Add files using upload-large-folder tool

pfam_gap_rates/5_3_exonuc.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "5_3_exonuc", "n_seqs": 2678, "length": 104, "gap_rates": [0.42867811799850636, 0.16878267363704258, 0.08401792382374906, 0.05003734129947722, 0.030246452576549662, 0.017923823749066467, 0.01568334578043316, 0.013816280806572068, 0.0074682598954443615, 0.005227781926811053, 0.0048543689320388345, 0.004480955937266617, 0.004107542942494399, 0.004107542942494399, 0.004107542942494399, 0.004107542942494399, 0.0037341299477221808, 0.002987303958177745, 0.0022404779686333084, 0.0022404779686333084, 0.0022404779686333084, 0.0026138909634055266, 0.0026138909634055266, 0.0014936519790888724, 0.0007468259895444362, 0.0007468259895444362, 0.0011202389843166542, 0.0003734129947722181, 0.0033607169529499626, 0.0003734129947722181, 0.0003734129947722181, 0.0003734129947722181, 0.0003734129947722181, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0003734129947722181, 0.0003734129947722181, 0.0003734129947722181, 0.0011202389843166542, 0.0011202389843166542, 0.0014936519790888724, 0.0014936519790888724, 0.0014936519790888724, 0.0014936519790888724, 0.008588498879761016, 0.006348020911127707, 0.004480955937266617, 0.909260642270351, 0.8973114264376401, 0.012696041822255415, 0.0268857356235997, 0.02389843166542196, 0.10679611650485436, 0.8607169529499626, 0.8935772964899178, 0.9118745332337566, 0.9032860343539956, 0.8737864077669902, 0.8495145631067961, 0.38237490664675133, 0.008215085884988798, 0.006348020911127707, 0.006348020911127707, 0.007094846900672144, 0.00784167289021658, 0.00784167289021658, 0.008215085884988798, 0.00784167289021658, 0.009708737864077669, 0.009708737864077669, 0.009708737864077669, 0.009335324869305451, 0.010828976848394324, 0.011202389843166542, 0.011202389843166542, 0.011202389843166542, 0.01157580283793876, 0.01194921583271098, 0.01194921583271098, 0.01194921583271098, 0.013069454817027632, 0.01344286781179985, 0.01568334578043316, 0.022404779686333084, 0.02389843166542196, 0.026138909634055265, 0.026512322628827484, 0.03472740851381628, 0.039208364451082896, 0.08849887976101568, 0.08737864077669903, 0.10306198655713218, 0.12285287528005974, 0.1430171769977595, 0.17513069454817026, 0.20238984316654218, 0.2296489917849141, 0.2826736370425691, 0.35287528005974605, 0.44100074682598955, 0.5212845407020165, 0.7830470500373413], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/ABG_transport.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "ABG_transport", "n_seqs": 465, "length": 514, "gap_rates": [0.5161290322580645, 0.26666666666666666, 0.2064516129032258, 0.1935483870967742, 0.1913978494623656, 0.18924731182795698, 0.18494623655913978, 0.18494623655913978, 0.18494623655913978, 0.18494623655913978, 0.1827956989247312, 0.17849462365591398, 0.16989247311827957, 0.16774193548387098, 0.12688172043010754, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11397849462365592, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.10967741935483871, 0.10752688172043011, 0.12903225806451613, 0.12688172043010754, 0.10752688172043011, 0.10752688172043011, 0.1053763440860215, 0.1053763440860215, 0.10752688172043011, 0.10752688172043011, 0.10752688172043011, 0.32903225806451614, 0.4172043010752688, 0.3419354838709677, 0.33978494623655914, 0.27956989247311825, 0.3204301075268817, 0.7333333333333333, 0.7655913978494624, 0.7784946236559139, 0.7419354838709677, 0.7182795698924731, 0.2903225806451613, 0.2172043010752688, 0.11182795698924732, 0.10752688172043011, 0.10752688172043011, 0.10752688172043011, 0.10752688172043011, 0.10967741935483871, 0.11182795698924732, 0.10967741935483871, 0.10967741935483871, 0.10967741935483871, 0.10967741935483871, 0.10967741935483871, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11397849462365592, 0.11397849462365592, 0.11397849462365592, 0.11397849462365592, 0.11397849462365592, 0.11397849462365592, 0.11397849462365592, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11397849462365592, 0.11397849462365592, 0.11397849462365592, 0.11397849462365592, 0.11612903225806452, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.10967741935483871, 0.10967741935483871, 0.10967741935483871, 0.11182795698924732, 0.11397849462365592, 0.11397849462365592, 0.11397849462365592, 0.11397849462365592, 0.11397849462365592, 0.11182795698924732, 0.11397849462365592, 0.11397849462365592, 0.11827956989247312, 0.12258064516129032, 0.11397849462365592, 0.11827956989247312, 0.11612903225806452, 0.11397849462365592, 0.11397849462365592, 0.11397849462365592, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11827956989247312, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11612903225806452, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12258064516129032, 0.12258064516129032, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12258064516129032, 0.12043010752688173, 0.11827956989247312, 0.12258064516129032, 0.12688172043010754, 0.9096774193548387, 0.8946236559139785, 0.12043010752688173, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.11827956989247312, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12258064516129032, 0.12043010752688173, 0.12258064516129032, 0.12043010752688173, 0.11827956989247312, 0.12473118279569892, 0.12258064516129032, 0.12473118279569892, 0.12688172043010754, 0.12043010752688173, 0.12258064516129032, 0.12258064516129032, 0.2817204301075269, 0.27741935483870966, 0.2623655913978495, 0.24086021505376345, 0.2172043010752688, 0.1935483870967742, 0.1870967741935484, 0.2129032258064516, 0.36774193548387096, 0.4172043010752688, 0.3204301075268817, 0.33763440860215055, 0.8279569892473119, 0.13333333333333333, 0.10967741935483871, 0.1032258064516129, 0.0967741935483871, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.9225806451612903, 0.09032258064516129, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.0989247311827957, 0.1032258064516129, 0.1032258064516129, 0.1010752688172043, 0.20430107526881722, 0.1010752688172043, 0.09462365591397849, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.3010752688172043, 0.12688172043010754, 0.11827956989247312, 0.10967741935483871, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.10967741935483871, 0.9268817204301075, 0.6645161290322581, 0.1032258064516129, 0.09462365591397849, 0.09462365591397849, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09462365591397849, 0.09462365591397849, 0.09462365591397849, 0.09462365591397849, 0.09462365591397849, 0.09462365591397849, 0.09462365591397849, 0.09462365591397849, 0.09247311827956989, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.08817204301075268, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09247311827956989, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09032258064516129, 0.09247311827956989, 0.0967741935483871, 0.1010752688172043, 0.1032258064516129, 0.1053763440860215, 0.1053763440860215, 0.1053763440860215, 0.10752688172043011, 0.10752688172043011, 0.10752688172043011, 0.10967741935483871, 0.10967741935483871, 0.11182795698924732, 0.11182795698924732, 0.11397849462365592, 0.11397849462365592, 0.11612903225806452, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.12043010752688173, 0.13118279569892474, 0.13118279569892474, 0.12258064516129032, 0.12258064516129032, 0.12258064516129032, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.11827956989247312, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12258064516129032, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12043010752688173, 0.12258064516129032, 0.12258064516129032, 0.12258064516129032, 0.12258064516129032, 0.12258064516129032, 0.12258064516129032, 0.12258064516129032, 0.12258064516129032, 0.12258064516129032, 0.12473118279569892, 0.12473118279569892, 0.12473118279569892, 0.12473118279569892, 0.12473118279569892, 0.12473118279569892, 0.12688172043010754, 0.12688172043010754, 0.12688172043010754, 0.12688172043010754, 0.12688172043010754, 0.12688172043010754, 0.12688172043010754, 0.12903225806451613, 0.12903225806451613, 0.12903225806451613, 0.12903225806451613, 0.12903225806451613, 0.12903225806451613, 0.12903225806451613, 0.12688172043010754, 0.12903225806451613, 0.12903225806451613, 0.12688172043010754, 0.12688172043010754, 0.12688172043010754, 0.12688172043010754, 0.12903225806451613, 0.12688172043010754, 0.12688172043010754, 0.12688172043010754, 0.12688172043010754, 0.12688172043010754, 0.12688172043010754, 0.12903225806451613, 0.12903225806451613, 0.12903225806451613, 0.12903225806451613, 0.12903225806451613, 0.12903225806451613, 0.12903225806451613, 0.12903225806451613, 0.12903225806451613, 0.12903225806451613, 0.9225806451612903, 0.13118279569892474, 0.13333333333333333, 0.13333333333333333, 0.13333333333333333, 0.13333333333333333, 0.13333333333333333, 0.17634408602150536, 0.1978494623655914, 0.210752688172043, 0.2537634408602151, 0.3419354838709677, 0.5225806451612903, 0.6795698924731183], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/ADH_N_2.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "ADH_N_2", "n_seqs": 1449, "length": 118, "gap_rates": [0.4968944099378882, 0.3105590062111801, 0.21739130434782608, 0.19806763285024154, 0.18702553485162182, 0.17805383022774326, 0.1746031746031746, 0.17391304347826086, 0.17184265010351968, 0.16494133885438234, 0.1601104209799862, 0.15113871635610765, 0.14699792960662525, 0.13595583160800553, 0.12560386473429952, 0.12146307798481712, 0.11801242236024845, 0.11594202898550725, 0.11594202898550725, 0.11525189786059352, 0.1111111111111111, 0.11042097998619738, 0.10973084886128365, 0.10628019323671498, 0.0986887508626639, 0.0904071773636991, 0.8474810213940649, 0.8750862663906143, 0.7101449275362319, 0.07453416149068323, 0.05659075224292615, 0.049689440993788817, 0.031055900621118012, 0.028985507246376812, 0.917184265010352, 0.911663216011042, 0.028295376121463076, 0.024154589371980676, 0.023464458247066944, 0.022084195997239476, 0.020703933747412008, 0.020703933747412008, 0.020703933747412008, 0.020703933747412008, 0.020703933747412008, 0.020703933747412008, 0.020703933747412008, 0.020703933747412008, 0.02139406487232574, 0.02139406487232574, 0.01725327812284334, 0.017943409247757072, 0.017943409247757072, 0.018633540372670808, 0.022084195997239476, 0.03450655624568668, 0.9440993788819876, 0.03657694962042788, 0.8778467908902692, 0.8412698412698413, 0.04071773636991028, 0.9158040027605245, 0.8992408557625949, 0.047619047619047616, 0.051759834368530024, 0.12836438923395446, 0.12077294685990338, 0.11456176673567978, 0.10144927536231885, 0.09316770186335403, 0.08350586611456176, 0.06418219461697723, 0.024154589371980676, 0.022774327122153208, 0.025534851621808144, 0.026224982746721876, 0.023464458247066944, 0.023464458247066944, 0.023464458247066944, 0.022774327122153208, 0.022774327122153208, 0.023464458247066944, 0.023464458247066944, 0.022774327122153208, 0.022774327122153208, 0.023464458247066944, 0.024154589371980676, 0.029675638371290544, 0.024844720496894408, 0.026224982746721876, 0.024844720496894408, 0.024844720496894408, 0.024844720496894408, 0.025534851621808144, 0.027605244996549344, 0.027605244996549344, 0.028295376121463076, 0.029675638371290544, 0.029675638371290544, 0.031746031746031744, 0.031055900621118012, 0.033816425120772944, 0.039337474120082816, 0.04209799861973775, 0.04209799861973775, 0.04278812974465148, 0.043478260869565216, 0.045548654244306416, 0.049689440993788817, 0.05521048999309869, 0.07660455486542443, 0.12146307798481712, 0.22705314009661837, 0.30917874396135264, 0.4051069703243616, 0.5065562456866805, 0.6307798481711525, 0.8164251207729468], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/ADH_N_assoc.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "ADH_N_assoc", "n_seqs": 625, "length": 23, "gap_rates": [0.0064, 0.0032, 0.0032, 0.0032, 0.0016, 0.0016, 0.0016, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0032, 0.0032, 0.0208, 0.024, 0.04, 0.0688, 0.3488], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/AHH.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "AHH", "n_seqs": 120, "length": 161, "gap_rates": [0.9083333333333333, 0.7416666666666667, 0.6416666666666667, 0.5833333333333334, 0.5333333333333333, 0.4666666666666667, 0.425, 0.38333333333333336, 0.2916666666666667, 0.23333333333333334, 0.19166666666666668, 0.15, 0.10833333333333334, 0.08333333333333333, 0.05, 0.05, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.03333333333333333, 0.03333333333333333, 0.03333333333333333, 0.10833333333333334, 0.1, 0.1, 0.15833333333333333, 0.2916666666666667, 0.4583333333333333, 0.5833333333333334, 0.6416666666666667, 0.6833333333333333, 0.925, 0.8916666666666667, 0.6833333333333333, 0.6166666666666667, 0.575, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.03333333333333333, 0.03333333333333333, 0.03333333333333333, 0.025, 0.03333333333333333, 0.03333333333333333, 0.95, 0.95, 0.9083333333333333, 0.025, 0.016666666666666666, 0.025, 0.016666666666666666, 0.008333333333333333, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.3, 0.725, 0.7916666666666666, 0.825, 0.8416666666666667, 0.8583333333333333, 0.875, 0.9416666666666667, 0.9416666666666667, 0.9416666666666667, 0.95, 0.95, 0.95, 0.95, 0.95, 0.95, 0.9416666666666667, 0.9416666666666667, 0.9416666666666667, 0.8833333333333333, 0.875, 0.8583333333333333, 0.8333333333333334, 0.825, 0.775, 0.7083333333333334, 0.48333333333333334, 0.45, 0.4083333333333333, 0.4, 0.39166666666666666, 0.39166666666666666, 0.39166666666666666, 0.39166666666666666, 0.39166666666666666, 0.3416666666666667, 0.3333333333333333, 0.15833333333333333, 0.08333333333333333, 0.025, 0.016666666666666666, 0.016666666666666666, 0.075, 0.95, 0.95, 0.95, 0.016666666666666666, 0.9083333333333333, 0.9333333333333333, 0.95, 0.95, 0.9166666666666666, 0.9083333333333333, 0.375, 0.016666666666666666, 0.016666666666666666, 0.016666666666666666, 0.025, 0.03333333333333333, 0.03333333333333333, 0.03333333333333333, 0.03333333333333333, 0.03333333333333333, 0.06666666666666667, 0.05, 0.05, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.08333333333333333, 0.13333333333333333, 0.15, 0.175, 0.18333333333333332, 0.225, 0.36666666666666664, 0.4166666666666667, 0.43333333333333335, 0.45, 0.475, 0.49166666666666664, 0.5333333333333333, 0.5333333333333333, 0.9333333333333333, 0.95, 0.95, 0.9083333333333333, 0.44166666666666665, 0.475, 0.5166666666666667, 0.5833333333333334, 0.6083333333333333, 0.6833333333333333, 0.75, 0.85], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/AOX.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "AOX", "n_seqs": 464, "length": 259, "gap_rates": [0.7952586206896551, 0.6810344827586207, 0.6357758620689655, 0.603448275862069, 0.5905172413793104, 0.5797413793103449, 0.5560344827586207, 0.5517241379310345, 0.5258620689655172, 0.5129310344827587, 0.4331896551724138, 0.29310344827586204, 0.28663793103448276, 0.2823275862068966, 0.27586206896551724, 0.27155172413793105, 0.26939655172413796, 0.26939655172413796, 0.2650862068965517, 0.2543103448275862, 0.25, 0.2478448275862069, 0.2478448275862069, 0.24568965517241378, 0.2413793103448276, 0.2413793103448276, 0.23275862068965517, 0.22629310344827586, 0.22413793103448276, 0.22198275862068967, 0.20905172413793102, 0.20905172413793102, 0.20043103448275862, 0.1875, 0.1788793103448276, 0.16594827586206898, 0.16163793103448276, 0.16379310344827586, 0.16379310344827586, 0.15732758620689655, 0.15948275862068967, 0.6982758620689655, 0.7327586206896551, 0.7456896551724138, 0.7586206896551724, 0.771551724137931, 0.7952586206896551, 0.8081896551724138, 0.8318965517241379, 0.9116379310344828, 0.9375, 0.8900862068965517, 0.8168103448275862, 0.7995689655172413, 0.7866379310344828, 0.7672413793103449, 0.7586206896551724, 0.7413793103448276, 0.7306034482758621, 0.6918103448275862, 0.5732758620689655, 0.5258620689655172, 0.5086206896551724, 0.5, 0.47629310344827586, 0.45905172413793105, 0.4267241379310345, 0.41163793103448276, 0.04956896551724138, 0.04741379310344827, 0.04741379310344827, 0.04525862068965517, 0.04525862068965517, 0.04741379310344827, 0.04741379310344827, 0.04310344827586207, 0.040948275862068964, 0.040948275862068964, 0.040948275862068964, 0.040948275862068964, 0.040948275862068964, 0.040948275862068964, 0.040948275862068964, 0.040948275862068964, 0.040948275862068964, 0.040948275862068964, 0.04310344827586207, 0.04525862068965517, 0.04741379310344827, 0.04525862068965517, 0.04525862068965517, 0.04525862068965517, 0.04525862068965517, 0.04310344827586207, 0.04525862068965517, 0.0603448275862069, 0.04525862068965517, 0.04525862068965517, 0.04525862068965517, 0.04525862068965517, 0.04525862068965517, 0.04741379310344827, 0.04956896551724138, 0.05172413793103448, 0.05603448275862069, 0.04741379310344827, 0.04525862068965517, 0.04525862068965517, 0.04525862068965517, 0.04310344827586207, 0.04310344827586207, 0.04525862068965517, 0.04525862068965517, 0.04525862068965517, 0.04741379310344827, 0.04525862068965517, 0.04525862068965517, 0.04525862068965517, 0.04310344827586207, 0.04310344827586207, 0.04310344827586207, 0.04310344827586207, 0.04310344827586207, 0.04310344827586207, 0.040948275862068964, 0.04310344827586207, 0.040948275862068964, 0.04310344827586207, 0.7974137931034483, 0.04525862068965517, 0.04310344827586207, 0.04525862068965517, 0.04525862068965517, 0.04525862068965517, 0.04741379310344827, 0.04741379310344827, 0.04741379310344827, 0.04741379310344827, 0.04741379310344827, 0.04956896551724138, 0.05172413793103448, 0.05172413793103448, 0.05172413793103448, 0.05387931034482758, 0.04956896551724138, 0.04956896551724138, 0.04956896551724138, 0.04956896551724138, 0.05172413793103448, 0.05172413793103448, 0.05172413793103448, 0.05387931034482758, 0.04956896551724138, 0.04741379310344827, 0.04741379310344827, 0.04956896551724138, 0.04956896551724138, 0.04741379310344827, 0.04741379310344827, 0.04525862068965517, 0.04741379310344827, 0.04741379310344827, 0.04956896551724138, 0.04741379310344827, 0.04741379310344827, 0.04741379310344827, 0.04956896551724138, 0.04956896551724138, 0.04956896551724138, 0.04956896551724138, 0.04956896551724138, 0.04956896551724138, 0.04956896551724138, 0.05172413793103448, 0.05172413793103448, 0.04956896551724138, 0.04956896551724138, 0.05172413793103448, 0.05172413793103448, 0.05172413793103448, 0.05172413793103448, 0.05172413793103448, 0.06465517241379311, 0.14870689655172414, 0.14655172413793102, 0.08405172413793104, 0.10129310344827586, 0.9181034482758621, 0.06896551724137931, 0.07112068965517242, 0.521551724137931, 0.5366379310344828, 0.5323275862068966, 0.07974137931034483, 0.9116379310344828, 0.9094827586206896, 0.06465517241379311, 0.05387931034482758, 0.05387931034482758, 0.05387931034482758, 0.05818965517241379, 0.05387931034482758, 0.05818965517241379, 0.0603448275862069, 0.0625, 0.06465517241379311, 0.06896551724137931, 0.06896551724137931, 0.07112068965517242, 0.8448275862068966, 0.07112068965517242, 0.07112068965517242, 0.0668103448275862, 0.8168103448275862, 0.8168103448275862, 0.8168103448275862, 0.8168103448275862, 0.8168103448275862, 0.8189655172413793, 0.8211206896551724, 0.8211206896551724, 0.8275862068965517, 0.9461206896551724, 0.8297413793103449, 0.8211206896551724, 0.8211206896551724, 0.8189655172413793, 0.8189655172413793, 0.8168103448275862, 0.8168103448275862, 0.8168103448275862, 0.8168103448275862, 0.8168103448275862, 0.07112068965517242, 0.06896551724137931, 0.06896551724137931, 0.06896551724137931, 0.06896551724137931, 0.06896551724137931, 0.06896551724137931, 0.06896551724137931, 0.06896551724137931, 0.06896551724137931, 0.06896551724137931, 0.06896551724137931, 0.06896551724137931, 0.07112068965517242, 0.07112068965517242, 0.07112068965517242, 0.07327586206896551, 0.07758620689655173, 0.08189655172413793, 0.09267241379310345, 0.10344827586206896, 0.11853448275862069, 0.14655172413793102, 0.18318965517241378, 0.3771551724137931, 0.5107758620689655], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/ASL_C2.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "ASL_C2", "n_seqs": 1777, "length": 78, "gap_rates": [0.2217220033764772, 0.10748452447945976, 0.029825548677546426, 0.020258863252673044, 0.019696117051209903, 0.0061902082160945416, 0.0061902082160945416, 0.005627462014631401, 0.0033764772087788407, 0.0033764772087788407, 0.0028137310073157004, 0.004501969611705121, 0.005064715813168261, 0.004501969611705121, 0.8137310073157006, 0.0028137310073157004, 0.0016882386043894203, 0.0011254924029262803, 0.0016882386043894203, 0.0016882386043894203, 0.0016882386043894203, 0.0016882386043894203, 0.0016882386043894203, 0.0011254924029262803, 0.0005627462014631402, 0.0011254924029262803, 0.0011254924029262803, 0.0011254924029262803, 0.0011254924029262803, 0.0016882386043894203, 0.0016882386043894203, 0.0028137310073157004, 0.015756893640967922, 0.018570624648283626, 0.015756893640967922, 0.013505908835115363, 0.011817670230725942, 0.014068655036578503, 0.013505908835115363, 0.014631401238041642, 0.013505908835115363, 0.011254924029262802, 0.011817670230725942, 0.015756893640967922, 0.016882386043894203, 0.016319639842431063, 0.016319639842431063, 0.016882386043894203, 0.017445132245357344, 0.029262802476083285, 0.028700056274620148, 0.025886325267304444, 0.9279684862127181, 0.9324704558244232, 0.9414743950478335, 0.9341586944288126, 0.9290939786156444, 0.9268429938097917, 0.026449071468767585, 0.025323579065841307, 0.9262802476083286, 0.023635340461451885, 0.024760832864378166, 0.9015194147439505, 0.028700056274620148, 0.026449071468767585, 0.030388294879009566, 0.028700056274620148, 0.032076533483398985, 0.033202025886325266, 0.03376477208778841, 0.03545301069217783, 0.03657850309510411, 0.03995498030388295, 0.04783342712436691, 0.06527855936972425, 0.11367473269555431, 0.47945976364659537], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/ATG13.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "ATG13", "n_seqs": 288, "length": 296, "gap_rates": [0.5763888888888888, 0.4861111111111111, 0.4270833333333333, 0.4201388888888889, 0.4201388888888889, 0.4131944444444444, 0.4027777777777778, 0.4027777777777778, 0.4027777777777778, 0.4027777777777778, 0.4027777777777778, 0.3958333333333333, 0.3958333333333333, 0.3958333333333333, 0.3958333333333333, 0.3958333333333333, 0.3958333333333333, 0.3958333333333333, 0.5590277777777778, 0.7326388888888888, 0.7673611111111112, 0.7881944444444444, 0.8055555555555556, 0.8333333333333334, 0.875, 0.8958333333333334, 0.9131944444444444, 0.90625, 0.8854166666666666, 0.8715277777777778, 0.8229166666666666, 0.7881944444444444, 0.78125, 0.7534722222222222, 0.6631944444444444, 0.5416666666666666, 0.4965277777777778, 0.5138888888888888, 0.4548611111111111, 0.4097222222222222, 0.4027777777777778, 0.3923611111111111, 0.3923611111111111, 0.3888888888888889, 0.3854166666666667, 0.3854166666666667, 0.3819444444444444, 0.3819444444444444, 0.3784722222222222, 0.3784722222222222, 0.3819444444444444, 0.3819444444444444, 0.3784722222222222, 0.3715277777777778, 0.3680555555555556, 0.3680555555555556, 0.3680555555555556, 0.3680555555555556, 0.3784722222222222, 0.3784722222222222, 0.375, 0.3680555555555556, 0.3680555555555556, 0.3680555555555556, 0.3680555555555556, 0.375, 0.375, 0.375, 0.3819444444444444, 0.375, 0.3680555555555556, 0.3680555555555556, 0.5868055555555556, 0.5833333333333334, 0.5416666666666666, 0.5694444444444444, 0.9444444444444444, 0.9097222222222222, 0.6145833333333334, 0.4513888888888889, 0.3715277777777778, 0.3680555555555556, 0.3645833333333333, 0.3645833333333333, 0.3611111111111111, 0.3611111111111111, 0.3611111111111111, 0.3611111111111111, 0.3611111111111111, 0.3645833333333333, 0.3715277777777778, 0.3715277777777778, 0.9479166666666666, 0.9479166666666666, 0.9479166666666666, 0.9479166666666666, 0.3819444444444444, 0.4097222222222222, 0.40625, 0.4305555555555556, 0.4305555555555556, 0.4652777777777778, 0.46875, 0.4722222222222222, 0.4756944444444444, 0.4652777777777778, 0.4652777777777778, 0.4652777777777778, 0.4756944444444444, 0.9409722222222222, 0.4826388888888889, 0.4756944444444444, 0.4722222222222222, 0.4583333333333333, 0.4618055555555556, 0.4548611111111111, 0.4479166666666667, 0.4548611111111111, 0.75, 0.7638888888888888, 0.7881944444444444, 0.8368055555555556, 0.8993055555555556, 0.9236111111111112, 0.8611111111111112, 0.8090277777777778, 0.7743055555555556, 0.7638888888888888, 0.7430555555555556, 0.7222222222222222, 0.7152777777777778, 0.6631944444444444, 0.6423611111111112, 0.6145833333333334, 0.5625, 0.4895833333333333, 0.4444444444444444, 0.3229166666666667, 0.2881944444444444, 0.2638888888888889, 0.19444444444444445, 0.16319444444444445, 0.125, 0.10069444444444445, 0.08680555555555555, 0.08333333333333333, 0.0798611111111111, 0.0798611111111111, 0.0798611111111111, 0.0798611111111111, 0.0798611111111111, 0.0798611111111111, 0.0798611111111111, 0.08333333333333333, 0.08333333333333333, 0.08333333333333333, 0.08333333333333333, 0.7604166666666666, 0.7986111111111112, 0.8472222222222222, 0.8680555555555556, 0.8854166666666666, 0.8923611111111112, 0.9131944444444444, 0.9444444444444444, 0.9479166666666666, 0.9201388888888888, 0.9027777777777778, 0.8854166666666666, 0.8784722222222222, 0.8611111111111112, 0.8229166666666666, 0.7708333333333334, 0.6493055555555556, 0.53125, 0.5138888888888888, 0.5104166666666666, 0.3680555555555556, 0.8854166666666666, 0.7638888888888888, 0.22569444444444445, 0.1076388888888889, 0.08333333333333333, 0.08333333333333333, 0.1076388888888889, 0.25, 0.2152777777777778, 0.06944444444444445, 0.06944444444444445, 0.06944444444444445, 0.06944444444444445, 0.06944444444444445, 0.06597222222222222, 0.06597222222222222, 0.06597222222222222, 0.06597222222222222, 0.06597222222222222, 0.06597222222222222, 0.06597222222222222, 0.06597222222222222, 0.06597222222222222, 0.06597222222222222, 0.06597222222222222, 0.0625, 0.0625, 0.0625, 0.0625, 0.0625, 0.0625, 0.0625, 0.0625, 0.0625, 0.06597222222222222, 0.06597222222222222, 0.06944444444444445, 0.06944444444444445, 0.3125, 0.2048611111111111, 0.21875, 0.22916666666666666, 0.2673611111111111, 0.2326388888888889, 0.1840277777777778, 0.2013888888888889, 0.3402777777777778, 0.3194444444444444, 0.9201388888888888, 0.9409722222222222, 0.8923611111111112, 0.08680555555555555, 0.08333333333333333, 0.0798611111111111, 0.08333333333333333, 0.0798611111111111, 0.0798611111111111, 0.0798611111111111, 0.08333333333333333, 0.09375, 0.09375, 0.09375, 0.4548611111111111, 0.4097222222222222, 0.9305555555555556, 0.2152777777777778, 0.19791666666666666, 0.1875, 0.1736111111111111, 0.2465277777777778, 0.25, 0.2569444444444444, 0.4513888888888889, 0.4375, 0.4340277777777778, 0.4652777777777778, 0.4618055555555556, 0.4270833333333333, 0.4722222222222222, 0.5347222222222222, 0.6006944444444444, 0.6006944444444444, 0.5972222222222222, 0.5729166666666666, 0.5069444444444444, 0.90625, 0.9444444444444444, 0.9270833333333334, 0.875, 0.125, 0.1111111111111111, 0.1076388888888889, 0.10416666666666667, 0.10416666666666667, 0.10416666666666667, 0.10416666666666667, 0.10416666666666667, 0.10416666666666667, 0.10416666666666667, 0.10416666666666667, 0.1076388888888889, 0.1076388888888889, 0.1076388888888889, 0.1076388888888889, 0.1076388888888889, 0.1111111111111111, 0.1111111111111111, 0.11458333333333333, 0.11805555555555555, 0.11805555555555555, 0.11805555555555555, 0.125, 0.1840277777777778, 0.23958333333333334, 0.28125, 0.4027777777777778, 0.5208333333333334, 0.5520833333333334], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/ATP-synt_DE_N.