.0033333333333333335,0.10422343324250681,0.06866666666666667,0.20299727520435967,0.025333333333333333,0.027929155313351498,0.0006666666666666666,0.011580381471389645,0.8916112624886469,0.44553615129721363,0.5876549762899689,94,False,0.3933333333333333,0.05333333333333334,0.62,0.05333333333333334,0.33333333333333337,10.422343324250681,1477.0,1276.5
+scsemi5,C141_2001,covid_positive,1500,3028,150,0.6893333333333334,0.3543593130779392,0.029333333333333333,0.014200792602377808,0.15466666666666667,0.35402906208718626,0.07,0.10997357992073976,0.02266666666666667,0.04722589167767503,0.034,0.1202113606340819,0.7002131219726994,0.6252784816802716,0.7167713916501842,1,True,0.31333333333333335,0.1,0.24,0.16,15.466666666666667,35.402906208718626,1476.0,1203.0
+scsemi5,C141_2201,covid_positive,1500,2514,150,0.6893333333333334,0.37748607796340494,0.03333333333333333,0.07438345266507558,0.14933333333333335,0.31145584725536996,0.07333333333333333,0.11177406523468576,0.016666666666666666,0.0588703261734288,0.038,0.066030230708035,0.6236945107398569,0.4550586611560526,0.714412057196852,2,False,0.28,0.12666666666666668,0.18666666666666668,0.14,14.933333333333335,31.145584725536995,1477.0,892.0
+scsemi5,C141_3001,covid_positive,1500,1237,150,0.3446666666666667,0.3556992724333064,0.034,0.116410670978173,0.464,0.28698464025869036,0.030666666666666665,0.09215844785772029,0.08533333333333333,0.02263540824575586,0.04133333333333333,0.12611156022635409,0.4794265696577743,0.4686970442815185,0.6430469534387746,1,True,0.32,0.09333333333333334,0.17333333333333334,0.20666666666666667,46.400000000000006,28.698464025869036,1480.0,1561.0
+scsemi5,C141_0202,covid_positive,1500,1025,150,0.56,0.5629268292682926,0.168,0.041951219512195125,0.20933333333333334,0.15609756097560976,0.016,0.18341463414634146,0.03933333333333333,0.02048780487804878,0.007333333333333333,0.0351219512195122,0.3962601626016259,0.19927823818616472,0.6084681469610755,51,False,0.4533333333333333,0.06,0.31333333333333335,0.14,20.933333333333334,15.609756097560975,1477.0,1487.0
+scsemi5,C145_3004,covid_negative,1500,743,150,0.82,0.6002691790040376,0.10533333333333333,0.05787348586810229,0.0026666666666666666,0.033647375504710635,0.048666666666666664,0.26648721399730824,0.021333333333333333,0.018842530282637954,0.002,0.02288021534320323,0.5393629430237775,0.41063782492923867,0.5295716853866008,94,False,0.4266666666666667,0.08666666666666667,0.5733333333333334,0.1,0.26666666666666666,3.3647375504710633,1479.0,894.0
+scsemi5,C145_0701,covid_positive,1500,1110,150,0.6706666666666666,0.3036036036036036,0.052,0.26306306306306304,0.14,0.1963963963963964,0.088,0.1972972972972973,0.020666666666666667,0.03063063063063063,0.028666666666666667,0.009009009009009009,0.7734414414414414,0.3934875834247578,0.6574223115021253,52,False,0.12666666666666668,0.06666666666666667,0.06,0.07333333333333333,14.000000000000002,19.63963963963964,1479.0,848.5
+scsemi5,C145_1201,covid_positive,1500,347,150,0.704,0.207492795389049,0.024666666666666667,0.5504322766570605,0.13133333333333333,0.0345821325648415,0.098,0.14697406340057637,0.017333333333333333,0.02881844380403458,0.024666666666666667,0.03170028818443804,1.1865168107588857,0.9102482760236211,0.547395251944824,141,False,0.12666666666666668,0.07333333333333333,0.04666666666666667,0.02,13.133333333333333,3.45821325648415,1475.0,627.0
+scsemi5,C145_1401,covid_positive,1500,1060,150,0.31666666666666665,0.2169811320754717,0.05333333333333334,0.2650943396226415,0.4493333333333333,0.22641509433962265,0.06533333333333333,0.24716981132075472,0.07933333333333334,0.016037735849056604,0.036,0.02830188679245283,0.787194968553459,0.5868900525589895,0.6242020044159119,38,False,0.16,0.06666666666666667,0.16666666666666666,0.10666666666666667,44.93333333333333,22.641509433962266,1478.5,861.0
+scsemi5,C145_1901,covid_positive,1500,1173,150,0.5153333333333333,0.32821824381926684,0.20533333333333334,0.24296675191815856,0.19266666666666668,0.216538789428815,0.016666666666666666,0.16112531969309463,0.06266666666666666,0.0247229326513214,0.007333333333333333,0.026427962489343565,0.4501176470588234,0.3747963883022996,0.5844373553951201,40,False,0.31333333333333335,0.08,0.3333333333333333,0.16,19.26666666666667,21.653878942881498,1479.0,1148.0
+scsemi5,C145_2301,covid_positive,1500,958,150,0.524,0.5198329853862212,0.19666666666666666,0.1638830897703549,0.20666666666666667,0.10334029227557412,0.02666666666666667,0.1826722338204593,0.038,0.009394572025052192,0.008,0.020876826722338204,0.3377647877522617,0.17892430748270988,0.635359921360809,46,False,0.3333333333333333,0.08,0.24666666666666667,0.1,20.666666666666668,10.334029227557412,1478.0,1421.0
+scsemi5,C146_3004,covid_negative,1500,2608,150,0.9393333333333334,0.7346625766871165,0.008,0.049079754601226995,0.027333333333333334,0.125,0.0026666666666666666,0.05253067484662577,0.020666666666666667,0.03450920245398773,0.002,0.004217791411042945,0.4093415132924336,0.5113393507286424,0.5064799912911155,42,False,0.08,0.21333333333333335,0.6666666666666666,0.18666666666666668,2.7333333333333334,12.5,1476.0,845.5
+scsemi5,C146_1201,covid_positive,1500,3205,150,0.68,0.5691107644305772,0.038,0.10452418096723869,0.152,0.2343213728549142,0.08333333333333333,0.05585023400936037,0.018,0.027769110764430577,0.028666666666666667,0.008424336973478939,0.3172293291731671,0.29819425556168294,0.705920989689823,25,False,0.29333333333333333,0.09333333333333334,0.11333333333333333,0.11333333333333333,15.2,23.432137285491418,1476.0,854.0
+scsemi5,C146_1401,covid_positive,1500,1733,150,0.8613333333333333,0.6641661858049625,0.020666666666666667,0.09001731102135026,0.054,0.14945181765724178,0.048,0.06520484708597807,0.014,0.029428736295441432,0.002,0.0017311021350259665,0.3948720907866898,0.36268422432729647,0.6215380935204506,56,False,0.11333333333333333,0.10666666666666667,0.28,0.06666666666666667,5.4,14.945181765724177,1478.0,758.0
+scsemi5,C146_1601,covid_positive,1500,363,150,0.668,0.4573002754820937,0.043333333333333335,0.2975206611570248,0.154,0.06336088154269973,0.09,0.1322314049586777,0.012666666666666666,0.0440771349862259,0.032,0.005509641873278237,0.6556584022038567,0.38378040252761075,0.6822679079004992,141,False,0.35333333333333333,0.14666666666666667,0.10666666666666667,0.06666666666666667,15.4,6.336088154269973,1476.0,577.0
+scsemi5,C146_1901,covid_positive,1500,2803,150,0.698,0.708169818052087,0.034,0.13877987870139136,0.144,0.06814127720299679,0.07133333333333333,0.06778451658936853,0.021333333333333333,0.00856225472707813,0.03133333333333333,0.00856225472707813,0.22989939350695682,0.4901921167363753,0.6758129176302774,10,False,0.19333333333333333,0.11333333333333333,0.16666666666666666,0.06666666666666667,14.399999999999999,6.814127720299679,1477.0,820.0
