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# Protocolo de mapeo: alineación ontológica y validación ciega de dominios empíricos en el marco I.O.

> Protocolo estandarizado de ingesta, asignación a perspectivas/tríadas, instanciación de `mirrorOf`/`creates` y evaluación ciega.  
> Evaluación independiente: [`datasets/independent_eval/`](../datasets/independent_eval/) · Pipeline: [`../REPRODUCCION.md`](../REPRODUCCION.md)

---

## 1. Marco fundamental y delimitación del protocolo I.O.

El establecimiento de un protocolo de mapeo riguroso resulta indispensable para formalizar el paso entre una estructura ontológica teórica y un instrumento de análisis interpretable, medible y operativo en el mundo real. Sin una metodología estandarizada de alineación, la arquitectura conceptual corre el riesgo de degradarse a un ejercicio autorreferencial de sintaxis formal.

### 1.1 Propósito y alcance de la prueba de validez semántica

El propósito primario es evaluar la **validez semántica en el mundo real**: la capacidad del marco para permitir que observadores independientes —ajenos al diseño del sistema— etiqueten y clasifiquen conceptos externos, nuevos o ambiguos, sin recurrir a reglas deductivas autorreferenciales.

| Eje de evaluación | Mecanismo de respuesta en el repositorio |
|---|---|
| ¿Pueden anotadores independientes, ciegos a las reglas, etiquetar relaciones semánticas sobre pares reales/nuevos/ambiguos? | Protocolo ciego + Fleiss' κ en `datasets/independent_eval/` |
| ¿La estructura formal es internamente coherente? | Lean 4 + SHACL/OWL (condición necesaria; no prueba de validez en el mundo real) |
| ¿Las reglas sintéticas son recuperables por un modelo? | PI-HGAT-T y baselines en `experiments/` (diagnóstico sintético) |
| ¿Se puede alinear un dominio empírico a las 13 tríadas? | `docs/CATALOGO_DOMINIOS.md` e ingesta en `datasets/ingestion/` |

### 1.2 Arquitectura sistémico-ontológica (perspectivas y tríadas)

| Perspectiva | Rol en el mapeo |
|---|---|
| **Individualidad** | Unidades discretas, entidades base, fronteras ontológicas primarias |
| **Dualidad** | Tensiones, polaridades, complementariedad entre pares |
| **Totalidad** | Integración sistémica, propiedades emergentes, cohesión holística |
| **Evolución** | Vectores de desarrollo, transformación ascendente, complejización |
| **Involución** | Retracción, simplificación, condensación, retorno a estados fundamentales |

Cada dominio empírico debe analizarse a través de estas cinco perspectivas y asignarse a las **13 tríadas** estructurales, evitando superposición u omisión de categorías.

---

## 2. Metodología de ingesta y mapeo de dominios empíricos externos

### 2.1 Protocolo de carga y alineación sistemática

1. Consultar fronteras en [`DELIMITACION_EPISTEMOLOGICA.md`](DELIMITACION_EPISTEMOLOGICA.md).
2. Seleccionar el dominio en [`CATALOGO_DOMINIOS.md`](CATALOGO_DOMINIOS.md).
3. Descomponer entidades, estados y procesos por las cinco perspectivas.
4. Asignar a las 13 tríadas y a la fase (`adv` / `ret`) correspondiente.
5. Registrar en CSV de ingesta (`datasets/ingestion/`) y validar con `scripts/importar_datos_personalizados.py`.

### 2.2 Relaciones operativas

Fundamento: [`RELACIONES_OPERATIVAS.md`](RELACIONES_OPERATIVAS.md).

- **`mirrorOf`:** correspondencia estructural/funcional o simetría divalente; misma tríada, fase opuesta, posición lateral invertida.
- **`creates`:** emanación, producción o transformación activa; direccionalidad irreflexiva según las cuatro reglas de `creation_rules`.

---

## 3. Capas de verificación formal y validación estructural

La coherencia lógica interna es **condición indispensable** pero **no sustituye** la validez semántica en el mundo real.

### 3.1 Lean 4

```bash
lake build
```

Verifica teoremas en `IOM/FormalRules.lean` (vacío, unidad, infinito, transformación; `isMirror` / `isCreates`). Véase [`PREMISAS_Y_TEOREMAS.md`](PREMISAS_Y_TEOREMAS.md).

### 3.2 OWL / SHACL / CSV

```bash
.venv/bin/python scripts/validate_spec.py
.venv/bin/python scripts/validate_shacl.py
```

Criterios: sin violaciones SHACL; dominio/rango de `mirrorOf` y `creates`; conformidad CSV↔especificación; integridad de tipado de tríadas.

---

## 4. Protocolo de anotación ciega y evaluación inter-anotador

### 4.1 Diseño experimental

Sobre `datasets/independent_eval/` ([`VALIDACION_INDEPENDIENTE.md`](VALIDACION_INDEPENDIENTE.md)):

1. Muestra de 14 pares (reales, nuevos, ambiguos).
2. Anotadores independientes sin acceso a reglas ni gold.
3. Etiquetado semántico (`mirrorOf`, `creates`, `none`, `unsure`).
4. Consolidación en `annotations.json`.