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "ATP-synt_DE_N", "n_seqs": 2428, "length": 83, "gap_rates": [0.3447281713344316, 0.1387973640856672, 0.06466227347611203, 0.05848434925864909, 0.05518945634266886, 0.051070840197693576, 0.0457166392092257, 0.04159802306425041, 0.03830313014827018, 0.03459637561779242, 0.03377265238879736, 0.03088962108731466, 0.026359143327841845, 0.025535420098846788, 0.026771004942339374, 0.01729818780889621, 0.8422570016474464, 0.012767710049423394, 0.01029654036243822, 0.007413509060955519, 0.00700164744645799, 0.00700164744645799, 0.00700164744645799, 0.00700164744645799, 0.006589785831960461, 0.006177924217462933, 0.0032948929159802307, 0.002883031301482702, 0.002883031301482702, 0.002883031301482702, 0.002883031301482702, 0.002883031301482702, 0.002471169686985173, 0.002471169686985173, 0.002883031301482702, 0.002883031301482702, 0.002883031301482702, 0.002471169686985173, 0.002471169686985173, 0.002059308072487644, 0.002059308072487644, 0.002059308072487644, 0.002471169686985173, 0.0037067545304777594, 0.004942339373970346, 0.004942339373970346, 0.0037067545304777594, 0.0037067545304777594, 0.004118616144975288, 0.004118616144975288, 0.004530477759472817, 0.34596375617792424, 0.025947281713344317, 0.009060955518945634, 0.9015650741350906, 0.014415156507413509, 0.011120263591433279, 0.01029654036243822, 0.008237232289950576, 0.009060955518945634, 0.009060955518945634, 0.01070840197693575, 0.01070840197693575, 0.011532125205930808, 0.011943986820428337, 0.012355848434925865, 0.012355848434925865, 0.012355848434925865, 0.01400329489291598, 0.015238879736408566, 0.016474464579901153, 0.9089785831960461, 0.0214168039538715, 0.025535420098846788, 0.044892915980230645, 0.06589785831960461, 0.08401976935749589, 0.09596375617792421, 0.11079077429983525, 0.14044481054365734, 0.17833607907743, 0.2598846787479407, 0.3978583196046129], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/ATPgrasp_ST.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "ATPgrasp_ST", "n_seqs": 349, "length": 313, "gap_rates": [0.7851002865329513, 0.501432664756447, 0.4297994269340974, 0.38968481375358166, 0.33810888252148996, 0.3123209169054441, 0.30659025787965616, 0.29512893982808025, 0.27507163323782235, 0.2607449856733524, 0.24641833810888253, 0.24355300859598855, 0.24068767908309455, 0.23209169054441262, 0.2148997134670487, 0.2177650429799427, 0.18051575931232092, 0.15759312320916904, 0.1489971346704871, 0.14613180515759314, 0.14040114613180515, 0.14326647564469913, 0.14040114613180515, 0.8595988538681948, 0.8624641833810889, 0.8624641833810889, 0.8595988538681948, 0.14040114613180515, 0.14040114613180515, 0.14040114613180515, 0.14040114613180515, 0.14040114613180515, 0.18911174785100288, 0.15759312320916904, 0.1489971346704871, 0.1489971346704871, 0.14613180515759314, 0.1489971346704871, 0.1489971346704871, 0.14326647564469913, 0.14326647564469913, 0.14326647564469913, 0.3008595988538682, 0.2979942693409742, 0.29512893982808025, 0.27793696275071633, 0.27793696275071633, 0.2722063037249284, 0.27507163323782235, 0.2722063037249284, 0.8624641833810889, 0.8653295128939829, 0.8681948424068768, 0.8853868194842407, 0.9312320916905444, 0.9484240687679083, 0.9025787965616046, 0.8710601719197708, 0.8681948424068768, 0.8653295128939829, 0.8567335243553008, 0.13753581661891118, 0.12893982808022922, 0.1318051575931232, 0.1346704871060172, 0.12320916905444126, 0.1174785100286533, 0.12034383954154727, 0.19197707736389685, 0.2349570200573066, 0.17765042979942694, 0.14613180515759314, 0.1346704871060172, 0.12034383954154727, 0.47564469914040114, 0.14326647564469913, 0.37249283667621774, 0.8853868194842407, 0.10315186246418338, 0.10028653295128939, 0.10028653295128939, 0.10028653295128939, 0.10028653295128939, 0.10028653295128939, 0.10028653295128939, 0.10315186246418338, 0.10601719197707736, 0.10315186246418338, 0.10315186246418338, 0.10315186246418338, 0.10315186246418338, 0.10315186246418338, 0.10315186246418338, 0.10315186246418338, 0.10315186246418338, 0.1318051575931232, 0.1174785100286533, 0.3151862464183381, 0.9455587392550143, 0.29512893982808025, 0.27793696275071633, 0.22063037249283668, 0.2148997134670487, 0.21203438395415472, 0.2808022922636103, 0.22063037249283668, 0.16905444126074498, 0.1518624641833811, 0.14040114613180515, 0.1346704871060172, 0.12034383954154727, 0.11461318051575932, 0.10601719197707736, 0.10601719197707736, 0.10315186246418338, 0.10888252148997135, 0.10601719197707736, 0.10888252148997135, 0.3638968481375358, 0.35816618911174786, 0.3638968481375358, 0.36962750716332377, 0.4584527220630373, 0.4584527220630373, 0.45558739255014324, 0.45272206303724927, 0.44412607449856734, 0.44412607449856734, 0.44412607449856734, 0.4068767908309456, 0.37822349570200575, 0.35816618911174786, 0.32951289398280803, 0.18051575931232092, 0.11174785100286533, 0.08882521489971347, 0.07736389684813753, 0.06303724928366762, 0.06017191977077364, 0.05730659025787966, 0.05730659025787966, 0.06017191977077364, 0.05730659025787966, 0.05730659025787966, 0.06017191977077364, 0.06017191977077364, 0.05730659025787966, 0.05730659025787966, 0.05730659025787966, 0.05730659025787966, 0.06017191977077364, 0.06017191977077364, 0.05730659025787966, 0.05730659025787966, 0.05730659025787966, 0.05730659025787966, 0.05730659025787966, 0.06303724928366762, 0.05730659025787966, 0.05730659025787966, 0.05730659025787966, 0.05730659025787966, 0.05157593123209169, 0.05157593123209169, 0.05157593123209169, 0.05157593123209169, 0.6045845272206304, 0.5988538681948424, 0.5931232091690545, 0.9140401146131805, 0.7621776504297995, 0.054441260744985676, 0.05157593123209169, 0.054441260744985676, 0.054441260744985676, 0.054441260744985676, 0.05730659025787966, 0.5931232091690545, 0.054441260744985676, 0.054441260744985676, 0.054441260744985676, 0.054441260744985676, 0.05730659025787966, 0.05730659025787966, 0.05730659025787966, 0.05730659025787966, 0.05730659025787966, 0.06017191977077364, 0.7048710601719198, 0.6189111747851003, 0.08595988538681948, 0.4383954154727794, 0.4355300859598854, 0.3954154727793696, 0.08595988538681948, 0.07736389684813753, 0.07449856733524356, 0.07163323782234957, 0.0830945558739255, 0.06017191977077364, 0.06017191977077364, 0.06017191977077364, 0.06017191977077364, 0.05730659025787966, 0.054441260744985676, 0.054441260744985676, 0.16332378223495703, 0.05730659025787966, 0.054441260744985676, 0.054441260744985676, 0.054441260744985676, 0.9369627507163324, 0.6189111747851003, 0.5157593123209169, 0.5100286532951289, 0.501432664756447, 0.054441260744985676, 0.054441260744985676, 0.05730659025787966, 0.06017191977077364, 0.05730659025787966, 0.37822349570200575, 0.3008595988538682, 0.0659025787965616, 0.04871060171919771, 0.045845272206303724, 0.04297994269340974, 0.045845272206303724, 0.045845272206303724, 0.04871060171919771, 0.045845272206303724, 0.05157593123209169, 0.06303724928366762, 0.045845272206303724, 0.04871060171919771, 0.03724928366762178, 0.04011461318051576, 0.03724928366762178, 0.034383954154727794, 0.045845272206303724, 0.045845272206303724, 0.03724928366762178, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.03724928366762178, 0.03724928366762178, 0.03724928366762178, 0.03724928366762178, 0.03724928366762178, 0.03724928366762178, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.5702005730659025, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.03724928366762178, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.40114613180515757, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.034383954154727794, 0.045845272206303724, 0.05157593123209169, 0.9455587392550143, 0.054441260744985676, 0.05730659025787966, 0.07163323782234957, 0.10028653295128939, 0.12034383954154727, 0.6762177650429799, 0.12893982808022922, 0.13753581661891118, 0.9283667621776505, 0.9340974212034384, 0.9312320916905444, 0.9283667621776505, 0.18911174785100288, 0.20916905444126074, 0.23782234957020057, 0.2664756446991404, 0.27793696275071633, 0.28939828080229224, 0.3008595988538682, 0.3151862464183381, 0.335243553008596, 0.3553008595988539, 0.36962750716332377, 0.38968481375358166, 0.44412607449856734, 0.4899713467048711, 0.9340974212034384], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/ATPgrasp_TupA.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "ATPgrasp_TupA", "n_seqs": 188, "length": 255, "gap_rates": [0.44680851063829785, 0.3670212765957447, 0.3351063829787234, 0.3351063829787234, 0.324468085106383, 0.31382978723404253, 0.30851063829787234, 0.30319148936170215, 0.30319148936170215, 0.9361702127659575, 0.9308510638297872, 0.2925531914893617, 0.2925531914893617, 0.2765957446808511, 0.25, 0.25, 0.23404255319148937, 0.22872340425531915, 0.21808510638297873, 0.20212765957446807, 0.20212765957446807, 0.20212765957446807, 0.19680851063829788, 0.19680851063829788, 0.19680851063829788, 0.19680851063829788, 0.19680851063829788, 0.19680851063829788, 0.19680851063829788, 0.19680851063829788, 0.19680851063829788, 0.2074468085106383, 0.19680851063829788, 0.2127659574468085, 0.31382978723404253, 0.26595744680851063, 0.26595744680851063, 0.19680851063829788, 0.18617021276595744, 0.18617021276595744, 0.18617021276595744, 0.18617021276595744, 0.18617021276595744, 0.17553191489361702, 0.1702127659574468, 0.16489361702127658, 0.1702127659574468, 0.1702127659574468, 0.2127659574468085, 0.2074468085106383, 0.1702127659574468, 0.15425531914893617, 0.15425531914893617, 0.15425531914893617, 0.15425531914893617, 0.14893617021276595, 0.14361702127659576, 0.13829787234042554, 0.13829787234042554, 0.13297872340425532, 0.1276595744680851, 0.1276595744680851, 0.1276595744680851, 0.1276595744680851, 0.1276595744680851, 0.1276595744680851, 0.1276595744680851, 0.13297872340425532, 0.13829787234042554, 0.13297872340425532, 0.13297872340425532, 0.1276595744680851, 0.1276595744680851, 0.13297872340425532, 0.14361702127659576, 0.13829787234042554, 0.14361702127659576, 0.15425531914893617, 0.13829787234042554, 0.14361702127659576, 0.13297872340425532, 0.13297872340425532, 0.14361702127659576, 0.13297872340425532, 0.13297872340425532, 0.13297872340425532, 0.12234042553191489, 0.8829787234042553, 0.8936170212765957, 0.8936170212765957, 0.8882978723404256, 0.8723404255319149, 0.11702127659574468, 0.12234042553191489, 0.11702127659574468, 0.11170212765957446, 0.10106382978723404, 0.16489361702127658, 0.12234042553191489, 0.11702127659574468, 0.11702127659574468, 0.9042553191489362, 0.8457446808510638, 0.10638297872340426, 0.10638297872340426, 0.10638297872340426, 0.10638297872340426, 0.11702127659574468, 0.11170212765957446, 0.11170212765957446, 0.11170212765957446, 0.10638297872340426, 0.10106382978723404, 0.10106382978723404, 0.10106382978723404, 0.09574468085106383, 0.09574468085106383, 0.09574468085106383, 0.09574468085106383, 0.09574468085106383, 0.09574468085106383, 0.09574468085106383, 0.10106382978723404, 0.10106382978723404, 0.10638297872340426, 0.10638297872340426, 0.11170212765957446, 0.12234042553191489, 0.12234042553191489, 0.10638297872340426, 0.11170212765957446, 0.11170212765957446, 0.3351063829787234, 0.21808510638297873, 0.19680851063829788, 0.2925531914893617, 0.06914893617021277, 0.06382978723404255, 0.05319148936170213, 0.05319148936170213, 0.05319148936170213, 0.05319148936170213, 0.05319148936170213, 0.06914893617021277, 0.047872340425531915, 0.15425531914893617, 0.05851063829787234, 0.05851063829787234, 0.05319148936170213, 0.05319148936170213, 0.05319148936170213, 0.06382978723404255, 0.07446808510638298, 0.07446808510638298, 0.05851063829787234, 0.05319148936170213, 0.047872340425531915, 0.047872340425531915, 0.925531914893617, 0.047872340425531915, 0.0425531914893617, 0.047872340425531915, 0.0425531914893617, 0.03723404255319149, 0.9468085106382979, 0.03723404255319149, 0.03723404255319149, 0.03723404255319149, 0.03723404255319149, 0.031914893617021274, 0.031914893617021274, 0.031914893617021274, 0.031914893617021274, 0.031914893617021274, 0.031914893617021274, 0.031914893617021274, 0.8563829787234043, 0.2127659574468085, 0.06914893617021277, 0.047872340425531915, 0.05319148936170213, 0.4521276595744681, 0.1702127659574468, 0.15425531914893617, 0.07446808510638298, 0.06382978723404255, 0.047872340425531915, 0.047872340425531915, 0.05851063829787234, 0.0425531914893617, 0.0425531914893617, 0.031914893617021274, 0.031914893617021274, 0.031914893617021274, 0.03723404255319149, 0.03723404255319149, 0.031914893617021274, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.031914893617021274, 0.8936170212765957, 0.8670212765957447, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.03723404255319149, 0.031914893617021274, 0.031914893617021274, 0.031914893617021274, 0.031914893617021274, 0.03723404255319149, 0.03723404255319149, 0.03723404255319149, 0.03723404255319149, 0.031914893617021274, 0.031914893617021274, 0.03723404255319149, 0.0425531914893617, 0.0425531914893617, 0.0425531914893617, 0.0425531914893617, 0.0425531914893617, 0.047872340425531915, 0.1595744680851064, 0.1702127659574468, 0.09042553191489362, 0.0851063829787234, 0.09574468085106383, 0.10638297872340426, 0.11702127659574468, 0.11702127659574468, 0.1276595744680851, 0.13297872340425532, 0.13297872340425532, 0.14893617021276595, 0.14893617021276595, 0.16489361702127658, 0.17553191489361702, 0.2553191489361702, 0.42021276595744683, 0.8829787234042553], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/AXH.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "AXH", "n_seqs": 120, "length": 147, "gap_rates": [0.125, 0.10833333333333334, 0.09166666666666666, 0.09166666666666666, 0.09166666666666666, 0.075, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.075, 0.85, 0.85, 0.8333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.8166666666666667, 0.8166666666666667, 0.8166666666666667, 0.8166666666666667, 0.85, 0.925, 0.825, 0.8166666666666667, 0.8166666666666667, 0.8166666666666667, 0.8166666666666667, 0.041666666666666664, 0.05, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.9416666666666667, 0.058333333333333334, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.05, 0.05, 0.05, 0.05, 0.26666666666666666, 0.31666666666666665, 0.3, 0.275, 0.275, 0.6, 0.575, 0.95, 0.95, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.05, 0.05, 0.05, 0.041666666666666664, 0.041666666666666664, 0.05, 0.9166666666666666, 0.9166666666666666, 0.9166666666666666, 0.9166666666666666, 0.925, 0.925, 0.95, 0.95, 0.925, 0.925, 0.9166666666666666, 0.9166666666666666, 0.9166666666666666, 0.7333333333333333, 0.058333333333333334, 0.05, 0.058333333333333334, 0.08333333333333333, 0.075, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.06666666666666667, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.06666666666666667, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.058333333333333334, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.075, 0.075, 0.075, 0.075, 0.075, 0.075, 0.06666666666666667, 0.075, 0.06666666666666667, 0.075, 0.075, 0.075, 0.075, 0.075, 0.075, 0.1, 0.125, 0.375, 0.7333333333333333], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/Abhydrolase_9_N.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "Abhydrolase_9_N", "n_seqs": 154, "length": 232, "gap_rates": [0.22727272727272727, 0.1038961038961039, 0.07792207792207792, 0.07792207792207792, 0.07792207792207792, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.06493506493506493, 0.06493506493506493, 0.06493506493506493, 0.06493506493506493, 0.06493506493506493, 0.06493506493506493, 0.06493506493506493, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.06493506493506493, 0.06493506493506493, 0.06493506493506493, 0.06493506493506493, 0.06493506493506493, 0.06493506493506493, 0.06493506493506493, 0.07792207792207792, 0.5454545454545454, 0.6753246753246753, 0.7077922077922078, 0.8896103896103896, 0.9025974025974026, 0.9155844155844156, 0.922077922077922, 0.9415584415584416, 0.948051948051948, 0.948051948051948, 0.948051948051948, 0.948051948051948, 0.948051948051948, 0.9415584415584416, 0.9415584415584416, 0.922077922077922, 0.9155844155844156, 0.9025974025974026, 0.8831168831168831, 0.6883116883116883, 0.6753246753246753, 0.17532467532467533, 0.14935064935064934, 0.13636363636363635, 0.11688311688311688, 0.11038961038961038, 0.1038961038961039, 0.08441558441558442, 0.08441558441558442, 0.08441558441558442, 0.07792207792207792, 0.07142857142857142, 0.07142857142857142, 0.06493506493506493, 0.06493506493506493, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.03896103896103896, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.03896103896103896, 0.03896103896103896, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.03896103896103896, 0.03896103896103896, 0.03896103896103896, 0.03896103896103896, 0.03896103896103896, 0.03896103896103896, 0.03896103896103896, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.032467532467532464, 0.948051948051948, 0.09740259740259741, 0.09740259740259741, 0.09090909090909091, 0.08441558441558442, 0.08441558441558442, 0.09740259740259741, 0.8831168831168831, 0.8571428571428571, 0.09740259740259741, 0.09740259740259741, 0.09740259740259741, 0.08441558441558442, 0.09740259740259741, 0.11038961038961038, 0.09740259740259741, 0.07142857142857142, 0.05194805194805195, 0.03896103896103896, 0.03896103896103896, 0.03896103896103896, 0.05194805194805195, 0.06493506493506493, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.06493506493506493, 0.05844155844155844, 0.05194805194805195, 0.05844155844155844, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.06493506493506493, 0.05844155844155844, 0.06493506493506493, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.06493506493506493, 0.06493506493506493, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05194805194805195, 0.05844155844155844, 0.05844155844155844, 0.07792207792207792, 0.12987012987012986, 0.17532467532467533, 0.33116883116883117], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/AceK.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "AceK", "n_seqs": 165, "length": 582, "gap_rates": [0.21212121212121213, 0.09090909090909091, 0.09090909090909091, 0.09090909090909091, 0.07878787878787878, 0.07272727272727272, 0.07272727272727272, 0.07272727272727272, 0.07272727272727272, 0.07272727272727272, 0.07272727272727272, 0.07272727272727272, 0.07272727272727272, 0.07272727272727272, 0.06666666666666667, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.07272727272727272, 0.06666666666666667, 0.07272727272727272, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.07272727272727272, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.07272727272727272, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.07272727272727272, 0.07272727272727272, 0.07878787878787878, 0.07878787878787878, 0.07878787878787878, 0.07272727272727272, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.07272727272727272, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.07272727272727272, 0.09090909090909091, 0.09090909090909091, 0.08484848484848485, 0.7575757575757576, 0.8121212121212121, 0.806060606060606, 0.6606060606060606, 0.07272727272727272, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.3939393939393939, 0.9333333333333333, 0.08484848484848485, 0.07878787878787878, 0.07272727272727272, 0.07272727272727272, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.07272727272727272, 0.07272727272727272, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.3878787878787879, 0.1696969696969697, 0.16363636363636364, 0.9333333333333333, 0.8606060606060606, 0.09090909090909091, 0.07878787878787878, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.24242424242424243, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06666666666666667, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.05454545454545454, 0.09090909090909091, 0.06060606060606061, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.9090909090909091, 0.9090909090909091, 0.9151515151515152, 0.9151515151515152, 0.9090909090909091, 0.9030303030303031, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.8363636363636363, 0.8363636363636363, 0.9212121212121213, 0.9212121212121213, 0.9212121212121213, 0.9212121212121213, 0.9212121212121213, 0.8363636363636363, 0.8121212121212121, 0.048484848484848485, 0.05454545454545454, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.048484848484848485, 0.05454545454545454, 0.05454545454545454, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.08484848484848485, 0.10909090909090909, 0.10909090909090909, 0.12121212121212122, 0.11515151515151516, 0.07878787878787878, 0.08484848484848485, 0.09090909090909091, 0.09696969696969697, 0.08484848484848485, 0.07878787878787878, 0.07272727272727272, 0.07272727272727272, 0.07272727272727272, 0.07272727272727272, 0.07272727272727272, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06666666666666667, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06060606060606061, 0.06666666666666667, 0.19393939393939394], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/Aconitase_C.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "Aconitase_C", "n_seqs": 4489, "length": 136, "gap_rates": [0.7937179772777901, 0.671864557807975, 0.40409890844286034, 0.3640008910670528, 0.3546446870126977, 0.3488527511695255, 0.3412786812207619, 0.3350412118511918, 0.3328135442192025, 0.3296948095344175, 0.3270216083760303, 0.32212073958565385, 0.3190020049008688, 0.31521496992648695, 0.31075963466250833, 0.3058587658721319, 0.3014034306081533, 0.29828469592336826, 0.29494319447538425, 0.29249276008019603, 0.29137892626420137, 0.29071062597460456, 0.29026509244820675, 0.2891512586322121, 0.2884829583426153, 0.2884829583426153, 0.2884829583426153, 0.2878146580530185, 0.2873691245266206, 0.2873691245266206, 0.2871463577634217, 0.2873691245266206, 0.28692359100022274, 0.2867008242370238, 0.28647805747382493, 0.2867008242370238, 0.28603252394742706, 0.28603252394742706, 0.2844731566050345, 0.2824682557362442, 0.28157718868344844, 0.2811316551570506, 0.28090888839385164, 0.28024058810425484, 0.318333704611272, 0.28335932278903986, 0.28335932278903986, 0.29382936065938964, 0.3205613722432613, 0.33058587658721317, 0.334372911561595, 0.3392737803519715, 0.35130318556471374, 0.46535976832256626, 0.5223880597014925, 0.48540877701047, 0.46602806861216306, 0.35687235464468703, 0.2960570282913789, 0.27600801960347515, 0.906883492982847, 0.9128981955892181, 0.9233682334595679, 0.9171307640899977, 0.9106705279572288, 0.9044330585876588, 0.24303853865003341, 0.2319002004900869, 0.21742036088215638, 0.2067275562486077, 0.20115838716863443, 0.19247048340387615, 0.1842281131655157, 0.17375807529516596, 0.16573847182000445, 0.141456894631321, 0.4401871240810871, 0.4125640454444197, 0.125417687680998, 0.08398306972599688, 0.06838939630207173, 0.06549342838048564, 0.043662285586990424, 0.0340833147694364, 0.04076631766540432, 0.028736912452662064, 0.39051013588772554, 0.020049008687903765, 0.016930274003118733, 0.014257072844731567, 0.008019603475161506, 0.007351303185564714, 0.006905769659166852, 0.006905769659166852, 0.006905769659166852, 0.007128536422365783, 0.006683002895967922, 0.007574069948763644, 0.006905769659166852, 0.007128536422365783, 0.007128536422365783, 0.007128536422365783, 0.006905769659166852, 0.006683002895967922, 0.006683002895967922, 0.007574069948763644, 0.008465137001559367, 0.008687903764758299, 0.008687903764758299, 0.00913343729115616, 0.008465137001559367, 0.008687903764758299, 0.008910670527957229, 0.008910670527957229, 0.00957897081755402, 0.010024504343951883, 0.010470037870349743, 0.010692804633548674, 0.010915571396747606, 0.011138338159946536, 0.010915571396747606, 0.010692804633548674, 0.011361104923145467, 0.011583871686344397, 0.011583871686344397, 0.01225217197594119, 0.012920472265537981, 0.013366005791935844, 0.019826241924704835, 0.07217643127645355, 0.09044330585876587, 0.10893294720427713, 0.12586322120739585, 0.1697482735575852, 0.23680106928046335, 0.488750278458454], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/AdoMet_Synthase.