id
stringlengths
12
30
sequence
stringlengths
12
4.38k
secondary_structure
stringlengths
12
4.38k
bpRNA_RFAM_27296
UUGCUCUUCAAAAGCACUGGUUUUAGGAUCCAUUAUUAUCCAAGCCAGCCGUCAAAACUGAGCUAUAAAAAUUAUCUUGUUUUUGGGUGAGGCGUAUUCAAAUCAGAAUGUGUCUCAAUAACACGAUGACAAUC
..((((.......((.(((((....((((........))))..)))))..)).......))))...................((((.((((((.(((........)).)).))))))....).)).........
bpRNA_RFAM_27298
ACGCUCUUCAAAAGCACUGGUUAUCGGACUCAGACUUGUCCAUGCCAGCCGUCAAAAUGAGCAAUAUGAAAUAUCCUGUUUUUGGGUGAGGUGUAACUGUAUUUAGAUUAGAUCUCAAUAACACGAUGACAGUU
..((((.......((.(((((....((((........))))..)))))..))......))))...................((((.((((((.(((((.......))))).))))))....).)))........
bpRNA_RFAM_27311
CGGACGGUCCGGAGUCAGUGGGUUAUCCAAAAUUUGAAACCCUCCCAUUGACACCAACUUGACCGUUUGU
.((.(((((.((.(((((((((.....................))))))))).)).....)))))..).)
bpRNA_RFAM_27318
ACCUCGGUCCGGCAUCUUUGGGUUAUCUUAUAGGAUCUCUUCGGGGAUCAUCCAUUGAUACUAACUUGACCGUUGAA
..(.(((((.((.(((((((((.............((((....))))...))))))))).)).....))))).)...
bpRNA_RFAM_27358
CGUUUCCGAUCCCACCGCUUGUCCGCUCCCCGGGCACGGCAGCAAUCCCAUCGGCGUCGGUUCCGCCGACGU
......((........(((((.(((.....))).)).)))..........((((((.......)))))))).
bpRNA_RFAM_27365
CUGAAUAUUUUUUAUACAACCCGCUAAAAAGUUGCUCGAAAAAGAAACAGCGCCUAGAAUUUUUUUUGCUUCUUGCGCUACGUCAGUUUACUUACUACAAGUAAUGGGUAGUAUGUACGCCGGCUAUUUCCUCACUCUGAGGUGA
.........................................(((((..(((((((........))))))).)))..))...(((.((.(((.((((((.(....)..)))))).))).)).)))...((((((......))))))
bpRNA_RFAM_27366
CUGCACAUUUUUUUCACAGACACGUCGCAAAUCUUGUCGGCGCGGAGUCAAGCAACAUUUUUUUUGCAGUUCUUGCGCUCUGUCAGUUUACUUACUACAAGUAAUGGGUACUAUGUACGCCGGCCAGUUUCUCUUUCCUGAGAGA
...................................((..((((((.(((((((........)))))))))))))..))...(((.((.(((.((((((.(....)..)))))).))).)).)))...((((((......))))))
bpRNA_RFAM_27372
GGCGGGGUGCUGCUCAGCCCGUUCCUGAUUUAUGUGGUGCUGGCGCUGGUGCUGACCGGUGCCCUGCGGAUGCUGGUGCGGGUAACCGGGCUGGGCCGCUGGAUCUGGCACGAAGCACUGUUCGAUUGUGCCCUG
.((((((((((((((((((((((...............))))).))))).)).....))))))))))((.....(((.(((.........))).)))((((((((..(((........)))..))))))))))..
bpRNA_RFAM_27414
ACAACAACAAAAAAAAUGUGACACCCAAUAAAAACAACAGGUAACGGCUCUGACAUAACAAGAACAACACGGCAGAGGCGUAGCAAGCAGAUUUUUUUGGAGUCGACACGCUUUUCAGGGGUACGCCCCGCGGUCUGGCACAGAACAAUAAAACUACCUCAAGGUAGCAGCAGCCAGGUUCGGAUCAGCCAUGAUGAAAGCAGGUCAGCGCUCAAAAAAAUACGUUUGCUCUUGACCCCGCAUGGGGGUCGCCCGCAACACCAGGACAAGCCGACAAAAACAACAAUAGGCCGGUCCCAAUAAUAAAAAAAGAGCAGGCA...
............................................((.((((......................)))).))..............(((((.........(((...................(((((((................(((((....))))).......)))).))).........................)))..))))).................(((((.....))))).............((((((.((...................))...................((((........
bpRNA_RFAM_27434
UCGAAGGGGAUGGCAUCGAUUGGCAGGAGAAAUAGAACCUUGCCCAGGCUGCCGACGGAUAUGCGUGAUCACCGGCUCUUGCGCAUGGCGCCUUCUCGUGGACAGGGCGCCAGCUGGGGUGAGCGGCAUUCUAGCGACAGGCCGAAAGUGGUUAUUUCUUCAAUGCGACAACUAAUUAUAAAAGCACCGAAGAGGGCAUUCGGCGAUAUUGACAGGCAGCGACAUUUGUGCCCGGAAAGCGCGAAGUGUAAUCAAUGAGUAAAGCAAAUCUCAAGCCAUAAAUUGCCAAUUCCUUCUCCUUCAAUGGCUUGCCCGCUACG...
