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数据卡 · HEA 分子动力学轨迹数据集(step 2 建模用)

本文件说明 data/processed/ 下三个文件的字段、单位、清洗规则与已知缺陷。 原始材料见 raw/(论文提取data_final.xlsx、step2.docx、报告正文 PDF)。

1. 来源与构建流程

  • 原始表格:raw/论文提取data_final.xlsx,Sheet1 为 71 行 × 63 列样本元数据, Sheet2 为 70 个「样本块」(每块 1 列 sample_id + 16 列数据 + 1 空列,401 行/块)。
  • 构建脚本:code/pimamba/build_dataset.py,命令 python -m pimamba.build_dataset(在 code/ 下执行)。
  • 输出:data/processed/samples_meta.csv(33 × 84)、trajectories.csv(13233 × 18)、 build_report.json(覆盖率与单位审计)、data_dictionary.json(字段字典)。

清洗规则

  1. 整条记录删除:Sheet1 中某行黄色填充单元格(FFFFFF00)≥ 50 个即判定为 「该样本整行被标黄」→ 删除对应 sample_id。命中 24–60 共 37 个样本, 分属 2 篇论文(原始 70 → 保留 33)。
  2. 应变网格:所有样本统一 401 点,strain ∈ [0, 0.2],步长 5e-4。
  3. 缺失/不适用:几何字段按形状解析(prism 用 L/W/H,cylinder 用 D 与 L/D), 不适用的字段保留 NaN 而非 0,并用 app_L/app_W/app_H/app_D/app_AR/app_V 六个适用性 flag 显式标记;模型侧以「归一化后置零 + flag」处理。
  4. N/A 数值:表格中的 N/A、空串、- 一律解析为 NaN,不参与损失(见 observed_mask)。

2. 样本构成

合金体系 样本数
Al0.1CoCrFeNi 6
Al20.4Mo10.5Nb22.4Ta10.1Ti17.8Zr18.8(难熔 RHEA) 5
FeCoNiCr 4
MoNbTaW 4
Fe2Ni2CrAl 4
CoCrFeMnNi 2
MEA/HEA/HESA FeNi(Cr)(Co)Al(拉/压各 1) 8

共 33 条轨迹 / 10 个合金体系(按合金名去重后 14 个「成分-工况」组合)。

3. 输出目标(13 个建模头)

key 物理量 单位 训练变换 有标签样本 点数
sigma 流动应力 GPa z-score 33 13233
xi_BCC BCC 相分数 – 不缩放(0–1) 11 4411
xi_FCC FCC 相分数 – 不缩放 11 4411
xi_HCP HCP 相分数 – 不缩放 7 2807
xi_other 其他/非晶相分数 – 不缩放 11 4411
rho_total 总位错密度 1e19 m⁻² asinh 16 6416
rho_perfect 完美位错 1e19 m⁻² asinh 3 1203
rho_shockley Shockley 不全位错 1e19 m⁻² asinh 6 2406
rho_stairrod 阶梯杆位错 1e19 m⁻² asinh 5 2005
rho_hirth Hirth 位错 1e19 m⁻² asinh 6 2406
rho_other_disl 其他位错 1e19 m⁻² asinh 4 1604
rho_112_111 1/2⟨112⟩{111} 型 1e19 m⁻² asinh 3 1203
twin 孪晶密度 nm⁻¹ asinh 6 2406

剔除:rho_frank、rho_100 在全部 70 个样本块中均无有效数据 → 不建模。

已知数据缺陷(必须在解读指标时考虑)

  • rho_perfect:仅 3 个样本、且数值长期贴近 0(全数据标准差 5.7e-4), 其 R² 在数值上无意义(分母趋零)。
  • rho_112_111:仅 3 个样本(同一篇论文),量级达 7.0×10²¹ m⁻²,比其余位错类型高 2–3 个数量级。原文该列确为「715.14 ×10¹⁹ m⁻²」,提取忠实但物理上存疑, 视为数据质量问题,不进主指标。
  • 6 个位错分型目标合计只覆盖 3–6 个样本,不足以支撑跨合金泛化评估。

因此主指标定义为 7 个目标的宏平均 R²: sigma, xi_BCC, xi_FCC, xi_HCP, xi_other, rho_total, twin (metrics.PRIMARY)。其余 6 个位错分型目标单独报告,不参与主指标聚合。

4. 输入特征

  • 静态(每样本):20 种元素原子百分比、VEC、δ、r̄、ΔH_mix、ΔS_mix、χ̄、M_avg、 δμ、T_m̄、ρ_mass、初始相结构、初始位错/孪晶密度、孪晶形核应力、孪晶类型/间距、 load_mode、load_direction、T0、strain_rate、系综(NPT/NVT/NVE one-hot)、 形状 one-hot + 适用性 flag + 几何量(log10)。
  • 动态(每应变步,5 通道):strain/0.2、Δstrain/5e-4、log10(rate)/10、 T0/1000、load_sign(拉 +1 / 压 −1)。

归一化:物理量 z-score;应变率与几何 log10;位错/孪晶密度 asinh(零值有定义); 相分数与 one-hot 不缩放。Normalizer 只在训练集上拟合,随 checkpoint 保存。

5. 划分

  • kfold:按合金分层的 5 折(全局轮转分配,每折 6–7 个测试样本)。
  • loao:Leave-One-Alloy-Out,10 个合金体系轮流留出。
  • random:按合金分层随机划分(同合金可跨集合,用于「内插」参照)。

6. 引用与许可

数据由使用者提供的论文提取表构建,原始文献版权归各论文作者所有; 本仓库仅用于方法复现与研究,未做再分发许可声明。