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "AdoMet_Synthase", "n_seqs": 122, "length": 425, "gap_rates": [0.4344262295081967, 0.319672131147541, 0.2459016393442623, 0.22950819672131148, 0.22131147540983606, 0.22131147540983606, 0.22131147540983606, 0.20491803278688525, 0.18032786885245902, 0.18032786885245902, 0.1721311475409836, 0.13934426229508196, 0.13114754098360656, 0.10655737704918032, 0.10655737704918032, 0.09836065573770492, 0.08196721311475409, 0.06557377049180328, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.05737704918032787, 0.04918032786885246, 0.8032786885245902, 0.8032786885245902, 0.8032786885245902, 0.8032786885245902, 0.07377049180327869, 0.06557377049180328, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.06557377049180328, 0.06557377049180328, 0.06557377049180328, 0.08196721311475409, 0.07377049180327869, 0.10655737704918032, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.8934426229508197, 0.8934426229508197, 0.8934426229508197, 0.8934426229508197, 0.9016393442622951, 0.9016393442622951, 0.9016393442622951, 0.9098360655737705, 0.9098360655737705, 0.9098360655737705, 0.9098360655737705, 0.9016393442622951, 0.9016393442622951, 0.9016393442622951, 0.8934426229508197, 0.8934426229508197, 0.8934426229508197, 0.8934426229508197, 0.04918032786885246, 0.05737704918032787, 0.04918032786885246, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.20491803278688525, 0.22131147540983606, 0.2459016393442623, 0.9016393442622951, 0.8114754098360656, 0.4344262295081967, 0.21311475409836064, 0.10655737704918032, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.08196721311475409, 0.3770491803278688, 0.11475409836065574, 0.09836065573770492, 0.09836065573770492, 0.09016393442622951, 0.08196721311475409, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.05737704918032787, 0.06557377049180328, 0.9344262295081968, 0.07377049180327869, 0.07377049180327869, 0.07377049180327869, 0.11475409836065574, 0.5983606557377049, 0.08196721311475409, 0.04918032786885246, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.07377049180327869, 0.07377049180327869, 0.040983606557377046, 0.7131147540983607, 0.9426229508196722, 0.7131147540983607, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.03278688524590164, 0.03278688524590164, 0.03278688524590164, 0.03278688524590164, 0.03278688524590164, 0.03278688524590164, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.040983606557377046, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.04918032786885246, 0.09836065573770492, 0.06557377049180328, 0.06557377049180328, 0.06557377049180328, 0.9098360655737705, 0.1721311475409836, 0.13934426229508196, 0.07377049180327869, 0.08196721311475409, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.06557377049180328, 0.07377049180327869, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.05737704918032787, 0.14754098360655737, 0.13114754098360656, 0.16393442622950818, 0.14754098360655737, 0.13114754098360656, 0.16393442622950818, 0.13114754098360656, 0.12295081967213115, 0.14754098360655737, 0.13114754098360656, 0.1721311475409836, 0.13934426229508196, 0.07377049180327869, 0.06557377049180328, 0.06557377049180328, 0.06557377049180328, 0.06557377049180328, 0.06557377049180328, 0.06557377049180328, 0.06557377049180328, 0.06557377049180328, 0.06557377049180328, 0.06557377049180328, 0.06557377049180328, 0.06557377049180328, 0.06557377049180328, 0.07377049180327869, 0.08196721311475409, 0.08196721311475409, 0.08196721311475409, 0.08196721311475409, 0.08196721311475409, 0.08196721311475409, 0.09016393442622951, 0.09016393442622951, 0.1885245901639344, 0.4426229508196721], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/Afi1.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "Afi1", "n_seqs": 149, "length": 162, "gap_rates": [0.20134228187919462, 0.087248322147651, 0.06711409395973154, 0.06040268456375839, 0.053691275167785234, 0.04697986577181208, 0.04697986577181208, 0.04697986577181208, 0.04697986577181208, 0.053691275167785234, 0.04697986577181208, 0.04697986577181208, 0.04697986577181208, 0.040268456375838924, 0.026845637583892617, 0.026845637583892617, 0.026845637583892617, 0.026845637583892617, 0.026845637583892617, 0.026845637583892617, 0.026845637583892617, 0.026845637583892617, 0.06711409395973154, 0.053691275167785234, 0.03355704697986577, 0.912751677852349, 0.9261744966442953, 0.9395973154362416, 0.9463087248322147, 0.9328859060402684, 0.9261744966442953, 0.8523489932885906, 0.020134228187919462, 0.020134228187919462, 0.020134228187919462, 0.020134228187919462, 0.8657718120805369, 0.8187919463087249, 0.020134228187919462, 0.013422818791946308, 0.013422818791946308, 0.013422818791946308, 0.013422818791946308, 0.013422818791946308, 0.013422818791946308, 0.013422818791946308, 0.013422818791946308, 0.013422818791946308, 0.006711409395973154, 0.006711409395973154, 0.006711409395973154, 0.006711409395973154, 0.013422818791946308, 0.013422818791946308, 0.013422818791946308, 0.013422818791946308, 0.013422818791946308, 0.020134228187919462, 0.026845637583892617, 0.026845637583892617, 0.03355704697986577, 0.04697986577181208, 0.087248322147651, 0.19463087248322147, 0.20134228187919462, 0.22818791946308725, 0.2550335570469799, 0.26174496644295303, 0.2550335570469799, 0.26174496644295303, 0.28859060402684567, 0.3288590604026846, 0.38926174496644295, 0.3825503355704698, 0.37583892617449666, 0.3959731543624161, 0.4161073825503356, 0.42953020134228187, 0.42953020134228187, 0.44966442953020136, 0.4563758389261745, 0.4697986577181208, 0.4899328859060403, 0.5033557046979866, 0.4966442953020134, 0.47651006711409394, 0.48322147651006714, 0.5033557046979866, 0.46308724832214765, 0.7516778523489933, 0.7583892617449665, 0.7919463087248322, 0.825503355704698, 0.8859060402684564, 0.9060402684563759, 0.9328859060402684, 0.9395973154362416, 0.9463087248322147, 0.9395973154362416, 0.9395973154362416, 0.9194630872483222, 0.8993288590604027, 0.8657718120805369, 0.8053691275167785, 0.7583892617449665, 0.7583892617449665, 0.7449664429530202, 0.5234899328859061, 0.5637583892617449, 0.5369127516778524, 0.5369127516778524, 0.5100671140939598, 0.4966442953020134, 0.4966442953020134, 0.48322147651006714, 0.47651006711409394, 0.4697986577181208, 0.46308724832214765, 0.46308724832214765, 0.4966442953020134, 0.47651006711409394, 0.4697986577181208, 0.4697986577181208, 0.47651006711409394, 0.47651006711409394, 0.4966442953020134, 0.5369127516778524, 0.5570469798657718, 0.8859060402684564, 0.9463087248322147, 0.7986577181208053, 0.6040268456375839, 0.5302013422818792, 0.5302013422818792, 0.5234899328859061, 0.4899328859060403, 0.5503355704697986, 0.5234899328859061, 0.5033557046979866, 0.7785234899328859, 0.48322147651006714, 0.48322147651006714, 0.48322147651006714, 0.4899328859060403, 0.4899328859060403, 0.4966442953020134, 0.4899328859060403, 0.4899328859060403, 0.48322147651006714, 0.48322147651006714, 0.48322147651006714, 0.48322147651006714, 0.48322147651006714, 0.4899328859060403, 0.4966442953020134, 0.4966442953020134, 0.4966442953020134, 0.4966442953020134, 0.5033557046979866, 0.5033557046979866, 0.5302013422818792, 0.6711409395973155], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/Aha1_N.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "Aha1_N", "n_seqs": 484, "length": 162, "gap_rates": [0.18181818181818182, 0.11363636363636363, 0.08264462809917356, 0.07851239669421488, 0.07231404958677685, 0.05785123966942149, 0.05785123966942149, 0.05785123966942149, 0.05165289256198347, 0.049586776859504134, 0.049586776859504134, 0.047520661157024795, 0.047520661157024795, 0.045454545454545456, 0.045454545454545456, 0.04132231404958678, 0.04132231404958678, 0.07851239669421488, 0.06611570247933884, 0.05578512396694215, 0.05371900826446281, 0.05165289256198347, 0.047520661157024795, 0.07231404958677685, 0.7830578512396694, 0.05785123966942149, 0.05785123966942149, 0.05785123966942149, 0.7789256198347108, 0.9008264462809917, 0.9235537190082644, 0.9442148760330579, 0.9462809917355371, 0.9442148760330579, 0.9318181818181818, 0.9070247933884298, 0.8822314049586777, 0.7541322314049587, 0.0371900826446281, 0.03512396694214876, 0.03512396694214876, 0.03305785123966942, 0.030991735537190084, 0.049586776859504134, 0.047520661157024795, 0.030991735537190084, 0.026859504132231406, 0.026859504132231406, 0.028925619834710745, 0.028925619834710745, 0.024793388429752067, 0.028925619834710745, 0.026859504132231406, 0.028925619834710745, 0.026859504132231406, 0.026859504132231406, 0.026859504132231406, 0.028925619834710745, 0.026859504132231406, 0.026859504132231406, 0.026859504132231406, 0.026859504132231406, 0.026859504132231406, 0.026859504132231406, 0.026859504132231406, 0.026859504132231406, 0.026859504132231406, 0.024793388429752067, 0.024793388429752067, 0.024793388429752067, 0.022727272727272728, 0.022727272727272728, 0.7066115702479339, 0.8512396694214877, 0.9256198347107438, 0.9359504132231405, 0.9483471074380165, 0.9421487603305785, 0.9297520661157025, 0.9173553719008265, 0.8264462809917356, 0.6921487603305785, 0.36363636363636365, 0.8512396694214877, 0.18801652892561985, 0.16322314049586778, 0.09090909090909091, 0.07644628099173553, 0.05991735537190083, 0.05371900826446281, 0.03925619834710744, 0.030991735537190084, 0.01652892561983471, 0.01652892561983471, 0.01652892561983471, 0.01652892561983471, 0.01652892561983471, 0.01652892561983471, 0.01859504132231405, 0.01859504132231405, 0.024793388429752067, 0.022727272727272728, 0.02066115702479339, 0.03925619834710744, 0.030991735537190084, 0.03512396694214876, 0.8429752066115702, 0.06818181818181818, 0.09297520661157024, 0.07024793388429752, 0.08677685950413223, 0.9276859504132231, 0.9194214876033058, 0.05165289256198347, 0.04338842975206612, 0.05991735537190083, 0.09917355371900827, 0.09297520661157024, 0.07024793388429752, 0.06198347107438017, 0.05991735537190083, 0.06198347107438017, 0.07644628099173553, 0.9028925619834711, 0.8760330578512396, 0.1859504132231405, 0.7128099173553719, 0.5971074380165289, 0.13016528925619836, 0.12190082644628099, 0.10537190082644628, 0.1012396694214876, 0.1384297520661157, 0.08264462809917356, 0.07851239669421488, 0.07644628099173553, 0.07644628099173553, 0.07644628099173553, 0.07644628099173553, 0.11363636363636363, 0.08884297520661157, 0.1322314049586777, 0.09090909090909091, 0.08884297520661157, 0.09090909090909091, 0.08884297520661157, 0.09090909090909091, 0.09090909090909091, 0.09297520661157024, 0.09504132231404959, 0.09710743801652892, 0.09917355371900827, 0.09917355371900827, 0.10537190082644628, 0.1115702479338843, 0.11570247933884298, 0.12603305785123967, 0.1384297520661157, 0.20867768595041322, 0.378099173553719, 0.512396694214876, 0.5991735537190083], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/Alpha_adaptin_C.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "Alpha_adaptin_C", "n_seqs": 301, "length": 123, "gap_rates": [0.11627906976744186, 0.11295681063122924, 0.10299003322259136, 0.08305647840531562, 0.059800664451827246, 0.05647840531561462, 0.053156146179401995, 0.03986710963455149, 0.03986710963455149, 0.03322259136212625, 0.03322259136212625, 0.03322259136212625, 0.03322259136212625, 0.03322259136212625, 0.03322259136212625, 0.03322259136212625, 0.03322259136212625, 0.03322259136212625, 0.029900332225913623, 0.046511627906976744, 0.07308970099667775, 0.03986710963455149, 0.029900332225913623, 0.046511627906976744, 0.029900332225913623, 0.023255813953488372, 0.023255813953488372, 0.023255813953488372, 0.023255813953488372, 0.023255813953488372, 0.023255813953488372, 0.5647840531561462, 0.5681063122923588, 0.8637873754152824, 0.9003322259136213, 0.7541528239202658, 0.6146179401993356, 0.06312292358803986, 0.036544850498338874, 0.036544850498338874, 0.023255813953488372, 0.016611295681063124, 0.016611295681063124, 0.016611295681063124, 0.009966777408637873, 0.016611295681063124, 0.019933554817275746, 0.023255813953488372, 0.026578073089700997, 0.016611295681063124, 0.016611295681063124, 0.9368770764119602, 0.016611295681063124, 0.019933554817275746, 0.019933554817275746, 0.013289036544850499, 0.009966777408637873, 0.009966777408637873, 0.009966777408637873, 0.036544850498338874, 0.023255813953488372, 0.013289036544850499, 0.006644518272425249, 0.006644518272425249, 0.019933554817275746, 0.006644518272425249, 0.009966777408637873, 0.009966777408637873, 0.006644518272425249, 0.006644518272425249, 0.006644518272425249, 0.006644518272425249, 0.006644518272425249, 0.006644518272425249, 0.006644518272425249, 0.006644518272425249, 0.006644518272425249, 0.006644518272425249, 0.009966777408637873, 0.49169435215946844, 0.036544850498338874, 0.023255813953488372, 0.023255813953488372, 0.9302325581395349, 0.9435215946843853, 0.946843853820598, 0.9302325581395349, 0.9235880398671097, 0.023255813953488372, 0.019933554817275746, 0.019933554817275746, 0.019933554817275746, 0.023255813953488372, 0.023255813953488372, 0.023255813953488372, 0.023255813953488372, 0.023255813953488372, 0.023255813953488372, 0.046511627906976744, 0.9003322259136213, 0.046511627906976744, 0.04318936877076412, 0.029900332225913623, 0.03322259136212625, 0.03322259136212625, 0.03986710963455149, 0.03986710963455149, 0.03986710963455149, 0.03986710963455149, 0.04983388704318937, 0.05647840531561462, 0.05647840531561462, 0.05647840531561462, 0.06312292358803986, 0.06312292358803986, 0.06312292358803986, 0.0664451827242525, 0.06976744186046512, 0.07973421926910298, 0.09634551495016612, 0.14285714285714285, 0.3388704318936877, 0.7641196013289037], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/Amidohydro_2.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "Amidohydro_2", "n_seqs": 3995, "length": 396, "gap_rates": [0.5602002503128911, 0.4755944931163955, 0.47284105131414267, 0.4708385481852315, 0.46983729662077595, 0.4688360450563204, 0.5216520650813516, 0.5549436795994994, 0.572215269086358, 0.6768460575719649, 0.6770963704630788, 0.7091364205256571, 0.6823529411764706, 0.7246558197747184, 0.7639549436795995, 0.7904881101376721, 0.8045056320400501, 0.8242803504380476, 0.8377972465581978, 0.8433041301627033, 0.8590738423028786, 0.8678347934918649, 0.8738423028785982, 0.8783479349186483, 0.8888610763454318, 0.9078848560700876, 0.9161451814768461, 0.9454317897371715, 0.9244055068836045, 0.9126408010012516, 0.9028785982478098, 0.8851063829787233, 0.8753441802252816, 0.872090112640801, 0.8625782227784731, 0.8495619524405507, 0.8397997496871089, 0.8330413016270338, 0.8137672090112641, 0.7942428035043805, 0.7769712140175219, 0.7444305381727159, 0.7186483103879849, 0.6678347934918648, 0.6615769712140175, 0.6403003754693367, 0.6180225281602002, 0.588485607008761, 0.5569461827284106, 0.5409261576971214, 0.530162703379224, 0.4963704630788486, 0.45982478097622026, 0.4260325406758448, 0.4037546933667084, 0.38773466833541925, 0.462828535669587, 0.4225281602002503, 0.41401752190237795, 0.4010012515644556, 0.38272841051314144, 0.37872340425531914, 0.3672090112640801, 0.3612015018773467, 0.3584480600750939, 0.34668335419274093, 0.34518147684605754, 0.3429286608260325, 0.34267834793491864, 0.34017521902377973, 0.434793491864831, 0.4, 0.3847309136420526, 0.37521902377972466, 0.3637046307884856, 0.32690863579474344, 0.32215269086357945, 0.31614518147684606, 0.31314142678347934, 0.30988735919899874, 0.3113892365456821, 0.4100125156445557, 0.39474342928660827, 0.4222778473091364, 0.37596996245306635, 0.30563204005006256, 0.29086357947434294, 0.28085106382978725, 0.27384230287859823, 0.26783479349186484, 0.2648310387984981, 0.2618272841051314, 0.2565707133917397, 0.251063829787234, 0.24505632040050063, 0.2425531914893617, 0.3246558197747184, 0.29637046307884857, 0.25982478097622025, 0.22077596996245308, 0.2095118898623279, 0.21051314142678348, 0.19899874843554444, 0.1902377972465582, 0.18823529411764706, 0.1834793491864831, 0.1799749687108886, 0.17772215269086358, 0.17446808510638298, 0.17446808510638298, 0.16996245306633292, 0.1669586983729662, 0.16520650813516896, 0.16245306633291615, 0.16270337922403003, 0.1607008760951189, 0.16345431789737172, 0.17822277847309137, 0.1644555694618273, 0.15819774718397997, 0.1566958698372966, 0.15269086357947434, 0.30062578222778474, 0.24355444305381727, 0.22252816020025032, 0.14317897371714644, 0.14843554443053816, 0.13591989987484354, 0.12640801001251564, 0.12015018773466833, 0.11714643304130162, 0.11589486858573217, 0.11389236545682102, 0.11439299123904881, 0.11239048811013767, 0.11088861076345431, 0.3444305381727159, 0.1336670838548185, 0.12565707133917398, 0.1048811013767209, 0.10112640801001252, 0.12065081351689612, 0.1148936170212766, 0.09762202753441802, 0.10062578222778473, 0.9409261576971214, 0.10012515644555695, 0.09937421777221526, 0.09561952440550689, 0.0951188986232791, 0.09486858573216521, 0.09261576971214018, 0.1016270337922403, 0.0951188986232791, 0.08961201501877347, 0.0853566958698373, 0.08485607008760951, 0.08660826032540676, 0.10387984981226533, 0.09887359198998748, 0.0951188986232791, 0.08610763454317898, 0.7827284105131415, 0.8237797246558197, 0.9076345431789737, 0.9376720901126409, 0.9296620775969963, 0.8888610763454318, 0.7947434292866082, 0.7276595744680852, 0.5043804755944932, 0.09386733416770963, 0.0625782227784731, 0.054568210262828536, 0.052065081351689614, 0.05006257822277847, 0.04981226533166458, 0.05006257822277847, 0.050312891113892366, 0.05281602002503129, 0.045306633291614516, 0.04105131414267835, 0.03379224030037547, 0.03329161451814768, 0.033041301627033795, 0.03379224030037547, 0.033541927409261575, 0.4841051314142678, 0.4675844806007509, 0.5927409261576971, 0.5797246558197747, 0.6150187734668335, 0.6475594493116396, 0.6763454317897372, 0.68360450563204, 0.6981226533166458, 0.7331664580725907, 0.8207759699624531, 0.8598247809762203, 0.9018773466833542, 0.9216520650813517, 0.9446808510638298, 0.9113892365456822, 0.881351689612015, 0.8340425531914893, 0.7994993742177722, 0.713892365456821, 0.690863579474343, 0.6788485607008761, 0.6538172715894869, 0.6438047559449311, 0.6040050062578223, 0.5747183979974969, 0.5586983729662077, 0.5424280350438048, 0.49036295369211513, 0.37622027534418023, 0.3602002503128911, 0.3526908635794743, 0.3461827284105131, 0.3126408010012516, 0.30337922403003753, 0.2748435544430538, 0.07459324155193993, 0.08886107634543179, 0.07209011264080101, 0.05231539424280351, 0.04806007509386733, 0.036045056320400504, 0.03053817271589487, 0.030037546933667083, 0.0295369211514393, 0.029286608260325406, 0.02828535669586984, 0.02778473091364205, 0.028035043804755945, 0.028035043804755945, 0.027284105131414268, 0.029286608260325406, 0.03954943679599499, 0.09036295369211514, 0.04430538172715895, 0.02653316645807259, 0.0230287859824781, 0.023529411764705882, 0.023779724655819776, 0.023529411764705882, 0.021777221526908634, 0.021526908635794744, 0.027284105131414268, 0.024780976220275343, 0.02553191489361702, 0.5904881101376721, 0.6160200250312892, 0.6620775969962454, 0.814017521902378, 0.844305381727159, 0.8775969962453066, 0.9299123904881101, 0.9486858573216521, 0.9419274092615769, 0.902127659574468, 0.8533166458072591, 0.8347934918648311, 0.7276595744680852, 0.6460575719649562, 0.6027534418022528, 0.5739674593241552, 0.5066332916145182, 0.4653316645807259, 0.21827284105131414, 0.13341677096370463, 0.1304130162703379, 0.07909887359198998, 0.05657071339173968, 0.05381727158948686, 0.05181476846057572, 0.052565707133917394, 0.08260325406758448, 0.06533166458072591, 0.061827284105131414, 0.05156445556946183, 0.05406758448060075, 0.17521902377972465, 0.08936170212765958, 0.07108886107634543, 0.11514392991239049, 0.10663329161451815, 0.10413016270337923, 0.1341677096370463, 0.13241551939924906, 0.3634543178973717, 0.4460575719649562, 0.44655819774718397, 0.4052565707133917, 0.6578222778473092, 0.6926157697121402, 0.7316645807259073, 0.7872340425531915, 0.8403003754693367, 0.895369211514393, 0.9479349186483104, 0.9384230287859825, 0.8705882352941177, 0.8220275344180226, 0.7564455569461828, 0.7111389236545682, 0.6745932415519399, 0.590738423028786, 0.5063829787234042, 0.2981226533166458, 0.2806007509386733, 0.24680851063829787, 0.14968710888610764, 0.1304130162703379, 0.11589486858573217, 0.09486858573216521, 0.0690863579474343, 0.06132665832290363, 0.056320400500625784, 0.05381727158948686, 0.04806007509386733, 0.9214017521902378, 0.04730913642052566, 0.05006257822277847, 0.05156445556946183, 0.05306633291614518, 0.05181476846057572, 0.05181476846057572, 0.05356695869837297, 0.053316645807259075, 0.12365456821026283, 0.06758448060075094, 0.04981226533166458, 0.05056320400500626, 0.05006257822277847, 0.050312891113892366, 0.050312891113892366, 0.050312891113892366, 0.05156445556946183, 0.052065081351689614, 0.05607008760951189, 0.06357947434292865, 0.06408010012515644, 0.06808510638297872, 0.07209011264080101, 0.07559449311639549, 0.10988735919899875, 0.09586983729662078, 0.0916145181476846, 0.9481852315394242, 0.09637046307884856, 0.10012515644555695, 0.10187734668335419, 0.10312891113892365, 0.10438047559449312, 0.12090112640801001, 0.11514392991239049, 0.13541927409261578, 0.1612015018773467, 0.41076345431789735, 0.41151439299123904, 0.42703379224030036, 0.6177722152690863, 0.8222778473091364, 0.8520650813516896, 0.9026282853566959, 0.9276595744680851, 0.9409261576971214, 0.9474342928660826, 0.9381727158948686, 0.91639549436796, 0.8770963704630789, 0.8440550688360451, 0.7762202753441803, 0.5724655819774719, 0.3899874843554443, 0.12290362953692115, 0.12240300375469337, 0.12165206508135169, 0.12215269086357948, 0.12265331664580725, 0.12390488110137672, 0.1251564455569462, 0.12565707133917398, 0.12891113892365458, 0.12991239048811012, 0.13216520650813518, 0.1381727158948686, 0.1669586983729662, 0.1709637046307885, 0.17622027534418022, 0.183729662077597, 0.20775969962453067, 0.3101376720901126, 0.5406758448060075], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/Annexin.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "Annexin", "n_seqs": 4114, "length": 67, "gap_rates": [0.6531356344190569, 0.2897423432182791, 0.18206125425376762, 0.15192027224112786, 0.8492950899368011, 0.11910549343704424, 0.10865337870685464, 0.10379192999513855, 0.09917355371900827, 0.0962566844919786, 0.08629071463296062, 0.07826932425862908, 0.0743801652892562, 0.07802625182304326, 0.06635877491492465, 0.0583373845405931, 0.04691298006806028, 0.037919299951385516, 0.032814778804083615, 0.027953330092367525, 0.02333495381623724, 0.021876519202722412, 0.02066115702479339, 0.019931939718035974, 0.01968886728245017, 0.01871657754010695, 0.020175012153621778, 0.01871657754010695, 0.017258142926592123, 0.015799708313077296, 0.01434127369956247, 0.019445794846864366, 0.01166747690811862, 0.010452114730189596, 0.009236752552260573, 0.007778317938745746, 0.008021390374331552, 0.009236752552260573, 0.009236752552260573, 0.009236752552260573, 0.009236752552260573, 0.0106951871657754, 0.01434127369956247, 0.015070491006319884, 0.017744287797763734, 0.019931939718035974, 0.0213903743315508, 0.02333495381623724, 0.02600875060768109, 0.02868254739912494, 0.031113271754982984, 0.03330092367525522, 0.040106951871657755, 0.052989790957705396, 0.06003889158969373, 0.07097715119105494, 0.07632474477394263, 0.08701993193971803, 0.09261059795819154, 0.09795819154107924, 0.10233349538162373, 0.10865337870685464, 0.11594555177442878, 0.12615459406903257, 0.1762275157997083, 0.2605736509479825, 0.40617403986387945], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/Apc13p.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "Apc13p", "n_seqs": 136, "length": 89, "gap_rates": [0.3014705882352941, 0.25, 0.2426470588235294, 0.2426470588235294, 0.5294117647058824, 0.5220588235294118, 0.5073529411764706, 0.22794117647058823, 0.22794117647058823, 0.19117647058823528, 0.16911764705882354, 0.16176470588235295, 0.13970588235294118, 0.1323529411764706, 0.08823529411764706, 0.10294117647058823, 0.08823529411764706, 0.08823529411764706, 0.08823529411764706, 0.08823529411764706, 0.08823529411764706, 0.08823529411764706, 0.08823529411764706, 0.08823529411764706, 0.9485294117647058, 0.0661764705882353, 0.014705882352941176, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.5661764705882353, 0.022058823529411766, 0.022058823529411766, 0.029411764705882353, 0.39705882352941174, 0.375, 0.3088235294117647, 0.29411764705882354, 0.3235294117647059, 0.3235294117647059, 0.3235294117647059, 0.33088235294117646, 0.33088235294117646, 0.34558823529411764, 0.33088235294117646, 0.33088235294117646, 0.051470588235294115, 0.07352941176470588, 0.0661764705882353, 0.0661764705882353, 0.07352941176470588, 0.08088235294117647, 0.08823529411764706, 0.11029411764705882, 0.10294117647058823, 0.10294117647058823, 0.08088235294117647, 0.08088235294117647, 0.11029411764705882, 0.08823529411764706, 0.08823529411764706, 0.08823529411764706, 0.08823529411764706, 0.08823529411764706, 0.09558823529411764, 0.09558823529411764, 0.09558823529411764, 0.09558823529411764, 0.10294117647058823, 0.11764705882352941, 0.11764705882352941, 0.11764705882352941, 0.125, 0.1323529411764706, 0.17647058823529413, 0.21323529411764705, 0.22794117647058823, 0.27205882352941174, 0.375, 0.4632352941176471, 0.5073529411764706, 0.7352941176470589, 0.8455882352941176], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/ArAE_1_C.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "ArAE_1_C", "n_seqs": 188, "length": 166, "gap_rates": [0.5, 0.23404255319148937, 0.0797872340425532, 0.0425531914893617, 0.0425531914893617, 0.031914893617021274, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.026595744680851064, 0.02127659574468085, 0.02127659574468085, 0.02127659574468085, 0.02127659574468085, 0.02127659574468085, 0.02127659574468085, 0.02127659574468085, 0.02127659574468085, 0.02127659574468085, 0.015957446808510637, 0.015957446808510637, 0.015957446808510637, 0.015957446808510637, 0.015957446808510637, 0.015957446808510637, 0.015957446808510637, 0.015957446808510637, 0.015957446808510637, 0.015957446808510637, 0.09574468085106383, 0.031914893617021274, 0.026595744680851064, 0.02127659574468085, 0.02127659574468085, 0.02127659574468085, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.015957446808510637, 0.4734042553191489, 0.015957446808510637, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.031914893617021274, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.015957446808510637, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.010638297872340425, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.005319148936170213, 0.0, 0.0, 0.0, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.010638297872340425, 0.015957446808510637, 0.02127659574468085, 0.06382978723404255, 0.09574468085106383, 0.4308510638297872], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/Arginosuc_synth.