.(((.(((((.(((.((((..((((((.(........)))))))..((((((...(((..(((((((..)))..((.(((((((((((((((((.((...)).))))))))...(((((((((.((.......((.((..((((((.((.....(((((((..(((.................)))..))))))))).))))))(((((.(...(((((((((((((((((.......)))).)))))).......((((..(((......((((((((........................))))))))...)))......
bpRNA_RFAM_27490
ACUCAACGAGUAUUAAUUAAGAAAGGUGAGUUUAAAUGCUAAAGCAAGCUAUCUUCGAAUAGAUCCUUGAAUGUUUAAUUAGCCUUAAUCCUGUUUAUUAGGAGUUU
......................(((((.....(((((....(((....((((......))))...)))....)))))....))))).....................
bpRNA_RFAM_27502
ACUCAACGCGAAUUUUUUUAUAAAGGGUGAGUCUAUUCUGCUAAAGCAAGCCUUAAUAGGGAUCCUUGAUCAGUUAGUUAGCUCUAAACUUGUUAAUACAAGAGUUU
........................((((......(((((....(((....((........)...)))....)))))....)))))......................
bpRNA_RFAM_2755
CGAAGCAGACCAGAUGGCCGCCGUCCACCGUAGCCUUUGGCGAAGGUGGAGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCAUGGUGCUGGAUAACGUCCAGCGAGGGUAACCUCAGGGAAAGUGCCACAGAGAGAAGUCCGCCCCCCACACCCUGGCGACAGGGUCCGCCGAAGCCUCGGCGAAGGCGGAAGGGGGGUAAGGGUGAAAGGGUGAGGUAAGAGCUCACCGGGUUCGGCGGCGACGCCGGAUGCCAGGUAAACCCCACCAGGAGCAAGACCAAAUAGGGAAGCGUUAAGGACGGCCCGUCCGUGCUUCCGGGUUG...
.(((((((.((((((((((.(((((((((...............)))))))))....[[[.[[[[[((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((........................................)))))))))..)).......((((((.......)))))).(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))).)))))).....)...
bpRNA_RFAM_27563
ACUCAACGAGUAUCUAUUAUAAAGGAUAAGUCUCAGUUGCUAAAGCAAGCCAUAGAAUUCGAAUUUAUUCUUUUUCAGGUGGAUCCUUGAUCAGCUAGUUAGUCCUAAACCUGUAAUAAUGGAGUUU
......................(((((......(((((....(((....((((.........................))))...)))....)))))....))))).....................
bpRNA_RFAM_27571
ACUCAACAGUUAUUUUUUAUAAAGAGUGACUCUAAGUUGUAAAAGCACGCCGUUACUAGACUUGUUCUAGGUAGACGGAACCUUGAUCAGCUUUAUAGCUCUAAUCCUUACUAUUAGGAGUUU
......................(((((......(((((....(((....((((.....................))))...)))....)))))....))))).....................
bpRNA_RFAM_27572
GGAGCAGCGAAGAAUUAGUUGCGAAACUGAUUGACUGACGGCGGGAGAGAUCCCGCCGUU
...((((((((...))))))))..............(((((((((......)))))))))
bpRNA_RFAM_27581
CCAGGGAUUUCAUCCCUGGCUAAUAUAUUUCGUGCUUUCAGCACU
.(((((((...))))))).............(((((...))))).
bpRNA_RFAM_2761
CCAGAUGGUCGGGCGGCCGCUGUCGCGUGGAUUUCCCACGCGGUGGAGGAAAGUCCGGGCUCCACGGAGGAACGGUGCCGGCUAACGGCCGGCGGGGGUGACCCCAGGGAAAGUGCCACAGAAAACAGACCGCCCCCACGGCAUUCCGGUUCGCCGGAGAUGGUGCGGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGUGCGGUAACGCAGGCGGCAGGGCAAACCCCACCGGGAGCAAGACCGAAUAGGAACGGCAGACGGACCGCCUCGCGCGGGGUCGUCGGGGGUCCCUCCGCCCCGUCGUUCGGGUUG...
.(((((((((((((((((.(((((((((.........)))))))))....[[[.[[[[[((((....[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((.....................)))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((..............................(((((.]]]]))))).)))))).....)...
bpRNA_RFAM_27610
ACUAGCACUGACGUGCUAGGCUGAGUUAUGCCGUACCUUCGGUACU
.(((((((....))))))).............(((((...))))).
bpRNA_RFAM_27619
CCUAGCUCUGGCGAGCCAGGCUAAGUUAUGUCGUGCCUUCAGCACU
.(((((((....))))))).............(((((...))))).
bpRNA_RFAM_27622
CCUAGCUCUCACGAGCUCGGCUAAUUUAUACCGUGCUUUCAGCACU
.(((((((....))))))).............(((((...))))).
bpRNA_RFAM_2763
GGAGCCGGACGGGCUGUCGUCGCGGGCCGCAAGGCCCGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCGCAGGGCAGGACGCUGGGUAACCCCCAGGACGAGCGAUCGUCGGACAGGGCCACAGAAAACAGACCGCCCGGCAGGUUCGCCUGCCGGGUAAGGGUGAAACGGUGGGGUAAGAGCCCACCAGCUGGCGCGGUGACGCACCAGGCUCGGUAACCCCCGUCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGAAGCGUACGAGGCCUGCCCGGCCCAUGCUUCCGGGUCGGUUGCUUGAGGGCGUCGGUAACGGCGCUCCUAGAGGAAUGACAGC...