+scsemi5,C146_2301,covid_positive,1500,1330,150,0.7566666666666667,0.649624060150376,0.102,0.13458646616541353,0.006,0.0518796992481203,0.12666666666666668,0.1443609022556391,0.008666666666666666,0.006015037593984963,0.0,0.013533834586466165,0.21938847117794488,0.3647137758609975,0.5145885799716164,85,False,0.46,0.02666666666666667,0.5733333333333334,0.04666666666666667,0.6,5.18796992481203,1478.0,953.5
+scsemi5,C146_2701,covid_positive,1500,1109,150,0.506,0.4211000901713255,0.20266666666666666,0.16050495942290352,0.21533333333333332,0.3155996393146979,0.034,0.06492335437330929,0.034,0.019837691614066726,0.008,0.018034265103697024,0.28244785091674185,0.37869799292792744,0.6913727086808955,17,False,0.37333333333333335,0.05333333333333334,0.37333333333333335,0.10666666666666667,21.53333333333333,31.55996393146979,1478.0,1485.0
+scsemi5,C146_2502,recovery,1500,5129,150,0.6853333333333333,0.71475921232209,0.09533333333333334,0.04679274712419575,0.12266666666666666,0.14837200233963735,0.05,0.06336517839734841,0.04533333333333334,0.01852212906999415,0.0013333333333333333,0.008188730746734256,0.15070358094495348,0.4638702773615516,0.5522666352422587,42,False,0.15333333333333332,0.04666666666666667,0.4866666666666667,0.15333333333333332,12.266666666666666,14.837200233963735,1478.5,1290.0
+scsemi5,C147_3004,covid_negative,1500,2048,150,0.7206666666666667,0.59375,0.07466666666666667,0.1328125,0.12,0.109375,0.028,0.1259765625,0.04533333333333334,0.0322265625,0.011333333333333334,0.005859375,0.31224479166666663,0.23767029715219964,0.4895064592979775,70,False,0.14,0.08666666666666667,0.5933333333333334,0.14666666666666667,12.0,10.9375,1480.0,1014.0
+scsemi5,C147_1401,covid_positive,1500,2973,150,0.6866666666666666,0.2263706693575513,0.03266666666666666,0.2472250252270434,0.14666666666666667,0.3871510258997645,0.07733333333333334,0.110326269761184,0.019333333333333334,0.02119071644803229,0.037333333333333336,0.007736293306424487,0.9797860746720485,0.6940749853803352,0.6941991716453996,82,False,0.46,0.10666666666666667,0.25333333333333335,0.06,14.666666666666666,38.71510258997645,1480.0,1017.0
+scsemi5,C147_1901,covid_positive,1500,3691,150,0.5,0.42021132484421564,0.196,0.24735843944730426,0.20066666666666666,0.04958005960444324,0.042666666666666665,0.21376320780276348,0.051333333333333335,0.006502302898943376,0.009333333333333334,0.06258466540232999,0.5514126253047955,0.4316146775994987,0.6662973156342605,93,False,0.46,0.12666666666666668,0.21333333333333335,0.04666666666666667,20.066666666666666,4.958005960444324,1475.0,844.0
+scsemi5,C152_0405,covid_negative,1500,4046,150,0.95,0.8826000988630747,0.002,0.014335145823035097,0.02,0.04572417202174987,0.0013333333333333333,0.04745427582797825,0.021333333333333333,0.009886307464162136,0.005333333333333333,0.0,0.1683605206788597,0.7903052283484736,0.5405740846637014,29,False,0.15333333333333332,0.04,0.5733333333333334,0.13333333333333333,2.0,4.572417202174988,1479.0,1464.5
+scsemi5,C161_1105,covid_negative,1500,820,150,0.7153333333333334,0.6743902439024391,0.08533333333333333,0.06341463414634146,0.04,0.20853658536585365,0.06666666666666667,0.00975609756097561,0.007333333333333333,0.03902439024390244,0.08533333333333333,0.004878048780487805,0.40045528455284546,0.4661763812403061,0.6297346068108156,70,False,0.2,0.013333333333333334,0.4066666666666667,0.11333333333333333,4.0,20.853658536585364,1479.0,1665.0
+scsemi5,C167_1205,covid_negative,1500,9978,150,0.9413333333333334,0.7162758067749048,0.005333333333333333,0.03487672880336741,0.029333333333333333,0.08819402685909,0.0026666666666666666,0.149929845660453,0.018,0.008719182200841852,0.0033333333333333335,0.0020044097013429546,0.4713345359791542,0.4553140485089203,0.5196411950310345,34,False,0.06666666666666667,0.006666666666666667,0.8933333333333333,0.11333333333333333,2.933333333333333,8.819402685909001,1477.0,1452.0
+scsemi5,C168_1205,covid_negative,1500,2323,150,0.6253333333333333,0.49978476108480413,0.10066666666666667,0.05337925096857512,0.14266666666666666,0.21437795953508396,0.09333333333333334,0.16272061988807576,0.03666666666666667,0.06371071889797675,0.0013333333333333333,0.006026689625484288,0.34567197589324145,0.17387767690726136,0.5615263245001793,50,False,0.19333333333333333,0.2,0.52,0.17333333333333334,14.266666666666666,21.437795953508395,1476.0,781.0
+scsemi5,C168_2001,covid_positive,1500,2751,150,0.818,0.3300617957106507,0.018666666666666668,0.31842966194111233,0.048666666666666664,0.18684114867320975,0.07133333333333333,0.11959287531806616,0.005333333333333333,0.03744093057070156,0.038,0.007633587786259542,1.0366092330061794,0.4584015454708214,0.6593643883415238,79,False,0.11333333333333333,0.03333333333333333,0.30666666666666664,0.06666666666666667,4.866666666666666,18.684114867320975,1479.0,945.0
+scsemi5,C168_2301,covid_positive,1500,901,150,0.6933333333333334,0.42730299667036625,0.04533333333333334,0.19200887902330743,0.11066666666666666,0.051054384017758046,0.072,0.2885682574916759,0.05333333333333334,0.03551609322974473,0.025333333333333333,0.005549389567147614,0.7264876063633001,0.3842553718824635,0.6357366022492229,96,False,0.44666666666666666,0.05333333333333334,0.2,0.03333333333333333,11.066666666666666,5.105438401775805,1477.5,853.0
+scsemi5,C168_3001,covid_positive,1500,1160,150,0.48733333333333334,0.3931034482758621,0.20533333333333334,0.10775862068965517,0.208,0.28706896551724137,0.036,0.1310344827586207,0.05266666666666667,0.06810344827586207,0.010666666666666666,0.01293103448275862,0.3836091954022989,0.31920021877701454,0.7287124891781125,12,False,0.5333333333333333,0.15333333333333332,0.35333333333333333,0.2,20.8,28.706896551724135,1480.0,837.0
+scsemi5,C168_0202,covid_positive,1500,651,150,0.7306666666666667,0.2903225806451613,0.07733333333333334,0.18125960061443933,0.08466666666666667,0.3302611367127496,0.068,0.09984639016897082,0.034666666666666665,0.09831029185867896,0.004666666666666667,0.0,0.8900215053763442,0.59264012147251,0.5422151827406722,111,False,0.4266666666666667,0.07333333333333333,0.62,0.06,8.466666666666667,33.026113671274956,1479.0,670.0
+scsemi5,C168_0403,recovery,1500,2526,150,0.49733333333333335,0.29493269992082344,0.20333333333333334,0.08036421219319081,0.21533333333333332,0.4398258115597783,0.034,0.1421219319081552,0.042666666666666665,0.0344418052256532,0.007333333333333333,0.00831353919239905,0.6671892319873317,0.5573906247616708,0.701600483595687,18,False,0.38,0.06,0.2866666666666667,0.1,21.53333333333333,43.982581155977826,1476.0,1080.0