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "Arginosuc_synth", "n_seqs": 2044, "length": 413, "gap_rates": [0.24315068493150685, 0.07681017612524461, 0.07191780821917808, 0.06555772994129158, 0.06457925636007827, 0.06457925636007827, 0.06262230919765166, 0.060665362035225046, 0.060665362035225046, 0.0611545988258317, 0.0611545988258317, 0.060665362035225046, 0.06017612524461839, 0.06017612524461839, 0.05870841487279843, 0.057729941291585124, 0.057729941291585124, 0.057729941291585124, 0.057729941291585124, 0.05724070450097847, 0.05724070450097847, 0.34833659491193736, 0.9055772994129159, 0.06262230919765166, 0.05675146771037182, 0.05626223091976516, 0.05626223091976516, 0.055283757338551856, 0.05430528375733855, 0.053816046966731895, 0.05185909980430528, 0.05185909980430528, 0.05185909980430528, 0.05136986301369863, 0.050880626223091974, 0.9285714285714286, 0.050880626223091974, 0.651174168297456, 0.055283757338551856, 0.9207436399217221, 0.05039138943248532, 0.049902152641878667, 0.04941291585127201, 0.049902152641878667, 0.04892367906066536, 0.04892367906066536, 0.04892367906066536, 0.049902152641878667, 0.048434442270058706, 0.048434442270058706, 0.048434442270058706, 0.048434442270058706, 0.04892367906066536, 0.04941291585127201, 0.07729941291585127, 0.9486301369863014, 0.9432485322896281, 0.04892367906066536, 0.04941291585127201, 0.04941291585127201, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.049902152641878667, 0.049902152641878667, 0.04892367906066536, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.0474559686888454, 0.06506849315068493, 0.048434442270058706, 0.05283757338551859, 0.0684931506849315, 0.1159491193737769, 0.05283757338551859, 0.05136986301369863, 0.049902152641878667, 0.04941291585127201, 0.050880626223091974, 0.050880626223091974, 0.050880626223091974, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.050880626223091974, 0.09001956947162426, 0.052348336594911934, 0.052348336594911934, 0.052348336594911934, 0.052348336594911934, 0.05332681017612524, 0.05675146771037182, 0.05870841487279843, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.049902152641878667, 0.05039138943248532, 0.04892367906066536, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.050880626223091974, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.049902152641878667, 0.05039138943248532, 0.049902152641878667, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.050880626223091974, 0.052348336594911934, 0.05430528375733855, 0.053816046966731895, 0.05577299412915851, 0.0547945205479452, 0.0547945205479452, 0.05430528375733855, 0.0547945205479452, 0.05430528375733855, 0.053816046966731895, 0.05430528375733855, 0.0547945205479452, 0.0547945205479452, 0.0547945205479452, 0.05430528375733855, 0.05430528375733855, 0.05430528375733855, 0.05332681017612524, 0.053816046966731895, 0.05332681017612524, 0.07974559686888454, 0.0675146771037182, 0.05430528375733855, 0.05430528375733855, 0.05332681017612524, 0.05283757338551859, 0.05283757338551859, 0.05283757338551859, 0.052348336594911934, 0.05283757338551859, 0.05332681017612524, 0.05332681017612524, 0.05332681017612524, 0.053816046966731895, 0.050880626223091974, 0.7108610567514677, 0.7416829745596869, 0.7700587084148728, 0.7113502935420744, 0.3312133072407045, 0.049902152641878667, 0.049902152641878667, 0.049902152641878667, 0.049902152641878667, 0.049902152641878667, 0.05039138943248532, 0.05136986301369863, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.04941291585127201, 0.04941291585127201, 0.049902152641878667, 0.05039138943248532, 0.05136986301369863, 0.050880626223091974, 0.052348336594911934, 0.07925636007827788, 0.913894324853229, 0.9065557729941291, 0.06555772994129158, 0.060665362035225046, 0.10665362035225048, 0.055283757338551856, 0.05185909980430528, 0.05185909980430528, 0.05185909980430528, 0.052348336594911934, 0.050880626223091974, 0.050880626223091974, 0.050880626223091974, 0.050880626223091974, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.050880626223091974, 0.05185909980430528, 0.05185909980430528, 0.05283757338551859, 0.05332681017612524, 0.05283757338551859, 0.060665362035225046, 0.052348336594911934, 0.05136986301369863, 0.05283757338551859, 0.05185909980430528, 0.9476516634050881, 0.9466731898238747, 0.05283757338551859, 0.05283757338551859, 0.05332681017612524, 0.9334637964774951, 0.05283757338551859, 0.052348336594911934, 0.052348336594911934, 0.05283757338551859, 0.053816046966731895, 0.060665362035225046, 0.07974559686888454, 0.08463796477495107, 0.07925636007827788, 0.07583170254403131, 0.07338551859099804, 0.07338551859099804, 0.0812133072407045, 0.08463796477495107, 0.1761252446183953, 0.08610567514677103, 0.06360078277886497, 0.05039138943248532, 0.04892367906066536, 0.04892367906066536, 0.04892367906066536, 0.04941291585127201, 0.049902152641878667, 0.049902152641878667, 0.04941291585127201, 0.04941291585127201, 0.04941291585127201, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.9001956947162426, 0.9339530332681018, 0.910958904109589, 0.898238747553816, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.05039138943248532, 0.04892367906066536, 0.04794520547945205, 0.0474559686888454, 0.8297455968688845, 0.0474559686888454, 0.0474559686888454, 0.0474559686888454, 0.0474559686888454, 0.0474559686888454, 0.046966731898238745, 0.046966731898238745, 0.046966731898238745, 0.0474559686888454, 0.04794520547945205, 0.04892367906066536, 0.04892367906066536, 0.048434442270058706, 0.04941291585127201, 0.04892367906066536, 0.048434442270058706, 0.04892367906066536, 0.04892367906066536, 0.04892367906066536, 0.050880626223091974, 0.04941291585127201, 0.05039138943248532, 0.05136986301369863, 0.05283757338551859, 0.053816046966731895, 0.053816046966731895, 0.05283757338551859, 0.05185909980430528, 0.050880626223091974, 0.05039138943248532, 0.049902152641878667, 0.04892367906066536, 0.048434442270058706, 0.048434442270058706, 0.04892367906066536, 0.04941291585127201, 0.04794520547945205, 0.048434442270058706, 0.048434442270058706, 0.048434442270058706, 0.0474559686888454, 0.0474559686888454, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.0474559686888454, 0.0474559686888454, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.046966731898238745, 0.046966731898238745, 0.046966731898238745, 0.046966731898238745, 0.048434442270058706, 0.04794520547945205, 0.0474559686888454, 0.0474559686888454, 0.0474559686888454, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.04794520547945205, 0.0474559686888454, 0.046966731898238745, 0.046966731898238745, 0.04647749510763209, 0.04647749510763209, 0.046966731898238745, 0.046966731898238745, 0.0474559686888454, 0.046966731898238745, 0.046966731898238745, 0.046966731898238745, 0.046966731898238745, 0.046966731898238745, 0.0474559686888454, 0.0474559686888454, 0.0474559686888454, 0.0474559686888454, 0.04892367906066536, 0.0474559686888454, 0.0474559686888454, 0.0474559686888454, 0.9246575342465754, 0.0474559686888454, 0.046966731898238745, 0.046966731898238745, 0.046966731898238745, 0.046966731898238745, 0.04647749510763209, 0.04647749510763209, 0.04647749510763209, 0.04647749510763209, 0.04647749510763209, 0.04794520547945205, 0.048434442270058706, 0.04892367906066536, 0.049902152641878667, 0.049902152641878667, 0.049902152641878667, 0.050880626223091974, 0.9119373776908023, 0.05039138943248532, 0.05185909980430528, 0.05332681017612524, 0.055283757338551856, 0.05626223091976516, 0.05626223091976516, 0.05626223091976516, 0.05675146771037182, 0.05675146771037182, 0.05724070450097847, 0.05724070450097847, 0.9031311154598826, 0.05675146771037182, 0.062133072407045006, 0.06017612524461839, 0.0611545988258317, 0.059197651663405085, 0.05870841487279843, 0.06017612524461839, 0.0611545988258317, 0.060665362035225046, 0.0611545988258317, 0.09246575342465753, 0.9173189823874756, 0.07045009784735812, 0.87720156555773, 0.07436399217221135, 0.9461839530332681, 0.0821917808219178, 0.09735812133072407, 0.09735812133072407, 0.09882583170254403, 0.09931506849315068, 0.09980430528375733, 0.1012720156555773, 0.10176125244618395, 0.10176125244618395, 0.1159491193737769, 0.11986301369863013, 0.1232876712328767, 0.1286692759295499, 0.1379647749510763, 0.14579256360078277, 0.15019569471624267, 0.16291585127201566, 0.17270058708414873, 0.20743639921722112, 0.2607632093933464, 0.6164383561643836], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/ArgoN.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "ArgoN", "n_seqs": 1025, "length": 194, "gap_rates": [0.48, 0.1824390243902439, 0.10926829268292683, 0.08487804878048781, 0.07707317073170732, 0.07707317073170732, 0.07317073170731707, 0.07317073170731707, 0.07317073170731707, 0.07317073170731707, 0.07317073170731707, 0.0721951219512195, 0.0702439024390244, 0.8126829268292682, 0.9346341463414635, 0.5375609756097561, 0.06926829268292684, 0.07902439024390244, 0.06341463414634146, 0.06731707317073171, 0.06341463414634146, 0.055609756097560976, 0.055609756097560976, 0.055609756097560976, 0.054634146341463415, 0.054634146341463415, 0.9473170731707317, 0.9482926829268292, 0.9473170731707317, 0.050731707317073174, 0.12, 0.07512195121951219, 0.16585365853658537, 0.68, 0.8253658536585365, 0.9434146341463414, 0.9160975609756098, 0.7707317073170732, 0.34536585365853656, 0.10048780487804879, 0.06439024390243903, 0.7970731707317074, 0.9307317073170732, 0.8741463414634146, 0.6731707317073171, 0.13463414634146342, 0.3775609756097561, 0.1404878048780488, 0.10926829268292683, 0.07902439024390244, 0.03414634146341464, 0.8419512195121951, 0.8878048780487805, 0.937560975609756, 0.9336585365853659, 0.8526829268292683, 0.7951219512195122, 0.03121951219512195, 0.026341463414634145, 0.025365853658536587, 0.025365853658536587, 0.023414634146341463, 0.0224390243902439, 0.0224390243902439, 0.03121951219512195, 0.9336585365853659, 0.06926829268292684, 0.19317073170731708, 0.944390243902439, 0.16585365853658537, 0.33658536585365856, 0.1151219512195122, 0.06829268292682927, 0.04780487804878049, 0.03804878048780488, 0.054634146341463415, 0.8595121951219512, 0.03024390243902439, 0.08, 0.033170731707317075, 0.013658536585365854, 0.00878048780487805, 0.00878048780487805, 0.005853658536585366, 0.005853658536585366, 0.005853658536585366, 0.00975609756097561, 0.013658536585365854, 0.005853658536585366, 0.004878048780487805, 0.005853658536585366, 0.005853658536585366, 0.005853658536585366, 0.005853658536585366, 0.004878048780487805, 0.16878048780487806, 0.24390243902439024, 0.6965853658536585, 0.9131707317073171, 0.7492682926829268, 0.3053658536585366, 0.18634146341463415, 0.1551219512195122, 0.1404878048780488, 0.1629268292682927, 0.15804878048780488, 0.15902439024390244, 0.12682926829268293, 0.12975609756097561, 0.48878048780487804, 0.054634146341463415, 0.686829268292683, 0.7453658536585366, 0.7921951219512195, 0.8380487804878048, 0.8634146341463415, 0.8770731707317073, 0.8975609756097561, 0.9160975609756098, 0.9404878048780487, 0.9102439024390244, 0.8839024390243903, 0.8692682926829268, 0.855609756097561, 0.8146341463414634, 0.7629268292682927, 0.7141463414634146, 0.6439024390243903, 0.18829268292682927, 0.6019512195121951, 0.6273170731707317, 0.5365853658536586, 0.5736585365853658, 0.46439024390243905, 0.4009756097560976, 0.3619512195121951, 0.3307317073170732, 0.1551219512195122, 0.1775609756097561, 0.17170731707317075, 0.09365853658536585, 0.07804878048780488, 0.1648780487804878, 0.13365853658536586, 0.03121951219512195, 0.03024390243902439, 0.03024390243902439, 0.03024390243902439, 0.03219512195121951, 0.03121951219512195, 0.03219512195121951, 0.03414634146341464, 0.03414634146341464, 0.8565853658536585, 0.03414634146341464, 0.17560975609756097, 0.050731707317073174, 0.04097560975609756, 0.04682926829268293, 0.04878048780487805, 0.050731707317073174, 0.05365853658536585, 0.05658536585365854, 0.05853658536585366, 0.06146341463414634, 0.06439024390243903, 0.10146341463414635, 0.09463414634146342, 0.11219512195121951, 0.09951219512195122, 0.6760975609756098, 0.9141463414634147, 0.9492682926829268, 0.7521951219512195, 0.12, 0.09853658536585366, 0.09951219512195122, 0.0975609756097561, 0.09658536585365854, 0.07707317073170732, 0.8975609756097561, 0.935609756097561, 0.9482926829268292, 0.8985365853658537, 0.895609756097561, 0.07804878048780488, 0.07804878048780488, 0.07902439024390244, 0.08, 0.08292682926829269, 0.08585365853658537, 0.09365853658536585, 0.1073170731707317, 0.2448780487804878], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/ArsB.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "ArsB", "n_seqs": 443, "length": 423, "gap_rates": [0.7313769751693002, 0.5146726862302483, 0.46275395033860045, 0.4198645598194131, 0.4018058690744921, 0.3972911963882618, 0.38826185101580135, 0.3792325056433409, 0.37697516930022573, 0.37697516930022573, 0.3724604966139955, 0.3656884875846501, 0.3656884875846501, 0.36343115124153497, 0.35891647855530473, 0.35665914221218964, 0.35665914221218964, 0.35891647855530473, 0.35891647855530473, 0.35665914221218964, 0.3544018058690745, 0.3476297968397291, 0.3431151241534989, 0.33182844243792325, 0.3227990970654628, 0.32054176072234764, 0.3182844243792325, 0.3160270880361174, 0.309255079006772, 0.3115124153498871, 0.2979683972911964, 0.29345372460496616, 0.28442437923250563, 0.28216704288939054, 0.27765237020316025, 0.27539503386004516, 0.27313769751693, 0.2708803611738149, 0.2708803611738149, 0.26636568848758463, 0.26636568848758463, 0.26636568848758463, 0.26636568848758463, 0.26410835214446954, 0.26410835214446954, 0.2618510158013544, 0.26410835214446954, 0.25733634311512416, 0.2505643340857788, 0.255079006772009, 0.2505643340857788, 0.23927765237020315, 0.2325056433408578, 0.21896162528216703, 0.18058690744920994, 0.16252821670428894, 0.14221218961625282, 0.1309255079006772, 0.12641083521444696, 0.12415349887133183, 0.12415349887133183, 0.12866817155756208, 0.12866817155756208, 0.1309255079006772, 0.12866817155756208, 0.12866817155756208, 0.12415349887133183, 0.12415349887133183, 0.12415349887133183, 0.12189616252821671, 0.12189616252821671, 0.12189616252821671, 0.12189616252821671, 0.12189616252821671, 0.12189616252821671, 0.12189616252821671, 0.12189616252821671, 0.12189616252821671, 0.12189616252821671, 0.12415349887133183, 0.11512415349887133, 0.11512415349887133, 0.11738148984198646, 0.11963882618510158, 0.12189616252821671, 0.11963882618510158, 0.12641083521444696, 0.12189616252821671, 0.11738148984198646, 0.11512415349887133, 0.11738148984198646, 0.11060948081264109, 0.11060948081264109, 0.11060948081264109, 0.11060948081264109, 0.11060948081264109, 0.11060948081264109, 0.11060948081264109, 0.10609480812641084, 0.10609480812641084, 0.10609480812641084, 0.10609480812641084, 0.10609480812641084, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.10609480812641084, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.10609480812641084, 0.11738148984198646, 0.11738148984198646, 0.11963882618510158, 0.16027088036117382, 0.1489841986455982, 0.15575620767494355, 0.14672686230248308, 0.2234762979683973, 0.28442437923250563, 0.3115124153498871, 0.24379232505643342, 0.16930022573363432, 0.11512415349887133, 0.10609480812641084, 0.11060948081264109, 0.11060948081264109, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.1038374717832957, 0.10609480812641084, 0.10609480812641084, 0.10609480812641084, 0.10609480812641084, 0.10835214446952596, 0.10835214446952596, 0.11286681715575621, 0.11286681715575621, 0.11286681715575621, 0.10835214446952596, 0.10835214446952596, 0.10835214446952596, 0.10835214446952596, 0.10835214446952596, 0.10835214446952596, 0.10835214446952596, 0.10835214446952596, 0.10835214446952596, 0.10835214446952596, 0.10835214446952596, 0.10835214446952596, 0.1038374717832957, 0.10835214446952596, 0.10609480812641084, 0.10609480812641084, 0.1038374717832957, 0.11738148984198646, 0.11963882618510158, 0.12641083521444696, 0.12641083521444696, 0.11286681715575621, 0.11512415349887133, 0.10609480812641084, 0.10835214446952596, 0.10158013544018059, 0.09706546275395034, 0.09480812641083522, 0.09480812641083522, 0.09480812641083522, 0.09706546275395034, 0.09480812641083522, 0.1038374717832957, 0.12866817155756208, 0.1399548532731377, 0.1580135440180587, 0.16027088036117382, 0.15575620767494355, 0.17381489841986456, 0.17607223476297967, 0.20090293453724606, 0.20316027088036118, 0.20993227990970656, 0.21670428893905191, 0.2076749435665914, 0.20090293453724606, 0.1986455981941309, 0.21218961625282168, 0.2144469525959368, 0.23476297968397292, 0.24153498871331827, 0.20993227990970656, 0.1873589164785553, 0.18058690744920994, 0.18058690744920994, 0.18284424379232506, 0.18284424379232506, 0.18510158013544017, 0.19187358916478556, 0.1963882618510158, 0.2054176072234763, 0.19187358916478556, 0.1873589164785553, 0.19187358916478556, 0.18510158013544017, 0.17832957110609482, 0.18284424379232506, 0.18058690744920994, 0.17607223476297967, 0.17607223476297967, 0.17607223476297967, 0.17381489841986456, 0.18058690744920994, 0.19413092550790068, 0.19187358916478556, 0.19187358916478556, 0.17832957110609482, 0.17607223476297967, 0.17607223476297967, 0.17381489841986456, 0.18510158013544017, 0.18510158013544017, 0.18961625282167044, 0.19187358916478556, 0.18284424379232506, 0.19187358916478556, 0.18961625282167044, 0.1873589164785553, 0.1873589164785553, 0.18284424379232506, 0.18961625282167044, 0.20090293453724606, 0.1986455981941309, 0.20316027088036118, 0.2076749435665914, 0.2076749435665914, 0.2054176072234763, 0.2054176072234763, 0.2076749435665914, 0.2076749435665914, 0.2076749435665914, 0.22799097065462753, 0.26636568848758463, 0.2686230248306998, 0.24830699774266365, 0.21218961625282168, 0.2076749435665914, 0.20316027088036118, 0.19187358916478556, 0.17832957110609482, 0.16930022573363432, 0.16252821670428894, 0.16252821670428894, 0.16478555304740405, 0.16252821670428894, 0.16027088036117382, 0.1580135440180587, 0.16027088036117382, 0.1580135440180587, 0.16027088036117382, 0.1580135440180587, 0.15575620767494355, 0.15575620767494355, 0.1580135440180587, 0.1580135440180587, 0.1580135440180587, 0.1580135440180587, 0.15575620767494355, 0.1580135440180587, 0.1580135440180587, 0.15575620767494355, 0.1580135440180587, 0.15575620767494355, 0.15575620767494355, 0.15575620767494355, 0.15575620767494355, 0.15575620767494355, 0.15575620767494355, 0.15575620767494355, 0.15575620767494355, 0.16027088036117382, 0.1670428893905192, 0.17832957110609482, 0.20316027088036118, 0.2144469525959368, 0.2325056433408578, 0.22799097065462753, 0.2076749435665914, 0.20090293453724606, 0.20316027088036118, 0.19413092550790068, 0.18510158013544017, 0.2076749435665914, 0.18961625282167044, 0.18284424379232506, 0.17607223476297967, 0.17155756207674944, 0.16478555304740405, 0.16930022573363432, 0.16027088036117382, 0.16027088036117382, 0.1580135440180587, 0.17155756207674944, 0.16930022573363432, 0.1670428893905192, 0.15349887133182843, 0.15349887133182843, 0.15124153498871332, 0.15349887133182843, 0.15349887133182843, 0.15349887133182843, 0.15349887133182843, 0.15349887133182843, 0.15349887133182843, 0.15575620767494355, 0.18961625282167044, 0.21896162528216703, 0.1986455981941309, 0.18510158013544017, 0.17155756207674944, 0.16930022573363432, 0.17832957110609482, 0.1963882618510158, 0.2076749435665914, 0.2325056433408578, 0.24830699774266365, 0.2708803611738149, 0.26410835214446954, 0.291196388261851, 0.3047404063205418, 0.28442437923250563, 0.27313769751693, 0.2528216704288939, 0.23024830699774265, 0.2076749435665914, 0.1963882618510158, 0.17155756207674944, 0.16930022573363432, 0.15349887133182843, 0.15349887133182843, 0.15124153498871332, 0.15124153498871332, 0.15124153498871332, 0.15124153498871332, 0.15124153498871332, 0.15124153498871332, 0.15124153498871332, 0.15124153498871332, 0.15124153498871332, 0.1489841986455982, 0.1489841986455982, 0.1489841986455982, 0.1489841986455982, 0.15124153498871332, 0.15124153498871332, 0.15349887133182843, 0.15124153498871332, 0.15124153498871332, 0.15124153498871332, 0.15124153498871332, 0.15124153498871332, 0.15349887133182843, 0.15349887133182843, 0.15349887133182843, 0.15349887133182843, 0.15349887133182843, 0.1580135440180587, 0.16027088036117382, 0.16027088036117382, 0.16027088036117382, 0.16027088036117382, 0.16252821670428894, 0.16027088036117382, 0.16252821670428894, 0.1670428893905192, 0.17381489841986456, 0.17607223476297967, 0.18058690744920994, 0.18284424379232506, 0.1873589164785553, 0.22121896162528218, 0.20993227990970656, 0.20316027088036118, 0.2144469525959368, 0.20993227990970656, 0.21670428893905191, 0.21896162528216703, 0.2234762979683973, 0.23702031602708803, 0.255079006772009, 0.2708803611738149, 0.28442437923250563, 0.30699774266365687, 0.32505643340857787, 0.3860045146726862, 0.4492099322799097, 0.5711060948081265, 0.6681715575620768], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/Atg8.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "Atg8", "n_seqs": 745, "length": 106, "gap_rates": [0.3516778523489933, 0.13557046979865772, 0.13288590604026845, 0.1221476510067114, 0.11946308724832215, 0.11543624161073826, 0.11140939597315436, 0.11006711409395974, 0.10335570469798658, 0.10067114093959731, 0.09798657718120805, 0.09261744966442953, 0.08322147651006712, 0.08187919463087248, 0.08187919463087248, 0.07919463087248323, 0.07516778523489932, 0.06577181208053691, 0.053691275167785234, 0.05503355704697987, 0.053691275167785234, 0.05100671140939597, 0.05100671140939597, 0.052348993288590606, 0.04832214765100671, 0.049664429530201344, 0.04832214765100671, 0.05100671140939597, 0.7825503355704698, 0.06308724832214765, 0.06308724832214765, 0.06040268456375839, 0.05906040268456376, 0.049664429530201344, 0.04832214765100671, 0.04429530201342282, 0.04563758389261745, 0.04697986577181208, 0.04429530201342282, 0.04563758389261745, 0.049664429530201344, 0.04429530201342282, 0.04697986577181208, 0.04563758389261745, 0.040268456375838924, 0.040268456375838924, 0.040268456375838924, 0.038926174496644296, 0.038926174496644296, 0.03758389261744966, 0.040268456375838924, 0.04161073825503356, 0.040268456375838924, 0.038926174496644296, 0.038926174496644296, 0.04161073825503356, 0.036241610738255034, 0.04161073825503356, 0.04161073825503356, 0.04161073825503356, 0.04429530201342282, 0.04563758389261745, 0.04832214765100671, 0.053691275167785234, 0.04832214765100671, 0.04832214765100671, 0.04832214765100671, 0.052348993288590606, 0.05100671140939597, 0.052348993288590606, 0.052348993288590606, 0.7543624161073825, 0.05100671140939597, 0.049664429530201344, 0.049664429530201344, 0.05100671140939597, 0.049664429530201344, 0.053691275167785234, 0.05906040268456376, 0.05906040268456376, 0.05906040268456376, 0.05906040268456376, 0.05906040268456376, 0.05906040268456376, 0.05906040268456376, 0.06040268456375839, 0.06711409395973154, 0.06845637583892618, 0.06845637583892618, 0.0738255033557047, 0.07516778523489932, 0.07516778523489932, 0.07785234899328859, 0.07919463087248323, 0.08053691275167785, 0.08456375838926175, 0.08590604026845637, 0.08590604026845637, 0.087248322147651, 0.09261744966442953, 0.09395973154362416, 0.10067114093959731, 0.10604026845637583, 0.11006711409395974, 0.11946308724832215, 0.12483221476510067], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/BAAT_C.