.(((((((((((((((((.(((((((((....)))))))))....[[[.[[[[[((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))))((...(((((............(((((((((((......)))))))))..)).......((((((.......)))))).(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((.....(((((.]]]])))))..)))))).....))))......((((((((....))))))))..........))))))...
bpRNA_RFAM_27631
CCUAGCACUUUCGUGCCAGGCUGUACUAUAUCGUCCCUUUGGGACU
.(((((((....))))))).............(((((...))))).
bpRNA_RFAM_27648
CCCAGGGCUUACGCCCUAGGCUAUUUCACGUCGCCCCUCCGGGGCU
.(((((((....))))))).............(((((...))))).
bpRNA_RFAM_27651
CCCAGCGCUCACGCGCUGGGCUACCAACUGGCGCCACUACGUGGCU
.(((((((....))))))).............(((((...))))).
bpRNA_RFAM_27657
CCCACCGCUUACGCGGUGGGCCAUUGCAUGGCGUCGCUGCGCGACU
.(((((((....))))))).............(((((...))))).
bpRNA_RFAM_27709
GUCGGUCCUCGGUAGUGGCCCUCGAAGGGAUUCGCGCCCAGCGCGAGAACCCGGGGGCCUCGAUCGAAGACCGCC
.((((((..((((...(((((.(((.(....((...........)..).)))).)))))...))))..)))))).
bpRNA_RFAM_27714
AUGGGUCCUCGGUAGUGGCCACCGGGGCGCGAUCCCGGCGGCUUCGAUCGAAGACCGGU
.((((((..((((...(((((.(((((.....))))).)))))...))))..)))))).
bpRNA_RFAM_27751
AUACUGAAUCUUGACGGGGAAUUAGUGCGAAAUUCACUUGCUGUUCCUGCAACCGUAUAGUCGGAGUGCCGUCCAGUAUAGUCCGCUGUUGAGCGAUGGCCAGGAAAAGCCUAGUUCUGCAAUUUAAUU
.(((((......(((((.....(((((.......)))))(((((.[[[))).[[[....))]]]....))))))))))............((((..((((.]]]....)))).))))............
bpRNA_RFAM_27796
GUGCUAAAAGCAUAGUGGGAAAGUGACGUGAAAUUCGUCCACAUUACUUGAUAAGGUCAUAGUCCGAAUGCCACCUAGCACAGAACAGAGCAAGGAGACUCGAAUGGUAAGAUUGAUUA
.(((((.......(((((.....(((((.......)))))(((((.[[[))).[[[.....))]]]....))))))))))......((((.]]]....)))).................
bpRNA_RFAM_27843
AUAGUAAAUAAUUUAGUAGGAAAACAGCGCGAAAUUUGUUGGCUAUACCUGCAACCGUUAAAGUCGGAGAGCCACCCAGUAUAGCCCAGUGUUGAAUGAAGGCCAGGAAAAGUCUAGCUCUGCAACUAAUUU
.(((((........(((((.....(((((.......)))))(((((.[[[))).[[[.....))]]]....))))))))))............((((..((((.]]]....)))).))))............
bpRNA_RFAM_27882
CAUACUACAGGAGUAGUGGGAAAUAAUGUGUAAAUCAUUGGCUGUACUCGCAACGGUAAAAAAAGCCCGGAAACCACAUAAAGUAUACCACUGUUGGAUGAAGACCGAGAAAAGUCACGUUCCACAAUUUUCAU
.(((((........(((((....(((((.......)))))(((((.[[[))).[[[........))]]]....))))))))))............((((..((((.]]]....)))).))))............
bpRNA_RFAM_27884
UAUCGAGGAACGCGGACUAAGUACGCCACGUCGUAUGGCAACGUCCUCAUGACCCGCUUCCUGCGGG
..........(((((((.......(((((.....)))))...)))))))...(((((.....)))))
bpRNA_RFAM_27887
CCUUAAGGAACGCAGACUAGGAAUGCCGCAUCCUGUGGCAACGUCUGCAUGGCCAGCUUCCUGGGGG
..........(((((((.......(((((.....)))))...)))))))...(((((.....)))))
bpRNA_RFAM_27898
AUUAGAGGAACGCAGGGCUAAAACCGCCACGUCCUGUGGCAACGCCUGCAUGAACCGCGUCCUGCGGG
..........(((((.((.......(((((.....)))))...)))))))...(((((.....)))))
bpRNA_RFAM_27946
AAAUAAGGAAGUUCGUUUAAAACCGUUCACGUCCUGUGAACAACACCGAACGACCUACAUCCUGUAGG
..........(((((((........(((((.....)))))....)))))))..(((((.....)))))