+scsemi5,C169_1205,covid_negative,1500,1252,150,0.6166666666666667,0.444888178913738,0.098,0.11421725239616613,0.14466666666666667,0.15175718849840256,0.114,0.2340255591054313,0.024,0.031150159744408944,0.0026666666666666666,0.023961661341853034,0.34355697550585734,0.14010993951406459,0.5330758551600138,76,False,0.21333333333333335,0.10666666666666667,0.5266666666666666,0.12666666666666668,14.466666666666667,15.175718849840255,1478.0,1000.0
+scsemi5,C169_2001,covid_positive,1500,755,150,0.8513333333333334,0.5814569536423841,0.015333333333333332,0.1827814569536424,0.043333333333333335,0.052980132450331126,0.06466666666666666,0.14437086092715232,0.010666666666666666,0.030463576158940398,0.014666666666666666,0.007947019867549669,0.5531920529801324,0.31206853050306066,0.6113986640174197,112,False,0.18,0.1,0.30666666666666664,0.04666666666666667,4.333333333333334,5.298013245033113,1477.0,586.0
+scsemi5,C169_2301,covid_positive,1500,3773,150,0.862,0.5139146567717996,0.022,0.08666843360720912,0.05,0.04320169626292075,0.04533333333333334,0.31221839385104694,0.012,0.028624436787702094,0.008666666666666666,0.015372382719321495,0.7097672939305593,0.32658452854400893,0.5723079024312285,108,False,0.26666666666666666,0.04666666666666667,0.4666666666666667,0.05333333333333334,5.0,4.320169626292075,1478.0,886.0
+scsemi5,C169_0202,covid_positive,1500,1286,150,0.5886666666666667,0.5256609642301711,0.10733333333333334,0.14774494556765164,0.12333333333333334,0.14074650077760498,0.14133333333333334,0.12052877138413685,0.037333333333333336,0.04821150855365474,0.002,0.017107309486780714,0.16762052877138414,0.1724051672707072,0.5871238715438738,54,False,0.36,0.19333333333333333,0.49333333333333335,0.13333333333333333,12.333333333333334,14.074650077760499,1477.0,841.0
+scsemi5,C169_0403,recovery,1500,4368,150,0.598,0.5057234432234432,0.09466666666666666,0.1201923076923077,0.15066666666666667,0.12248168498168498,0.116,0.21268315018315018,0.04066666666666666,0.023351648351648352,0.0,0.015567765567765568,0.2755531135531135,0.11365782412951929,0.5830666445701645,97,False,0.23333333333333334,0.04666666666666667,0.5266666666666666,0.05333333333333334,15.066666666666666,12.248168498168498,1475.0,992.0
+scsemi5,C170_1205,covid_negative,1500,953,150,0.9013333333333333,0.5204616998950682,0.012666666666666666,0.02098635886673662,0.052,0.21720881427072403,0.018,0.19832109129066108,0.014666666666666666,0.03882476390346275,0.0013333333333333333,0.004197271773347324,0.7617432668765303,0.2216981141985615,0.5326080715273466,79,False,0.20666666666666667,0.09333333333333334,0.58,0.05333333333333334,5.2,21.720881427072403,1479.0,736.0
+scsemi5,C170_2301,covid_positive,1500,1055,150,0.5613333333333334,0.4199052132701422,0.10133333333333333,0.0947867298578199,0.154,0.07109004739336493,0.14333333333333334,0.37156398104265403,0.034666666666666665,0.03981042654028436,0.005333333333333333,0.002843601895734597,0.4667488151658768,0.4190176662609261,0.5751346419138474,137,False,0.16666666666666666,0.19333333333333333,0.36,0.02,15.4,7.109004739336493,1478.0,548.0
+scsemi5,C170_0202,covid_positive,1500,5621,150,0.776,0.4090019569471624,0.10266666666666667,0.10745418964597046,0.006,0.13271659847002312,0.088,0.26845756982743285,0.025333333333333333,0.07987902508450453,0.002,0.0024906600249066002,0.7339960861056752,0.2929420409189242,0.6324075258547032,61,False,0.38,0.12666666666666668,0.5533333333333333,0.14666666666666667,0.6,13.271659847002311,1475.0,840.0
+scsemi5,C170_0402,covid_positive,1500,808,150,0.6133333333333333,0.5742574257425742,0.09866666666666667,0.054455445544554455,0.13266666666666665,0.017326732673267328,0.11466666666666667,0.3193069306930693,0.04066666666666666,0.03094059405940594,0.0,0.0037128712871287127,0.4167062706270627,0.46605600184833984,0.5471660953060205,119,False,0.17333333333333334,0.03333333333333333,0.46,0.05333333333333334,13.266666666666666,1.7326732673267329,1478.0,907.0
+scsemi5,C170_0403,recovery,1500,3745,150,0.6013333333333334,0.6101468624833111,0.09933333333333333,0.015487316421895861,0.144,0.06809078771695594,0.12666666666666668,0.2809078771695594,0.028,0.021628838451268357,0.0006666666666666666,0.003738317757009346,0.33225278148642623,0.45885372100100463,0.5978290909191201,71,False,0.18,0.04,0.37333333333333335,0.14,14.399999999999999,6.809078771695594,1477.0,984.0
+scsemi5,C187_2605,covid_negative,1500,1867,150,0.8546666666666667,0.129084092126406,0.04933333333333333,0.04124263524370648,0.035333333333333335,0.5243706480985538,0.029333333333333333,0.11355115158007499,0.027333333333333334,0.17621853240492769,0.004,0.015532940546331012,1.4673465452597747,1.0140951584964935,0.5005955006259061,64,False,0.25333333333333335,0.15333333333333332,0.7,0.1,3.5333333333333337,52.437064809855386,1477.5,783.0
+scsemi5,C187_1201,covid_positive,1500,1985,150,0.618,0.05994962216624685,0.034,0.02518891687657431,0.15466666666666667,0.23425692695214106,0.13266666666666665,0.6392947103274559,0.024666666666666667,0.031234256926952142,0.036,0.010075566750629723,1.1855717884130983,1.0922471294704434,0.8022216908601222,22,False,0.38,0.10666666666666667,0.19333333333333333,0.16,15.466666666666667,23.425692695214106,1478.0,706.0
+scsemi5,C187_1401,covid_positive,1500,3155,150,0.6433333333333333,0.10998415213946117,0.03133333333333333,0.041521394611727415,0.152,0.22060221870047544,0.11066666666666666,0.5670364500792393,0.02666666666666667,0.04659270998415214,0.036,0.014263074484944533,1.1101722134178553,0.9522430781993891,0.8000688032345967,2,False,0.31333333333333335,0.14,0.26,0.15333333333333332,15.2,22.060221870047545,1477.5,671.0
+scsemi5,C187_1901,covid_positive,1500,1966,150,0.6446666666666667,0.08748728382502544,0.028666666666666667,0.07019328585961343,0.15466666666666667,0.1958290946083418,0.106,0.5635808748728383,0.030666666666666665,0.049338758901322485,0.035333333333333335,0.0335707019328586,1.117884028484232,0.9398930323324884,0.7772665806036884,1,True,0.30666666666666664,0.1,0.20666666666666667,0.2,15.466666666666667,19.58290946083418,1479.0,904.5
+scsemi5,C187_2301,covid_positive,1500,529,150,0.4766666666666667,0.16446124763705103,0.18533333333333332,0.17391304347826086,0.22,0.06994328922495274,0.06,0.5311909262759924,0.04133333333333333,0.03780718336483932,0.016666666666666666,0.022684310018903593,0.9544171392564587,0.8754697400055456,0.6714674536864493,100,False,0.49333333333333335,0.12,0.44666666666666666,0.12,22.0,6.994328922495274,1479.0,695.0