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "BAAT_C", "n_seqs": 365, "length": 249, "gap_rates": [0.6082191780821918, 0.3561643835616438, 0.3315068493150685, 0.3150684931506849, 0.3095890410958904, 0.28493150684931506, 0.26575342465753427, 0.2054794520547945, 0.1780821917808219, 0.16712328767123288, 0.16712328767123288, 0.16164383561643836, 0.1589041095890411, 0.15616438356164383, 0.15616438356164383, 0.14520547945205478, 0.2328767123287671, 0.2, 0.20273972602739726, 0.16164383561643836, 0.23835616438356164, 0.11506849315068493, 0.08493150684931507, 0.07397260273972603, 0.07123287671232877, 0.07123287671232877, 0.07123287671232877, 0.07123287671232877, 0.07123287671232877, 0.07123287671232877, 0.07123287671232877, 0.0684931506849315, 0.0684931506849315, 0.07123287671232877, 0.06575342465753424, 0.06575342465753424, 0.06575342465753424, 0.06575342465753424, 0.06575342465753424, 0.06575342465753424, 0.06575342465753424, 0.06575342465753424, 0.0684931506849315, 0.07123287671232877, 0.852054794520548, 0.07397260273972603, 0.07671232876712329, 0.08493150684931507, 0.08493150684931507, 0.0821917808219178, 0.0821917808219178, 0.08493150684931507, 0.09041095890410959, 0.09315068493150686, 0.09315068493150686, 0.09315068493150686, 0.09863013698630137, 0.1095890410958904, 0.11232876712328767, 0.1178082191780822, 0.14794520547945206, 0.1506849315068493, 0.14520547945205478, 0.14794520547945206, 0.15342465753424658, 0.1506849315068493, 0.15342465753424658, 0.19726027397260273, 0.1917808219178082, 0.5671232876712329, 0.6383561643835617, 0.6493150684931507, 0.6657534246575343, 0.726027397260274, 0.7808219178082192, 0.8246575342465754, 0.8821917808219178, 0.8986301369863013, 0.9232876712328767, 0.9424657534246575, 0.947945205479452, 0.9397260273972603, 0.9095890410958904, 0.8958904109589041, 0.873972602739726, 0.7945205479452054, 0.7534246575342466, 0.7041095890410959, 0.6547945205479452, 0.6438356164383562, 0.6054794520547945, 0.5287671232876713, 0.2219178082191781, 0.21095890410958903, 0.21095890410958903, 0.2191780821917808, 0.2219178082191781, 0.21643835616438356, 0.21095890410958903, 0.20273972602739726, 0.20821917808219179, 0.2054794520547945, 0.20821917808219179, 0.23013698630136986, 0.2684931506849315, 0.23835616438356164, 0.7150684931506849, 0.7726027397260274, 0.8, 0.852054794520548, 0.915068493150685, 0.9452054794520548, 0.9315068493150684, 0.8849315068493151, 0.8356164383561644, 0.7890410958904109, 0.7479452054794521, 0.6821917808219178, 0.22465753424657534, 0.2136986301369863, 0.2054794520547945, 0.1917808219178082, 0.2, 0.20273972602739726, 0.2, 0.19452054794520549, 0.19726027397260273, 0.1917808219178082, 0.2, 0.20273972602739726, 0.2, 0.20821917808219179, 0.22465753424657534, 0.24383561643835616, 0.22465753424657534, 0.2054794520547945, 0.25753424657534246, 0.2273972602739726, 0.19452054794520549, 0.1917808219178082, 0.2493150684931507, 0.24383561643835616, 0.2, 0.17534246575342466, 0.16712328767123288, 0.16712328767123288, 0.16712328767123288, 0.16164383561643836, 0.9260273972602739, 0.1643835616438356, 0.16986301369863013, 0.16164383561643836, 0.16164383561643836, 0.1643835616438356, 0.1643835616438356, 0.1643835616438356, 0.16164383561643836, 0.16164383561643836, 0.16164383561643836, 0.16164383561643836, 0.16164383561643836, 0.16164383561643836, 0.16164383561643836, 0.16164383561643836, 0.16712328767123288, 0.16712328767123288, 0.16986301369863013, 0.1780821917808219, 0.18082191780821918, 0.18356164383561643, 0.25753424657534246, 0.2328767123287671, 0.22465753424657534, 0.2273972602739726, 0.20821917808219179, 0.19726027397260273, 0.20821917808219179, 0.2, 0.19452054794520549, 0.1863013698630137, 0.18904109589041096, 0.18904109589041096, 0.1917808219178082, 0.6383561643835617, 0.3095890410958904, 0.2136986301369863, 0.20821917808219179, 0.20821917808219179, 0.2054794520547945, 0.25205479452054796, 0.2356164383561644, 0.2356164383561644, 0.19726027397260273, 0.2, 0.20821917808219179, 0.20821917808219179, 0.21643835616438356, 0.2328767123287671, 0.25205479452054796, 0.273972602739726, 0.32602739726027397, 0.3589041095890411, 0.3698630136986301, 0.37534246575342467, 0.38082191780821917, 0.3863013698630137, 0.38904109589041097, 0.3917808219178082, 0.42191780821917807, 0.4273972602739726, 0.4931506849315068, 0.4931506849315068, 0.5260273972602739, 0.5178082191780822, 0.5068493150684932, 0.4986301369863014, 0.473972602739726, 0.9397260273972603, 0.8958904109589041, 0.4383561643835616, 0.4328767123287671, 0.4246575342465753, 0.42191780821917807, 0.42191780821917807, 0.4136986301369863, 0.42191780821917807, 0.4246575342465753, 0.4273972602739726, 0.4301369863013699, 0.4273972602739726, 0.4273972602739726, 0.4246575342465753, 0.4246575342465753, 0.4273972602739726, 0.4273972602739726, 0.4301369863013699, 0.4301369863013699, 0.4301369863013699, 0.4383561643835616, 0.4465753424657534, 0.4547945205479452, 0.4684931506849315, 0.4794520547945205, 0.4794520547945205, 0.4849315068493151, 0.4958904109589041, 0.536986301369863, 0.5753424657534246, 0.6767123287671233], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/BHD_3.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "BHD_3", "n_seqs": 400, "length": 80, "gap_rates": [0.0825, 0.0725, 0.0625, 0.0575, 0.0575, 0.0475, 0.0425, 0.0425, 0.04, 0.035, 0.0325, 0.03, 0.03, 0.03, 0.0225, 0.0175, 0.0175, 0.0175, 0.015, 0.015, 0.015, 0.015, 0.015, 0.015, 0.93, 0.94, 0.9225, 0.015, 0.0225, 0.02, 0.02, 0.015, 0.015, 0.015, 0.015, 0.015, 0.015, 0.025, 0.0175, 0.015, 0.015, 0.0125, 0.0125, 0.0125, 0.0125, 0.0125, 0.0125, 0.01, 0.01, 0.01, 0.01, 0.0125, 0.0125, 0.5725, 0.5125, 0.1325, 0.105, 0.1125, 0.36, 0.9375, 0.27, 0.02, 0.0225, 0.03, 0.03, 0.03, 0.03, 0.03, 0.0325, 0.035, 0.035, 0.035, 0.035, 0.0475, 0.055, 0.0575, 0.0825, 0.12, 0.27, 0.9], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/BLM10_mid.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "BLM10_mid", "n_seqs": 430, "length": 598, "gap_rates": [0.4930232558139535, 0.386046511627907, 0.36046511627906974, 0.35348837209302325, 0.35348837209302325, 0.35348837209302325, 0.35348837209302325, 0.35348837209302325, 0.35348837209302325, 0.34651162790697676, 0.34651162790697676, 0.34418604651162793, 0.3395348837209302, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.33488372093023255, 0.33488372093023255, 0.3325581395348837, 0.3325581395348837, 0.3325581395348837, 0.32790697674418606, 0.32558139534883723, 0.32558139534883723, 0.32558139534883723, 0.32558139534883723, 0.32325581395348835, 0.32325581395348835, 0.32325581395348835, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3209302325581395, 0.32558139534883723, 0.32325581395348835, 0.32325581395348835, 0.3209302325581395, 0.3186046511627907, 0.3209302325581395, 0.9255813953488372, 0.8953488372093024, 0.34186046511627904, 0.3488372093023256, 0.34418604651162793, 0.3697674418604651, 0.7906976744186046, 0.8441860465116279, 0.8162790697674419, 0.7674418604651163, 0.3627906976744186, 0.34418604651162793, 0.34418604651162793, 0.34186046511627904, 0.3395348837209302, 0.3325581395348837, 0.3302325581395349, 0.33488372093023255, 0.32790697674418606, 0.32325581395348835, 0.3209302325581395, 0.3209302325581395, 0.31627906976744186, 0.31627906976744186, 0.3186046511627907, 0.3209302325581395, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.31627906976744186, 0.31627906976744186, 0.31627906976744186, 0.3186046511627907, 0.31627906976744186, 0.31627906976744186, 0.31627906976744186, 0.31627906976744186, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.31627906976744186, 0.3209302325581395, 0.32558139534883723, 0.3302325581395349, 0.4441860465116279, 0.43023255813953487, 0.3302325581395349, 0.33488372093023255, 0.33488372093023255, 0.31627906976744186, 0.313953488372093, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.30930232558139537, 0.30697674418604654, 0.30930232558139537, 0.30930232558139537, 0.30930232558139537, 0.3116279069767442, 0.313953488372093, 0.30930232558139537, 0.30930232558139537, 0.30930232558139537, 0.30930232558139537, 0.30697674418604654, 0.30930232558139537, 0.30930232558139537, 0.30930232558139537, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.313953488372093, 0.32325581395348835, 0.3186046511627907, 0.3209302325581395, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.31627906976744186, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.313953488372093, 0.31627906976744186, 0.31627906976744186, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.313953488372093, 0.3186046511627907, 0.32325581395348835, 0.313953488372093, 0.9302325581395349, 0.3302325581395349, 0.3511627906976744, 0.38372093023255816, 0.37906976744186044, 0.34651162790697676, 0.34418604651162793, 0.6511627906976745, 0.8813953488372093, 0.9093023255813953, 0.913953488372093, 0.9186046511627907, 0.9302325581395349, 0.9302325581395349, 0.9279069767441861, 0.9162790697674419, 0.9116279069767442, 0.9069767441860465, 0.6534883720930232, 0.641860465116279, 0.3395348837209302, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.33488372093023255, 0.33488372093023255, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.33488372093023255, 0.3395348837209302, 0.34186046511627904, 0.34418604651162793, 0.34418604651162793, 0.3488372093023256, 0.3488372093023256, 0.3488372093023256, 0.3488372093023256, 0.3488372093023256, 0.3488372093023256, 0.3511627906976744, 0.3511627906976744, 0.36046511627906974, 0.37906976744186044, 0.39069767441860465, 0.40930232558139534, 0.41627906976744183, 0.4255813953488372, 0.4255813953488372, 0.4255813953488372, 0.43023255813953487, 0.4372093023255814, 0.7069767441860465, 0.9372093023255814, 0.9441860465116279, 0.9488372093023256, 0.9488372093023256, 0.9488372093023256, 0.9395348837209302, 0.9348837209302325, 0.7162790697674418, 0.7, 0.6767441860465117, 0.6627906976744186, 0.6651162790697674, 0.6581395348837209, 0.6488372093023256, 0.6511627906976745, 0.6488372093023256, 0.7023255813953488, 0.6976744186046512, 0.6883720930232559, 0.672093023255814, 0.6581395348837209, 0.6558139534883721, 0.6604651162790698, 0.6604651162790698, 0.6651162790697674, 0.6627906976744186, 0.6558139534883721, 0.6651162790697674, 0.686046511627907, 0.686046511627907, 0.8813953488372093, 0.9093023255813953, 0.9279069767441861, 0.9395348837209302, 0.9418604651162791, 0.9372093023255814, 0.9186046511627907, 0.8930232558139535, 0.872093023255814, 0.6651162790697674, 0.6697674418604651, 0.6186046511627907, 0.5906976744186047, 0.5790697674418605, 0.5069767441860465, 0.5, 0.48372093023255813, 0.45813953488372094, 0.4558139534883721, 0.4511627906976744, 0.4604651162790698, 0.4720930232558139, 0.5279069767441861, 0.5953488372093023, 0.5023255813953489, 0.4558139534883721, 0.45348837209302323, 0.4325581395348837, 0.4255813953488372, 0.41627906976744183, 0.40930232558139534, 0.40930232558139534, 0.39069767441860465, 0.3883720930232558, 0.3558139534883721, 0.34186046511627904, 0.3395348837209302, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.34418604651162793, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.3372093023255814, 0.33488372093023255, 0.33488372093023255, 0.33488372093023255, 0.33488372093023255, 0.33488372093023255, 0.3302325581395349, 0.36046511627906974, 0.3627906976744186, 0.3558139534883721, 0.3558139534883721, 0.3558139534883721, 0.36046511627906974, 0.45348837209302323, 0.4069767441860465, 0.5953488372093023, 0.7697674418604651, 0.8255813953488372, 0.8883720930232558, 0.9325581395348838, 0.9465116279069767, 0.9162790697674419, 0.8697674418604651, 0.7744186046511627, 0.6627906976744186, 0.5837209302325581, 0.35348837209302325, 0.3488372093023256, 0.32790697674418606, 0.32790697674418606, 0.3209302325581395, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3209302325581395, 0.3209302325581395, 0.3186046511627907, 0.31627906976744186, 0.31627906976744186, 0.3186046511627907, 0.31627906976744186, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.313953488372093, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.3116279069767442, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.7976744186046512, 0.7883720930232558, 0.31627906976744186, 0.3186046511627907, 0.31627906976744186, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.31627906976744186, 0.31627906976744186, 0.31627906976744186, 0.31627906976744186, 0.31627906976744186, 0.31627906976744186, 0.31627906976744186, 0.32325581395348835, 0.32558139534883723, 0.32790697674418606, 0.32790697674418606, 0.3883720930232558, 0.3302325581395349, 0.3302325581395349, 0.3302325581395349, 0.32790697674418606, 0.32790697674418606, 0.32790697674418606, 0.32790697674418606, 0.32790697674418606, 0.32790697674418606, 0.3325581395348837, 0.33488372093023255, 0.33488372093023255, 0.3395348837209302, 0.4, 0.37906976744186044, 0.386046511627907, 0.37906976744186044, 0.7697674418604651, 0.3953488372093023, 0.42093023255813955, 0.4372093023255814, 0.44651162790697674, 0.45348837209302323, 0.4511627906976744, 0.44651162790697674, 0.4511627906976744, 0.7837209302325582, 0.42093023255813955, 0.4069767441860465, 0.9488372093023256, 0.9465116279069767, 0.3953488372093023, 0.386046511627907, 0.7790697674418605, 0.9418604651162791, 0.9, 0.7558139534883721, 0.3767441860465116, 0.36046511627906974, 0.3511627906976744, 0.3511627906976744, 0.3488372093023256, 0.3511627906976744, 0.34186046511627904, 0.3325581395348837, 0.32790697674418606, 0.32790697674418606, 0.32790697674418606, 0.32325581395348835, 0.3209302325581395, 0.32325581395348835, 0.32325581395348835, 0.3209302325581395, 0.32325581395348835, 0.3209302325581395, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.33488372093023255, 0.3209302325581395, 0.3209302325581395, 0.3186046511627907, 0.31627906976744186, 0.3209302325581395, 0.3209302325581395, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3209302325581395, 0.5395348837209303, 0.32325581395348835, 0.32325581395348835, 0.32325581395348835, 0.32325581395348835, 0.32325581395348835, 0.32325581395348835, 0.5930232558139535, 0.32558139534883723, 0.3209302325581395, 0.3209302325581395, 0.3209302325581395, 0.3209302325581395, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.3186046511627907, 0.313953488372093, 0.313953488372093, 0.3116279069767442, 0.30930232558139537, 0.30930232558139537, 0.30930232558139537, 0.30930232558139537, 0.30930232558139537, 0.30930232558139537, 0.30930232558139537, 0.30930232558139537, 0.30930232558139537, 0.30930232558139537, 0.35348837209302325, 0.3511627906976744, 0.32558139534883723, 0.3186046511627907, 0.32325581395348835, 0.3209302325581395, 0.3209302325581395, 0.3302325581395349, 0.3930232558139535, 0.3767441860465116, 0.37209302325581395, 0.5651162790697675, 0.8837209302325582, 0.8744186046511628, 0.34651162790697676, 0.3325581395348837, 0.8860465116279069, 0.32325581395348835, 0.3186046511627907, 0.30930232558139537, 0.7790697674418605, 0.9209302325581395, 0.8162790697674419, 0.7790697674418605, 0.30930232558139537, 0.30697674418604654, 0.30697674418604654, 0.30697674418604654, 0.30697674418604654, 0.30465116279069765, 0.30465116279069765, 0.8372093023255814, 0.8767441860465116, 0.9069767441860465, 0.9, 0.8604651162790697, 0.8325581395348837, 0.30465116279069765, 0.30465116279069765, 0.30465116279069765, 0.3116279069767442, 0.30697674418604654, 0.3, 0.3023255813953488, 0.30465116279069765, 0.3023255813953488, 0.3023255813953488, 0.3023255813953488, 0.3023255813953488, 0.3023255813953488, 0.3023255813953488, 0.30465116279069765, 0.30465116279069765, 0.30465116279069765, 0.30465116279069765, 0.30465116279069765, 0.30465116279069765, 0.30697674418604654, 0.3116279069767442, 0.31627906976744186, 0.32325581395348835, 0.3186046511627907, 0.3209302325581395, 0.32325581395348835, 0.3302325581395349, 0.3325581395348837, 0.3325581395348837, 0.33488372093023255, 0.3325581395348837, 0.3325581395348837, 0.3395348837209302, 0.3511627906976744, 0.3953488372093023, 0.39767441860465114, 0.4046511627906977, 0.43023255813953487, 0.5604651162790698, 0.6744186046511628, 0.7837209302325582, 0.8023255813953488, 0.7930232558139535, 0.7744186046511627, 0.5441860465116279, 0.5395348837209303, 0.4720930232558139, 0.44651162790697674, 0.4372093023255814, 0.43488372093023253, 0.43488372093023253, 0.43488372093023253, 0.43488372093023253, 0.4372093023255814, 0.4372093023255814, 0.43953488372093025, 0.4418604651162791, 0.44883720930232557, 0.45348837209302323, 0.45348837209302323, 0.45348837209302323, 0.4558139534883721, 0.4604651162790698, 0.4697674418604651, 0.4720930232558139, 0.47674418604651164, 0.47674418604651164, 0.48604651162790696, 0.5, 0.5720930232558139, 0.5883720930232558, 0.6116279069767442, 0.7325581395348837], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/BNR_3.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "BNR_3", "n_seqs": 646, "length": 472, "gap_rates": [0.4040247678018576, 0.0913312693498452, 0.06346749226006192, 0.06191950464396285, 0.06191950464396285, 0.058823529411764705, 0.058823529411764705, 0.058823529411764705, 0.058823529411764705, 0.058823529411764705, 0.058823529411764705, 0.058823529411764705, 0.058823529411764705, 0.058823529411764705, 0.058823529411764705, 0.058823529411764705, 0.058823529411764705, 0.058823529411764705, 0.06501547987616099, 0.06501547987616099, 0.15789473684210525, 0.07894736842105263, 0.9442724458204335, 0.9489164086687306, 0.9442724458204335, 0.9442724458204335, 0.09287925696594428, 0.14396284829721362, 0.8436532507739938, 0.10681114551083591, 0.1021671826625387, 0.9256965944272446, 0.8900928792569659, 0.06191950464396285, 0.7724458204334366, 0.7832817337461301, 0.8080495356037152, 0.8173374613003096, 0.826625386996904, 0.8498452012383901, 0.8777089783281734, 0.8839009287925697, 0.9411764705882353, 0.9055727554179567, 0.8823529411764706, 0.8730650154798761, 0.8405572755417957, 0.8173374613003096, 0.8111455108359134, 0.7894736842105263, 0.7770897832817337, 0.7693498452012384, 0.06191950464396285, 0.1563467492260062, 0.16873065015479877, 0.16253869969040247, 0.16253869969040247, 0.12848297213622292, 0.07430340557275542, 0.8405572755417957, 0.8591331269349846, 0.9458204334365325, 0.9458204334365325, 0.9287925696594427, 0.8529411764705882, 0.8405572755417957, 0.07430340557275542, 0.07585139318885449, 0.07275541795665634, 0.07739938080495357, 0.07120743034055728, 0.1346749226006192, 0.13157894736842105, 0.11764705882352941, 0.11609907120743033, 0.10061919504643962, 0.10526315789473684, 0.10371517027863777, 0.16408668730650156, 0.11764705882352941, 0.11764705882352941, 0.13622291021671826, 0.15015479876160992, 0.05727554179566564, 0.44427244582043346, 0.47832817337461303, 0.47832817337461303, 0.5, 0.5077399380804953, 0.565015479876161, 0.7507739938080495, 0.7585139318885449, 0.781733746130031, 0.781733746130031, 0.7925696594427245, 0.8699690402476781, 0.9287925696594427, 0.9024767801857585, 0.8142414860681114, 0.781733746130031, 0.781733746130031, 0.781733746130031, 0.7569659442724458, 0.6377708978328174, 0.5232198142414861, 0.5030959752321982, 0.48761609907120745, 0.47832817337461303, 0.47368421052631576, 0.4411764705882353, 0.05263157894736842, 0.08359133126934984, 0.07739938080495357, 0.0804953560371517, 0.058823529411764705, 0.93343653250774, 0.9427244582043344, 0.9489164086687306, 0.9489164086687306, 0.934984520123839, 0.9055727554179567, 0.05263157894736842, 0.05417956656346749, 0.047987616099071206, 0.043343653250773995, 0.8591331269349846, 0.043343653250773995, 0.04489164086687306, 0.04489164086687306, 0.04643962848297214, 0.05108359133126935, 0.04643962848297214, 0.04489164086687306, 0.04489164086687306, 0.04489164086687306, 0.04489164086687306, 0.04489164086687306, 0.04489164086687306, 0.043343653250773995, 0.043343653250773995, 0.043343653250773995, 0.043343653250773995, 0.043343653250773995, 0.043343653250773995, 0.043343653250773995, 0.6253869969040248, 0.7151702786377709, 0.8250773993808049, 0.9148606811145511, 0.8575851393188855, 0.7647058823529411, 0.6547987616099071, 0.6176470588235294, 0.04489164086687306, 0.12229102167182662, 0.08823529411764706, 0.4628482972136223, 0.5061919504643962, 0.7027863777089783, 0.8854489164086687, 0.7461300309597523, 0.6486068111455109, 0.48297213622291024, 0.4504643962848297, 0.08513931888544891, 0.11145510835913312, 0.05727554179566564, 0.7972136222910217, 0.8328173374613003, 0.9086687306501547, 0.9303405572755418, 0.8575851393188855, 0.8111455108359134, 0.7894736842105263, 0.05108359133126935, 0.05108359133126935, 0.05108359133126935, 0.05108359133126935, 0.04953560371517028, 0.04953560371517028, 0.047987616099071206, 0.8080495356037152, 0.8328173374613003, 0.8405572755417957, 0.8250773993808049, 0.804953560371517, 0.047987616099071206, 0.4520123839009288, 0.6145510835913313, 0.8018575851393189, 0.9318885448916409, 0.8637770897832817, 0.7151702786377709, 0.4535603715170279, 0.43653250773993807, 0.04953560371517028, 0.09442724458204334, 0.09597523219814241, 0.11609907120743033, 0.11609907120743033, 0.14086687306501547, 0.047987616099071206, 0.3126934984520124, 0.5557275541795665, 0.8250773993808049, 0.9442724458204335, 0.8854489164086687, 0.7074303405572755, 0.39164086687306504, 0.3126934984520124, 0.047987616099071206, 0.047987616099071206, 0.047987616099071206, 0.06037151702786378, 0.05417956656346749, 0.06501547987616099, 0.05263157894736842, 0.05572755417956656, 0.06346749226006192, 0.0696594427244582, 0.07275541795665634, 0.08204334365325078, 0.42569659442724456, 0.6826625386996904, 0.9427244582043344, 0.8498452012383901, 0.5634674922600619, 0.33591331269349844, 0.1130030959752322, 0.25232198142414863, 0.25696594427244585, 0.08513931888544891, 0.5309597523219814, 0.7755417956656346, 0.6718266253869969, 0.5154798761609907, 0.06037151702786378, 0.8157894736842105, 0.9256965944272446, 0.8839009287925697, 0.8142414860681114, 0.05727554179566564, 0.05727554179566564, 0.06811145510835913, 0.05727554179566564, 0.05572755417956656, 0.05727554179566564, 0.05727554179566564, 0.05727554179566564, 0.05727554179566564, 0.05572755417956656, 0.05417956656346749, 0.05727554179566564, 0.05572755417956656, 0.05572755417956656, 0.05572755417956656, 0.05727554179566564, 0.05727554179566564, 0.05727554179566564, 0.05727554179566564, 0.05727554179566564, 0.058823529411764705, 0.058823529411764705, 0.06191950464396285, 0.058823529411764705, 0.06191950464396285, 0.06191950464396285, 0.06037151702786378, 0.06037151702786378, 0.47058823529411764, 0.6671826625386997, 0.6965944272445821, 0.7941176470588235, 0.9287925696594427, 0.9442724458204335, 0.8761609907120743, 0.7275541795665634, 0.6795665634674922, 0.6470588235294118, 0.2306501547987616, 0.06037151702786378, 0.05727554179566564, 0.05727554179566564, 0.06656346749226007, 0.058823529411764705, 0.058823529411764705, 0.06037151702786378, 0.058823529411764705, 0.06191950464396285, 0.3715170278637771, 0.0804953560371517, 0.05727554179566564, 0.05727554179566564, 0.05417956656346749, 0.05417956656346749, 0.05572755417956656, 0.05263157894736842, 0.05572755417956656, 0.05572755417956656, 0.05572755417956656, 0.05727554179566564, 0.06346749226006192, 0.05417956656346749, 0.05417956656346749, 0.05263157894736842, 0.05263157894736842, 0.05263157894736842, 0.05263157894736842, 0.05263157894736842, 0.05417956656346749, 0.05572755417956656, 0.05572755417956656, 0.05572755417956656, 0.9489164086687306, 0.9009287925696594, 0.3080495356037152, 0.06346749226006192, 0.9380804953560371, 0.9458204334365325, 0.9380804953560371, 0.9380804953560371, 0.14086687306501547, 0.05417956656346749, 0.05417956656346749, 0.05417956656346749, 0.05263157894736842, 0.05263157894736842, 0.05263157894736842, 0.05263157894736842, 0.05263157894736842, 0.05417956656346749, 0.06656346749226007, 0.05417956656346749, 0.13157894736842105, 0.1996904024767802, 0.05572755417956656, 0.05572755417956656, 0.05572755417956656, 0.05572755417956656, 0.05727554179566564, 0.07120743034055728, 0.05572755417956656, 0.05572755417956656, 0.05572755417956656, 0.06037151702786378, 0.06501547987616099, 0.058823529411764705, 0.06037151702786378, 0.06501547987616099, 0.06811145510835913, 0.06346749226006192, 0.06191950464396285, 0.06037151702786378, 0.06037151702786378, 0.06037151702786378, 0.06191950464396285, 0.06191950464396285, 0.06191950464396285, 0.06191950464396285, 0.06191950464396285, 0.06191950464396285, 0.07894736842105263, 0.3018575851393189, 0.3560371517027864, 0.93343653250774, 0.5309597523219814, 0.3142414860681115, 0.2894736842105263, 0.08513931888544891, 0.13312693498452013, 0.13003095975232198, 0.09597523219814241, 0.08823529411764706, 0.08823529411764706, 0.09752321981424149, 0.11609907120743033, 0.16253869969040247, 0.3622291021671827, 0.3328173374613003, 0.8947368421052632, 0.6764705882352942, 0.28637770897832815, 0.23529411764705882, 0.0696594427244582, 0.07120743034055728, 0.0696594427244582, 0.0696594427244582, 0.06811145510835913, 0.06811145510835913, 0.06811145510835913, 0.06811145510835913, 0.06811145510835913, 0.06811145510835913, 0.06811145510835913, 0.06811145510835913, 0.06811145510835913, 0.23993808049535603, 0.21362229102167182, 0.7678018575851393, 0.9009287925696594, 0.8297213622291022, 0.6764705882352942, 0.14705882352941177, 0.16873065015479877, 0.10526315789473684, 0.29721362229102166, 0.9024767801857585, 0.934984520123839, 0.8854489164086687, 0.11919504643962849, 0.09597523219814241, 0.06811145510835913, 0.9210526315789473, 0.0696594427244582, 0.0696594427244582, 0.07275541795665634, 0.07275541795665634, 0.07275541795665634, 0.07430340557275542, 0.07585139318885449, 0.07739938080495357, 0.07739938080495357, 0.07739938080495357, 0.07739938080495357, 0.07894736842105263, 0.07894736842105263, 0.08204334365325078, 0.08204334365325078, 0.08204334365325078, 0.08513931888544891, 0.08513931888544891, 0.08513931888544891, 0.08513931888544891, 0.35294117647058826, 0.18111455108359134, 0.08513931888544891, 0.08513931888544891, 0.9024767801857585, 0.8157894736842105, 0.08823529411764706, 0.9195046439628483, 0.08668730650154799, 0.08668730650154799, 0.08668730650154799, 0.08668730650154799, 0.08823529411764706, 0.08823529411764706, 0.08823529411764706, 0.08823529411764706, 0.0913312693498452, 0.0913312693498452, 0.0913312693498452, 0.0913312693498452, 0.12229102167182662, 0.7925696594427245, 0.9117647058823529, 0.9489164086687306, 0.8606811145510835, 0.6888544891640866, 0.5975232198142415, 0.5712074303405573, 0.5232198142414861, 0.5061919504643962, 0.47678018575851394, 0.4102167182662539, 0.3668730650154799, 0.29876160990712075, 0.29876160990712075, 0.30030959752321984, 0.30030959752321984, 0.3065015479876161, 0.3281733746130031], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/BRCA-2_OB1.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "BRCA-2_OB1", "n_seqs": 197, "length": 161, "gap_rates": [0.16243654822335024, 0.1218274111675127, 0.04568527918781726, 0.04568527918781726, 0.04568527918781726, 0.04568527918781726, 0.04568527918781726, 0.04568527918781726, 0.04568527918781726, 0.04060913705583756, 0.04060913705583756, 0.04060913705583756, 0.03553299492385787, 0.03553299492385787, 0.03553299492385787, 0.03553299492385787, 0.030456852791878174, 0.030456852791878174, 0.030456852791878174, 0.030456852791878174, 0.030456852791878174, 0.030456852791878174, 0.030456852791878174, 0.04060913705583756, 0.04060913705583756, 0.04060913705583756, 0.04568527918781726, 0.09137055837563451, 0.1319796954314721, 0.16751269035532995, 0.19796954314720813, 0.25380710659898476, 0.27918781725888325, 0.38578680203045684, 0.5888324873096447, 0.6548223350253807, 0.6903553299492385, 0.8274111675126904, 0.8426395939086294, 0.8477157360406091, 0.8527918781725888, 0.8578680203045685, 0.934010152284264, 0.9390862944162437, 0.949238578680203, 0.9441624365482234, 0.934010152284264, 0.8629441624365483, 0.8578680203045685, 0.8527918781725888, 0.8477157360406091, 0.8375634517766497, 0.7969543147208121, 0.6751269035532995, 0.6345177664974619, 0.5634517766497462, 0.5126903553299492, 0.4720812182741117, 0.4517766497461929, 0.41116751269035534, 0.39086294416243655, 0.3299492385786802, 0.2436548223350254, 0.17766497461928935, 0.04568527918781726, 0.04568527918781726, 0.025380710659898477, 0.025380710659898477, 0.025380710659898477, 0.025380710659898477, 0.025380710659898477, 0.030456852791878174, 0.025380710659898477, 0.025380710659898477, 0.025380710659898477, 0.03553299492385787, 0.030456852791878174, 0.030456852791878174, 0.030456852791878174, 0.03553299492385787, 0.03553299492385787, 0.03553299492385787, 0.04060913705583756, 0.025380710659898477, 0.025380710659898477, 0.025380710659898477, 0.025380710659898477, 0.030456852791878174, 0.030456852791878174, 0.06091370558375635, 0.06598984771573604, 0.03553299492385787, 0.025380710659898477, 0.025380710659898477, 0.025380710659898477, 0.025380710659898477, 0.030456852791878174, 0.03553299492385787, 0.03553299492385787, 0.03553299492385787, 0.03553299492385787, 0.03553299492385787, 0.03553299492385787, 0.03553299492385787, 0.03553299492385787, 0.8730964467005076, 0.18274111675126903, 0.050761421319796954, 0.04568527918781726, 0.9441624365482234, 0.9441624365482234, 0.949238578680203, 0.9441624365482234, 0.9441624365482234, 0.9390862944162437, 0.04568527918781726, 0.06091370558375635, 0.06091370558375635, 0.05583756345177665, 0.06091370558375635, 0.06091370558375635, 0.06091370558375635, 0.04568527918781726, 0.883248730964467, 0.9035532994923858, 0.9238578680203046, 0.9441624365482234, 0.9441624365482234, 0.9441624365482234, 0.9441624365482234, 0.9238578680203046, 0.8984771573604061, 0.8426395939086294, 0.7157360406091371, 0.09137055837563451, 0.07614213197969544, 0.06091370558375635, 0.05583756345177665, 0.050761421319796954, 0.050761421319796954, 0.050761421319796954, 0.050761421319796954, 0.06091370558375635, 0.06091370558375635, 0.06091370558375635, 0.06091370558375635, 0.06091370558375635, 0.06091370558375635, 0.06091370558375635, 0.07106598984771574, 0.07106598984771574, 0.07106598984771574, 0.07106598984771574, 0.07106598984771574, 0.07106598984771574, 0.07106598984771574, 0.07106598984771574, 0.07106598984771574, 0.07614213197969544, 0.18274111675126903, 0.8324873096446701], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/Bac_export_3.