bpRNA_RFAM_27963
AACAUAGGAACACCUGCUAAAUGCGCCACUUCCUGUGGCAACGCAUGUGUUAGCAUGUCCUAUGCG
..........(((((((.......(((((.....)))))...)))))))..(((((.....)))))
bpRNA_RFAM_27981
GUAGUCAACGGUACCGGAACGACCAACGGGAGCGAGGAUAAGGAGUUGACUAGCUAACUAAA
.((((((((...................................))))))))..........
bpRNA_RFAM_27986
UUAGUCAACGGCUAGCGGACAACCGUAAGGGAGGGGCAUUAAGGAGUUGACUAAAUAACACCU
.((((((((....................................))))))))..........
bpRNA_RFAM_27995
UCUGUCAACGGUAAGCGGACAGAAUGAAGCUGUAAGCGAAAUGAAGGAGCAUUAAGGAGUUGACAGACUUACUAUG
.((((((((.................................................))))))))..........
bpRNA_RFAM_27997
UGAGUCAACGGUAAGCGGAACGAAAGUGAGCAUUAAGGAGUUGACUCAUUCACUACA
.((((((((..............................))))))))..........
bpRNA_RFAM_28004
AAUGUCAACGGUACCGGACUGAGCUUGCGAGGGAGGAUAAGGAGUUGACAUUUUGCUGUC
.((((((((..................................)))))))).........
bpRNA_RFAM_28010
UCGUUGCUAUAUUUGAAGUGAUUAUGAAUUUAAAAUUAAUUACUAAUUGGUGGCAAUCGCUUAAUUUUCAUUAGGUCGAUAACUCUUUUAGUUUACAGUAAAUAAUAAAAGGCUUGUU
...................................(((.((((((((.((((...((((((.(((....))).)))).))..)))))))))..)))..))).................
bpRNA_RFAM_28017
AUUUUUACCUUUGUAACAUAAUGAAAAACAGUAUAAACAUAUCUUGGUGGUGGAACUCUCUUAACUAAUAAGUGAGUUUAUACCUGUAUGUAAAAAUAUAUUAAAAAGGCUUAUC
.....................................((((((..((((...((.((((.(((.....))).)))).)).)))).))))))........................
bpRNA_RFAM_28018
UUAUCUUUGAUGCUCAAAUUAUGAAAAACAAAACAGUAAAUACUUGGUGGUGGAUCUCGCAACAGUAAUGUCGUGAAACAACCUUGUAUUUAAAAUUUAAAUAACUGAAAGGCCUGUC
..............................(((..((((((((..(...((.(((....(.(((....))).)...))).)))).))))))))..)).....................
bpRNA_RFAM_28019
UCUACCCUACUUUUGUACUCGACAUGAAAAAUAAUACAAACAAAACUUGGUGGUGGAACUCUCUUAAUUCAUAAGUGAGAUGAAUCCUAUAUGUUUAUAACAUAAUAAAAAAAGGCUUAUC
...................................(((.((((((((.((((......((((.(((.....))).)))).))..))))...)))))))).)....................
bpRNA_RFAM_28033
CCAAAAUAAAAACAGAUUUUAUGAAUAGAAUCAUGGUAAAUACAUAUUGGUGGCGUUUCUUACAACUAAACAAGUCGUAAGGGAACCAGACCAUGUAUAUAUACCUGACAUUCUAAUAAGGAUAUUCAAACUGAAGGCCUGUC
...................................(((.((((((((.((((..(((((...(.(((.....))).)...))).).).)))))))))))).))).......................................
bpRNA_RFAM_28086
AUGCAAGUCGACCUGAAGCUGUUUGUGAGUAUGUGAAUAUACAUGGAUAGUACUUAUACCUCCCCGGUAUAGACAGGGAGA
.................(((..(((((.((((....)))).)))))..)))..(((((((.....))))))).........
bpRNA_RFAM_28097
AUGCAAAUCGCCUGAUAAAGCUUCUUAUGGGUAUGCGAAUAUAGAUAAGUCAAGCAAGGUAUGCCUCCCCGGCAUUACAGGUAAGA
...................(((..(((((.((((....)))).)))))....)))...(((((((.....)))).)))........
bpRNA_RFAM_281
AGUAACAAUAGCAAAAGGGAUCACCUGAAUCCAUUCCGAACUCAGUAGUUAAGCCUUUUUACGCCGAAGAUACUAGAAAUAGGAAAAUAGGGAGUUACUC
.(((((....((.(((((......((((((.......))..))))..))....)))))....(((.((..(.((.......)).).)).))).)))))..
bpRNA_RFAM_28126
AUUUACGGUGGGGCAGUCAGGAAGACCGCAAGGUCUGCCGGUUCAUGCGCAAGCUCCGUUCCCGGUUUGCCAAUCCUGCCUGUCCCAUCACCA
.....((((((((((((((((((((((....)))))(((((....................))))).......)))))))))))))))))...
bpRNA_RFAM_28143
UUUUAUGGUGGCUGUGCGCGGGGCGCUUUCGAGUGCGCCGGGUGCCUAACGUCCCGGUCUUCCACACCUGCGUACAGCCGCCACCCAU
.....((((((((((((((((((((((....)))))(((((............)))))........))))))))))))))))).....
