Spaces:
Sleeping
Sleeping
File size: 26,550 Bytes
ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c 57c7d0c d697600 daabc0c 26840fc ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 8b352cc daabc0c ca4976b 8b352cc daabc0c 8b352cc daabc0c 8b352cc daabc0c 8b352cc daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 d24c8ec ce01761 daabc0c ce01761 57c7d0c daabc0c ca4976b daabc0c ce01761 57c7d0c daabc0c ce01761 daabc0c 57c7d0c daabc0c d24c8ec daabc0c d24c8ec daabc0c d24c8ec daabc0c d24c8ec daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 7cec16a 7d0049e daabc0c 7d0049e 3ede7bb 7d0049e ce01761 3ede7bb ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 3ede7bb ce01761 daabc0c ce01761 3ede7bb daabc0c 3ede7bb daabc0c 3ede7bb d697600 3ede7bb daabc0c 7d0049e 3ede7bb 7d0049e 3ede7bb ce01761 7d0049e daabc0c d24c8ec daabc0c d24c8ec daabc0c d24c8ec daabc0c d24c8ec daabc0c d24c8ec daabc0c d24c8ec daabc0c ce01761 daabc0c d24c8ec daabc0c d24c8ec daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 d24c8ec ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c ce01761 daabc0c | 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 | """
MODULE: VALIDATION CONTRACT (ETL ENGINE) - VERSION AMÉLIORÉE
=============================================================
Responsabilité : Pipeline ETL complet avec nettoyage des anomalies spécifiques hospitalières
Architecture : RAW → VALIDATED → CLEAN (3 couches)
Pipeline:
1. Extract → Chargement données brutes
2. Validate → Détection anomalies
3. Transform → Nettoyage spécifique (dates inversées, âges, doublons, etc.)
4. Load → Stockage RAW + CLEAN
5. Report → Rapport de transformation détaillé
Fonctionnalités :
- ✅ Stockage version BRUTE (pour Indicateurs_DQ)
- ✅ Stockage version CLEAN (pour EDA)
- ✅ Correction dates inversées
- ✅ Filtrage âges aberrants
- ✅ Déduplification patients
- ✅ Correction suroccupation
- ✅ Normalisation gravité
- ✅ Rapport transformation visuel
"""
import pandas as pd
import numpy as np
import streamlit as st
import plotly.express as px
import plotly.graph_objects as go
from datetime import datetime
import sys
import uuid # <--- AJOUTER CECI EN HAUT AVEC LES AUTRES IMPORTS
# Augmentation limite sécurité Python
sys.set_int_max_str_digits(100000)
# =====================================================
# ============= CLASSES DE DONNÉES ====================
# =====================================================
class DataExplorer:
"""Conteneur pour stocker les versions RAW et CLEAN des données"""
def __init__(self):
self.dataframes_raw = {} # Données BRUTES (pour DQ)
self.dataframes_clean = {} # Données NETTOYÉES (pour EDA)
self.metadata = {}
self.transformation_report = {}
self.load_timestamp = None
def add_dataframe(self, name, df_raw, df_clean, metrics):
"""Ajoute les deux versions d'un dataframe"""
self.dataframes_raw[name] = df_raw
self.dataframes_clean[name] = df_clean
# Métadonnées
numeric_cols = df_clean.select_dtypes(include=[np.number]).columns.tolist()
categorical_cols = df_clean.select_dtypes(include=['object']).columns.tolist()
date_cols = df_clean.select_dtypes(include=['datetime64']).columns.tolist()
# --- FIX CRITIQUE 1 : Calcul Anomalies Sécurisé (Gestion Infini) ---
anomalies_raw = 0
if 'dq_is_anomaly' in df_raw.columns:
try:
# 1. Convertir en numérique (les textes géants deviennent 'inf' ou 'NaN')
s_anom = pd.to_numeric(df_raw['dq_is_anomaly'], errors='coerce')
# 2. Remplacer Infini et NaN par 0 pour éviter le crash int(inf)
s_anom = s_anom.replace([np.inf, -np.inf], 0).fillna(0)