+scsemi5,C187_2502,recovery,1500,5693,150,0.5026666666666667,0.284559985947655,0.184,0.018443702792903565,0.21666666666666667,0.2466186544879677,0.035333333333333335,0.39030388196030213,0.051333333333333335,0.04268399789214825,0.01,0.017389776919023364,0.7846246267345864,0.649246794220649,0.677865269825085,24,False,0.48,0.04666666666666667,0.26666666666666666,0.11333333333333333,21.666666666666668,24.661865448796767,1476.0,985.0
+scsemi5,C190_2605,covid_negative,1500,1791,150,0.49533333333333335,0.04578447794528197,0.196,0.0893355667225014,0.22266666666666668,0.4712451144611949,0.03933333333333333,0.3405918481295366,0.038,0.0413176996091569,0.008666666666666666,0.011725293132328308,1.1124265773310997,0.9896823849321572,0.687334490338418,6,False,0.36,0.08,0.26,0.16,22.26666666666667,47.124511446119485,1477.5,1186.0
+scsemi5,C190_2901,covid_positive,1500,1527,150,0.49466666666666664,0.0412573673870334,0.20133333333333334,0.3798297314996726,0.22866666666666666,0.3700065487884741,0.037333333333333336,0.16110019646365423,0.03133333333333333,0.04191224623444663,0.006666666666666667,0.005893909626719057,0.9083641126391618,0.995834100779999,0.6675413194379362,51,False,0.42,0.06,0.30666666666666664,0.08666666666666667,22.866666666666667,37.00065487884741,1478.0,1198.0
+scsemi5,C190_0102,covid_positive,1500,4868,150,0.906,0.03594905505341003,0.008666666666666666,0.3769515201314708,0.04133333333333333,0.33340180772391126,0.028,0.20336894001643385,0.013333333333333334,0.042317173377156944,0.0026666666666666666,0.00801150369761709,1.7401018898931797,0.9719894005315332,0.5838155249841059,48,False,0.22666666666666666,0.03333333333333333,0.46,0.08666666666666667,4.133333333333333,33.34018077239113,1475.5,1038.0
+scsemi5,C190_0302,covid_positive,1500,2220,150,0.86,0.11576576576576576,0.08533333333333333,0.3342342342342342,0.021333333333333333,0.3045045045045045,0.004666666666666667,0.20315315315315316,0.006,0.03333333333333333,0.02266666666666667,0.009009009009009009,1.5157837837837838,0.810360968484038,0.48162295902514746,63,False,0.44,0.08,0.7333333333333333,0.14666666666666667,2.1333333333333333,30.45045045045045,1477.0,1175.5
+scsemi5,C190_0502,covid_positive,1500,2030,150,0.8026666666666666,0.05172413793103448,0.11266666666666666,0.24778325123152709,0.005333333333333333,0.5167487684729064,0.05733333333333333,0.10541871921182266,0.019333333333333334,0.07389162561576355,0.0026666666666666666,0.004433497536945813,1.5018850574712643,1.0891843383752067,0.6050592072642837,86,False,0.41333333333333333,0.12,0.6866666666666666,0.04666666666666667,0.5333333333333333,51.67487684729064,1475.0,799.0
+scsemi5,C190_0802,covid_positive,1500,1447,150,0.48333333333333334,0.038700760193503804,0.20133333333333334,0.2156185210780926,0.21733333333333332,0.5929509329647547,0.04733333333333333,0.0912232204561161,0.04066666666666666,0.05459571527297857,0.01,0.006910850034554251,0.8954434462105506,1.1386673863664643,0.6841455319821552,29,False,0.44666666666666666,0.12666666666666668,0.38666666666666666,0.07333333333333333,21.73333333333333,59.295093296475464,1477.0,854.0
+scsemi5,C190_1002,covid_positive,1500,4052,150,0.506,0.044669299111549855,0.19933333333333333,0.12043435340572557,0.20866666666666667,0.6414116485686081,0.042,0.12709772951628825,0.03333333333333333,0.06071076011846002,0.010666666666666666,0.005676209279368213,1.090440276406713,1.0574505719203997,0.7238674165253923,3,False,0.49333333333333335,0.14666666666666667,0.35333333333333333,0.12666666666666668,20.866666666666667,64.14116485686081,1481.0,994.0
+scsemi5,C190_0903,recovery,1500,1371,150,0.844,0.0962800875273523,0.07133333333333333,0.24288840262582057,0.021333333333333333,0.4062727935813275,0.010666666666666666,0.1560904449307075,0.03266666666666666,0.07221006564551423,0.02,0.0262582056892779,1.4954398249452956,0.8792411977297442,0.5068430962656719,39,False,0.26666666666666666,0.24,0.7866666666666666,0.19333333333333333,2.1333333333333333,40.62727935813275,1477.0,998.0
+scsemi5,C193_2605,covid_negative,1500,5566,150,0.7666666666666667,0.40837226015091627,0.05466666666666667,0.03557312252964427,0.07133333333333333,0.34441250449155586,0.04066666666666666,0.17714696370822852,0.06133333333333333,0.02982393100970176,0.005333333333333333,0.004671218109953288,0.8191189363995688,0.3534657171006781,0.5404297303043424,8,False,0.19333333333333333,0.013333333333333334,0.7133333333333334,0.14,7.133333333333333,34.44125044915559,1476.0,2119.5
+scsemi5,C195_2605,covid_negative,1500,7759,150,0.9266666666666666,0.5532929501224385,0.005333333333333333,0.038407011212785155,0.027333333333333334,0.08815569016625854,0.012666666666666666,0.3107359195772651,0.025333333333333333,0.008248485629591443,0.0026666666666666666,0.0011599432916612965,0.7839305752459508,0.3982978934601291,0.5409135220763844,22,False,0.09333333333333334,0.0,0.6466666666666666,0.15333333333333332,2.7333333333333334,8.815569016625854,1477.0,1513.0
+scsemi5,C197_2605,covid_negative,1500,2835,150,0.5966666666666667,0.6052910052910053,0.102,0.13015873015873017,0.14333333333333334,0.1347442680776014,0.128,0.08677248677248678,0.03,0.01869488536155203,0.0,0.02433862433862434,0.12224338624338629,0.2741820965345068,0.6047061103924333,26,False,0.26,0.02,0.4666666666666667,0.24,14.333333333333334,13.474426807760139,1478.0,1812.0
+scsemi5,C212_2705,covid_negative,1500,1150,150,0.7406666666666667,0.5417391304347826,0.088,0.0817391304347826,0.06866666666666667,0.15478260869565216,0.048666666666666664,0.18869565217391304,0.048,0.026956521739130435,0.006,0.00608695652173913,0.452463768115942,0.12922811241767654,0.5771062369552966,4,False,0.32666666666666666,0.013333333333333334,0.6266666666666667,0.17333333333333334,6.866666666666667,15.478260869565217,1476.0,1861.5
+scsemi5,C214_2705,covid_negative,1500,6279,150,0.8026666666666666,0.3494186972447842,0.064,0.08138238573021182,0.04466666666666667,0.3817486860965122,0.028666666666666667,0.14667940754897277,0.050666666666666665,0.03567447045707915,0.009333333333333334,0.005096352922439879,0.9449542920847268,0.4373401829529498,0.5154846401156997,24,False,0.18,0.013333333333333334,0.74,0.1,4.466666666666667,38.17486860965122,1477.5,1795.0
+scsemi5,C234_2805,covid_negative,1500,9882,150,0.558,0.609492005666869,0.11666666666666667,0.08429467719085205,0.14466666666666667,0.16636308439587127,0.144,0.12001619105444242,0.035333333333333335,0.016798218984011334,0.0013333333333333333,0.0030358227079538553,0.14978182554138827,0.240242449094144,0.6679459795321017,3,False,0.19333333333333333,0.08,0.3933333333333333,0.31333333333333335,14.466666666666667,16.63630843958713,1476.0,1650.0