bpRNA_RFAM_28145
AGUCGCGGCGGCUAUGCGCGGGCACGUUUCGACGUGGCUGAGAUCCCUGGGUACUCGGUUCCUACCCCGCGUAUGGCUGCCACCCAU
.....((((((((((((((((((((((....)))))(((((.............)))))......))))))))))))))))).....
bpRNA_RFAM_28155
AAUUAUGGCGGCUGUGCGUAGGGCGCCUUCGGGCGCGCCGGGUUUGUGUGGGAUUACCGGUCUACUAACCUGCGCACAGCUGCCACCCAA
.....((((((((((((((((((((((....)))))(((((...............))))).......))))))))))))))))).....
bpRNA_RFAM_28168
AAUUAUGGUGGGCUGGGCAGGGGAGCCGAAAGGCUCGCCGGUUUCCUUGAUCGCCGGUAGUUCCAACCCUGUUCAGUCCGCCACCAGC
.....((((((((((((((((((((((....)))))(((((............)))))........))))))))))))))))).....
bpRNA_RFAM_28195
CUCUUUGGUAGUGUGCGUGGGGAGACCUUCGGGUCUGCCGGUUUUGCCUUGUGUUGCCGGUCUGCGAACCCCGCGCAUGCUGCCACCAAU
.....((((((((((((((((((((((....)))))(((((...............))))).......))))))))))))))))).....
bpRNA_RFAM_28248
AACAAUGGUGGGGCGUACGGGGGAGCUGAAAGGCUCGCCGGGUGUUGUUGUGACCGGUAGUGCAAACCUCGUACGUCUCACCACCCAA
.....((((((((((((((((((((((....)))))(((((............)))))........))))))))))))))))).....
bpRNA_RFAM_28267
UUCUAUGGGCUGGCCAUGGCAGGAGCGUGCUUGCACGCGCCGGUCACCUUGAGUCCCGGUCCGCCAAUCCUGCCAUUGUGCCAGCCCACCC
.....(((((((((..(((((((((((((....)))))(((((............))))).......))))))))....)))))))))...
bpRNA_RFAM_28271
UGCUAUGGCGACUGUGCGCUUGGCACCUUCGGGUGCGCCGGUUCUUAGCUCACCGGUCUACUAACUUGCGUACAGUUGCCGCCUU
.....((((((((((((((((((((((....)))))(((((...........))))).......)))))))))))))))))....
bpRNA_RFAM_2828
CAUUGCAGGCAACCGAGCCAGCGAUGGUUAGGAAAGUCCAUGCUAGCACAGGCUGCGAUCGCCUGUAGUGAUUGUGAUAGAGGAAACCAUAACUCUAUGCACCCGAGAGGGUGACGGCUGAGAAAGAGGCUUAUCAAGUCUUGAGUAUCUUUAAAAGUGCCACAGAGACGAGCUCUUUUAGCAAUAAAAGAGGUGGAACGGGUAAACCCCGCAAGCUAGAAACCCAAAUUUUGGUAGGGGCACUUGGCGUGAGAAACUGAACUUAACGCCGAGGUACGAUUUUGUACAGAUAAAUGGUUGCCACCCUUUUUAAAGGGUAC...
...(((((((((((..((((....)))).....[[[.[[[[[(((((((((((.......)))))).....(((((((((((..........)))))).(((((.....)))).)((.((((....((((.......)))).....))))......(((((...........((((((((....))))))))........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((.................)))))))((((((..))))))........)))))))..((((.....))))......
bpRNA_RFAM_28285
UUCAAUGGCGGGUCGAGGUGGGGACACCUUCGGGUGUGCCGGUUCCUGGUAGCCGGUCGGCCAACCCCGCUUUCGGUCCGCCGCCCGU
.....(((((((((.(((((((((((((....)))))(((((..........))))).......))))))))..))))))))).....
bpRNA_RFAM_2832
AGUUUUGGGUAAUUGAGCACAGCUUAUGUUGUGUUAGGAAGGUCCAUGCUCGCACAGGCUGCGAUGCCUGUAGUGUUUGUGCUCGCUGAAAAAAUAAGGCGGGGCACCAUUUUAUGGUGACGGCGGAAAAACGGACUAAGGUUUUAACUACGUCUUAGUAUUCCUGAAAAGUGCCACAGUGACGAUACAAUAUUGGAAACGAUAUUGGUGGAACGCGGUAAACCCCUCAAGCGGUAAACCCAAACUACGGUAGGGGAGCUUUGGAUAACAAAUUGAAGUGAUUCCAGGGGAGAGUAUUUCGAUACUCUGAGAUAGAUGAU...
