The dataset viewer is not available for this split.
Error code: FeaturesError
Exception: ArrowTypeError
Message: ("Expected bytes, got a 'list' object", 'Conversion failed for column NC_029549.1 with type object')
Traceback: Traceback (most recent call last):
File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/datasets/packaged_modules/json/json.py", line 290, in _generate_tables
pa_table = paj.read_json(
io.BytesIO(batch), read_options=paj.ReadOptions(block_size=block_size)
)
File "pyarrow/_json.pyx", line 342, in pyarrow._json.read_json
File "pyarrow/error.pxi", line 155, in pyarrow.lib.pyarrow_internal_check_status
return check_status(status)
File "pyarrow/error.pxi", line 92, in pyarrow.lib.check_status
raise convert_status(status)
pyarrow.lib.ArrowInvalid: JSON parse error: Missing a comma or '}' after an object member. in row 0
During handling of the above exception, another exception occurred:
Traceback (most recent call last):
File "/src/services/worker/src/worker/job_runners/split/first_rows.py", line 244, in compute_first_rows_from_streaming_response
iterable_dataset = iterable_dataset._resolve_features()
File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/datasets/iterable_dataset.py", line 4408, in _resolve_features
features = _infer_features_from_batch(self.with_format(None)._head())
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~^^
File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/datasets/iterable_dataset.py", line 2679, in _head
return next(iter(self.iter(batch_size=n)))
File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/datasets/iterable_dataset.py", line 2861, in iter
for key, pa_table in ex_iterable.iter_arrow():
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~^^
File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/datasets/iterable_dataset.py", line 2395, in _iter_arrow
yield from self.ex_iterable._iter_arrow()
File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/datasets/iterable_dataset.py", line 536, in _iter_arrow
for key, pa_table in iterator:
^^^^^^^^
File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/datasets/iterable_dataset.py", line 419, in _iter_arrow
for key, pa_table in self.generate_tables_fn(**gen_kwags):
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~^^^^^^^^^^^^^
File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/datasets/packaged_modules/json/json.py", line 331, in _generate_tables
pa_table = pa.Table.from_pandas(df, preserve_index=False)
File "pyarrow/table.pxi", line 4796, in pyarrow.lib.Table.from_pandas
File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/pyarrow/pandas_compat.py", line 651, in dataframe_to_arrays
arrays = [convert_column(c, f)
~~~~~~~~~~~~~~^^^^^^
File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/pyarrow/pandas_compat.py", line 639, in convert_column
raise e
File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/pyarrow/pandas_compat.py", line 633, in convert_column
result = pa.array(col, type=type_, from_pandas=True, safe=safe)
File "pyarrow/array.pxi", line 365, in pyarrow.lib.array
File "pyarrow/array.pxi", line 91, in pyarrow.lib._ndarray_to_array
check_status(NdarrayToArrow(pool, values, mask, from_pandas,
File "pyarrow/error.pxi", line 92, in pyarrow.lib.check_status
raise convert_status(status)
pyarrow.lib.ArrowTypeError: ("Expected bytes, got a 'list' object", 'Conversion failed for column NC_029549.1 with type object')Need help to make the dataset viewer work? Make sure to review how to configure the dataset viewer, and open a discussion for direct support.
Paneles de referencia Geeknome
Este repositorio aloja exclusivamente las bases de datos de referencia y los paneles genómicos utilizados por la plataforma Geeknome. No contiene el software, el motor de análisis ni una licencia de uso del programa.
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Base de datos de referencia por paneles
Base de datos: NCBI RefSeq Viral — 10 de julio de 2026 (09:06 UTC).
Este repositorio aloja los paneles de referencia de Geeknome, derivados y organizados a partir de la base de datos indicada. La base se ha dividido en paneles específicos para que el análisis se realice frente al conjunto de referencias más pertinente para cada muestra o proyecto. Esta división facilita la selección del contexto analítico, reduce comparaciones innecesarias y hace más trazable el panel utilizado en cada reporte.
Cada panel contiene sus propias secuencias de referencia, taxonomía e índices asociados. Durante una ejecución, Geeknome descarga y utiliza el panel seleccionado; los resultados deben interpretarse únicamente dentro del alcance taxonómico y de las referencias incluidas en ese panel. Un resultado negativo no descarta organismos que no formen parte del panel elegido.
| Panel | Alcance de referencia |
|---|---|
| Panel Respiratorio | Virus y referencias asociadas a análisis respiratorio |
| Panel Animal Exótico | Referencias de interés en animales exóticos |
| Panel Arbovirus Flavivirus | Arbovirus del grupo Flavivirus |
| Panel Arbovirus Otros | Otros arbovirus incluidos en el catálogo Geeknome |
| Panel DNA Herpes y Pox | Virus ADN, herpesvirus y poxvirus |
| Panel DNA Otros | Otros virus ADN disponibles en la base de datos |
| Panel Fagos Ambientales | Bacteriófagos de contexto ambiental |
| Panel Fagos Microbiota | Bacteriófagos asociados a microbiota |
| Panel Fagos Otros | Otros bacteriófagos del catálogo Geeknome |
| Panel Plantas | Referencias genómicas de interés en plantas |
Los recursos de cada panel se publican como archivos de referencia FASTA comprimidos, con sus archivos taxonómicos e índices de apoyo cuando correspondan. La aplicación Geeknome selecciona y descarga el conjunto asociado al panel elegido. Este repositorio no es una guía de instalación del software ni requiere ejecutar comandos para utilizar los paneles desde la plataforma.
La composición de los paneles puede evolucionar con las actualizaciones de Geeknome. Para reproducibilidad, conserve el reporte generado, el nombre del panel, la fecha de análisis y la versión de las referencias cuando estén disponibles. No combine, altere ni redistribuya los paneles de Geeknome como una base de datos propia sin autorización expresa.
Acceso y uso de los paneles
Estos paneles son recursos de datos alojados para su integración con la plataforma Geeknome. El programa Geeknome selecciona el panel correspondiente durante el análisis y utiliza sus archivos de referencia, taxonomía e índices asociados.
Para utilizar el software de análisis y los paneles dentro del flujo de trabajo Geeknome, solicite o adquiera una licencia de uso en geeknome.com. La descarga, presencia o acceso técnico a los archivos de este repositorio no equivale a una autorización de uso del software ni a una licencia de los datos.
Limitaciones y uso responsable
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Soporte
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