Dataset Viewer
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Cannot get the split names for the config 'default' of the dataset.
Exception:    SplitsNotFoundError
Message:      The split names could not be parsed from the dataset config.
Traceback:    Traceback (most recent call last):
                File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/datasets/inspect.py", line 286, in get_dataset_config_info
                  for split_generator in builder._split_generators(
                                         ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~^
                      StreamingDownloadManager(base_path=builder.base_path, download_config=download_config)
                      ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
                  )
                  ^
                File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/datasets/packaged_modules/webdataset/webdataset.py", line 81, in _split_generators
                  first_examples = list(islice(pipeline, self.NUM_EXAMPLES_FOR_FEATURES_INFERENCE))
                File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/datasets/packaged_modules/webdataset/webdataset.py", line 32, in _get_pipeline_from_tar
                  fs: fsspec.AbstractFileSystem = fsspec.filesystem("memory")
                                                  ~~~~~~~~~~~~~~~~~^^^^^^^^^^
                File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/fsspec/registry.py", line 302, in filesystem
                  cls = get_filesystem_class(protocol)
                File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/fsspec/registry.py", line 239, in get_filesystem_class
                  raise ValueError(f"Protocol not known: {protocol}")
              ValueError: Protocol not known: memory
              
              The above exception was the direct cause of the following exception:
              
              Traceback (most recent call last):
                File "/src/services/worker/src/worker/job_runners/config/split_names.py", line 71, in compute_split_names_from_streaming_response
                  for split in get_dataset_split_names(
                               ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~^
                      path=dataset,
                      ^^^^^^^^^^^^^
                      config_name=config,
                      ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
                      token=hf_token,
                      ^^^^^^^^^^^^^^^
                  )
                  ^
                File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/datasets/inspect.py", line 340, in get_dataset_split_names
                  info = get_dataset_config_info(
                      path,
                  ...<6 lines>...
                      **config_kwargs,
                  )
                File "/usr/local/lib/python3.14/site-packages/datasets/inspect.py", line 291, in get_dataset_config_info
                  raise SplitsNotFoundError("The split names could not be parsed from the dataset config.") from err
              datasets.inspect.SplitsNotFoundError: The split names could not be parsed from the dataset config.

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🧬 SchemaBio Bundle

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📖 概述

本数据集是一个全面、精心整理的一站式注释库,专为生物信息学和基因组变异分析设计(如 WES/WGS 流水线)。它将核心的变异效应预测器、临床数据库和基因组参考文件整合到统一的资源库中,大幅减少数据收集、格式对齐和预处理的时间。

🗂️ 包含数据与来源

本资源库包含以下类别的数据:

  1. 变异效应预测器与评分: AlphaMissense、EVOScore2、Pangolin。
  2. 临床与人群频率数据: gnomAD、CIViC、mskcc_hotspot。
  3. 基因组参考与区域: UCSC 注释文件(cytobandncbiRefSeq.gtf)、Ensembl 参考文件(GRCh38/37 FASTAvep_cache)、ManeSelectBed。

⚖️ 许可证与商业使用

好消息:本资源库包含的所有基础数据集目前均允许商业使用,前提是用户严格遵守各自的署名和相同方式共享要求。

由于本资源库作为聚合器,它不受单一许可证约束。您必须遵守各基础数据源的单独许可证。下表概述了每个组件的具体许可证:

📊 数据库许可证汇总

数据库 / 来源 版本 官方许可证 商业使用 再分发 关键要求与说明
AlphaMissense v3 CC BY 4.0 ✅ 允许 ✅ 允许 必须署名 DeepMind Technologies Limited。
EVOScore2 20260128 MIT ✅ 允许 ✅ 允许 必须包含原始版权声明。
Pangolin v1 CC BY 4.0 ✅ 允许 ✅ 允许 必须提供适当署名。
ManeSelectBed v49 MIT ✅ 允许 ✅ 允许 必须包含原始版权声明。
mskcc_hotspot v2 ODbL ✅ 允许 ✅ 允许 相同方式共享: 如果您修改/改编此数据库,衍生作品也必须采用 ODbL 许可证。
CIViC 20260301 CC0 1.0 ✅ 允许 ✅ 允许 公共领域。无限制。
gnomAD v4.1 无限制 ✅ 允许 ✅ 允许 Broad Institute 声明对使用无限制。
UCSC Data / 公共领域 ✅ 允许 ✅ 允许 公共资助数据,可自由用于任何用途。
Ensembl Data release 116 无限制 ✅ 允许 ✅ 允许 EMBL-EBI 对使用或再分发无限制。

免责声明:本组合数据集的创建者对原始源数据不主张任何所有权。用户需自行确保其下游使用符合原始数据提供者的条款。

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