...(((((((((((.((((((........))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((((...)))))).)((.((((....((((...(((....)))..)))).....))))......(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((.................)))))))((((((........))))))........)))...
bpRNA_RFAM_28328
AAUUAUGGUGGGCUGAGUGAGAGCACUUCGGUGCGCCGUAUCCUUGGAAGCGGUAUGACUAAUCUUGCUCAGUUCGCCACCCAA
.....(((((((((((((((((.(((.....)))(((((..........)))))........))))))))))))))))).....
bpRNA_RFAM_2833
UUAAAUCGACAGUCGCUGGCUACUUAGAUAGUUAGAGGAAAGUCCAUGCUCGCACAAUCUGUGAUGAUUGUAGUGUUUGUGCUAGAUGAAUAAAUAAGUCUAGGCAAGUUAUUGCUUGACGGCUGUUUUGUUUGCUAAGGGAAACUAUGUAAACAAACUUUAAAAGUGCCACAGAGACGAAUCUAUAUGGAAACGUAUAGGGUGGAACGGGUAAACCCCACAAGCGAGAAACCCAAAUUUGGUAGGGGAACCGGCUGGAAUGAAACGAAAGGAAGGCUGGAUAGCUUUAUGCUAUAGAUAAAUGACUGUCACCACGCAAG...
...(((((((((((.((((((........))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((((..)))))).)((.((((....((((...(((..)))..))))....)))).....(((((...........((((((((....))))))))........)))..))))))))))))))...(((..........)))...(((((((................)))))))((((((...))))))........)))))))..(((........
bpRNA_RFAM_28353
UUUCAUGGCGGCUGUACGCGGGAGAUCCUCGGAUCUGCCGAUUAUUGUGGGAUGAGUCGGCUCGCCAACCCGCGUAUAGCUGCCACCUAU
.....((((((((((((((((((((((....)))))(((((...............))))).......))))))))))))))))).....
bpRNA_RFAM_28373
CUCAAUGGUAGAGCGUAAAGGGCAACCGCUUGCGGUUGGCUAUGUUCCUUUGUACGUAGUUUCCUACCCCUUUACGCUUUACCGCCC
.....((((((((((((((((((((((......)))))(((((............))))).......)))))))))))))))))...
bpRNA_RFAM_28378
UGUUAUGGCAGUGUGCGUGGGAGAACCGCAAGGUUCGCCGUUUCUUUCGUAGCGGUAGUCUCAAUCCUGCGUACACUGUCGCCCUC
.....((((((((((((((((((((((....)))))(((((..........)))))........))))))))))))))))).....
bpRNA_RFAM_28387
CGUAGCGGUAGGACGGGAGAGGGACACCUACGGGUGUGCUGGUUAUAUCUUUCACCAGUCUGCUAACCCUUUCUCGUUCUGCCACCAUA
.....(((((((.(((((((((((((((....)))))(((((............))))).......)))))))))).))))))).....
bpRNA_RFAM_28471
CUCCAUGGCGGUCGUGCGCGGGCAGGCUUCGGUCUGGCCGGGGUUACCGUAUGUCCCGGGUCUCACCCCGUGCACGACUGCCACCCAA
.....((((((((((((((((((((((....)))))(((((..............)))))......))))))))))))))))).....
bpRNA_RFAM_28490
UUUCAUGGCGGGCCGGGCGGUGAGACCUUCGGGUCUGCCGGUAGCUGGGAUAGGGCCGGUCUGCUAACGCCGUCGUCAGGCCCGCCACCC
.....((((((((((((((((((((((....)))))(((((..............))))).......)))))))..).)))))))))...
bpRNA_RFAM_28501
UGUCAUGGCGGCUGUGCGCGGGAGACCGAAAGGUCUGCCGGGUUCCGUGUGUCCCGGUUCGCCAACCUGCGCACAGUCGCCUCCAAU
.....((((((((((((((((((((((....)))))(((((............))))).......))))))))))))))))).....
bpRNA_RFAM_28522
UUCUAGGGCGGGCUAUAUGUGGGAGCUUCGGCUCGCUGGUUCCGGUGACCAGCCUACCAACCCAUAUAGUCCCGCCCUUUUU
......(((((((((((((.((.(((.....)))(((((.........))))).......)))).)))).))))))).....
bpRNA_RFAM_28532
CGCAAUGGUGGCUACGUGCGGGUGACCUCUUGGUCAGCCGGGUUUUCGCCUCGUAAUGCCCCGGUCUUGCAGGCCCGUACGUAGCUGCCACCCU
.....((((((((((((((((((((((....)))))(((((...................)))))........)))))))))))))))))....
bpRNA_RFAM_28541
UGUUAUGGCAGCUGUGCGCGGGCAGGCUUUGCCUGGCCGGAAUGUAGCCUCCAACUUCGCCGGUUCUCACCCCGCGCAUGGCUGCCACCCAU
.....((((((((((((((((((((((...)))))(((((...................)))))......))))))))))))))))).....
bpRNA_RFAM_28564
AACAAUGGUGGGCUGUAUGGAACUUCCUUCGGGAAGGCUGGUUUCCUCUAACACCAGUAAGGCCAAUUCCGUACAGUCCACCGCCAGC
.....((((((((((((((((((((((....)))))(((((............)))))........))))))))))))))))).....
bpRNA_RFAM_28600
AAACUUUCUGGACAACGGUUGGGCCAGAGGCUUUCAAGUGAUUUGUGCUUUUGAUUAUUUGGCAGCUUUUCUCUUUCUAU
......((((.((((...))))..))))((((.((((((((((.........)))))))))).)))).............