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "Bac_export_3", "n_seqs": 1025, "length": 74, "gap_rates": [0.9395121951219512, 0.18634146341463415, 0.06926829268292684, 0.04097560975609756, 0.0224390243902439, 0.014634146341463415, 0.013658536585365854, 0.012682926829268294, 0.012682926829268294, 0.012682926829268294, 0.00975609756097561, 0.00975609756097561, 0.00878048780487805, 0.00878048780487805, 0.005853658536585366, 0.005853658536585366, 0.004878048780487805, 0.004878048780487805, 0.004878048780487805, 0.004878048780487805, 0.004878048780487805, 0.004878048780487805, 0.003902439024390244, 0.003902439024390244, 0.002926829268292683, 0.002926829268292683, 0.002926829268292683, 0.002926829268292683, 0.002926829268292683, 0.001951219512195122, 0.000975609756097561, 0.000975609756097561, 0.000975609756097561, 0.000975609756097561, 0.000975609756097561, 0.000975609756097561, 0.000975609756097561, 0.000975609756097561, 0.000975609756097561, 0.000975609756097561, 0.000975609756097561, 0.000975609756097561, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.000975609756097561, 0.000975609756097561, 0.000975609756097561, 0.000975609756097561, 0.001951219512195122, 0.000975609756097561, 0.000975609756097561, 0.000975609756097561, 0.002926829268292683, 0.003902439024390244, 0.003902439024390244, 0.003902439024390244, 0.004878048780487805, 0.004878048780487805, 0.004878048780487805, 0.007804878048780488, 0.0175609756097561, 0.03024390243902439, 0.07414634146341463, 0.848780487804878], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/Beta_helix.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "Beta_helix", "n_seqs": 4205, "length": 256, "gap_rates": [0.9405469678953626, 0.7774078478002379, 0.7143876337693222, 0.6815695600475624, 0.6518430439952437, 0.6214030915576695, 0.5807372175980975, 0.5512485136741974, 0.518192627824019, 0.4896551724137931, 0.9443519619500594, 0.5227110582639715, 0.38882282996432815, 0.3560047562425684, 0.34625445897740786, 0.3381688466111772, 0.3286563614744352, 0.31938168846611176, 0.31343638525564804, 0.30820451843043994, 0.30273483947681334, 0.38192627824019026, 0.853269916765755, 0.8898929845422117, 0.9246135552913198, 0.947205707491082, 0.935077288941736, 0.9103448275862069, 0.8699167657550535, 0.8256837098692034, 0.2741973840665874, 0.24304399524375744, 0.2235434007134364, 0.20737217598097504, 0.19881093935790725, 0.19357907253269918, 0.1859690844233056, 0.1812128418549346, 0.17312722948870393, 0.1643281807372176, 0.15671819262782402, 0.1479191438763377, 0.8444708680142687, 0.8789536266349584, 0.9186682520808561, 0.949821640903686, 0.9367419738406658, 0.8975029726516053, 0.8663495838287752, 0.7800237812128419, 0.26777645659928656, 0.13269916765755055, 0.12104637336504162, 0.11866825208085613, 0.13816884661117718, 0.11414982164090369, 0.11010701545778835, 0.10606420927467301, 0.10487514863258027, 0.10297265160523186, 0.7985731272294887, 0.857550535077289, 0.9177170035671819, 0.9379310344827586, 0.8894173602853745, 0.8290130796670631, 0.7695600475624257, 0.2342449464922711, 0.09536266349583829, 0.08608799048751486, 0.07942925089179548, 0.07205707491082045, 0.06896551724137931, 0.06753864447086802, 0.06349583828775268, 0.06373365041617123, 0.06967895362663495, 0.16076099881093936, 0.7973840665873959, 0.855885850178359, 0.9053507728894173, 0.9372175980975029, 0.9476813317479191, 0.9241379310344827, 0.8837098692033294, 0.8287752675386445, 0.6741973840665874, 0.0366230677764566, 0.02877526753864447, 0.023305588585017835, 0.02140309155766944, 0.019976218787158145, 0.0178359096313912, 0.016884661117717005, 0.016884661117717005, 0.01807372175980975, 0.01807372175980975, 0.017598097502972653, 0.026872770511296076, 0.027348394768133173, 0.0187871581450654, 0.6508917954815696, 0.7043995243757432, 0.780975029726516, 0.8273483947681332, 0.8863258026159334, 0.920808561236623, 0.944589774078478, 0.9331747919143877, 0.9101070154577884, 0.8556480380499405, 0.8052318668252081, 0.742449464922711, 0.6751486325802616, 0.6278240190249703, 0.15434007134363853, 0.034720570749108205, 0.023067776456599288, 0.019500594530321047, 0.0183115338882283, 0.0183115338882283, 0.019738406658739594, 0.8011890606420927, 0.02568370986920333, 0.01807372175980975, 0.015695600475624256, 0.03828775267538644, 0.010463733650416172, 0.009512485136741973, 0.007609988109393579, 0.007372175980975029, 0.007372175980975029, 0.007372175980975029, 0.008085612366230678, 0.008085612366230678, 0.008085612366230678, 0.008085612366230678, 0.008561236623067776, 0.8492271105826397, 0.8760998810939358, 0.929845422116528, 0.9410225921521997, 0.9029726516052319, 0.8582639714625446, 0.8356718192627824, 0.014268727705112961, 0.038763376932223544, 0.1502972651605232, 0.8696789536266349, 0.8991676575505351, 0.9326991676575506, 0.9426872770511296, 0.9167657550535078, 0.87705112960761, 0.8565992865636147, 0.017360285374554103, 0.019024970273483946, 0.027586206896551724, 0.02544589774078478, 0.03305588585017836, 0.8149821640903686, 0.07633769322235434, 0.7479191438763377, 0.8002378121284186, 0.8504161712247325, 0.9020214030915576, 0.9372175980975029, 0.9464922711058263, 0.9255648038049941, 0.8694411414982164, 0.8256837098692034, 0.7800237812128419, 0.7117717003567182, 0.034244946492271104, 0.03281807372175981, 0.02164090368608799, 0.9462544589774079, 0.020927467300832343, 0.02116527942925089, 0.02116527942925089, 0.020927467300832343, 0.02140309155766944, 0.02164090368608799, 0.024019024970273483, 0.02544589774078478, 0.029488703923900118, 0.03210463733650416, 0.03781212841854935, 0.04233055885850178, 0.7607609988109394, 0.8133174791914387, 0.8851367419738406, 0.9143876337693222, 0.9384066587395957, 0.949821640903686, 0.9286563614744352, 0.9051129607609988, 0.8577883472057075, 0.7793103448275862, 0.7284185493460167, 0.22925089179548158, 0.06896551724137931, 0.06682520808561236, 0.06634958382877527, 0.07300832342449465, 0.07895362663495838, 0.08632580261593341, 0.09417360285374554, 0.09678953626634959, 0.10392390011890607, 0.7821640903686088, 0.8777645659928657, 0.9410225921521997, 0.9131985731272295, 0.8316290130796671, 0.7196195005945303, 0.5629013079667063, 0.18977407847800237, 0.1488703923900119, 0.17074910820451844, 0.1595719381688466, 0.13816884661117718, 0.13793103448275862, 0.1403091557669441, 0.1450653983353151, 0.1512485136741974, 0.16694411414982163, 0.18644470868014268, 0.19928656361474434, 0.22806183115338882, 0.8834720570749108, 0.9224732461355529, 0.9464922711058263, 0.8989298454221165, 0.8644470868014269, 0.4149821640903686, 0.3065398335315101, 0.3051129607609988, 0.32271105826397145, 0.3969084423305589, 0.38145065398335315, 0.412128418549346, 0.43543400713436387, 0.4663495838287753, 0.500832342449465, 0.5322235434007134, 0.949346016646849, 0.7966706302021404, 0.6439952437574317, 0.6430439952437574, 0.6573127229488704, 0.6777645659928656, 0.6932223543400713, 0.710820451843044, 0.7745541022592152, 0.8956004756242568], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/Big_5.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "Big_5", "n_seqs": 1363, "length": 130, "gap_rates": [0.6052824651504035, 0.5275128393250184, 0.4101247248716067, 0.3008070432868672, 0.24064563462949376, 0.19809244314013205, 0.1731474688187821, 0.16140865737344093, 0.14233308877476156, 0.11885546588407923, 0.10858400586940573, 0.10271460014673514, 0.10344827586206896, 0.10344827586206896, 0.0983125458547322, 0.08070432868672046, 0.06382978723404255, 0.07850330154071901, 0.05942773294203962, 0.05282465150403522, 0.05062362435803375, 0.9413059427732942, 0.05722670579603815, 0.10051357300073367, 0.016140865737344093, 0.013939838591342627, 0.007336757153338224, 0.007336757153338224, 0.006603081438004402, 0.006603081438004402, 0.006603081438004402, 0.006603081438004402, 0.009537784299339692, 0.00880410858400587, 0.9457079970652972, 0.015407190022010272, 0.012472487160674981, 0.008070432868672046, 0.006603081438004402, 0.019809244314013204, 0.04842259721203228, 0.0491562729273661, 0.03008070432868672, 0.10564930300807043, 0.04548789435069699, 0.03374908290535583, 0.4512105649303008, 0.4387380777696258, 0.8451944240645635, 0.9038884812912693, 0.9288334556126192, 0.9471753484959647, 0.9361702127659575, 0.9185619955979457, 0.8782098312545855, 0.7879677182685253, 0.13646368305209097, 0.07410124724871607, 0.058694057226705794, 0.07410124724871607, 0.05282465150403522, 0.04035216434336023, 0.03888481291269259, 0.03301540719002201, 0.043286867204695524, 0.0748349229640499, 0.04475421863536317, 0.6265590608950844, 0.863536316947909, 0.9280997798972854, 0.9479090242112986, 0.9002201027146002, 0.8114453411592076, 0.5399853264856933, 0.32575201760821715, 0.28613352898019073, 0.019075568598679385, 0.014673514306676448, 0.008070432868672046, 0.8576669112252384, 0.006603081438004402, 0.005135730007336757, 0.005135730007336757, 0.005135730007336757, 0.004402054292002935, 0.007336757153338224, 0.006603081438004402, 0.007336757153338224, 0.9200293470286134, 0.011005135730007337, 0.07703595011005136, 0.00586940572267058, 0.02714600146735143, 0.00586940572267058, 0.004402054292002935, 0.010271460014673514, 0.00586940572267058, 0.006603081438004402, 0.007336757153338224, 0.008070432868672046, 0.008070432868672046, 0.00880410858400587, 0.13866471019809246, 0.041085840058694055, 0.02347762289068232, 0.6947909024211298, 0.04695524578136464, 0.03961848862802641, 0.029347028613352897, 0.030814380044020543, 0.03154805575935436, 0.049889948642699924, 0.8048422597212033, 0.05942773294203962, 0.30007336757153336, 0.946441672780631, 0.2714600146735143, 0.2971386647101981, 0.33088774761555395, 0.17754952311078503, 0.169479090242113, 0.1760821716801174, 0.6067498165810712, 0.586940572267058, 0.5641966250917094, 0.16434336023477622, 0.16801173881144535, 0.17168011738811445, 0.21203228173147468, 0.29860601614086574], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/Biotin_carb_N.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "Biotin_carb_N", "n_seqs": 4892, "length": 122, "gap_rates": [0.562346688470973, 0.16148814390842192, 0.06030253475061324, 0.045380212591986914, 0.042722812755519216, 0.035772690106295996, 0.03556827473426002, 0.03311529026982829, 0.03250204415372036, 0.03209321340964841, 0.031479967293540474, 0.03107113654946852, 0.03025347506132461, 0.03025347506132461, 0.029231398201144725, 0.02902698282910875, 0.030049059689288636, 0.02636958299264105, 0.025960752248569093, 0.025756336876533115, 0.02473426001635323, 0.024325429272281276, 0.02391659852820932, 0.020850367947669663, 0.9182338511856092, 0.9200735895339329, 0.9202780049059689, 0.9276369582992641, 0.92886345053148, 0.9276369582992641, 0.9200735895339329, 0.919664758789861, 0.9149632052330335, 0.019623875715453803, 0.01901062959934587, 0.01901062959934587, 0.01901062959934587, 0.01901062959934587, 0.018806214227309895, 0.018601798855273917, 0.018601798855273917, 0.018806214227309895, 0.01839738348323794, 0.01778413736713001, 0.9497138184791496, 0.9488961569910057, 0.017375306623058053, 0.017988552739165987, 0.019419460343417825, 0.020850367947669663, 0.016762060506950123, 0.014513491414554375, 0.014513491414554375, 0.012878168438266557, 0.010834014717906787, 0.010425183973834832, 0.010220768601798855, 0.010220768601798855, 0.010834014717906787, 0.010220768601798855, 0.010220768601798855, 0.010220768601798855, 0.013286999182338511, 0.8757154538021259, 0.08094848732624693, 0.050695012264922325, 0.04333605887162715, 0.03025347506132461, 0.01901062959934587, 0.014717906786590351, 0.009403107113654947, 0.009403107113654947, 0.00919869174161897, 0.008381030253475062, 0.008585445625511038, 0.007972199509403107, 0.007972199509403107, 0.007972199509403107, 0.00776778413736713, 0.00776778413736713, 0.007154538021259199, 0.006950122649223222, 0.006950122649223222, 0.006950122649223222, 0.006950122649223222, 0.006950122649223222, 0.007154538021259199, 0.00919869174161897, 0.00776778413736713, 0.007972199509403107, 0.007563368765331153, 0.00776778413736713, 0.00776778413736713, 0.007972199509403107, 0.008176614881439084, 0.008176614881439084, 0.008176614881439084, 0.01062959934587081, 0.008789860997547016, 0.008789860997547016, 0.008789860997547016, 0.008789860997547016, 0.008789860997547016, 0.008994276369582993, 0.008994276369582993, 0.00919869174161897, 0.009403107113654947, 0.009811937857726901, 0.010016353229762878, 0.010834014717906787, 0.011038430089942763, 0.011038430089942763, 0.011242845461978741, 0.011651676206050695, 0.011651676206050695, 0.011856091578086671, 0.012264922322158627, 0.012264922322158627, 0.013695829926410465, 0.02350776778413737, 0.04088307440719542, 0.16905151267375307], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/Bowman-Birk_leg.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "Bowman-Birk_leg", "n_seqs": 161, "length": 26, "gap_rates": [0.10559006211180125, 0.006211180124223602, 0.006211180124223602, 0.006211180124223602, 0.0, 0.6086956521739131, 0.0, 0.0, 0.10559006211180125, 0.006211180124223602, 0.006211180124223602, 0.006211180124223602, 0.006211180124223602, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.7888198757763976, 0.006211180124223602, 0.018633540372670808, 0.024844720496894408, 0.06832298136645963, 0.33540372670807456], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/Bromo_TP.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "Bromo_TP", "n_seqs": 581, "length": 78, "gap_rates": [0.6746987951807228, 0.45266781411359724, 0.27710843373493976, 0.20137693631669534, 0.14974182444061962, 0.08777969018932874, 0.06712564543889846, 0.06196213425129088, 0.04991394148020654, 0.04647160068846816, 0.04475043029259897, 0.04130808950086059, 0.03442340791738382, 0.024096385542168676, 0.022375215146299483, 0.020654044750430294, 0.0189328743545611, 0.024096385542168676, 0.022375215146299483, 0.01549053356282272, 0.01549053356282272, 0.013769363166953529, 0.01549053356282272, 0.012048192771084338, 0.010327022375215147, 0.010327022375215147, 0.008605851979345954, 0.008605851979345954, 0.008605851979345954, 0.008605851979345954, 0.008605851979345954, 0.0068846815834767644, 0.0068846815834767644, 0.0068846815834767644, 0.0068846815834767644, 0.010327022375215147, 0.010327022375215147, 0.012048192771084338, 0.008605851979345954, 0.008605851979345954, 0.008605851979345954, 0.008605851979345954, 0.0068846815834767644, 0.010327022375215147, 0.010327022375215147, 0.06884681583476764, 0.01721170395869191, 0.020654044750430294, 0.024096385542168676, 0.03098106712564544, 0.8623063683304647, 0.05679862306368331, 0.06712564543889846, 0.08433734939759036, 0.08950086058519793, 0.10154905335628227, 0.11359724612736662, 0.11876075731497418, 0.13080895008605853, 0.14285714285714285, 0.9414802065404475, 0.1514629948364888, 0.15834767641996558, 0.16179001721170397, 0.16523235800344235, 0.16695352839931152, 0.1703958691910499, 0.1721170395869191, 0.18072289156626506, 0.19104991394148021, 0.22547332185886404, 0.25817555938037867, 0.3029259896729776, 0.43717728055077454, 0.6092943201376936, 0.7091222030981067, 0.7969018932874354, 0.9328743545611016], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/C8.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "C8", "n_seqs": 1419, "length": 73, "gap_rates": [0.6187455954897816, 0.08315715292459479, 0.08315715292459479, 0.07540521494009866, 0.06976744186046512, 0.06272022551092318, 0.080338266384778, 0.14376321353065538, 0.5271317829457365, 0.38266384778012685, 0.04933051444679352, 0.037350246652572236, 0.03453136011275546, 0.02748414376321353, 0.0204369274136716, 0.03171247357293869, 0.03241719520789288, 0.021846370683579985, 0.014799154334038054, 0.010570824524312896, 0.010570824524312896, 0.010570824524312896, 0.008456659619450317, 0.005637773079633545, 0.0035236081747709656, 0.0028188865398167725, 0.004933051444679351, 0.004228329809725159, 0.004228329809725159, 0.0021141649048625794, 0.0021141649048625794, 0.0007047216349541931, 0.0007047216349541931, 0.028188865398167725, 0.923185341789993, 0.047216349541930935, 0.1331923890063425, 0.11205073995771671, 0.897815362931642, 0.6589147286821705, 0.15997181113460182, 0.06553911205073996, 0.018322762508809022, 0.7610993657505285, 0.004228329809725159, 0.0028188865398167725, 0.0028188865398167725, 0.0021141649048625794, 0.0028188865398167725, 0.0028188865398167725, 0.006342494714587738, 0.007047216349541931, 0.008456659619450317, 0.008456659619450317, 0.009161381254404511, 0.009161381254404511, 0.009866102889358703, 0.011980267794221282, 0.014799154334038054, 0.018322762508809022, 0.021141649048625793, 0.028893587033121917, 0.03312191684284708, 0.03453136011275546, 0.4587737843551797, 0.04369274136715997, 0.04439746300211417, 0.04439746300211417, 0.046511627906976744, 0.080338266384778, 0.12332628611698379, 0.21282593375616632, 0.25299506694855534], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/CAC1F_C.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "CAC1F_C", "n_seqs": 111, "length": 614, "gap_rates": [0.4954954954954955, 0.4864864864864865, 0.4864864864864865, 0.4864864864864865, 0.4864864864864865, 0.4864864864864865, 0.4864864864864865, 0.4864864864864865, 0.4864864864864865, 0.4774774774774775, 0.4774774774774775, 0.4774774774774775, 0.4774774774774775, 0.4774774774774775, 0.4774774774774775, 0.4774774774774775, 0.4774774774774775, 0.4774774774774775, 0.4774774774774775, 0.4774774774774775, 0.4774774774774775, 0.9369369369369369, 0.9369369369369369, 0.4774774774774775, 0.4774774774774775, 0.9279279279279279, 0.9099099099099099, 0.4774774774774775, 0.4774774774774775, 0.4954954954954955, 0.5135135135135135, 0.4954954954954955, 0.4954954954954955, 0.5045045045045045, 0.4954954954954955, 0.4864864864864865, 0.4954954954954955, 0.4954954954954955, 0.5045045045045045, 0.5045045045045045, 0.5135135135135135, 0.5225225225225225, 0.5405405405405406, 0.5405405405405406, 0.5495495495495496, 0.5495495495495496, 0.5495495495495496, 0.7207207207207207, 0.8738738738738738, 0.9279279279279279, 0.9459459459459459, 0.8918918918918919, 0.8288288288288288, 0.6756756756756757, 0.5585585585585585, 0.5765765765765766, 0.5675675675675675, 0.5855855855855856, 0.5765765765765766, 0.5765765765765766, 0.5675675675675675, 0.5495495495495496, 0.5405405405405406, 0.5405405405405406, 0.5495495495495496, 0.5675675675675675, 0.5675675675675675, 0.5675675675675675, 0.5585585585585585, 0.5675675675675675, 0.5765765765765766, 0.6576576576576577, 0.6486486486486487, 0.6036036036036037, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.9459459459459459, 0.9369369369369369, 0.5945945945945946, 0.6036036036036037, 0.6036036036036037, 0.5585585585585585, 0.5495495495495496, 0.5495495495495496, 0.5495495495495496, 0.5495495495495496, 0.5855855855855856, 0.9099099099099099, 0.5855855855855856, 0.5675675675675675, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5495495495495496, 0.5495495495495496, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8198198198198198, 0.8288288288288288, 0.8288288288288288, 0.8378378378378378, 0.8378378378378378, 0.8468468468468469, 0.8468468468468469, 0.8558558558558559, 0.8558558558558559, 0.8738738738738738, 0.8738738738738738, 0.8738738738738738, 0.8738738738738738, 0.8828828828828829, 0.8918918918918919, 0.9009009009009009, 0.9099099099099099, 0.9099099099099099, 0.9099099099099099, 0.9099099099099099, 0.9099099099099099, 0.9099099099099099, 0.8918918918918919, 0.8918918918918919, 0.8828828828828829, 0.8738738738738738, 0.8738738738738738, 0.8738738738738738, 0.8648648648648649, 0.8558558558558559, 0.8558558558558559, 0.8468468468468469, 0.8468468468468469, 0.8378378378378378, 0.8378378378378378, 0.8288288288288288, 0.8198198198198198, 0.8198198198198198, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.5495495495495496, 0.6036036036036037, 0.6576576576576577, 0.6576576576576577, 0.9369369369369369, 0.6576576576576577, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5675675675675675, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5675675675675675, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5765765765765766, 0.5585585585585585, 0.5765765765765766, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5675675675675675, 0.5765765765765766, 0.5765765765765766, 0.5765765765765766, 0.5675675675675675, 0.5675675675675675, 0.5675675675675675, 0.5675675675675675, 0.5675675675675675, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5675675675675675, 0.5765765765765766, 0.6576576576576577, 0.6216216216216216, 0.9459459459459459, 0.8288288288288288, 0.6126126126126126, 0.6036036036036037, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5675675675675675, 0.5585585585585585, 0.5495495495495496, 0.5495495495495496, 0.5495495495495496, 0.5495495495495496, 0.5765765765765766, 0.5765765765765766, 0.5675675675675675, 0.5675675675675675, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.9459459459459459, 0.8828828828828829, 0.6576576576576577, 0.5945945945945946, 0.5765765765765766, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5495495495495496, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5495495495495496, 0.5495495495495496, 0.5495495495495496, 0.6126126126126126, 0.5675675675675675, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.5585585585585585, 0.9009009009009009, 0.918918918918919, 0.9369369369369369, 0.918918918918919, 0.8648648648648649, 0.5855855855855856, 0.5765765765765766, 0.5675675675675675, 0.5675675675675675, 0.5855855855855856, 0.5855855855855856, 0.5855855855855856, 0.5945945945945946, 0.5855855855855856, 0.5675675675675675, 0.9009009009009009, 0.9459459459459459, 0.9459459459459459, 0.8738738738738738, 0.5765765765765766, 0.5675675675675675, 0.5675675675675675, 0.6396396396396397, 0.6306306306306306, 0.6126126126126126, 0.6126126126126126, 0.9459459459459459, 0.6216216216216216, 0.6216216216216216, 0.5855855855855856, 0.5855855855855856, 0.5855855855855856, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.5495495495495496, 0.8018018018018018, 0.8018018018018018, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8198198198198198, 0.8198198198198198, 0.8198198198198198, 0.8288288288288288, 0.8288288288288288, 0.8378378378378378, 0.8468468468468469, 0.8468468468468469, 0.8468468468468469, 0.8468468468468469, 0.8468468468468469, 0.8468468468468469, 0.8558558558558559, 0.8558558558558559, 0.8558558558558559, 0.8558558558558559, 0.8558558558558559, 0.8648648648648649, 0.8648648648648649, 0.8738738738738738, 0.8738738738738738, 0.8738738738738738, 0.8738738738738738, 0.8738738738738738, 0.8828828828828829, 0.8828828828828829, 0.8918918918918919, 0.8918918918918919, 0.8918918918918919, 0.8918918918918919, 0.8918918918918919, 0.8918918918918919, 0.8828828828828829, 0.8738738738738738, 0.8738738738738738, 0.8738738738738738, 0.8738738738738738, 0.8738738738738738, 0.8648648648648649, 0.8648648648648649, 0.8648648648648649, 0.8558558558558559, 0.8558558558558559, 0.8558558558558559, 0.8558558558558559, 0.8468468468468469, 0.8468468468468469, 0.8468468468468469, 0.8468468468468469, 0.8468468468468469, 0.8468468468468469, 0.8468468468468469, 0.8378378378378378, 0.8288288288288288, 0.8288288288288288, 0.8198198198198198, 0.8198198198198198, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8108108108108109, 0.8018018018018018, 0.7837837837837838, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.8468468468468469, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5315315315315315, 0.5495495495495496, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.6216216216216216, 0.6126126126126126, 0.6126126126126126, 0.6126126126126126, 0.6126126126126126, 0.6216216216216216, 0.6216216216216216, 0.6216216216216216, 0.9459459459459459, 0.8648648648648649, 0.6306306306306306, 0.6126126126126126, 0.6126126126126126, 0.6126126126126126, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.6036036036036037, 0.6036036036036037, 0.6036036036036037, 0.6756756756756757, 0.6846846846846847, 0.6846846846846847, 0.6846846846846847, 0.6936936936936937, 0.6936936936936937, 0.7027027027027027, 0.7027027027027027, 0.7657657657657657, 0.7657657657657657, 0.8018018018018018, 0.8108108108108109, 0.8018018018018018, 0.7837837837837838, 0.7657657657657657, 0.7117117117117117, 0.7027027027027027, 0.6936936936936937, 0.6936936936936937, 0.6936936936936937, 0.6846846846846847, 0.6846846846846847, 0.6846846846846847, 0.6756756756756757, 0.6036036036036037, 0.6126126126126126, 0.6036036036036037, 0.6036036036036037, 0.6036036036036037, 0.6036036036036037, 0.7297297297297297, 0.8468468468468469, 0.9369369369369369, 0.8468468468468469, 0.8468468468468469, 0.6036036036036037, 0.5945945945945946, 0.6036036036036037, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.9369369369369369, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.5855855855855856, 0.5945945945945946, 0.7567567567567568, 0.7567567567567568, 0.7567567567567568, 0.7567567567567568, 0.7567567567567568, 0.7657657657657657, 0.9279279279279279, 0.7567567567567568, 0.7567567567567568, 0.7567567567567568, 0.7567567567567568, 0.7567567567567568, 0.7387387387387387, 0.6036036036036037, 0.6216216216216216, 0.6396396396396397, 0.5855855855855856, 0.8648648648648649, 0.8738738738738738, 0.9099099099099099, 0.9279279279279279, 0.9369369369369369, 0.9369369369369369, 0.9459459459459459, 0.9459459459459459, 0.9459459459459459, 0.9369369369369369, 0.9279279279279279, 0.918918918918919, 0.8828828828828829, 0.8648648648648649, 0.7027027027027027, 0.5945945945945946, 0.5945945945945946, 0.5855855855855856, 0.5855855855855856, 0.5855855855855856, 0.5855855855855856, 0.5855855855855856, 0.5855855855855856, 0.5855855855855856, 0.6036036036036037, 0.5765765765765766, 0.9459459459459459, 0.5315315315315315, 0.8288288288288288, 0.8288288288288288, 0.5225225225225225, 0.5045045045045045, 0.4954954954954955, 0.4954954954954955, 0.46846846846846846, 0.4594594594594595, 0.46846846846846846, 0.42342342342342343, 0.40540540540540543, 0.38738738738738737, 0.38738738738738737, 0.34234234234234234, 0.35135135135135137, 0.3153153153153153, 0.3333333333333333, 0.3063063063063063, 0.2972972972972973, 0.2972972972972973, 0.2882882882882883, 0.2882882882882883, 0.2882882882882883, 0.25225225225225223, 0.24324324324324326, 0.24324324324324326, 0.22522522522522523, 0.21621621621621623, 0.23423423423423423, 0.23423423423423423, 0.22522522522522523, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.22522522522522523, 0.21621621621621623, 0.3963963963963964, 0.23423423423423423, 0.23423423423423423, 0.22522522522522523, 0.23423423423423423, 0.23423423423423423, 0.25225225225225223, 0.25225225225225223, 0.24324324324324326, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.21621621621621623, 0.25225225225225223, 0.3783783783783784, 0.44144144144144143, 0.4774774774774775, 0.5135135135135135, 0.5495495495495496, 0.6756756756756757, 0.7387387387387387, 0.7387387387387387, 0.7387387387387387, 0.7477477477477478, 0.7657657657657657, 0.7747747747747747, 0.7837837837837838, 0.7927927927927928, 0.7927927927927928, 0.7927927927927928, 0.9369369369369369, 0.8018018018018018, 0.7927927927927928, 0.7927927927927928, 0.7837837837837838, 0.7747747747747747, 0.7657657657657657, 0.7477477477477478, 0.7477477477477478, 0.7387387387387387, 0.7387387387387387, 0.7387387387387387, 0.6846846846846847, 0.6846846846846847, 0.6846846846846847, 0.6846846846846847, 0.6846846846846847, 0.6846846846846847, 0.6846846846846847, 0.8108108108108109, 0.6936936936936937, 0.6846846846846847, 0.7117117117117117, 0.6846846846846847, 0.6756756756756757, 0.6756756756756757, 0.6756756756756757, 0.6756756756756757, 0.6756756756756757, 0.6756756756756757, 0.6756756756756757, 0.6756756756756757, 0.6756756756756757, 0.6756756756756757, 0.6846846846846847, 0.6846846846846847, 0.7117117117117117, 0.8828828828828829], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/CALCOCO1.