### 4.2 Métricas actuales

```bash
.venv/bin/python scripts/score_independent_eval.py --annotations datasets/independent_eval/annotations.json
```

| Métrica | Valor | Lectura |
|---|---:|---|
| Fleiss' κ | **0.6871** | Acuerdo moderado-sustancial |
| Unánimes | 10/14 | Controles estructurales estables |
| Desacuerdos | 4/14 | NC01, NC02, AM01, AM03 |

Demostración **provisional** de interpretabilidad; no prueba universal del marco.

### 4.3 Diagnóstico de desacuerdos

- **NC01, NC02 (conceptos nuevos):** dispersión al clasificar fenómenos sin contornos consolidados.
- **AM01, AM03 (ambiguos):** solapamiento entre especularidad y causalidad.

---

## 5. Pipeline de ejecución reproducible

```bash
python3 -m venv .venv && .venv/bin/python -m pip install -r requirements-lock.txt
lake build
.venv/bin/python scripts/validate_spec.py
.venv/bin/python scripts/generate_ontology.py
.venv/bin/python -m unittest discover -s tests -v
.venv/bin/python scripts/validate_shacl.py
.venv/bin/python scripts/score_independent_eval.py --annotations datasets/independent_eval/annotations.json
.venv/bin/python experiments/pi_hgat_t.py
.venv/bin/python experiments/baselines.py
.venv/bin/python scripts/generate_audit_report.py
```

### Deslinde conceptual

| Capa | Afirmación legítima |
|---|---|
| Validez semántica (mundo real) | Interpretabilidad y acuerdo humano sobre conceptos externos |
| Formal | Consistencia lógica y teoremas en Lean 4 |
| Estructural | Conformidad SHACL/CSV con la especificación |
| Diagnóstico sintético | Recuperación de relaciones *generadas por reglas* (no validez semántica real) |

El marco I.O. no es un software aislado ni un conjunto de reglas sintéticas autorreferenciales: es un marco de alineación ontológica y una **prueba demostrativa** de mapeo semántico sobre el mundo real.

	# Protocolo de mapeo: alineación ontológica y validación ciega de dominios empíricos en el marco I.O.

	> Protocolo estandarizado de ingesta, asignación a perspectivas/tríadas, instanciación de `mirrorOf`/`creates` y evaluación ciega.
	> Evaluación independiente: [`datasets/independent_eval/`](../datasets/independent_eval/) · Pipeline: [`../REPRODUCCION.md`](../REPRODUCCION.md)

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	## 1. Marco fundamental y delimitación del protocolo I.O.

	El establecimiento de un protocolo de mapeo riguroso resulta indispensable para formalizar el paso entre una estructura ontológica teórica y un instrumento de análisis interpretable, medible y operativo en el mundo real. Sin una metodología estandarizada de alineación, la arquitectura conceptual corre el riesgo de degradarse a un ejercicio autorreferencial de sintaxis formal.

	### 1.1 Propósito y alcance de la prueba de validez semántica

	El propósito primario es evaluar la validez semántica en el mundo real: la capacidad del marco para permitir que observadores independientes —ajenos al diseño del sistema— etiqueten y clasifiquen conceptos externos, nuevos o ambiguos, sin recurrir a reglas deductivas autorreferenciales.

	\| Eje de evaluación \| Mecanismo de respuesta en el repositorio \|
	\|---\|---\|
	\| ¿Pueden anotadores independientes, ciegos a las reglas, etiquetar relaciones semánticas sobre pares reales/nuevos/ambiguos? \| Protocolo ciego + Fleiss' κ en `datasets/independent_eval/` \|
	\| ¿La estructura formal es internamente coherente? \| Lean 4 + SHACL/OWL (condición necesaria; no prueba de validez en el mundo real) \|
	\| ¿Las reglas sintéticas son recuperables por un modelo? \| PI-HGAT-T y baselines en `experiments/` (diagnóstico sintético) \|
	\| ¿Se puede alinear un dominio empírico a las 13 tríadas? \| `docs/CATALOGO_DOMINIOS.md` e ingesta en `datasets/ingestion/` \|

	### 1.2 Arquitectura sistémico-ontológica (perspectivas y tríadas)

	\| Perspectiva \| Rol en el mapeo \|
	\|---\|---\|
	\| Individualidad \| Unidades discretas, entidades base, fronteras ontológicas primarias \|
	\| Dualidad \| Tensiones, polaridades, complementariedad entre pares \|
	\| Totalidad \| Integración sistémica, propiedades emergentes, cohesión holística \|
	\| Evolución \| Vectores de desarrollo, transformación ascendente, complejización \|
	\| Involución \| Retracción, simplificación, condensación, retorno a estados fundamentales \|

	Cada dominio empírico debe analizarse a través de estas cinco perspectivas y asignarse a las 13 tríadas estructurales, evitando superposición u omisión de categorías.