bpRNA_RFAM_28607
AAAUCAUCCAAUGGUUGGCUGAUCGCUGACAGGUUAUGUGUGCUUUGGUUACCUGUUGAGCGUUUCUUUUUUC
...((((((((...)))))))).((((.(((((((((..........)))))))))..))))...........
bpRNA_RFAM_28609
ACAUCAGCCAAUGGUUGGCUGAUCGCUAUCGGAUAACGUGUGCUUUUGGUUAUUUGACAGCGGUUCUCUUUCUAU
...((((((((...)))))))).((((...(((((((...........))))))))).))...............
bpRNA_RFAM_28612
AACCACAGAAUGGUUUGGCGCUUUCAGGUGAUUUGUGCUCUUGAUUAUUUGUAAGCGUAUAGUAU
....(((..(...)).))((((.((((((((((.........)))))))))).))))........
bpRNA_RFAM_28615
CGUCCCGUCGGCUGCGGCGGGCAGCACGGCCGACAUUGGCCGGCCGGUUGCCCGCCUUCGUUUGUUGAUGACCGAAACGCAACA
...............((((((((((.((((((........)))))))))))))))).(((((....))))).............
bpRNA_RFAM_28622
UGAUAUCAGGGUCAAAAGGUCAGAAAGUCGUUCGUGCUUGCACGAUAAGACUUUGGAGCUUGGGACUCGUCAAACAUGAGAAAGUAGCAAUUUACGUAGUAAAUCAGAGGAUUUCGAAUGUUUGAGUAUUGACAGGCCAGAGUCAGGAAAAUUUUUGACUCUGGCCUGCUAUAUA
.((((((...(((..(((((((.(((((((((((((....))))).))))))))).)))))..))))..((((((((..((((...(((((((.......))))).))...))))..))))))))........(((((((((((............)))))))))))))))).).
bpRNA_RFAM_28629
ACUCACCAACCCCCGGAACUUUCAAGGCACCUGUGCUUGCACAAAGGUGCCUUGAAAAGUUUCGGGGGUGCCUUAUUAUGAGCAUAAAAGGGCGACGAAGUCGCACGAUAUGCGAAUAAUAAGGACAGAUUGCGGGAGCGGGAAGCGCGUAGCAAUCUGAGGUGAGU
.((((.....((((..(((.(((((((((((.(((....))))).))))))))))))).))..)........(((((((..((((......((.((....).)).....))))..))))))))...(((((((....((((...))))...)))))))....)))).
bpRNA_RFAM_28632
UGAUACCAGGGGCAAAAAUUUCAAAUGAUGUUCGUGCUUGCACGAUAAAGCAUUUGAAUUUGGGGACCUCCAAACAUGAGGAAGUAGCGAUUUACAUAGUAAAUCAGCGGAUUCCGAAUGUUUGAAGGAUUGUGGGAGCAGUUUACUGCGGAACAAUCCGUAAGUAUCA
.((((((...((((...(((((((((((((((((((....))))).)))))))))))))))..)))..((((.((((..((((...(((((((.......))))).))...))))..)))))))).(((((((....((((....))))...)))))))...)))))).
bpRNA_RFAM_28637
UGAUACCAGGGUCAAAAGGGUAUGCGUUUCAUGCUUGUAUGAAAAAGCAGGGCUUUGGGACCCAUAAAACAUGAGAAAGCAGCCCGAUUAGGGCGGAUUUCGAAUGUUUUUAGGAUUGUGGGAGCACAAAGUGCGGAACAAUCCGCAGGUAUCU
.((((((..((((..(((((((.((((((((((....))))).)))))).))))))..))))....(((.((..((((...((((......)))...))))..))).)))..(((((((....((((...))))...)))))))...)))))).
bpRNA_RFAM_28719
UGUAUAAGCUCCCGGACAGCGGCUGGGCGACUGGUAAGCUUGCUUGCCGAGACGCACAGACAUUGGACGGGGCAACAGGUAUGAGCACGCAGGCAUAUGCGCCGGAGUGCGAAUGCCUGUCGGGAUUGCGGGAGUGCGAUGCACGGGGCAAUCCGCAGGUUAUA
.(((.(....((((...(((((((((((((((.(((((....))))).).))))))))))))))...))))....(((((((..((((...(((.......))...))))..))))))))..(((((((....((((...))))...)))))))...))).)..
bpRNA_RFAM_28805
GUCUUUGGUGAAUAGUCGGUCAAAGCAUAGGCGGGACGACUGCUUGCAGGCAGGAACGCCUAUGCAUUAGACGGACAAACAGACAUGAGCAAGUAGGGCGACAGCCCGGAAUGCGAAUGCGAAUGGCUGUAGCGGUUCGAGAGUGCGAAGCACGGAGAAACGCGUGAUUCACCAAAGAU
.....(((((((...((((...((.(((((((((((((((((....))))).)))))))))))))).)...)))....((((((((..((((...((((.....)))...))))........))))))))...(((((....((((...))))...))))).)....))))))).....