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "CALCOCO1", "n_seqs": 105, "length": 621, "gap_rates": [0.44761904761904764, 0.3523809523809524, 0.3523809523809524, 0.3523809523809524, 0.3523809523809524, 0.3523809523809524, 0.3523809523809524, 0.3523809523809524, 0.3523809523809524, 0.34285714285714286, 0.34285714285714286, 0.34285714285714286, 0.3333333333333333, 0.3333333333333333, 0.3333333333333333, 0.3333333333333333, 0.3142857142857143, 0.3047619047619048, 0.3047619047619048, 0.3047619047619048, 0.2761904761904762, 0.2761904761904762, 0.26666666666666666, 0.29523809523809524, 0.26666666666666666, 0.26666666666666666, 0.2761904761904762, 0.2571428571428571, 0.2571428571428571, 0.2571428571428571, 0.2571428571428571, 0.2571428571428571, 0.2571428571428571, 0.2571428571428571, 0.24761904761904763, 0.24761904761904763, 0.24761904761904763, 0.23809523809523808, 0.23809523809523808, 0.21904761904761905, 0.21904761904761905, 0.21904761904761905, 0.22857142857142856, 0.22857142857142856, 0.22857142857142856, 0.22857142857142856, 0.22857142857142856, 0.22857142857142856, 0.23809523809523808, 0.23809523809523808, 0.22857142857142856, 0.22857142857142856, 0.22857142857142856, 0.22857142857142856, 0.23809523809523808, 0.24761904761904763, 0.23809523809523808, 0.2761904761904762, 0.2761904761904762, 0.26666666666666666, 0.2571428571428571, 0.26666666666666666, 0.2571428571428571, 0.2857142857142857, 0.29523809523809524, 0.3142857142857143, 0.29523809523809524, 0.2571428571428571, 0.24761904761904763, 0.22857142857142856, 0.21904761904761905, 0.21904761904761905, 0.21904761904761905, 0.23809523809523808, 0.23809523809523808, 0.23809523809523808, 0.23809523809523808, 0.23809523809523808, 0.23809523809523808, 0.2571428571428571, 0.3619047619047619, 0.26666666666666666, 0.24761904761904763, 0.23809523809523808, 0.23809523809523808, 0.23809523809523808, 0.23809523809523808, 0.23809523809523808, 0.23809523809523808, 0.23809523809523808, 0.23809523809523808, 0.23809523809523808, 0.23809523809523808, 0.23809523809523808, 0.22857142857142856, 0.22857142857142856, 0.22857142857142856, 0.22857142857142856, 0.22857142857142856, 0.22857142857142856, 0.22857142857142856, 0.22857142857142856, 0.22857142857142856, 0.23809523809523808, 0.2571428571428571, 0.2761904761904762, 0.3904761904761905, 0.4095238095238095, 0.45714285714285713, 0.45714285714285713, 0.45714285714285713, 0.4380952380952381, 0.45714285714285713, 0.44761904761904764, 0.45714285714285713, 0.4666666666666667, 0.47619047619047616, 0.49523809523809526, 0.49523809523809526, 0.8761904761904762, 0.8952380952380953, 0.9047619047619048, 0.9238095238095239, 0.8095238095238095, 0.6285714285714286, 0.5619047619047619, 0.5142857142857142, 0.49523809523809526, 0.47619047619047616, 0.4857142857142857, 0.4857142857142857, 0.4857142857142857, 0.4857142857142857, 0.4857142857142857, 0.4857142857142857, 0.5047619047619047, 0.5047619047619047, 0.5142857142857142, 0.5142857142857142, 0.5047619047619047, 0.49523809523809526, 0.49523809523809526, 0.4857142857142857, 0.49523809523809526, 0.49523809523809526, 0.49523809523809526, 0.49523809523809526, 0.49523809523809526, 0.49523809523809526, 0.49523809523809526, 0.5047619047619047, 0.5047619047619047, 0.5047619047619047, 0.5047619047619047, 0.5047619047619047, 0.5047619047619047, 0.49523809523809526, 0.8476190476190476, 0.8476190476190476, 0.8380952380952381, 0.8285714285714286, 0.8095238095238095, 0.7619047619047619, 0.7619047619047619, 0.7619047619047619, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.7619047619047619, 0.7523809523809524, 0.7619047619047619, 0.7619047619047619, 0.7428571428571429, 0.7428571428571429, 0.7428571428571429, 0.7523809523809524, 0.47619047619047616, 0.47619047619047616, 0.45714285714285713, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.4380952380952381, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.4666666666666667, 0.45714285714285713, 0.45714285714285713, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.45714285714285713, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.44761904761904764, 0.45714285714285713, 0.45714285714285713, 0.45714285714285713, 0.45714285714285713, 0.45714285714285713, 0.47619047619047616, 0.47619047619047616, 0.4857142857142857, 0.47619047619047616, 0.47619047619047616, 0.47619047619047616, 0.47619047619047616, 0.47619047619047616, 0.47619047619047616, 0.47619047619047616, 0.47619047619047616, 0.4666666666666667, 0.4666666666666667, 0.4666666666666667, 0.45714285714285713, 0.45714285714285713, 0.45714285714285713, 0.45714285714285713, 0.45714285714285713, 0.44761904761904764, 0.45714285714285713, 0.45714285714285713, 0.45714285714285713, 0.45714285714285713, 0.45714285714285713, 0.45714285714285713, 0.47619047619047616, 0.4666666666666667, 0.4666666666666667, 0.4666666666666667, 0.4666666666666667, 0.4666666666666667, 0.4666666666666667, 0.4666666666666667, 0.4666666666666667, 0.4666666666666667, 0.4666666666666667, 0.47619047619047616, 0.47619047619047616, 0.4857142857142857, 0.49523809523809526, 0.49523809523809526, 0.49523809523809526, 0.49523809523809526, 0.49523809523809526, 0.49523809523809526, 0.49523809523809526, 0.47619047619047616, 0.47619047619047616, 0.49523809523809526, 0.49523809523809526, 0.4857142857142857, 0.49523809523809526, 0.5142857142857142, 0.5238095238095238, 0.6857142857142857, 0.6952380952380952, 0.6952380952380952, 0.6952380952380952, 0.6952380952380952, 0.6952380952380952, 0.6857142857142857, 0.5047619047619047, 0.49523809523809526, 0.5047619047619047, 0.5047619047619047, 0.5047619047619047, 0.5142857142857142, 0.5142857142857142, 0.5238095238095238, 0.5238095238095238, 0.5142857142857142, 0.5047619047619047, 0.5047619047619047, 0.5047619047619047, 0.5047619047619047, 0.5047619047619047, 0.5047619047619047, 0.5333333333333333, 0.5428571428571428, 0.5333333333333333, 0.5333333333333333, 0.5333333333333333, 0.5333333333333333, 0.5333333333333333, 0.5333333333333333, 0.5428571428571428, 0.5333333333333333, 0.5333333333333333, 0.5333333333333333, 0.5333333333333333, 0.5333333333333333, 0.5428571428571428, 0.5714285714285714, 0.5619047619047619, 0.5619047619047619, 0.5619047619047619, 0.5523809523809524, 0.5523809523809524, 0.5523809523809524, 0.5523809523809524, 0.5619047619047619, 0.5619047619047619, 0.5619047619047619, 0.5619047619047619, 0.5619047619047619, 0.5619047619047619, 0.5714285714285714, 0.5714285714285714, 0.580952380952381, 0.580952380952381, 0.580952380952381, 0.5714285714285714, 0.5714285714285714, 0.5714285714285714, 0.5714285714285714, 0.5714285714285714, 0.580952380952381, 0.580952380952381, 0.5904761904761905, 0.5904761904761905, 0.5904761904761905, 0.5904761904761905, 0.5904761904761905, 0.5904761904761905, 0.5904761904761905, 0.6, 0.5904761904761905, 0.9428571428571428, 0.6, 0.9428571428571428, 0.9333333333333333, 0.580952380952381, 0.5904761904761905, 0.5714285714285714, 0.9428571428571428, 0.5714285714285714, 0.5619047619047619, 0.5619047619047619, 0.5619047619047619, 0.9238095238095239, 0.9333333333333333, 0.9238095238095239, 0.5428571428571428, 0.5428571428571428, 0.5428571428571428, 0.5428571428571428, 0.5428571428571428, 0.5428571428571428, 0.5428571428571428, 0.5428571428571428, 0.5428571428571428, 0.5428571428571428, 0.5428571428571428, 0.5428571428571428, 0.5523809523809524, 0.5619047619047619, 0.5714285714285714, 0.5714285714285714, 0.5714285714285714, 0.5714285714285714, 0.5714285714285714, 0.5714285714285714, 0.580952380952381, 0.580952380952381, 0.580952380952381, 0.580952380952381, 0.580952380952381, 0.5904761904761905, 0.5904761904761905, 0.5904761904761905, 0.5904761904761905, 0.6095238095238096, 0.6095238095238096, 0.6095238095238096, 0.6095238095238096, 0.6095238095238096, 0.6190476190476191, 0.6190476190476191, 0.6190476190476191, 0.6190476190476191, 0.6190476190476191, 0.6190476190476191, 0.6190476190476191, 0.6190476190476191, 0.6190476190476191, 0.6190476190476191, 0.6285714285714286, 0.6285714285714286, 0.6285714285714286, 0.6285714285714286, 0.6285714285714286, 0.6285714285714286, 0.638095238095238, 0.638095238095238, 0.6476190476190476, 0.638095238095238, 0.638095238095238, 0.638095238095238, 0.638095238095238, 0.6476190476190476, 0.6666666666666666, 0.6761904761904762, 0.6857142857142857, 0.6857142857142857, 0.7619047619047619, 0.7619047619047619, 0.7428571428571429, 0.7428571428571429, 0.7428571428571429, 0.7523809523809524, 0.7523809523809524, 0.7523809523809524, 0.7523809523809524, 0.7523809523809524, 0.7523809523809524, 0.7619047619047619, 0.7714285714285715, 0.780952380952381, 0.780952380952381, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.7714285714285715, 0.780952380952381, 0.780952380952381, 0.780952380952381, 0.780952380952381, 0.780952380952381, 0.7904761904761904, 0.7904761904761904, 0.7904761904761904, 0.7904761904761904, 0.7904761904761904, 0.7904761904761904, 0.7904761904761904, 0.7904761904761904, 0.7904761904761904, 0.7904761904761904, 0.7904761904761904, 0.7904761904761904, 0.8, 0.8, 0.8, 0.8, 0.8, 0.8, 0.8, 0.8095238095238095, 0.8095238095238095, 0.8095238095238095, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.819047619047619, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.819047619047619, 0.819047619047619, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8285714285714286, 0.8380952380952381, 0.8571428571428571, 0.8571428571428571, 0.8476190476190476, 0.8476190476190476, 0.8476190476190476, 0.8476190476190476, 0.8476190476190476, 0.8476190476190476, 0.8476190476190476, 0.8476190476190476, 0.8476190476190476, 0.8476190476190476, 0.8476190476190476, 0.8476190476190476, 0.8476190476190476, 0.8476190476190476, 0.8857142857142857, 0.8857142857142857, 0.8857142857142857, 0.8857142857142857, 0.8857142857142857, 0.8857142857142857, 0.8952380952380953, 0.8857142857142857, 0.8761904761904762, 0.9047619047619048, 0.9047619047619048, 0.9047619047619048, 0.8380952380952381, 0.8571428571428571, 0.8476190476190476, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8476190476190476, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.9142857142857143, 0.9142857142857143, 0.9142857142857143, 0.9142857142857143, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.9428571428571428, 0.9428571428571428, 0.8476190476190476, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8571428571428571, 0.8571428571428571, 0.8761904761904762, 0.8476190476190476, 0.8476190476190476, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8380952380952381, 0.8952380952380953, 0.8952380952380953, 0.9142857142857143, 0.8952380952380953, 0.8952380952380953, 0.8380952380952381, 0.8666666666666667, 0.8761904761904762, 0.8857142857142857, 0.9047619047619048, 0.9142857142857143, 0.9428571428571428], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/CCP_MauG.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "CCP_MauG", "n_seqs": 1098, "length": 258, "gap_rates": [0.38524590163934425, 0.16393442622950818, 0.08561020036429873, 0.06375227686703097, 0.05737704918032787, 0.04189435336976321, 0.04189435336976321, 0.04007285974499089, 0.039162112932604735, 0.039162112932604735, 0.039162112932604735, 0.039162112932604735, 0.058287795992714025, 0.04918032786885246, 0.04644808743169399, 0.04553734061930783, 0.04553734061930783, 0.037340619307832425, 0.03551912568306011, 0.042805100182149364, 0.031876138433515486, 0.026411657559198543, 0.025500910746812388, 0.025500910746812388, 0.02459016393442623, 0.02459016393442623, 0.02459016393442623, 0.02459016393442623, 0.056466302367941715, 0.06284153005464481, 0.044626593806921674, 0.030054644808743168, 0.02459016393442623, 0.025500910746812388, 0.031876138433515486, 0.040983606557377046, 0.9289617486338798, 0.9426229508196722, 0.924408014571949, 0.04553734061930783, 0.04007285974499089, 0.8351548269581056, 0.04189435336976321, 0.03825136612021858, 0.03825136612021858, 0.03642987249544627, 0.9153005464480874, 0.918943533697632, 0.930783242258652, 0.9408014571948998, 0.9499089253187614, 0.9444444444444444, 0.936247723132969, 0.9234972677595629, 0.9162112932604736, 0.9143897996357013, 0.04735883424408015, 0.8342440801457195, 0.930783242258652, 0.9480874316939891, 0.9171220400728597, 0.7577413479052824, 0.13114754098360656, 0.12750455373406194, 0.0947176684881603, 0.0883424408014572, 0.08469945355191257, 0.03278688524590164, 0.9316939890710383, 0.9326047358834244, 0.9326047358834244, 0.9335154826958105, 0.936247723132969, 0.9408014571948998, 0.9453551912568307, 0.9471766848816029, 0.9453551912568307, 0.9435336976320583, 0.9398907103825137, 0.9335154826958105, 0.9326047358834244, 0.9326047358834244, 0.9326047358834244, 0.9316939890710383, 0.03278688524590164, 0.030965391621129327, 0.030965391621129327, 0.031876138433515486, 0.031876138433515486, 0.031876138433515486, 0.031876138433515486, 0.031876138433515486, 0.03278688524590164, 0.04189435336976321, 0.042805100182149364, 0.04553734061930783, 0.03278688524590164, 0.8105646630236795, 0.8825136612021858, 0.8843351548269581, 0.8879781420765027, 0.8888888888888888, 0.8916211293260473, 0.9225865209471766, 0.8888888888888888, 0.8888888888888888, 0.8870673952641166, 0.8825136612021858, 0.8806921675774135, 0.8014571948998178, 0.03278688524590164, 0.03278688524590164, 0.03278688524590164, 0.03278688524590164, 0.03278688524590164, 0.03460837887067395, 0.03460837887067395, 0.03460837887067395, 0.03460837887067395, 0.8843351548269581, 0.8861566484517304, 0.8870673952641166, 0.9034608378870674, 0.9061930783242259, 0.907103825136612, 0.9080145719489982, 0.9080145719489982, 0.9089253187613844, 0.9116575591985429, 0.9234972677595629, 0.9253187613843351, 0.9171220400728597, 0.9089253187613844, 0.9089253187613844, 0.9080145719489982, 0.907103825136612, 0.907103825136612, 0.9052823315118397, 0.9016393442622951, 0.8870673952641166, 0.8861566484517304, 0.8615664845173042, 0.03278688524590164, 0.03278688524590164, 0.03278688524590164, 0.033697632058287796, 0.03551912568306011, 0.037340619307832425, 0.056466302367941715, 0.06739526411657559, 0.06375227686703097, 0.06375227686703097, 0.06830601092896176, 0.06648451730418943, 0.06830601092896176, 0.06830601092896176, 0.0692167577413479, 0.07012750455373407, 0.900728597449909, 0.900728597449909, 0.9025500910746812, 0.9171220400728597, 0.924408014571949, 0.9316939890710383, 0.9353369763205829, 0.9444444444444444, 0.9489981785063752, 0.9471766848816029, 0.9398907103825137, 0.9335154826958105, 0.9316939890710383, 0.9198542805100182, 0.9134790528233151, 0.900728597449909, 0.900728597449909, 0.900728597449909, 0.08014571948998178, 0.9143897996357013, 0.6174863387978142, 0.09927140255009108, 0.08743169398907104, 0.08561020036429873, 0.08378870673952642, 0.07923497267759563, 0.07923497267759563, 0.08014571948998178, 0.08196721311475409, 0.08287795992714025, 0.08287795992714025, 0.08105646630236794, 0.09198542805100182, 0.1111111111111111, 0.1703096539162113, 0.11293260473588343, 0.08743169398907104, 0.08743169398907104, 0.08743169398907104, 0.08652094717668488, 0.08652094717668488, 0.08743169398907104, 0.08652094717668488, 0.08652094717668488, 0.08652094717668488, 0.0883424408014572, 0.5163934426229508, 0.7495446265938069, 0.8233151183970856, 0.9234972677595629, 0.9398907103825137, 0.9426229508196722, 0.9453551912568307, 0.9499089253187614, 0.9480874316939891, 0.9426229508196722, 0.941712204007286, 0.9344262295081968, 0.9089253187613844, 0.7777777777777778, 0.5774134790528234, 0.24863387978142076, 0.08652094717668488, 0.13570127504553733, 0.1029143897996357, 0.0883424408014572, 0.08743169398907104, 0.08743169398907104, 0.08743169398907104, 0.08743169398907104, 0.08743169398907104, 0.08743169398907104, 0.08743169398907104, 0.08743169398907104, 0.08743169398907104, 0.08743169398907104, 0.0883424408014572, 0.0883424408014572, 0.0883424408014572, 0.9162112932604736, 0.11566484517304189, 0.11566484517304189, 0.12750455373406194, 0.10564663023679417, 0.10837887067395265, 0.18032786885245902, 0.9107468123861566, 0.9480874316939891, 0.9098360655737705, 0.09198542805100182, 0.09198542805100182, 0.09198542805100182, 0.09198542805100182, 0.09562841530054644, 0.12112932604735883, 0.13114754098360656, 0.16848816029143898, 0.19489981785063754, 0.2604735883424408, 0.45719489981785066], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/CD225.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "CD225", "n_seqs": 478, "length": 71, "gap_rates": [0.6171548117154811, 0.26569037656903766, 0.2489539748953975, 0.10460251046025104, 0.08786610878661087, 0.06694560669456066, 0.05230125523012552, 0.0397489539748954, 0.029288702928870293, 0.029288702928870293, 0.029288702928870293, 0.03347280334728033, 0.02510460251046025, 0.02510460251046025, 0.058577405857740586, 0.7635983263598326, 0.7719665271966527, 0.7552301255230126, 0.08158995815899582, 0.02510460251046025, 0.029288702928870293, 0.28870292887029286, 0.22594142259414227, 0.01882845188284519, 0.01882845188284519, 0.01882845188284519, 0.01882845188284519, 0.01882845188284519, 0.01882845188284519, 0.01882845188284519, 0.016736401673640166, 0.014644351464435146, 0.010460251046025104, 0.016736401673640166, 0.02510460251046025, 0.03138075313807531, 0.03556485355648536, 0.03556485355648536, 0.0397489539748954, 0.0397489539748954, 0.043933054393305436, 0.04184100418410042, 0.04184100418410042, 0.04184100418410042, 0.043933054393305436, 0.043933054393305436, 0.043933054393305436, 0.043933054393305436, 0.043933054393305436, 0.043933054393305436, 0.043933054393305436, 0.043933054393305436, 0.04602510460251046, 0.04602510460251046, 0.04602510460251046, 0.0502092050209205, 0.0502092050209205, 0.05230125523012552, 0.0502092050209205, 0.0502092050209205, 0.05230125523012552, 0.056485355648535567, 0.056485355648535567, 0.058577405857740586, 0.058577405857740586, 0.06485355648535565, 0.07322175732217573, 0.10669456066945607, 0.16527196652719664, 0.3138075313807531, 0.7071129707112971], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/CHDNT.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "CHDNT", "n_seqs": 101, "length": 54, "gap_rates": [0.6435643564356436, 0.25742574257425743, 0.1485148514851485, 0.04950495049504951, 0.04950495049504951, 0.04950495049504951, 0.04950495049504951, 0.04950495049504951, 0.04950495049504951, 0.04950495049504951, 0.04950495049504951, 0.039603960396039604, 0.04950495049504951, 0.039603960396039604, 0.0297029702970297, 0.0297029702970297, 0.0297029702970297, 0.0297029702970297, 0.0297029702970297, 0.0297029702970297, 0.0297029702970297, 0.019801980198019802, 0.019801980198019802, 0.019801980198019802, 0.019801980198019802, 0.019801980198019802, 0.019801980198019802, 0.019801980198019802, 0.019801980198019802, 0.019801980198019802, 0.019801980198019802, 0.019801980198019802, 0.0297029702970297, 0.0297029702970297, 0.009900990099009901, 0.009900990099009901, 0.009900990099009901, 0.009900990099009901, 0.009900990099009901, 0.009900990099009901, 0.009900990099009901, 0.009900990099009901, 0.009900990099009901, 0.009900990099009901, 0.009900990099009901, 0.009900990099009901, 0.009900990099009901, 0.009900990099009901, 0.009900990099009901, 0.009900990099009901, 0.019801980198019802, 0.0891089108910891, 0.13861386138613863, 0.22772277227722773], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/CHGN.