+scsemi5,C237_2805,covid_negative,1500,5071,150,0.804,0.5912048905541314,0.08666666666666667,0.08913429303884836,0.04066666666666666,0.15519621376454348,0.042,0.14789982252021297,0.02266666666666667,0.014198382961940446,0.004,0.0023663971603234074,0.445793991980543,0.20341065386708088,0.6849147550695054,6,False,0.3466666666666667,0.04,0.6333333333333333,0.26,4.066666666666666,15.519621376454348,1477.0,1379.0
+scsemi5,C238_2905,covid_negative,1500,7843,150,0.7646666666666667,0.8912405967104424,0.072,0.034298100216753794,0.07466666666666667,0.03735815376769094,0.05466666666666667,0.023842917251051893,0.028666666666666667,0.010455182965701899,0.005333333333333333,0.002805049088359046,0.2531478600875515,0.8077079211959891,0.6301919639953528,9,False,0.38,0.02666666666666667,0.5733333333333334,0.28,7.466666666666668,3.735815376769094,1478.0,1738.0
+scsemi5,C240_2905,covid_negative,1500,2346,150,0.892,0.5524296675191815,0.015333333333333332,0.03836317135549872,0.043333333333333335,0.20588235294117646,0.03333333333333333,0.18584825234441602,0.011333333333333334,0.014919011082693947,0.004666666666666667,0.0025575447570332483,0.6833589087809037,0.2172934936335721,0.6303834521087647,6,False,0.08,0.02666666666666667,0.6066666666666667,0.19333333333333333,4.333333333333334,20.588235294117645,1479.0,1652.5
+scsemi5,C246_2905,covid_negative,1500,769,150,0.8826666666666667,0.7451235370611183,0.019333333333333334,0.013003901170351105,0.04533333333333334,0.08972691807542263,0.034666666666666665,0.13394018205461639,0.016,0.015604681404421327,0.002,0.002600780234070221,0.2885357607282185,0.5134158151417165,0.6286555668476286,20,False,0.13333333333333333,0.013333333333333334,0.49333333333333335,0.16666666666666666,4.533333333333333,8.972691807542263,1478.0,1382.0
+scsemi5,C251_2905,covid_negative,1500,2117,150,0.8066666666666666,0.8304204062352385,0.056666666666666664,0.07510628247520075,0.026,0.03306565895134624,0.02,0.05054322153991497,0.06266666666666666,0.007085498346717053,0.028,0.003778932451582428,0.15960447173673434,0.6852109178445219,0.5236279500143859,8,False,0.15333333333333332,0.006666666666666667,0.8266666666666667,0.16666666666666666,2.6,3.306565895134624,1479.0,2293.0

paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20260928T225702Z-paired-ft-scsemi-delta/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scores/imperial_eskd/fewshot_n5/draw1_scsemi5/summary.json

@@ -0,0 +1,1007 @@
+{
+ "schema": "paired_ft_scores.v1",
+ "dataset": "imperial_eskd",
+ "written_utc": "2026-09-28T15:14:37.119772+00:00",
+ "command": [
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/tools/score_ft.py",
+  "--dataset",
+  "imperial_eskd",
+  "--out",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scores/imperial_eskd/fewshot_n5/draw1_scsemi5",
+  "--threads",
+  "6",
+  "--donors",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/data/imperial_eskd/fewshot_n5/draw1/test_samples.txt",
+  "--case-groups",
+  "covid_positive",
+  "--control-groups",
+  "covid_negative",
+  "--arm",
+  "scsemi5=/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/generated/imperial_eskd/fewshot_n5/draw1/scsemi5__raw.npz"
+ ],
+ "arms": [
+  "scsemi5"
+ ],
+ "donors": [
+  "C20_1004",
+  "C20_1404",
+  "C21_1004",
+  "C21_1704",
+  "C21_2504",
+  "C23_2204",
+  "C33_1401",
+  "C33_1601",
+  "C33_1901",
+  "C34_1404",
+  "C34_2104",
+  "C34_2504",
+  "C36_1504",
+  "C36_1704",
+  "C36_2104",
+  "C40_1504",
+  "C40_2204",
+  "C40_0105",
+  "C42_1504",
+  "C42_2204",
+  "C42_2704",
+  "C58_1604",
+  "C58_2501",
+  "C58_2901",
+  "C58_0102",
+  "C58_0402",
+  "C58_1003",
+  "C60_2504",
+  "C63_1704",
+  "C63_2404",
+  "C63_2904",
+  "C69_1804",
+  "C82_2504",
+  "C85_2004",
+  "C93_2104",
+  "C93_2704",
+  "C93_0405",
+  "C103_2204",
+  "C104_2204",
+  "C106_2204",
+  "C108_2204",
+  "C108_1501",
+  "C108_1801",
+  "C108_2201",
+  "C113_0605",
+  "C123_2404",
+  "C123_2904",
+  "C123_0505",
+  "C124_2404",
+  "C124_2704",
+  "C124_0105",
+  "C126_2504",
+  "C126_3004",
+  "C126_0605",
+  "C127_2504",
+  "C127_0405",
+  "C127_1105",
+  "C128_2504",
+  "C128_0405",
+  "C128_1105",
+  "C132_2804",
+  "C132_0205",
+  "C132_1105",
+  "C137_3004",
+  "C137_2502",
+  "C138_3004",
+  "C138_2301",
+  "C138_3001",
+  "C138_0202",
+  "C138_0402",
+  "C140_3004",
+  "C140_2801",
+  "C140_3001",
+  "C140_0202",
+  "C140_0402",
+  "C140_0602",
+  "C140_0902",
+  "C140_1103",
+  "C141_2001",
+  "C141_2201",
+  "C141_3001",
+  "C141_0202",
+  "C145_3004",
+  "C145_0701",
+  "C145_1201",
+  "C145_1401",
+  "C145_1901",
+  "C145_2301",
+  "C146_3004",
+  "C146_1201",
+  "C146_1401",
+  "C146_1601",
+  "C146_1901",
+  "C146_2301",
+  "C146_2701",
+  "C146_2502",
+  "C147_3004",
+  "C147_1401",
+  "C147_1901",
+  "C152_0405",
+  "C161_1105",
+  "C167_1205",
+  "C168_1205",
+  "C168_2001",
+  "C168_2301",
+  "C168_3001",
+  "C168_0202",
+  "C168_0403",
+  "C169_1205",
+  "C169_2001",
+  "C169_2301",
+  "C169_0202",
+  "C169_0403",
+  "C170_1205",
+  "C170_2301",
+  "C170_0202",
+  "C170_0402",
+  "C170_0403",
+  "C187_2605",
+  "C187_1201",
+  "C187_1401",
+  "C187_1901",
+  "C187_2301",
+  "C187_2502",
+  "C190_2605",
+  "C190_2901",
+  "C190_0102",
+  "C190_0302",
+  "C190_0502",
+  "C190_0802",
+  "C190_1002",
+  "C190_0903",
+  "C193_2605",
+  "C195_2605",
+  "C197_2605",
+  "C212_2705",
+  "C214_2705",
+  "C234_2805",
+  "C237_2805",
+  "C238_2905",
+  "C240_2905",
+  "C246_2905",
+  "C251_2905"
+ ],
+ "n_donors": 143,
+ "reference": {
+  "cache": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/imperial_eskd",
+  "reference_sha256": "34b4caa3f8a60b46d5faf58f09cdaa5622bcce19e4c45d9902a711fead96375e",
+  "features_sha256": "e46e5bb1a24eae045efe75125d20e3accaa8f68a1006eb2f60d24159013d4aa7",
+  "n_r1_cells": 21395,
+  "pca": {
+   "n_components": 50,
+   "explained_variance_ratio_sum": 0.25817039608955383,
+   "n_fit_cells": 21395
+  },
+  "r2_control": {
+   "precision": 0.9685440523486796,
+   "coverage": 0.999813040430007,
+   "density": 1.28853003038093,
+   "n_query": 21395,
+   "depth_matched": {
+    "precision": 0.9688712315961673,
+    "coverage": 0.999626080860014,
+    "density": 1.2930217340500119
+   }
+  },
+  "observed_l1_loo_null_mean": 0.5086759403753967
+ },
+ "contrast_definition": {
+  "enabled": true,
+  "rule": "explicit --case-groups / --control-groups",
+  "group_source": "features groups",
+  "case_groups": [
+   "covid_positive"
+  ],
+  "control_groups": [
+   "covid_negative"
+  ],
+  "n_case_donors": 102,
+  "n_control_donors": 32,
+  "n_donors_in_neither": 9,
+  "case": [
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false
+  ],
+  "ctrl": [