# 3. Somme sécurisée
anomalies_raw = int(s_anom.sum())
# Cap de sécurité
if anomalies_raw > 1_000_000: anomalies_raw = 999999
except Exception:
anomalies_raw = 0
anomalies_clean = 0
if 'dq_is_anomaly' in df_clean.columns:
try:
s_anom = pd.to_numeric(df_clean['dq_is_anomaly'], errors='coerce')
s_anom = s_anom.replace([np.inf, -np.inf], 0).fillna(0)
anomalies_clean = int(s_anom.sum())
if anomalies_clean > 1_000_000: anomalies_clean = 999999
except Exception:
anomalies_clean = 0
# -------------------------------------------------------------------
self.metadata[name] = {
'rows_raw': len(df_raw),
'rows_clean': len(df_clean),
'rows_removed': len(df_raw) - len(df_clean),
'mem_raw_mb': df_raw.memory_usage(deep=True).sum() / 1024**2,
'mem_clean_mb': df_clean.memory_usage(deep=True).sum() / 1024**2,
'columns': len(df_clean.columns),
'null_cells_raw': int(df_raw.isnull().sum().sum()),
'null_cells_clean': int(df_clean.isnull().sum().sum()),
'anomalies_raw': anomalies_raw,
'anomalies_clean': anomalies_clean,
'numeric_columns': numeric_cols,
'categorical_columns': categorical_cols,
'datetime_columns': date_cols
}
# Rapport de transformation
self.transformation_report[name] = metrics
@property
def dataframes(self):
"""Alias pour compatibilité avec Indicateurs_DQ (retourne version BRUTE)"""
return self.dataframes_raw
def get_clean_dataframe(self, name):
"""Récupère la version nettoyée"""
return self.dataframes_clean.get(name)
def get_raw_dataframe(self, name):
"""Récupère la version brute"""
return self.dataframes_raw.get(name)
def get_summary(self):
"""Résumé global"""
total_rows_raw = sum(m['rows_raw'] for m in self.metadata.values())
total_rows_clean = sum(m['rows_clean'] for m in self.metadata.values())
total_mem = sum(m['mem_clean_mb'] for m in self.metadata.values())
return {
'tables_loaded': len(self.dataframes_clean),
'total_rows_raw': total_rows_raw,
'total_rows_clean': total_rows_clean,
'total_rows_removed': total_rows_raw - total_rows_clean,
'total_memory_mb': round(total_mem, 2),
'timestamp': self.load_timestamp
}
def show_transformation_report(self):
"""Rapport visuel de transformation ETL"""
st.markdown("---")
st.markdown("### Rapport de Transformation ETL")
if not self.transformation_report:
st.warning("Aucun rapport de transformation disponible.")
return
# --- FIX : Génération d'un ID unique pour cet affichage ---
# Cela permet d'afficher le rapport plusieurs fois sans conflit de clé
unique_id = str(uuid.uuid4())[:8]
# Métriques globales
col1, col2, col3, col4 = st.columns(4)
summary = self.get_summary()
col1.metric("Tables traitées", summary['tables_loaded'])
col2.metric("Lignes BRUTES", f"{summary['total_rows_raw']:,}")
col3.metric("Lignes CLEAN", f"{summary['total_rows_clean']:,}")
col4.metric("Lignes supprimées", f"{summary['total_rows_removed']:,}",
delta_color="inverse")
# Graphiques
col_a, col_b = st.columns(2)
with col_a:
# Anomalies avant/après
names = list(self.metadata.keys())
anom_raw = [self.metadata[n]['anomalies_raw'] for n in names]
anom_clean = [self.metadata[n]['anomalies_clean'] for n in names]
fig_anom = go.Figure()
fig_anom.add_trace(go.Bar(x=names, y=anom_raw, name='BRUT', marker_color='crimson'))
fig_anom.add_trace(go.Bar(x=names, y=anom_clean, name='CLEAN', marker_color='green'))
fig_anom.update_layout(
title="Anomalies : BRUT vs CLEAN",
barmode='group',
height=400
)
# UTILISATION DE L'ID UNIQUE ICI 👇
st.plotly_chart(fig_anom, use_container_width=True, key=f"etl_chart_anom_{unique_id}")
