KernLat-ML 示例 CGMD 数据

本数据集提供 KernLat-ML 的四组粗粒化分子动力学示例条件：

conditions/
├── DMPE_05/
├── DMPE_10/
├── DOPE_05/
└── DOPE_10/

目录名表示磷脂类型和 PE 摩尔分数（例如 DMPE_05 表示 DMPE、5% PE）。每组条件保留对应的囊泡构建、融合矩阵、GROMACS 输入文件、轨迹、坐标、拓扑、检查点和质量控制记录，便于复核 CGMD 运行过程并提取 KernLat-ML 所需的动力学指标。

文件说明

• *.xtc、*.trr：分子动力学轨迹
• *.gro、*.pdb：坐标和结构文件
• *.tpr、*.cpt、*.edr：GROMACS 运行文件、检查点和能量文件
• *.top、*.itp、*.mdp、*.ndx：拓扑、参数和索引文件
• *.json、*.log、*.tsv：质量控制、运行状态和分析记录

大文件通过 Hugging Face Xet/LFS 存储。下载后可按各目录中的运行记录、拓扑和参数文件复核对应条件。

数据来源与许可

数据来自 KernLat-ML 项目的 CGMD 条件目录，仅用于项目示例、方法复核和特征提取。完整数据的使用应遵守数据提供方、模拟软件及所含力场文件的许可要求；本仓库不授予超出原始许可范围的权利。

关联代码

预测和筛选代码位于配套的 KernLat-ML 代码包中。该数据集不包含正式模型权重；示例数据和模型的使用范围以代码包中的说明文件为准。