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "CHGN", "n_seqs": 408, "length": 652, "gap_rates": [0.6838235294117647, 0.6151960784313726, 0.5955882352941176, 0.5955882352941176, 0.5931372549019608, 0.5906862745098039, 0.5759803921568627, 0.5686274509803921, 0.5612745098039216, 0.5563725490196079, 0.553921568627451, 0.5465686274509803, 0.5441176470588235, 0.5441176470588235, 0.5416666666666666, 0.5392156862745098, 0.5343137254901961, 0.5318627450980392, 0.5318627450980392, 0.5269607843137255, 0.5269607843137255, 0.5269607843137255, 0.5294117647058824, 0.5318627450980392, 0.5269607843137255, 0.5269607843137255, 0.5269607843137255, 0.5269607843137255, 0.5269607843137255, 0.5269607843137255, 0.5269607843137255, 0.5245098039215687, 0.5269607843137255, 0.5220588235294118, 0.5147058823529411, 0.48284313725490197, 0.4877450980392157, 0.49019607843137253, 0.49019607843137253, 0.49019607843137253, 0.49019607843137253, 0.49019607843137253, 0.49019607843137253, 0.5759803921568627, 0.49264705882352944, 0.5588235294117647, 0.6078431372549019, 0.5833333333333334, 0.5833333333333334, 0.678921568627451, 0.6495098039215687, 0.6348039215686274, 0.8088235294117647, 0.7573529411764706, 0.7450980392156863, 0.7279411764705882, 0.5024509803921569, 0.5245098039215687, 0.5049019607843137, 0.9411764705882353, 0.8872549019607843, 0.4950980392156863, 0.49264705882352944, 0.47549019607843135, 0.47549019607843135, 0.4730392156862745, 0.4730392156862745, 0.47058823529411764, 0.47058823529411764, 0.47058823529411764, 0.47058823529411764, 0.47058823529411764, 0.47058823529411764, 0.47058823529411764, 0.47058823529411764, 0.4730392156862745, 0.4730392156862745, 0.47058823529411764, 0.45588235294117646, 0.4534313725490196, 0.44607843137254904, 0.44362745098039214, 0.44362745098039214, 0.44362745098039214, 0.44362745098039214, 0.44362745098039214, 0.4411764705882353, 0.4411764705882353, 0.4411764705882353, 0.4338235294117647, 0.4264705882352941, 0.4166666666666667, 0.40931372549019607, 0.39705882352941174, 0.3872549019607843, 0.37745098039215685, 0.375, 0.37254901960784315, 0.36764705882352944, 0.3627450980392157, 0.3627450980392157, 0.3627450980392157, 0.3627450980392157, 0.3602941176470588, 0.3627450980392157, 0.36519607843137253, 0.36519607843137253, 0.3700980392156863, 0.37745098039215685, 0.37745098039215685, 0.38235294117647056, 0.38480392156862747, 0.40931372549019607, 0.43137254901960786, 0.42892156862745096, 0.4264705882352941, 0.45098039215686275, 0.46078431372549017, 0.5147058823529411, 0.5171568627450981, 0.5, 0.7941176470588235, 0.8112745098039216, 0.8186274509803921, 0.821078431372549, 0.821078431372549, 0.8235294117647058, 0.8284313725490197, 0.8357843137254902, 0.8504901960784313, 0.8529411764705882, 0.8799019607843137, 0.8921568627450981, 0.9313725490196079, 0.9387254901960784, 0.946078431372549, 0.9485294117647058, 0.9411764705882353, 0.9338235294117647, 0.9240196078431373, 0.8848039215686274, 0.8578431372549019, 0.8504901960784313, 0.8357843137254902, 0.8333333333333334, 0.8284313725490197, 0.821078431372549, 0.821078431372549, 0.8186274509803921, 0.8112745098039216, 0.8063725490196079, 0.7818627450980392, 0.4387254901960784, 0.44362745098039214, 0.4264705882352941, 0.4264705882352941, 0.4215686274509804, 0.4166666666666667, 0.40931372549019607, 0.3897058823529412, 0.37745098039215685, 0.38235294117647056, 0.39215686274509803, 0.6470588235294118, 0.6372549019607843, 0.6274509803921569, 0.39705882352941174, 0.3799019607843137, 0.3799019607843137, 0.3700980392156863, 0.36519607843137253, 0.36519607843137253, 0.36764705882352944, 0.36764705882352944, 0.36519607843137253, 0.3627450980392157, 0.3627450980392157, 0.36764705882352944, 0.36764705882352944, 0.36764705882352944, 0.4387254901960784, 0.36764705882352944, 0.36764705882352944, 0.36764705882352944, 0.36764705882352944, 0.36764705882352944, 0.3700980392156863, 0.36764705882352944, 0.37745098039215685, 0.37254901960784315, 0.375, 0.8823529411764706, 0.9166666666666666, 0.7671568627450981, 0.37745098039215685, 0.9142156862745098, 0.3700980392156863, 0.36764705882352944, 0.36764705882352944, 0.36764705882352944, 0.3627450980392157, 0.3602941176470588, 0.34558823529411764, 0.31862745098039214, 0.2965686274509804, 0.29411764705882354, 0.2916666666666667, 0.29411764705882354, 0.34068627450980393, 0.2867647058823529, 0.2818627450980392, 0.27941176470588236, 0.2769607843137255, 0.27941176470588236, 0.27941176470588236, 0.27450980392156865, 0.27205882352941174, 0.27450980392156865, 0.27450980392156865, 0.27450980392156865, 0.2769607843137255, 0.2769607843137255, 0.32107843137254904, 0.31862745098039214, 0.3137254901960784, 0.3014705882352941, 0.571078431372549, 0.4632352941176471, 0.42892156862745096, 0.30392156862745096, 0.27450980392156865, 0.2696078431372549, 0.2696078431372549, 0.26715686274509803, 0.2647058823529412, 0.26715686274509803, 0.2647058823529412, 0.2647058823529412, 0.2647058823529412, 0.2622549019607843, 0.25735294117647056, 0.25735294117647056, 0.25735294117647056, 0.25735294117647056, 0.2696078431372549, 0.2647058823529412, 0.25735294117647056, 0.25980392156862747, 0.25735294117647056, 0.25735294117647056, 0.2549019607843137, 0.2549019607843137, 0.2549019607843137, 0.2549019607843137, 0.2549019607843137, 0.25245098039215685, 0.25245098039215685, 0.25245098039215685, 0.2549019607843137, 0.8553921568627451, 0.2818627450980392, 0.3627450980392157, 0.33578431372549017, 0.6299019607843137, 0.9411764705882353, 0.6372549019607843, 0.625, 0.6911764705882353, 0.6102941176470589, 0.47058823529411764, 0.37254901960784315, 0.3480392156862745, 0.2549019607843137, 0.24754901960784315, 0.2426470588235294, 0.23774509803921567, 0.23774509803921567, 0.25, 0.2426470588235294, 0.2426470588235294, 0.24019607843137256, 0.23774509803921567, 0.24019607843137256, 0.23774509803921567, 0.23529411764705882, 0.23529411764705882, 0.23529411764705882, 0.23774509803921567, 0.6740196078431373, 0.6813725490196079, 0.6642156862745098, 0.6936274509803921, 0.7009803921568627, 0.7083333333333334, 0.7230392156862745, 0.7303921568627451, 0.7303921568627451, 0.7450980392156863, 0.7475490196078431, 0.7475490196078431, 0.7524509803921569, 0.7622549019607843, 0.7745098039215687, 0.8014705882352942, 0.8259803921568627, 0.8406862745098039, 0.8823529411764706, 0.8921568627450981, 0.946078431372549, 0.8897058823529411, 0.8529411764705882, 0.8284313725490197, 0.8137254901960784, 0.7794117647058824, 0.7696078431372549, 0.7524509803921569, 0.75, 0.7475490196078431, 0.7475490196078431, 0.7352941176470589, 0.7303921568627451, 0.7279411764705882, 0.7230392156862745, 0.7083333333333334, 0.7009803921568627, 0.6911764705882353, 0.6495098039215687, 0.7328431372549019, 0.5318627450980392, 0.3161764705882353, 0.27205882352941174, 0.23039215686274508, 0.23039215686274508, 0.22058823529411764, 0.2181372549019608, 0.21323529411764705, 0.2034313725490196, 0.2034313725490196, 0.19852941176470587, 0.19362745098039216, 0.19362745098039216, 0.19362745098039216, 0.19362745098039216, 0.18872549019607843, 0.18872549019607843, 0.19117647058823528, 0.19117647058823528, 0.19117647058823528, 0.19362745098039216, 0.946078431372549, 0.7769607843137255, 0.19607843137254902, 0.19607843137254902, 0.19607843137254902, 0.19362745098039216, 0.19362745098039216, 0.19607843137254902, 0.19607843137254902, 0.19607843137254902, 0.19607843137254902, 0.19117647058823528, 0.19117647058823528, 0.18627450980392157, 0.18137254901960784, 0.18872549019607843, 0.2034313725490196, 0.20833333333333334, 0.2034313725490196, 0.21568627450980393, 0.23774509803921567, 0.20098039215686275, 0.9019607843137255, 0.18627450980392157, 0.18627450980392157, 0.7230392156862745, 0.18627450980392157, 0.18627450980392157, 0.18627450980392157, 0.18627450980392157, 0.19117647058823528, 0.18872549019607843, 0.18872549019607843, 0.18872549019607843, 0.18872549019607843, 0.7965686274509803, 0.8406862745098039, 0.9068627450980392, 0.8627450980392157, 0.8284313725490197, 0.7818627450980392, 0.4730392156862745, 0.47794117647058826, 0.9191176470588235, 0.40441176470588236, 0.22303921568627452, 0.22058823529411764, 0.22303921568627452, 0.22794117647058823, 0.21568627450980393, 0.2034313725490196, 0.21323529411764705, 0.2181372549019608, 0.22549019607843138, 0.23039215686274508, 0.22303921568627452, 0.2181372549019608, 0.23284313725490197, 0.25245098039215685, 0.27205882352941174, 0.24754901960784315, 0.24509803921568626, 0.25980392156862747, 0.2769607843137255, 0.3112745098039216, 0.2965686274509804, 0.8897058823529411, 0.8529411764705882, 0.25, 0.2107843137254902, 0.18872549019607843, 0.18627450980392157, 0.18137254901960784, 0.17892156862745098, 0.17401960784313725, 0.8921568627450981, 0.9166666666666666, 0.9313725490196079, 0.9387254901960784, 0.9411764705882353, 0.9362745098039216, 0.928921568627451, 0.9093137254901961, 0.8823529411764706, 0.678921568627451, 0.18382352941176472, 0.18382352941176472, 0.17647058823529413, 0.17401960784313725, 0.17401960784313725, 0.17401960784313725, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.16911764705882354, 0.16911764705882354, 0.16911764705882354, 0.16911764705882354, 0.17401960784313725, 0.9362745098039216, 0.6642156862745098, 0.16911764705882354, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.16911764705882354, 0.17401960784313725, 0.17401960784313725, 0.17401960784313725, 0.17401960784313725, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.17647058823529413, 0.17892156862745098, 0.17892156862745098, 0.17401960784313725, 0.18382352941176472, 0.18382352941176472, 0.17647058823529413, 0.17401960784313725, 0.1715686274509804, 0.17892156862745098, 0.18137254901960784, 0.16666666666666666, 0.16911764705882354, 0.16911764705882354, 0.16911764705882354, 0.16911764705882354, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.18872549019607843, 0.2622549019607843, 0.2696078431372549, 0.23284313725490197, 0.23284313725490197, 0.2426470588235294, 0.19362745098039216, 0.21323529411764705, 0.22303921568627452, 0.3946078431372549, 0.3946078431372549, 0.3946078431372549, 0.3946078431372549, 0.3553921568627451, 0.6053921568627451, 0.7426470588235294, 0.7034313725490197, 0.8848039215686274, 0.8970588235294118, 0.9142156862745098, 0.9215686274509803, 0.928921568627451, 0.9362745098039216, 0.9387254901960784, 0.9387254901960784, 0.9387254901960784, 0.9411764705882353, 0.946078431372549, 0.9411764705882353, 0.9411764705882353, 0.9387254901960784, 0.9387254901960784, 0.9387254901960784, 0.9362745098039216, 0.9240196078431373, 0.9191176470588235, 0.9142156862745098, 0.8897058823529411, 0.8578431372549019, 0.5490196078431373, 0.4681372549019608, 0.39705882352941174, 0.27941176470588236, 0.25245098039215685, 0.22549019607843138, 0.21568627450980393, 0.19607843137254902, 0.19362745098039216, 0.1715686274509804, 0.18627450980392157, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.17647058823529413, 0.17401960784313725, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.17401960784313725, 0.1715686274509804, 0.17401960784313725, 0.17401960784313725, 0.17401960784313725, 0.16911764705882354, 0.16911764705882354, 0.16911764705882354, 0.1715686274509804, 0.1715686274509804, 0.3799019607843137, 0.375, 0.3700980392156863, 0.18137254901960784, 0.18137254901960784, 0.18137254901960784, 0.17892156862745098, 0.8823529411764706, 0.875, 0.17892156862745098, 0.18137254901960784, 0.3112745098039216, 0.28431372549019607, 0.2867647058823529, 0.27450980392156865, 0.19852941176470587, 0.19607843137254902, 0.19607843137254902, 0.8406862745098039, 0.8553921568627451, 0.8676470588235294, 0.9068627450980392, 0.9093137254901961, 0.9411764705882353, 0.9436274509803921, 0.9485294117647058, 0.9411764705882353, 0.9387254901960784, 0.9093137254901961, 0.9068627450980392, 0.8627450980392157, 0.8431372549019608, 0.8406862745098039, 0.18137254901960784, 0.18137254901960784, 0.18382352941176472, 0.18137254901960784, 0.18382352941176472, 0.18627450980392157, 0.18627450980392157, 0.19117647058823528, 0.7254901960784313, 0.2034313725490196, 0.20098039215686275, 0.20098039215686275, 0.20588235294117646, 0.20588235294117646, 0.20833333333333334, 0.21323529411764705, 0.21323529411764705, 0.2181372549019608, 0.2181372549019608, 0.22058823529411764, 0.22303921568627452, 0.22058823529411764, 0.22058823529411764, 0.2181372549019608, 0.22058823529411764, 0.2181372549019608, 0.2181372549019608, 0.22794117647058823, 0.24754901960784315, 0.34068627450980393, 0.35049019607843135, 0.35049019607843135, 0.9362745098039216, 0.36519607843137253, 0.35784313725490197, 0.3553921568627451, 0.3602941176470588, 0.3700980392156863, 0.3700980392156863, 0.36519607843137253, 0.3627450980392157, 0.35784313725490197, 0.35784313725490197, 0.35784313725490197, 0.35784313725490197, 0.35784313725490197, 0.37254901960784315, 0.37254901960784315, 0.37254901960784315, 0.37745098039215685, 0.37745098039215685, 0.38235294117647056, 0.3872549019607843, 0.3872549019607843, 0.39950980392156865, 0.40931372549019607, 0.42401960784313725, 0.47058823529411764], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/CHMI.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "CHMI", "n_seqs": 119, "length": 135, "gap_rates": [0.058823529411764705, 0.008403361344537815, 0.008403361344537815, 0.008403361344537815, 0.008403361344537815, 0.008403361344537815, 0.008403361344537815, 0.008403361344537815, 0.008403361344537815, 0.008403361344537815, 0.008403361344537815, 0.8991596638655462, 0.01680672268907563, 0.8067226890756303, 0.008403361344537815, 0.8823529411764706, 0.008403361344537815, 0.7983193277310925, 0.01680672268907563, 0.9495798319327731, 0.008403361344537815, 0.008403361344537815, 0.01680672268907563, 0.008403361344537815, 0.008403361344537815, 0.01680672268907563, 0.008403361344537815, 0.008403361344537815, 0.008403361344537815, 0.03361344537815126, 0.01680672268907563, 0.03361344537815126, 0.06722689075630252, 0.08403361344537816, 0.15966386554621848, 0.058823529411764705, 0.01680672268907563, 0.8823529411764706, 0.8823529411764706, 0.9159663865546218, 0.8823529411764706, 0.8823529411764706, 0.025210084033613446, 0.01680672268907563, 0.01680672268907563, 0.008403361344537815, 0.008403361344537815, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.008403361344537815, 0.01680672268907563, 0.0, 0.0, 0.008403361344537815, 0.0, 0.0, 0.0, 0.07563025210084033, 0.23529411764705882, 0.15126050420168066, 0.3277310924369748, 0.06722689075630252, 0.008403361344537815, 0.04201680672268908, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.025210084033613446, 0.05042016806722689, 0.09243697478991597, 0.1092436974789916, 0.14285714285714285, 0.15966386554621848, 0.15966386554621848, 0.16806722689075632, 0.16806722689075632, 0.15966386554621848, 0.15966386554621848, 0.17647058823529413, 0.16806722689075632, 0.16806722689075632, 0.16806722689075632, 0.17647058823529413, 0.17647058823529413, 0.17647058823529413, 0.19327731092436976, 0.21008403361344538, 0.23529411764705882, 0.2857142857142857, 0.3277310924369748, 0.33613445378151263, 0.3949579831932773, 0.3865546218487395, 0.3865546218487395, 0.3949579831932773, 0.40336134453781514, 0.42857142857142855, 0.4369747899159664, 0.44537815126050423, 0.46218487394957986, 0.5378151260504201, 0.5966386554621849, 0.7647058823529411], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/CIMR.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "CIMR", "n_seqs": 613, "length": 173, "gap_rates": [0.7536704730831973, 0.5807504078303426, 0.3735725938009788, 0.15823817292006526, 0.10929853181076672, 0.09135399673735727, 0.0799347471451876, 0.0799347471451876, 0.0766721044045677, 0.07504078303425775, 0.0734094616639478, 0.0701468189233279, 0.06851549755301795, 0.06688417618270799, 0.06688417618270799, 0.3197389885807504, 0.2137030995106036, 0.06035889070146819, 0.8890701468189234, 0.9282218597063622, 0.8075040783034257, 0.05872756933115824, 0.05546492659053834, 0.05057096247960848, 0.04730831973898858, 0.04730831973898858, 0.053833605220228384, 0.04404567699836868, 0.04567699836867863, 0.601957585644372, 0.9396411092985318, 0.9265905383360522, 0.5611745513866232, 0.048939641109298535, 0.03425774877650897, 0.03262642740619902, 0.03099510603588907, 0.03262642740619902, 0.02936378466557912, 0.02773246329526917, 0.02936378466557912, 0.02936378466557912, 0.02936378466557912, 0.02936378466557912, 0.026101141924959218, 0.02773246329526917, 0.022838499184339316, 0.022838499184339316, 0.5481239804241436, 0.8172920065252854, 0.9184339314845025, 0.7797716150081566, 0.4437194127243067, 0.29200652528548127, 0.12561174551386622, 0.053833605220228384, 0.05872756933115824, 0.057096247960848286, 0.05057096247960848, 0.05057096247960848, 0.053833605220228384, 0.05546492659053834, 0.05872756933115824, 0.06851549755301795, 0.06851549755301795, 0.0766721044045677, 0.22022838499184338, 0.5464926590538336, 0.08972267536704731, 0.0799347471451876, 0.07177814029363784, 0.07177814029363784, 0.0701468189233279, 0.0734094616639478, 0.0766721044045677, 0.0766721044045677, 0.08972267536704731, 0.10929853181076672, 0.1468189233278956, 0.1631321370309951, 0.15823817292006526, 0.8743882544861338, 0.8988580750407831, 0.8482871125611745, 0.1533442088091354, 0.1272430668841762, 0.12561174551386622, 0.11419249592169657, 0.11745513866231648, 0.11256117455138662, 0.11745513866231648, 0.13376835236541598, 0.15171288743882544, 0.1729200652528548, 0.8776508972267537, 0.7259380097879282, 0.6378466557911908, 0.5530179445350734, 0.42251223491027734, 0.27732463295269166, 0.10766721044045677, 0.10440456769983687, 0.09951060358890701, 0.09951060358890701, 0.09951060358890701, 0.09951060358890701, 0.09951060358890701, 0.6394779771615008, 0.866231647634584, 0.9396411092985318, 0.9445350734094616, 0.9151712887438825, 0.7422512234910277, 0.5856443719412724, 0.300163132137031, 0.17944535073409462, 0.1631321370309951, 0.13050570962479607, 0.12071778140293637, 0.11419249592169657, 0.10929853181076672, 0.11256117455138662, 0.12071778140293637, 0.9265905383360522, 0.7781402936378466, 0.14355628058727568, 0.11582381729200653, 0.11745513866231648, 0.11419249592169657, 0.11745513866231648, 0.11908646003262642, 0.12234910277324633, 0.1402936378466558, 0.14845024469820556, 0.15171288743882544, 0.8172920065252854, 0.9168026101141925, 0.634584013050571, 0.1566068515497553, 0.16639477977161501, 0.16150081566068517, 0.9363784665579119, 0.9314845024469821, 0.15823817292006526, 0.1566068515497553, 0.15171288743882544, 0.15171288743882544, 0.1533442088091354, 0.1631321370309951, 0.17455138662316477, 0.16965742251223492, 0.16150081566068517, 0.16476345840130505, 0.16965742251223492, 0.17128874388254486, 0.17944535073409462, 0.9200652528548124, 0.6639477977161501, 0.18270799347471453, 0.18270799347471453, 0.18270799347471453, 0.18433931484502447, 0.1859706362153344, 0.18760195758564438, 0.19412724306688417, 0.19738988580750408, 0.22185970636215335, 0.2969004893964111, 0.3197389885807504, 0.33931484502446985, 0.3621533442088091, 0.38499184339314846, 0.7373572593800979], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/COX2_TM.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "COX2_TM", "n_seqs": 1073, "length": 92, "gap_rates": [0.7185461323392358, 0.6775396085740913, 0.5936626281453867, 0.5302889095992545, 0.4846225535880708, 0.451071761416589, 0.4147250698974837, 0.9450139794967382, 0.9459459459459459, 0.9450139794967382, 0.35787511649580617, 0.3429636533084809, 0.315004659832246, 0.30288909599254427, 0.2842497670083877, 0.25629077353215285, 0.22926374650512582, 0.22646784715750232, 0.2124883504193849, 0.2022367194780988, 0.19105312208760486, 0.15563839701770738, 0.14725069897483692, 0.13140726933830382, 0.12488350419384903, 0.11835973904939422, 0.11090400745573159, 0.09599254426840634, 0.08201304753028892, 0.05778191985088537, 0.032618825722273995, 0.02516309412861137, 0.022367194780987885, 0.023299161230195712, 0.0195712954333644, 0.017707362534948742, 0.01863932898415657, 0.0195712954333644, 0.017707362534948742, 0.016775396085740912, 0.014911463187325256, 0.014911463187325256, 0.009319664492078284, 0.008387698042870456, 0.007455731593662628, 0.005591798695246971, 0.0065237651444548, 0.008387698042870456, 0.0065237651444548, 0.009319664492078284, 0.06523765144454799, 0.06430568499534017, 0.045666356011183594, 0.036346691519105315, 0.033550792171481825, 0.033550792171481825, 0.010251630941286114, 0.009319664492078284, 0.009319664492078284, 0.08294501397949673, 0.021435228331780055, 0.43988816402609504, 0.07455731593662628, 0.021435228331780055, 0.0195712954333644, 0.0195712954333644, 0.0195712954333644, 0.0195712954333644, 0.6933830382106244, 0.0195712954333644, 0.0195712954333644, 0.0195712954333644, 0.0195712954333644, 0.021435228331780055, 0.022367194780987885, 0.022367194780987885, 0.023299161230195712, 0.022367194780987885, 0.022367194780987885, 0.024231127679403542, 0.02516309412861137, 0.024231127679403542, 0.02982292637465051, 0.0521901211556384, 0.07455731593662628, 0.13233923578751164, 0.157502329916123, 0.17893755824790308, 0.25256290773532153, 0.4594594594594595, 0.5731593662628145, 0.6710158434296365], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/CRM1_C.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "CRM1_C", "n_seqs": 445, "length": 341, "gap_rates": [0.30337078651685395, 0.2786516853932584, 0.27191011235955054, 0.26741573033707866, 0.25842696629213485, 0.25617977528089886, 0.25617977528089886, 0.24719101123595505, 0.23820224719101124, 0.23595505617977527, 0.23146067415730337, 0.2292134831460674, 0.2292134831460674, 0.2292134831460674, 0.2292134831460674, 0.22696629213483147, 0.22696629213483147, 0.22696629213483147, 0.22696629213483147, 0.22696629213483147, 0.22696629213483147, 0.2247191011235955, 0.2606741573033708, 0.25617977528089886, 0.24719101123595505, 0.24044943820224718, 0.24269662921348314, 0.23820224719101124, 0.23146067415730337, 0.23370786516853934, 0.23146067415730337, 0.2292134831460674, 0.2247191011235955, 0.2247191011235955, 0.22247191011235956, 0.20898876404494382, 0.20674157303370785, 0.20449438202247192, 0.2, 0.19550561797752808, 0.19325842696629214, 0.19101123595505617, 0.18876404494382024, 0.19101123595505617, 0.18651685393258427, 0.1842696629213483, 0.18202247191011237, 0.18202247191011237, 0.18202247191011237, 0.1842696629213483, 0.18202247191011237, 0.18202247191011237, 0.18202247191011237, 0.18202247191011237, 0.18202247191011237, 0.1842696629213483, 0.18651685393258427, 0.18651685393258427, 0.18651685393258427, 0.9101123595505618, 0.9168539325842696, 0.946067415730337, 0.9438202247191011, 0.9146067415730337, 0.9078651685393259, 0.20224719101123595, 0.2, 0.19550561797752808, 0.2, 0.19550561797752808, 0.18202247191011237, 0.1797752808988764, 0.1797752808988764, 0.1797752808988764, 0.1797752808988764, 0.1797752808988764, 0.18202247191011237, 0.18202247191011237, 0.17752808988764046, 0.1797752808988764, 0.19550561797752808, 0.1797752808988764, 0.1797752808988764, 0.1752808988764045, 0.1752808988764045, 0.1752808988764045, 0.17303370786516853, 0.1842696629213483, 0.9325842696629213, 0.1797752808988764, 0.1797752808988764, 0.1797752808988764, 0.1752808988764045, 0.1752808988764045, 0.1752808988764045, 0.1707865168539326, 0.1707865168539326, 0.1707865168539326, 0.1707865168539326, 0.1707865168539326, 0.1707865168539326, 0.1707865168539326, 0.16853932584269662, 0.16853932584269662, 0.16853932584269662, 0.16853932584269662, 0.16853932584269662, 0.16853932584269662, 0.16853932584269662, 0.17303370786516853, 0.17303370786516853, 0.1662921348314607, 0.1752808988764045, 0.1752808988764045, 0.17303370786516853, 0.1707865168539326, 0.16853932584269662, 0.15955056179775282, 0.15730337078651685, 0.1550561797752809, 0.15056179775280898, 0.15056179775280898, 0.14831460674157304, 0.14831460674157304, 0.14831460674157304, 0.13258426966292136, 0.1303370786516854, 0.12134831460674157, 0.10561797752808989, 0.08314606741573034, 0.0696629213483146, 0.060674157303370786, 0.0651685393258427, 0.0651685393258427, 0.060674157303370786, 0.06292134831460675, 0.060674157303370786, 0.060674157303370786, 0.058426966292134834, 0.0651685393258427, 0.0651685393258427, 0.058426966292134834, 0.058426966292134834, 0.058426966292134834, 0.058426966292134834, 0.060674157303370786, 0.060674157303370786, 0.060674157303370786, 0.060674157303370786, 0.058426966292134834, 0.058426966292134834, 0.056179775280898875, 0.056179775280898875, 0.058426966292134834, 0.060674157303370786, 0.06292134831460675, 0.058426966292134834, 0.056179775280898875, 0.056179775280898875, 0.056179775280898875, 0.060674157303370786, 0.058426966292134834, 0.058426966292134834, 0.058426966292134834, 0.0696629213483146, 0.060674157303370786, 0.0696629213483146, 0.06292134831460675, 0.07191011235955057, 0.07415730337078652, 0.060674157303370786, 0.06292134831460675, 0.060674157303370786, 0.060674157303370786, 0.060674157303370786, 0.060674157303370786, 0.060674157303370786, 0.0651685393258427, 0.0651685393258427, 0.06741573033707865, 0.06741573033707865, 0.0651685393258427, 0.08089887640449438, 0.06741573033707865, 0.0651685393258427, 0.0651685393258427, 0.0651685393258427, 0.06741573033707865, 0.06741573033707865, 0.06292134831460675, 0.0651685393258427, 0.0651685393258427, 0.06292134831460675, 0.06292134831460675, 0.06292134831460675, 0.060674157303370786, 0.0651685393258427, 0.0651685393258427, 0.06741573033707865, 0.09213483146067415, 0.09887640449438202, 0.10112359550561797, 0.10561797752808989, 0.10786516853932585, 0.10561797752808989, 0.9370786516853933, 0.7573033707865169, 0.46741573033707867, 0.29213483146067415, 0.1348314606741573, 0.1146067415730337, 0.11685393258426967, 0.11685393258426967, 0.11910112359550562, 0.11685393258426967, 0.11685393258426967, 0.11685393258426967, 0.12134831460674157, 0.12134831460674157, 0.12134831460674157, 0.11910112359550562, 0.1393258426966292, 0.13707865168539327, 0.11910112359550562, 0.12134831460674157, 0.11910112359550562, 0.11910112359550562, 0.11910112359550562, 0.11910112359550562, 0.12359550561797752, 0.12808988764044943, 0.12808988764044943, 0.1258426966292135, 0.12134831460674157, 0.12134831460674157, 0.1258426966292135, 0.13258426966292136, 0.13258426966292136, 0.1348314606741573, 0.13258426966292136, 0.1303370786516854, 0.13258426966292136, 0.1303370786516854, 0.13258426966292136, 0.13258426966292136, 0.13707865168539327, 0.13707865168539327, 0.13707865168539327, 0.1348314606741573, 0.13707865168539327, 0.13258426966292136, 0.13258426966292136, 0.14382022471910114, 0.14382022471910114, 0.18876404494382024, 0.19101123595505617, 0.2292134831460674, 0.25842696629213485, 0.9078651685393259, 0.9101123595505618, 0.9101123595505618, 0.9101123595505618, 0.9078651685393259, 0.19101123595505617, 0.18876404494382024, 0.18202247191011237, 0.1752808988764045, 0.17303370786516853, 0.1797752808988764, 0.1842696629213483, 0.18202247191011237, 0.39775280898876403, 0.4606741573033708, 0.7370786516853932, 0.9191011235955057, 0.5123595505617977, 0.44269662921348313, 0.3393258426966292, 0.3146067415730337, 0.2539325842696629, 0.24719101123595505, 0.21123595505617979, 0.21123595505617979, 0.19101123595505617, 0.18876404494382024, 0.19325842696629214, 0.19325842696629214, 0.18651685393258427, 0.1797752808988764, 0.1797752808988764, 0.17303370786516853, 0.17303370786516853, 0.17303370786516853, 0.1752808988764045, 0.1797752808988764, 0.1797752808988764, 0.1797752808988764, 0.1842696629213483, 0.22696629213483147, 0.19325842696629214, 0.18651685393258427, 0.1842696629213483, 0.18202247191011237, 0.18651685393258427, 0.18876404494382024, 0.18876404494382024, 0.1842696629213483, 0.1842696629213483, 0.1842696629213483, 0.1842696629213483, 0.1842696629213483, 0.18876404494382024, 0.18876404494382024, 0.18876404494382024, 0.19550561797752808, 0.19101123595505617, 0.19550561797752808, 0.20449438202247192, 0.19775280898876405, 0.946067415730337, 0.2157303370786517, 0.20224719101123595, 0.2, 0.2, 0.2, 0.20449438202247192, 0.20449438202247192, 0.20674157303370785, 0.20674157303370785, 0.20898876404494382, 0.20898876404494382, 0.20898876404494382, 0.2157303370786517, 0.2157303370786517, 0.2157303370786517, 0.21797752808988763, 0.2202247191011236, 0.2292134831460674, 0.25842696629213485, 0.30337078651685395, 0.6134831460674157], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}

pfam_gap_rates/CUB.gap.json

@@ -0,0 +1 @@
+{"family": "CUB", "n_seqs": 5000, "length": 126, "gap_rates": [0.3906, 0.387, 0.3818, 0.3642, 0.9048, 0.8248, 0.3066, 0.2726, 0.2308, 0.1856, 0.1524, 0.1296, 0.1154, 0.107, 0.1052, 0.1034, 0.0972, 0.0954, 0.09, 0.0874, 0.0962, 0.9296, 0.0884, 0.0746, 0.0664, 0.054, 0.0482, 0.0412, 0.0384, 0.0376, 0.0358, 0.0356, 0.0356, 0.0338, 0.0336, 0.0342, 0.034, 0.0334, 0.0338, 0.0334, 0.0452, 0.922, 0.0296, 0.028, 0.0274, 0.0278, 0.0264, 0.0292, 0.0294, 0.926, 0.0268, 0.0278, 0.0274, 0.0278, 0.3314, 0.3116, 0.2946, 0.2782, 0.8214, 0.91, 0.943, 0.871, 0.772, 0.0908, 0.1154, 0.043, 0.0402, 0.0394, 0.0376, 0.038, 0.04, 0.0432, 0.0468, 0.0476, 0.0534, 0.0564, 0.1706, 0.161, 0.9334, 0.8394, 0.2234, 0.1662, 0.1, 0.0876, 0.0782, 0.0674, 0.0652, 0.0662, 0.1042, 0.8804, 0.949, 0.9276, 0.7776, 0.0866, 0.0746, 0.0744, 0.074, 0.075, 0.074, 0.0756, 0.076, 0.0766, 0.1022, 0.0802, 0.0804, 0.0812, 0.081, 0.0814, 0.0826, 0.0836, 0.0872, 0.0896, 0.0962, 0.1134, 0.1222, 0.134, 0.1574, 0.1668, 0.172, 0.1776, 0.181, 0.1888, 0.2004, 0.2276, 0.2946, 0.3986], "gap_symbol": "-", "mismatch_seqs": 0}