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   false,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true,
+   true
+  ],
+  "groups": [
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "covid_positive",
+   "recovery",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative",
+   "covid_negative"
+  ]
+ },
+ "deg_definition": {
+  "enabled": true,
+  "score": "top-50 DEG overlap per cell type (benchmark total_top50_overlap, Welch backend)",
+  "source": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/bulk2sc-paper/scripts/evaluate_generated_vs_truth.py",
+  "functions": [
+   "welch_bh_deg",
+   "top_deg_genes",
+   "jaccard"
+  ],
+  "reproduces": "utility_studies_final6k_20260925/sle top-50 DEG 81 (1,006 genes) / 84 (2,279 genes) = sum over the six gated types of top50_overlap_count",
+  "top_n": 50,
+  "fdr": 0.05,
+  "n_genes": 5927,
+  "types": [
+   "T cell",
+   "B cell",
+   "Monocyte",
+   "NK cell",
+   "DC"
+  ],
+  "aggregates_source": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/imperial_eskd/deg_reference.npz",
+  "aggregates_sha256": "8fada1ace7530b79bfc5c5201b9cb60399ff77d083dd8b53b13cfbe900cda55c",
+  "aggregates_note": null,
+  "types_not_scored_observed": [],
+  "observed": {
+   "T cell": {
+    "n_significant": 827,
+    "n_tested": 5745,
+    "n_case_donors": 102,
+    "n_control_donors": 32,
+    "n_cells": 239681,
+    "top_list_size": 50
+   },
+   "B cell": {
+    "n_significant": 255,
+    "n_tested": 5632,
+    "n_case_donors": 102,
+    "n_control_donors": 32,
+    "n_cells": 44946,
+    "top_list_size": 50
+   },
+   "Monocyte": {
+    "n_significant": 260,
+    "n_tested": 5620,
+    "n_case_donors": 101,
+    "n_control_donors": 32,
+    "n_cells": 76538,
+    "top_list_size": 50
+   },
+   "NK cell": {
+    "n_significant": 386,
+    "n_tested": 5579,
+    "n_case_donors": 102,
+    "n_control_donors": 32,
+    "n_cells": 68326,
+    "top_list_size": 50
+   },
+   "DC": {
+    "n_significant": 242,
+    "n_tested": 5423,
+    "n_case_donors": 102,
+    "n_control_donors": 32,
+    "n_cells": 12644,
+    "top_list_size": 50
+   }
+  },
+  "broadcast": "welch_bh_deg + top_deg_genes on the arm's condition bulk_counts (scoring genes, case|control donors), one list compared with every type's observed list (sle_broadcast.py broadcast_input_bulk); not part of the published benchmark"
+ },
+ "headline": {
+  "scsemi5": {
+   "comp_l1": 0.6118506281162628,
+   "comp_l1_obs_loo_null": 0.5086759403753967,
+   "precision": 0.31745734984809537,
+   "coverage": 0.06347277401261978,
+   "precision_dm": 0.44365505959336293,
+   "coverage_dm": 0.14110773545220845,
+   "pb_r_median": 0.6297346068108156,
+   "pb_top1": 0.03496503496503497,
+   "mono_pct_gen": 13.206993006993004,
+   "mono_pct_obs": 17.000072050147295,
+   "median_umi_gen": 1478.0,
+   "median_umi_obs": 1338.0,
+   "contrast_mean_cp10k_r_gen": 0.5327834847462688,
+   "contrast_pseudobulk_log1p_cpm_r_gen": 0.22996054966425475,
+   "contrast_mean_cp10k_r_broadcast": 0.6611787175621116,
+   "contrast_pseudobulk_log1p_cpm_r_broadcast": 0.6068677589525703,
+   "deg_top50_T": 8,
+   "deg_top50_B": 4,
+   "deg_top50_Mono": 7,
+   "deg_top50_NK": 7,
+   "deg_top50_DC": 6,
+   "deg_top50_sum": 32,
+   "deg_top50_max": 250,
+   "deg_top50_sum_4type": 26,
+   "deg_top50_sum_broadcast": 86,
+   "seconds": 29.6
+  }
+ },
+ "per_arm": {
+  "scsemi5": {
+   "arm": "scsemi5",
+   "npz": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/generated/imperial_eskd/fewshot_n5/draw1/scsemi5__raw.npz",
+   "npz_sha256": "184060f4ddf0f344490da622322fc4f09743c36923b2abc9a0a0f37cfe57eb5c",
+   "receipt_verified": true,
+   "generation": {
+    "checkpoint": null,
+    "checkpoint_sha256": null,
+    "input_condition_path": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/data/imperial_eskd/fewshot_n5/draw1/test_raw.npz",
+    "input_condition_sha256": "c2293bb938f0dbf9c76063b305230e4ad0b9bec482e4fe5dfcf38a110511283f",
+    "seed": 20260927,
+    "steps": null,
+    "support_readout": "upstream (values <= 10 normalized units zeroed by fast_semi)",
+    "weights": null
+   },
+   "condition_for_broadcast": {
+    "path": "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/data/imperial_eskd/fewshot_n5/draw1/test_raw.npz",
+    "sha256": "c2293bb938f0dbf9c76063b305230e4ad0b9bec482e4fe5dfcf38a110511283f"
+   },
+   "poisson": {
+    "seed": 20260916,
+    "rule": "whole NPZ, rows in NPZ order",
+    "nnz_whole_npz": 27261109,
+    "median_library_whole_npz_panel": 1478.0,
+    "n_rows_whole_npz": 214500
+   },
+   "annotation": {
+    "model_pt_sha256": "bf3655899e5abee435340fc008656c4a17342da0f30b70cfd43de8e9223e1930",
+    "zero_padded_model_genes": 0,
+    "label_counts": {
+     "T cell": 141467,
+     "Monocyte": 28329,
+     "B cell": 20533,
+     "NK cell": 13685,
+     "DC": 7323,
+     "Other": 3163
+    },
+    "mean_l2_max_prob": 0.9193037530709675,
+    "predict_seconds": 6.1
+   },
+   "n_donors": 143,
+   "n_generated_cells": 214500,
+   "composition": {
+    "l1_mean": 0.6118506281162628,
+    "l1_median": 0.5393629430237775,
+    "l1_obs_loo_null_mean": 0.5086759403753967,
+    "l1_generated_loo_mean_vs_observed_mean": 0.5558153215942764,
+    "composition_top1": 0.0,
+    "mean_fraction_generated": {
+     "T cell": 0.65952,
+     "B cell": 0.095725,
+     "Monocyte": 0.13207,
+     "NK cell": 0.0638,
+     "DC": 0.03414,
+     "Other": 0.014746
+    },
+    "mean_fraction_observed": {
+     "T cell": 0.490211,
+     "B cell": 0.119516,
+     "Monocyte": 0.170001,
+     "NK cell": 0.176062,
+     "DC": 0.030282,
+     "Other": 0.013929
+    }
+   },
+   "pseudobulk": {
+    "n_genes": 5927,
+    "r_median": 0.6297346068108156,
+    "r_mean": 0.6273951391954038,
+    "top1": 0.03496503496503497,
+    "n_top1": 5,
+    "own_rank_median": 43.0,
+    "chance_top1": 0.006993006993006993
+   },
+   "precision_coverage": {
+    "precision": 0.31745734984809537,
+    "coverage": 0.06347277401261978,
+    "density": 0.0573919139985978,
+    "n_query": 21395,
+    "n_reference": 21395
+   },
+   "precision_coverage_depth_matched": {
+    "precision": 0.44365505959336293,
+    "coverage": 0.14110773545220845,
+    "density": 0.13511568123393317,
+    "detected_median_before": {
+     "R1": 344.0,
+     "Q": 125.0
+    },
+    "detected_median_after": {
+     "R1": 125.0,
+     "Q": 125.0
+    }
+   },
+   "monocyte_pct": {
+    "generated_mean_over_donors": 13.206993006993004,
+    "observed_mean_over_donors": 17.000072050147295,
+    "generated_pooled_cells": 13.206993006993006
+   },
+   "median_umi_per_cell_scoring_genes": {