with col_b:
# Cellules nulles avant/après
null_raw = [self.metadata[n]['null_cells_raw'] for n in names]
null_clean = [self.metadata[n]['null_cells_clean'] for n in names]
fig_null = go.Figure()
fig_null.add_trace(go.Bar(x=names, y=null_raw, name='BRUT', marker_color='orange'))
fig_null.add_trace(go.Bar(x=names, y=null_clean, name='CLEAN', marker_color='blue'))
fig_null.update_layout(
title="Cellules Nulles : BRUT vs CLEAN",
barmode='group',
height=400
)
# UTILISATION DE L'ID UNIQUE ICI 👇
st.plotly_chart(fig_null, use_container_width=True, key=f"etl_chart_null_{unique_id}")
# Détail des transformations
with st.expander("Détail des Transformations par Table"):
for table_name, report in self.transformation_report.items():
st.markdown(f"#### {table_name.upper()}")
if report.get('corrections_applied'):
st.markdown("** Corrections appliquées :**")
for correction in report['corrections_applied']:
st.write(f"- {correction}")
else:
st.info("Aucune correction nécessaire")
# Stats
meta = self.metadata[table_name]
col1, col2, col3 = st.columns(3)
col1.metric("Lignes supprimées", meta['rows_removed'])
col2.metric("Anomalies corrigées", meta['anomalies_raw'] - meta['anomalies_clean'])
col3.metric("Nulls comblés", meta['null_cells_raw'] - meta['null_cells_clean'])
st.markdown("---")
# [AJOUTER CECI À LA FIN DE LA MÉTHODE show_transformation_report]
# --- EXPORT CSV DES MÉTRIQUES ---
st.markdown("---")
st.subheader("📥 Export du Rapport ETL")
# 1. Préparation des données pour le CSV
export_data = []
for name, meta in self.metadata.items():
# Récupération des corrections sous forme de texte
report = self.transformation_report.get(name, {})
corrections_txt = " | ".join(report.get('corrections_applied', []))
row = {
"Table": name,
"Lignes Brutes": meta['rows_raw'],
"Lignes Nettoyées": meta['rows_clean'],
"Lignes Supprimées": meta['rows_removed'],
"Anomalies Avant": meta['anomalies_raw'],
"Anomalies Après": meta['anomalies_clean'],
"Cellules Vides (Nulls)": meta['null_cells_clean'],
"Corrections Appliquées": corrections_txt
}
export_data.append(row)
df_export = pd.DataFrame(export_data)
# 2. Bouton de téléchargement
csv = df_export.to_csv(index=False).encode('utf-8-sig') # utf-8-sig pour Excel
st.download_button(
label="📄 Télécharger le Rapport de Transformation (CSV)",
data=csv,
file_name=f"rapport_etl_{datetime.now().strftime('%Y%m%d_%H%M%S')}.csv",
mime="text/csv",
key=f"dl_btn_etl_{unique_id}" # Utilise l'ID unique généré plus haut
)
# =====================================================
# ============= MOTEUR ETL AMÉLIORÉ ===================
# =====================================================
class ETL_Engine:
"""Moteur ETL avec nettoyage spécifique des anomalies hospitalières"""
def __init__(self, gspread_client, sheet_name="bdd_mvp_faker"):
self.client = gspread_client
self.sheet_name = sheet_name
# Schéma contractuel (types attendus)
self.SCHEMA = {
'patients': {
'numeric': ['age', 'code_postal'],
'date': ['date_naissance'],
'categorical': ['patient_id', 'nom', 'prenom', 'sexe', 'ville',
'num_carte_vitale_fictif', 'num_carte_vitale_masque',
'pathologie_frequente_code'],
'preserve_as_is': ['dq_is_anomaly', 'dq_anomaly_type', 'dq_anomaly_detail']
},
'sejours': {
'numeric': ['gravite_1_5', 'duree_sejour_jours', 'consommables_estimes_score'],
'date': ['date_entree', 'date_sortie'],
'categorical': ['stay_id', 'patient_id', 'service_code', 'mode_entree',
'type_lit', 'pathologie_code', 'scenario_jour',
'equipement_principal_code'],