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	## 2. Metodología de ingesta y mapeo de dominios empíricos externos

	### 2.1 Protocolo de carga y alineación sistemática

	1. Consultar fronteras en [`DELIMITACION_EPISTEMOLOGICA.md`](DELIMITACION_EPISTEMOLOGICA.md).
	2. Seleccionar el dominio en [`CATALOGO_DOMINIOS.md`](CATALOGO_DOMINIOS.md).
	3. Descomponer entidades, estados y procesos por las cinco perspectivas.
	4. Asignar a las 13 tríadas y a la fase (`adv` / `ret`) correspondiente.
	5. Registrar en CSV de ingesta (`datasets/ingestion/`) y validar con `scripts/importar_datos_personalizados.py`.

	### 2.2 Relaciones operativas

	Fundamento: [`RELACIONES_OPERATIVAS.md`](RELACIONES_OPERATIVAS.md).

	- `mirrorOf`: correspondencia estructural/funcional o simetría divalente; misma tríada, fase opuesta, posición lateral invertida.
	- `creates`: emanación, producción o transformación activa; direccionalidad irreflexiva según las cuatro reglas de `creation_rules`.

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	## 3. Capas de verificación formal y validación estructural

	La coherencia lógica interna es condición indispensable pero no sustituye la validez semántica en el mundo real.

	### 3.1 Lean 4

	```bash
	lake build
	```

	Verifica teoremas en `IOM/FormalRules.lean` (vacío, unidad, infinito, transformación; `isMirror` / `isCreates`). Véase [`PREMISAS_Y_TEOREMAS.md`](PREMISAS_Y_TEOREMAS.md).

	### 3.2 OWL / SHACL / CSV

	```bash
	.venv/bin/python scripts/validate_spec.py
	.venv/bin/python scripts/validate_shacl.py
	```

	Criterios: sin violaciones SHACL; dominio/rango de `mirrorOf` y `creates`; conformidad CSV↔especificación; integridad de tipado de tríadas.

	---

	## 4. Protocolo de anotación ciega y evaluación inter-anotador

	### 4.1 Diseño experimental

	Sobre `datasets/independent_eval/` ([`VALIDACION_INDEPENDIENTE.md`](VALIDACION_INDEPENDIENTE.md)):

	1. Muestra de 14 pares (reales, nuevos, ambiguos).
	2. Anotadores independientes sin acceso a reglas ni gold.
	3. Etiquetado semántico (`mirrorOf`, `creates`, `none`, `unsure`).
	4. Consolidación en `annotations.json`.

	### 4.2 Métricas actuales

	```bash
	.venv/bin/python scripts/score_independent_eval.py --annotations datasets/independent_eval/annotations.json
	```

	\| Métrica \| Valor \| Lectura \|
	\|---\|---:\|---\|
	\| Fleiss' κ \| 0.6871 \| Acuerdo moderado-sustancial \|
	\| Unánimes \| 10/14 \| Controles estructurales estables \|
	\| Desacuerdos \| 4/14 \| NC01, NC02, AM01, AM03 \|

	Demostración provisional de interpretabilidad; no prueba universal del marco.

	### 4.3 Diagnóstico de desacuerdos

	- NC01, NC02 (conceptos nuevos): dispersión al clasificar fenómenos sin contornos consolidados.
	- AM01, AM03 (ambiguos): solapamiento entre especularidad y causalidad.

	---

	## 5. Pipeline de ejecución reproducible

	```bash
	python3 -m venv .venv && .venv/bin/python -m pip install -r requirements-lock.txt
	lake build
	.venv/bin/python scripts/validate_spec.py
	.venv/bin/python scripts/generate_ontology.py
	.venv/bin/python -m unittest discover -s tests -v
	.venv/bin/python scripts/validate_shacl.py
	.venv/bin/python scripts/score_independent_eval.py --annotations datasets/independent_eval/annotations.json
	.venv/bin/python experiments/pi_hgat_t.py
	.venv/bin/python experiments/baselines.py
	.venv/bin/python scripts/generate_audit_report.py
	```

	### Deslinde conceptual

	\| Capa \| Afirmación legítima \|
	\|---\|---\|
	\| Validez semántica (mundo real) \| Interpretabilidad y acuerdo humano sobre conceptos externos \|
	\| Formal \| Consistencia lógica y teoremas en Lean 4 \|
	\| Estructural \| Conformidad SHACL/CSV con la especificación \|
	\| Diagnóstico sintético \| Recuperación de relaciones generadas por reglas (no validez semántica real) \|

	El marco I.O. no es un software aislado ni un conjunto de reglas sintéticas autorreferenciales: es un marco de alineación ontológica y una prueba demostrativa de mapeo semántico sobre el mundo real.