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数据卡 · HEA 分子动力学轨迹数据集(step 2 建模用)
本文件说明 data/processed/ 下三个文件的字段、单位、清洗规则与已知缺陷。
原始材料见 raw/(论文提取data_final.xlsx、step2.docx、报告正文 PDF)。
1. 来源与构建流程
- 原始表格:
raw/论文提取data_final.xlsx,Sheet1 为 71 行 × 63 列样本元数据, Sheet2 为 70 个「样本块」(每块 1 列sample_id+ 16 列数据 + 1 空列,401 行/块)。 - 构建脚本:
code/pimamba/build_dataset.py,命令python -m pimamba.build_dataset(在code/下执行)。 - 输出:
data/processed/samples_meta.csv(33 × 84)、trajectories.csv(13233 × 18)、build_report.json(覆盖率与单位审计)、data_dictionary.json(字段字典)。
清洗规则
- 整条记录删除:Sheet1 中某行黄色填充单元格(
FFFFFF00)≥ 50 个即判定为 「该样本整行被标黄」→ 删除对应sample_id。命中 24–60 共 37 个样本, 分属 2 篇论文(原始 70 → 保留 33)。 - 应变网格:所有样本统一 401 点,
strain ∈ [0, 0.2],步长5e-4。 - 缺失/不适用:几何字段按形状解析(prism 用 L/W/H,cylinder 用 D 与 L/D),
不适用的字段保留
NaN而非 0,并用app_L/app_W/app_H/app_D/app_AR/app_V六个适用性 flag 显式标记;模型侧以「归一化后置零 + flag」处理。 - N/A 数值:表格中的
N/A、空串、-一律解析为NaN,不参与损失(见observed_mask)。
2. 样本构成
| 合金体系 | 样本数 |
|---|---|
| Al0.1CoCrFeNi | 6 |
| Al20.4Mo10.5Nb22.4Ta10.1Ti17.8Zr18.8(难熔 RHEA) | 5 |
| FeCoNiCr | 4 |
| MoNbTaW | 4 |
| Fe2Ni2CrAl | 4 |
| CoCrFeMnNi | 2 |
| MEA/HEA/HESA FeNi(Cr)(Co)Al(拉/压各 1) | 8 |
共 33 条轨迹 / 10 个合金体系(按合金名去重后 14 个「成分-工况」组合)。
3. 输出目标(13 个建模头)
| key | 物理量 | 单位 | 训练变换 | 有标签样本 | 点数 |
|---|---|---|---|---|---|
sigma |
流动应力 | GPa | z-score | 33 | 13233 |
xi_BCC |
BCC 相分数 | – | 不缩放(0–1) | 11 | 4411 |
xi_FCC |
FCC 相分数 | – | 不缩放 | 11 | 4411 |
xi_HCP |
HCP 相分数 | – | 不缩放 | 7 | 2807 |
xi_other |
其他/非晶相分数 | – | 不缩放 | 11 | 4411 |
rho_total |
总位错密度 | 1e19 m⁻² | asinh | 16 | 6416 |
rho_perfect |
完美位错 | 1e19 m⁻² | asinh | 3 | 1203 |
rho_shockley |
Shockley 不全位错 | 1e19 m⁻² | asinh | 6 | 2406 |
rho_stairrod |
阶梯杆位错 | 1e19 m⁻² | asinh | 5 | 2005 |
rho_hirth |
Hirth 位错 | 1e19 m⁻² | asinh | 6 | 2406 |
rho_other_disl |
其他位错 | 1e19 m⁻² | asinh | 4 | 1604 |
rho_112_111 |
1/2⟨112⟩{111} 型 | 1e19 m⁻² | asinh | 3 | 1203 |
twin |
孪晶密度 | nm⁻¹ | asinh | 6 | 2406 |
剔除:rho_frank、rho_100 在全部 70 个样本块中均无有效数据 → 不建模。
已知数据缺陷(必须在解读指标时考虑)
rho_perfect:仅 3 个样本、且数值长期贴近 0(全数据标准差 5.7e-4), 其 R² 在数值上无意义(分母趋零)。rho_112_111:仅 3 个样本(同一篇论文),量级达 7.0×10²¹ m⁻²,比其余位错类型高 2–3 个数量级。原文该列确为「715.14 ×10¹⁹ m⁻²」,提取忠实但物理上存疑, 视为数据质量问题,不进主指标。- 6 个位错分型目标合计只覆盖 3–6 个样本,不足以支撑跨合金泛化评估。
因此主指标定义为 7 个目标的宏平均 R²:
sigma, xi_BCC, xi_FCC, xi_HCP, xi_other, rho_total, twin
(metrics.PRIMARY)。其余 6 个位错分型目标单独报告,不参与主指标聚合。
4. 输入特征
- 静态(每样本):20 种元素原子百分比、VEC、δ、r̄、ΔH_mix、ΔS_mix、χ̄、M_avg、 δμ、T_m̄、ρ_mass、初始相结构、初始位错/孪晶密度、孪晶形核应力、孪晶类型/间距、 load_mode、load_direction、T0、strain_rate、系综(NPT/NVT/NVE one-hot)、 形状 one-hot + 适用性 flag + 几何量(log10)。
- 动态(每应变步,5 通道):
strain/0.2、Δstrain/5e-4、log10(rate)/10、T0/1000、load_sign(拉 +1 / 压 −1)。
归一化:物理量 z-score;应变率与几何 log10;位错/孪晶密度 asinh(零值有定义);
相分数与 one-hot 不缩放。Normalizer 只在训练集上拟合,随 checkpoint 保存。
5. 划分
kfold:按合金分层的 5 折(全局轮转分配,每折 6–7 个测试样本)。loao:Leave-One-Alloy-Out,10 个合金体系轮流留出。random:按合金分层随机划分(同合金可跨集合,用于「内插」参照)。
6. 引用与许可
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