'preserve_as_is': ['dq_is_anomaly', 'dq_anomaly_type', 'dq_anomaly_detail']
},
'ressources_jour': {
'numeric': ['intensity', 'lits_total', 'lits_occupes', 'lits_disponibles',
'taux_occupation', 'personnel_total', 'taux_absence_conges',
'taux_absence_scenario', 'est_periode_conges', 'personnel_disponible',
'personnel_requis', 'tension_personnel'],
'date': ['date'],
'categorical': ['service_code', 'scenario', 'periode_conges_label'],
'preserve_as_is': ['dq_is_anomaly', 'dq_anomaly_type', 'dq_anomaly_detail']
},
'admissions_jour': {
'numeric': ['nb_admissions', 'intensity'],
'date': ['date'],
'categorical': ['service_code', 'scenario']
},
'stock_materiel_jour': {
'numeric': ['stock_total', 'stock_disponible', 'consommation_estimee_jour',
'tension_stock'],
'date': ['date'],
'categorical': ['service_code', 'materiel_code', 'alerte_stock'],
'preserve_as_is': ['dq_is_anomaly', 'dq_anomaly_type', 'dq_anomaly_detail']
},
'scenarios_calendrier': {
'numeric': ['intensity'],
'date': ['date'],
'categorical': ['scenario']
}
}
self.REFERENCE_TABLES = [
'service_ref', 'pathologie_ref', 'materiel_ref',
'mode_entree_ref', 'type_lit_ref', 'calendrier_conges', 'hypotheses'
]
def _convert_types(self, name, df):
"""Étape 1 : Conversion et Typage Strict"""
df_typed = df.copy()
# --- MODIF 1 : Normalisation des noms de colonnes ---
# Nettoie les espaces, met en minuscule et remplace les tirets pour une détection fiable
df_typed.columns = df_typed.columns.str.strip().str.lower().str.replace(' ', '_').str.replace('-', '_')
name_normalized = name.lower().strip().replace(' ', '_').replace('-', '_')
# Tables de référence : on conserve le format brut
if name_normalized in self.REFERENCE_TABLES:
return df_typed
config = self.SCHEMA.get(name_normalized)
if not config:
return df_typed
# 1. Conversion DATES
for col in config.get('date', []):
if col in df_typed.columns:
df_typed[col] = pd.to_datetime(df_typed[col], errors='coerce')
# 2. --- MODIF 2 : Conversion NUMÉRIQUES BLINDÉE ---
# Liste des colonnes numériques à traiter
num_cols = config.get('numeric', [])
# On ajoute dynamiquement les colonnes de DQ si elles existent pour éviter le crash 'str' vs 'int'
if 'dq_is_anomaly' in df_typed.columns:
num_cols.append('dq_is_anomaly')
for col in num_cols:
if col in df_typed.columns:
# Nettoyage des caractères parasites (espaces, virgules)
if df_typed[col].dtype == 'object':
df_typed[col] = df_typed[col].astype(str).str.replace(',', '.', regex=False)
df_typed[col] = df_typed[col].str.replace(r'\s+', '', regex=True)
# Suppression des termes textuels courants
df_typed[col] = df_typed[col].replace(['Full', 'Erreur', 'nan', 'None', ''], np.nan)
# Conversion en numérique (coerce transforme les erreurs en NaN)
df_typed[col] = pd.to_numeric(df_typed[col], errors='coerce')
# FIX CRITIQUE : Remplacement des NaN par 0
# C'est l'assurance vie du Dashboard pour les comparaisons mathématiques
df_typed[col] = df_typed[col].fillna(0)
# 3. Conversion CATÉGORIELLES
for col in config.get('categorical', []):
if col in df_typed.columns:
df_typed[col] = df_typed[col].astype(str).str.strip()
df_typed[col] = df_typed[col].replace(['nan', 'NaN', 'None', ''], np.nan)
return df_typed
def _clean_patients(self, df):
"""Nettoyage spécifique PATIENTS"""
df_clean = df.copy()
corrections = []
# 1. Filtrer âges aberrants
if 'age' in df_clean.columns:
mask_age_invalid = (df_clean['age'] < 0) | (df_clean['age'] > 120)
nb_invalid_age = mask_age_invalid.sum()
if nb_invalid_age > 0:
df_clean = df_clean[~mask_age_invalid].copy()
corrections.append(f" Supprimé {nb_invalid_age} patients avec âge aberrant (<0 ou >120)")
# 2. Déduplification (nom + prénom)
if 'nom' in df_clean.columns and 'prenom' in df_clean.columns:
nb_before = len(df_clean)
df_clean = df_clean.drop_duplicates(subset=['nom', 'prenom'], keep='first')
nb_removed = nb_before - len(df_clean)
if nb_removed > 0:
corrections.append(f" Supprimé {nb_removed} doublons (nom+prénom)")
# 3. Filtrer dates de naissance futures
if 'date_naissance' in df_clean.columns:
mask_future = df_clean['date_naissance'] > pd.Timestamp.now()
nb_future = mask_future.sum()
if nb_future > 0:
df_clean = df_clean[~mask_future].copy()
corrections.append(f" Supprimé {nb_future} patients avec date de naissance future")
return df_clean, corrections
def _clean_sejours(self, df):
"""Nettoyage spécifique SÉJOURS"""
df_clean = df.copy()
corrections = []
# 1. Corriger dates inversées (swap entrée/sortie)
if 'date_entree' in df_clean.columns and 'date_sortie' in df_clean.columns:
mask_inverted = df_clean['date_sortie'] < df_clean['date_entree']
nb_inverted = mask_inverted.sum()
if nb_inverted > 0:
# Swap des dates
df_clean.loc[mask_inverted, ['date_entree', 'date_sortie']] = \
df_clean.loc[mask_inverted, ['date_sortie', 'date_entree']].values
# Recalcul durée
if 'duree_sejour_jours' in df_clean.columns:
df_clean.loc[mask_inverted, 'duree_sejour_jours'] = \
(df_clean.loc[mask_inverted, 'date_sortie'] -
df_clean.loc[mask_inverted, 'date_entree']).dt.days
corrections.append(f" Inversé {nb_inverted} paires de dates (sortie < entrée)")
# 2. Normaliser gravité (forcer entre 1 et 5)
if 'gravite_1_5' in df_clean.columns:
mask_invalid_grav = (df_clean['gravite_1_5'] < 1) | (df_clean['gravite_1_5'] > 5)
nb_invalid_grav = mask_invalid_grav.sum()
if nb_invalid_grav > 0:
# Clip entre 1 et 5
df_clean.loc[mask_invalid_grav, 'gravite_1_5'] = \
df_clean.loc[mask_invalid_grav, 'gravite_1_5'].clip(1, 5)
corrections.append(f" Normalisé {nb_invalid_grav} gravités hors norme (1-5)")
# 3. Supprimer séjours avec durée négative (même après correction dates)
if 'duree_sejour_jours' in df_clean.columns:
mask_negative_duration = df_clean['duree_sejour_jours'] < 0
nb_negative = mask_negative_duration.sum()
if nb_negative > 0:
df_clean = df_clean[~mask_negative_duration].copy()
corrections.append(f"Supprimé {nb_negative} séjours avec durée négative")
return df_clean, corrections
def _clean_ressources(self, df):
"""Nettoyage spécifique RESSOURCES"""
df_clean = df.copy()
corrections = []
# 1. Corriger suroccupation (lits_occupes > lits_total)
if 'lits_occupes' in df_clean.columns and 'lits_total' in df_clean.columns:
# Conversion sécurisée
df_clean['lits_occupes'] = pd.to_numeric(df_clean['lits_occupes'], errors='coerce').fillna(0)
mask_suroccup = df_clean['lits_occupes'] > df_clean['lits_total']
nb_suroccup = mask_suroccup.sum()
if nb_suroccup > 0:
# Plafonner à lits_total
df_clean.loc[mask_suroccup, 'lits_occupes'] = df_clean.loc[mask_suroccup, 'lits_total']
# Recalculer taux_occupation
if 'taux_occupation' in df_clean.columns:
df_clean.loc[mask_suroccup, 'taux_occupation'] = 1.0
corrections.append(f" Corrigé {nb_suroccup} cas de suroccupation (plafonné à capacité)")
# 2. Filtrer taux d'occupation aberrants (>1.5 = 150%)
if 'taux_occupation' in df_clean.columns:
mask_invalid_rate = df_clean['taux_occupation'] > 1.5
nb_invalid_rate = mask_invalid_rate.sum()
if nb_invalid_rate > 0:
df_clean = df_clean[~mask_invalid_rate].copy()