+    "generated_pooled": 1478.0,
+    "observed_pooled": 1338.0,
+    "generated_mean_of_donor_medians": 1477.6258544921875,
+    "observed_mean_of_donor_medians": 1275.0874125874127
+   },
+   "contrast": {
+    "mean_cp10k": {
+     "per_type": {
+      "T cell": {
+       "r_generated": 0.6216931467766444,
+       "r_broadcast": 0.6393101171199623,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.587625625406497,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.29770740155278297,
+       "n_genes": 3031
+      },
+      "B cell": {
+       "r_generated": 0.3921663727078082,
+       "r_broadcast": 0.6236351264700181,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.3361144783575504,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.21762364053770225,
+       "n_genes": 3188
+      },
+      "Monocyte": {
+       "r_generated": 0.5567156938097007,
+       "r_broadcast": 0.7132449085093915,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.31423851689297394,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.5160238834129596,
+       "n_genes": 2883
+      },
+      "NK cell": {
+       "r_generated": 0.5605587256909219,
+       "r_broadcast": 0.6685247181490744,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.4901638715921738,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.32232842747444074,
+       "n_genes": 2966
+      }
+     },
+     "mean_r_generated": 0.5327834847462688,
+     "mean_r_broadcast": 0.6611787175621116,
+     "mean_partial_r": 0.4320356230622988
+    },
+    "pseudobulk_log1p_cpm": {
+     "per_type": {
+      "T cell": {
+       "r_generated": 0.354945755824924,
+       "r_broadcast": 0.6360064629967949,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.30141858731094423,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.19973514031339598,
+       "n_genes": 3031
+      },
+      "B cell": {
+       "r_generated": -0.0007962257691689206,
+       "r_broadcast": 0.4862172069397853,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": -0.08450124911923894,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.1485446568414446,
+       "n_genes": 3188
+      },
+      "Monocyte": {
+       "r_generated": 0.34403585059374175,
+       "r_broadcast": 0.7072577030580933,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.12158099904456728,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.37371268811719577,
+       "n_genes": 2883
+      },
+      "NK cell": {
+       "r_generated": 0.22165681800752213,
+       "r_broadcast": 0.5979896628156075,
+       "partial_r_generated_given_broadcast": 0.12545272735909002,
+       "r_generated_vs_broadcast": 0.2061330120076724,
+       "n_genes": 2966
+      }
+     },
+     "mean_r_generated": 0.22996054966425475,
+     "mean_r_broadcast": 0.6068677589525703,
+     "mean_partial_r": 0.11598776614884064
+    }
+   },
+   "deg_top50": {
+    "types_scored": [
+     "T cell",
+     "B cell",
+     "Monocyte",
+     "NK cell",
+     "DC"
+    ],
+    "types_not_scored": {},
+    "per_type": {
+     "T cell": {
+      "deg_scored": true,
+      "top50_overlap": 8,
+      "top50_jaccard": 0.08695652173913043,
+      "obs_top_list_size": 50,
+      "gen_top_list_size": 50,
+      "top50_overlap_broadcast": 17,
+      "top50_jaccard_broadcast": 0.20481927710843373,
+      "n_cells_obs": 239681,
+      "n_cells_gen": 133048
+     },
+     "B cell": {
+      "deg_scored": true,
+      "top50_overlap": 4,
+      "top50_jaccard": 0.041666666666666664,
+      "obs_top_list_size": 50,
+      "gen_top_list_size": 50,
+      "top50_overlap_broadcast": 13,
+      "top50_jaccard_broadcast": 0.14942528735632185,
+      "n_cells_obs": 44946,
+      "n_cells_gen": 18743
+     },
+     "Monocyte": {
+      "deg_scored": true,
+      "top50_overlap": 7,
+      "top50_jaccard": 0.07526881720430108,
+      "obs_top_list_size": 50,
+      "gen_top_list_size": 50,
+      "top50_overlap_broadcast": 24,
+      "top50_jaccard_broadcast": 0.3157894736842105,
+      "n_cells_obs": 76538,
+      "n_cells_gen": 26547
+     },
+     "NK cell": {
+      "deg_scored": true,
+      "top50_overlap": 7,
+      "top50_jaccard": 0.07526881720430108,
+      "obs_top_list_size": 50,
+      "gen_top_list_size": 50,
+      "top50_overlap_broadcast": 17,
+      "top50_jaccard_broadcast": 0.20481927710843373,
+      "n_cells_obs": 68326,
+      "n_cells_gen": 12982
+     },
+     "DC": {
+      "deg_scored": true,
+      "top50_overlap": 6,
+      "top50_jaccard": 0.06382978723404255,
+      "obs_top_list_size": 50,
+      "gen_top_list_size": 50,
+      "top50_overlap_broadcast": 15,
+      "top50_jaccard_broadcast": 0.17647058823529413,
+      "n_cells_obs": 12644,
+      "n_cells_gen": 6598
+     }
+    },
+    "sum": 32,
+    "sum_4type": 26,
+    "max": 250,
+    "mean": 6.4,
+    "sum_broadcast": 86,
+    "sum_broadcast_4type": 71,
+    "broadcast_n_significant": 1949,
+    "seconds": 0.2
+   },
+   "seconds": 29.6
+  }
+ },
+ "code_sha256": {
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/tools/score_ft.py": "492e929e9bc7b716f6f9c8bbeedc98e7dec8cc759a20cdc6ec39b1e65194eb74",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/tools/ft_common.py": "4a6366b0f22208cd58714fc0261b8840c643b9d4569704d560cfd93534cbc747",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/utility_studies_final6k_20260925/umap/cell_immicro_5arm/tools/stage_b_embed.py": "d056cfdf38fb0e5f478756f370174e993b75d0c973c48e02e21749175a4ca2da",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/bulk2sc-paper/scripts/evaluate_generated_vs_truth.py": "48b12d794782b840838853e93e0fc55fab00532c4b3698f4588e926b985d2881",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/utility_studies_final6k_20260925/immicro/tools/immicro_common.py": "c5c30e917148cc5e664e91ea30c11bbdff9b6d1f53a3e0a13e16b1917eff37e9",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/aifi_scanvi_rebuild_20260916/predict_scanvi.py": "482ee5dcf4d72b54bc36cbb6dcff62e5030bc7afc46cb5fb01eca73a82ee45a5",
+  "/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/aifi_scanvi_rebuild_20260916/poisson_readout.py": "8bfa080942fbcdc89ae23b276524a1a83266fb8cbc56b9af279e50f82e6cde38"
+ },
+ "seconds": 37.5
+}

paper-releases/pbisc-diffusion/updates/20260928T225702Z-paired-ft-scsemi-delta/diffusion/dataset/server_1/model8/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scores/imperial_eskd/fewshot_n5/draw2_scsemi5/README.md

@@ -0,0 +1,73 @@
+# score_ft.py output: imperial_eskd, 142 scored donors
+
+Arms: scsemi5.  Every arm is scored on the same donors against the same observed reference.