bpRNA_RFAM_28816
AGCGACAUGAGGCCAUCUGCGCUCAUGUGCUGAAUCCAAUCGUUCGGUGGUUUAGGUUCUGUACCCAUUCCAUGGCGGCGGGAACGGGUAUAAUCGAAAUCGAAAGAAGCGGACCCCGCGCAGGUGGCUAACCAGAUACGCGGGCGAUGCGGAUUUUCAGUUGCAAAGGCCGGGCUGCACUCCCGGCC
.(((.((((((...........)))))))))..........((((.....................................)))).................(..(((((...(((((..((............))..)))))...)))...)))...........(((((((.......)))))))
bpRNA_RFAM_28825
GUGUGUGUAGGAGGAAUUAAUUUUAAUCAAGUGGAAACUAGGAAACACUUGAUCUAGAUUAAUUUAAAA
.............((((((..((...(((.(((............))).)))...))..))))))....
bpRNA_RFAM_28847
UCUCGUGUGAGGAGUGCAGACGCUACUCAGGGUCGAAACAAGGACAGACUCCUGAGGUUGUCUGAAUU
..............(..(((((..((..((((((............))).)))...))))))))....
bpRNA_RFAM_28914
UUGUGUGUAGGAGGAAUUGAUUUAUUUUAGUGGAAACAAGGAAACACUAAAAUUAAAUCAGUUUUUAA
.............((((((..((..(((.(((............))).)))...))..))))))....
bpRNA_RFAM_2898
UAAUGAUAGUUGGUUGCUAUAAGUUUCUUAUAGAGGAAAGUCCAUGCUAGCACUAUCUGAGAUGAUAGUAGUGUUUGUUGCAGGUAUAUAAAAAAUAAAACCUGGAAGAUUUACUCUUACGACACAACAAAACCUAAAAUGGUUGCAUUAUGGUUGAGUUGUAUAAAGUGCCACAGAGACGAGCAAAGAAGAAAUUCUUGAUAUGAAACGCGGUAAACUCCACAAGCUAGAAACCUAAAUUUGGUAAGGGAACUGGUUAUAAAAGAAUUCAAUUUUAUAAACGGAAGAAUGUAUGUUCUUAGAUAAAUAACCAACGUCUA...
...(((.((((((((.((((((.....))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....((((.(((((((............))))))(((((......))).)[[.((((...((((...(((......)))..))))...)))).....(((((.............(((((....)))))))..........)))..).]]))))))))))...(((..........)))...(((((((..................)))))))((((((....))))))........))))))).((((...
bpRNA_RFAM_28998
AUCUGUGUGAGGAGUGCUGAACGCCUCUUCAGGGUCGAAACAAGGACAGACUCCCUGAACGUGUUCCUCA
..............(....(((((....((((((((............)))..)))))..))))))....
bpRNA_RFAM_29020
AGGUGUGUGAGGAGUAAGUUGAAGCCCCCGGAGUCGAAACAAGGAAAGACGCCCAGGGGCUUUUUCU
..............(.....(((((..((((((((............))).)))..))))))))...
bpRNA_RFAM_29022
GACUUAGUGAGGAGUGAUUCGCAAACAAAAGUCCUAGGGUCGAAACACGGCAAGACUCCUAGGGCUUUUUAUUU
..............(...........(((((..((((((((............))).)))))..))))))....
bpRNA_RFAM_29028
UCGUUUGUGAGGAGGACUUCUCCUCGGAGUGGAAACAAGGAAACACGCCCAAAGAGAAGUCUUGA
..............((((((((...((((((............))).)))...))))))))....
bpRNA_RFAM_29070
GAGAGCUUAAAGAGUAAAGCACUUGGUGUCGAAACAAGGCAAGACUUCCAGGUGCUUUUCUCA
..............((((((..((((((((............))).)))))..))))))....
bpRNA_RFAM_29085
AGCAGUACGGGGAGAGCGACCCUGAUGCUGGCAGAAGAGUUUCCCCGUUGAGAAGAUCAGCGGGGAAAUCUCUCUGUGCCUGAAAGGUCUGAAAGCUUUAGACAUUCAGUGCAUCAGGCACAAAUCAAUGUGCCGUCGCGAGCAUAUUUACGCGGAAACCGCAUCGCUCGGGCAGGACCUGUUUCUCCUCGCGGUUCCGUGGCUCCA
..((((((((((.......)))))).))))(((((((....(((((((((.......)))))))))))..)))))............................................................................(((((.(((((.......((((((((.....)))))))))))))))))).......
bpRNA_RFAM_29221
AAGCGUUCACUCCACCACUUGCGUGGAGCGCAGUUCGAUCCAGGCCAAGGAACGGGGACCUGGA
...(((((.(((((.........)))))..........[[[[[[[[...))))).]].]]]]]]
bpRNA_RFAM_29239
AGACGUUCACCUUGCCUCCCUCGGCAAGGCGCAGUUCGACUCAGGCCAUGGAACGGGGACCUGAG
...(((((.(((((..........)))))..........[[[[[[[[...))))).]].]]]]]]
bpRNA_RFAM_29257
GUCCGUUCAUCCCGCAAGGGACGCAUGACAUGAGGUGACAUGGAACGGGGUCCCUCA
...(((((..(((.....))).........[[[[[.[[[...)))))..]]]]]]]]