corrections.append(f" Supprimé {nb_invalid_rate} lignes avec taux >150%")
return df_clean, corrections
def _clean_stock(self, df):
"""Nettoyage spécifique STOCK"""
df_clean = df.copy()
corrections = []
# 1. Filtrer stocks négatifs
if 'stock_disponible' in df_clean.columns:
mask_negative = df_clean['stock_disponible'] < 0
nb_negative = mask_negative.sum()
if nb_negative > 0:
df_clean.loc[mask_negative, 'stock_disponible'] = 0
corrections.append(f"🔧 Corrigé {nb_negative} stocks négatifs (mis à 0)")
return df_clean, corrections
def _clean_dataframe(self, name, df_raw):
"""Pipeline de nettoyage complet"""
# Étape 1 : Conversion types
df_typed = self._convert_types(name, df_raw)
# Étape 2 : Nettoyage spécifique selon la table
name_normalized = name.lower().strip().replace(' ', '_').replace('-', '_')
corrections = []
if name_normalized == 'patients':
df_clean, corr = self._clean_patients(df_typed)
corrections.extend(corr)
elif name_normalized == 'sejours':
df_clean, corr = self._clean_sejours(df_typed)
corrections.extend(corr)
elif name_normalized == 'ressources_jour':
df_clean, corr = self._clean_ressources(df_typed)
corrections.extend(corr)
elif name_normalized == 'stock_materiel_jour':
df_clean, corr = self._clean_stock(df_typed)
corrections.extend(corr)
else:
df_clean = df_typed
corrections.append("ℹ️ Aucun nettoyage spécifique appliqué")
return df_clean, corrections
def run_etl(self):
"""Pipeline ETL complet avec stockage RAW + CLEAN"""
data_explorer = DataExplorer()
try:
spreadsheet = self.client.open(self.sheet_name)
worksheets = spreadsheet.worksheets()
relevant_sheets = [ws for ws in worksheets if ws.title.lower() not in ['', 'sheet1', 'feuil1']]
progress_bar = st.progress(0, text=" ETL Engine: Extraction...")
for i, ws in enumerate(relevant_sheets):
raw_data = ws.get_all_values()
if len(raw_data) > 1:
headers = raw_data[0]
rows = raw_data[1:]
df_raw = pd.DataFrame(rows, columns=headers)
std_name = ws.title.lower().strip().replace(' ', '_').replace('-', '_').split('.')[0]
# TRANSFORM
progress_bar.progress((i + 0.5) / len(relevant_sheets),
text=f"🔧 Nettoyage: {std_name}...")
df_clean, corrections = self._clean_dataframe(std_name, df_raw)
# Metrics
metrics = {
'corrections_applied': corrections,
'rows_before': len(df_raw),
'rows_after': len(df_clean)
}
# LOAD (RAW + CLEAN)
data_explorer.add_dataframe(std_name, df_raw, df_clean, metrics)
progress_bar.progress((i + 1) / len(relevant_sheets))
data_explorer.load_timestamp = datetime.now()
progress_bar.empty()
# Stockage session
st.session_state.data_explorer = data_explorer
# Rapport
summary = data_explorer.get_summary()
st.success(f"✅ ETL Terminé : {summary['total_rows_clean']:,} lignes CLEAN "
f"({summary['total_rows_removed']:,} supprimées)")
return True, data_explorer
except Exception as e:
st.error(f"❌ Erreur ETL : {str(e)}")
import traceback
st.code(traceback.format_exc())
return False, str(e)
def get_dataframe(self, table_name, version='clean'):
"""
Récupère un dataframe depuis le session_state
Args:
table_name: Nom de la table
version: 'raw' ou 'clean' (défaut: 'clean')
"""
if 'data_explorer' in st.session_state:
if version == 'raw':
return st.session_state.data_explorer.get_raw_dataframe(table_name)
else:
return st.session_state.data_explorer.get_clean_dataframe(table_name)
return None
def get_all_tables(self):
"""Retourne la liste de toutes les tables disponibles"""
if 'data_explorer' in st.session_state:
return list(st.session_state.data_explorer.dataframes_clean.keys())
return [] |