+
+## Inputs and fixed contracts
+- Observed reference: `/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/imperial_eskd/reference.npz` (sha 34b4caa3f8a6), built from datadir:/home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/data/imperial_eskd;
+  observed cells sum exactly to the features pseudobulk of every donor. Observed labels: /home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/imperial_eskd/observed_labels/labels/labels.parquet.
+- Generated cells: `generated_counts` read out once with Poisson(seed 20260916) over the **whole NPZ in row order**
+  (`poisson_readout.poisson_integerise`), then the scored donors' rows. These integer counts are used for labels, embedding,
+  depth and the contrast. Pseudobulk uses the summed `generated_counts` (rates), as `score_generated.py`.
+- Labels: frozen f01common scANVI (`predict_scanvi.py`, CPU, zero query epochs), six-type gate ['T cell', 'B cell', 'Monocyte', 'NK cell', 'DC', 'Other']; query genes =
+  the 1,006-gene annotation list minus genes the dataset's sc assay did not measure in every sample (1005 genes).
+- Scoring genes: 6k panel genes measured by both assays in every sample of the dataset (5927 genes).
+
+## Definitions
+1. **Composition**: fraction of each donor's cells per six-type label (all generated cells; all observed QC cells).
+   `comp_l1` = sum over the six labels of |generated - observed| (immicro_common.l1). `comp_l1_obs_loo_null` = L1 of the
+   donor's observed composition to the mean of the *other scored donors'* observed compositions. `composition_top1` =
+   fraction of donors whose generated composition is closest (L1) to their own observed composition.
+2. **Pseudobulk**: `pb_r` = Pearson r of CPM-log1p(summed generated_counts) vs CPM-log1p(observed pseudobulk) on the scoring
+   genes (evaluate_realbulk.cpm_log1p / paired_r). `pb_top1` = the donor's generated pseudobulk is closest (Pearson) to its own
+   observed pseudobulk among the 142 scored donors (immicro_common.retrieval = evaluate_realbulk.top1 arithmetic).
+3. **Precision / coverage / density** (stage_b_embed.py functions): per-cell CP10K over the scoring genes + log1p; PCA-50
+   (randomized, random_state 20260925) and k = 10 real-real k-NN balls fitted on **R1 of the scored donors only**.
+   Reference rule (independent of fold and arm): per donor, cells in canonical order (library_id+barcode), one
+   permutation from `default_rng([20260925, uint64(sha256(donor)[:8])])`; R1 = first n, R2 = next n,
+   n = min(150, n_cells // 2) (21232 R1 cells here). Generated query: per donor n cells (the donor's R1 size),
+   without replacement, `default_rng([20260926, same key])`. Precision = fraction of generated cells inside any R1 ball
+   (Kynkaanniemi 2019); coverage = fraction of R1 cells whose ball holds a generated cell; density = Naeem 2020.
+   Per-donor precision = that donor's generated cells; per-donor coverage = that donor's R1 cells (the pooled values are
+   their n-weighted means; plain means when every donor has 150 reference cells). R2 (held-out real cells of the same donors) is the
+   perfect-generator control: precision 0.9694, coverage 0.9998.
+   **Depth matched**: stage_b_embed depth matching run pairwise (R1 vs this arm): per donor and within-donor rank of detected
+   genes, both cells are thinned by UMI sampling without replacement to the smaller detected-gene count; PCA kept from
+   un-thinned R1, radii recomputed on thinned R1; fresh rng(20260929) per arm. R2 control: precision
+   0.9690, coverage 0.9997.
+4. **Monocyte %** = 100 x Monocyte fraction (all cells) per donor; **median UMI per cell** = median over cells of the
+   Poisson-read (generated) / observed counts summed over the scoring genes (per donor, and pooled).
+5. **Group contrast** (T, B, Monocyte, NK): case groups ['covid_positive'] (n = 103) vs control groups ['covid_negative'] (n = 31); rule: explicit --case-groups / --control-groups; groups from features groups.
+   Genes per type = scoring genes detected (count > 0) in >= 1 % of the scored donors' observed
+   cells of that type. Primary statistic `mean_cp10k`: per-cell CP10K over the scoring genes; per donor the mean over its
+   cells of the type (donors with >= 1 such cell); group mean = mean over the group's donors (donor-balanced);
+   logFC = log2(case mean + 1) - log2(control mean + 1). Secondary `pseudobulk_log1p_cpm`: the SLE benchmark evaluator's
+   statistic (donor x type summed counts, log1p CPM over the scoring genes, mean case - mean control;
+   evaluate_generated_vs_truth.group_log_fold_change). Both are computed on the generated cells (their frozen labels) and on
+   the observed cells; `r_generated` = Pearson r of the two logFC vectors. Broadcast baseline `r_broadcast`: the same
+   observed vector against the logFC of the input bulk (condition NPZ `bulk_counts` of the arm, scoring genes, per-donor
+   CP10K resp. log1p CPM, group means). `partial_r_generated_given_broadcast`: r of the OLS residuals of observed and
+   generated logFC on the bulk logFC (residual_specificity.py).
+6. **Top-50 DEG overlap** (contrast.csv rows `statistic = welch_top50_deg`; summary `deg_top50`): the SLE benchmark's score (`total_top50_overlap` of
+   `bulk2sc-paper/scripts/evaluate_generated_vs_truth.py`, Welch backend: the "top-50 DEG 81 / 84" of the final model), run
+   with the evaluator's own functions on the same donor x type pseudobulks as the contrast. Per cell type, observed and
+   generated separately: donor x type summed counts on all 5927 scoring genes (donors of the two groups with
+   >= 1 cell of the type) -> `welch_bh_deg` (log1p CPM, two-sided Welch t-test case vs control, Benjamini-Hochberg over the
+   genes with a defined p-value; needs >= 2 donors per group) -> `top_deg_genes` (FDR < 0.05, descending |logFC|,
+   first 50; shorter when fewer genes pass). `top50_overlap` = |observed list & generated list|; `top50_jaccard`
+   the evaluator's Jaccard. Summary `sum` = total over the scored types (the quantity reported as 81), `max` = the sum of
+   the observed list lengths (the "of 262"), `sum_4type` = T + B + Monocyte + NK. A type is scored when its observed test
+   is defined; an arm whose generated test is undefined for a scored type gets overlap 0. Types: T cell, B cell, Monocyte, NK cell, DC
+   (aggregates: /home/sj_server_1/PBISC/immun-pbmc-fm/model_8_sparse_data_diffusion/plans/paired_finetune_intradataset_20260927/scoring_cache/imperial_eskd/deg_reference.npz).
+   **Broadcast analogue** (`top50_overlap_broadcast`, as `sle_broadcast.py` `broadcast_input_bulk`; not part of the
+   published benchmark): the same test on the arm's condition bulk_counts (scoring genes, the 103 + 31
+   donors), one whole-PBMC top-50 list, compared with every type's observed list.
+
+## Files
+- `per_donor.csv`: one row per arm x donor (all per-donor quantities above).
+- `summary.json`: per arm the donor means / pooled values, provenance (NPZ sha, receipt check, generation metadata,
+  Poisson nnz of the whole NPZ, annotation contract), and the reference block (PCA, R2 control).
+- `contrast.csv`: per arm x cell type x statistic (`mean_cp10k`, `pseudobulk_log1p_cpm`: logFC r; `welch_top50_deg`:
+  top-50 DEG overlap, T / B / Monocyte / NK / DC; columns of the other kind are empty).
+- `arms/<arm>/labels/` (predict_scanvi.py labels + manifest), `arms/<arm>/generated_cells.parquet` (NPZ row, donor, label,
+  UMI on the scoring genes, P/C subsample flag), `arms/<arm>/deg_top50_lists.csv` (observed, generated and broadcast
+  top-50 gene lists, Ensembl ids, rank order).